ボド（発掘）

ボド
	ボド・サルタン
科学的分類
ドメイン：	真核生物
門:	ユーグレノゾア
クラス：	キネトプラステア
注文：	Eubodonida ; Vickerman、Moreira et al.、2004 年
家族：	ボドニダエ; Bütschli , 1883
属:	ボド・; エーレンベルグ、1830年
タイプ種
	ボド・サルタン; エーレンベルク、1830

ボド（ / ˈ b oʊ d oʊ /）は、1831年にクリスチャン・ゴットフリート・エーレンベルクによって初めて記載された、微小なキネトプラスチド属、鞭毛虫の属です。^[1]この属は小さく、最近4種のみを含むように再定義されました。^[2]ボドには、多くの海洋および淡水環境と一部の陸生環境で見られる自由生活性の貪食性生物が含まれます。貪食性であるボドは、水系の生息地を泳ぎながら見つけた細菌やその他の微生物を食べます。^[3]泳ぐような動きは、ボドが持つ、前方に位置する鞭毛ポケットから生じる2本の不均等な鞭毛によって可能になります。^[4]ボドはほぼ豆の形をしており、その小さいサイズのために水または陸生環境のサンプルでは見逃されることがよくあります。

歴史

この属は1831年にクリスチャン・ゴットフリート・エーレンベルクによって、卵形の体と非常に短い尾を持ち、透明で摂取した食物の色がわかると最初に記載された。^[1]エーレンベルクはまた、タイプ種のボド・サルタンスを緑色であると記載したが、これは後に、緑色は摂取した光合成細菌によるものであることが発見され、反証された。^[4] 1988年、ボドは多くの種類の細菌を食べる貪食生物であり、細菌の中には他の細菌よりも魅力的なものがあることが判明した。^{[4] 2002年、シンプソンらはボド科魚類を細分化し、その結果、}ボド属のほとんどの種が他の属に移され、ボド属は縮小した。^[5] ボド属は新しい目であるエウボドニダに分類され、この変更により、元々149種あった種はわずか4種にまで削減されました。^[5] 2002年以降、11の新種がこの属に追加されましたが、そのうち9種は議論の的となっています。^[2] 130年後、ボド属は改良され、現在ではボドニダエ科で唯一の属となり、均質なグループとなっていますが、この種についての研究が進むにつれて、より多くの変化が生じる可能性があります。^[2]多重遺伝子解析を行った後でも、この属への特定の種の配置については依然として大きな議論があり、この時点に到達するまでに130年かかりました。^[6]

生息地と生態学的重要性

自然界では、ボドは海水や淡水、および糞など水分の多い陸上環境に生息しています。^[4] ボドは、それが属する食物網の底近くに生息しています。ボドは食性生物であるため、摂取することで細菌を食べますが、ボドは透明であるため、そのことが生物の色の変化を引き起こすことがあります。^[4]多くの場合、細菌は光合成性であり、つまりボドは自分でエネルギーを生成する能力がないため、食物網の第2層の一部です。ボド属のいくつかの種は、海洋で最も豊富な巨大ウイルスであるボド・サルタンス・ウイルス（BsV）として知られる巨大ウイルスに感染しています。 ^{[7]ウイルスの異なる株は、特定の種にのみ感染することができ、}ボド・サルタンスの場合は、その非常に異質な分類群の特定の株にさえ感染することができます。^[7]

形態学

ボドは顕微鏡でしか見えない、二鞭毛を持つ腎臓形の単細胞生物で、最大の細胞は長さ8μm、幅5μmです。^[4]小さな生物の中には、長さ3μm、幅2μmほどのものもあります。この生物は透明ですが、光合成細菌を取り込むため、しばしば緑のブドウに似ています。^[1] ボドには、長い鞭毛の先端を使って基質に付着する能力を持つ自由生活生物も含まれます。この鞭毛の通常の機能は移動ですが、付着することで摂食流が作られます。^[4]摂食中、通常はマスティゴネムが付いている2つの鞭毛のうち短い方を掃くように動かし、細胞膜のすぐ下にある頬周囲のラペットに向かって細菌を移動させます。頬周囲のラペットは膜に巻き付いて細菌を頬腔内に取り込み、そこから細菌は細胞咽頭へと運ばれます。細胞咽頭では細菌は食物胞に包み込まれ、消化と貯蔵が可能になります。^[4]

