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| オストレオコッカス | |
|---|---|
科学的分類 
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| クレード: | 緑色植物 |
| 分割： | 緑藻類 |
| クラス： | マミエロ藻類 |
| 注文： | マミエラ目 |
| 家族： | バチコッカス科 |
| 属: | オストレオコッカス C. コーティーズ & M.-J.クレティエンノ・ディネ (1995) |
| 種 | |
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オストレオコッカスは、マミエロ藻綱に属する単細胞の球状または球形の緑藻の属です。海洋炭素循環で中心的な役割を果たす地球規模のピコプランクトン群集の主要メンバーが含まれます。
歴史
この属の最初のメンバーであるO. tauriは、1994 年にCourties と Chretiennot-Dinet がフローサイトメトリーを使用してThau ラグーンのピコプランクトンの調査中に発見されました。[1]単細胞の光合成生物は、細胞が太陽光を集めて制御するために使用するクロロフィルやその他の蛍光体による自己蛍光により、細胞を染色せずにそのような色素を研究できるため、一般的にフローサイトメトリーを使用した研究に適しています。存在するさまざまな色素は、フローサイトメトリーを使用して細胞ごとに区別および識別できるため、研究者はサンプル内に存在するさまざまな種を推測し、発見された新種の分類に役立ちます。[2] O. tauri は、特徴的なクロロフィル色素とChlorophyceae関連カロテノイド[1]および細胞超微細構造の存在に基づいて、すぐにPrasinophyceaeクラスに分類され、後に 18S rDNA の分析によってその位置が確認されました。 [3] 18SrDNA 配列に基づく分子系統解析により、 Ostreococcus種を 含む新しいクラスである Mamiellophyceae が定義され、 Bathycoccaceae科に分類されました。[4] Mamiellophyceae は、海洋環境、おそらくは淡水環境でも、真核生物の光合成ピコプランクターの中で生態学的に最も成功したグループの 1 つです。 メタゲノム[5] およびメタバーコーディング[6]調査により、多くの海洋地域にOstreococcus属の他のメンバーが存在することが明らかになりました。現在までに4つの異なる種が記載されている：O. tauri、O. lucimarinus [7]、 O . mediterraneus [8]、O spp. RCC809。[9]
解剖学
この属には、平均サイズが0.8 μmと、知られている中で最も小さい自由生活性真核生物種が含まれます。 [1]この属の細胞の超微細構造は 、これまでのところ、細胞壁を持たず、単一の葉緑体、単一のミトコンドリア、および単一のゴルジ体とその核を含む球状細胞であるという、驚くほど単純な特徴があります。[1]この属の3つのメンバーのゲノム配列が公開されています。 2006年に公開され、2014年に更新されたO. tauri RCC4221の13 Mbの核ゲノム[10] 、および[11] O. lucimarinus CCMP2514 [7]と株RCC809です。 [ 9]これら2つのオストレオコッカス種の代謝ネットワークのドラフトは、 KEGGデータベースから再構築され、熱力学的に制約され、元素的にバランスがとられ、2012年に機能的に評価されました。[12]
参考文献
- ^ abcd コートティ C、ヴァケル A、トルセリエ M、ローティエ J、クレティエンノ＝ディネ MJ、ヌヴー J、マシャド C、クローストル H (1994)。 「最小の真核生物」。自然。370 (255): 255。書誌コード:1994Natur.370..255C。土井：10.1038/370255a0。S2CID 4321127。
- ^ Davey, HM および Kell, DB (1996)「フローサイトメトリーと異種微生物集団の細胞選別: 単一細胞分析の重要性」Microbiological Reviews 60 (4): 641-696
- ^ Courties, C. et al. (1998). 「 Ostreococcus tauri (Chlorophyta, Prasinophyceae)の系統解析とゲノムサイズ」 J. Phycol. 34 (5): 844-849.
- ^ Marin B, Melkonian M. (2010). 核およびプラスチドにコードされた rRNA オペロンの配列比較に基づく Mamiellophyceae クラスの新種 (Chlorophyta) の分子系統学と分類。Protist . 161 (2) :304-36. doi :10.1016/j.protis.2009.10.002
- ^ Piganeau G, Moreau H. (2007). Ostreococcusのゲノム進化を調査するためのデータを得るためサルガッソ海のメタゲノムをスクリーニングする。Gene . 406 : 184-90 doi :10.1016/j.gene.2007.09.015
- ^ Demir-Hilton E et al . (2011). 光合成ピコ真核生物Ostreococcusの異なる系統の世界的分布パターン. ISME J. 5 (7) :1095-107. doi :10.1038/ismej.2010.209
- ^ ab 小さな真核生物オストレオコッカスはプランクトンの種分化のパラドックスにゲノム的洞察を提供する。米国科学アカデミー紀要 104 : 7705–7710。doi :10.1073/ pnas.0611046104
- ^ Subirana L, et al. (2013). 形態、ゲノム可塑性、および系統発生から、Ostreococcus 属の隠蔽種O. mediterraneus sp. nov. (Mamiellales、Mamiellophyceae) が明らかになった。原生生物. 164(5) :643-59. doi :10.1016/j.protis.2013.06.002
- ^ ab 「ホーム - Ostreococcus sp. RCC809」。
- ^ Derelle, E. et al. (2006). 「最小の自由生活真核生物Ostreococcus tauriのゲノム解析により、多くのユニークな特徴が明らかになる」米国科学アカデミー紀要 103 : 11647-52。
- ^ Blanc-Mathieu R, et al. (2014). モデル海藻Ostreococcus tauriの改良ゲノムはIllumina de novo アセンブリの評価によって展開されます。BMC Genomics . 15 :1103. doi :10.1186/1471-2164-15-1103
- ^ Krumholz EW、Yang H、Weisenhorn P、Henry CS 、 Libourel IG (2012)。「ピコ藻類Ostreococcusのゲノムワイド代謝ネットワーク再構築」。Journal of Experimental Botany。63 ( 6): 2353–2362。doi : 10.1093/jxb/ err407。PMID 22207618 。