神聖ローマ皇帝フリードリヒ2世

ブラウンシュヴァイクのオットーは、 1209年10月に教皇インノケンティウス3世によってオットー4世として神聖ローマ皇帝に戴冠された。^{[ 32 ]}南イタリアでは、オットーは、貴族擁護派のパレアリアのワルターの解任など、フリードリヒの権力抑制のためのますます強まる措置を恐れる貴族や男爵たちの擁護者となった。新皇帝はイタリアに侵攻し、ほとんど抵抗を受けることなくカラブリアに到達した。^{[ 6 ]}

これに対し、インノケンティウスはオットーに反対し、1211年9月、ニュルンベルク帝国議会で、フリードリヒは教皇の支援を受けた反乱派によって不在のままドイツ王に選出された。インノケンティウスはまた、オットーを破門し、オットーはドイツに帰国せざるを得なくなった。 ^{[ 6 ]}フリードリヒは少数の従者とともにガエータへ航海した。彼はシチリアと帝国の称号の将来的な分離について教皇と合意し、妻のコンスタンスを摂政に任命した。ロンバルディアとエンガディンを通過し、1212年9月にコンスタンツに到着し、オットーより数時間早く到着した。^{[ 6 ]}

フリードリヒは1212年12月9日にマインツでドイツ王として戴冠した。ドイツにおけるフリードリヒの権威は不安定で、南ドイツでのみ認められていた。教皇派ゲルフ派の中心地である北ドイツでは、オットーは破門されたにもかかわらず、王権と帝国権を保持し続けた。ブーヴィーヌの戦いでオットーが決定的な軍事的敗北を喫した後、インノケンティウス3世の支援を受けたドイツ諸侯は1215年に再びフリードリヒをドイツ王に選出し、同年7月中旬にアーヘンで3人のドイツ大司教のうちの1人によって戴冠された。

ブーヴィーヌの戦いでの敗北後、ドイツのオットーのゲルフ連合とイングランド王ジョンとの同盟により、彼はゲルフの世襲領地に退き、1218年にほとんど支持者もなく死去した。^{[ 33 ]}フリードリヒはラインラントと下ロレーヌの服従を確保し、1215年までにアーヘンやケルンなどの主要都市が、しばしば抵抗を受けることなくフリードリヒの手に落ちた。アーヘンでの戴冠式は、彼をカール大帝と結びつける象徴的なジェスチャーと、十字架を被るという予期せぬ発表によって強化され、彼の地位を高めると同時に、若き理想主義の表れとも見えるものの、教皇の指示からの独立をさりげなく主張した。^{[ 34 ]}

フリードリヒ2世のドイツでの初期の時代は、譲歩、強制、そして慎重な政治的連携を意図的に組み合わせたものであった。彼の急速な王位の拡大は、南ドイツ全域に秩序を回復させ、無秩序を厳しく罰する一方で、忠誠を確保するために諸侯や都市に土地、特権、権利を分配した。ホーエンシュタウフェン家の優位性を着実に再構築した彼のエネルギーと勤勉さは、ドイツで彼に名声と尊敬をもたらした。^{[ 35 ]}彼はまた、フランス王室との同盟関係を強化し続け、1218年には、フランス王フィリップ2世とブルゴーニュ公オド3世がシャンパーニュ（フランス）の継承戦争を終結させるために、ロレーヌに侵攻し、ナンシーを占領して焼き払い、ロレーヌ公テオバルド1世を捕らえ、ブリエンヌ＝ラメルプトのエラールへの支持を撤回させることを強要した。決定的に重要なのは、フリードリヒがこの時点での自らの立場がドイツ諸侯、特に聖職者諸侯と教皇庁の両方に依存していることを認識していた点である。1213年のエーガーにおいて、彼は教皇インノケンティウス3世への広範な譲歩を再確認し、正統性を得る代わりに教皇の利益に身を委ねた。その後、彼は「聖職者諸侯との同盟」を発布し、過去10年間の内戦中に事実上獲得していたドイツ聖職者諸侯の王権特権を、自らの王朝への支持と引き換えに確認した。諸侯間の合意形成を図るこのホーエンシュタウフェン家の戦略は、実際に大きな成果をもたらした。 1216年にインノケンティウスが死去し、新教皇ホノリウス3世が即位すると、フリードリヒは1220年にドイツ諸侯との慎重な交渉を経て、長男ハインリヒをローマ王に選出させた。こうして彼は、帝国イタリアとシチリア王国が単一の皇帝の下に統合されることを常に恐れていた教皇庁を巧みに出し抜いた。フリードリヒは巧妙な手腕で、ハインリヒがドイツの副王として留まる間、息子の事実上の摂政として南イタリアの領土を掌握し続けることに成功した。 ^{[ 34 ]}

ドイツ王位獲得、ホーエンシュタウフェン家の支配再建、教皇権の回避という驚異的な成功を収めたにもかかわらず、フリードリヒのドイツ政策は構造的な現実によって制約されていた。数世代にわたり、ドイツにおける王権は本質的に領主、特に聖職者諸侯へと移行し、彼らはほぼ主権に近い権限を行使していた。同時に、都市の経済成長は、王権とますます強力になる帝国都市との関係性を変化させ始めていた。フリードリヒは、諸侯の間で自らの権威に対する合意形成を図ることに注力すると同時に、南ドイツにおけるホーエンシュタウフェン家の支配領域を再構築した。この観点から見ると、フリードリヒのドイツ政策は、父や祖父といった先代の王たちの政策と根本的に異なるものではなかった。実際、それは多くの点で、中世ドイツにおける権力の構造的現実を反映したものであった。^{[ 36 ]}したがって、ドイツにおけるフリードリヒの権威を、一部の古いドイツ史学が主張しているように、本質的に弱かったり怠慢であったりするものと見なすのは間違いであり、ましてやドイツにおける王朝権力政治のより広範な連続性との断絶と見なすのはなおさら間違いである。実際、ドイツにおける強大なホーエンシュタウフェン家の領土は、フリードリヒの治世の終わりと、彼の死後の内戦と権力の空白によって、ほぼ回復されていた。^{[ 37 ]}しかし、ほとんどの神聖ローマ皇帝とは異なり、フリードリヒは主にイタリアに拠点を置き、ドイツで過ごした年数は比較的少なかった。1220年後半の皇帝戴冠式後、フリードリヒは1235年にドイツへの最後の旅に出るまで、シチリア王国か十字軍に留まった。彼は1237年にイタリアに戻り、残りの13年間をそこで過ごし、ドイツでは息子のコンラートが彼の代理を務めた。フリードリヒの政策は、より大きな構想に基づいていた。ドイツ皇帝の誰も成し遂げられなかったように、まずドイツに中央集権的な王権を確立しようとするのではなく、フリードリヒはより広範な帝国構想を追求した。すなわち、シチリアに確固たる主権を確立し、それをイタリアへと拡大し、十分な資源が確保できた時点で初めて、より広範な帝国体制の一環としてドイツにおける中央集権的な権力を行使しようとしたのである。したがって、彼がドイツで行ったいわゆる譲歩は、ローマ帝国の普遍主義に根ざした地域横断的な帝国を構築するというより大きな計画の一環として、実用的かつ戦術的な合意形成政策であったと言える。

フリードリヒが神聖ローマ皇帝としてローマで戴冠式を受けるのは、ドイツ王としての戴冠からさらに5年が経過し、フリードリヒとインノケンティウス3世、そして後に教皇ホノリウス3世の間でさらなる交渉が合意された後のことであった。^{[ 33 ]}その間、フリードリヒはドイツとイタリアの両方を確保するまでローマへの出発を遅らせた。彼は使節を通じて北イタリアと中央イタリアの安定化に取り組み、部分的な平定を達成し、1220年までにミラノを含む主要都市から権威の承認を得た。最終的にイタリアに入ったとき、フリードリヒはロンバルディアの都市との衝突を避け、特権を選択的に確認し、教会寄りの立法を通じて教皇の好意を維持するなど、慎重に進めた。同時に、彼はシチリア王冠に関する事柄については確約を拒否し、それが彼の権力の核心であり続けることを示唆した。 1220年の冬までに、フリードリヒはローマに到着し、11月20日に神聖ローマ皇帝として戴冠した。同時に、フリードリヒの長男は正式にローマ王の称号をハインリヒ7世として名乗った。^{[ 33 ]}正式に皇帝の冠を手にしたフリードリヒは、南方の王国を安定させるために南下した。

1220年末までに、フリードリヒは南イタリアへと渡り、それまでの20年間で著しく衰退していたシチリア王権の再建を決意した。祖父ロジャー2世、そして後継者のウィリアム1世とウィリアム2世の治世下では、ノルマン人のシチリア王国はヨーロッパで最も中央集権的な国家であったと言えるだろう。しかし、フリードリヒが幼少だった頃、摂政たちは貴族に王権と領土の大部分を奪わせてしまった。王権は弱体化し、その実効支配はパレルモをはるかに超えることはなかった。

3つの重要な立法行為のうち最初のものとして、フリードリヒは1220年12月に王国に帰還した直後、ロジャー2世のアリアーノの法規を基にしたカプア法規を発布した。この法律はフリードリヒの帰還前にすでに細部に至るまで準備されており、彼は王国で最初に立ち寄った都市でいち早く公布する機会を捉えた。これは、皇帝が無法の時代が終わったことを臣民にすぐに理解させようと焦っていたことを示している。カプア法規は、最後の正統なノルマン王であるウィリアム2世の死後、すべての王領と城を元の状態に復元することを要求した。ウィリアム2世の治世の終わり以降、誰に対しても与えられたあらゆる特権は、本土諸州については1221年の復活祭までに、シチリア島については同年の聖霊降臨祭までに、王室大法官府に承認を求めるよう命じられた。この包括的な布告は、過去 30 年間に行われた王室の授与のすべて、最大の封土から最小の個人所有地まで、通行料やその他の特権の徴収を含めて対象となった。ウィリアム 2 世の死後、王室領から土地を奪うために使用された偽の法的手段や偽造文書は、王室大法官による改訂を待つ間、包括的に取り消され、どの合法的な封土と特権が実際に存在するかを決定する理想的な手段が作られた。これは賢明な一手であることが証明され、司法の独占権が王室に戻された。^{[ 38 ]}カプアで公布された法律は、封土の現在の保有を規制し、皇帝による将来の管理も規定した。封土の所有者は、君主の同意なしに結婚することも、その子供が直接相続することもできず、フリードリヒは封土を常に返還させることが可能となり、実際の所有者だけでなくその相続人をも支配する強力な手段となった。

カプアの巡回裁判は、フリードリヒが自らの覇権に反対する者たちに対して行動を起こし、王領地と城を奪還するための法的根拠となった。フリードリヒは法的な策略を用いて、最も有力な男爵たちの土地を没収し、彼らを王国から追放した。皇帝は、勅令に従わない男爵たちに対する作戦を開始した。抵抗した男爵たちは城に包囲され、捕らえられると追放されるか、時には処刑され、その家族は奴隷として売られた。しかし、皇帝はこれらの作戦を自ら指揮したわけではない。彼は重要な男爵たちに反対勢力を鎮圧するよう委任し、次に下級貴族をこれらの男爵たちに対抗させ、抵抗を打ち砕くために最もマキャベリ的な手段に訴えた。^{[ 39 ]}彼は部下の一人に手紙を書いた。

