ロバート・マクナマラ国防長官

戦略核兵器運搬システムに関して、マクナマラは、地上配備型大陸間弾道ミサイル（ICBM）、海上配備型潜水艦発射弾道ミサイル（SLBM）、短距離攻撃ミサイル（SRAM）を搭載した空中戦略爆撃機からなる三本柱の軍事力構造である核三本柱の開発を継続した。この構造は、抑止力として十分な兵器の存続を確保するために必要であると考えられていた。^{[ 17 ]}

マクナマラは、時代遅れまたは有用性の低い戦略システムの退役を加速させるだろう。^{[ d ]}

国防総省は、空軍からの新しい弾道ミサイル提案を評価するために、1966年11月1日にSTRAT-X研究を開始した。 ^{[ 18 ] [ 19 ]}最初の成果である重弾道ミサイルBGM-75 AICBMは、不安定化を招くという理由で1967年にマクナマラによって中止された。この研究は、マクナマラが退任した後、より高度なミサイルシステムの開発につながった。^{[ e ] [ 20 ]}

SRAMの開発決定に先立ち、米国と英国はアイゼンハワー政権時代にAGM-48スカイボルト空対地弾道ミサイル（ALBM）を共同開発することで合意し、英国はすべてのミサイル計画を中止した。マクナマラは、スカイボルトの試験が失敗に終わり、ポラリスとミニットマンミサイルの試験が成功したことを受け、1962年11月に計画の中止を発表した。ただし、ポラリスとミニットマンの初期の試験失敗率はスカイボルトと同程度であった。彼は1962年11月23日にケネディ大統領を説得して計画を中止させた。これが英国との外交上のスカイボルト危機を引き起こし、ケネディは1962年12月中旬にハロルド・マクミラン首相との会談を急遽開催した。その結果、ナッソー協定が締結され、米国は英国製の核弾頭と潜水艦のために英国海軍にポラリスミサイルを供給することになった（これはマクナマラが反対していた措置である）。^{[ 21 ]}

マクナマラは、戦略航空軍団（SAC）の戦略爆撃機のうち、15分間隔で地上待機する機体の割合を25%から50%に引き上げ、ミサイル攻撃に対する脆弱性を軽減した。また、1961年にはクロームドーム作戦を承認し、熱核兵器を搭載した一部のB-52戦略爆撃機を常時空中待機させ、命令があればソ連の標的を攻撃できる位置につくルートを飛行させた。これがブロークンアロー核兵器事故を複数引き起こすことになった。 ^{[ f ] [ 22 ]}

マクナマラは、核兵器の無許可使用の可能性を懸念していた。彼は、後にパーミッシブ・アクション・リンク（PAL）として知られるようになる装置の開発を提唱した。これは、無許可使用の試みがあった際に核兵器を作動不能にする装置である。PALは最初にヨーロッパに保管されている兵器に設置され、その後米国の兵器庫全体に設置された。^{[ 23 ]}

1961年10月のメモの中で、マクナマラは歩兵が操作する核無反動砲デイビークロケットの指揮統制と拡散について懸念を表明したと伝えられている。^{[ 24 ]}

1958年から1961年までの核実験モラトリアムが終了する前に、マクナマラは個人的に、大気圏内核実験は「実際には必要ない」と認めていた。^{[ 25 ]}ケネディ大統領が大気圏内および大気圏外核実験の再開を決定すると、国防総省は1962年のドミニク作戦、フィッシュボウル作戦、サンビーム作戦の一連の実験に物資支援を行った。部分的核実験禁止条約が署名された後、マクナマラは1963年8月に上院外交委員会で条約批准への「明確な支持」を表明し、米国の核戦力は安全であり、ソ連の核戦力よりも明らかに優れており、ソ連の大規模な核実験は探知されるだろうと主張した。^{[ 26 ]}

任期末期、マクナマラはソ連のミサイルに対する防衛のために米国に設置が提案された弾道ミサイル迎撃システム（ABM）に反対し、400億ドルという金額は「それ自体が問題なのではなく、提案されたシールドの貫通性が問題なのだ」と主張した。 ^{[ g ] [ 27 ]}ソ連が同様の計画を開始したことが明らかになった後、ABM計画を進めるよう圧力を受けたマクナマラは、はるかに少ない数の中国製ミサイルから防衛できると考えた「軽量」システムに最終的に同意した。^{[ h ]}しかし、核兵器に過度に依存することによる心理的リスクや、軍事的に有効ではない大規模なシステムを構築するよう多くの方面から圧力がかかることから、米国がその方向に進むのは賢明ではないと決して考えていなかった。^{[ 28 ]}

マクナマラは、米国にとって最良の防衛戦略はソ連との相互確証破壊の均衡であると常に信じていた。配備された核ミサイル能力の増加に比べれば、ABMシステムは効果のない兵器となるだろう。^{[ 29 ]}

マクナマラ国防長官の下で、米軍は既存の戦術核兵器に新しい弾頭を搭載してアップグレードすることを引き続き受け入れたが、新しい兵器運搬システムは一般的ではなかった。MGM -31パーシング戦域弾道ミサイルの開発と初期配備はマクナマラの下で完了し、これによりいくつかの競合ミサイルが退役した。^{[ i ] [ 30 ]}また、この時期にはMGM-29サージェントとMGM-52ランス短距離弾道ミサイル（SRBM）および革新的なUUM-44 SUBROC対潜ミサイルも開発および/または配備された。^{[ 31 ]}

生物・化学兵器実験プロジェクトであるプロジェクト112は、ロバート・マクナマラによって米軍全体の見直しの一環として承認された。「プロジェクト112」という名称は、マクナマラが承認した150のプロジェクト見直しプロセスにおけるこのプロジェクトの番号を指している。資金と人員は、米軍のすべての部門と情報機関から提供された。プロジェクト112は主に、エアロゾルを使用して「制御された一時的な無力化」を引き起こす可能性のある生物・化学剤を散布することに関するものであった。この実験プログラムは、中央太平洋と南太平洋の「大陸外実験場」で軍関係者が一部被曝する形で大規模に実施され、また、ニューヨークの地下鉄などの民間施設では、同意なしに「無害」とみなされた細菌が秘密裏に使用された。^{[ 32 ]}

1961年9月29日、南ベトナム大統領ゴ・ディン・ディエムは、アメリカ大使フレデリック・ノルティングとアメリカ軍事援助諮問グループ（MAAG）司令官ライオネル・C・マクガー中将と会談し、ベトコンの食料供給を断つために除草剤の使用を要求した。1961年11月6日、ノルティングとマクガーはマクナマラに「落葉剤散布と食料破壊プロジェクト」の開始を要請したが、すぐに返答は得られなかった。^{[ 33 ]}ケネディ大統領は1962年1月に16マイルの道路に落葉剤を散布する試験運用を承認したが、統合参謀本部と国務省はプロパガンダの反発を恐れてこの試験に反対した。^{[ 34 ]}

1962年、マクナマラは、ベトナム戦争でベトナム軍を飢えさせるためにフーイエン省の山岳地帯の水田に除草剤を散布する計画を支持したが、極東担当国務次官補のW・アヴェレル・ハリマンが、これは罪のない人々に害を及ぼすと指摘したため、この計画は中止された。^{[ 35 ]}マクナマラは、どの戦争でも作物は破壊されることをケネディに思い出させ、この計画を推進し続けた。除草剤が禁止されたとしても、南ベトナム軍は手作業かナパーム弾で同じことをするだろう。除草剤の方がはるかに効率的で、少ない労力で敵の食料をより多く破壊できるのだ。^{[ 36 ]}この計画は最終的に実行された。

1963年4月17日、マクナマラは「作物破壊作戦により70万ポンド以上の米が破壊されたと推定される。これはベトコン1000人を1年間養うのに十分な量である。軍事的にも技術的にも、結果は素晴らしかった」との報告を受けた。^{[ 37 ]}

マクナマラは後に、枯葉剤の使用を承認した記憶はないと主張したが、国防総省が彼の在任中に使用していたことは認めた。^{[ 38 ]}

柔軟な対応戦略では、米国は平時において、二つの大規模な地域戦争と一つの小規模な山火事を同時に戦える能力を持つべきだと規定されていた。その結果、人員募集、投資、研究開発が強化された。

ケネディ政権は、共産主義者の「民族解放戦争」に対抗する能力の向上に特に重点を置いた。この戦争では、敵は正面からの軍事衝突を避け、政治的な破壊工作やゲリラ戦術に頼っていた。マクナマラが1962年の年次報告書で述べたように、「軍事戦術は狙撃、待ち伏せ、襲撃である。政治的戦術はテロ、恐喝、暗殺である」。実際には、これは米軍兵士と南ベトナムなどの同盟国を、まさにそのような対反乱作戦のために訓練し装備することを意味した。ケネディは対反乱戦争に魅了され、グリーンベレーとして知られる特殊部隊の開発に大きく力を注いだ。^{[ 42 ]}

通常戦力への注目の高まりは、こうした特殊部隊の準備と相まって、より効果的なものとなった。この場合、マクナマラは予備役を招集し、正規軍の拡大にも着手した。1953年（朝鮮戦争終結）から1961年にかけて現役兵力は約355万5000人から248万3000人に減少したが、1962年6月30日までに約280万8000人に増加した。その後、1965年にベトナム戦争に向けた軍備増強が始まるまで兵力は約270万人で横ばいとなり、マクナマラが退任した直後の1968年半ばには約355万人のピークに達した。^{[ 1 ]}米陸軍指導部は、概して対反乱作戦の流行に強く反対し、対反乱作戦の訓練と部隊の増強を求める大統領の圧力に断固として抵抗した。^{[ 43 ]}米陸軍は、官僚政治、予算上の理由、そして純粋なプライドから、第三世界の国でアサルトライフルなどの比較的低技術の武器で武装した少数の特殊部隊を戦わせるのではなく、中央ヨーロッパでソ連軍と通常戦争を戦うために、最大限の火力を発揮するように設計された高価なハイテク兵器で武装した多数の師団を装備することを望んでいた。^{[ 43 ]}

マクナマラは、米国の抑止力と軍事能力を高めるために他の措置も講じた。1961年12月、彼は米国ストライク・コマンド（STRICOM）を設立した。戦略陸軍軍団（STRAC）、戦術航空軍団（TAC）、軍事航空輸送部隊（MATS）および各軍の空輸部隊から必要に応じて部隊を動員する権限を与えられたストライク・コマンドの任務は、「世界のいかなる地域においても平和に対する脅威に対し、迅速かつ必要なあらゆる戦力をもって対応し、統合軍を増強するか、あるいは個別の緊急作戦を実行すること」であった。

1966年1月8日、軍事航空輸送サービス（MATS）は軍事空輸司令部（MAC）に置き換えられることになった。

マクナマラ国防長官室による最初の行動の一つは、ロッキードC-141スターリフターの生産承認であった。^{[ 44 ]}これに続いて、ロッキードC-5ギャラクシーの開発と調達が行われた。^{[ 45 ]}どちらの航空機も新しい柔軟な対応戦略に必要であり、どちらもプロペラ駆動からジェット輸送機への移行を象徴するものであった。

マクナマラは、インドシナやその他の地域での動向を踏まえると、陸軍の航空機、特にヘリコプターの調達と戦術が十分積極的ではないという懸念を非常に早い段階で抱いていた。彼は陸軍長官エルヴィス・ジェイコブ・スター・ジュニアを飛び越え、1962年4月16日付の覚書を発行し、陸軍航空の「新しい姿」を開発するためにハウズ委員会として知られるようになる組織を設立するよう命じた。委員会は、大規模な空挺攻撃のための空挺機動の概念（つまり、パラシュートではなくヘリコプターによる投下）を開発し、5つの空挺機動師団の編成を求めたが、実際にそのように実施されたのは第101空挺師団のみであった（第1騎兵師団も空挺機動師団となったが、ベトナム戦争の期間中のみであった）。^{[ 46 ]}

