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| リムノフィラ | |
|---|---|
科学的分類 
| |
| ドメイン： | 真核生物 |
| クレード: | 発汗抑制剤 |
| クレード: | ロシア |
| 門: | ケルコゾア |
| クラス： | グラノフィロセア |
| 注文： | リムノフィリダ キャバリエ・スミス＆バス、2009 |
| 家族： | リムノフィラ科 キャバリア・スミス＆バス、2009 |
| 属: | リムノフィラ キャバリエ・スミス＆バス、2009年[1] |
| タイプ種 | |
| リムノフィラ・ボロケンシス キャバリエ・スミス＆バス、2009年
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| 種 | |
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リムノフィラ（ギリシャ語の limnos 「湿地」とfila 「糸」に由来）は、淡水に生息し、細菌を餌とする従属栄養 原生生物の属です。土壌生態系にも存在し、細菌の捕食者として重要な役割を果たしています、リムノフィラ目Limnofilidae科に分類されます。
特徴
リムノフィラ類は系統学的に最大の系統群として定義され、現在唯一のメンバーであるリムノフィラを含むが、白目類に属するマッシステリアは除外される。系統学的に遠い海洋性ナノフィラは形態学的には類似しているが、枝分かれしていない糸状仮足を持つ。これらは、摂食中に基質に付着する非常に細い枝分かれした顆粒状の糸状仮足（または顆粒仮足）を持つ小型の淡水従属栄養原生生物である。栄養（摂食）段階は小さな球状細胞である。鞭毛を示すことがあるが、通常は光学顕微鏡では見えない。[1]
リムノフィリダ属の2種（ L. borokensisとL. mylnikovi）の細胞超微細構造が研究されている。これらの種は平らなミトコンドリアクリステと複雑な同心円構造の外節を呈している。糸状仮足（糸状または糸状の仮足）は2～6本の微小管の束で支えられている。ヘリオモナディダ属とは異なり、顕著な中心体を持たない。[1]
エコロジー
リムノフィラダは細菌食性の真核生物で、貪食作用によって細菌を餌とする。そのため、土壌中の微生物の重要な捕食者であり、土壌原生生物の多様な生態学的コミュニティに属している。[2]淡水グループとして説明されているが、[1]土壌微生物群集に存在している。ドイツの温帯農地では、ケルコゾアの環境DNA配列またはOTUの少数派として出現する（1.3%）。[2]ノルウェーとチェコ共和国の2つの異なる森林土壌で見つかったケルコゾアのOTUの同様の少数派（2%）も構成しているが、落ち葉、純粋土壌、根圏、植物の根との関連など、すべてのレベルにわたって一貫して存在している。[3]
系統学
L. アングリカ
L. ロンガ
L. ロンガ
L.オキソニエンシス
L. ボロケンシス
L. ミルニコビ
L. ミルニコビ
起源と語源
Limnofila属は 、2009年に原生生物学者のThomas Cavalier-SmithとDavid BassがProtist誌に発表した研究論文によって創設された。この属は、系統解析では内生類亜綱にも有孔虫亜綱にも属さない、顆粒状の糸状仮足（または糸状仮足）を持つ裸アメーバ数種を含むと説明された。18S rRNA遺伝子に基づく系統解析に基づき、これらは同論文で新たに説明されたCercozoaのGranofiloseaクレードに分類された。特に、この属は単型のLimnofilida目Limnofilidae科に分類された。Limnofilidaは、 Limnofilaを含むがLeucodictyidaに属するMassisteriaを除いた最も包括的なクレードとして定義された。リムノフィラという名前はギリシャ語のlimnos （湿地）とfila （糸）に由来しており、 淡水にのみ生息し、非常に細い糸状の糸状仮足を持つことを強調しています。[1]
分子系統学
リムノフィラおよびリムノフィリダ属は、グラノフィロセア内で最も早く分岐した 系統群であり、これにロイコディクティダ、クリプトフィリダ、デスモソラシダが続く。グラノフィロセアは、残りの糸状ケルコゾアアメーバを含むモナドフィロサの姉妹群である。以下は、18S rRNA遺伝子に基づく2011年の系統解析によるグラノフィロセアの簡略化された系統樹であり、環境DNAの系統群は示されていない。[1] [4]
種
Limnofilaには5種あり、すべてこの属が初めて記載された2009年の同じ論文に記載されています。2種、L. anglicaとL. longa は、イギリスのカンブリアにあるプリーストポットとして知られる淡水湖から分離されました。[5] 1種、L. oxoniensisは、オックスフォードの庭の土壌から分離されました。残りの2種、L. borokensisとL. mylnikovi は、ロシアのヤロスラヴスカヤ州ボロクの廃棄物処理施設で収集されたサンプルから分離され、当初はGymnophrys cometaと誤認されていました。[6] [1]
- リムノフィラ アングリカ—カンブリア州、イギリス。
- Limnofila borokensis —ボロク、ロシア。
- Limnofila longa — イギリス、カンブリア州。
- Limnofila oxoniensis —オックスフォード、イギリス。
- リムノフィラ・ミルニコヴィ— ロシア、ボロック（未配列）。
参考文献
- ^ abcdefgh Bass D, Chao EE, Nikolaev S, Yabuki A, Ishida K, Berney C, Pakzad U, Wylezich C, Cavalier-Smith T (2009). 「新しい裸の糸状虫と網状虫の系統発生: Granofilosea cl. n. と Proteomyxidea の改訂版」. Protist . 160 (1): 75–109. doi :10.1016/j.protis.2008.07.002. PMID 18952499.
- ^ ab デグリューネ、フロリン;デュマック、ケネス。フィオーレ＝ドンノ、アンナ・マリア。マイケル・ボンコウスキー。ソーサ・エルナンデス、モイセス・A.シュローター、マイケル。カウツ、ティモ。フィッシャー、ドリーン。マティアス・C・リリグ（2019年4月）。 「温帯農地のさまざまな土壌深さにあるケルコゾアの特徴的な群落」。FEMS 微生物学、生態学。95 (4):fiz041。土井：10.1093/femsec/fiz041。
- ^ Fiore-Donno, Anna Maria; Human, Zander R.; Štursová, Martina; Mundra, Sunil; Morgado, Luis; Kauserud, Håvard; Baldrian, Petr; Bonkowski, Michael (2022). 「窒素沈着量が異なる森林における土壌原生生物群集分布の主な要因としての土壌コンパートメント（バルク土壌、落葉、根および根圏）」。土壌生物学および生化学。168 : 108628。doi : 10.1016 / j.soilbio.2022.108628。hdl : 10852/101716。
- ^ Howe AT、Bass D、Scoble JM、Lewis R、Vickerman K、Arndt H、Cavalier-Smith T (2011)。「新種の培養原生生物がCercozoaの深く分岐した環境DNA系統群を同定：新属Tremula、Micrometopion、Minimassisteria、Nudifila、Peregrinia」。原生生物。162 ( 2): 332–372。doi :10.1016/ j.protis.2010.10.002。ISSN 1434-4610 。
- ^ Calabuig I (2016)、Priest Pot種リスト、カンブリア、イギリス、コペンハーゲン大学生物学部、doi :10.15468/lih6qc 、 2023年9月22日閲覧
- ^ Nikolaev, SI; et al. (2003). 「Gymnophrys cometa と Lecythium sp. はコア Cercozoa: 進化上の意味合い」(PDF)。Acta Protozoologica。42 : 183–190。2009-06-17にオリジナル(PDF)からアーカイブ。