原生生物の分類

オバゾア系統群には、鞭毛虫の小グループであるブレビアテス類とアプソモナス類、および動物、菌類、およびそれらに最も近縁な原生生物を含む大系統群オピストコンタ類が含まれる。 ^{[ 6 ]}キャバリエ・スミス分類体系では、ブレビアテス類とアプソモナス類はアプソゾア門を構成する2つの綱であったが、^{[ 4 ]}アプソモナス類はオピストコンタ類により近縁であるため、この分類群は側系統群である。^{[ 16 ]}アプソモナス類の分類は、多くの新属を導入した2022年の系統学的研究で拡張された。^{[ 19 ]}

• ブレヴィアテア 綱Cavalier-Smith 2004、ブレヴィアティダ目Cavalier-Smith 2004。属はどの科にも属さない：Lenisia。
  • ブレビアタ 科Cavalier-Smith 2013、ブレビアタ属、サブラトモナス属。
  • ピグスイ 科Cavalier-Smith 2022、ピグスイア属。

• 綱Thecomonadea Cavalier-Smith 1993 emend. 2013、目Apusomonadida Karpov & Mylnikov 1989、科Apusomonadidae Karpov & Mylnikov 1989。どの亜科にも割り当てられていない属: Amastigomonas、Multimonas、Podomonas、Catacumbia、Cavaliersmithia、Karpovia、Singekia。
  • Apusomonadinae 亜科Cavalier-Smith 2010、属Apusomonas (= Rostromonas )、Manchomonas。
  • 亜科Thecamonadinae Larsen & Patterson 1990、属Chelonemonas、Thecamonas。

アメーボゾア門には、主にアメーバ状の原生生物が約2,400種含まれています^{[ 33 ]}。^{[ 6 ]}この門には、すべてのアメーバをまとめる分類群である伝統的なサルコディナの大部分が含まれています。特に、裸アメーバと有殻葉状アメーバ（伝統的なロボサ）、アーカメーバ、真菌類（粘菌）、および少数の鞭毛虫が含まれます^{[ 34 ]} 。国際原生生物学会（ISOP）が2019年に発表した一般的な改訂^{[ 6 ]の後、真菌類[ 35 ]と有殻アメーバ[ 36 ]}の分類に具体的な改訂がありました。

アメーボゾア門ルーエ 1913 sensu Cavalier-Smith 1998。属incertae sedis : Belonocystis、Boveella、Biomyxa、Corallomyxa、Gibbodiscus、Hartmannia、Malamoeba、Malpighamoeba、Oscillosignum、Pseudothecamoeba、Rhabdamoeba、Schoutedamoeba、Stereomyxa、Subulamoeba、Triaenamoeba、ウンダ。^{[ 6 ]}

• 管状綱 Smirnov et al. 2005
  • Corycidia Kang et al. 2017 ^{[ 37 ]}
    • トリコシダ 目Möbius 1889、トリコスファエリ科Sheehan & Banner 1973 (=Trichosidae Möbius 1889 )、トリコスファエリウム属(= Atrichosa )。
    • ミクロコリキア 科デ・サデレール 1934 年、属Amphizonella、Diplochlamys、Microcorycia、Parmulina、Penardochlamys、Zonomyxa。^{[ c ]}
  • エキナモエビダ を注文するCavalier-Smith et al. 2004年末。スミルノフら。 2011年
    • エキナメーバ 科Page 1975、属Echinamoeba、Micriamoeba。
    • Vermamoeba 科（Cavalier-Smith & Smirnov 2011）、属：Vermamoeba。
  • エラルディア・カンら。 2017年^{[ 37 ]}
    • Leptomyxida属 の分類群（ Pussard & Pons 1976年改訂版、 1987年ページ）
      • 科Leptomyxidae Pussard & Pons 1976、属Leptomyxa。
      • Rhizamoebidae 科、Smirnov et al. 2016、Rhizamoeba属。^{[ 38 ]}
      • Flabellulidae Bovee 1970、Flabellula属^{[ 39 ]} (= Paraflabellula )。
      • ゲフィラモエバ 科（Gephyramoebidae Pussard & Pons 1976） 、ゲフィラモエバ属。^{[ 38 ]}
    • 上目Eulobosia Cavalier-Smith et al. 2016
      • オーダーEuamoebida Lepşi 1960 sensu Smirnov et al. 2011年
        • アメーバ 科Ehrenberg 1838 ページ 1987、属:アメーバ、カオス、ポリカオス、パラカオス、トリカメーバ、デューテラメーバ、ヒドラメーバ。
        • ハルトマネリ科 Volkonsky 1931、属Cashia、Copromyxa、Copromyxella、Glaeseria、Hartmannella、Ptolemeba、Saccamoeba。
        • ノーランデリ 科Cavalier-Smith 2011、Lahr & Katz 2011、ノーランデラ属。
      • アルセリニダケント 1880を注文します。属incertae sedis : Acipyxis、Apolimia、Armipyxis、Conicocassis、Cornuapyxis、Ellipsopyxella、Ellipsopyxis、Erugomicula、Frenopyxis、Geamphorella、Geoplagiopyxis、Geopyxella、Hoogenraadia、Jungia、Lagenodifflugia、ランプトピクシス、ラムトカドルラ、レプトクラミス、マグレビア、マイスターフェルディア、ミクロカドルラ、ナブラネラ、オーピクシス、パラセントロピクシス、パラカドルラ、ペンタゴニア、フィソキラ、プランホーゲンラディア、ポモリエラ、ポンティグラシア、プラントリティナ、^{[ 40 ]}前斜斜症,前斜斜症, Protocucurbitella、Pseudawerintzewia、Pseudonebela、Schoenbornia、Sexangularia、Suiadifflugia、Trigonopyxis、Wailesella、^{[ 36 ]} † Cangwuella。^{[ 41 ]}
        • 亜目Phryganellina Bovee 1985
          • 科Phryganellidae Jung 1942、属Phryganella。
          • 科Cryptodifflugiidae Jung 1942、属Cryptodifflugia。^{[ 42 ]}
        • 亜目Organoconcha Lahr et al. 2019、科Microchlamyiidae Ogden 1985、属Microchlamys (= Pseudochlamys )、Spumochlamys、Pyxidicula。
        • グルチノコンチャ 亜目Lahr et al. 2019年
          • 下目Cylindrothecina González-Miguéns, Todorov, Blandenier, Porfirio-Sousa, Ribeiro, Ramos, Lahr & Lara 2022、科Cylindrifflugiidae González-Miguéns, Todorov, Blandenier, Porfirio-Sousa, Ribeiro, Ramos, Lahr & Lara 2022、シリンドリフルギア属。
          • 下目Excentrostoma Lahr et al. 2019、科Centropyxidae Jung 1942 ( Plagiopyxidae Bonnet & Thomas 1960を含む)、属Awerinzewia、Bullinularia、Centropyxis、Frenopyxis、^{[ 43 ]} Golemanskia、Plagiopyxis。
          • 下目Hyalospheniformes Lahr et al. 2019、ヒアロスフェニ科Schulze 1877 年改正。 Kosakyan & Lara 2012 (=Nebelidae Taranek 1882 )、属Alabasta、Alocodera、Apodera、Certesella、Cornutheca、Gibbocarina、Hyalosphenia、Longinebela、Mrabella、Nebela、Padaungiella、Planocarina、Porosia、Quadrulella。
          • インフラオーダーLongithecina Lahr et al. 2019年
            • Difflugiidae Wallich 1864科、Difflugia属、Zivkovicia属。
            • Lesquereusiidae Jung 1942科、Lesquereusia属。
          • 下目Pyrumthecina Porfirio-Sousa、Gomes E Souza、Jones、Brown、Lahr & Tice 2025、Argynniidae Porfirio-Sousa、Gomes E Souza、Jones、Brown、Lahr & Tice 2025、Argynni属。^{[ 44 ]}
          • 下目Sphaerothecina Kosakyan, Lara & Lahr 2016
            • Arcellidae Ehrenberg 1843 年、 属Arcella、Galeripora。
            • Netzeliidae 科Kosakyan et al. 2016、Cucurbitella属、Cyclopyxis 属、Netzelia 属。
          • 下目Volnustoma Lahr et al. 2019、科Heleoperidae Jung 1942、属Heleopera、Metaheleopera。