ハウズ委員会は、失敗に終わったロッキードAH-56シャイアンや暫定的なベルAH-1コブラなどの攻撃ヘリコプターの開発も加速させた。^{[ 46 ]}マクナマラはコブラの初期テスト飛行を熱心に目撃し、コブラがベルUH-1イロコイと80%の部品共通性を持っていることに魅力を感じた。^{[ 47 ]}

M551シェリダン空挺突撃車両は、マクナマラの下で空挺師団へのパラシュートまたは大型輸送ヘリコプターによる輸送用に開発された軽戦車である。開発上の問題があり、ベトナムへの配備も順調ではなかったが、第82空挺師団は1996年までこれを保有し続けた。^{[ 48 ]}

マクナマラの下で、海軍は一連の新しい高速水陸両用戦闘艦の開発または建造を開始または継続するだろう。その中には非常に革新的な性質を持つものもあるが、実際に建造される数は少ないだろう。^{[ j ]}これらの艦艇はすべて、新しい柔軟な対応戦略のために必要だった。

新たな紛争に迅速に対応しようと、1961年に国防総省は、陸軍の物資を戦略海上輸送船に事前配置し、空輸で空輸された兵士と合流させることを検討し始めた。12隻のそのような船は歩兵師団を支援し、第二次世界大戦時代の87隻のビクトリー船に取って代わる予定だった。これらの船は、 LARC水陸両用車、LCM-8上陸用舟艇、貨物を降ろすためのシコルスキーCH-54ターヘ大型輸送ヘリコプターを搭載する予定だった。1965年に統合参謀本部は30隻の必要性を認識し、議会は1966年に2隻を承認し、マクナマラは1967年7月20日に契約の授与を発表した。これはマクナマラのトータルパッケージ調達政策を利用するものだった。これらの船は直接水陸両用攻撃に参加できなかったにもかかわらず、反戦感情の高まりにより、上院は次の2会計年度の予算を一切認めず、既に承認された2隻の予算も取り消そうとした。^{[ 50 ]}

最初の原子力空母エンタープライズは8基の原子炉を搭載し、マクナマラの就任1年目に完成する予定だった。空母ジョン・F・ケネディは、 4基の原子炉を搭載した原子力空母として設計されていたが、マクナマラは初期費用の高騰を避けるため、従来型燃料の艦として起工するよう命じた。^{[ 51 ]}フレッド・コルト海軍長官は、老朽化し​​た艦艇の全面的な艦隊更新や給与引き上げなど、この件やその他の政策についてマクナマラを説得して方針転換させることができなかったため、1963年11月1日付で辞任した。^{[ 52 ]}マクナマラは、4基の原子炉を搭載した艦艇など、原子炉設計の段階的進歩を提唱するハイマン・リッコーバー提督の主張を拒否した。 ^{[ k ]}また、全水上艦艇に対する原子力の運用上の利点のほとんどを定量化することを拒否し、システム分析プロセスから除外した。議会と海軍では、彼の決定に対する反対が高まった。 1964年8月までに、国防研究開発局長のハロルド・ブラウンはリックオーバーに「正直に言おう、ボブ（マクナマラ）は間違いを犯した。我々は2基の原子炉プラントを開発することで彼を窮地から救わなければならない」と語った。マクナマラはその後、ニミッツ級航空母艦となる艦艇に2基の原子炉プラントを使用することを承認した。^{[ 18 ]}

ケネディ政権は、電子走査アレイレーダーを使用して艦艇の防御の飽和を防ぐRIM-50タイフォン対空ミサイルシステム計画を引き継いでいた。^{[ l ]}開発中に遭遇した技術的な問題とコスト超過が重なり、この計画は1963年11月に中止された。^{[ m ] [ 53 ] [ 54 ]}これにより、新しい巡洋艦の建造は終了した。それ以降に巡洋艦として指定された艦艇はすべて駆逐艦の特性を備え、能力は低下した。^{[ 55 ]} 1966年5月、 L・メンデル・リバース下院議員は、マクナマラの遅延戦術の経験から、カリフォルニア級原子力巡洋艦の開発を義務付ける法的文言を作成した。 ^{[ 18 ]}

1967年までに、ベトナム戦争の莫大な費用（予算とインフレの両方）により、^{マクナマラは空母}フランクリン・D・ルーズベルト、ボストン級およびオールバニー級ミサイル巡洋艦を含むいくつかの最前線艦艇の近代化計画を縮小または中止せざるを得なくなった。^{[ 56 ] [ 57 ]}

1966年4月6日、空軍参謀総長ジョン・P・マコーネルと陸軍参謀総長ハロルド・K・ジョンソンは、長年にわたる軍種間の争いの末、陸軍の固定翼戦術空輸資産を空軍に移管する1966年のジョンソン・マコーネル協定を締結した。統合参謀本部議長アール・ウィーラーは、マクナマラ国防長官や他の参謀総長が関与しないように、この協定を推進した。^{[ 58 ]}

マクナマラ国防長官は、情報活動における各機関の個別かつ連携の取れていない取り組みを精査した後、1961年2月にこれらの機能を統合し、国防情報局（DIA）を設立した。DIAは統合参謀本部（JCS）を通じて国防長官の指揮下に入ることになった。その結果、情報活動は軍の統制下から切り離され、国防長官の統制下に置かれることになった。

1961年8月31日、マクナマラ国防長官は、軍ではなく国防長官の管理下で、統一された物資調達、流通、在庫管理を行うことを目指し、国防補給局を設立した。

1961年9月6日、ミサイル・衛星システム局は国家偵察局となり、国防長官の指揮下に入り、サモスやコロナなどの宇宙偵察計画をすべて引き継いだ。空軍の衛星資産には、 MIDAS早期警戒ミサイル発射探知衛星とVela核爆発探知衛星のみが残った。^{[ 59 ]}

1961年の別の再編では、航空資材軍団は空軍兵站軍団（AFLC）に改称され、一方、兵器システムの開発と取得の責任を担う航空研究開発軍団は、バーナード・シュリーバー将軍の下で空軍システム軍団（AFSC）に改称された。マクナマラが導入したトータルパッケージ調達政策により、システム軍団のプログラムマネージャーの柔軟性は大幅に制限された。^{[ o ] [ 61 ]}

陸軍資材コマンド（AMC）は1962年5月8日に設立され、その後同年8月1日にアメリカ陸軍の兵器システム開発および調達のための主要野戦コマンドとして活動を開始した。^{[ 62 ]}

局制度は1842年から海軍の​​資材支援組織であり、すべての艦船、航空機、兵器の設計を担当していた。局長は大部分が自治権を持ち、海軍長官に直接報告し、他の局の影響を受けることなくそれぞれの組織を管理していたため、第二次世界大戦前と戦中には調整の不備が生じた。1966年、局は徐々に統合司令部（一般に「システム司令部」またはSYSCOMとして知られる）に置き換えられ、海軍作戦部長に報告するようになった。その結果、戦後、局間の調整役を務めていた艦船特性委員会は重要性を失い、その焦点は設計と開発から調達と予算遵守へと移った。^{[ 63 ]}

1962年以前は、各軍種が航空機の指定に独自のシステムを使用していた。1962年9月18日、統一された三軍航空機指定システムが採用された。伝えられるところによると、三軍システムは、当時海軍と空軍が使用していた異なる指定システムに対するマクナマラの混乱と不満がきっかけの一つとなった。^{[ p ] [ 64 ]}同様のミサイルおよびロケット指定システムは、1962年12月11日に採用された。

トータルパッケージ調達（TPP、またはTPPCとも呼ばれる）は、マクナマラによって導入された主要なシステム調達政策であった。^{[ 69 ]}これは、兵器設計の詳細な紙面研究を実施することで、兵器システムの試作コストを回避しようとしたが、紙面研究のコストが大幅に増加し、生産段階で問題が発見されなかった。^{[ 70 ]} TPPアプローチで大きな問題に直面した注目すべきプログラムには、ジェネラル・ダイナミクスF-111、ロッキードC-5ギャラクシー、ボーイングAGM-69 SRAM、ロッキードAH-56シャイアン、MBT-70主力戦車、タラワ級強襲揚陸艦、スプルーアンス級駆逐艦などがあり、すべてのプログラムの総コスト超過額は最低でも100億ドルに達した。^{[ 71 ] [ 72 ]} TPPは失敗と判断され、1970年に放棄された。^{[ 73 ]}

マクナマラのスタッフは、兵器開発やその他の多くの予算問題に関する意思決定の補助としてシステム分析を重視した。国防長官は、米国は国家安全保障に必要な金額をいくらでも支出できると信じていたが、「この能力があるからといって、国防費の支出方法に有効性と効率性の厳格な基準を適用する義務を免れるわけではない。…どれだけあれば十分かを判断しなければならない」と述べた。^{[ 74 ]}これらの原則に基づいて、マクナマラは広く報道されたコスト削減プログラムを実施し、1961年から始まる5年間で140億ドルを節約したと報告した。影響を受ける選挙区の上院議員や下院議員からの激しい批判に耐えなければならなかったが、国家安全保障に不要と判断した多くの軍事基地や施設を閉鎖した。^{[ 1 ]}

マクナマラのコスト抑制策には、欺瞞も含まれていた。就任から1か月後、リンドン・ジョンソンは1964会計年度の国防費が4億ドル超過すると報告しなければならないのではないかと心配していた。マクナマラは、国防費の支出額を意図的に過小評価し、後に支出が国防省の予測を上回った際に驚いたふりをすることを申し出た。^{[ 75 ]}

1965年5月14日、空軍は防空軍団（ADC）向けにロッキードF-12Bマッハ3+迎撃機93機の生産を発注した。しかし、マクナマラはベトナム戦争の費用のため、3年連続で予算を承認しなかった。任期最後の月である1968年2月5日、マクナマラはロッキードに対し、A-12、YF-12、SR-71の製造設備を廃棄するよう命じた。^{[ 76 ]}

核軍拡競争、ベトナム戦争の軍備増強、その他のプロジェクトにより、マクナマラ政権時代に総義務的権限（TOA）は大幅に増加した。会計年度のTOAは、1962年の484億ドル（ 2024年の3830億ドルに相当）から、1965年（ベトナム戦争による大幅な増加前）の495億ドル（3750億ドル）を経て、マクナマラの最後の任期となった1968年（2月に退任）には749億ドル（ 5140億ドル）に増加した。 ^{[ 77 ]}国防総省の総義務的権限が実質ドルで1968会計年度を上回ったのは、1984会計年度になってからだった。 

マクナマラが就任する前、海軍は通常型と原子力の両方の攻撃型潜水艦105隻の必要性を認識しており、退役する通常型潜水艦を原子力潜水艦に置き換える予定だった。マクナマラは原子力攻撃型潜水艦計画が国防総省予算の大きな負担になると考え、65隻での生産を何度も中止しようとした。彼は2つの海軍造船所での原子力潜水艦の建造を中止するよう命じ、退任するまでに民間造船所で建造する潜水艦の数は5つから2つに減った。^{[ q ]}彼のシステムアナリストは、海軍が想定する必要数の見積もりを繰り返し過小評価し、第二次世界大戦で海軍がウォーゲーミングで成功を収めたにもかかわらず、その見積もりを裏付ける手段としてウォーゲーミングを拒否した。1966年、マクナマラは予算の圧力に対応し、海軍が望んでいた原子力潜水艦による代替なしに、ほとんどの通常型潜水艦を退役させた。^{[ r ]}彼はまた、何度も繰り返される紙ベースの調査を命じることで、スタージョン級潜水艦 の後継となる新しいクラスの開発を遅らせようとした。議会は、産業基盤が危機に瀕する恐れがあるとして、核攻撃潜水艦の生産を中止しようとする彼の試み​​に抵抗した。^{[ 78 ]}

