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| ロドプシン様受容体 | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 ロドプシンの構造：AGタンパク質共役受容体。[1] | |||||||||||
| 識別子 | |||||||||||
| シンボル | 7tm_1 | ||||||||||
| パム | PF00001 | ||||||||||
| ファム一族 | GPCR_A | ||||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||||
| プロサイト | PDOC00211 | ||||||||||
| SCOP2 | 1f88 / スコープ / SUPFAM | ||||||||||
| OPMスーパーファミリー | 6 | ||||||||||
| OPMタンパク質 | 1gzm | ||||||||||
| 医療機器 | cd00637 | ||||||||||
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ロドプシン様受容体は、Gタンパク質共役受容体の最大のグループを構成するタンパク質ファミリーです。[2]
範囲
G タンパク質共役受容体 (GPCR) は、幅広い機能 (さまざまなオートクリン、パラクリン、および内分泌プロセスを含む) を網羅する広大なタンパク質ファミリーを構成します。配列レベルでは大きな多様性を示し、それに基づいて明確なグループに分けることができます。GPCR は、進化的関係の兆候があるものの、統計的に有意な配列の類似性がないファミリーのグループを包含するため、通常「スーパーファミリー」と呼ばれます。 [2]現在知られているスーパーファミリーのメンバーには、ロドプシン様 GPCR (このファミリー)、セクレチン様 GPCR、cAMP 受容体、真菌交配フェロモン受容体、および代謝型グルタミン酸受容体ファミリーが含まれます。GPCR 専用のデータベースがあります。 [ 3]
関数
ロドプシン様GPCR自体は、ホルモン、神経ペプチド、神経伝達物質、光受容体を含む広範なタンパク質ファミリーを表し、それらはすべてグアニンヌクレオチド結合（G）タンパク質との相互作用を通じて細胞外シグナルを伝達します。それらの活性化リガンドは構造と特性が大きく異なりますが、受容体のアミノ酸配列は非常に類似しており、7つの膜貫通（TM）ヘリックスからなる共通の構造フレームワークを採用していると考えられています。[4] [5] [6]
クラス
ロドプシン様GPCRは系統解析に基づいて以下の19のサブグループ（A1-A19）に分類されています。[7]
亜科A1
- ケモカイン受容体 InterPro : IPR000355
- ケモカイン（CCモチーフ）受容体1（CCR1、CKR1）
- ケモカイン（CCモチーフ）受容体2（CCR2、CKR2）
- ケモカイン（CCモチーフ）受容体3（CCR3、CKR3）
- ケモカイン（CCモチーフ）受容体4（CCR4、CKR4）
- ケモカイン（CCモチーフ）受容体5（CCR5、CKR5）
- ケモカイン（CCモチーフ）受容体8（CCR8、CKR8）
- ケモカイン（CCモチーフ）受容体様2（CCRL2、CKRX）
- ケモカイン（Cモチーフ）受容体1（XCR1、CXC1）InterPro： IPR005393
- ケモカイン（C-X3-C モチーフ）受容体 1（CX3CR1、C3X1）InterPro： IPR005387
- GPR137B ( GPR137B、TM7SF1)
亜科A2
- ケモカイン受容体 InterPro : IPR000355
- ケモカイン（CCモチーフ）受容体様1（CCRL1 CCRL1、CCR11）
- ケモカイン（CCモチーフ）受容体6（CCR6、CKR6）
- ケモカイン（CCモチーフ）受容体7（CCR7、CKR7）
- ケモカイン（CCモチーフ）受容体9（CCR9、CKR9）
- ケモカイン（CCモチーフ）受容体10（CCR10、CKRA）
- CXCケモカイン受容体 InterPro : IPR001053
- ケモカイン（CXCモチーフ）受容体3（CXCR3）
- ケモカイン（CXCモチーフ）受容体4（CXCR4、Fusin）
- ケモカイン（CXCモチーフ）受容体5（CXCR5）
- ケモカイン（CXCモチーフ）受容体6（CXCR6、BONZO）
- ケモカイン（CXCモチーフ）受容体7（CXCR7、RDC1）InterPro： IPR001416
- インターロイキン-8 InterPro : IPR000174 (IL8R)
- 副腎メデュリン受容体（GPR182）
- ダフィー血液型、ケモカイン受容体（DARC、DUFF）
- G タンパク質共役受容体 30 ( GPER、CML2、GPCR エストロゲン受容体)
亜科A3
- アンジオテンシンII受容体 InterPro : IPR000248