• ディスコセア 綱（ Cavalier-Smith et al. 2004、Smirnov et al. 2011による定義）
  • サブクラスFlabellinia Smirnov et al. 2005年
    • スーパーオーダーダーメリア・ジョーンズ 他2025年^{[ 45 ]}
      • 目Mycamoebida Jones & Brown in Jones et al. 2025、科Mycamoebidae Jones & Brown in Jones et al. 2025、属Mycamoeba、Janelia、Microglomus。
      • Dermamoebida Cavalier-Smith 2004を注文してください。クドリャフツェフ、ヴォイチンスキー、ヴォルコワ 2022 ^{[ 46 ]}
        • 科Dermamoebidae Cavalier-Smith & Smirnov 2011、属Dermamoeba、Paradermamoeba、Coronamoeba。^{[ 46 ]}
        • マヨレリ科 シェーファー1926、マヨレラ属。
    • 超目Thecavania Jones et al. 2025 ^{[ 45 ]}
      • Stygamoebida Smirnov & Cavalier-Smith目、Smirnov et al. 2011 ^{[ 32 ]}
        • Stygamoebidae 科（ Smirnov & Cavalier-Smith in Smirnov et al. 2011） 、 Stygamoeba属。
        • 科Vermistellidae Cavalier-Smith in Cavalier-Smith et al. 2016、属Vermistella。^{[ 5 ]}
      • 目Thecamoebida ^{[ d ]} Schaeffer 1926 sensu Smirnov & Cavalier-Smith 2011、属Sappinia、Stenamoeba、Stratorugosa、^{[ 47 ]} Thecamoeba、Thecochaos。^{[ 48 ]}
      • 指指目^{[ d ]} Smirnov et al. 2005センス・カン他2017、クネア属、ジャニッキーナ属、コロトネベラ属、ネオパラメーバ属、パラメーバ属、シュードパラメーバ属、ベキシリフェラ属。
      • Vannellida Smirnov らを注文します。 2005、Vannellidae Bovee 科 1979、属Clydonella、Lingulamoeba、Paravannella、Pessonella、^{[ e ]} Ripella、Vannella。
  • セントラメービア亜綱Cavalier-Smith et al. 2016
    • Himatismenida目^{[ d ]} 1987 ページ、Cochliopodium、Ovalopodium、Parvamoeba属。
    • スーパーオーダーアカポステリアガルベス＝モランテ、バーニー & リヒター 2026 ^{[ 49 ]}
      • Acanthopodida目^{[ d ]} Page 1976 (=Centramoebida Rogerson & Patterson 2002 sensu Tice et al. 2016 )、^{[ 50 ]} Acanthamoeba属、Balamuthia 属、Luapeleamoeba 属、Protacanthamoeba 属、Dracoamoeba 属、Vacuolamoeba 属。
      • アポスタメーバ 目Gàlvez-Morante, Berney & Richter 2026、^{[ 49 ]}アポスタメーバ科アポスタメーバ科Gàlvez-Morante, Berney & Richter 2026、アポスタメーバ属
      • ペリティダ目^{[ d ]} Smirnov & Cavalier-Smith 2011 sensu Kang et al. 2017、属Endostelium、Gocevia、Paragocevia、Pellita。

• エボセア・カンら 2017
  • 綱：Cutosea Cavalier-Smith 2016、目：Squamocutida Cavalier-Smith 2016
    • 有鱗目エビ科Cavalier-Smith 2016、Armaparvus属、Squamamoeba属。
    • 科Sapocribridae Cavalier-Smith 2016、属Sapocribrum。
    • イディオネクテス 科Hess & Simpson 2019、イディオネクテス属。^{[ 51 ]}
  • ヴァリオセア 綱Cavalier-Smith 2004。下位クレードに分類されていない属: Angulamoeba、Arboramoeba、Darbyshirella、Dictyamoeba、Ischnamoeba、Heliamoeba、Filamoeba、Phalansterium。^{[ f ]}
    • Lahr et al. のフラメリ科 Lahr & Katz 科2011 、 Flamella属(= Comandonia )、^{[ 52 ]} Telaepolella Lahr et al. 2012年。
    • Protosteliida (Protosteliales) LSOlive & Stoianを注文します。 1966年、シャドウィック＆シュピーゲル著、Adlら著。 2012、Protosteliidae (Protosteliaceae) LSOlive & Stoian。 1966、プロトステリウム属(プラノプロトステリウムを含む)。
    • Fractovitellida Lahr らを注文します。 2011センス・カンほか2017年
      • アクラモエバ 科Smirnov, Nassonova & Cavalier-Smith 2008 、アクラモエバ属。
      • Schizoplasmodiidae 科Shadwick & Spiegel in Adl et al. 2012、属Ceratiomyxella、Nematostelium、Schizoplasmodium。
      • Soliformovidae 科Lahr & Katz 2011。属: Soliformovum Spiegel 1995 ;グレラメーバディコヴァ、コストカ、ペッコヴァ 2008 年。
    • 目Cavosteliida (Cavosteliales) Shadwick & Spiegel in Adl et al. 2012、科Cavosteliidae (Cavosteliaceae) Olive & Stoianovitch 1964、属Cavostelium、Schizoplasmodiopsis、Tychosporium。
    • Holomastigida Lauterborn 1895目(Artodiscida Cavalier-Smith 2013を含む)、Multiciliidae Poche 1913科 (Artodiscidae Cavalier-Smith 2013を含む)、Artodiscus属、Multicilia属。
  • クラスArchamoebea Cavalier-Smith 1983 sensu Pánek et al. 2016年^{[ 53 ]}
    • トリコリマキ 科Cavalier-Smith 2012、属Tricholimax。
    • 目Entamoebida Cavalier-Smith 1993、科Entamoebidae Chatton 1925、属Entamoeba、† Entamoebites。^{[ 54 ]}
    • Pelobiontida の 注文ページ 1976 sensu Pánek et al. 2016年
      • ペロミキシナ・ スタロボガトフ亜目1980 年の統計。 11月パネクら。 2016、ペロミクサ科Schulze 1877、マスティゲラ属(=マスティガメーバ)、ペロミクサ。
      • マスティガモエビナ 亜目Frenzel 1897 の統計。 11月パネクら。 2016年
        • Rhizomastixidae 科Ptáčková et al. 2013、Rhizomastix属。
        • マスティガメーバ 科Goldschmidt 1907、属エンダメーバ、エンドリマックス、アイオダメーバ、マスティガメーバ、マスティギナ。
  • Eumycetozoa Zopf 1884 sensu Kang et al. 2017 (=Mycetozoa de Bary 1859 ex Rostafinski 1873、Macromycetozoa Fiore-Donno 2010 )
    • Class Dictyostelea Lister 1909 sensu Sheikh et al. 2018 (Dictyosteliomycetes Doweld 2001 )。どの目にも割り当てられていない属: Synstelium。incertae sedis属:コエノニア。^{[ 55 ]}
      • 注文Acytosteliales S.Baldauf S.Sheikh & Thulin 2018
        • 科Acytosteliaceae Raper ex Raper & Quinlan 1958、属Acytostelium、Rostrostelium、Heterostelium。
        • 科Cavenderiaceae S.Baldauf, S.Sheikh & Thulin 2018、属Cavenderia。
      • Dictyosteliales L.S.Olive ex PMKirk et al. 2001目。属はどの科にも分類されていない: Coremiostelium。
        • 科Dictyosteliaceae Rostaf. ex Cooke 1877、属Dictyostelium、Polysphondylium。
        • Raperosteliaceae 科S.Baldauf S.Sheikh & Thulin 2018、Hagiwaraea属、Raperostelium属、Speleostelium 属、Tieghemostelium 属。
    • Ceratiomyxomycetes綱(Ceratiomyxea) D. Hawksw., B. Sutton & Ainsw. 2019 , ^{[ 35 ]} Protosporangiida目Shadwick & Spiegel in Adl et al. 2012 (Ceratiomyxales GW Martin ex ML Farr & Alexop. )
      • Ｃｅｒａｔｉｏｍｙｘａｃｅａｅ科（Ｃｅｒａｔｉｏｍｙｘｉｄａｅ）Ｊ．Ｓｃｈｒｏｔ． 1889 年、 Ceratiomyxa属。
      • Protosporangiidae Spiegel科（Adl et al.） 2012 (Protosporangiaceae Leontyev, Stephenson, Schnittler, Shchepin & Novozhilov 2020 )、属Clastostelium、Protosporangium。^{[ 20 ]}
    • Class Myxogastrea Cavalier-Smith 1993 (Myxomycetes G.Winter 1880 ) (=Myxogastres Fr. 1829、Myxogasteres Schröt., 1889、Endosporeae Rostaf. 1873、Myxogastromycetidae GWMartin 1961、Myxogastromycetes M.Locquin 1974、Myxogastria Cavalier-Smith 2012 as "Myxogastria LSOlive 1970" nom. inval. ) ^{[ 35 ]}
      • Lucisporinia Cavalier-Smith 2013 を「Lucissporidia」としてサブクラス化します(Lucisporomycetidae Leontyev, Schnittler, SLStephenson, Novozhilov & Shchepin 2019 )。属incertae sedis :アルシリアテッラ、カロネマ、ミナカテラ、トリキオイデス。
        • 超目クリバリ目レオンチェフ、シュニトラー、SLスティーブンソン、ノボズヒロフ、シチェピン 2019、クリバリ目目(Cribariida) T.Macbr。 1922 年、クリバリア科(Cribariidae) Corda 1838、クリバリア属、リンブラディア属、リカエタリウム属。
        • スーパーオーダートリキディアレオンチェフ、シュニトラー、SLスティーブンソン、ノボジロフ、シチェピン 2019
          • 目Reticulariales (Reticulariida) Leontyev, Schnittler, SLStephenson, Novozhilov & Shchepin 2019、科Reticulariaceae (Reticulariidae) Chevall. ex Corda 1842、属: Alwisia、Lycogala、Reticularia、Tubifera。
          • シラミ目（Liceida）、シラミ科（シラミ科）シュヴァル。 1826年、リセア属、リステレラ属。
          • トリキア目(Trichiida) T.Macbr. 1922年
            • Dianemataceae科(Dianematidae) T.Macbr. 1922年、カロミクサ属、ディアネマ属、ディクティディアエタリウム属、プロトトリキア属。
            • トリキア科(Trichiidae)シュヴァル。 1826 sensu Martin & Alexopoulos 1969、ヘミトリキア属（モズクを含む）、アルシリア（アルキョデスを含む）。Perichaena ^(P)、Trichia (コルヌビア、メタトリキア、オリゴネマを含む)。
      • Columellidia Cavalier-Smith 2013 を「Columellidia」としてサブクラス化する(Columellomycetidae Leontyev, Schnittler, SLStephenson, Novozhilov & Shchepin 2019 ) (=Fuscisporidia Cavalier-Smith 2013 sensu Kretzschmar et al. 2015 )。incertae sedis属: Diachea、Echinosteliopsis、Leptoderma、Paradiachea、Protophysarum、Trabrooksia、Willkommlangea。
        • 超目エキノステリディアLeontyev、Schnittler、SLStephenson、Novozhilov & Shchepin 2019 、エキノステリア目(Echinosteliida) GW Martin 1961、エキノステリア科(Echinosteliidae)ロスタフ。 ex Cooke 1877、属: Barbeyella、Echinostelium (セミモルラを含む)。
        • Superorder Stemonitidia Leontyev、Schnittler、SLStephenson、Novozhilov & Shchepin 2019
          • クラストデルマ目(Clastodermatidae) Leontyev、Schnittler、SLStephenson、Novozhilov & Shchepin 2019、クラストデルマ目(Clastodermatidae)アレクソップ科。 & TE Brooks 1971、クラストデルマ属。
          • メリデルマ目(メリデルマ目) Leontyev, Schnittler, SLStephenson, Novozhilov & Shchepin 2019、メリデルマ科(Meridermatidae) Leontyev, Schnittler, SLStephenson, Novozhilov & Shchepin 2019、メリデルマ属。
          • ステモニタ目(Stemonitida) T.Macbr. 1922年終了。レオンチェフ、シュニトラー、SLスティーブンソン、ノボジロフ、シチェピン 2019
            • ステモニティス科(Stemonitidae) Fr. 1829 emend. Leontyev, Schnittler, SLStephenson, Novozhilov & Shchepin 2019、属Macbrideola、Stemonitis、Symphytocarpus。
            • 科Amaurochaetaceae (Amaurochaetidae) Rostaf. ex Cooke 1877 emend. Leontyev, Schnittler, SLStephenson, Novozhilov & Shchepin 2019、属Comatricha、Stemonaria、Stemonitopsis、Amaurochaete、Brefeldia、Enerthenema、Paradiacheopsis。
          • 目Physarales (Physarida) T.Macbr. 1922。属はどの科にも割り当てられていない: Tasmaniomyxa。^{[ 56 ]}
            • ヤツメグサ科（ヤツメグサ科）T.Macbr. 1899年終了。 Leontyev、Schnittler、SLStephenson、Novozhilov & Shchepin 2019、Lamproderma属 ( Dichaeopsis、Colloderma、Elaeomyxa を含む)、Collaria ^(P)。
            • ディディミ科(ディディミ科)ロスタフ。 ex Cooke 1877、属ディデルマ、ディディミウム、レピドデルマ、ムシラゴ。
            • フクロソウ科（フクロソウ科）シュヴァル。 1826年、Craterium属、Leocarpus属、Fuligo属、Physarum属（ Badhamiaを含む）、Physarella属、Physarina属、Kelleromyxa属。