ハイマン・リッコーバー提督は1964年に原子力潜水艦のコスト削減と静音性の向上を任された。このため、彼はターボ電気推進潜水艦、すなわちTEDSを提案した。これは、ギア付きタービンではなく直流電気推進を採用したスタージョン級潜水艦の派生型である。ギアノイズがなく、安全性も向上するはずだった。マクナマラは、この実験的ではあるものの運用可能な潜水艦の建造に反対したが、1967年にリッコーバーの勧告により議会で覆された。TEDSはマクナマラの退任後にグレナード・P・リップスコムとして建造されたが、技術的な問題や低速に悩まされることになった。TEDSをめぐる議会との争いにより、マクナマラは自身の影響力が衰えていることを悟り、スタージョン級の後継艦であるロサンゼルス級の建造を進めることを許可した。^{[ 79 ]}

マクナマラはほとんどの先進爆撃機の提案に懐疑的であり、彼の在任期間中に精査を通過できたものはごくわずかだった。

マクナマラの要請を受け、ケネディ大統領は1961年3月26日に航空機原子力推進計画を中止した。ルメイ将軍はこの計画によって原子力推進戦略爆撃機を開発する予定だった。

マクナマラの勧告（そしてルメイ将軍の反対）により、ケネディ大統領は1961年3月28日、ソ連が効果的な高高度対空ミサイルを実証したことを受け、ノースアメリカンB-70ヴァルキリー超音速爆撃機計画を実験段階に縮小した。マクナマラは議会公聴会でこの決定を全面的に支持し、この爆撃機は正当化できないと述べた。^{[ 80 ]}

1963年、海軍は航空母艦の戦略爆撃任務を終了し、超音速のノースアメリカンA-5ビジランテは戦略偵察任務に転用されることになった。^{[ 81 ]}

空軍は1961年に低空侵攻爆撃機の研究を開始し、それがB-1となったが、マクナマラは1964年にこのAMSAプログラムを研究と部品開発に限定した。^{[ 82 ]}

1955年、米国政府はプルート計画の下、核ラムジェット推進の超音速低高度巡航ミサイル（SLAM）の開発を開始したが、これは通常爆撃機のように核爆弾を投下するものであった。^{[ 83 ]}メルビン・プライス下院議員を含む数名の議員は、一貫した防衛技術開発政策を発表することを拒むマクナマラ国防長官の姿勢を覆すため、1964年初頭にこの計画を存続させようと試みた。^{[ 84 ]}マクナマラは1964年7月1日にこの計画を中止した。^{[ 83 ]}

マクナマラは、空軍初の超音速爆撃機であるコンベア B-58 ハスラーに当初反対していた。運用コストはボーイング B-52 ストラトフォートレスより 3 分の 1 高く、航続距離が限られているため、追加の空中給油機を投入しなければ克服できないことから、実用的な兵器システムとは考えていなかった。^{[ 85 ] [ 86 ]}この見解はルメイ将軍も共有していたが、彼は計画中の後継機 B-70 ヴァルキリーの乗員を訓練するための暫定機として B-58 を受け入れていた。^{[ 87 ]}運用開始から 5 年後の 1965 年後半、マクナマラは 1970 年までに B-58 を退役させるよう命じた。この指令の主な理由は、機体の維持費が高いことと、後継機FB-111Aの導入が計画されていたことであった。^{[ 88 ]}

1966年9月22日、マクナマラは、残っているB-52搭載のハウンドドッグ空対地巡航ミサイル（ALCM）を数年以内にすべて退役させることを勧告した。マクナマラの勧告は実行されなかった。代替品がまだ入手できなかったため、ハウンドドッグは運用され続けた。^{[ 89 ]}彼は以前、ハウンドドッグの後継機であるAGM-48スカイボルトを中止していた。

マクナマラのコスト削減策の大きな特徴の一つは、異なる軍種にまたがるプログラムの統合であり、特に小火器と航空機の調達において顕著であった。彼は、重複が無駄と不必要な支出を生み出していると考えていた。

マクナマラが未検証のM16ライフルを時期尚早に全面的に採用するよう命じたことは、戦闘で武器が故障し始めたときに壊滅的な結果を招いたが、後の議会調査では、これらの故障の原因は陸軍兵器部隊の将校による過失とほぼ破壊行為であったことが明らかになった。^{[ 90 ]}

マクナマラは空軍に対し、海軍のマクドネルF-4ファントムII多用途戦闘機とLTV A-7コルセアII攻撃戦闘機を採用するよう指示した。この統合は非常に成功し、その成功は双方向的であった。海軍は後に空軍が最初に行った改良を採用した。^{[ 91 ]}

• ファントムIIの米空軍への採用は、マクナマラ国防長官が1961年11月にリパブリックF-105サンダーチーフ戦闘爆撃機とコンベアF-106デルタダート迎撃機の生産を終了すると決定したことの一環であった。^{[ s ] [ 92 ]}
• 空軍は依然としてA-7コルセアの改良が必要だと考えていたため、1966年9月8日、アメリカ空軍参謀総長のジョン・P・マコーネル将軍は、特殊な近接航空支援機を設計、開発、調達するよう命じた。これがAXプログラムとなり、マクナマラが退任した後、A-7コルセア、ノースロップA-9、フェアチャイルド・リパブリックA-10サンダーボルトIIの間で飛行試験が行われた。^{[ 93 ]}

1961年2月14日、マクナマラは2つの開発プログラムを統合し、後にF-111として知られるTFXプログラムという軍民両用プロジェクトとした。海軍の艦隊防空（FAD）機の要求（当初の提案であるダグラスF6Dミサイラーは1961年12月に中止された^{[ 94 ]）}と空軍の低空爆撃機の要求を統合した。企業での経験から、異なる任務やサービスに単一の機種を採用すれば費用を節約できると考えた。共通性の利点が大きいことから、国防総省がボーイングの低価格のモデル818を優先していたにもかかわらず、ジェネラル・ダイナミクスのモデル12を主張した^{[ 95 ]}。あらゆる任務（高速超音速飛行、低速空母および短距離飛行場への着陸、戦術攻撃、近接航空支援など）をこなせる戦闘機として宣伝されたが、最終的には妥協点が多すぎて、すべてを完全に達成することはできなかった。海軍のFADバージョン（F-111B）は重量が著しく重く、空母への着艦が困難であったため、新しいエネルギー機動性（EM）理論によって、現行および新たに公開されたソ連の航空機の能力に匹敵できないことが判明し、最終的に開発中止となった。^{[ t ] [ 97 ] [ u ]}この航空機は最終的に、空軍において戦術阻止爆撃機（F-111A）、軽戦略爆撃機（FB-111A）、電子戦機（EF-111A）としてニッチな用途を見出した。 ^{[ v ]}

1965年4月、国防研究開発局長のハロルド・ブラウンは、空軍向けの新型FX戦闘機の研究を開始した。1967年初頭、海軍はF-111が要求を満たさないと判断し、新型専用戦闘機設計であるVFAXプログラムの開発を開始した。マクナマラは再び各軍に設計を検討し、VFAXが空軍のFXニーズを満たすかどうかを調べるよう求めた。その結果、18か月かけて行われた研究で、求められる機能があまりにも異なっているという結論に至った。海軍は滞空時間と任務の柔軟性を重視していたのに対し、空軍はベトナム戦争の経験から、主に機動性を求めていた。VFAXはグラマンF-14トムキャットとなり、FXはマクドネル・ダグラスF-15イーグルとなった。^{[ 100 ]}

1961年7月、マクナマラは英国国防大臣ピーター・ソーニークロフトから、世界中の英国軍を維持しようとする財政的負担が大きすぎること、そして英国首相ハロルド・マクミランがアジアにおける英国軍の駐留を終わらせるために「スエズ以東」のすべての英国軍を撤退させることを検討していることを知らされた。^{[ 101 ]}マクナマラはこれに反対し、米国海軍は英国がインド洋に米海軍基地を設置することを許可するよう働きかけ始めた。これは1962年1月の統合参謀本部覚書で支持され、英国植民地における民族主義運動の高まりが米軍の撤退を求める可能性があることへの懸念が表明された。^{[ 102 ]}

1962年9月、ソーニークロフトはマクナマラと会談し、インド洋のどのイギリス領の島にアメリカ軍基地を設置するかについての協議を開始するためにワシントンを訪れた。^{[ 101 ]} 1963年までに、アメリカはイギリス領モーリシャスの植民地の一部であったチャゴス諸島のディエゴガルシア島を空軍基地と海軍基地の理想的な場所として選定した。^{[ 103 ]}マクナマラは、ディエゴガルシア島の基地の賃料として、アメリカがイギリス政府に年間1500万米ドルを支払うことを提案し、この金額はロンドンにとって同意できるものであった。^{[ 104 ]} 1965年、チャゴス諸島はモーリシャス植民地（ 1968年3月に独立し、2020年代までチャゴス諸島を自国の領土として主張することになる）から分離され、計画されていたアメリカ軍基地の前段階としてイギリス領インド洋地域となった。 ^{[ 105 ]}

1966年、マクナマラは国防大臣デニス・ヒーリーとの会談で、イギリス軍がアジアに留まるよう強く求め、シンガポールに基地を維持してほしいと述べた。^{[ 106 ]}ヒーリーは、政府はシンガポール基地を維持したいが、その財政的コストがイギリスの財政を圧迫していると主張し、曖昧な回答をした。^{[ 107 ]} 1966年7月、マクナマラはジョンソンに対し、イギリス軍が「スエズ以東」に留まることは「絶対に不可欠」であり、軍事的理由ではなく政治的理由、すなわち、それがこの地域の重要性を示し、それによってアメリカのベトナムへの関与を正当化する、と述べた。^{[ 108 ]}アメリカをなだめるため、イギリスはディエゴガルシア島をアメリカに有利なほぼあらゆる条件で租借することを申し出た。^{[ 109 ]}アメリカはイギリスに対し、チャゴス諸島の先住民全員を島から追放してほしいと伝え、イギリスはこの要求に同意した。^{[ 110 ]} 1968年1月、ウィルソンは香港を除き、経費削減のため「スエズ以東」からすべてのイギリス軍を撤退させると発表した。^{[ 111 ]} 1968年からイギリス当局はディエゴガルシア島からチャゴス諸島民の追放を開始し、その過程は1973年までに完了した。

トルーマン政権とアイゼンハワー政権は、ベトナム北部の共産主義者による統一の試みに抵抗するベトナムのフランス軍と現地の反共産主義勢力を米国が支援することを約束した。当初の援助は財政支援、軍事助言、秘密情報収集に限られていたが、1954年にフランス軍が撤退した後、拡大した。米国軍事援助諮問グループ（MAAG）ベトナムは1955年11月1日に設立された。^{[ 122 ]} CIA顧問のルーファス・フィリップスは後に、1956年までに市民活動プログラムによって南ベトナムのベトミンはほぼ敗北したが、米国の官僚機構が不適切な政策と助言によってその勝利を無駄にしたと主張した。^{[ z ] [ aa ]} 1956年12月、北ベトナム政府は南ベトナムのベトコン部隊に低レベルの反乱を開始することを許可した。^{[ 124 ]}ペンタゴン・ペーパーズは後に次のように述べている。「すべての証拠は、1959年秋がベトコンが秘密の政治運動からより公然とした軍事作戦へと移行した時期であることを示している…しかし、1959年秋までに、ベトコンは正規軍部隊に対して大隊規模の部隊を投入できる立場にあった。」^{[ 125 ]}

ジョン・F・ケネディ大統領の任期中、1961年から1963年にかけて、南ベトナムの米軍は900人から16,000人の顧問に増加した。^{[ 126 ]}ケネディは1962年2月8日にベトナム軍事援助司令部（MACV）を設立し、ベトナム共和国軍（ARVN）の訓練のためにアメリカ人を派遣した。^{[ 127 ] [ 128 ]}マクナマラは国務長官のディーン・ラスクと緊密に連携しており、両者とも南ベトナムへのアメリカの支援拡大を支持していた。^{[ 129 ]}

1964年8月のトンキン湾事件は、北ベトナム海軍艦艇による米海軍駆逐艦への2度の攻撃とされる事件であり、ベトナムにおける米国の関与の拡大につながった。^{[ 130 ]}

