ロデルフィス

ロデルフィス
科学的分類
クレード:	アーケプラスチダ
門:	ローデルフィディア・ チホネンコフ、ガウリルク、ミルニコフ、キーリング、2019
クラス：	ロデルフェア・ ティコネンコフ、ガウリルク、ミルニコフ、キーリング、2019
注文：	ローデルフィダ・ チホネンコフ、ガウリルク、ミルニコフ、キーリング、2019
家族：	ローデルフィダエ チホネンコフ、ガウリルク、ミルニコフ、キーリング、2019
属:	ローデルフィス・ チホネンコフ、ガウリルク、ミルニコフ、キーリング、2019 [1]
種[2]
R. リムネティクス R. マリヌス R.ミルニコビ

ロデルフィスは単細胞のアーキプラスチドで、水生環境に生息し、紅藻類やおそらくピコゾアの姉妹群である。紅藻類には鞭毛段階がなく、一般的に光合成独立栄養であるのに対し、ロデルフィスは非光合成プラスチドを含む鞭毛捕食者である。 ^[1]このグループは、初期のアーキプラスチドの形態と生化学に関する洞察を提供するため、プラスチドの進化を理解する上で重要である。ロデルフィスには光合成ができない残存プラスチドが含まれているが、ヘム合成や鉄硫黄クラスタリングなど、細胞内の生化学的経路で役割を果たしている可能性がある。 ^[1]プラスチドにはゲノムはないが、遺伝子は核からそれに向けられる。 ^[1] ロデルフィスは卵形で、先端が先細りになっており、垂直に向いた2本の鞭毛がある。 ^[1]

Rhodelphisは、2019年にRyan MR Gawrylukと共著者によってNatureに掲載された論文を通じて記述されました。この属は、過去数年にわたって分離された原生生物の2つの異なる培養物のために作成されました。Rhodelphis marinusは、2015年にベトナムのコンダオ島、アイランドベイカンの海洋サンゴ砂から初めて収集されました。Rhodelphis limneticusは、2016年にウクライナのチェルニゴフスカヤ州の淡水湖から初めて収集されました。^[1] 3番目の種であるRhodelphis mylnikoviは、2023年にフランスのモンティニー＝ル＝ブルトンヌー近くの淡水池から分離されました。^[2]

現在までに、Rhodelphis属の 3 種が記載されています。

• Rhodelphis limneticus Tikhonenkov、Gawryluk、Mylnikov、Keeling、2019 ^[1]
• Rhodelphis marinus Tikhonenkov、ガウリルク、ミルニコフ、キーリング、2019 ^[1]
• ローデルフィス・ミルニコヴィ・ プロキナ、チホネンコフ、ロペス・ガルシア、モレイラ、2023年^[2]

ロデルフィスは細菌や小型真核生物の鞭毛虫を餌とする従属栄養性の 捕食者だが、水生生態系におけるその役割についてはほとんどわかっていない。知られているロデルフィスの3種は、非常に異なる水生生息地から分離されており、そのうち1種は浅い海水（R. marinus ）から、2種は淡水（R. limneticusとR. mylnikovi ）から分離されている。^{[1] [2]}

ロデルフィスは直径10～13μmの卵形の単細胞生物である。細胞には色素が含まれないため、顕微鏡で見るとほぼ透明で、傘状の糖柱で覆われている^{[説明が必要]}。^[1]細胞は運動性があり、2本の鞭毛を使って泳ぎ回ることができる。細胞の前端のすぐ下から始まる鞭毛は互いに垂直で、長さはほぼ同じである。^{[1]後方に向いた鞭毛は毛のような}マスティゴネムで覆われている。目立った摂食装置は存在しないが、後端で獲物の貪食が行われる。 ^[1]

顕微鏡では特定されていないが、プラスチド輸入タンパク質の証拠から、ロデルフィスの非光合成性残存プラスチドが明らかになった。プラスチドは鉄硫黄クラスターの組み立てとヘム生合成においていくらかの機能を保持しているが、脂肪酸やイソプレノイドを合成しない。ロデルフィスは、このために細胞質内の別の経路を使用する。 ^[1] ロデルフィスには、鉄硫黄クラスター生合成経路を持ち、ヘム生合成に関与する管状クリステを持つミトコンドリアも含まれる。^[1]

ロデルフィスは紅藻の姉妹群だが、両群の遺伝子構成は大きく異なる。ロデルフィスのゲノムは紅藻のゲノムよりもはるかに大きく、その遺伝子にははるかに多くのイントロンが含まれている。^[1]さらに、ゲノム解析により、ロデルフィスには、べん毛タンパク質や貪食に必要な成分をコードする配列など、紅藻には存在しない配列が多数含まれていることが明らかになった。^[1]

紅藻類とロデルフィスの共通祖先は、原始プラスチドの進化の初期に起こった一次共生現象から生まれた。^[1] ロデルフィスには、プラスチドを標的とするタンパク質と、葉緑体にあるタンパク質輸送体の相同遺伝子が含まれていることがわかった。プラスチドを標的とする遺伝子は、紅藻類のものと一致した。^[1]核からプラスチドへのタンパク質の標的化にもかかわらず、ロデルフィスには光合成に関与する可能性のあるタンパク質が2つしか含まれておらず、プラスチドゲノムは完全に失われていると思われる。^[1]

ロデルフィスは、原始プラスチドを獲得した共通の祖先を持つグループである原始プラスチドの一部です。一次共生イベントの中間体はほとんど存在しないため、ロデルフィスの発見は、そもそもプラスチドを取り込んだ可能性のある生物の種類、つまりすべての原始プラスチドの祖先についての洞察を提供できる可能性があります。さらに、タンパク質の標的化や、食栄養から混合栄養への移行など、プラスチドの進化の初期に行われたいくつかのステップを示しています。^[1]  これらの発見は、世界中で不可欠な一次生産者である緑藻、植物、紅藻の進化を理解する上で重要です。

• ピコゾアは、紅藻類および紅藻類の姉妹群とされる。

• ニコレッタ・ラネーゼ、デニス・ティコネンコフ（画像）：本日の画像：捕食性原生生物 — 原生生物の Rhodelphis limneticus は、遺伝的に近縁な紅藻類とほとんど類似点がありません。掲載元：The Scientist。2019 年 7 月 19 日。