ボドサルタンスの細胞内には、収縮液胞、キネトプラスト、鞭毛ポケット、ループ状のミトコンドリア、核も含まれています。キネトプラストの近くには、細胞咽頭を支える役割を果たす8つの微小管があります。これらの微小管は、1988年にミッチェルらが議論したように、摂取に関与していると考えられていますが、積極的な役割を果たしているかどうかは未確認です。ループ状のミトコンドリアは細胞の内部容積の大部分を占め、環状DNAの大きなネットワークであるキネトプラストを含んでいます。^[4]

遺伝学

ボド属が最近再定義された後も、ボド・サルタンスは非常に多様な遺伝的多様性を持っており、この種は今後さらに細分化される必要があると思われます。この属の他の種は分子レベルで研究されていません。キネトプラストDNA（kDNA）は、生物を正しく複製するために必要な何千もの環状DNA断片で構成されています。^[8]これらの環状遺伝子は、いくつかの遺伝子が完全な形で存在せず、断片が複数の円上に位置するため、非常にユニークなミトコンドリアゲノムを生み出します。kDNAのこの奇妙な分類は、kDNAを使用して系統樹を作成しようとする際の困難さの増加につながります。^[8]

種

ボドセレル
ボド・ロストラトゥス
ボド・サルタン
ボド・ウンキナトゥス

^[9]

ボド属
ボド・グロボスス
ボド・カウダトゥス
ボド尾状嚢胞

参考文献

^ abc クリスチャン・ゴットフリート・エーレンベルク(1832)。「Über die Entwickelung und Lebensdauer der Infusionsthiere; nebst ferneren Beiträgen zu einer Vergleichung ihrerorganischen Systeme」。Abhandlungen der Königlichen Akademie der Wissenschaften zu Berlin (ドイツ語)。1831 : 1–154。ISSN 2944-4411。ウィキデータ Q124499817。
^ abc Thomas Cavalier-Smith (2016年9月15日). 「ユーグレノゾアの高次分類と系統発生」. European Journal of Protistology . 56 :250–276. doi :10.1016/J.EJOP.2016.09.003. ISSN 0932-4739. PMID 27889663. Wikidata Q39151632.
^ NA Davidovich; OI Davidovich; Yu. A. Podunay; SL Polyakova; R. Gastineau (2019年4月). 「キネトプラスチドBodo saltans Ehrenberg, 1832に汚染された珪藻類培養物の除染」モスクワ大学生物科学紀要. 74 (2): 63–68. doi :10.3103/S0096392519020032. ISSN 0096-3925. Wikidata Q124499825.
^ abcdefghi Gary C. Mitchell; JH Baker; MA Sleigh (1988年5月). 「淡水鞭毛虫Bodo saltansの多様な細菌に対する摂食」. Journal of Protozoology . 35 (2): 219–222. doi :10.1111/J.1550-7408.1988.TB04327.X. ISSN 0022-3921. Wikidata Q56003721.
^ ab David Moreira; Purificación López-García; Keith Vickerman (2004 年 9 月 1 日)。「環境シーケンスとより近いアウトグループを使用したキネトプラスチド系統発生の最新ビュー: キネトプラステア綱の新しい分類の提案」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology。54 ( 5): 1861–1875。doi : 10.1099 /IJS.0.63081-0。ISSN 1466-5026。PMID 15388756。Wikidata Q33207150 。
^ Andrew P Jackson、Michael A Quail、Matthew Berriman (2008)。「自由生活キネトプラスチドのゲノム配列に関する考察：Bodo saltans（キネトプラスチダ：ユーグレノゾア）」( BMC Genomics ) 。9 ( 1 ) : 594。doi : 10.1186 / 1471-2164-9-594。ISSN 1471-2164。PMC 2621209。PMID 19068121。Wikidata Q21263159 。
^ Christoph M Deeg、Cheryl-Emiliane T Chow、 Curtis A. Suttle (2018年3月27日) 。「キネトプラスチド感染性ボドサルタンスウイルス（ BsV）、海で最も豊富な巨大ウイルスへの窓」eLife。7。doi：10.7554 / ELIFE.33014。ISSN 2050-084X。PMC 5871332。PMID 29582753。Wikidata Q52340619 。
^ ab ジュリアス・ルカシュ; D・リス・ギルブライド。ヤン・ヴォティプカ。アレナ・ジコバ。ロブ・ベンポール・T・イングランド（2002年8月1日）。「キネトプラスト DNA ネットワーク: ありそうもない構造の進化」。真核細胞。1 (4): 495–502。土井:10.1128/EC.1.4.495-502.2002。ISSN 1535-9778。PMC 117999。PMID 12455998。ウィキデータ Q24531931。
^ Guiry, MD & Guiry, GM 2020. AlgaeBase. 世界的な電子出版物、アイルランド国立大学、ゴールウェイ。http://www.algaebase.org