- アンジオテンシン II 受容体、タイプ 1 ( AGTR1、AG2S)
- アンジオテンシン II 受容体 2 型( AGTR2、AG22)
- アペリン受容体( AGTRL1、APJ) InterPro : IPR003904
- ブラジキニン受容体 InterPro : IPR000496
- ブラジキニン受容体B1（BDKRB1、BRB1）
- ブラジキニン受容体B2（BDKRB2、BRB2）
- GPR15 ( GPR15、GPRF)
- GPR25 ( GPR25 )
亜科A4
- オピオイド受容体 InterPro : IPR001418
- デルタオピオイド受容体（OPRD1、OPRD）
- カッパオピオイド受容体( OPRK1、 OPRK )
- μオピオイド受容体（OPRM1、OPRM）
- ノシセプチン受容体（OPRL1、OPRX）
- ソマトスタチン受容体 InterPro : IPR000586
- ソマトスタチン受容体1（SSTR1、SSR1）
- ソマトスタチン受容体2（SSTR2、SSR2）
- ソマトスタチン受容体3（SSTR3、SSR3）
- ソマトスタチン受容体4（SSTR4、SSR4）
- ソマトスタチン受容体5（SSTR5、SSR5）
- GPCR 神経ペプチド受容体 InterPro : IPR009150
- 神経ペプチド B/W 受容体 1 ( NPBWR1、 GPR7 )
- 神経ペプチド B/W 受容体 2 ( NPBWR2、 GPR8 )
- GPR1 オーファン受容体( GPR1 ) InterPro : IPR002275
亜科A5
- ガラニン受容体 InterPro : IPR000405
- システイニルロイコトリエン受容体InterPro : IPR004071
- システイニルロイコトリエン受容体1（CYSLTR1）
- システイニルロイコトリエン受容体2（CYSLTR2）
- ロイコトリエンB4受容体 InterPro : IPR003981
- ロイコトリエンB4受容体（LTB4R、P2Y7）
- ロイコトリエン B4 受容体 2 ( LTB4R2 )
- リラキシン受容体 InterPro : IPR008112
- リラキシン/インスリン様ファミリーペプチド受容体1（RXFP1、LGR7）
- リラキシン/インスリン様ファミリーペプチド受容体2（RXFP2、GPR106）
- リラキシン/インスリン様ファミリーペプチド受容体3（RXFP3、SALPR）
- リラキシン/インスリン様ファミリーペプチド受容体4（RXFP4、GPR100/GPR142）
- KiSS1由来ペプチド受容体（GPR54）（KISS1R）InterPro： IPR008103
- メラニン凝集ホルモン受容体1（MCHR1、GPRO）InterPro： IPR008361
- ウロテンシン II 受容体( UTS2R、UR2R) InterPro : IPR000670
亜科A6
- コレシストキニン受容体 InterPro : IPR009126
- コレシストキニン A 受容体( CCKAR、CCKR)
- コレシストキニンB受容体（CCKBR、GASR）
- 神経ペプチド FF 受容体 InterPro : IPR005395
- 神経ペプチド FF 受容体 1 ( NPFFR1、 FF1R )
- 神経ペプチド FF 受容体 2 ( NPFFR2、 FF2R)
- オレキシン受容体 InterPro : IPR000204
- ヒポクレチン（オレキシン）受容体1（HCRTR1、OX1R）
- ヒポクレチン（オレキシン）受容体2（HCRTR2、OX2R）
- バソプレシン受容体 InterPro : IPR001817
- アルギニンバソプレシン受容体1A（AVPR1A、V1AR）
- アルギニンバソプレシン受容体1B（AVPR1B、V1BR）
- アルギニンバソプレシン受容体2（AVPR2、V2R）
- オキシトシン受容体（OXTR）
- ゴナドトロピン放出ホルモン受容体（GNRHR、GRHR）InterPro： IPR001658
- ピログルタミル化 RFアミドペプチド受容体( QRFPR、GPR103)
- GPR22 ( GPR22、GPRM)
- GPR176 ( GPR176、GPR)
亜科A7
- ボンベシン受容体 InterPro : IPR001556
- ボンベシン様受容体3（BRS3）
- ニューロメジン B 受容体( NMBR )
- ガストリン放出ペプチド受容体（GRPR）
- エンドセリン受容体 InterPro : IPR000499
- エンドセリン受容体A型（EDNRA、ET1R）
- エンドセリン受容体B型（EDNRB、ETBR）
- GPR37 ( GPR37、ETBR-LP2)インタープロ: IPR003909
- ニューロメジンU受容体 InterPro : IPR005390
- ニューロメジンU受容体1（NMUR1）
- ニューロメジンU受容体2（NMUR2）
- ニューロテンシン受容体 InterPro : IPR003984