紅藻類は、正式には紅藻植物門として知られ、一次色素体を含む7,100種以上の光合成真核生物のグループです。単一の球状細胞から、最大3世代の複雑な生活環を持つ大きな偽柔組織状の葉状体まで、多様な形態に進化してきました。 ^{[ 59 ]}他の真核生物とは異なり、紅藻類はすべての生活段階で鞭毛と中心体を欠いています。^{[ 60 ]}

従来、紅藻類は形態に基づいて、2つの綱（BangiophyceaeとFlorideophyceae）、または単一の綱Rhodophyceaeの2つの亜綱（BangiophycidaeとFlorideophycidae）に分類されてきた。この分類体系は、分子系統学の台頭によって見直され、Bangiophyceaeが側系統群であることが明らかになった。さらに、3番目の綱であるCyanidiophyceaeが、最も初期に分岐した系統として発見された。2004年には、紅藻類の分子に基づく新しい分類が提案され、紅藻類は植物の亜界（Rhodoplantae）を構成し、2つの門に分けられた。1つの綱のみからなるCyanidiophytaと、3つの亜門（Rhodellophytina、Metarhodophytina、Eurhodophytina）と4つの綱からなるRhodophytaである。そのうちの1つは依然として側系統群であった。^{[ 61 ]} 2006年に包括的な分子解析により分類が改訂され、1つの門Rhodophytaに2つの亜門、すなわち1つの綱を持つCyanidiophytinaと6つの綱を持つRhodophytinaが提案された。^{[ 62 ]} Hwan Su Yoonと共同研究者によって開発されたこの分類体系は分類学者の間で広く普及しており、^{[ 63 ] [ 59 ]} 2017年には亜門RhodophytinaがProteorhodophytinaとEurhodophytinaの2つの亜門に分割された。^{[ 58 ]} 2022年にはすべての淡水紅藻の分類を改訂した書籍が出版された。^{[ 64 ]}