「何か用事を装って、用心深く城主をおびき寄せなさい。可能であれば彼を捕らえ、城を明け渡すまで拘束しておきなさい。」^{[ 40 ]}

1221年から1222年にかけて、フリードリヒは本土の抵抗勢力のほとんどを鎮圧し、王領の大部分を回復した。ナポリ、ガエータ、アヴェルサ、フォッジャなど、数々の要塞が征服、破壊、あるいは新たに要塞化された。モリーゼ伯チェラーノのトマスだけが、アブルッツォ地方の要塞で本格的な抵抗を見せた。しかし、長期にわたる戦いの末、彼の要塞ロッカマンドルフィとオヴィンドリは降伏し、彼は追放された。抵抗の罰として、チェラーノの町は破壊され、住民はシチリア島へ追放された。

モリーゼ伯の敗北は、本土における男爵の抵抗の終焉を意味し、大貴族の権力は完全に崩壊した。フリードリヒ2世は、地域全体に秩序を確立するために、本土各地に要塞の建設を開始した。これらの要塞は巨大で実用的な性質を持ち、居住区はなく、厳格な直角の数学的に単純な設計のみを示し、地元の貴族の費用で国家軍が駐屯した。長年の衰退によって崩壊した、緩やかな結びつきの封建王国の枠組みは、着実に堅固な「国家の建築」に取って代わられた。^{[ 39 ]}

1221年の春、フリードリヒはメッシーナで市政に関する巡回令を発布した。これには、公共の秩序、売春、ユダヤ人の特別な服装に関する規則が含まれていた。ジェノヴァとピサの海上勢力は、過去数十年の不安定な状況を利用して、長らくシチリアの貿易を支配していた。フリードリヒはシラクサからジェノヴァの商人を追放し、過去30年間にパレルモ、メッシーナ、トラパニ、その他の港でジェノヴァに与えられたすべての特権を取り消した。ジェノヴァとピサの倉庫は国家によって没収された。^{[ 41 ]}フリードリヒはまた、古いノルマン法に基づく規定でシチリア海軍を再建した。この規定では、王国の都市や町を含む特定の封土所有者が、造船用の木材または資金を提供し、艦隊の維持を担うことになっていた。これらの法律は再び完全に施行され、フリードリヒは新しい国家埠頭を建設した。 1221年末までに、皇帝はすでに2つの艦隊を海上に擁していた。フリードリヒの治世中、シチリア艦隊は再び地中海で強力な勢力となり、海洋共和国の艦隊に匹敵するようになった。^{[ 42 ] [ 43 ]}

1212年に彼が去って以来、シチリアのイスラム教徒住民が独立した統治を確立したことを懸念したフリードリヒは、長らく王権を認めようとしなかったイスラム教徒の抵抗勢力の拠点に対して戦争を仕掛けた。山岳地帯の拠点におけるイスラム教徒の抵抗勢力に対する作戦は困難を極めたが、いくつかの拠点は着実に占領された。ある記録によると、反乱軍の指導者アミール・イブン・アッバードはフリードリヒに和平を懇願せざるを得なかったが、皇帝の使者に対するアミールの虐待に激怒したフリードリヒは、拍車でアミールの脇腹を切り裂き、アミールとその息子たちを絞首刑にしたという。^{[ 44 ]}

1221年から1230年代にかけて、シチリアのイスラム教徒はイタリア本土に追放された。ルチェーラの町はキリスト教徒の住民がいなくなり、追放されたシチリアのイスラム教徒がそこに住み着き、特別税と引き換えに完全な宗教的自治が認められた。フリードリヒは600人を自身の親衛隊として、また数千人を比較的大きな常備軍として徴募した^{[ 45 ]}。シチリアのイスラム教徒の追放と再定住は、皇帝の「稀有な啓蒙」と同時代の人々の中で並外れた客観性を示し、大胆な政治手腕の傑作であることが証明された。フリードリヒは反抗的なシチリアのイスラム教徒を、彼の保護に完全に依存する従順で価値のある臣民に変えただけでなく、キリスト教徒の敵や教皇の敵意に対して忠誠を誓うことができる恒久的な軍事力も確保したのである^{[ 46 ] [ 47 ] 。}

わずか数年のうちに、フリードリヒ2世はシチリア王国の王権を回復し、数十年にわたる衰退を覆した。王国は復興し、再びヨーロッパ政治の中心舞台に立った。この過程で、皇帝は国家建設者であると同時に、抜け目のない狡猾な政治家としての手腕を発揮した。精力的な君主としての彼の評判は広まり、その地位をさらに高めた。カプアの治世裁判は、フリードリヒが1231年のメルフィ憲章で劇的に拡大することになる政府の大規模な再編の基礎を築き、ヨーロッパ国家の歴史に永続的な影響を与えた。フリードリヒは自らの行動によって、壮大な野望を実現するための強固な権力基盤を築くことができた。シチリア王国は彼の資源の大部分を提供し、広大な領土の中でも宝石のような存在であり続けた。皇帝の治世を通して、レグノ（シチリア王国）は中世ヨーロッパで最も洗練された国家となり、地中海における活気に満ちた文化の中心地となった。フリードリヒは、侵略、陰謀、破門、そしてロンバルディアや教皇領との戦争にも耐え、南方の王国を強固に支配し続けた。彼が後継者に残した強固な地位は、レグノに根ざしたものであり、ホーエンシュタウフェン家の敵対者たちにとって非常に魅力的なものであったが、13世紀後半、アンジュー家の支配下で最終的に崩壊と分裂を余儀なくされた。

ローマ王に選出された時、フリードリヒは十字軍に参加することを約束した。しかし、彼はそれを繰り返し延期し、ドイツ王として戴冠した際にこの誓いを新たにしたにもかかわらず、 1217年に第5回十字軍の軍隊とともにエジプトへは行かなかった。彼はバイエルン公ルートヴィヒ1世の指揮下でエジプトに軍隊を派遣したが、彼の到着を常に期待していたため、教皇特使ペラギウスは、十字軍がエジプトから撤退する代わりにエルサレムのラテン王国を十字軍に返還するというアイユーブ朝のスルタン、アル＝カミルの申し出を拒否し、十字軍は彼の到着が遅れるのを待ちながら、絶えず停滞した。十字軍は1221年にダミエッタを失って失敗に終わった。 ^{[ 48 ]}この悲惨な敗北について、教皇ホノリウス3世と一般のキリスト教徒の両方からフリードリヒの責任を問われた。^{[ 49 ]}

1225年、フリードリヒは教皇ホノリウスと1228年までに十字軍を開始することに同意した後、ロンバルディア地方の親帝国派の主要都市クレモナで帝国議会を招集した。議会開催の主な目的は、異端との戦いを継続し、十字軍を組織し、そして何よりも、北イタリアに多数存在するコムーネによって長らく奪われていた帝国の権力を回復することであった。集まった人々は、12世紀に祖父フリードリヒ・バルバロッサを破ったロンバルディア同盟の再編で応じ、再びミラノが同盟の盟主に選ばれた。しかし、議会は中止され、事態はホノリウスがフリードリヒと同盟の間で合意した妥協によってのみ安定した。^{[ 6 ]}北イタリア滞在中、フリードリヒは恐らくリミニの黄金勅書によって、後に東プロイセンとなる領地をドイツ騎士団に与え、後に北方十字軍と呼ばれることになる遠征を開始した。^{[ 6 ]}しかし、一部の歴史家は、この勅書は実際には1235年に発行され、日付が1226年に遡って記載されたと示唆している。 ^{[ 50 ] [ 51 ]}

フリードリヒが同盟に気を取られている間に、1226年6月、フランスのルイ8世が帝都アヴィニョンを包囲した。フランス軍の男爵たちは、軍事上の必要性から自分たちの行動を擁護する書簡をフリードリヒに送り、包囲開始から数日後、アンリ7世は1223年に署名されたフランスとの同盟を批准した。^{[ 52 ]}

帝国内の安定性の問題により、フリードリヒの十字軍への出発は遅れた。フリードリヒがエルサレム王国の相続人であるイザベラ2世と代理結婚した1225年になって初めて、彼の出発は確実になった。フリードリヒはすぐに、現在のエルサレム王である義父のブリエンヌのジャンを追放し、その権利を皇帝に移譲させた。1227年8月、フリードリヒはブリンディジから聖地に向けて出発したが、流行した疫病に倒れたため引き返さざるを得なかった。皇帝の病気は本物だったようで、友人であるテューリンゲン方伯ルートヴィヒ4世など、彼の指揮官の何人かが病に倒れて亡くなった。^{[ 53 ]}ドイツ騎士団総長のザルツァのヘルマンでさえ、本土に戻って療養することを勧めた。フリードリヒは翌年まで航海を延期することを決定し、ローマに使節団を派遣してその決定の経緯を説明した。しかし、1227年9月29日、フリードリヒは十字軍の誓約を守らなかったとして教皇グレゴリウス9世から破門された。 ^{[ 6 ]}グレゴリウス9世はフリードリヒ2世の病状を確認しようともせず、性急に彼を破門し、その機会を利用して政敵を攻撃した。彼の公式告発、特にキリスト教世界に提示されたものは誇張または誤解を招くものであり、十字軍の失敗に焦点を当てながら、フリードリヒがシチリアの主権を教皇に譲り渡すというより深い要求を隠蔽していた。多くの告発は明らかに虚偽または歪曲されており、皇帝に対する世論をそらし、服従を強要することを目的とした意図的な虚偽表示を示唆している。^{[ 54 ]}

しかし、同時代の年代記作家の中には、フリードリヒの病気の真偽を疑う者もおり、彼らの態度は教皇支持の傾向によって説明できるかもしれない。当時の年代記作家であるウェンドーバーのロジャーは、フリードリヒについて次のように記している。

地中海に向かい、少数の従者とともに船に乗り込んだが、聖地に向かうふりを3日間した後、突然の病に襲われたと言った。[...] この皇帝の行動は、彼自身の不名誉と十字軍全体の事業への損害を招いた。^{[ 55 ]}