- ニューロテンシン受容体1（NTSR1、NTR1）
- ニューロテンシン受容体2（NTSR2、NTR2）
- 甲状腺刺激ホルモン放出ホルモン受容体（TRHR、TRFR）InterPro： IPR009144
- 成長ホルモン分泌促進因子受容体（GHSR）InterPro： IPR003905
- GPR39 ( GPR39 )
- モチリン受容体（MLNR、GPR38）
亜科A8
- アナフィラトキシン受容体 InterPro : IPR002234
- C3a受容体（C3AR1、C3AR）
- C5a受容体（C5AR1、C5AR）
- ケモカイン様受容体1（CMKLR1、CML1）InterPro： IPR002258
- ホルミルペプチド受容体 InterPro : IPR000826
- ホルミルペプチド受容体1（FPR1、FMLR）
- フォルミルペプチド受容体様1（FPRL1、FML2）
- フォルミルペプチド受容体様2（FPRL2、FML1）
- MAS1 がん遺伝子 InterPro : IPR000820
- GPR1 ( GPR1 )
- GPR32 ( GPR32、GPRW)
- GPR44 ( GPR44 )
- GPR77 ( GPR77、C5L2)
亜科A9
- メラトニン受容体 InterPro : IPR000025
- メラトニン受容体1A（MTNR1A、ML1A）
- メラトニン受容体1B（MTNR1B、ML1B）
- ニューロキニン受容体 InterPro : IPR001681
- タキキニン受容体 1 ( TACR1、NK1R)
- タキキニン受容体 2 ( TACR2、NK2R)
- タキキニン受容体 3 ( TACR3、NK3R)
- 神経ペプチドY受容体 InterPro : IPR000611
- 神経ペプチドY受容体Y1（NPY1R、NY1R）
- 神経ペプチドY受容体Y2（NPY2R、NY2R）
- 膵ポリペプチド受容体1（PPYR1、NY4R）
- 神経ペプチドY受容体Y5（NPY5R、NY5R）
- プロラクチン放出ペプチド受容体（PRLHR、GPRA）InterPro： IPR001402
- プロキネティシン受容体1（PROKR1、GPR73）
- プロキネティシン受容体2（PROKR2、PKR2）
- GPR19 ( GPR19、GPRJ)
- GPR50 ( GPR50、ML1X)
- GPR75 ( GPR75 )
- GPR83 ( GPR83、GPR72)
亜科 A10
- 糖タンパク質ホルモン受容体InterPro : IPR002131
- FSH受容体（FSHR）
- 黄体形成ホルモン/絨毛性ゴナドトロピン受容体（LHCGR、LSHR）
- 甲状腺刺激ホルモン受容体( TSHR )
- ロイシンリッチリピート含有Gタンパク質共役受容体4（LGR4、GPR48）
- ロイシンリッチリピート含有Gタンパク質共役受容体5（LGR5、GPR49）
- ロイシンリッチリピート含有Gタンパク質共役受容体6（LGR6）
亜科A11
- GPR40関連受容体 InterPro : IPR013312
- P2プリン受容体 InterPro : IPR002286
- プリン受容体 P2Y 1 ( P2RY1 )
- プリン受容体 P2Y 2 ( P2RY2 )
- プリン受容体 P2Y 4 ( P2RY4 )
- プリン受容体 P2Y 6 ( P2RY6 )
- プリン受容体 P2Y 8 ( P2RY8 )
- プリン受容体 P2Y 11 ( P2RY11 )
- ヒドロキシカルボン酸受容体1（HCAR1、GPR81）
- ヒドロキシカルボン酸受容体2、ナイアシン受容体1（HCAR2、GPR109A）
- ヒドロキシカルボン酸受容体3、ナイアシン受容体2（HCAR3、GPR109B、HM74）
- GPR31 ( GPR31、GPRV)
- GPR82 ( GPR82 )
- オキソグルタル酸（α-ケトグルタル酸）受容体1（OXGR1、GPR80）
- コハク酸受容体1（SUCNR1、GPR91）
亜科A12
- P2プリン受容体 InterPro : IPR002286
- プリン受容体 P2Y 12 ( P2RY12 )
- プリン受容体 P2Y 13 ( P2RY13、 GPR86 ) InterPro : IPR008109
- プリン受容体 P2Y 14 ( P2RY14、 UDP-グルコース受容体、 KI01) InterPro : IPR005466
- GPR34 ( GPR34 )
- GPR87 ( GPR87 )
- GPR171 ( GPR171 , H963)
- 血小板活性化因子受容体（PTAFR、PAFR）InterPro： IPR002282
亜科A13
- カンナビノイド受容体 InterPro : IPR002230
- カンナビノイド受容体1（脳）（CNR1、CB1R）
- カンナビノイド受容体2（マクロファージ）（CNR2、CB2R）
- リゾホスファチジン酸受容体 InterPro : IPR004065
- リゾホスファチジン酸受容体1 ( LPAR1 )