紅藻門ヴェッツシュタイン 1901

• 亜門Cyanidiophytina H.S.Yoon, KMMüller, RGSheath, FDOtt & D.Bahattacharya 2006、綱Cyanidiophyceae Merola, Castaldo, De Luca, Gambardella, Musacchio & Taddei 1981、目Cyanidiales Christensen 1962
  • シアニジウム 科Geitler 1935、属Cyanidium、Cyanidioschyzon。
  • ガルディエリア 科、Merola、Castaldo、De Luca、Gambardella、Musacchio & Taddei 1981 、 Galdieria属。
• Proteorhodophytina 亜門S.A.Muñoz-Gómez、FGMejía-Franco、K.Durnin、M.Colp、CJGrisdale、JMArchibald & CHSlamovits 2017
  • 綱Compsopogonophyceae G.W.Saunders & Hommersand 2004
    • オーダー コンプソポゴナレス スクジャ 1939
      • ボルディア科（Boldiaceae Herndon 1964）、ボルディア属（Boldia）。
      • コンプソポゴン科 シュミッツ(Engler & Prantl 1896)、コンプソポゴン属。
    • 目Erythropeltidales Garbary, Hansen & Scagel 1980、科Erythrotrichiaceae G.M.Smith 1933、属Erythrotrichia、Chlidophyllon、Erythrocladia、Pyrophyllon、Sahlingia。
    • Rhodochaetales Bessey 1907、Rhodochaetaceae Schmitz in Engler & Prantl 1896、Rhodochaete属。
  • 綱Porphyridiophyceae H.S.Yoon, KMMüller, RGSheath, FDOtt & D.Bahattacharya 2006、目Porphyridiales Kylin ex Skuja 1939、科Porphyridiaceae Skuja 1939、属Porphyridium、Erythrolobus、Flintiella。
  • クラスRhodellophyceae Cavalier-Smith 1998、目Rhodellales H.S.Yoon、KMMüller、RGSheath、FDOtt & D.Bahattacharya 2006、科Rhodellaceae H.S.Yoon、KMMüller、RGSheath、FDOtt & D.Bahattacharya 2006、属Rhodella、Dixoniella、Glaucosphaera。
  • 綱Stylonematophyceae H.S.Yoon、KMMüller、RGSheath、FDOtt & D.Bahattacharya 2006、目Stylonematales Drew 1956、科Stylonemataceae Drew 1956、属Stylonema、Bangiopsis、Chroodactylon、Chroothece、Purpureofilum、Rhodosorus、Rhodospora、Rufusia。
• 亜門Eurhodophytina G.W.Saunders & Hommersand 2004
  • バンギア藻綱 Wettstein 1901、バンギアレスネーゲリ目 1847、バンギア科Engler 1892、属バンギア、ディオネ、ミネルバ、ポルフィラ、シュードバンギア。
  • フロリデオ 藻綱（Cronquist 1960）
    • 亜綱Hildenbrandiophycidae G.W.Saunders & Hommersand 2004、目Hildenbrandiales Pueschel & KMCole 1982、科Hildenbrandiaceae Rabenhorst 1868、属Apophlaea、Hildenbrandia、Riverina。^{[ 65 ]}
    • 亜綱Nemaliophycidae T.Christensen 1978
      • Acrochaetiales Feldmann emend目。 JTHarper & GWSaunders 2002、Acrochaetiaceae Fritsch emend 科。 JTHarper & GWSaunders 2002、属Acrochaetium、Audouniella、Rhodochorton。
      • バルビアニア目 Sheath & KMMüller 1999、バルビアニア科Sheath & KMMüller 1999、バルビアニア属、ロドドラパルナルディア属。
      • Balliales H.-G.Choi, Kraft & GWSaunders 2000、Baliaceae H.-G.Choi, Kraft & GWSaunders 2000、Ballia属。^{[ 66 ]}
      • Batrachospermales Pueschel & KMCole 1982、Batrachospermaceae科C.Agardh 1824を修正。 Entwisle、MLVis、WBChiasson、Necchi & ARSherwood 2009、^{[ 67 ]}アカルポスポロフィコス属、^{[ 68 ]}バリオプシス、^{[ 69 ]}バトラコスペルマム、ゲナデンダリア、クマノア、リンパ属、マクロスポロフィコス、モンターニア、^{[ 70 ]}ノクチュラマ、^{[ 71 ]}ノトヘスペルス、ペトロワ、​​サイロシフォン、シーシア、^{[ 72 ]}シロドティア、トルラリア、^{[ 73 ]}トゥオメヤ、ヴィレセンティア、^{[ 74 ]}ヴィシア、^{[ 64 ] [ 75 ]}ヴォラトゥス。^{[ 76 ]}
      • コラコネマ 目J.T.Harper & GWSaunders 2002、コラコネマ科J.T.Harper & GWSaunders 2002、コラコネマ属。
      • 目Corynodactylales G.W.Saunders, Wadland, Salomaki & CE Lane 2017、科Corynodactylaceae G.W.Saunders, Wadland, Salomaki & CELane 2017、属Corynodactylum。^{[ 77 ]}
      • Entwisleiales 目G.W.Saunders & Kraft 2013、Entwisleiaceae科G.W.Saunders & Kraft 2013、Entwisleia属。^{[ 78 ]}
      • Engler 1892 でNemaliales Schmitz を注文^{[ 79 ]}
        • ガラクサウルス 亜目J.F.Costa、SMLin、ECMacaya、C.Fernández-García、H.Verbruggen 2016
          • ガラクサウラ科Galaxaura属、Actinotrichia属、Dichotomaria属。
          • キナヤ科Sciania属、Tricleocarpa属、Nothogenia属、Gloiophloea属、Whidbeyella属。
        • Nemaliineae 亜目J.F.Costa、SMLin、ECMacaya、C.Fernández-García、H.Verbruggen 2016
          • ネマリア科ネマリオン属。
          • リアゴラ科Akalaphycus、Cumagloia、Cylindraxis、Dermonema、Dotyophycus、Ganonema、Gloiocalis、Gloiotrichus、Helminthocladia、Helminthora、Hommersandiophycus、Izziella、Liagora、Macrocarpus、Neoizziella、Patenocarpus、Sinocladia、Stenopeltis、Titanophycus、Trichogloea、Trichogloeopsis、Yoshizakia属。
          • 科Liagoropsidaceae S.-M.Lin, Rodríguez-Prieto & Huisman 2015、属Liagoropsis。
          • ヤマダエラ 科S.-M.Lin、Rodríguez-Prieto & JMHuisman 2015 、ヤマダエラ属。
      • Inkyleeales Díaz-Tapia & Maggs 2019、Inkyleeaceae H.-G.Choi、Kraft & GWSaunders 2008、Inkyleea属。^{[ 80 ]}
      • Ottiales 目K.P.Fang、FRNan、SLXie 2022、Ottiaceae科Entwisle、JR Evans、ML Vis、GW Saunders 2018 、 Ottia属。^{[ 81 ]}
      • Palmariales Guiry & DEGIrvine 1978 ^{[ 82 ]}を注文する
        • メディオディスク 科S.L.Clayden & GWSaunders 2010、属Mediodiscus、Kallymenicola、Rhodophysemopsis、Rubrointrusa、Torngatum。^{[ 83 ]}
        • Palmariaceae 科Guiry 1974、属Palmaria (= Ceramium、Leptosarca )、Devaleraea、Halosaccion、Neohalosacciocolax * ^{[ g ]}。
        • Rhodophysemataceae 科G.W.Saunders & JLMcLachlan 1989、属Rhodophysema (= Halosacciocolax、Rhododerma )、Rhodonematella、Coriophyllum * (= Asymmetria )、Pseudorhododiscus *。^{[ g ]}
        • 科Rhodothamniellaceae G.W. Saunders 1995、属Rhodothamniella、Camontagnea。
      • ロダクリア 目G.W.Saunders、SLClayden、JLScott、KAWest、U.Karsten & JAWest 2008、ロダクリア科G.W.Saunders、SLClayden、JLScott、KAWest、U.Karsten & JAWest 2008、Rhodachlya属。
      • Thoreales 目K.M.Müller, Sheath, ARSherwood & Pueschel 2002、Thoreaceae科Hassall 1845、Thorea属、Nemalionopsis属。
    • 亜綱Corallinophycidae Le Gall & GWSaunders 2007
      • コラリーナレス・シルバ & HWヨハンセン 1986を注文
        • サンゴ科Lamouroux 1812。^{[ 84 ] [ 85 ]} incertae sedis属: † Aguirrea。^{[ 86 ]}
          • Chamberlainoideae 亜科Caragnano, Foetisch, Maneveldt & Payri 2018、属Chamberlainium、Pneophyllum。
          • 亜科Corallinoideae (Areschoug) Foslie 1908
            • サンゴ科、属Alatocladia属、Bossiella属、Calliarthron 属、Chiharaea 属、Coralrina 属、Ellisolandia属、Johansenia 属、Pseudolithophyllum 属。^{[ 87 ]}
          • Mastophoroideae 亜科(Setchell) A.Kato & M.Baba (Kato et al.) 2011、マストフォラ属、メタストフォラ属。
          • Neogoniolithoideae 亜科(A.Kato & M.Baba)を修正します。 A.Rösler、Perfectti、V.Peña & JCBraga 2016、ネオゴニオリトン属、スポンジイト属。
          • Lithophylloideae 亜科Setchel 1943修正。 JCBailey 1999 (Amphiroideae Johansen 1969を含む)、属Amphiroa、Ezo、Lithophyllum、Lithothrix、Tenarea、Titanoderma。^{[ 88 ]}
        • ポロリタ科 R.A.Townsend & Huisman 2018 ^{[ 89 ]}
          • 亜科Floiophycoideae R.A.Townsend & Huisman 2018、属Dawsoniolithon、Floiophycus、Oztralia。
          • 亜科Metagoniolithoideae H.W.Johansen 1969、属Harveylithon、Metagoniolithon。
          • ポロリソイダ 科A.Kato & M.Baba (A.Kato、M.Baba & S.Sida 2011)、ポロリトン属、レプトポロリトン属。
        • 海綿状科 Kützing 1843、海綿状属。
        • スポンジ 科（Spongitidae） Kützing 1843
      • Corallinapetrales S.Y.Jeong , WANelson, BYWon & TOCho 2021、Corallinapetraceae S.Y.Jeong, WANelson, BYWon & TOCho 2021、Corallinapetra属。^{[ 90 ]}
      • ハパリディア目
        • ハパリディア科
          • Austrolithoideae亜科、Austrolithon属、Boreolithon 属。
          • 亜科Choreonematoideae、属Choreonema。
          • Melobesioideae亜科、Clathromorphum属、Exilicrusta 属、Kvaleya 属、Lithothamnion 属、Mastophoropsis 属、Melobesia 属、Mesophyllum 属、Phymatolithon 属、Synarthrophyton 属。
      • ロドゴルゴナレス目
      • 胞子虫目
        • スポロリトン科、ヘイドリキア属、スポロリトン属。
    • アンフェルティオフィシダ亜綱
      • アンフェルティアレスを注文する
      • ピヒエラ目
    • ロディメニオフィシダ亜綱
      • アクロシンフィタレス目
      • ボンネメゾニアルを注文する
      • 目：セラミアル目
      • テングサ目
      • ギガルティナレスを注文する
      • グラシラリアレス目
      • ハリメニア目
      • ネマストマタレス目
      • ペイソネリア目
      • プラカミ類目
      • ロディメニア目
      • セブデニア目