フリードリヒは1228年6月に再びブリンディジから出航した。皇帝の反抗に驚いたグレゴリウス9世は、フリードリヒは破門されていたため、厳密には十字軍を指揮できる立場になかったことから、この行動を挑発とみなした。グレゴリウスは皇帝を二度目の破門とした。フリードリヒの東方十字軍は、キプロスに対する皇帝の権威を確立しようとする試みから始まったが、キプロスの男爵たち、特にイベリンのヨハネに対する彼の無神経で高圧的な態度は、すぐに緊張と不信を生み出した。9月にアッコに到着した後、皇帝はすぐに、戦争ではなく外交によって成功しなければならないと認識した。十字軍はすでに小規模な部隊であり、教皇の敵意と十字軍内部の分裂が彼の立場を弱めていた。地元の貴族、テンプル騎士団、聖ヨハネ騎士団の多くも公然とした支援を申し出ることに消極的だった。そこでフリードリヒは、同じくイスラム内部の紛争を抱えていたアル＝カミルと連絡を取った。フリードリヒは、エジプトのスルタンがエルサレム市を実用上ほとんど必要としておらず、イスラム教徒が支配するダマスカス市に対しては政治的にさらに無関心であることを認識していた。こうした状況下で、両君主の相互の政治的制約圧力の中で、アル＝カミルとの交渉はゆっくりと進んだ。皇帝側では、フリードリヒがイスラム教の使節と文化交流を行ったことに対するキリスト教指導者たちの疑念が、彼の地位をさらに損なった。同時に、グレゴリウス9世はイタリアにおけるフリードリヒの部下たちに直接介入し、教皇の反対が続いたことで、国内での権威が脅かされる前に聖地で成果を上げるよう、フリードリヒに緊急の圧力がかかった。皇帝とスルタンは哲学や数学の問題、詩、芸術への関心について意見を交換し、着実に実効性のある対話を築き上げていった。両国の統治者は1229年2月18日に条約に署名した。この条約は、エルサレム、ナザレ、ベツレヘム、および小さな沿岸地帯をエルサレム王国に10年間返還することに合意したが、返還された領土の範囲については意見の相違がある。 ^{[ 6 ]}また、この条約は、岩のドームとアル＝アクサ・モスクはイスラム教徒の支配下に留まり、エルサレム市は要塞を持たないままにしておくことを規定した。^{[ 6 ]}

この条約は、フリードリヒの外交手腕の驚くべき成果のように見えたが、キリスト教徒とイスラム教徒の両方から幅広い支持を得られなかった。事実上、これはフリードリヒとアル・カミルの個人的な合意であり、それぞれの共同体によって承認された和解ではなかった。^{[ 56 ]}テンプル騎士団や聖ヨハネ騎士団を含む他のほぼすべての十字軍は、フリードリヒが十字軍の大義を裏切り、王国を取り戻そうとする政治的策略として、この取引を非難した。シリアとメソポタミアを支配していた親族との戦争の可能性を心配していたアル・カミルは、少なくとも国内のライバルが制圧されるまでは、キリスト教徒からのさらなるトラブルを避けたいと考えていた。

十字軍は1229年3月18日、フリードリヒがエルサレム王として戴冠し休戦協定を結んで終結したが、厳密にはこの戴冠式は不適切であった。フリードリヒの妻で相続人であったイザベラは既に亡くなっており、幼い息子コンラートが正当な王位継承者であった。また、この「戴冠式」がそもそも戴冠式であったかどうかについても意見が分かれている。フリードリヒがイングランド王ヘンリー3世に宛てた手紙には、彼が自らの頭に載せた冠は実際にはローマ帝国の皇帝冠であったことが示唆されているからである。

戴冠式において、彼はロジャー2世の治世中に作られた赤い絹のマントを着用した可能性がある。そのマントにはアラビア語の銘文が刻まれており、イスラム暦528年（西暦1133～1134年）のものであることを示すとともに、着用者に「莫大な繁栄、寛大さ、そして高貴な栄華、名声、そして素晴らしい財産、そして願いと希望の成就」を祈る一般的な祝福の言葉が記されていた。「彼の昼夜が、終わりなく、変わることなく喜びに満ちますように」。この戴冠式用のマントは現在、ウィーン美術史美術館の宝物庫に所蔵されている。

いずれにせよ、エルサレムのラテン総大司教ジェラルド・ド・ローザンヌは式典に出席しなかった。実際、翌日、カイサリアの司教が到着し、総大司教の命令によりエルサレムを聖務停止下に置いた。フリードリヒによるエルサレム王国の統治のさらなる試みは、ベイルート領主ジョン・ド・イベリン率いる男爵たちの抵抗に遭った。1240年代初頭までに、フリードリヒの副王リチャード・フィランジェリはアッコを去ることを余儀なくされ、1244年には包囲の後、エルサレム自体が新たなイスラム教徒の攻勢により再び失われた。この間、フリードリヒはイザベラ2世との間に生まれた息子コンラートのために王国の名目上の摂政を務めたが、実質的な権力はほとんど行使しなかった。 1243年までに、彼はエルサレムに対する権利をキプロスの女王アリスに売却し、アリスは事実上コンラート、そして後に彼女の息子であるキプロスのヒューのエルサレムの摂政となった。^{[ 6 ]}しかし、フリードリヒは依然として王国を自身の帝国の勢力圏内にあると考えており、遺言で、3番目の妻であるイングランドのイザベラとの間の息子であるヘンリー・チャールズ・オットーに継承させる条項を残した。

フリードリヒが十字架のためにエルサレムを無血で奪還したことは、ヨーロッパの一部のサークルで大きな名声をもたらしたが、破門されたまま十字軍を完遂するという彼の決断は教会の敵意を招いた。1230年に教皇はフリードリヒの破門を解除したが、この決定はヨーロッパの政治情勢に関連するさまざまな理由から下された。フリードリヒの十字軍について、当時の年代記作家であるノヴァラのフィリップは、「皇帝は（休戦協定の締結後）憎まれ、呪われ、中傷されながらアッコを去った」と述べている。^{[ 57 ]}全体として、おそらく第1回十字軍以来初めて成功したこの十字軍は、破門された皇帝の和解を教会が支持しなかったことで悪影響を受けた。こうした事情と、教皇によるシチリア王国への侵攻により、フリードリヒはエルサレム王国を放棄せざるを得なくなり、王国は彼の代理人と地元の貴族との間で、ロンバルディア戦争として知られる内戦状態に陥った。

巡回説教者ヨアキム派と多くの急進的なフランシスコ会士、霊性派はフリードリヒを支持した。説教者たちは、彼の領地に対して宣告された聖務停止に反対し、教皇を非難し、聖餐式を執り行い、赦免を与え続けた。シュヴァーベンのアルノルド修道士は、1260年に再臨すると宣言し、その時にフリードリヒはローマの富を没収し、「真のキリスト教徒」である貧しい人々に分配するとした。^{[ 58 ]}

フリードリヒのレバント遠征は、おそらく十字軍運動の歴史における転換点であった。ラテン君主、しかも最も傑出した君主が、教皇の承認なしに十字軍遠征に乗り出したのはこれが初めてであり、実際、教皇の強い敵意をよそに独立して行動したのである。皇帝の行動は、その後の世代において、教皇権への従属が少なくなり、より狭義の党派的政治目標によってより露骨に動機づけられた、君主主導の十字軍の先例となった。実際、教皇権自身もすでに十字軍を敵対勢力に対する武器として再構築し始めていた。^{[ 59 ]}

フリードリヒが聖地に滞在していた間、摂政のスポレートのライナルドがアンコーナ辺境伯領とスポレート公国を攻撃した。グレゴリウス9世はこれを皇帝に対する直接的な軍事行動の口実とし、シチリア王国を奪取しようとフリードリヒに対する前例のない十字軍を呼びかけた。グレゴリウスはヨーロッパ各地から教会の資金を集めてこの作戦を支援し、皇帝の義父であったブリエンヌのジャンを指揮官として軍隊を編成した。1229年、ジャンは奪取可能な規模の軍隊を率いて南イタリアに侵攻した。彼の軍隊はモンテカッシーノで最初の抵抗を克服し、カンパニア地方のヴォルトゥルノ・カロレ・イルピーノまで到達した。^{[ 60 ]}教皇庁とその支持者は、皇帝が実際には聖地で死去したという噂を広めていた。そのため、1229年6月にフリードリヒがブリンディジに到着したことは、敵対者たちを驚かせ、流れを逆転させた。皇帝は直ちに事態の収拾に乗り出し、シチリア全土の忠誠派勢力を結集させた。皇帝の到着の知らせを受けて、シチリア島では支持が急増した。

王国内の忠誠派勢力と、ドイツ騎士団などの帰還した十字軍兵士からなる強化された軍隊を擁したフリードリヒは、資金不足と士気の低下に苦しむ教皇軍が混乱のうちに撤退する中、王国を急速に再征服した。1229年末までに、フリードリヒは完全に支配権を回復し、離反した都市や反乱を起こした男爵たちを処罰した。しかし、彼は王国の北の国境を越えてローマ周辺の教皇領にまで戦線を拡大することはしなかった。その代わりに、グレゴリウス9世との和解へと舵を切り、破門の解除がキリスト教世界における自身の地位を強化するために不可欠であると判断したのである。^{[ 6 ]}戦争は1230年7月のサン・ジェルマーノ条約で終結した。 8月28日、チェプラーノで行われた公開の式典で、教皇特使のトマス・ディ・カプアとジョヴァンニ・コロンナはフリードリヒを赦免し、破門を解除した。^{[ 61 ]}次に皇帝はアナニでグレゴリウス9世と直接会見し、シチリアの教会にいくつかの譲歩を行った。^{[ 6 ]}フリードリヒの譲歩（主に聖職者の特権と財産の回復）は比較的限定的で、大部分は戦術的なものであった。それは彼の基本的な主権を維持し、南王国を固めるための余地を確保するための計算であった。

教皇の侵攻により、彼の南王国の弱点が露呈し、フリードリヒは政府機構全体の大規模な再編を断行することを決意した。その後に行われたシチリア王国の再建は、ヨーロッパの国家の歴史における画期的な出来事となった。^{[ 62 ]} 1231年、皇帝はメルフィ憲章を包括的な法典として発布し、シチリア王国全土に王権を集中させ、聖職者官僚をローマ法を学んだ俗人の法学者に置き換え、皇帝から最も下位の地方官吏に至るまで厳格な階層制行政システムを確立した。その根底にある哲学は明確であった。フリードリヒは皇帝を地上の生きた法とみなし、神から直接権威を授かり、皇帝の地位が世俗の正義の唯一の源泉であると考えていた。^{[ 63 ]}この法典はノルマン人の先例と皇帝の以前の裁判記録に基づいていたが、徹底的に「ローマ化」された方法で再構築され、その広さと範囲において質的に新しいものを生み出した。この法典は先例の集まりであるだけでなく、君主の意思と国家全体の構造の概略によってのみ変更される比較的複雑な王法体系でもあった。そのため、皇帝はこの法典を自身の広大な領土帝国のモデル枠組みとみなした。^{[ 6 ]}フリードリヒの君主制の考え方は、1231年に初めて発行された有名な金貨アウグスタリスにも表れており、これは古代と現代の伝統の融合をある程度捉えている。上質なコインであるこの金貨には、キリスト教のシンボルではなく、古代のカエサルの様式で皇帝自身の肖像が刻まれており、古典古代とローマの普遍主義に根ざした世俗的な帝国の権威という彼の概念を具体的な形で表明した。^{[ 64 ]}

国家建設の努力に加えて、皇帝は国際色豊かな宮廷の評判によって名声を得た。主にパレルモとフォッジャに拠点を置き、フリードリヒの旅に同行した宮廷は、13世紀ヨーロッパの主要な知的中心地の1つとなった。^{[ 6 ]}皇帝は、宗教や出身に関係なく、ヨーロッパとイスラム世界から集めた学者、法学者、詩人、数学者、自然哲学者で周囲を固めた。彼は知的で学問的な探求に積極的に関心を持ち、宮廷のメンバーと直接交流することで知られていた。特に著名な従者の中には、スコットランドの博学者ミカエル・スコトゥス、占星術師グイド・ボナッティ、数学者レオナルド・フィボナッチ、哲学者アンティオキアのテオドロス、詩人ジャコモ・ダ・レンティーニ、そして皇帝の首席大臣となった法学者ピエロ・デッラ・ヴィーニャがいた。^{[ 65 ]}ダンテ・アリギエーリは後に、フリードリヒ2世の宮廷をイタリア語詩の発祥地と特定した。同時代の記録には、ローマの法伝統、アラビア哲学、ビザンツの行政的影響、そしてイタリア半島で勃興しつつあった文学文化が融合した知的環境についても記述されている。このように、フリードリヒの宮廷は、おそらく驚くべきノルマン・シチリア文化の融合の最後の偉大な開花であった。^{[ 66 ]}

