ラビリンチュロミセス

ラビリンチュロミセス（ICNafp）またはラビリンチュレア^{[ 2 ]}（ICZN）は、フィラメントまたはチューブのネットワーク^[³^]を生成する原生生物のクラスであり、細胞が滑走して栄養を吸収するためのトラックとして機能します。主な2つのグループは、ラビリンチュリド（または粘液網）とスラウストキトリドです。これらは主に海洋性で、藻類や海草に寄生したり、死んだ植物材料を分解したりすることが一般的です。また、海洋無脊椎動物の寄生生物や、ズークロレラと共生関係にある混合栄養種も含まれます。^[⁴^]^[⁵^]^[⁶^]

特徴

ラビリンチュラ菌類の菌糸は細胞の外側にあるが、膜に囲まれている。菌糸は、サゲノゲンまたはボトロソームと呼ばれる独特の細胞小器官によって形成され、細胞質とつながっている。細胞は単核で、通常は卵形であり、5～150μm/分の速度で不定形のネットワークに沿って前後に移動する。ラビリンチュラ類では細胞は管の中に閉じ込められており、スラウストキトリド類では細胞は管の側面に付着している。^{[ 7 ]}

進化

進化上の起源

ラビリンチュロミセスは菌類ではなく、ストラメノパイル内の単系統群の真核生物である。これらはビギラ門に属し、この門にはビコソエシドなどの他の従属栄養微生物が含まれる。ストラメノパイルの色素体は、おそらく最後の共通祖先における細胞内共生の結果であることを考えると、ビコソエシドとラビリンチュロミセスは、二次的に色素体を失った混合栄養藻類の共通祖先から生じた可能性がある。^[³^]

ラビリンチュロミセス類のいくつかの特徴は、祖先のプラスチドに由来することで説明できます。ラビリンチュロミセス類は、通常葉緑体に存在する脱飽和酵素を使用してオメガ3多価不飽和脂肪酸を生成します。ラビリンチュリド類の遊走子には、光合成ストラメノパイルの眼点に似た膜結合顆粒からなる眼点があり、これはプラスチド内にあるか、プラスチドに由来すると考えられています。^[³^]

Bigyraの中では、labyrinthulomycetes はEogyreaの姉妹群であり、Eogyrea にはPseudophyllomitus vesiculosusという種とMAST-4 と呼ばれる環境クレードが含まれています。これらを合わせて Sagenista亜門を構成します。^[⁸^]^[⁹^]

分類

ラビリンチュロミセテスまたはラビリンチュレアは、かつて廃止された菌類門ラビリンチュロミコタを構成していました。^{[ 10 ]}これらは元々は珍しい粘菌と考えられていましたが、他の種類の粘菌とはあまり似ていません。遊走子の構造と遺伝学的研究により、これらは原始的なヘテロコント群であることが示されていますが、その分類と扱いは依然としてやや不確定です。

このクラスは通常、Labyrinthulales目とThraustochytriales目（ICBN）、またはLabyrinthulida目とThraustochytrida目（ICZN）の2つの目を含んでいたが、最近、異なる分類が提案された。^{[ 6 ]}^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}^{[ 1 ]}^{[ 10 ]}