ローデルフィディアチホネンコフ門、ガウリルク、ミルニコフ & キーリング 2019 → クラス ローデルフィディアチホネンコフ、ガウリルク、ミルニコフ & キーリング 2019 → 順序 ローデルフィダチホネンコフ、ガウリルク、ミルニコフ & キーリング 2019 → 家族 ローデルフィダ科チホネンコフ、ガウリルク、ミルニコフ＆キーリング 2019。唯一の属: Rhodelphis Tikhonenkov、Gawryluk、Mylnikov & Keeling 2019。^{[ 91 ]}

ピコゾア門Seenivasan, Sausen, Medlin & Melkonian 2013 (=picobiliphytes Not et al. 2007 ) →ピコモナダ科Seenivasan, Sausen, Medlin & Melkonian 2013 →ピコモナダ科Seenivasan, Sausen, Medlin & Melkonian 2013 →ピコモナダ科Seenivasan,サウセン、メドリン、メルコニアン 2013。唯一の属: Picomonas Seenivasan、Sausen、Medlin & Melkonian 2013。^{[ 11 ] [ h ]}

門Glaucophyta Skuja 1954 (=Glaucocystaceae West 1904、 Glaucocystophyta Kies and Kremer 1986、 Glaucoplantae Marin & Melkonian in Li et al. 2020 )。 所属不明属: Archaeopsis、Chalarodora、Glaucocystopsis、Peliaina、Strobilomonas。^{[ 93 ]}

• シアノフォラ 目Kies & Kremer 2006。唯一の属: Cyanophora。
• 目Glaucocystales Bessey 1907。唯一の属: Glaucocystis。
• Gloeochaetales Bessey 1907目。属: Cyanoptyche、Gloeochaete。

緑藻類は側系統群であり、そこから陸上植物（胚植物門）が進化しました。緑藻類はまとめて葉緑体植物門（緑色の色素体を持つことから）を形成し、緑色植物門（Viridiplantae）とも呼ばれます。緑藻類はもともと緑藻植物門（Chlorophyta ）という単一の門として研究されていました。

ビギラ門は当初、光合成を行うヘテロコント類（オクロ植物門）に近縁な従属栄養性原生生物の門として提唱された。この門には、偽菌類（卵菌類とヒフォキトリド類）、ビギロモナダ類（自由生活性の二鞭毛虫）、オパリナタ類（大型の多鞭毛性腸内共生生物）の3つの亜門が含まれていた。この門は、二重らせんまたは環状の鞭毛移行帯の存在という共通の特徴をもって提唱された。この定義は後に修正され、偽菌類とビギロモナダ類の両方が除外され、代わりにオパロゾア類（オパリナタ類とビコソエシド類を含む）とサゲニスタ類の2つの異なる亜門に縮小された。これ以前は、サゲニスタ類自体もビコソエシド類とラビリンチュラ類を含む門であったが、ラビリンチュラ類と少数の鞭毛虫のみに縮小された。^{[ 150 ] [ 3 ]}

Bigyra の現在の定義は、いくつかの系統解析によると側系統群であり、Sagenista は Gyrista により近縁である。側系統群である可能性が高いにもかかわらず、ほとんどの分類学者は引き続きこれを使用しており、単系統群を優先する ISOP による 2019 年の改訂で認められた。 ^{[ 6 ] [ 151 ]}そのグローバル分類は、2013 年と 2018 年に Cavalier-Smith によって最後に改訂されたが、^{[ 7 ] [ 3 ]}特定のクラスPlacidideaは 2021 年に改訂され、Alexandra Rybarski と共著者によって新しい分類群が記載された。^{[ 152 ]}また、クラス Labyrinthulea と Opalinea は、2017 年のHandbook of the protistsで詳細に改訂された。^{[ 153 ] [ 154 ]}