フリードリヒは一時的に教皇と和解し、南イタリアにおける権威を確立したかもしれないが、ドイツの状況は問題になりつつあった。フリードリヒの息子ハインリヒ7世（1211年にシチリアで、フリードリヒの最初の妻アラゴンのコンスタンスの子として生まれた）は、特権に対する攻撃的な政策によってドイツ諸侯の不満を招き、高位貴族に反して都市側に味方し、ドイツ王権の中央集権的な権威を主張した。しかし、彼は諸侯にすぐに出し抜かれ、ヴォルムスで発布された「諸侯に有利な法令」（Statutum in favorem principum）に同意せざるを得なくなった。この法令は、理論上、ドイツ王権から直接的な主権の多くを事実上奪うものであった。^{[ 6 ]}フリードリヒはハインリヒを会議に呼び出し、会議は1232年にアクイレイアで開催された。ハインリヒは父への服従を確認し、ドイツ諸侯は皇帝への忠誠を再確認したが、フリードリヒはその後すぐにチヴィダーレのスタトゥトゥムを再確認せざるを得ないと感じた。^{[ 6 ]}

北イタリアの状況も不安定で、皇帝がグレゴリウス9世（当時、反乱によってローマから追放されていた）の助けを借りてロンバルディアで和解を図ろうとした試みは、1233年までにほとんど成果を上げていなかった。ハインリヒは父の意に反して、ドイツで再び無益な反君主政策を再開した。これに対し、フリードリヒは1234年7月にグレゴリウス9世から息子の破門を取り付け、ドイツへの帰還準備を始めた。ハインリヒはドイツで反対勢力を結集しようとし、ロンバルディアの諸都市にアルプスの峠を封鎖するよう要請した。1235年5月、フリードリヒは軍隊を伴わず、権力と富を誇示するために豪華な随行員だけを連れてドイツへ向かった。皇帝の名声も彼より先に広まっていた。彼の到着の知らせはすぐに伝わり、反乱は崩壊した。 7月には、彼は息子にヴォルムスで王位とすべての領地を放棄させることに成功し、そこでハインリヒは裁判にかけられ投獄された。ハインリヒはその後、プーリアで生涯囚われの身となり、伝えられるところによると自殺した。^{[ 6 ]}ある意味では、ドイツにおける王権の中央集権化を主張したハインリヒの失敗した政策は、南イタリアにおける父の政策と全く異質ではなかった。しかし、皇帝にとって帝国全体の統合が最重要事項であり、その結束を脅かしたり、より大きな帝国計画を危険にさらしたりするものは、容赦なく対処しなければならなかった。この流れで、フリードリヒはハインリヒの反乱という複雑な課題を、ドイツとアルプス以北の帝国の統治方法に「徹底的かつ画期的な」改革を導入する機会に現実的に変えた。1235年にマインツで開催された帝国議会で制定されたマインツ平和条約（Constitutio Pacis）は、帝国の基本法の一つとなり、諸侯がドイツにおける地方統治の負担を分担することを定めた。ハインリヒの反乱の危機の後、諸侯をホーエンシュタウフェン家の権力に再び縛り付けることに成功したことは、フリードリヒの並外れた政治力とイメージ構築、1230年代初頭の彼の名声の高まり、そして圧倒的な権力の証であった。^{[ 67 ]}

ホーエンシュタウフェン家とゲルフ家も1235年に和解した。ハインリヒ獅子公の孫であるオットー幼王は1180年にバイエルン公とザクセン公の地位を追われ、ゲルフ家の領地をフリードリヒに譲渡した。フリードリヒはこれに対し、オットーに新たに設立されたブラウンシュヴァイク＝リューネブルク公と同じ領地と、さらに以前の帝国領を与え、1180年以降称号も地位も失っていたドイツのゲルフ家の曖昧な地位を解消し、彼らの協力を促した。外交を確固たるものにするため、フリードリヒは3番目の妻としてイングランド王ヘンリー3世の妹イザベラと結婚し、旧ゲルフ派との婚姻関係を築き、彼らを自身の新たなドイツ植民地に戦略的に結びつけた。

ドイツにおける皇帝の最大の目的は、アルプス以北のホーエンシュタウフェン家の勢力を安定させ、ロンバルディアの反乱都市を鎮圧するためにドイツ諸侯から軍隊を編成することであった。諸​​侯のほとんどは1235年の和解に概ね賛同していた。しかし、オーストリア公フリードリヒ2世は皇帝と対立しており、マインツでの議会への召集を拒否していた。皇帝は公爵を帝国追放した。ロンバルディアで本格的に作戦を展開する前に、この好戦的な公爵を始末する必要があり、皇帝は自身とボヘミアのヴェンツェル1世、バイエルンのオットー3世との連合を組織して公爵を鎮圧した。皇帝はウィーンを占領し、1237年2月には9歳の息子コンラートにローマ王の称号を与えた。 ^{[ 6 ]}しかし、オーストリア公に対する帝国の作戦は反発を招いた。皇帝のかつての同盟者であったボヘミアのヴェンツェスラウスとバイエルンのオットーは、オーストリアが皇帝の直轄領となる可能性を警戒し、フリードリヒ公と手を組んで反対し、妥協を求めた。皇帝はドイツで再び公然とした衝突が起こるリスクを避けるため、フリードリヒ公が自治権の一部を譲歩した上で皇帝の宗主権を再承認することを条件に、公に対する禁令を解除した。その後2年間、皇帝はハンガリー王ベーラ4世に対するフリードリヒ公の国境主張への支援を約束することで、慎重に公を連合から引き離した。最終的に、1241年にオットー・バイエルンの娘が若きコンラート王と結婚したことで、オットー・バイエルンも皇帝の信頼を取り戻した。こうして、オーストリアのフリードリヒとバイエルンのオットーは、皇帝の晩年の10年間において、重要な帝国の同盟者となった。

上から時計回りに：

• 『ヌオーヴァ・クロニカ』に描かれた細密画。1237年の第二次ロンバルディア同盟軍とのコルテヌオーヴァの戦いを描いている。
• ヌオーヴァ・クロニカの細密画には、 1240年から1241年のファエンツァ包囲戦中にフリードリヒの軍隊が革貨で給料を支払われている様子が描かれている。 ^{[ 68 ]}
• 『クロニカ・マイオーラ』に描かれた、 1241年のグレゴリウス9世に対するジリオの戦いを描いた細密画

アルプス以北に平和が訪れたことで、フリードリヒはロンバルディアの反乱都市を鎮圧するため、ドイツ諸侯から軍隊を編成した。グレゴリウスは外交努力で侵略を阻止しようとしたが、徒労に終わった。ロンバルディア諸都市、教皇、そして皇帝外交官との交渉が失敗に終わった後、フリードリヒはヴェローナからロンバルディアに侵攻した。1237年11月、コルテヌオーヴァの戦いでロンバルディア同盟軍に大勝利を収め、困難な状況下でも機敏に行動し勝利を収める戦略家、そして戦場の指揮官としての能力を示した。フリードリヒは古代ローマ皇帝のやり方でクレモナで凱旋式を行い、捕獲した馬車（後にローマ市に送られた）と象を伴って勝利を祝った。コルテヌオーヴァでの皇帝の勝利はヨーロッパ中に衝撃を与え、フリードリヒの既に伝説的だった地位をさらに高めた。権力の絶頂期にあったフリードリヒの政治的優位性は揺るぎないものと思われ、彼の覇権はラテンキリスト教世界のほぼ全域で認められていた。父や祖父の時代、あるいはオットー朝やザーリア朝の全盛期以来、皇帝の主権がこれほど強固な地位を占めたことはなかった。皇帝はヨーロッパの支配者であるかのように思われた。

自らの覇権が確固たるものとなったフリードリヒは、ロンバルディアの敵対勢力からの条件付き和平の申し出を一切拒否した。都市の中でも最も手強い敵であったミラノからの申し出さえも拒否した。ミラノは多額の資金を送ってきたにもかかわらずである。長年にわたるミラノの抵抗を冷静に計算した結果か、あるいは単にミラノに対する憎悪からか、彼は完全な軍事的服従こそが帝国の支配を最終的に確固たるものにする唯一の方法だと確信していた。皇帝は、ミラノとの和平交渉（皇帝の官吏によるミラノへの統治の導入を含む）は、自分がこの地域を去った後、ミラノの人々がすぐに皇帝の代理人を打倒するだろうと考えていたのかもしれない。

フリードリヒの全面降伏要求は、ミラノ、ブレシア、ボローニャ、ピアチェンツァからのさらなる抵抗を招いた。1238年の春、フリードリヒは残りの反乱都市に対する作戦を支援するために、イングランド、フランス、ハンガリー、ニカイア帝国、さらには東方のイスラムのスルタンが派遣した部隊から兵を集め、大規模な国際軍を招集した。^{[ 69 ]} 6月から、彼はブレシアを包囲した。皇帝自身が捕らえられそうになる激しい戦闘の後、フリードリヒは、大軍を前にして都市が抵抗を続けることに驚き、降伏交渉のために使者を送った。フリードリヒの主任技師は捕らえられ、包囲する帝国軍に対抗する仕事を強いられた。ブレシアの人々は皇帝の条件を拒否し、包囲は9月まで続いたが、豪雨のため攻撃は不可能となった。 10月の最後の攻撃が失敗に終わった後、フリードリヒは包囲を解かざるを得なくなった。^{[ 6 ]}フリードリヒの威信は傷つき、「皇帝の不敗神話」も損なわれた。^{[ 70 ]}年末に態勢を立て直したが、フリードリヒを裏切ったのは彼の政治的手腕ではなく、不運と、北イタリアで帝国の権威に抵抗する最後の数人を制圧するために必要な軍事資源の評価の誤りが重なったことだった。^{[ 71 ]}

グレゴリウス 9 世は弱みを感じ取り、フリードリヒは 1239 年の最初の数か月間、宮廷がパドヴァにあるときに教皇から破門されたという知らせを受け取った[ 72 ] ^{: 149 [ 73 ]皇帝はロンバルディア}からフランシスコ会とドミニコ会を追放し、北イタリアの重要な家族から人質を取り、息子のエンツォをロンバルディアの総督兼皇帝代理に選出することで対応した^{[ 74 ]}エンツォはすぐに名目上教皇領の一部であったロマーニャ、マルケ、スポレート公国を併合した。皇帝はエンツォに、シチリアに対して船を送っていたヴェネツィア共和国を滅ぼすよう命じた。王国において、フリードリヒはグレゴリウスの支持者を聖職者から容赦なく一掃した。托鉢修道士を追放し、疑わしい司祭を逮捕し、優柔不断な司教を忠実な支持者に交代させ、空席となった司教区には信頼できる同盟者を任命した。シチリア教会は事実上ローマから独立し、フリードリヒの側近であるパレルモ大司教ベラール・ディ・カスターニャが名目上の首長に任命された。^{[ 75 ]}