当初、ケネディ新政権の主な関心事は南ベトナムではなくラオスだった。1961年2月、マクナマラはラオスへの介入を支持し、CIAが所有する6機のAT-6機に200ポンド爆弾を搭載してプーミ・ノサヴァン将軍の部隊を支援できると述べた。ラスクはこの提案を却下し、ビルマでの第二次世界大戦の経験から、ジャングルでの爆撃は効果がなく、6機では不十分だと学んだと述べた。^{[ 131 ]} 1961年春、ケネディは、北ベトナムの支援を受けた共産主義パテト・ラオが内戦で優勢だったラオスへの介入を真剣に検討した。ある時点では、統合参謀本部が6万人の米軍をラオスに派遣することを勧告した。しかし、ラオスは未開発の内陸国で、近代的な道路はほとんどなく、近代的な飛行場は2つしかなく、どちらも西側の基準からすると小さく、兵站上の問題を引き起こすと考えられた。^{[ 132 ]}さらに、朝鮮戦争の記憶はまだ生々しく、米国がラオスに軍隊を派遣すれば、中国の介入を招き、同国との新たな対立につながることはほぼ確実であると一般的に考えられていた。東南アジア条約機構（SEATO）は、フランスや英国などの欧州加盟国が介入に反対し、タイやフィリピンなどのアジア加盟国が賛成する形で分裂した。 ^{[ 133 ]}マクナマラはケネディに対し、ラオスの2つの飛行場が共産主義勢力に占領され、ラオスの米軍が孤立し、介入が失敗に終わる可能性は十分にあると指摘した。1961年4月29日の会合で、ロバート・F・ケネディ司法長官から質問を受けたマクナマラは、「我々はタイと南ベトナムで立場を表明すべきだ」と述べ、東南アジア諸国の中で戦争のリスクを冒す対象国からラオスを意図的に除外した。^{[ 134 ]}

マクナマラはすぐにラオスに関する考えを変えた。1961年5月1日、彼はケネディにラオスへの地上部隊派遣を助言し、「我々は勝利する準備をしなければならない」と述べ、中国が介入する場合には核兵器の使用を勧めた。5月2日、マクナマラはさらに強い言葉で、たとえそれが中国の介入につながると確信していたとしても、米国は必ずラオスに介入すべきだとケネディに伝え、「いずれは、我々の軍の敗北を防ぐために核兵器の使用を開始しなければならないかもしれない」と結論付けた。ピッグス湾侵攻の失敗後、統合参謀本部が与えたタカ派的な助言を信用していなかったケネディは、代わりに1961年から62年にかけてジュネーブで開催された平和会議でラオス危機の外交的解決を模索することに決め、最終的にラオスを冷戦における公式な中立国とする合意に至った。^{[ 135 ]}中国との戦争の可能性によって生じる問題と、ラオスで大規模な部隊を支援する兵站上の問題から、マクナマラは最終的に、少数の米陸軍特殊部隊をラオスに駐留させ、モン族などの米国の同盟国と協力するという代替戦略を支持するに至った。^{[ 136 ]} 1961年9月29日、統合参謀本部はマクナマラに対し、中国軍がラオスに侵攻した場合、SEATO軍はそれを阻止するために少なくとも15個師団、約27万8000人の兵力が必要になると推定した。^{[ 137 ]}同時に、統合参謀本部は、ラオスの2つの飛行場はそれぞれ1日に約1000人の兵士を着陸させる能力があり、中国に有利になるとも推定した。^{[ 131 ]}このような悲観的な評価から、ケネディはマクナマラと統合参謀本部の意見を無視し、ラオス危機の外交的解決を支持するに至った。^{[ 137 ]}

マクナマラは1961年にはラオスへの介入計画を支持していたが、1962年には考えを変えた。統合参謀本部議長のライマン・レムニッツァー将軍との会談で、マクナマラは、アメリカがラオスに介入した場合、北ベトナムが介入してきたらアメリカはどうするのかと尋ねたが、誰も答えられなかった。北ベトナムがラオスからカンボジア、そして最終的には南ベトナムへとメコン川流域を下って大規模な攻勢をかけてきた場合、アメリカはどうすべきかというマクナマラの質問に統合参謀本部が答えられなかったことで、マクナマラは統合参謀本部が問題の本質を理解しておらず、弱腰に見られないようにラオスへの介入を主張しているだけだと確信した。^{[ 138 ] [ ab ]}

バレルロール作戦は、1964年3月5日から1973年3月29日にかけてアメリカ空軍とアメリカ海軍がラオスで実施した秘密の阻止および近接航空支援作戦である。1964年6月6日（ハワイ時間6月5日）、海軍偵察パイロットのチャールズ・クルスマン中尉がラオスのジャール平原上空で撃墜された。^{[ ac ]}マクナマラは救出作戦を行わないよう命じた。ハリー・D・フェルト提督はホノルルからマクナマラに電話をかけ、そのような命令を出す権限は自分にはなく、最高司令官のみが出す権限があると伝え、ワシントン時間午前1時でマクナマラがためらっているにもかかわらず、繰り返しリンドン・ジョンソンに電話を繋ぐよう「頼んだ」。ジョンソンはすぐに電話に出てマクナマラの命令を取り消したが、遅れた結果クルスマンは捕らえられた。クルスマンは拷問と飢餓にもかかわらず3か月後に脱出し救出され、ラオスで捕らえられパテト・ラオに拘束されていたアメリカ人のうち、帰還したわずか2人のうちの1人となった。^{[ 140 ] [ ad ]}

空軍准将エドワード・ランスデールは、 1950年から1954年にかけてのフィリピンのフクバラハップ反乱鎮圧と、1954年から1956年にかけての南ベトナムにおけるベトミン鎮圧の立役者であり、いずれの場合も、低レベルの軍事的治安維持活動と並行して市民活動プログラムを採用した。1961年初頭、彼は国防長官特別作戦担当補佐官に就任し、マクナマラにベトナム戦争の性質についてブリーフィングを行った。^{[ 141 ]}彼はマクナマラにベトコンの原始的な自家製武器の例を示し、この戦争は軍事戦争というより政治的戦争であると説明した。彼は「勝つには武器や制服や大量の食料は必要ない。必要なのは思想と理想だ」と述べた。10分後、マクナマラは「それだけか？」という言葉でブリーフィングを突然終了した。^{[ 142 ] [ ae ]}

1961年10月、マックスウェル・テイラー将軍と国務省顧問ウォルト・ホイットマン・ロストウが8,000人のアメリカ軍戦闘部隊を南ベトナムに派遣するよう勧告した際、マクナマラは8,000人の部隊では「おそらく決定的な転換点にはならないだろう」としてその勧告を却下し、代わりにケネディに6個師団を南ベトナムに派遣するよう勧告した。ケネディはその勧告を却下した。^{[ 143 ]}

1962年4月、陸軍参謀総長のジョージ・デッカー将軍はマクナマラに対し「東南アジアで通常戦争に勝つことはできない」と助言した。このためデッカーは4年の任期の途中で1962年9月30日に退役を余儀なくされた。後任にはアール・ウィーラーが就任したが、彼はウェストポイントの元数学教授であり、解析に関するマクナマラの見解の多くを共有していた。^{[ 144 ]}

1962年5月、マクナマラは初めて南ベトナムを訪問し、報道陣に対し「あらゆる定量的測定結果は、我々が戦争に勝利していることを示している」と述べた。^{[ 145 ]}ポール・D・ハーキンス将軍率いるMACVの将校たちは、南ベトナムの大部分がベトコンの支配下にあることを示す地図を改変し、ベトコンが実際よりも弱く見えるように統計を操作した。^{[ 146 ]}ベトナムの動向に関するコンピューターによる膨大な数値計算に基づくマクナマラの「定量的」な手法は、人間的な側面を見落としていた。南ベトナムの人々の見解や態度、そして権力維持のために複数の政府機関を互いに競わせるという南ベトナム大統領ゴ・ディン・ディエムの「分割統治」戦略といった戦争の側面は、コンピューターでは計算できないため、マクナマラの「定量的」なアプローチでは見落とされていた。^{[ 145 ]}

MAAG司令官ライオネル・C・マクガー中将は1962年7月に米国に帰国した。マクナマラはベトナムでの経験について彼と協議することを拒否した。^{[ 147 ]}この頃にはマクガーは米国の武力拡大に反対していた。MAAGは1964年5月にMACVに統合されることになる。

1962年後半、マクナマラは計画担当者に対し、1964年に南ベトナムからアメリカ人顧問が撤退することを想定するよう命じた。ペンタゴンの計算によれば、その頃には戦争は勝利しているはずだったからである。当時、マクナマラはケネディに「勝利が可能だという新たな自信が芽生えている」と語った。^{[ 148 ]}

1963年1月2日、マクナマラがコンピューターから得たベトナムに関する楽観的な予測と想定は、アプバックの戦いで打ち砕かれた。アプバック村でベトコン3個中隊が南ベトナム軍第7師団に包囲されたのである。 ^{[ 149 ]} 10対1の兵力差と圧倒的な火力差にもかかわらず、ベトコンは続く戦闘で第7師団を破り、ジャングルに逃げ込み、その過程で米軍機5機を撃墜した。^{[ 150 ]}第7師団に配属されていたアメリカ人顧問のジョン・ポール・ヴァン大佐は、いつもの率直な言葉でこの戦いを報告書にまとめ、「いつものように、惨めなクソみたいなパフォーマンスだった」と述べている。^{[ 150 ]}ヴァンは、戦争の進め方に対する率直で遠慮のない批判でメディアのお気に入りとなった個性的な人物だったが、マクナマラは戦争に勝利していると主張し続けたため、ヴァンの批判を快く思わなかった。^{[ 151 ]}

ヴァンがディエム政権を腐敗していて無能だと批判した報告書は、マクナマラにとって非常に不都合なもので、マクナマラはヴァンが提唱する改革は不要だと主張した。^{[ 152 ]} 1963年3月、ヴァンは陸軍を辞任した。

アプバックの戦いの後、ケネディ内閣ではディエム政権の存続可能性についての議論が始まった。これは、南ベトナム政府による一連の弾圧行為を受けて1963年5月に始まった市民抵抗運動である仏教徒危機によってさらに強まった。 ^{[ 153 ]} 1963年8月の国家安全保障会議でケネディがディエムに対するクーデター支援について初めて言及したとき、マクナマラはディエム政権の維持を支持した。^{[ 154 ]} 1963年8月31日、サイゴンから帰国したばかりの外交官ポール・カッテンバーグは、ラスク、マクナマラ、ジョンソン副大統領が出席した会議で、米国はディエムへの支援を終了し、南ベトナムをその運命に任せるべきだと提案した。マクナマラはカッテンバーグの提案に強く反対し、「我々は戦争に勝ってきた」と述べた。^{[ 155 ]}

ケネディ政権は、どうすべきかについて合意を得ることができなかった。1963年9月初旬、マクナマラは海兵隊少将ビクター・クルラックを4日間の事実調査任務に派遣することを勧告し、国務省高官ジョセフ・メンデンホールも同行した。クルラックは戦争に勝利しつつあると述べ、メンデンホールは強く反対したが、二人の報告書は食い違っていたため、ケネディ大統領は「君たち二人は同じ国を訪れたんだね？」と尋ねた^{[ 156 ]}。USAID職員ルーファス・フィリップスは、この会議とその後の会議で、ベトナムについて学ぶことに興味を示したのはケネディ大統領だけで、マクナマラを含む他の主要人物は皆、プライドと官僚的な忠誠心だけで動いていたと考えた。マクナマラはフィリップスの「60の戦略村が制圧された」という報告を「60%」に変更し、それが事実ではないと主張した^{[ 157 ] 。}