ビギラ門^(P?) Cavalier-Smith 1998 年終了。 2013年

• オパロゾア 亜門Cavalier Smith 1991 年改正。 2006年
  • 下門プラシドゾアCavalier-Smith 2013
    • スーパークラスWobblata ^(P) Cavalier-Smith in Cavalier-Smith and Chao, 2006 stat. n. 2013
      • 綱プラシディダ科モリヤ・ナカヤマ・イノウエ 2002、プラシディダ目モリヤ・ナカヤマ・イノウエ 2002、プラシディダ科モリヤ・ナカヤマ・イノウエ 2002、属アレグラ、ハロプラシディア、ペンデュロモナス、プラシディア、プラシロンガ、水月モナス、ワッブリア。
      • ナノモナデア 綱（ Cavalier-Smith in Cavalier-Smith & Scoble 2013、=クレードMAST-3）、ユニキリアティダ目（ Cavalier-Smith in Cavalier-Smith & Scoble 2013）
        • Incisomonadidae 科（ Cavalier-Smith in Cavalier-Smith & Scoble 2013） 、 Incisomonas属。
        • Solenicolidae 科（ Cavalier-Smith in Cavalier-Smith & Scoble 2013） 、 Solenicola属。
      • オパロモナデア 綱（Cavalier-Smith 2013）（＝クレードMAST-12）、記載種なし。
    • スーパークラスオパリナタWenyon 1926修正Cavalier-Smith 1997
      • Blastocystea 綱Zierdt et al. 1967、Blastocystida目Zierdt 1978、Blastocystidae科Jiang & He 1988、Blastocystis属。
      • Opalinea 綱Wenyon 1926 (=Slopalinida Patterson 1985 )
        • Proteromonadida Grassé 1952を修正してください。 Cavalier-Smith 1993、Proteromonadidae Grassé 科 1952、Proteromonas属(=" Prowazekella ")。
        • Opalinida Poche 1913 stat. nov. Hall 1953 emend. Cavalier-Smith 2013 の命令
          • カロトモルファ 科Travis 1934、カロトモルファ属。
          • オパリニ 科Claus 1874、属Cepedea、Opalina、Protoopalina、Protozelleriella、Zelleriella。
  • Infraphylum Bikosia Cavalier-Smith 2018 (=Bicosoecida Grassé 1926 emend. Karpov 1998 )、Bikosea Cavalier-Smith 1986 を「Bicosoecea」orth として分類。直す。 2013年。
    • 科Pseudobodonidae Cavalier-Smith in Cavalier-Smith & Scoble 2013、属Pseudobodo。
    • 亜綱Bicosidia ^{(P?) [ 155 ]} Cavalier-Smith in Cavalier-Smith & Chao 2006。どの目にも割り当てられていない属: Halocafeteria、^{[ 156 ]} Cafileria。^{[ 157 ] [ 158 ] [ 7 ]}
      • ボロカ目(Borokida) Cavalier-Smith (Cavalier-Smith & Chao 2006)、ボロカ科(Borokida) Cavalier-Smith (Cavalier-Smith & Chao 2006)、ボロカ属。
      • アノエカレス目^（P?）（アノエカ目）Cavalier-Smith 1997 ^{[ k ]}下位分類群に割り当てられていない属：Bilabrum。^{[ 159 ]}
        • アノエカ科 Cavalier -Smith in Cavalier-Smith & Chao 2006、属Anoeca。
        • Caecitellaceae科(Caecitellidae) Caevalier-Smith (Cavalier-Smith & Chao 2006) 、 Caecitellus属。
        • Family Cafeteriaceae (Cafeteriidae) Moestrup 1995、Cafeteria属。
        • Symbiomonadaceae 科（Cavalier-Smith in Cavalier-Smith & Chao 2006）、属Symbiomonas。
      • ビコエシダ目（Bicoecales）Grassé 1926
        • ビコソエカ科(ビコソエカ科) Stein 1878、属Bicosoeca、Stephanocodon、Poteriodendron、Hirugamonas。^{[ 158 ]}
        • ラブロモナス科(Labromonadaceae) Cavalier-Smith in Cavalier-Smith & Chao 2006、属名Labromonas。
      • シュードデンドロモナダ目（「シュードデンドロモナダレス」）Hibberd 1985 emend. Cavalier-Smith 2006。
        • 科Pseudodendromonadidae ("Pseudodendromonadaceae") Karpov 2000、属Cyathobodo、Pseudodendromonas。
        • シルアニ科^(P) (Siluaniaceae) Karpov 1998、属Adriamonas、Siluania、Otto、Regin。^{[ 160 ]}
        • Paramonadidae 科Kent 1880、属Paramonas。
        • Cavalier-Smith & Scoble 2013 のナニ科 Cavalier -Smith 、ナナム属(= Nanos ")。
        • 科Neradidae Cavalier-Smith in Cavalier-Smith & Chao 2006、属Nerada。
        • Filidae 科Cavalier-Smith in Cavalier-Smith & Scoble 2013、属Filos。
    • 所属不明の亜門
      • 目Rictida Cavalier-Smith in Cavalier-Smith & Scoble 2013、科Rictidae Cavalier-Smith in Cavalier-Smith & Scoble 2013、属Rictus。
      • カンティーナ・ユブキ他 2015
• 亜門Sagenista Cavalier-Smith 1995
  • 綱Labyrinthulea L.S.Olive 1975 (旧 Cavalier-Smith 1989) (Labyrinthulomycetes Arx 1970 (旧 Dick 2001 )) (='門' Labyrinthomorpha Page in Levine et al. 1980 (Labyrinthulomycota Whittaker 1969 ))
    • アンフィトレミダ 目(Poche 1913) Gomaa et al. 2013年
      • Amphitremidae 科Poche 1913、属Amphitrema、Archerella (= Ditrema )、^{[ 161 ]} Paramphitrema。
      • Diplophryidae 科（ Cavalier-Smith in Anderson & Cavalier-Smith 2012）、属名：Diplophrys。
    • アンダーソン＆キャバリエ＝スミス2012年版では「Amphifilida Cavalier-Smith」を「Amphifiloidea」として分類する。
      • Amphifilidae 科、Cavalier-Smith in Anderson & Cavalier-Smith 2012、属名Amphifila。
      • Sorodiplophryidae 科Cavalier-Smith in Anderson & Cavalier-Smith 2012、属Fibrophrys、Sorodiplophrys。
    • Oblongichytrida目（Oblongichytriales）Bennett et al. 2017、Oblongichytriidae科（Oblongichytriaceae）Cavalier-Smith in Anderson & Cavalier-Smith 2012、Oblongichytrium属。
    • ラビリンチュラ 目Doffein 1901 (ラビリンチュラ目EABessey 1950 )。属はどの科にも属さない: Stellarchytrium。
      • アプラノキトリ科(Aplanochytriaceae) Leander ex Cavalier-Smith in Anderson & Cavalier-Smith 2012、属Aplanochytrium (= Labyrinthuloides )。
      • ラビリンチュラ 科Cienkowski 1867 (Labyrinthulaceae Haeckel 1868 )、ラビリンチュラ属(= Pseudoplasmodium、Labyrinthodictyon、Labyrinthorhiza )。
    • スラウストキトリダ目（スラウストキトリア目）Sparrow 1943
      • Althorniidae (Althornidiaceae) Jones & Alderman 1973、Althornia属。
      • 科Thraustochytriidae (Thraustochytriaceae) Sparrow ex Cejp 1959、属Aurantiochytrium、Botryochytrium、Japonochytrium、Monorhizochytrium、Parietichytrium、Phycophthorum、^{[ 162 ]} Schizochytrium、Sicyoidochytrium、Thraustochytrium、Ulkenia。
  • Eogyrea 綱Cavalier-Smith 2013、Eogyrida目Cavalier-Smith 2018 ^{[ 3 ]} (=クレード MAST-6)。下位分類群に割り当てられていない属: Mastreximonas、Vomastromonas。^{[ 151 ]}
    • Pseudophyllomitidae科（Pseudophyllomitaceae）白鳥ら。 2017、シュードフィロミトゥス属。^{[ 163 ]}