1239 年 12 月、フリードリヒはトスカーナに入り、クリスマスをピサで過ごした。1240 年 1 月、フリードリヒはフォリーニョに凱旋し、続いてヴィテルボに入り、そこからローマを最終的に征服して帝国の古き栄光を回復することを目指した。しかし、フリードリヒのローマ攻撃計画は、教皇が扇動した反乱がプーリアで勃発した南イタリアに向かうことを選択したため、実現しなかった。南イタリアで、フリードリヒはサンタンジェロとベネヴェントの教皇領を攻撃し、破壊した。^{[ 76 ]}皇帝は権力の絶頂に留まった。

その間、親帝国派のギベリン派の都市フェラーラは陥落し、フリードリヒは北へ進軍してラヴェンナを占領し、さらに長期の包囲戦の末、ファエンツァをも制圧した。ホーエンシュタウフェン家の権力が崩壊した後もギベリン派の立場を貫いていたフォルリの人々は、ライバル都市の占領の際に忠実な支援を提供した。感謝の印として、フォルリの市民は、ホーエンシュタウフェン家の鷲を市章に加えるなどの特権を与えられた。このエピソードは、独立都市が帝国と教皇の対立をいかにして自らの利益を最大限に引き出す手段として利用したかを示している。

この時、グレゴリウスは譲歩を検討した。^{[ 77 ]}休戦が成立し、和平交渉が始まった。直接和平交渉は最終的に失敗に終わり、グレゴリウスは総評議会を招集した。しかし、フリードリヒとその同盟軍は、ジェノヴァ艦隊でローマに向かう聖職者の使節団をジリオの戦い（1241年）で襲撃し、ほぼすべての高官を捕らえ、数千人の捕虜と艦隊の大部分を奪取し、グレゴリウスの総評議会計画を頓挫させた。^{[ 78 ]}皇帝は、この勝利を神の裁きであり、グレゴリウスによる迫害の違法性に対する象徴であると宣言した。

フリードリヒはその後、ローマと教皇に向けて軍を進め、進軍しながらウンブリアを焼き払い破壊した。そして、皇帝の軍がローマを攻撃する準備が整ったまさにその時、グレゴリウスは1241年8月22日に死去した。ローマへの攻撃は失敗に終わるだけでなく、ヨーロッパ全体における彼の主張に対する認識を損なう可能性があると認識したフリードリヒは、軍を撤退させ、ジリオで捕らえた2人の枢機卿、トネンゴのオットー（彼と親交を深め、忠実な同盟者にした）とペコラーラのジェームズをカプアの牢獄から解放することで、戦争はローマ教会ではなく教皇に向けられたものであると示そうとした。その後、フリードリヒは新しい教皇の選出を待つためにレグノへ向かった。 ^{[ 79 ]}それでも、ローマと教皇庁への直接攻撃からの撤退とされる彼の行動は、冷笑的な策略であることが判明した。

南部に拠点を置くフリードリヒは、教皇選挙に積極的に介入した。教皇座空位の間、皇帝軍はローマを包囲し続け、皇帝の利益に敵対的であることが知られていた枢機卿選帝侯たちの到着を阻止した。合意に達することができなかった枢機卿たちは、ローマの市当局によってセプタソリウムと呼ばれる修道院に閉じ込められ、最終的に1241年10月下旬、彼らのうち最も高齢で虚弱な一人であるゴッフレード・ダ・カスティリオーネが選出された。

新教皇チェレスティーヌ4世は、皇帝の意向により協力的であった。しかし、修道院内の状況が、翌11月の選挙後まもなく彼の死につながったようである。チェレスティーヌ4世の死後、半島での戦争が再開し、枢機卿たちは1年半以上も散り散りになり、その後アナニに集まって新たな教皇を選出した。皇帝は教皇の空位を利用して、ロンバルディアの抵抗都市の一部を除いてイタリアの大部分で自らの優位性を確立し、新たに統一されたイタリア・シチリア帝国の統治体制を強化した。フリードリヒは依然として権力の絶頂にあり、教皇選挙のプロセスを意図的に長引かせようとしたことは、重要な節目となった。この出来事は、中世後期に数多く見られた長期にわたる教皇空位の最初の事例であり、帝国と教皇権の間の闘争の中で、後者の露骨な二極化が着実に進行していったことを示している。そして、これは14世紀までに教皇権がフランス王権に事実上吸収されるという結果に至った。

1241年から1242年にかけて、モンゴル帝国の軍勢はハンガリーとポーランドの軍勢を決定的に打ち破り、両国の田園地帯と要塞化されていない集落を全て荒廃させた。ハンガリー王ベーラはフリードリヒに援軍を求めたが、フリードリヒはベーラが教皇側に立って自分に敵対していたため、しばらく前からハンガリー王と対立しており、大規模な軍事遠征に安易に着手したくなかったため、これを拒否した。^{[ 80 ]}彼はハンガリーに侵攻することを望まず、モンゴルの侵攻に備えて有力者や他の君主たちを統合しようと努めたものの、特に「アルプスのこちら側」での帝国の防衛を誓った。^{[ 81 ]}

フリードリヒはモンゴルがもたらす危険を認識しており、状況を厳しく評価したが、同時にそれを教皇庁に対する交渉材料として利用し、自らをキリスト教世界の守護者として位置づけようとした。^{[ 82 ]}フリードリヒはモンゴル人を裏切り者の異教徒と呼んだが、彼らの功績、特に有能な指揮官と厳格な規律と服従について聞いた後、モンゴルの軍事力に賞賛の意を表し、後者が彼らの成功の最大の源泉であると判断した。^{[ 83 ]}モンゴルがハンガリーを襲撃している間、彼はドイツ全土で徴兵を行った。1241年半ば、モンゴルがドナウ川東岸の土地に集中し、ハンガリーの抵抗をすべて打ち砕こうとしている間、フリードリヒは軍隊をそれぞれの拠点に分散させた。その後、彼は家臣たちに防御を強化し、防御態勢を取り、多数の弩兵を集めるよう命じた。^{[ 84 ]}

年代記作家によると、フリードリヒはバトゥ・ハーンから服従の要求を受けたが、それを無視したという。^{[ 85 ]}フリードリヒ2世はモンゴルの活動について常に最新の情報を把握していたようで、1241年6月付の皇帝の手紙には、モンゴルが略奪したハンガリーの鎧を使用していると記されている。^{[ 86 ]} 6月20日、ファエンツァで皇帝は回勅「タルタロスに対する反逆」を発布し、キエフの陥落、ハンガリー侵攻、ドイツへの脅威を告げ、キリスト教国それぞれにキリスト教世界の防衛のために適切な兵力と武器を投入するよう求めた。^{[ 87 ] [ 88 ] [ 89 ] [ 90 ]}パリのマシューの回勅の写しによれば、それはフランス、スペイン、ウェールズ、アイルランド、イングランド、シュヴァーベン、デンマーク、イタリア、ブルゴーニュ、アプリア、クレタ、キプロス、シチリア、スコットランド、ノルウェーといったカトリック諸国に宛てられ、それぞれが自国のステレオタイプに従って宛てられていた。^{[ 91 ] [ 92 ]}サン・ジェルマーノのリチャードは、写しが西方のすべての君主に送られたと述べ、フランス国王への手紙の冒頭を引用している。^{[ 93 ]}回勅の中で、フリードリヒはハンガリーの服従を皇帝として受け入れたと述べている。^{[ g ]}フリードリヒが書いた別の手紙は、1241年6月20日付で『帝国の統治』に収められており、シュヴァーベン、オーストリア、ボヘミアのすべての家臣宛てのもので、いくつかの具体的な軍事指示が含まれていた。彼の軍隊はモンゴル軍との野戦を避け、すべての要塞と砦に食料備蓄を蓄え、可能な限りの徴募兵と一般市民を武装させることになっていた。^{[ 95 ]}

スプリトのトーマスは、イタリアを含む神聖ローマ帝国全土で城や都市の要塞化が盛んに行われたと述べている。^{[ 96 ]}オーストリア公フリードリヒ2世は、皇帝の指示に従ったのか、あるいは自らのイニシアチブによるのかは不明だが、国境の城を自費で強化した。^{[ 97 ]}ボヘミア王ヴァーツラフ1世は、すべての城を強化して物資を供給したほか、修道院に兵士と武器を提供して、民間人の避難所とした。^{[ 98 ]}

モンゴル軍の偵察攻撃は神聖ローマ帝国の国境地帯で現実のものとなった。クロツコ近郊での小競り合いでモンゴル軍は撃退され、ウィーン近郊での戦闘ではモンゴル軍300～700人が死亡、オーストリア軍の損害は100人（オーストリア公による）であった。また、モンゴル軍の襲撃部隊はマルヒ川の国境まで追い詰められた後、テーベン地方でオーストリア騎士団によって壊滅させられた。神聖ローマ帝国がモンゴルの標的となったため、フリードリヒ2世はモンゴル帝国に対する十字軍を組織するためにイングランドのヘンリー3世とフランスのルイ9世に書簡を送った。 ^{[ 99 ]} 本格的な侵攻は起こらず、モンゴル軍は翌年ハンガリーを略奪した後撤退した。^{[ 100 ]}モンゴル軍がハンガリーからロシアへ撤退した後、フリードリヒはイタリア問題に再び注意を向けた。モンゴル人がヨーロッパに存在することによってもたらされる危険性は、 1245年の第1回リヨン公会議で再び議論されたが、フリードリヒ2世は教皇庁との対立の中で、まさにその公会議によって破門され、最終的にモンゴル帝国に対する十字軍の可能性を断念した。

1243年6月25日、新しい教皇インノケンティウス4世が選出された。彼はジェノヴァの貴族の家系で、ギベリン派に同情的で、帝国側に親戚もいた。しかし、インノケンティウスは後に彼の最大の敵となる。フリードリヒは当初、彼の選出を喜んだが、和解の見通しについては内心悲観的だったようだ。後に彼は「教皇はギベリン派であってはならない」と苦々しく叫んだと伝えられている。^{[ 101 ]}それにもかかわらず、フリードリヒはイタリア半島全体に広がる統一された帝国イタリア国家の計画を推し進め続けた。すでに1240年には、帝国イタリアと彼のシチリア王国をより正式な行政システムに統合するプロセスを開始する勅令を発布していた。 1243年半ば、皇帝はギベリン派の都市シエナで議会を開き、フリードリヒがそれまでに行った努力やメルフィ憲章に沿って、この統一イタリア・シチリア政権のための広範な憲法上の枠組みを策定した。^{[ 102 ]}統一イタリア行政システムの構築に向けた作業は、これから起こる挫折に直面しても、その後数年間着実に続けられた。