2週間後、ケネディはマクナマラとテイラー将軍を南ベトナムへの10日間の事実調査任務に派遣した。^{[ 155 ]}ジアロン宮殿での会談で、ディエム大統領はマクナマラに、戦争に勝利しつつある証拠とされる様々なグラフや図表を見せた。このパフォーマンスにより、マクナマラは戦争はほぼ勝利したと確信した。^{[ 158 ]}ケネディはクーデターを支持する正当化のためにディエムに対する否定的な評価を求めていたが、マクナマラとテイラーは代わりにディエムが達成した「大きな進歩」について書き、1965年にはベトコンの反乱が鎮圧されると予測し、アメリカ人顧問の「大部分」は1965年に去ると自信を持って予測した。^{[ 159 ]}マクナマラは、ディエムが政策を継続すれば、1965年までに反乱は「組織的な盗賊行為に過ぎなくなる」と予測した。^{[ 160 ]}

ランスデール少将は、ディエムの最初のアメリカ人指導者だった。ダニエル・エルズバーグによれば、彼は1963年9月下旬か10月上旬にマクナマラの事務所に派遣された。二人はマクナマラのリムジンに乗り、ホワイトハウスへ向かい、ケネディ大統領と面会した。ケネディは、ランスデールがディエムを説得できる能力を持っていることから、彼をベトナムに派遣したいと考えていたが、必要になった場合にディエムを解任することに賛成するかどうかを尋ねた。ランスデールは、ディエムは友人であるとして反対した（ランスデールは、ディエムを交代させることは大惨事につながるとも考えていた）。ケネディは理解したようで、落胆した様子は見せなかったが、リムジンの中でマクナマラは激怒した。「アメリカ合衆国大統領にそんな口の利き方をするな。大統領が何かを頼んだら、やらないなどと言うな。」^{[ af ] [ 162 ]}ランスデールは10月末までに空軍を退役するよう命じられた。^{[ 163 ]}ランスデールの退役祝賀会の間、マクナマラは部屋を通り過ぎたが、ランスデールには目もくれなかった。^{[ 164 ]}

CIAとヘンリー・カボット・ロッジ・ジュニア大使がクーデターへの支持を促し、国防総省が反対する中、ケネディは迷ったものの、最終的にロッジに決定権を与えた。^{[ 165 ]}ディエムを嫌っていたロッジは、彼に反逆する将軍たちを承認した。^{[ 166 ]}マクナマラはクーデターに反対し続け、10月25日のケネディとの会談でも、ロッジがルシアン・コネインを南ベトナム軍将軍との連絡役に起用したことに反対した。コネインはベトナムでの豊富な経験を持つフランス系アメリカ人の軍人兼CIA職員だったが、マクナマラは「我々は報道に熱心な大使と不安定なフランス人（5回離婚している）を通して交渉している…これを阻止しなければならない」と彼らを退けた。^{[ ag ] [ 167 ]}

1963年11月1日、クーデターが始まった。^{[ 168 ]}戦闘で大統領官邸が制圧された 後、ディエムはサイゴンから逃亡しようとして捕らえられ、1963年11月2日に処刑された。 ^{[ 169 ]}サイゴンの新政府はズオン・ヴァン・ミン将軍が率いていた。1963年11月22日、ケネディが暗殺され、リンドン・ジョンソンが後任となった。ジョンソンは極めて不安な性格で、マクナマラの忠誠心と自信に大きく依存していた。^{[ 170 ]}

1963年12月、ジョンソンはミン将軍の業績を評価するため、マクナマラを南ベトナムへの別の「事実調査任務」に派遣した。1963年12月19日、マクナマラは状況が「非常に憂慮すべき」ものであり、「現在の傾向は、今後2、3か月で覆されない限り、せいぜい中立化、あるいは共産主義支配下の国家につながるだろう」と報告した。彼はまた、自身が非常に重要視していたコンピューターモデルと統計が「著しく誤っていた」こと、そして7月以降、農村地域の政府支配が「実際には我々が認識していたよりもはるかに悪化していた」ことを認めた。^{[ 171 ]}翌日、マクナマラはミン将軍、チャン・ヴァン・ドン将軍、レ・ヴァン・キム将軍と会談し、傲慢に尋問した。1954年から1956年の市民活動キャンペーンの成功のベテランであるキムは、後に「怒りで舌を噛んだ」と語った。^{[ 172 ]}ミン政権に関して、マクナマラは現時点で「南ベトナムには組織化された政府は存在しない」と記した。マクナマラは新政権が「優柔不断で漂流している」と認めつつも、ジョンソンに対し「状況が早期に改善の兆しを見せない場合は、より強硬な措置を取るべきだ」と助言した。^{[ 171 ]}

1964年1月30日、ミンはグエン・カイン将軍によるクーデターで打倒された^{[ 173 ]}が、指導者の交代は戦争に影響を与えなかった。CIAのライマン・カークパトリックは1964年2月にサイゴンを訪問した後、「我々の国民と軍人、常に我々が勝利していると言っている者でさえ、戦況が我々に不利になっていると感じている人数に衝撃を受けた」と報告した。同じ月にARVNの問題点を浮き彫りにした戦闘では、メコンデルタのベトコン大隊が、訓練したアメリカ人顧問によってARVNの中でも最高レベルの部隊と評価されていた南ベトナム軍の大部隊から脱出した^{[ 174 ] 。}

1964年3月8日、マクナマラは南ベトナムを訪問し、ジョンソン大統領にカインの新政権が戦争をいかにうまく処理しているかを報告した。サイゴンに到着すると、マクナマラは報道陣に対し、「我々は共産主義反乱軍との戦いに勝利するまで滞在する」と述べた。訪問中、マクナマラはベトナム語が声調言語であることを何度も忘れ、暗記したフレーズをたどたどしいベトナム語で演説し、カインを南ベトナムの「最良の指導者」と称賛した。^{[ 175 ]}マクナマラはいつも演説の最後に「自由なベトナム万歳！」という意味だと思ったフレーズを叫んだが、声調が間違っていたため、「ベトナムよ、眠れ！」と言ってしまった。^{[ 176 ]}マクナマラはカインに対し、健康な若者全員を徴兵して南ベトナムを戦争体制に置くよう強く求め、カインはそうすると約束した。^{[ 177 ]}しかし、裕福な南ベトナム人や中流階級の南ベトナム人家庭が息子たちの徴兵に反対したため、カーンは約束を守らなかった。その結果、徴兵の負担は貧しい家庭の息子たちにのしかかり、大きな憤りを引き起こした。^{[ 177 ]}ジョンソンの強い要望により、マクナマラはボクサーのようにカーンの腕を持ち上げて写真に撮られたが、この写真はあらゆる政治的背景を持つベトナム人の間で、カーンがアメリカの傀儡であることを証明するものとして広く受け止められた。^{[ 178 ]}

3月13日にワシントンに戻ったマクナマラはジョンソンに、1963年12月の前回の訪問以来、状況は「間違いなく悪化している」と報告した。農村部の40%が「ベトコンの支配下または支配的な影響下」にあり、南ベトナム国民のほとんどが「無関心と無気力」を示し、南ベトナム軍の脱走率は「高く、増加傾向にある」一方、ベトコンは「精力的に兵士を募集している」という。マクナマラによれば、「最大の弱点」は、派閥争いが蔓延する南ベトナム軍において、カイン政権が「存続の不確実性」であり、いつでも転覆される可能性があった。^{[ 179 ]}

南ベトナムを救うため、マクナマラは米国がカインを徹底的に支援する意思を「明確に」示すべきだと勧告した。国家安全保障会議の「行動覚書」で受け入れられた他の勧告では、米国が南ベトナム軍の増員費用を負担し、ベトナム共和国空軍に航空機とヘリコプターを増便し、南ベトナムの農村部を統治する公務員の増員費用を負担するよう求められた。さらに重要なことに、「行動覚書」はベトナム戦争をアジアだけでなく全世界にとって重要なものと再定義し、南ベトナム政府が打倒されれば米国の同盟国が米国の約束を信用しなくなるため、米国の世界的な信頼性が危機に瀕していると主張した。「行動覚書」は、南ベトナムを「失う」ことは米国の世界的なリーダーシップを致命的に弱体化させ、この戦争を米国が世界的な大国として存続する意思の「試金石」にすると主張した。^{[ 179 ]}

マクナマラは1964年春に「段階的圧力」戦略を提唱し始めており、リンドン・ジョンソンは好戦的と見なされることを避けたいという思いからこのアプローチに魅力を感じていた。 ^{[ 180 ]}マクナマラは統合参謀本部がベトナムに関して自分の意見と矛盾する勧告をすることを望まなかったため、軍種間の対立を利用して合意形成を阻止した。1964年3月、彼は「この状況では分割統治がかなり有効なルールだ。率直に言って、ここ数週間それを試みてきたが、かなりうまくいっている…」と述べた。^{[ 181 ]}彼はまた、統合参謀本部議長のマックスウェル・テイラー将軍と協力して、彼らの意見が大統領に届かないようにした。HRマクマスターは次のように書いている。

参謀長たちは、自分たちをまとめるリーダーを必死に必要としていた。議長だけが、彼らの軍の利益に対する根深い執着を克服できた。しかし、テイラーは、大統領からの相反する助言を封じ込めようと、参謀長たちの分裂を利用して、政策決定の主導権をマクナマラと自分自身に握らせようと決意した。建設的な協力関係を築くことができず、国防長官と議長によって助言を封じられた参謀長たちは、ベトナムにおけるアメリカの軍事介入に関するマクナマラの戦略構想に異議を唱えることはなかった。もし参謀長たちが、アメリカは北ベトナムを打ち負かすために強力な行動を取る必要があるという立場を大統領に強く主張できていれば、全面戦争か南ベトナムからの撤退かという難しい選択を迫ることができたかもしれない。参謀長たちは、自分たちの（狭量な）行動とテイラーとマクナマラの策略によって、ベトナムの戦略構想の策定に影響を与える機会を逃し、その後は常に、大統領が既に承認した政策に疑問を呈するという困難な立場に置かれることになった。ベトナムにおけるアメリカの関与を深めるための知的基盤は、統合参謀本部の関与なしに築かれていた。大統領の政策の根底にあった前提（主にマクナマラによって作られたもの）は、法律と伝統によってアメリカ合衆国大統領に戦略と戦争について助言する唯一の正式な機関によって異議を唱えられることなく受け入れられた。^{[ 182 ]}

1964年4月6日から9日にかけて、 SIGMA I-64と呼ばれる戦争ゲームが実施された。彼らは、爆撃作戦は停止せず、北ベトナム軍の南ベトナムへの浸透を加速させる可能性が高いと結論付けた。マクナマラはこの結論が十分に定量化されていないという理由で却下した。^{[ 183 ]}​​ 1964年9月8日から17日に行われた2回目のゲーム、SIGMA II-64も同じ結論に達したが、これも無視された。^{[ 184 ] [ 185 ]}

チーフスは、マクナマラがめったに会わない会合や、問題が話し合われない会合を、彼が自分たちと会っていないという批判を避けるための「見せかけ」だと考えるようになった。^{[ 186 ]}

1964年5月初旬、ロッジ大使は軍事行動の拡大を強く主張し始めた。ジョンソン大統領は1964年の選挙と「偉大な社会」法案の成立前にそのような拡大を避けたいと考え、マクナマラをサイゴンに送り返して、そのような勧告を阻止しようとした。マクナマラはMACVの将校たちに、要求は定量的なデータに基づいて行うように指示し、そうすれば適切に検討できるとした。^{[ 187 ]}

MACV司令官のポール・D・ハーキンス将軍は1964年6月20日に米国に帰国した。マクナマラはベトナムでの経験について彼と相談することを拒否した。^{[ 147 ]}後任には副司令官のウィリアム・ウェストモーランド将軍が就任した。