• Kaonashiidae Weston, Eglit & Simpson 2023 . Kaonashia . ^{[ 164 ] [ 165 ]}
• Pseudofungi Cavalier-Smith 1986 (=Heterokontimycotina MW Dick 1976、 Peronosporomycotina MWDick 2001 ) ^{[ 166 ] : 288}
  • Bigyromonadea Cavalier-Smith 1997
    • Developea Aleoshin et al. 2016年。Cubaremonas Tikhonenkov、Cho、および Keeling 2022、^{[ 167 ]} Develoamica Prokina et al。 2026、^{[ 168 ]} Develocanicus Tikhonenkov、Cho、Mylnikov、および Keeling 2022、^{[ 167 ]} Develocauda Tikhonenkov、Cho、および Keeling 2022、^{[ 167 ]} Developarva Prokina et al。 2026、^{[ 168 ]} Developayella Tong 1995、Develorapax Karpov & Aleoshin 2016、Mediocremonas del Campo および Weiler 2020。^{[ 169 ]}
    • ピルソニアレスキャバリア スミス & チャオ 2006 年終了。プロキナら。 2024年。どの下位分類群にも割り当てられていない属: Bordeauxia Prokina et al. 2024年;ブリオニア・プロキナら。 2024年;フェオドシア・プロキナら。 2024年; Koktebelia Prokina et al. 2024年。^{[ 170 ] [ 171 ]}
      • ピルソニア科Cavalier & Chao 2006。Noirmoutieria Prokina et al. 2024年;ピルソニア・シュネプフ、デブレス、エルブラハター 1990 年。^{[ 170 ] [ 171 ]}
  • Hyphochytriomycetes ^ICN Sparrow ex MWDick 1983 (Hyphochytrea ^ICZN Cavalier-Smith 1986 )。属は下位分類群に割り当てられていない: Hyphochytrium Karling 1939。
    • Anisolpidium Karling 1943 emend. Dick 2001 . Anisolpidium Karling 1943 ; Canteriomyces Sparrow 1960 .
    • Rhizidiomycetaceae Karling 1943。ラトロスティウムツォップ 1894 ;リジディオミセス・ゾップ 1884 ; Rhizidiomycopsis Sparrow 1960。
  • ペロノスポロミセテスディック 2001 (=ペロノスポロミセテス冬 1897、修正。ディック 1976 )。 Incerae sedis: Atkinsiella Vishniac 1958 ; Ciliatomyces Foissner & Foissner 1995 (= Ciliatomyces Foissner & Foissner 1986 ); ^{[ 172 ]} Crypticola Humber ら。 1989年; Ectrogella Zopf 1884 ;エウリュカスマ・マグナス 1905 ; Halodaphnea M.W.ディック 1998 ;ハリフトロス・ヴィシュニアック 1958 ;ハプトグロッサドレクスラー 1940 ;ラゲーナ・ヴァンテルプ。 & レディンガム 1930 ;ラゲニスマ・ドレベス 1968 ;オルピディオプシスコルヌ 1872 ;ポンティスマH.E.ピーターセン 1905 ;ピティエラカウチ 1935 ;ロゼロプシス・カーリング 1942 ;シロルピジウムH.E.ピーターセン 1905。
    • Adlらのサプロレグニア系統Lara。 2019年。アクリヤ・ニーズ 1823 ;アファノミセス・デ・バリー 1860 ;アプラノプシス・ヘンク 1952 ;アポダクリヤ・プリンシュ。 1883年;アクアステラS.L.グロックリング & DP モロイ 2014 ; Geolegnia Coker & JVHarv. 1925 ;レプトミタス(ロス) C.アガルド 1824 ; Newbya M.W.ディック＆マスペンサー 2002 ;ピティオプシス・ド・バリー 1888 ;プロトアクリヤコッカー 1923 ;サリサピリア・ハルベイ、ニグレリ、テル、ラムール＆ザネス 2010 ; Saprolegnia Nees 1823 ;スラウストテカ・ハンフリー 1893。
    • AdlらのPeronosporalean系統Lara。 2019年。Albugo (Pers.) Roussel ex Grey 1821 ;ブレミアリーゲル 1843 ;クラミドミジウムM.W.ディック 1997 ; Halophytopthora H.H.Ho & SCJong 1990 ;ヒアロペロノスポラ定数。定数で。 & J.ファテヒ 2002 ;ラゲニジウムツォップ 1859 ;ミゾシチオプシスM.W.ディック 1997 ;ペロノスポラコルダ 1837 ; Plasmopara J.Schröt. 1886年;ピシウム・プリンシュ。 1858年;シュードペロノスポラロストフゼス 1903 ;フィトフトラ・デ・バリー 1975 ;フィトピシウムアバド、デ コック、バラ、ロビドー、アムロディ、バラのレベスクなど。 2010年;プスチュラザネス 2005。
• 緑藻類Cavalier-Smith 1986、修正。 Cavalier-Smith & Chao 1996 (=Heterokontophyta Guiry、RAAndersen & Moestrup 2023 )
  • クリシスタ・キャバリア・スミス 1986。 Incertae sedis: Chrysoderma C.Billard 1984 nom.無効です。 ;クリソメリスカーター 1937 ;クリソネフォスW.R.テイラー 1952 ; 「ギラウディオプシス」ダンギア 1965 年名。無効です。 ; ^{[ 173 ]}ラムノクリシスウィルス&マーキー 1974年。^{[ l ]}
    • Eustigmatophyceae Hibberd & Leedale 1971 ^{[ 177 ] [ m ]}
      • ゴニオクロリダレスK.P.フォーリー、M.エリアシュ、MWフォーリー 2013。ゴニオクロリス・ガイトラー 1928 ; Pseudostaurastrum Chodat 1921 ;テトラエドリエラパッシャー 1930 年名。短所。 ; Trachydiscus H.Ettl 1964 ; Trebonskia Přibyl & Procházková 2022 ; ^{[ 180 ]}バキュオリビリデ中山、中村、横山、白鳥、イノウエ、石田 2015 年。
      • ユースティグマタレス・ヒバード 1981
        • Paraeustigmatos M.W.Fawley、Nĕmcová & KPFawley 2019 ^{[ 181 ]}
        • キキョウ科ヒバード 1981。エリプソディオンパッシャー 1938 ;クロロボトリスボーリン 1901 ;ユースティグマトス・ヒバード 1981 ;シュードカラシオプシスK.W.Lee & Bold 1973 ;ヴィシェリアパッシャー 1938 年。
        • Monodopsidaceae Hibberd 1981 ( Hedgewald, Padisak & Friedl 2007 のLoboceae Hedgewald を含む)。ミクロクロロプシスM.W.Fawley、I.Jameson & KPFawley 2015 ;モノドプシス・ヒバード 1981 ;ナンノクロロプシス・ヒバード 1981 ; Pseudotetraedriella Hedgewald、Hedgewald、Padisak & Friedl 2007。
        • Neomonodaceae R.Amaral、KPFawley、Nĕmcová、T.Ševčíková、Lukešová、MWFawley、LMASantos & M.Eliáš 2020。ボトリオクロロプシスプレイジグ & ヴィルヘルム 1989 ; Characiopsella R.Amaral、KPFawley、Nĕmcová、T.Ševčíková、Lukešová、MWFawley、LMASantos & M.Eliáš 2020 ; Munda R.Amaral、KPFawley、Nĕmcová、T.Ševčíková、Lukešová、MWFawley、LMASantos & M.Eliáš 2020 ; Neomonodus R.Amaral、KPFawley、Nĕmcová、T.Ševčíková、Lukešová、MWFawley、LMASantos & M.Eliáš 2020 ; Pseudellipsoidion (Neustupa & Nĕmcová) Nĕmcová emend。アマラルら。 2020年。
    • SIIクレード
      • Olisthodiscophyceae Barcytė、Eikrem & M. Eliáš 2021 → Olisthodiscus。
      • Pinguiophyceae Kawachi、Inouye、Honda、O'Kelly、Bailey、Bidigare、RAAndersen 2002。グロソマスティックス・オケリー 2002 ;ファエオモナス・ホンダ＆イノウエ 2002 ; Pinguiochrysis河内 2002 ;ピンギオコッカスR.A.アンダーセン、D.ポッター、JCBailey 2002 ;ポリーポドクリシス・マグネ 1975。
      • SSCクレード^{[ 178 ] [ 179 ]}
        • クリソ藻科パッシャー 1914。 Incerae sedis 分類群:クリオソサッカス、クリソスフェラ、サイクロネクシス、リギニオン、ファエオプラカ。
          • Chromulinales Pascher 1910。クロムリナ、クリソモナス。
          • Hibberdiales Andersen 1989 . Hibberdia .
          • オクロモナダレスパッシャー 1910。スプメラ、ペドスプメラ、オクロモナス。
          • Paraphysomonadida Scoble & Cavalier-Smith 2014 . Paraphysomonas .
          • Synurales Andersen 1987。Chrysodidymus、Mallomonas、Synura、Tesselaria。
        • ピコファゲアCavalier-Smith 2006 年終了。 2018 ^{[ 182 ]} [Synchromophyceae S.Horn & C.Wilhelm 2007 ]。クラミドミクサ、クリソポドシスティス、グアノクロマ、ロイカラクニオン、ピコファガス、シンクロマ。
    • SIクレード
      • Raphidophyceae Chadefaud 1950 ex Silva 1980 → Tomas 1993 のChattonellales Throndsen を修正。山口、中山、村上、イノウエ 2010 (=Vacuolariales Shameel、2001 )。チャットネラ、フィブロカプサ、ゴニオストムム、ハラモナス、ヘテロシグマ、メロトリカ、液胞虫。
      • PXクレード^{[ 176 ]}
        • Chrysoparadoxophyceae Wetherbee in Wetherbee et al. 2019 → 目 Chrysoparadoxales Wetherbee in Wetherbee et al. 2019 → 科 Chrysoparadoxaceae Wetherbee in Wetherbee et al. 2019。^{[ 183 ]} Chrysoparadoxa Wetherbee in Wetherbee et al. 2019 ; Nematochrysis Pascher 1925 (= Chrysowaernella Gayral & Lepailleur 1971 ) 。^{[ 176 ]}
        • 褐藻類Hansgirg 1886 [Kjellman 1891; Pfitzer 1894]
          • Ascoseirales Petrov 1964 . Ascoseira .
          • デスマレスティアレスセッチェル & ガードナー 1925 年。関節クラディア、デスマレスティア^(P)、ヒマントタラス、ファウルス。
          • 独裁物語ボリー・ド・サン＝ヴァンサン 1828 年。ディクティオタ、ディロファス、ロボフォラ、パディナ、スティポポディウム、タオニア、ゾナリア。