1243年の夏、インノケンティウス4世との和解交渉が始まったが、ヴィテルボの反帝国派の地元枢機卿ラニエリの扇動によりヴィテルボが反乱を起こし、関係は急速に悪化した。フリードリヒはローマ近郊の主要拠点を失うわけにはいかなかったので、ヴィテルボを包囲した。^{[ 102 ]}インノケンティウス4世は反乱軍を説得して和平に署名させ、フリードリヒは駐屯軍を撤退させることに同意した。しかし、撤退中にラニエリが市内の反乱軍を扇動し、11月13日に帝国軍の駐屯軍は虐殺された。フリードリヒは激怒したが、それでも和平条約に署名したが、それはすぐに破られた。新教皇は今やフリードリヒに断固反対していることを示した。インノケンティウス1世は、自身によって新たに任命された多くの枢機卿たちと共に、ジェノヴァのガレー船でリグリア地方へ逃れ、1244年12月7日に到着した。彼の目的は、翌年後半に彼が招集した新しい教会会議のあるリヨンにたどり着くことだった。 ^{[ 102 ]}

評議会は出席者が少なく、当初は妥協で終わるかと思われたものの、フリードリヒに対する中傷的なパンフレットを多数出版したラニエリの介入（その中で彼は皇帝を異端者、反キリストと定義した）により、聖職者たちはより妥協的でない解決策へと向かった。^{[ 102 ]}フリードリヒはリヨンに行って自ら弁明する意向のようだったが、皇帝のカリスマ的な評判、権力、影響力のため、インノケンティウスはフリードリヒが評議会を左右することを恐れてこれを許さなかった。^{[ 103 ]} 1か月後、フリードリヒの使者がリヨンに到着する前に、インノケンティウス4世はフリードリヒを皇帝の座から追放したと宣言し、彼を「バビロンのスルタンの友」、「サラセン人の習慣」、「宦官に守られたハーレムを持つ」ビザンツ帝国の分裂皇帝のような人物、つまり「異端者」と評した。^{[ 104 ]}皇帝の不当な「追放」は他のヨーロッパの君主たちを驚愕させ、傲慢な教皇の干渉にうんざりしていた彼らは、誰もインノケンティウスに意味のある支援をしなかった。皇帝に同情的だったルイ9世は、フランスへの入国を求めるインノケンティウスの要請を拒否し、フリードリヒとの教皇戦争の資金を調達するための教会の募金の増加に対するイングランドの不満に駆られたイングランドのヘンリー3世は、ガスコーニュへの移住を求めるインノケンティウスの嘆願を拒否した。フランス、ドイツ、イングランド、そしてイタリア国内の一部の聖職者の間でも、フリードリヒの「廃位」と皇帝に対する十字軍の説教に対する不満が高まっていた。しかしながら、インノケンティウス4世は教皇と皇帝の争いを全てか無かの戦いとし、それがまず（フリードリヒの死後）帝国の権力を、そして最終的には教皇権の権力をも滅ぼすことになった。教皇権は頑固な旗印を掲げた。^{[ 102 ]}

フリードリヒは、あらゆる手段を駆使してこの難題に立ち向かい、他の君主たちに回勅を送り、教皇の非難を一つ一つ詳細に反論する比較的効率的な「宣伝機関」を持っていたようで、彼の代理人はヨーロッパ各地の宮廷で皇帝の主張を直接弁護した。^{[ 105 ]}皇帝は1245年の春先にヴェローナで帝国議会を招集しており、当時破門されていたにもかかわらず、多くの出席者が集まり、そこで皇帝は帝国諸侯によるインノケンティウスの不当な廃位を広く非難する勅令を発布した。これと、フリードリヒが他のヨーロッパの君主たちにインノケンティウスの虚偽と二枚舌を説得しようとした努力が、リヨン公会議の出席者の少なさに何らかの影響を与えたようだ。^{[ 102 ]}しかし、教皇庁との争いが和解の見込みもなく始まった今、フリードリヒ自身は、古代末期以来のどの人物よりも、帝国とローマそのものの唯一無二の「個人的な使命」となった。争いによって鍛えられた彼の統治のすべては、今や本質的に彼と結びついていた。これからの数年間の緊張は、彼を最も専制的で絶対主義的、そして冷酷な人物として示すことになるだろう。リヨンでの党派的な廃位への報復として、フリードリヒはシチリアとイタリアの聖職者の中から、インノケンティウスの支持者を見つけ次第粛清した。イタリア全土で、彼は教皇の支援を受けているか否かを問わず、あらゆる反対の兆候を標的に恐怖のキャンペーンを展開した。彼の報復は残忍で、フリードリヒは「私は長い間金床であったが…今こそハンマーとなる」と宣言したと言われている。^{[ 106 ]}

1246年、インノケンティウス1世は、皇帝の友人であり、教皇の義弟であるオルランド・デ・ロッシの支援を受けて、フリードリヒ2世とエンツォ3世を殺害する陰謀を企てたとされる。フリードリヒ2世の暗殺は、イタリア全土で皇帝支配に対する大規模な反乱の引き金となるはずだった。しかし、皇帝がグロッセートに滞在中に、陰謀者の一人であるジョヴァンニ・ダ・プレセンツァーノが裏切り、カゼルタ伯リッカルド・サンセヴェリーノによって陰謀者たちの正体が暴かれた。陰謀の首謀者たちは、皇帝の最も親しい友人や高官たちだった。フリードリヒ2世はこの陰謀に容赦なく対処した。彼の部下たちは陰謀者たちを追跡し、彼らが隠れ家としていたチレント、サラ・コンシリーナ、アルタヴィッラの拠点を破壊した。陰謀者たちの最後の一団は、1246年の夏の大半をカパッチョ城でフリードリヒの軍勢に抵抗したが、水不足のため降伏を余儀なくされた。数百人の陰謀者が捕らえられ、盲目にされ、身体を切り裂かれ、生きたまま焼かれたり絞首刑に処されたりし、その家族は投獄されるか奴隷として売られた。サンセヴェリーノ家をはじめとする陰謀者たちの所領の多くは王室に没収された。陰謀は完全に鎮圧され、シチリア王室は既に広大な領土をさらに拡大した。ラニエリ枢機卿の指揮下でシチリア王国に侵攻しようとした試みは、スポレートの帝国代理であるマリーノ・ディ・エボリによってスペッロで阻止された。陰謀を暴いた忠実さに対して、フリードリヒは非嫡出子のヴィオランテ（1248年）をリッカルド・サンセヴェリーノと婚約させた。

教皇の支援を受けた暗殺計画にもかかわらず、フリードリヒはレグノ（イタリア王国）においてさらに強力な専制君主となり、イタリア中部とロンバルディアの大部分に対する支配力は依然として強固であった。しかし、この暗殺計画は皇帝にとって個人的な打撃となり、部下に対する疑念を深め、息子たちにますます頼るようになった。エンツォはすでにロンバルディアにおける父の最高代理人であり、アンティオキアのフリードリヒはトスカーナの帝国代理に任命された。

インノケンティウス1世は、ドイツにおけるフリードリヒの権力を打倒するために、ドイツに資金を送った。ケルン大司教とマインツ大司教はフリードリヒの廃位を宣言し、1246年5月、テューリンゲン方伯ハインリヒ・ラスペが教皇の支援を受けた対立王に選ばれた。1246年8月5日、ハインリヒ・ラスペは教皇の資金援助のおかげで、フランクフルトの戦いでフリードリヒの息子コンラートの軍隊を破ることに成功した。しかし、フリードリヒは後継者なく死去したオーストリア公国と、財産を失ったバーベンベルク家の莫大な財宝を獲得し、南ドイツにおける地位を強化した。1年後、ハインリヒ・ラスペが死去し、インノケンティウス1世はホラントのヴィルヘルム2世を新たな教皇支持の対立王に選んだが、皇帝の死まで、ヴィルヘルム2世への支持はドイツではごくわずかで、概して効果はなかった。

1247年2月から3月にかけて、フリードリヒはテルニでの議会でイタリア情勢を整理し、親族や友人を各地の代理に任命した。その中には、非嫡出子の一人であるキエーティのリチャードも含まれており、スポレートの帝国代理に任命された。彼は息子のマンフレッドをアメデオ・ディ・サヴォイアの娘と結婚させ、リヨンへのアルプス峠を確保し、モンフェッラート侯爵の服従を強要した。オッタヴィアーノ・デッリ・ウバルディーニの指揮下にある教皇軍はロンバルディアに到達することはなく、皇帝は大軍を率いてトリノで再び議会を開いた。インノケンティウスは再びフランス国王ルイ9世に保護を求めたが、国王は一貫してこれを拒否し、代わりにフリードリヒがレバントでの十字軍計画を自由に支援できるような和平を仲介することを望んでいた。しかし、ルイはまた、リヨンでフリードリヒがインノケンティウスに対して直接攻撃することは決して認めないと警告した。それにもかかわらず、リヨンは厳密には帝国の都市であり、フリードリヒはアルプス山脈を越えてイノセントと直接対決するために遠征隊を率いる態勢を整えていた。

予期せぬ出来事が状況を劇的に変えることになった。1247年6月、ロンバルディアの重要な都市パルマは皇帝の役人を追放し、ゲルフ派に味方した。エンツォは市内にいなかったため、父に助けを求めることしかできなかった。父は友人のヴェローナの暴君エッツェリーノ3世ダ・ロマーノと共に戻ってきて反乱軍を包囲した。包囲された人々は飢餓で降伏するのを皇帝が待つ間、苦しい日々を送った。皇帝は城壁の周囲に「ヴィットリア」と名付けた木造の都市を建設させた。

1248年2月18日、フリードリヒが狩りに出かけている間に、陣営は突然襲撃され占領された。そして、続くパルマの戦いで、皇帝軍は敗走した。シチリア大裁判官であり、重要な皇帝顧問であったタッデオ・ダ・スエッサはこの戦いで戦死した。フリードリヒはまた、帝国の財宝を失い、反乱を起こしたコムーネに対する当面の攻勢の勢いも失い、少なくともその年の残りの期間は、リヨンへの攻撃を断念せざるを得なくなった。これを察知したインノケンティウスは、シチリアへの十字軍遠征の計画を立て始めた。

フリードリヒはすぐに回復し、軍隊を再建したが、パルマ郊外での敗北は、彼の政権の財政的負担に耐えられなくなった多くの都市で抵抗を促し、ロマーニャ、マルケ、スポレートの一部が一時的に失われた。1248年5月、フリードリヒの非嫡出子であるキエーティのリチャードは、教皇派のフーゴ・ノヴェッルス率いる教皇軍をチヴィタノーヴァ・マルケ近郊で破り、マルケとスポレートの一部を奪還した。6月にピエモンテに拠点を置いたフリードリヒは、宮廷に北イタリアの多くの貴族や外国の王からの使節を招き、ロンバルディアにおける帝国の権威の再建に精力的に取り組んだ。彼の活動の規模は、彼の廃位もパルマでの敗北も、彼の名声や卓越性を損なわなかったことを示しているようだ。^{[ 107 ]}フリードリヒの比較的迅速な回復は、パルマでの敗北が決定的なものではなく、ロンバルディアでの戦争が根本的に断続的で局地的なものであったことを示している。^{[ 108 ]}それにもかかわらず、フリードリヒは精力的な、いや容赦ない努力によってのみ、1248年末までに状況を安定させ、約13万オンスの金を集めて国庫を補充することができた。^{[ 109 ]}