1964年までに南ベトナムはアメリカから1日あたり200万ドルもの経済・軍事援助を受けていたにもかかわらず、南ベトナム国家は崩壊寸前だった。汚職は深刻化し、南ベトナムの公務員や兵士のほとんどが給料を受け取れず、アメリカが資金を提供していた「農村平定」プロジェクトも、資金が横領されたために頓挫していた。マクナマラ国防長官をはじめとするアメリカ当局者が、汚職を取り締まり、政府をより効率的にするための改革を行うよう南ベトナムに助言したが、南ベトナム政府は、アメリカが公の場で繰り返し「南ベトナムの喪失」を決して許さないと約束していたにもかかわらず、今や自らのレトリックの囚人になっていることを十分に理解していたため、その助言は常に無視された。援助停止の脅しはブラフであり、南ベトナムはアメリカの助言を無視することでそれを暴き、タイム誌のベトナム特派員スタンリー・カーノウが指摘したように、「…アメリカには影響力がなかった…南ベトナムは、アメリカが自国の威信を損なわずに彼らを見捨てることはできないと知っていた。そのため、年間5億ドル以上にもなるアメリカの援助に依存しているにもかかわらず、彼らはアメリカの命令に安全に逆らうことができた。要するに、彼らの弱みが強みとなったのだ」。当時、ある南ベトナムの大臣はカーノウに「アメリカに対する我々の大きな利点は、彼らが我々よりも戦争に勝ちたいと思っていることだ」と語った。^{[ 188 ]}

1964年4月、ウェイン・モース上院議員はベトナム戦争を「マクナマラの戦争」と呼んだ。これに対し、マクナマラは報道陣に対し、光栄に思うと述べ、「これは非常に重要な戦争であり、この戦争に関わっていることを嬉しく思います。勝利のためにできる限りのことをします」と語った。1964年5月、リチャード・ラッセル上院議員はジョンソン大統領に対し、マクナマラに頼りすぎないよう助言し、「マクナマラは我々が知る中で最も賢い男だ。だが、彼は考えが強すぎる。とんでもなく頑固で、もう決心がついている」と述べた。ラッセルはジョンソン大統領に対し、できれば「マクナマラを恐れていない」第二次世界大戦の将軍など、専門家を見つけて南ベトナムに派遣し、戦争は勝ち目がなく、アメリカは撤退すべきだと伝えるべきだと助言したが、ジョンソン大統領はこの助言を拒否した。^{[ 189 ] [ ah ]}

南ベトナム国家の弱点を補うため、1964年の冬の終わりまでに、マクナマラ国防長官の副官であるウィリアム・バンディ国防次官補など、ジョンソン政権の高官らは、戦争へのアメリカの介入を主張していた。このような介入は憲法上の問題を引き起こした。想定された規模で介入することは戦争を遂行することを意味し、宣戦布告の法的権限は議会のみにあったからである。解決策として、ジョンソン大統領が北ベトナムへの宣戦布告の計画に反対していたにもかかわらず、議会がジョンソン大統領にベトナムでの戦争遂行権限を与える決議を可決するという案が浮上した。^{[ 191 ]}

1964年までに、米海軍はトンキン湾に駆逐艦を派遣し、情報収集と南ベトナム特殊部隊による北ベトナムへの襲撃を支援した。1964年8月2日、駆逐艦USSマドックス は、北ベトナム人民海軍の魚雷艇3隻と海戦を繰り広げた。1964年8月4日、マドックスと別の駆逐艦USSターナー・ジョイは 、嵐の夜に国際水域で北ベトナムの魚雷艇に攻撃されたと当初報告したが、その後まもなく、おそらく攻撃はなかったと報告した。マドックスのジョン・J・ヘリック艦長は、「魚雷艇」は嵐の「異常気象の影響」によるレーダーの「点滅」に過ぎず、艦への攻撃の報告は、艦のエンジン音を魚雷の突進と勘違いした「熱心すぎる」ソナー操作員によるものだと報告した。^{[ 192 ] [ 38 ]}ジョンソンは、国際水域で海軍の軍艦が攻撃されたという報告をすぐに利用し、ベトナム戦争を遂行する権限を自分に与える決議案を議会に可決するよう求めた。マクナマラは、太平洋艦隊のグラント・シャープ・ジュニア提督を通じて、ヘリックの懸念にもかかわらず、彼の艦が魚雷艇に攻撃されたと述べるようヘリックに強い圧力をかけた。^{[ 193 ]}

1964年8月5日、マクナマラは議会に出席し、トンキン湾沖の国際水域で海軍の軍艦が攻撃されたという証拠を提示し、議会ができるだけ早く決議を可決することが不可欠であると述べた。^{[ 194 ]}リンドン・ジョンソン図書館の記録によると、マクナマラは、米太平洋軍司令官からの空爆実行に反対する勧告を隠蔽することで、マドックスへの攻撃とされる件についてジョンソンを誤解させた可能性がある。^{[ 195 ]}マクナマラはまた、共産主義者に対する戦争の拡大を正当化するために、この事件を議会と国民に提示する上で重要な役割を果たした。^{[ 196 ]}

事件から数十年後の1995年、マクナマラは北ベトナムの元国防相ヴォー・グエン・ザップと会談し、ザップはマクナマラに対し、8月4日の攻撃は実際には起こらなかったと告げた。マクナマラは最終的にその結論を受け入れた。^{[ 197 ]}

議会は1964年8月10日に決議を承認したが、反対票を投じたのはウェイン・モース上院議員（オレゴン州選出、民主党）とアーネスト・グルーニング上院議員（アラスカ州選出、民主党）のみであった。 ^{[ 198 ]}決議の可決に向けた努力と並行して、ジョンソン大統領は北ベトナム海軍基地への報復空爆作戦「ピアース・アロー作戦」を命じた。トンキン湾決議は、大統領に「米軍に対するいかなる武力攻撃も撃退し、さらなる侵略を防止するために必要なあらゆる措置を講じる」権限を与えたが、より大きな問題は、決議によって与えられた広範な権限であることが判明した。この決議は、ジョンソンに、比較的軽微な海軍事件に対する報復を、50万人の米兵が関与する大規模な地上戦に拡大する事実上無制限の権限を与えた。「トンキン湾の根本的な問題は、欺瞞ではなく、決議によって与えられた権限の濫用であった」とマクナマラは後に書いている。^{[ 199 ]}ジョンソンは戦争を遂行する権限を得たものの、それを行使することに消極的であった。例えば、1964年11月1日にビエンホア空軍基地がベトコンの攻撃を受け、アメリカ人5人が死亡、 B-57爆撃機5機が破壊された後、統合参謀本部が北ベトナムを爆撃するよう勧告したが、ジョンソンはこれを拒否した。^{[ 200 ]}

マクナマラは、米軍の軍事力の行使は北ベトナム指導部の思考に影響を与えるように設計されるべきだと主張した。アンドリュー・グッドパスター中将は1964年秋に彼にこう言った。「閣下、あなたは敵を洗脳しようとしていますが、それは決してしてはならないことです。我々は敵の代わりに考えることはできません。」グッドパスターの警告は聞き入れられなかった。^{[ 201 ]}

1964年12月1日、マクナマラは再び段階的対応計画を提言し、ジョンソン大統領にラオス南部のホーチミン・ルート沿いの北ベトナム補給線に対する爆撃作戦「バレルロール作戦」の開始を促した。これは大統領によって承認された。1964年のクリスマスイブ、ベトコンはサイゴンのブリンクス・ホテルを爆撃し、アメリカ人2人を殺害した。マクナマラが北ベトナム爆撃を提言したにもかかわらず、ジョンソン大統領は依然として躊躇していた。^{[ 202 ]}

1965年、南ベトナムにおけるベトコン反乱軍と北ベトナム正規軍の軍事活動の活発化を受けて、米国は北ベトナムへの爆撃を開始し、大規模な軍事力を展開して南ベトナムでの戦闘に突入した。ベトナム駐留米軍最高司令官の要請に支えられたマクナマラの計画は、1967年末までに48万5000人、1968年6月30日までに約53万5000人の兵力投入につながった。1965年1月、マクナマラは国家安全保障担当補佐官のマクジョージ・バンディと共にジョンソン大統領宛ての覚書を共同執筆し、「我々二人は、現在の政策では壊滅的な敗北しか招かないと確信している」と述べた。これは、不安定で腐敗した南ベトナム政府が、着実に「農村部で勢力を拡大している」ベトコンを打ち負かすことは不可能だったためである。バンディとマクナマラは、「厳しい選択の時が来た」と書き、米国には「わずかに残せるものを救済する」ために北ベトナムと交渉するか、「変化を強制する」ために介入するかの選択肢があった。バンディとマクナマラはともに後者を支持し、南ベトナムでの戦闘への米軍の投入と北ベトナムに対する戦略爆撃作戦が今や必要であると主張した。^{[ 203 ]}マクナマラのベトナムに対するタカ派的な姿勢はワシントンではよく知られており、多くの報道機関は、内閣で常に米国のより大きな関与を主張していたマクナマラが、この戦争を「マクナマラの戦争」と呼ぶことが多かった。^{[ 204 ]}

1965年2月7日、ベトコンがプレイクのアメリカ軍飛行場を攻撃し、アメリカ人8人が死亡、航空機10機が破壊された。攻撃の知らせを聞いたジョンソン大統領は、国家安全保障チームと下院議長のジョン・W・マコーマック、上院多数党院内総務のマイク・マンスフィールドを招集し、「もう我慢できない」と宣言した。ジョンソン大統領の北ベトナム爆撃計画に反対したのは、マンスフィールドと副大統領のヒューバート・ハンフリーだけだった。同日、空母USSレンジャー から発進した航空機が、ドンホイの北ベトナム軍基地を爆撃する「フレイミング・ダート作戦」を開始した。 ^{[ 205 ]}マクナマラ国防長官はジョンソン大統領に対し、厚い雲のためパイロットが爆弾投下時に目標を外すことが多く、フレイミング・ダート作戦による被害は少なく、さらなる爆撃が必要だと伝えざるを得なかった。^{[ 206 ]} 2月11日、ジョンソンは爆撃作戦の拡大を命じ、3月2日にはローリングサンダー作戦を承認した。これは北ベトナムに対する戦略爆撃作戦で、当初は8週間で終了する予定だったが、実際には3年間続いた。爆撃作戦開始後、ウェストモーランド将軍はジョンソンに電報を送り、ダナン空軍基地は脆弱であり、南ベトナム軍が基地を守る能力を信用していないと伝え、代わりに米軍の派遣を要請した。1965年3月8日、アメリカ海兵隊の2個大隊がダナンに上陸し、アメリカにとって地上戦が始まった。4月20日、マクナマラはジョンソンに4万人の兵士をベトナムに派遣するよう促し、この助言は受け入れられた。^{[ 207 ]}

1965年6月までに、ウェストモーランドは南ベトナムが「崩壊」に直面しており、その勢いを止め逆転させるには28万人の兵力が必要だと報告した。^{[ 208 ]} 1965年7月にマクナマラがジョンソンに、北ベトナムの経済を破壊するために空爆を強化することに加えて、南ベトナムにさらに18万人の兵力を投入するよう助言したが、マクジョージ・バンディはこれを「愚かさの極み」と呼んだ。^{[ 209 ] [ 210 ]}バンディは、ジョンソンがマクナマラの助言に同意することは「米国が全責任を負うことと、それに伴うベトナム側の無能さへの滑りやすい坂道」だと述べた。バンディは、ベトコンを止めるのは南ベトナム政府の責任であり、米国が戦闘を続けると、米国はサイゴンに改革を促すのに必要な影響力を失い、「…紛争は白人の戦争になり、米国はフランスの立場になる」と主張した。^{[ 209 ]}