          • Discosporangeales Kawai et al. 2007年。Choristocarpus、Discosporoangium。
          • Ectocarpales Bessey 1907、Silva & Reviers 2000 修正。Adenocystis 、Acinetospora、Asterocladon、Asteronema、Chordaria、Ectocarpus、Scytosiphon。
          • フカレス・ボリー・ド・サン・ヴァンサン 1927 年。アスコフィラム、ビフルカリア、シストセイラ、ドルビレア、ヒバマタ、ホルモシラ、ホンダワラ、ツルビナリア。
          • イシゲレス・チョーら。 2004 [イシゲアセアオカムラ 1935 ]。石毛。
          • ラミナリアレスミグラ 1908。アケシオフィカス、アラリア、コルダ、コスタリア、ラミナリア、レッソニア、シュードコーダ。
          • Nemodermatales Parente et al. 2008年。ネモデルマ。
          • オンスローヴィアレスドライスマ & プリュドム ヴァン レーヌ 2008。オンスローウィア。
          • ラルフシアレスナカムラ ex リム＆カワイ 2007。苔皮症、ネラルフシア、偽苔皮症、ラルフシア。
          • Scytothamnales Peters & Clayton 1998。Scytothamnus、Splachnidium、Stereocladon。
          • Sphacelariales Migula 1908。Chaetopteris、Halopteris、Stypocaulon、Sphacelaria、Verosphacella。
          • スポロクナレスソヴァーゴー 1926。ベロティア、カルポミトラ、ネレイア、スポロコヌス、トマクロプシス。
          • Syringodermatales Henry 1984 . Syringoderma .
          • Tilopteridales Bessey 1907。Cutleria、Halosiphon、Haplospora、Phaeosiphoniella、Phyllaria、Tilopteris。
        • Phaeosacciophyceae R.A.Andersen、L.Graf、HSYoon in Graf et al. 2020 → Phaeosacciales RAAndersen、L.Graf、HSYoon を Graf et al で注文。 2020年^{[ 176 ]}
          • キハダ科J. Feldmann 1949。南極サクシオンデレピーヌ 1970 ;フェオサクシオン ファーロー 1882 年。
          • テトラスポロプシ科R.A.Andersen、L.Graf、HSYoon in Graf et al. 2020年。テトラスポロプシスレンマーマン 1899 ; GrafらのPsammochrysis R.Wetherbee。 2020年。
        • Phaeothamniophyceae Andersen & Bailey in Bailey et al. 1998
          • Phaeothamniales Bourrelly 1954、修正します。アンデルセンとベイリー、Bailey et al. 1998年。ファエオタムニオン。
          • プレウロクロリダレスEttl 1956。プロウロクロリデラ。
        • Schizocladiophyceae Henry, Okuda & Kawai 2003 . Schizocladia .
        • Xanthophyceae Allorge 1930、修正。フリッチュ 1935 [異邦人ルター 1899 ;ヘテロモナデアリーデール 1983;黄色植物門ヒバード 1990 ]
          • Tribonematalesパッシャー 1939。ボトリジウム、ブミレリオプシス、カラシオプシス、クロロメソン、ヘテロコッカス、モナドゥス、オフィオシチウム、スファエロソラス、トリボネマ、キサントネマ。
          • ボーシュリアレスボーリン 1901 年。ヴァシェリア。
  • ディアトミスタ・デレルら。 2016年、終わります。キャバリア・スミス 2018 [SIII クレード]。 Incerae sedis 分類群: 環境クレード MOCH-1、MOCH-2、および MOCH-4 Massana et al. 2014年。
    • Bolidophyceae Guillou et al . 1999 [Parmales Booth & Marchant 1987 ]。Bolidomonas 、Triparma、Tetraparma、Pentalamina。
    • 珪藻類Dumortier 1821 [珪藻類Haeckel 1878 ]
      • レプトシリンドロフィティナD.G. Mann、Adl et al. 2019年
        • レプトシリンドロ藻類D.G. Mann、Adl et al. 2019年。レプトシリンドルス、テヌイシリンドルス。
        • Corethrophyceae D.G. Mann、Adl et al. 2019年。コアスロン。
      • エラーベッキオフィティナD.G. Mann、Adl et al. 2019年。エラーベッキア。
      • Probosciophytina D.G. Mann、Adl et al. 2019 . Proboscia。
      • メロシロフィティナD.G. Mann、Adl et al. 2019年。アウラコセイラ、メロシラ、ヒアロディスカス、ステファノピクシス、パラリア、エンディクティア。
      • Coscinodiscophytina Medlin & Kaczmarska 2004、修正。アドルら。 2019年。アクチノプティコス、コシノディスカス、アクティノサイクルス、アステロムファルス、アウラコディスカス、ステラリマ。
      • リゾソレニオフィティナD.G. Mann、Adl et al. 2019年。ギナルディア、リゾソレニア、シュードソレニア。
      • Arachnoidiscophytina D.G. Mann、Adl et al. 2019 . Arachnoidiscus。
      • Bacillariophytina Medlin & Kaczmarska 2004、修正。アドルら。 2019年
        • Medlin & Kaczmarska 2004 のMediophyceae Jouse & Proshkina-Lavrenko 著
          • Chaetocerotophycidae Round & RM Crawford in Round et al. 1990年、終了。アドルら。 2019年。ケトセロス、バクテリアストラム、ダクティリオソレン、ケラタウリナ、ヘミアウルス、ユーカンピア、アカントセラス、ウロソレニア、テルプシノエ、ヒドロセラ。
          • Lithodesmiophycidae Round & RM Crawford in Round et al. 1990年、終了。アドルら。 2019年。リトデスミウム、リソデスミオイデス、ヘリコテカ、ベレロケア、ディティラム。
          • Thalassiosirophycidae Round & RM Crawford in Round et al. 1990。Thalassiosira、Lindavia、Cyclotella、Stephanodiscus、Cyclostephanos、Discostella、Bacteriosira、Skeletonema、Detonula。
          • Cymatosirophycidae Round & RM Crawford in Round et al. 1990年。キマトシラ、ミヌートセルス、パピリオセルルス、レヤネラ、エクスチューブボセルルス、斜廓モプシス、カンピロシラ、ブロックマニエラ、ピエールコンペリア。
          • Odontellophycidae D. G. Mann、Adl et al. 2019年。オドンテラ、トリケラチウム、ケラタウルス、プレウロシラ、シューダウリスカス、アンフィテトラス、トリエール、マストディスカス。
          • キク科D.G. Mann、Adl et al. 2019年。クリサンテモディスカス、ビドゥルフィオプシス、トリゴニウム、イスミア、ランプリスカス、スティクトサイクルス、アルディソネア、クリマコスフェニア、トキサリウム。
        • Biddulphiophyceae D. G. Mann、Adl et al. 2019年
          • Biddulphiophycidae Round と RM Crawford in Round et al. 1990年、終了。アドルら。 2019年。ビドゥルフィア。
          • アテヤ・T・ウェスト 1860年
        • 桿菌藻類Haeckel 1878、修正。アドルら。 2019年
          • Striatellaceae Kützing 1844 . Striatella、Pseudostriatella。
          • ウルネイド藻類^(P?) Medlin 2016。プラジオグラマ、ディメレグラマ、ラフォニス、デルフィネイス、プサモネイス、ブリーケレヤ、アステリオネロプシス。
          • Fragilaliophycidaeラウンドインラウンド、Crawford & Mann 1990、修正。アドルら。 2019年。フラギラリア、シネドラ、タベラリア、アステリオネラ、珪藻、タブラリア、シクロフォラ、アストロシュネ、リクモフォラ、ラブドネマ、グラマトフォラ、スタウロシラ、タラシオネマ。
          • バシラリオフィシダエD.G.マン・イン・ラウンド、クロフォード＆マン 1990、修正。アドルら。 2019年。ユーノティア、アクナンテス、バシラリア、ニチア、シュードニチア、シリンドロテカ、ナビキュラ、セミナビス、ハスレア、プルウロシグマ、ジャイロシグマ、アクナンチジウム、ココネイス、フルツリア、ディプロネイス、セラフォラ、ピンヌラリア、ゴンポネマ、シンベラ、ディディモスフェニア、フェオダクチラム、アンフォラ、エントモネイス、エピテミア、スリレラなど。
            • ナヴィキュラレス・ベッセイ 1907
              • Stauroneidaceae D.G.マン・イン・ラウンド、クロフォード＆マン 1990 年。クラティキュラ、ドロフェユケア、フィストゥリフェラ、カラエビア、マディニチディウム、パーリベラス、プレスタウロニス、スタウロネイス、シゾスタウロン。^{[ 184 ]}
    • Dictyochophyceae Silva 1980 [Silicoflagellata Lemmermann, 1901 ]
      • Dictyochales Haeckel 1894 [Dictyochida Borgert, 1891 ; Dictyochaceae Lemmermann, 1901 ] 。Dictyocha。
      • フロレンシエラレスエイクレム、エドヴァルドセン、トロンセン 2007 年。^{[ 185 ]}フロレンシエラ、ヴェルコフォラ。
      • Pedinellales Zimmermann et al. 1984 [Ciliophryida Febre-Chevalier, 1985 ; Actinomonadaceae Kent , 1880 ]。Actinomonas 、Apedinella、Ciliophrys、Mesopedinella、Palatinella、Pedinella、Pseudopedinella、Pteridomonas。
      • リゾクロムリナ目O'Kelly & Wujek 1994 [リゾクロムリナ科O'Kelly & Wujek, 1994 ]。リゾクロムリナ。
    • ペラゴ藻綱Andersen & Saunders 1993
      • ペラゴモナダレスアンデルセン＆サンダース 1993。オーレオコッカス、ペラゴコッカス、ペラゴモナス。
      • サルシノクリシダレス目Gayral & Billard 1977
        • サルシノクリシダ科Gayral & Billard 1977。アンキロクリスシス、アラクノクリシス、オーレオスケダ、オーレオウンブラ、ネマトクリソプシス、ペラゴスピルス、プルビナリア、サルシノクリシス、サルガソコッカス。
        • クリソシス科M.Melkonian、HSYoon & RAAndersen 2018。^{[ 186 ]}クリソシスティス、クリソラインハルディア、ソンミンブーア。
      • プロカミオモナダレス ダウグビャーグ & ラブジョイ 2024。プロカミオモナス。^{[ 187 ]}