フリードリヒは自信を保っていたが、数年にわたる戦争の後、疑心暗鬼になり、疲弊していった。フリードリヒの愛人ビアンカ・ランシアは、1248年のある時点で亡くなったようだ。フリードリヒは1246年に彼女と結婚したと伝えられているが、彼女の要求^{[ 110 ] [ 111 ]}と、おそらくマンフレッドを嫡出子として認め、彼を後継者候補に加えるため^{[ 112 ] 、彼女との間に生まれた子供たちを嫡出子として認めることに同意したようだ。}

1249年2月、フリードリヒは、顧問兼首席大臣であり、著名な法学者で詩人でもあったピエル・デッレ・ヴィーニェを、横領と窃盗の罪で解任した。歴史家の中には、ピエルが皇帝を裏切る計画を立てていたと推測する者もおり、パリのマシューによれば、皇帝はその陰謀を知って涙を流したという。ピエルは盲目にされ、鎖につながれた状態でピサで亡くなったが、おそらく自殺だったと思われる。

フリードリヒにとってさらに衝撃的だったのは、1249年5月のフォッサルタの戦いでエンツォがボローニャ軍に敗れ捕らえられたことだった。春の初め、皇帝はロンバルディアの最後の抵抗勢力を最終的に鎮圧し、リヨンのインノケ​​ンティウスに攻め込むことを期待して大軍を集めた。フリードリヒは挟撃作戦を計画し、エンツォが軍の一部を率いてボローニャ軍を撃破する一方、主力軍はロンバルディア中部へと北上を続けた。皇帝率いる主力軍はエミリア・ロマーニャの広範囲を制圧し、ロンバルディア中部の大部分は依然として帝国領であったが、フォッサルタでのエンツォの敗北により作戦は中断された。エンツォはボローニャの宮殿に幽閉され、1272年に亡くなるまで捕虜として過ごした。キエーティのリチャードも1249年に戦死したが、おそらく同じ戦いで戦死したと思われる。しかし、この戦いは政治情勢を大きく変えることはなく、皇帝は依然として比較的優位な立場にあったものの、有能な副官であったエンツォの捕縛とキエーティのリチャードの死は、フリードリヒにとって大きな個人的な痛手となった。彼は捕虜となったエンツォの後任としてマンフレートをイタリア総督に任命した。ボローニャの人々は皇帝による息子の身代金要求を一切拒否し、ボローニャはミラノとともに北イタリアで最も強固なゲルフ派の都市の一つであり続けた。

総じて言えば、1249年は皇帝の運命のどん底であり、帝国の地位がいかに彼自身に依存していたかを如実に示した年であった。疲弊しながらも持ち前の不屈の精神で、フリードリヒはロンバルディア中部に軍の一部を指揮官に任せ、南部へと戻り、そこで生涯を終えた。

イタリアとドイツにおける教皇庁とその同盟勢力との戦いは続いた。コモは失われ、モデナは一時的にゲルフ派に占領された。しかし、1249年末から1250年初頭にかけても、状況は次第にフリードリヒに有利に傾いていった。年初、枢機卿ピエトロ・カポッチの指揮の下、シチリア王国侵攻のために派遣された軍隊は、マルケ地方のチンゴリの戦いで、フリードリヒの副官であるパレリア伯ウォルターと皇帝傭兵隊によって壊滅させられた。彼らは再びロマーニャ地方、マルケ地方、スポレートのほぼ全域を奪還した。5月下旬には、不屈のヴィテルボのラニエリが死去し、イタリアにおける教皇派の指導者は皇帝の容赦ない敵を失った。ギベリン派のマンフレディ家はファエンツァを保持し、バニャカヴァッロ伯はラヴェンナを皇帝のために奪還した。^{[ 113 ] : 164}ヴィテルボは以前の離反以来奪還され、ウンブリア、アンコーナ県、ロマーニャの大部分はより安全になったように見えた。ドイツでは、コンラートはホラントのウィリアムに対していくつかの勝利を収め、教皇派のライン大司教に休戦協定に署名させた。

ドイツ、イタリア、そしてヨーロッパ全土で教皇派への支持が急速に衰退するにつれ、インノケンティウス4世はますます孤立していった。トスカーナの皇帝代理でありフィレンツェのポデスタであったアンティオキアのフリードリヒは、強引ではあったが効果的な手段によってこの地域を比較的安定させていたが、トスカーナのギベリン派の忠誠心は実利的であり、フィレンツェの忠誠心は流動的であった。これは、同年後半に皇帝が亡くなる直前に、フィレンツェのゲルフ派がアンティオキアのフリードリヒを追放したことからも明らかである。ピアチェンツァは皇帝に忠誠を誓い、ロンバルディアの皇帝代理であるオベルト・パラヴィチーノはパルマを破り、ゲルフ派を追放し、ロンバルディア中央部の広範囲を奪還した。エッツェリーノ・ダ・ロマーノは、ヴェローナ、ヴィチェンツァ、パドヴァ、トレヴィザ辺境伯領、そしてロンバルディア東部の大部分を支配下に置き、ベッルーノとエステを占領した。ロンバルディア同盟の都市のうち、抵抗を続けたのはミラノ、ブレシア、ボローニャのみであった。

前年に寝返ったモデナなどのいくつかの都市はギベリン派の支持者による奪還の機が熟しており、多くの都市が再び忠誠を変えた。ジェノヴァはサヴォーナ近郊で帝国軍に海戦で敗北した後、フリードリヒの同盟軍に脅かされ、ヴェネツィアのインノケ​​ンティウスと同盟への支持は弱まった。同盟の攻撃部隊は1237年のコルテヌオーヴァでの敗北から完全には回復しておらず、抵抗はミラノやボローニャなどの主要都市に限られていた。しかし、その年の皇帝の急速な成功により、ボローニャの人々でさえ、不本意ながらも落胆して和平を懇願せざるを得なくなった。イタリア全土で、帝国の鎖の輪が回復し、締め付けられているように見えた。^{[ 113 ] : 164}大規模な離反は止まり、教皇庁はイタリアで皇帝に対する戦争を維持する能力がないことが示された。^{[ 114 ]}

しかし、帝国の見通しが明るくなったとはいえ、イタリアの広大な地域は長年の戦争で荒廃しており、同盟軍の防衛施設によって主要都市への攻撃は困難を極めていた。とはいえ、イタリア全土における帝国の復興は心強いものであったが、ロンバルディア地方で最も強力な都市、特にミラノとボローニャ（どれほど孤立していたとしても）との戦いは、多くの点で膠着状態にとどまっていた。帝国の復興には、相当なコストも継続的にかかった。戦争の要求により、皇帝はここ数年でますます高い税金を課さざるを得なくなり、裕福で繁栄していたレグノの財源さえも逼迫していた。フリードリヒが新たに統一したイタリアとシチリアの政権は専制的で搾取的であり、厳しい税金を課し、可能な限りあらゆる場所で反対意見を容赦なく弾圧した。それでもなお、彼の行政システムが過去数年間の挫折にもかかわらず着実に回復してきたことは、驚くべき偉業であり、彼の巧みな政治手腕の証である。

フリードリヒは、1250年の戦役には総司令官としてのみ参加し、それ以外の作戦には一切関与しなかった。彼は病に伏し、シチリア王国に退き、その年の大半をそこで過ごした。1250年12月13日、フリードリヒは赤痢の発作が長引いた後、プーリアのカステル・フィオレンティーノ（トッレマッジョーレ領）で急逝した。晩年に裏切りや挫折、そして運命の浮き沈みに直面したにもかかわらず、フリードリヒは安らかに息を引き取り、伝えられるところによればシトー会修道士の服を着ていたという。父の​​死について、マンフレートはドイツのコンラートに「正義の太陽は沈み、平和の創造者は逝去した」と書き送った。^{[ 115 ]}

フリードリヒの死の時点で、ヨーロッパにおける彼の卓越した地位は挑戦を受けたものの、失われてはいなかった^{[ 116 ]。}衰えていたのは皇帝の運命ではなく、彼の敵の運命だったからである。ヨーロッパのどの君主も彼の廃位を受け入れず、インノケンティウス4世に意味のある支援も提供しなかった。過去2年間の挫折の後でも、皇帝の威信は比較的衰えていなかった。これに加えて、フリードリヒの王国における権力は依然として強固であった。イタリアとドイツの大部分に対する彼の支配は依然として強固であった。政治情勢は流動的であり、1250年の勝利によってフリードリヒは再び優位に立った。

あらゆる場所で、インノケンティウスの運命は悲惨なものに見えた。教皇庁の財政は枯渇し、対立王ホラント公ウィリアムはドイツでコンラートに敗れていたが、ホーエンシュタウフェン家の支持と南ドイツにおける勢力基盤は、フリードリヒの死と後継者たちの死後崩壊して崩壊していた。イタリアでは、フリードリヒの副官とパルチザンが過去2年間に失った領土の多くを奪還しており、彼は有利な立場にあり、新年にはリヨンへの進軍を準備していた。王国に課せられた経済的負担にもかかわらず、ニカイア皇帝ヨハネス3世ドゥーカス・ヴァタツェスの支援により、フリードリヒは財政を回復し、軍隊を補充することができた。この勢いを止めたのは、彼の死だけであった。

彼の遺言では、コンラートに帝国とシチリアの王冠、そして聖地の維持のためにコンラートの裁量で使用できる10万オンスの金が遺贈された。マンフレートはタラント公国、1万オンスの金、そして異母兄弟がドイツに留まる間、シチリアとイタリアの摂政権と完全な帝国の権限を与えられた。フリードリヒとイングランドのイザベラの息子であるハインリヒ・カール・オットーは1万オンスの金とアルル王国またはエルサレム王国を受け継ぎ、皇帝と同名の孫であるフリードリヒ（ハインリヒ7世の息子）はオーストリア公国とシュタイアーマルク辺境伯領を託された。コンラートとインノケンティウスの間での和平交渉の礎を築くため、あるいは教皇の彼に対する偏見をさらに示すための最後の策略として、フリードリヒの遺言には、彼が教会から奪ったすべての土地を教会に返還し、大逆罪を犯した者を除くすべての囚人を釈放し、帝国の威信を損なわない限り税金を減免するという条項が含まれていた。彼の死後、ホーエンシュタウフェン帝国はヨーロッパにおける主要勢力であり続け、その安全は彼の息子たちによって確保されているように見えた。^{[ 72 ]}

フリードリヒの石棺（赤色斑岩製）は、パレルモ大聖堂に、両親（ヘンリー6世とコンスタンス）と祖父であるノルマン王ロジャー2世（シチリア王）の石棺の隣に安置されている。19世紀に石棺が開けられた際、彼はトゥルス様式の銘文入りの袖口が付いた葬儀用アルバを着用しており、大英博物館のコレクションには、葬儀用冠の小さな破片など、さまざまな品々が収蔵されている。 ^{[ 117 ]}