ラビリンチュラ目/ラビリンチュラ目E.A. Bessey 1950/Doffein 1901
- アプラノキトリ科/アプラノキトリイ科Leander ex Cavalier-Smith 2012
  - Aplanochytrium Bahnweg & Sparrow 1972 [= Labyrinthuloides Perkins 1973 ]
- ラビリンチュラ科/ラビリンチュラ科 Haeckel 1868/Cinekowksa 1867
  - Labyrinthomyxa Duboscq 1921
  - Pseudoplasmodium Molisch 1925
  - Labyrinthula Cienkowski 1864 [= Labyrinthodictyon Valkanov 1969 ; Labyrinthorhiza Chadefaud 1956 ]
- 科レベルのクレード「Stellarchytriaceae/Stellarchytriidae」 – このグループは暫定的にLabyrinthulida ^{[ 10 ]}^{[ 1 ]}に分類されていますが、系統解析によると、他のラビリンチュラ類クレードよりも先に分岐しています。^{[ 12 ]}
  - ステラルキトリウム・フィオリト＆リーアンダー 2016
オブロンギキトリ目/オブロンギキトリ目
- オブロンギキトリ科/オブロンギキトリイ科Cavalier-Smith 2012
  - Oblongichytrium Yokoyama & Honda 2007
スラウストキトリ目/スラウストキトリダ Sparrow 1973
- Pyrrhosorus Juel 1901
- Thanatostrea Franc & Arvy 1969
- アルトホルニディア科/アルトホルニ科Jones & Alderman 1972
  - アルソーニア・ジョーンズ＆オールダーマン 1972
- スラウストキトリウム科/スラウストキトリウム科Sparrow ex Cejp 1959
  - ジャパノキトリウムコバヤシ＆オオクボ 1953
  - モノリゾキトリウム土肥＆本多 2017
  - Sicyoidochytrium Yokoy., Salleh & Honda 2007
  - オーランチオキトリウム・ヨコイ。 &ホンダ2007
  - ウルケニア・ガートン、1977年
  - Parietichytrium Yokoy., Salleh & Honda 2007
  - Botryochytrium Yokoy., Salleh & Honda 2007
  - Schizochytrium Goldst. & Belsky emend. Booth & Mill.
  - スラウストキトリウム・スパロウ 1936
  - ホンダエア・アマート＆カニャック 2018
  - Labyrinthulochytrium Hassett & Gradinger 2018 ^{[ 13 ]}
Amphitrematales/ Amphitremida Gomaa et al. 2013年
- 科「Amphitremidiaceae」/ Amphitremidae Poch 1913
  - パランフィトレマ・ヴァルカノフ 1970
  - アーチェレラ・ローブリッヒ＆タッパン 1961
  - アンフィトレマ・アーチャー 1867
- 科「Diplophrydaceae」/ Diplophryidae Cavalier-Smith 2012
  - ディプロフリス・バーカー 1868年
目「Amphifilales」/ Amphifilida Cavalier Smith 2012
- Sorodiplophryidae 科Cavalier-Smith 2012
  - ソロディプロフリスオリーブ & ディクストラ 1975
  - Fibrophrys Takahashi et al. 2016
- Amphifilidae 科Cavalier-Smith 2012
  - Amphifila 属Cavalier-Smith 2012

遺伝暗号

ラビリンチュロミセス属のThraustochytrium aureumは、ロイシンをコードする代わりにTTAを終止コドンとして使用するミトコンドリアの代替遺伝コードで注目に値する。^[¹⁴^]このコードは、 NCBI翻訳テーブル23、Thraustochytriumミトコンドリアコードで表されている。^[¹⁵^]

ギャラリー

光学顕微鏡下で観察したアプラノキトリウム属（Aplanochytrium sp.）
SEMで観察したアプラノキトリウム属（Aplanochytrium sp.）
Aurantiochytrium sp.
最近グループに分類された有殻アメーバであるAmphitremaのテスト
レオン・チェンコフスキーは、1867年にこのグループの最初の属であるラビリンチュラを記載したロシアの植物学者である^{[ 16 ]。}

参考文献

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外部リンク

ラビリンチュロミコタ

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[WIDEMAN_2019-14] Wideman, Jeremy G.; Monier, Adam; Rodríguez-Martínez, Raquel; Leonard, Guy; Cook, Emily; Poirier, Camille; Maguire, Finlay; Milner, David S.; Irwin, Nicholas AT; Moore, Karen; Santoro, Alyson E. (2019-11-25). "従属栄養性鞭毛虫の標的単一細胞ゲノミクスにより明らかになった予期せぬミトコンドリアゲノムの多様性" . Nature Microbiology . 5 (1): 154– 165. doi : 10.1038/s41564-019-0605-4 . hdl : 10871/39819 . ISSN 2058-5276 . PMID 31768028 . S2CID 208279678。

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特徴

進化

進化上の起源

分類

遺伝暗号

ギャラリー

参考文献

外部リンク

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ICZN

フィラメント

を生成する原生生物