議論を解決するため、マクナマラはジョンソン大統領のために7月下旬にまたもや「事実調査任務」として南ベトナムを訪問したが、出発前にジョン・マクノートンはマクナマラが帰国後に大統領に送る報告書をすでに作成していた。マクノートンの副官であるアダム・ヤーモリンスキーは後に、マクナマラの訪問を、すでに下された決定を正当化するための「芝居」と評した。^{[ 211 ]}彼は、カインを打倒したばかりの南ベトナムの新首相、グエン・カオ・キー空軍元帥と会った。キーは、白のジャケット、黒のズボン、赤い靴下、黒の靴という、彼自身がデザインした派手な制服を着ており、マクナマラは彼を「二流のナイトクラブのサックス奏者のようだ」と評した。マクナマラはキーに感銘を受けず、ジョンソンに、彼が戦争に勝利できるという証拠はほとんど見られないと報告し、米国は南ベトナムにさらに多くの兵力を派遣する必要があると述べた。米国に帰国後、マクナマラは報道陣に対し、ベトナムの米軍はベトコンに「ますます大きな損害」を与えていると語ったが、ジョンソンには内緒で、状況は「1年前よりも悪化している」と語った。^{[ 212 ]}

1965年11月2日、クエーカー教徒の反戦活動家ノーマン・モリソンは、ペンタゴンのマクナマラの窓の下で灯油をかぶって焼身自殺を図り死亡した。マクナマラはオフィスから駐車場から立ち上る煙しか見えなかったが、この事件に深く心を痛め、家族と話し合うことを拒否した。妻のマーギーは戦争に反対しており、モリソンの自殺には同意しなかったものの、彼の気持ちには同情していたため、なおさらだった。^{[ 213 ] [ 214 ]}マクナマラは後に2003年のドキュメンタリー映画『フォッグ・オブ・ウォー』の中で、「モリソンはペンタゴンに来て、ガソリンをかぶった。私のオフィスの下で焼身自殺した…彼の妻は非常に感動的な声明を発表した。『人間は他の人間を殺すのをやめなければならない』と。それは私が当時も共有していた信念であり、今日ではさらに強く信じている」と述べている。マクナマラは続けて、「善を行うために、どれほどの悪を行わなければならないのか？我々には一定の理想と責任がある。時には悪に手を染めなければならないこともあるが、それを最小限に抑えるべきだ」と述べた。^{[ 38 ]}

マクナマラは1965年7月に大統領に対し、戦争によって翌年の国防費が100億ドル増えると警告したが、ジョンソンは記者会見で、政権は1966年1月まで3億～4億ドルしか追加支出しないと述べた。マクナマラは、支出の増加はインフレを引き起こし、財政赤字を拡大させると警告し、ジョンソンに議会に増税を要請してそうした事態を未然に防ぐよう助言した。ジョンソンは、議会は増税に賛成票を投じないだろうと答えたため、マクナマラは「正しいことのために戦って失敗する方が、何もしないよりましだ」と大統領は少なくとも試みるべきだと主張した。ジョンソンは「ちくしょう、ボブ、それがお前の悪いところだ。お前は政治家じゃない」と怒鳴った。^{[ 215 ]}

1965年11月7日、マクナマラはジョンソンにメモを送り、ベトナムでの「相当数のアメリカ人の命の損失」は、マクナマラが世界で最も危険な国と呼ぶ中国を封じ込めるためには犠牲に見合う価値があると述べた。マクナマラは、南ベトナムへの部隊派遣は「中国を封じ込めるという米国の長期政策を支援する場合にのみ意味がある」と書き、中国を「封じ込める」プロセスには「アメリカの注意、資金、そして時折残念ながら命」が必要になると書いた。^{[ 216 ]}

兵力数と戦闘の激しさが増すにつれて、死傷者リストは増えていった。マクナマラはベトナムでの勝利のために統計に基づいた戦略を立てた。彼は南ベトナムにはベトコンの戦闘員が限られており、消耗戦で彼らを壊滅させるのに十分だと結論付けた。彼は自分の計画がどれだけ成功に近いかを判断するために指標（死者数）を適用した。ゲリラ戦に直面して、領土の保持の問題は無関係だった。ベトコンはアメリカ軍が強い地域では長期間活動することはなく、アメリカ軍が地域を大挙して占領すると、ベトコンはアメリカ軍の存在が弱い他の地域に移動するだけだったからである。^{[ 217 ]}ウェストモーランドはマクナマラの支持を得て、南ベトナム全土を防衛することを決定した。彼は消耗戦の戦略で勝利できると信じており、敵の戦争遂行能力を終わらせるのに十分な損失を与えるだけでよいと考えていた。^{[ 218 ]}マクナマラは、アメリカ軍の戦果を判断するために「死者数」という測定方法を考案した。アメリカ軍が「死者数」で測られるほど大きな損害を与えているなら、それはアメリカ軍が勝利している証拠に違いないと考えたからである。^{[ 217 ]}

ウィリアム・ピアーズ将軍（マクナマラが辞任してから2週間後に起きたミーライ虐殺事件の調査責任者）は、「死者数」戦略を批判し、「…不適切な指揮の下では、『死者数』は部隊間の競争を生み出す可能性があり、特にこれらの統計が野球の順位表のように比較され、誰がどのように数えるかについての厳格な要件がない場合にはなおさらである」と述べている。「死者数」への執着は、最も多くの「死者数」を上げた将校が昇進したため、敵に与えた損失を大幅に誇張することにつながり、また、最も多くの「死者数」を達成するための部隊間の凄惨な競争を煽り、日々の「死者数」を水増しするために罪のない民間人が殺害される事態を招いた。歴史家の間では、昇進を切望する多くの将校が実際に達成したよりもはるかに多くの「死者数」を報告したため、米軍将校がベトコンに与えたと主張する膨大な日々の損失は捏造されたものであると一般的に認められている。^{[ 217 ]}

米陸軍は、ケネディとマクナマラがより対反乱作戦の役割を担おうとする努力を妨害した。陸軍の基本単位である師団はゲリラと交戦するのに十分な柔軟性があると宣言し、さらに、従来から最大火力の使用を好む傾向があったが、火力の使用は「選別的」になるため問題にはならないと約束したのだ。ベトナムでは、このため師団は規模が小さく補給部隊も道路上に限定されていたため、大量の火力をゲリラに対して使用したが、ゲリラはしばしば「機敏」で、投入された火力をすべて回避した。その代わりに、ナパーム弾や砲撃という形でゲリラに対して大量の火力を投入するという標準的な戦術は、しばしば民間人を殺害し、ベトコンへの支持を煽る結果となった。特殊部隊はベトナムで戦闘に参加したが、戦闘の大部分を担ったのは従来の歩兵師団と機甲師団の副官としてのみだった。 1966年のメモで、マクナマラは、ケネディが構想したような特殊部隊が主導する対反乱戦争は起こらなかったことを認め、その責任は陸軍の「間違いなく管理のまずさ」にあると書いた。^{[ 219 ]}

1965年11月、戦争を支持していたマクナマラは、初めて戦争に疑問を抱き始め、記者会見で「これは長期戦になるだろう」と発言した。これは、戦争がすぐに終わるという以前の楽観的な発言と完全に矛盾していた。^{[ 218 ]} マクナマラはベトナム戦争の主要な立案者であり、戦略問題で統合参謀本部の決定を何度も覆したが、南ベトナムへの兵力増強と北ベトナムへの爆撃強化で戦争に勝利できるかどうかについて徐々に懐疑的になり、数年後に著書でその主張を発表した。また、戦争への支持は政権の方針への忠誠心から行ったと後に述べている。彼は状況を直接調査するために何度も南ベトナムを訪れ、軍司令官が要求する大規模な兵力増強を承認することにますます消極的になった。

クリスマスの贈り物として、ジョンソンは北ベトナムへの爆撃を一時停止し、休暇をテキサスの牧場で過ごすことにした。マクナマラは家族とコロラドでスキーをしていたが、大統領が爆撃の一時停止をさらに数日延長することに前向きであると聞いて、1965年12月27日にロッキー山脈のスキーロッジに家族を残してジョンソンの牧場へ飛んだ。マクナマラは、ジョンソンがラスクの助言に耳を傾ける傾向があることを知っていた。ラスクは爆撃の一時停止の延長を弱さだと考えており、ラスク抜きでジョンソンと会談することを望んでいた。マクナマラは3時間にわたる会談で、北ベトナムは繰り返し言っているように、まず爆撃が停止されない限り和平交渉を開始しないと大統領に主張し、ジョンソンに爆撃の一時停止を1月まで延長するよう説得した。^{[ 220 ]} 1966年を迎えるためにワシントンのエリートが出席した大晦日のパーティーで、マクナマラはアメリカが戦争に勝つ能力について疑問を呈した。その1週間後、経済学者のジョン・ケネス・ガルブレイスとジョンソンのスピーチライターであるディック・グッドウィンが出席した夕食会で、マクナマラは勝利は不可能であり、達成できる最善のことは南ベトナムを国家として救うかもしれない「名誉ある撤退」であると述べた。^{[ 221 ]}

1966年2月、ホノルル会議の際、マクナマラはジャーナリストグループとの非公式な会話の中で、戦争について非常に冷めた口調で語り、ローリングサンダー作戦は失敗だったと率直に述べた。マクナマラは、北ベトナムは先進的な産業インフラを持たない後進的な第三世界であり、爆撃作戦は無意味だと述べた。マクナマラは「どれだけ爆撃しても戦争は終わらない」と結論付けた。この非公式な会話に同席していたジャーナリストの一人であるカーノウは、マクナマラの性格が変わったと述べ、普段は傲慢で自信満々で、どんな問題でも「科学的に」解決できると確信していた国防長官が、おとなしくなり、明らかに自信を失っていたと指摘した。^{[ 204 ]}

1966年5月18日、マクナマラはモントリオールで全米新聞編集者協会を前に「現代世界における安全保障」と題する演説を行い^{[ 222 ]}、その中で米国の防衛政策の多くの側面を批判した。彼は後に「モントリオールでの演説をしたのは、それをしなければ職務を続けられなかったし、自分の良心と相まって生き残れなかったからであり、おかげでさらに10ヶ月間は職務を続けられたが、議会やホワイトハウスでは、私がずっと平和主義者だと思っていた人たちから、その代償は非常に大きかった。もしやり直せるなら、あの演説はしないだろう」と述べている^{[ ai ] [ 223 ] 。}

マクナマラはまた、1966年初頭までに戦争に勝利するためには南ベトナムにさらに10万人の兵士を派遣する必要があり、予備役と州兵も動員する必要があると大統領に助言した。ジョンソンは最初の勧告を受け入れたが、後者を拒否し、兵士を増派すると皮肉にも南ベトナムに対する影響力が低下するというバンディの警告を無視した。^{[ 212 ]}予備役と州兵を動員するには、数十万人の民間人を召集する必要があり、必然的に経済を混乱させ、戦争体制に置くことになる。ジョンソンはこのシナリオを拒否した。それは一般のアメリカ人にあまりにも多くの犠牲を強いるだけでなく、再選の可能性を脅かすからである。予備役が召集されることはなかったため、陸軍は人員の多くをベトナムに送らざるを得ず、西ヨーロッパの米軍師団は「骨組み」の状態になった。不足分を補うため、陸軍は徴兵に頼らざるを得なかったが、徴兵制度は大学や専門学校に通う者には寛大な免除を与え、貧しい家庭の男性に戦闘の負担が不均衡にのしかかることになったため、国内で大きな反対を引き起こした。^{[ 224 ]}予備役の招集が拒否されたため、マクナマラは1965年7月に徴兵数を月17,000人から月35,000人に増やさざるを得なかった。^{[ 225 ]} 18歳と19歳の徴兵者のほとんどが高校卒業資格以下であったため、陸軍の知的水準の低下にもつながり、多くの将校が徴兵者のほとんどが技術的な任務の訓練を受けたり昇進したりするのに十分な知能がないと不満を漏らした。戦争中、統合参謀本部議長のアール・ウィーラー将軍は、戦争が着実に米陸軍を破滅させているとして、予備役と州兵の招集を強く主張した。^{[ 226 ]}