フリードリヒ2世は、教皇庁やイタリアとドイツの同盟国との対立が解決されなかったにもかかわらず、死後も依然として根本的な支配権を維持していた。1250年に帝国の勢力が全体的に著しく回復したことは、彼の明らかな個人的優位性を裏付けたように思われる。実際、彼の突然の死の衝撃は、おそらく、彼が帝国権力の「完全な栄光」の中で巨人のように時代を闊歩していたという当時の感覚を象徴していたのだろう。^{[ 118 ]}しかし、彼の治世の壮大さにもかかわらず、まずシチリア、次にイタリアとドイツをより緊密な帝国統一に結びつけようとする彼の「ヘラクレス的」な努力は、最終的に彼の王朝の崩壊とともに無駄に終わった。^{[ 119 ]}フリードリヒは不可能なことを試み、あり得ないことを成し遂げた。彼が活動した非常に複雑で多面的なレベル、そして非常に長い間、非常に激しい対立に対抗したことを考えると、彼の功績は重大である。彼の王朝とホーエンシュタウフェン帝国の最終的な失敗にもかかわらず、彼が成し遂げたことの規模は、彼の並外れた能力と粘り強さを示しており、おそらく中世のすべての支配者の中で彼の個性を際立たせている。^{[ 120 ]}しかし、それは脆弱な遺産であり、その後の数年間で大部分が崩壊した。

フリードリヒの地位は、特に教皇庁がホーエンシュタウフェン王朝全体の滅亡を企てていたため、後継者にとって継承不可能な遺産であることが判明した。それでも、皇帝の最後の年に帝国が拡大したことを考えると、コンラートはシチリア王国を確保すれば父の跡を継ぎ、帝位に就くことができるように思われた。父の以前の計算と同様に、コンラートはまず王国での支配を固める方が良いと判断し、1252年にドイツを離れて南イタリアで権威を確立しようとした。この決定は実利的ではあったものの、アルプス以北のホーエンシュタウフェン領を脆弱な状態に置いた。1254年までに、コンラートは王国での権力を固め、ローマに戻りイタリアで反ホーエンシュタウフェン反乱を扇動し続けていたインノケンティウス4世を最終的に打ち負かす態勢を整えたように見えた。しかし、コンラートはマラリアで急死し、ホーエンシュタウフェン朝はドイツで権力を失い、ルドルフ・フォン・ハプスブルクがドイツ王位に就く1273年まで続く大空位時代が始まった。インノケンティウス4世もその直後の1254年に死去した。後継者のアレクサンダー4世はホーエンシュタウフェン朝に反対したが、インノケンティウス4世ほど有能な政治家ではなかったため、マンフレートは王国における自らの権威を確立しようと動き出した。

マンフレートは当初、ドイツにいるコンラートの息子、若いコンラディンの摂政として王国を統治したが、1258年にシチリア王位を継承した。教皇庁の敵意が続き、アレクサンデル4世とクレメンス4世によって破門されたにもかかわらず、マンフレートはその後数年間、イタリアで目覚ましい成功を収めた。フリードリヒ2世の子供たちの中で、おそらくエンツォを除けば、マンフレートは父親に最もよく似ており、才覚と知性の両方を示した。彼はまた、フリードリヒの文化的、知的嗜好を共有し、彼の宮廷は父親の壮麗さをある程度享受した。彼は有能で野心的な統治者であることを証明し、依然として強力な王国を維持し、その影響力を北はイタリアの他の地域に、東はギリシャにまで及ぼした。 1260年のモンタペルティの戦いでギベリンが大勝利を収めた後、マンフレートは半島の大部分で覇権を確立することに成功した。彼は父の地位に手が届くかに見えた。しかし、1266年に教皇の支援を受けたアンジュー家のシャルル率いる軍がイタリアに侵攻すると、イタリアにおけるマンフレートの影響力は大きく失われた。その後、ベネヴェントの戦いでマンフレートが戦死したことで、南イタリアにおけるアンジュー家の支配が何世代にもわたって始まった。コンラディンはマンフレートの死後、シチリア奪還を試みたが、1268年のタリアコッツォの戦いで敗北し捕らえられ、その後まもなくアンジュー家のシャルル1世によって処刑された。コンラディンの処刑と、1273年のエンツォの獄中死により、おそらく1世紀以上にわたってヨーロッパ政治の中心的存在であったホーエンシュタウフェン家の本流はついに終焉を迎えた。

アンジュー家の統治下、続く20年間で、ロジャー2世とフリードリヒ2世の偉大な王国は、シチリアの晩祷戦争によって崩壊し、本土領土とシチリア島が分断された。さらに、イタリアとドイツにおけるホーエンシュタウフェン家の勢力が完全に消滅したことで、フランスのカペー朝国王、特に専制君主フィリップ4世は、ラテンキリスト教世界における最高君主としての覇権を主張し始めた。反ホーエンシュタウフェン派の対立の直接的な結果として、教皇権とフランス王権の共存は次第に摩擦を生むようになった。この摩擦​​は、フィリップ4世が教皇ボニファティウス8世とイデオロギー的優位性をめぐって衝突した際に頂点に達した。数十年にわたる露骨な権力闘争と攻撃的な政治介入の後、教皇権の信頼性は低下した。フリードリヒ2世がインノケンティウス4世に対抗したのと同様に、フィリップ4世は反教皇プロパガンダを用いて教皇を攻撃し、より積極的なフランス王政を強化した。しかし、フリードリヒとは異なり、フィリップ4世のプロパガンダ活動は、過去数十年にわたる教皇の傲慢さに対するはるかに大きな反感を基盤としていたため、より強力だった。フィリップは容赦なくボニファティウスを破り、カペー朝寄りの教皇クレメンス5世を擁立した。フィリップはまた、傀儡教皇をローマからアヴィニョンに移し、事実上、教皇制そのものをフランス王冠に数十年間結びつけた。この時代はアヴィニョン教皇制として知られている。14世紀までに、ホーエンシュタウフェン家に激しく反対していた神聖ローマ帝国と帝国教皇制は、中世ローマの普遍主義の残骸の中に分裂していた。

最初の妻：アラゴンのコンスタンス（1179年 - 1222年6月23日）。^{[ 197 ]}結婚：1209年8月15日、シチリアのメッシーナにて。

• ヘンリー7世（1211年 - 1242年2月12日）。^{[ 197 ]}

2番目の妻：エルサレムのイザベラ2世（1212年 - 1228年4月25日）。^{[ 197 ]}結婚：1225年11月9日、プーリア州ブリンディジにて。

• マーガレット（1226年11月 - 1227年8月）。
• コンラート4世（1228年4月25日 - 1254年5月21日）。^{[ 197 ]}

3番目の妻：イングランドのイザベラ（1214年 - 1241年12月1日）。^{[ 197 ]}結婚：1235年7月15日、ドイツのヴォルムスにて。

• ヨルダン（1236年の春に生まれたが、その年を生き延びることができなかった）^{[ 198 ]}この子供はヨルダン川からその目的のために運ばれた水で洗礼を受けたため、ヨルダヌスという洗礼名を与えられた。
• アグネス（1237年生まれ、1237年没）。
• ヘンリー・チャールズ・オットー（1238年2月18日 - 1253年5月）は、叔父であるイングランド王ヘンリー3世にちなんで名付けられ、シチリア総督に任命された。父の死後、エルサレム王となることを約束されたが、彼自身も3年以内に亡くなり、戴冠式は行われなかった。教皇インノケンティウス4世の多くの姪と婚約したが、結婚はしなかった。
• マルガレーテ（1241年12月1日 - 1270年8月8日）は、テューリンゲン方伯アルベルト^{[ 199 ]}と結婚し、後にマイセン辺境伯となった。

• 名前は不明、シチリアの伯爵夫人。彼女の正確な血統は不明ですが、トーマス・トゥカスの『皇帝皇帝と教皇庁』 (1280 年頃) には、彼女がここシチリアの貴族であったと記載されています。
  • ペットラーノのフレデリック（1212/13年 - 1240年以降）は、1240年に妻と子供たちと共にスペインへ逃れた。
• ウルスリンゲンのアデルハイト（アデライデ）（1184年頃 - 1222年頃）。^{[ 200 ]}彼女とフリードリヒ2世の関係は、彼が1215年から1220年の間にドイツに滞在していた時期に起こった。いくつかの資料によると、^{[ 201 ]}彼女はフォブルクのアライタ（イタリア語：アライタ・ディ・マラノ）という名前でホーエンブルク家と関係があったが、最も広く受け入れられている説では、彼女はアッシジ伯およびスポレート公 コンラート・フォン・ウルスリンゲンの娘であるとされている。
  • サルデーニャのエンツォ（1215年 - 1272年）。^{[ 197 ]}ボローニャとフェラーラの有力なベンティヴォーリオ家は、彼の子孫であると主張した。
  • カテリーナ・ダ・マラノ（1216/18年 - 1272年以降）は、最初にNNと結婚し、次にノリとフィナーレの侯爵ジャコモ・デル・カレットと結婚した。
• アンティオキア出身のマチルダまたはマリア。
  • アンティオキアのフリードリヒ（1221年 - 1256年）。^{[ 197 ]}フリードリヒには最大8人の子供がいたとされているが、一次資料から特定できるのは2人か3人だけである。彼の息子コンラートは1301年まで生きていた。彼の娘フィリッパは1242年頃に生まれ、 1258年にマンフレディ・ランチャの侍従長マンフレディ・マレッタと結婚した。彼女はアンジューのシャルルによって投獄され、1273年に獄中で亡くなった。バルナボ・マラスピナの妻マリアも彼の娘であった可能性がある。^{[ 202 ]}
• ランチャ家の知られざる一員：^{[ 200 ]}
  • セルヴァッジャ(1221/23–1244)、エッツェリーノ 3 世 ダ ロマーノと結婚。
• マナ、パレルモ大司教ベラルド・ディ・カスターニャの姪: ^{[ 200 ]}
  • キエーティのリチャード（1224/25年 - 1249年5月26日）。
• アナイス・ド・ブリエンヌ（1205年頃 - 1236年）、エルサレム女王イザベラ2世の従姉妹：^{[ 200 ]}
  • ブランシュフルール（1226年 - 1279年6月20日）、フランス、モンタルジのドミニコ会修道女。
• ヴォルフゾーデンのリチナ (1205 年頃 - 1236 年): ^{[ 200 ]}
  • シュヴァーベンのマーガレット（1230年 - 1298年）、アセーラ伯トーマス・オブ・アキノと結婚。
• 正体不明の愛人：
  • コスケレのゲルハルト（1255年以降に死去）は、トゥライダのカウポの娘マグダレーナと結婚した。^{[ 203 ]}

フレデリックはビアンカ・ランチャ（1200/10年頃 - 1230/46年）^{[ 197 ]}と関係を持っており、おそらく1225年頃から始まったと思われる。ある資料によると、その関係は20年間続いたという。彼らには3人の子供がいた。

• コンスタンス (アンナ) (1230 – 1307 年 4 月)、ジョン 3 世デュカス・ヴァタッツェスと結婚。^{[ 197 ]}
• マンフレッド（1232年 - 1266年2月26日、ベネヴェントの戦いで戦死）^{[ 197 ]}は、初代摂政であり、後にシチリア王となった。
• ヴィオランテ（1233年 - 1264年）、カゼルタ伯リッカルド・サンセヴェリーノと結婚。

パリのマシューは、ビアンカが死にかけている時に、二人の間で結婚が成立したという話を語っているが、 ^{[ 204 ]}この結婚は教会によって認められることはなかった。それにもかかわらず、ビアンカの子供たちはフリードリヒによって嫡出子とみなされていたようで、娘コンスタンスがニカイア皇帝と結婚したことや、フリードリヒ自身の遺言でマンフレッドをタラント公およびシチリア摂政に任命したことがその証拠である。^{[ h ]}