- リゾホスファチジン酸受容体2 ( LPAR2 )
- リゾホスファチジン酸受容体3 ( LPAR3 )
- スフィンゴシン1リン酸受容体 InterPro : IPR004061
- スフィンゴシン1リン酸受容体1（S1PR1）
- スフィンゴシン1-リン酸受容体2（S1PR2）
- スフィンゴシン1リン酸受容体3（S1PR3）
- スフィンゴシン1リン酸受容体4（S1PR4）
- スフィンゴシン1リン酸受容体5（S1PR5）
- メラノコルチン/ACTH受容体 InterPro : IPR001671
- メラノコルチン1受容体（MC1R、MSHR）
- メラノコルチン3受容体（MC3R）
- メラノコルチン4受容体（MC4R）
- メラノコルチン 5 受容体( MC5R )
- ACTH受容体（MC2R）、ACTR）
- GPR3 ( GPR3 )
- GPR6 ( GPR6 )
- GPR12 ( GPR12、GPRC)
亜科A14
- エイコサノイド受容体 InterPro : IPR008365
- プロスタグランジンD 2受容体( PTGDR、PD2R)
- プロスタグランジンE 1受容体( PTGER1、PE21)
- プロスタグランジンE 2受容体( PTGER2、 PE22 )
- プロスタグランジンE 3受容体( PTGER3、PE23)
- プロスタグランジンE 4受容体( PTGER4、 PE24 )
- プロスタグランジン F 受容体( PTGFR、PF2R)
- プロスタグランジン I 2 (プロスタサイクリン) 受容体( PTGIR、PI2R)
- トロンボキサンA 2受容体( TBXA2R、 TA2R )
亜科A15
- リゾホスファチジン酸受容体 InterPro : IPR004065
- リゾホスファチジン酸受容体4 ( LPAR4 )
- リゾホスファチジン酸受容体 5 ( LPAR5 )
- リゾホスファチジン酸受容体6（LPAR6）InterPro： IPR002188
- P2プリン受容体 InterPro : IPR002286
- プリン受容体 P2Y 10 ( P2RY10、 P2Y10 )
- プロテアーゼ活性化受容体 InterPro : IPR003912
- 凝固因子II（トロンビン）受容体様1（F2RL1、PAR2）
- 凝固因子II（トロンビン）受容体様2（F2RL2、PAR3）
- 凝固因子II（トロンビン）受容体様3（F2RL3、PAR4）
- エプスタイン・バーウイルス誘導遺伝子2（リンパ球特異的Gタンパク質共役受容体）（GPR183）
- プロトン感知Gタンパク質共役受容体
- GPR17 ( GPR17、GPRH)
- GPR18 ( GPR18、GPRI)
- GPR20 ( GPR20、GPRK)
- GPR35 ( GPR35 )
- GPR55 ( GPR55 )
- 凝固因子II受容体 （F2R、THRR）
亜科A16
- オプシン インタープロ： IPR001760 [8]
- ロドプシン( RHO、OPS)
- オプシン 1 (錐体色素)、短波感受性 (色覚異常、三色性) ( OPN1SW、OPSB) (青感受性オプシン)
- オプシン 1 (錐体色素)、中波長感受性 (色覚異常、デュータン) ( OPN1MW、OPSG) (緑感受性オプシン)
- オプシン 1 (錐体色素)、長波感受性 (色覚異常、プロタン) ( OPN1LW、OPSR) (赤色感受性オプシン)
- オプシン 3、パノプシン( OPN3 )
- オプシン4、メラノプシン（OPN4）
- オプシン5（OPN5、GPR136）
- 網膜Gタンパク質共役受容体（RGR）
- 網膜色素上皮由来ロドプシンホモログ（RRH、OPSX）（視覚色素様受容体オプシン）InterPro： IPR001793
亜科 A17
- 5-ヒドロキシトリプタミン (5-HT) 受容体 InterPro : IPR002231
- アドレナリン受容体 InterPro : IPR002233
- ドーパミン受容体 InterPro : IPR000929
- 微量アミン受容体 InterPro : IPR009132
- ヒスタミンH 2受容体( HRH2、HH2R) InterPro : IPR000503
亜科A18
- ヒスタミンH 1受容体( HRH1、HH1R) InterPro : IPR000921
- ヒスタミンH 3受容体( HRH3 ) InterPro : IPR003980
- ヒスタミンH4受容体（HRH4）InterPro： IPR008102
- アデノシン受容体 InterPro : IPR001634
- ムスカリン性アセチルコリン受容体 InterPro : IPR000995
- GPR21 ( GPR21、GPRL)
- GPR27 ( GPR27 )
- GPR45 ( GPR45、PSP24)
- GPR52 ( GPR52 )
- GPR61 ( GPR61 )
- GPR62 ( GPR62 )
- GPR63 ( GPR63 )
