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bioRxiv（「バイオアーカイブ」と発音される[ 1 ] [ 2 ]）は、2013年11月にジョン・イングリスとリチャード・セバーによって共同設立された、生物科学のためのオープンアクセスプレプリントリポジトリである[ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]。 2025年3月11日までコールド・スプリング・ハーバー研究所（CSHL）がホストしていたが、その所有権は新たに設立された非営利団体openRxivに移管され、bioRxivとmedRxivを運営している[ 6 ]。
プレプリントとしてbioRxivに掲載される論文は査読を受けていません（ただし、投稿論文が査読を受けている場合や、他の情報源からの査読結果がプレプリントと併せて掲載される場合もあります）。しかし、すべての投稿論文は、セキュリティチェック、自動盗用スクリーニング、適切性評価を含む基本的な審査プロセスを経ます。さらに、読者はコメントを投稿できます。
bioRxivに投稿された論文の3分の2が後に査読付きジャーナルに掲載されることが測定されている。[ 7 ] BioRxivとその姉妹サイトであるmedRxivは、 COVID-19研究の普及における主要な情報源となっている。[ 8 ] [ 9 ]
BioRxivは、主に数学、物理学、および関連分野に焦点を当てたarXivリポジトリに触発され、それを補完することを目的としており、1991年にポール・ギンスパーグ（bioRxiv諮問委員会にも参加）によって立ち上げられました。CSHLとルーリー財団の両方から支援を受けています。[ 10 ]チャン・ザッカーバーグ・イニシアチブからの追加資金は2017年4月に確認されました。[ 11 ] [ 12 ]
bioRxivが設立される以前は、生物学者の間では、専用のプレプリント公開リポジトリを持つことについて意見が分かれていました。[ 4 ]多くの研究者は、研究成果が競合他社に先を越され、発見者としての権利を失うことを懸念していました。しかし、複数の遺伝学者がarXivリポジトリの「定量的生物学」セクション（2003年に開設）に論文を投稿し、プレプリントを提示することで発見者としての主張を裏付けることができるため、もはやそのような懸念はなくなりました。[ 4 ] [ 13 ]
Science誌のジョセリン・カイザー氏は、このリポジトリは初年度に「控えめながらも増加傾向にある論文の流れを引き付け」、824件のプレプリントを掲載したと述べた。[ 14 ] 2015年には、bioRxivに掲載されたプレプリントについて 2万件以上のツイートがあった。[ 10 ]
2016年2月、bioRxivへの投稿数は月平均約60件から約200件へと着実に増加した。[ 10 ] 2017年には、月間投稿数は3月の800件超[ 15 ]から7月には1000件超[ 16 ]へと増加し、2017年全体では10,722件の論文が投稿された。[ 17 ]
2018年には合計20,000件の原稿が投稿され、月平均1600件の論文が投稿されたことになる。[ 18 ]
2019年には31,000件を超える原稿が投稿され、月平均2,600件の論文が投稿された（2019年第4四半期には月平均3,000件強に加速した）。[ 19 ]
年間の原稿数は2020年に38,088件に増加し、2021年にはわずかに増加して40,223件となり、2022年には36,417件の原稿が出版されました。2022年12月31日現在、合計で約18万件のプレプリントが受理されています。[ 20 ]
bioRxivは以下の分野のプレプリントを受け付けています。
bioRxivの人気を受けて、多くの生物学ジャーナルがプレプリントに関する方針を更新し、[ 10 ] [ 14 ]インゲルフィンガー規則の目的上、プレプリントは「先行出版物」とはみなされないことを明確にした。
bioRxiv to Journals (B2J) イニシアチブにより、著者は bioRxiv を介してジャーナルの投稿システムに直接原稿を提出することができます。2020 年 5 月現在、177 のジャーナルがこのイニシアチブに参加しています。[ 1 ]
2019年、BioRxivはプレプリントへのコメントに加えて、プレプリントと並んでレビューを投稿することを許可し始めた。レビューはジャーナルやReview Commonsなどのプラットフォームから得られる。[ 21 ]