長期間の研究の後、1966年9月、マクナマラは、北ベトナム軍のラオス南部、南ベトナム、カンボジアへの侵入を検知し、空爆の誘導に役立てるための障壁線の建設を命じた。物理的には、マクナマラ線は南ベトナムを横断してベトナム非武装地帯（DMZ）に沿ってラオス国境まで伸びていた。^{[ 227 ]}ベトナムの障壁とそのラオスへの延長線では、イグルー・ホワイト作戦の下で革新的な空中投下センサーも使用された。^{[ 228 ]}イグルー・ホワイトの設計と建設には10億ドルから17億ドルの費用がかかり、作戦の5年間の期間中、年間10億ドルの運用費がさらにかかった。その有効性に関する報告をめぐって論争が起こっている。

1966年10月、マクナマラは再び南ベトナムを訪問し帰国したが、公には自信満々だったものの、内心では疑念を抱いていた。マクナマラは報道陣に対し「進展は我々の予想を上回っている」と述べた一方で、大統領には「戦争を早期に終結させる合理的な方法は見当たらない」と伝えた。マクナマラはジョンソン大統領に対し、米軍が北ベトナム軍とベトコンに大きな損害を与えていると報告したが、その損失は「十分に補填できる」ものであり、南ベトナムでは、たとえアメリカ軍によって「平定」されたとされる地域であっても、「完全な安全はどこにも存在しない」と付け加えた。最悪なことに、マクナマラは南ベトナム人がまだ十分な負担を負っておらず、アメリカが自分たちのためにすべての戦闘を行うことを期待していると不満を述べ、次のように語った。「この重要な戦争はベトナム人自身が戦い、勝利しなければならない。我々は最初からこのことを知っていた。しかし、落胆させられる真実は、1961年、1963年、1965年の場合と同様に、我々は彼らを訓練し、効果的な行動へと鼓舞するための公式、触媒を見つけていないということだ。」^{[ 229 ]}

1966年10月、彼は軍の武装軍資格試験の基準を引き下げるプロジェクト100,000を開始し、高ストレスまたは危険な環境での作業には適していないという批判にもかかわらず、354,000人の男性を追加で採用できるようにした。著書『マクナマラの愚行：ベトナム戦争における低IQ部隊の使用』の著者であるハミルトン・グレゴリーによると、このプロジェクトで採用された兵士は、ベトナムで従軍した他のアメリカ人の3倍の割合で死亡し、従軍後は非退役軍人に比べて収入が低く、離婚率が高かった。^{[ 230 ] [ 231 ] [ 232 ]}

1966年11月、マクナマラはヘンリー・キッシンジャーに会うためハーバード大学を訪れた。彼の車は反戦デモ隊に取り囲まれ、停車を余儀なくされた。学生たちは、マクナマラが彼らのリーダーであり、民主社会学生同盟（SDS）ハーバード支部の会長であるマイケル・アンサラと討論するまで、車を動かすことを拒否した。マクナマラは討論に応じ、車のボンネットの上に立ち、群衆の中の学生から「アメリカは侵略行為を行っている」という非難に対し、「戦争は1957年ではなく1954年に始まった。国際管理委員会がそう記した報告書を書いたからだ。君たちはそれを読んでいないし、読んだとしても明らかに理解していない」と反論した。^{[ 233 ]}学生が国際管理委員会の報告書を読んだが、そこにはそんなことは書いてなかったと答えると、マクナマラは自分は相手よりはるかに優秀な大学生だったと言い、「私は当時も君よりタフだったし、今もタフだ！当時も礼儀正しかったし、今も礼儀正しいことを願っている！」と答えた。マクナマラが群衆を侮辱し続け、雰囲気が悪化するにつれ、彼はクインシー・ハウスに逃げ込み、そこから地下トンネルを通ってキッシンジャーに会いに行った。学生たちとの対立で彼は動揺し、キッシンジャーの授業で話をする準備ができるまで30分かかった。^{[ 234 ]}

ローリングサンダー作戦の効果は地上戦よりも測定しやすかったため、マクナマラは爆撃作戦が予想通り北ベトナム経済の崩壊を引き起こさなかったという事実に特に困惑した。^{[ 235 ]}マクナマラの計算によると、1967年6月、アメリカの爆撃機は北ベトナムの水力発電所を攻撃し、北ベトナムの発電能力を85%減少させた。同時に、北ベトナムで毎年発電される電力は、バージニア州アレクサンドリアにあるポトマック電力会社の発電所で毎年発電される電力のわずか5分の1に過ぎず、発電量が非常に少なかったため、北ベトナムの発電所の破壊は戦争の結果には何の意味も持たなかったと計算した。彼はまた、1967年に、過去2年間でアメリカの爆撃機が北ベトナムに与えた損害は約3億ドルに相当するが、同時にローリングサンダー作戦ではアメリカ空軍が北ベトナム上空で撃墜された航空機約700機の総額が約9億ドルに達し、爆撃作戦は非経済的であると計算した。^{[ aj ] [ 236 ]}

マクナマラの疑念は、レスリー・H・ゲルブやジョン・マクノートンといった文民補佐官によって助長された。彼らは仕事から帰宅すると、妻や十代の子供たちから「戦争犯罪人」と叱責されると不満を漏らした。^{[ 237 ]}マクナマラ自身の十代の息子、ロバート・クレイグ・マクナマラは戦争に反対し、毎日仕事から帰ってくると父親を非難した。^{[ 238 ]}息子の寝室にアメリカ国旗が逆さまに掛けられているのを見てマクナマラはショックを受けた。息子は、父親のせいでアメリカが恥ずかしいと言った。^{[ 233 ]}マクノートンはマクナマラに、若者たちと話をした後、「『体制側』は正気を失っているという感情が広く強く抱かれている」と伝え、支配的な意見は「我々は理解できない遠い人々にアメリカのイメージを押し付けようとしており、それをばかげたところまで推し進めている」というものだったと語った。^{[ 237 ]}

1967年5月19日付の大統領宛メモで、マクナマラは、戦争の軍事面は順調に進んでおり、アメリカ軍は毎月数千人の敵兵を殺害しているが、政治面はそうではなく、南ベトナムは相変わらず機能不全に陥っていると述べた。彼は「汚職が蔓延している。真の政府支配は飛び地に限られている。組織は腐敗している」と記した。マクナマラは、アメリカ軍が一時的に状況を安定させ、南ベトナムが自ら戦争を引き継ぐという考えは誤りであり、機能不全に陥った南ベトナム国家は決して戦争に勝利することはできず、したがってアメリカ軍は今後数十年間ベトナムに駐留し続けなければならないだろうと書いた。彼はジョンソン大統領に対し、ウェストモーランドが要求した20万人の追加兵力を受け入れないよう助言した。それは予備役の招集を意味し、ひいては戦時経済を必要とするからである。平時経済の終焉に伴う経済的犠牲は、和平交渉を政治的にほぼ不可能にし、事実上タカ派に主導権を握らせることになるため、タカ派は予備役の招集を強く求め続けていた。経済的犠牲は、戦争を勝利で終結させるという説明によってのみアメリカ国民に正当化できた。マクナマラはタカ派の助言を拒否し、飢饉を引き起こす目的で北ベトナムの堤防や閘門を爆撃して農地を水没させる、武器を運ぶソ連船を沈めるために北ベトナム沿岸に機雷を敷設する、ラオスとカンボジアに侵攻する、そして他の手段が失敗した場合の最終手段として核兵器を使用するといった措置は、国際世論を遠ざけ、国内の反対を増大させる可能性が高いと警告した。マクナマラは次のように書いている。「世界最大の超大国が、その是非が激しく議論されている問題で、小さな後進国を屈服させようとしながら、毎週1000人もの非戦闘員を殺害または重傷を負わせているという状況は、決して美しいものではない」^{[ 239 ] 。}

最後に、マクナマラは、 1965年にスハルト将軍がインドネシアで権力を掌握し、世界で3番目に大きいインドネシア共産党を壊滅させ、数十万人のインドネシア共産党員を殺害したため、ドミノ理論は無関係だと一蹴した。彼は、インドネシアでスハルトが権力を握ったことで、「アジアの潮流は今やアメリカに有利に働き、南ベトナムの重要性が低下した」と主張した。アメリカ人にとって、インドネシアは東南アジアのすべての「ドミノ」の中で最も重要な国であり、マクナマラは、たとえ南ベトナムの「ドミノ」が倒れたとしても、インドネシアの「ドミノ」は依然として立っているだろうと主張した。^{[ 239 ]}

1968年1月21日、テト攻勢の9日前、ウィリアム・ウェストモーランド将軍はベトナムでの戦術核兵器使用計画を提案し、空軍参謀総長のジョン・マコーネル将軍もこれに同意した。^{[ 240 ]}マクナマラは1968年2月19日、退任の10日前にリンドン・ジョンソンに秘密覚書を送り、核兵器使用の選択肢を否定した。マクナマラは「南ベトナムでの作戦特有の地形やその他の状況から、ベトコンや北ベトナム軍に対して核兵器の使用が推奨されることは考えられない」と記した。^{[ 241 ]}同じ覚書の中でマクナマラは、核兵器の使用は検討されていないことを保証するため、科学者のジョージ・キリアン、ジョージ・キスティアコフスキー、イル・ラビに直接連絡を取ったと述べている。この3人は、核兵器使用に反対するようアイゼンハワー前大統領に電報を送っていた。^{[ 242 ]}

マクナマラは1967年6月17日にベトナム研究タスクフォースを任命した。^{[ 243 ]}前年11月のハーバードでの対立がきっかけだった。議論していた学生たちが自分よりもベトナムの歴史についてよく知っていることに気づいたからだ。^{[ 244 ]}マクナマラはレスリー・ゲルブと6人の職員に、第二次世界大戦中のベトミンとのアメリカとの関係から始まる100の質問に答えることで、アメリカがベトナムにどのように、そしてなぜ関与するようになったのかを調査するよう指示した。^{[ 245 ] [ 246 ]}マクナマラは1967年9月までに完了することを期待していたが、1969年1月までに完了した。^{[ 246 ]}ゲルブは共和党上院議員ジェイコブ・ジャビッツのために戦争支持演説を書いたタカ派だったが、1969年までに36人に増えた彼と彼のチームは、歴史を執筆するにつれて幻滅していった。ベトナム戦争の教訓について議論していた際、歴史家の一人である後の将軍ポール・F・ゴーマンは黒板の前に出て、ただ「やめろ」とだけ書いた。^{[ 247 ]}チームのメンバーには、ゲルブ、ゴーマン、メルビン・ガートフ、ハンス・ヘイマン、リチャード・ムーアスタイン、ダニエル・エルズバーグ、リチャード・ホルブルック、ジョン・ガルビン、ポール・ワーンケ、モートン・ハルペリンらがいた。^{[ 246 ] [ 248 ] [ 249 ]}

1969年1月までに、ペンタゴン・ペーパーズの正式名称である「国防長官室ベトナム対策本部報告書」は完成したが、政府内では広く無視された。^{[ 250 ] [ 247 ]}ゲルブは、その年の初めにマクナマラにこの文書を提示したが、マクナマラは当時それを読まず、2018年になってもマクナマラが読んだかどうかはゲルブにはわからなかったと回想している。^{[ 246 ] [ 251 ]}インドシナにおける米軍の関与の公式記録として意図された最終報告書は7,000ページに及び^{[ 252 ] [ 250 ]}、「極秘－機密」に分類された。^{[ 245 ]}

この報告書は最終的に1971年に、マクナマラ国防次官補ジョン・マクノートンの元側近ダニエル・エルズバーグによってニューヨーク・タイムズにリークされた。 ^{[ 250 ]}リークされた研究はペンタゴン・ペーパーズとして知られるようになり、マクナマラらがベトナム攻勢が無益であることを認識していたことが明らかになった。^{[ 252 ] [ 250 ]}ニクソン政権によるその後のリーク防止の取り組みは、間接的にウォーターゲート事件につながった。インタビューでマクナマラは、ドミノ理論がベトナム戦争参戦の主な理由だったと述べた。また、「ケネディはベトナムでの敗北に直面した場合、完全に撤退するかどうかを死ぬ前には言っていなかったが、もし彼がその選択を迫られていたら撤退していたと私は今日信じている」とも述べた。^{[ 38 ]}