- GPR78 ( GPR78 )
- GPR84 ( GPR84 )
- GPR85 ( GPR85 )
- GPR88 ( GPR88 )
- GPR101 ( GPR101 )
- GPR161 ( GPR161、RE2)
- GPR173 ( GPR173、SREB3)
亜科A19
- 5-ヒドロキシトリプタミン (5-HT) 受容体 InterPro : IPR002231
非公開
- 嗅覚受容体 InterPro : IPR000725
- 線虫化学受容体[9]（複数、InterPro : IPR000344 InterPro : IPR019424を含む）
- 味覚受容体2型[9] InterPro : IPR007960
- 鋤鼻受容体タイプ1 InterPro : IPR004072
参考文献
- ^ Palczewski K, Kumasaka T, Hori T, et al. (2000年8月). 「ロドプシンの結晶構造: AGタンパク質結合受容体」. Science . 289 (5480): 739–45. Bibcode :2000Sci...289..739P. doi :10.1126/science.289.5480.739. PMID 10926528.
- ^ ab Attwood TK、Findlay JB (1994)。「Gタンパク質結合受容体のフィンガープリント」。Protein Eng . 7 (2): 195–203. doi :10.1093/protein/7.2.195. PMID 8170923。
- ^ 「Gタンパク質結合受容体の情報システム」。GPCRDB。www.gpcr.org。2009年4月22日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2008年12月5日閲覧。
- ^ Birnbaumer L (1990). 「シグナル伝達におけるGタンパク質」Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol . 30 : 675–705. doi :10.1146/annurev.pa.30.040190.003331. PMID 2111655.
- ^ Gilman AG、Casey PJ (1988)。「受容体-エフェクターカップリングにおけるGタンパク質の関与」。J . Biol. Chem . 263 (6): 2577–2580. doi : 10.1016/S0021-9258(18)69103-3 . PMID 2830256。
- ^ Attwood TK、Findlay JB (1993)。「Gタンパク質結合受容体の識別指紋の設計」。Protein Eng . 6 (2): 167–176. doi :10.1093/protein/6.2.167. PMID 8386361。
- ^ Joost P, Methner A (2002). 「オーファン受容体リガンドの予測ツールとしての277個のヒトGタンパク質共役受容体の系統学的解析」Genome Biol . 3 (11): research0063.1–0063.16. doi : 10.1186/gb-2002-3-11-research0063 . PMC 133447 . PMID 12429062.
- ^ 寺北 明 (2005). 「オプシン」. Genome Biol . 6 (3): 213. doi : 10.1186 /gb-2005-6-3-213 . PMC 1088937. PMID 15774036.
- ^ ab Nordström KJ、Sällman Almén M、Edstam MM、Fredriksson R、Schiöth HB (2011 年 9 月)。「独立した HHsearch、Needleman-Wunsch ベース、およびモチーフ分析により、G タンパク質結合受容体ファミリーのほとんどの全体的な階層が明らかになりました」。分子生物学と進化。28 ( 9): 2471–80。doi : 10.1093/molbev/ msr061。PMID 21402729 。
外部リンク
- Vriend G、Horn F、Oliveira L、Bywater RP、Cohen FE。「GPCRDB (G タンパク質結合受容体データベース): シーケンス由来データ」。2007 年 11 月 14 日にオリジナルからアーカイブ。2007年 12 月 10 日に取得。
- Horn F, Bettler E, Oliveira L, Campagne F, Cohen FE, Vriend G (2003). 「Gタンパク質共役受容体のGPCRDB情報システム」. Nucleic Acids Res . 31 (1): 294–7. doi :10.1093/nar/gkg103. PMC 165550. PMID 12520006 . このデータベースには、すべての GPCR ファミリーとサブファミリーの複数の配列アライメントが含まれています。