[:0-1] クリスチャン・ゴットフリート・エーレンベルク(1832)。「Über die Entwickelung und Lebensdauer der Infusionsthiere; nebst ferneren Beiträgen zu einer Vergleichung ihrerorganischen Systeme」。Abhandlungen der Königlichen Akademie der Wissenschaften zu Berlin (ドイツ語)。1831 : 1–154。ISSN 2944-4411。ウィキデータ Q124499817。

[:1-2] Thomas Cavalier-Smith (2016年9月15日). 「ユーグレノゾアの高次分類と系統発生」. European Journal of Protistology . 56 :250–276. doi :10.1016/J.EJOP.2016.09.003. ISSN 0932-4739. PMID 27889663. Wikidata Q39151632.

[3] NA Davidovich; OI Davidovich; Yu. A. Podunay; SL Polyakova; R. Gastineau (2019年4月). 「キネトプラスチドBodo saltans Ehrenberg, 1832に汚染された珪藻類培養物の除染」モスクワ大学生物科学紀要. 74 (2): 63–68. doi :10.3103/S0096392519020032. ISSN 0096-3925. Wikidata Q124499825.

[:2-4] Gary C. Mitchell; JH Baker; MA Sleigh (1988年5月). 「淡水鞭毛虫Bodo saltansの多様な細菌に対する摂食」. Journal of Protozoology . 35 (2): 219–222. doi :10.1111/J.1550-7408.1988.TB04327.X. ISSN 0022-3921. Wikidata Q56003721.

[:3-5] David Moreira; Purificación López-García; Keith Vickerman (2004 年 9 月 1 日)。「環境シーケンスとより近いアウトグループを使用したキネトプラスチド系統発生の最新ビュー: キネトプラステア綱の新しい分類の提案」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology。54 ( 5): 1861–1875。doi : 10.1099 /IJS.0.63081-0。ISSN 1466-5026。PMID 15388756。Wikidata Q33207150 。

[6] Andrew P Jackson、Michael A Quail、Matthew Berriman (2008)。「自由生活キネトプラスチドのゲノム配列に関する考察：Bodo saltans（キネトプラスチダ：ユーグレノゾア）」( BMC Genomics ) 。9 ( 1 ) : 594。doi : 10.1186 / 1471-2164-9-594。ISSN 1471-2164。PMC 2621209。PMID 19068121。Wikidata Q21263159 。

[:4-7] Christoph M Deeg、Cheryl-Emiliane T Chow、 Curtis A. Suttle (2018年3月27日) 。「キネトプラスチド感染性ボドサルタンスウイルス（ BsV）、海で最も豊富な巨大ウイルスへの窓」eLife。7。doi：10.7554 / ELIFE.33014。ISSN 2050-084X。PMC 5871332。PMID 29582753。Wikidata Q52340619 。

[:5-8] ジュリアス・ルカシュ; D・リス・ギルブライド。ヤン・ヴォティプカ。アレナ・ジコバ。ロブ・ベンポール・T・イングランド（2002年8月1日）。「キネトプラスト DNA ネットワーク: ありそうもない構造の進化」。真核細胞。1 (4): 495–502。土井:10.1128/EC.1.4.495-502.2002。ISSN 1535-9778。PMC 117999。PMID 12455998。ウィキデータ Q24531931。

[9] Guiry, MD & Guiry, GM 2020. AlgaeBase. 世界的な電子出版物、アイルランド国立大学、ゴールウェイ。http://www.algaebase.org