LGR6

LGR6
識別子
エイリアス	LGR6、GPCR、VTS20631、ロイシンリッチリピート含有Gタンパク質共役受容体6、ロイシンリッチリピート含有Gタンパク質共役受容体6
外部ID	オミム：606653; MGI : 2441805;ホモロジーン: 49680;ジーンカード：LGR6; OMA :LGR6 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体1（ヒト）
終わり	202,319,781 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体1（マウス）
終わり	135,033,014 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	右冠動脈; ; 胸部大動脈下行; ; 上行大動脈; ; 左冠動脈; ; 顆粒球; ; 右心房の心筋組織; ; 胃粘膜; ; 膝窩動脈; ; 脛骨動脈; ; 下垂体前葉;
	トップの表現
	上行大動脈; ; 大動脈弁; ; 外耳の皮膚; ; 臼歯; ; 二次卵母細胞; ; 右心室; ; 中央隆起; ; 一次卵母細胞; ; 背中の皮膚; ; 表皮;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	タンパク質結合; Gタンパク質共役受容体活性; 膜貫通シグナル受容体活性; 信号変換器の活動; タンパク質ホルモン受容体活性; ヘパリン結合; ラウンドアバウトバインディング;
細胞成分	膜の不可欠な構成要素; 小胞; 細胞膜; 細胞膜の不可欠な構成要素; トランスゴルジネットワーク膜; 膜; 細胞外空間;
生物学的プロセス	標準的なWntシグナル伝達経路の正の制御; Wntシグナル伝達経路の正の調節; Gタンパク質共役受容体シグナル伝達経路; Wntシグナル伝達経路; シグナル伝達; 細胞移動の正の調節; 組織再生; 骨の再生; 軸索誘導; 負の走化性;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	59352
	329252
	ENSG00000133067
	ENSMUSG00000042793
	翻訳:
	Q3UVD5
	NM_001017403 ; NM_001017404 ; NM_021636
	NM_001033409
	NP_001017403 ; NP_001017404 ; NP_067649
	NP_001028581
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

ロイシンリッチリピート含有Gタンパク質共役受容体6は、ヒトではLGR6遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]他のGタンパク質共役受容体 LGR4およびLGR5とともに、 LGR6はWntシグナル伝達経路メディエーターである。LGR6は、マウスの生体内での扁平上皮癌における上皮幹細胞マーカーとしても機能する。^[7]

この遺伝子は、Gタンパク質共役7回膜貫通タンパク質スーパーファミリーのロイシンリッチリピート含有サブグループのメンバーをコードしています。コードされているタンパク質は、リガンド結合のための馬蹄形相互作用モチーフの形成に重要なロイシンリッチリピートを含む大きなN末端細胞外ドメインを持つ糖タンパク質ホルモン受容体です。この遺伝子の選択的スプライシングにより、複数の転写バリアントが生成されます。^[6]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000133067 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000042793 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Hsu SY、Kudo M、Chen T、Nakabayashi K、Bhalla A、van der Spek PJ、van Duin M、Hsueh AJ (2001 年 1 月)。「ロイシンリッチリピート含有 G タンパク質結合受容体 (LGR) の 3 つのサブファミリー: LGR6 と LGR7 の同定および LGR7 のシグナル伝達メカニズム」。Mol Endocrinol . 14 (8): 1257–71. doi : 10.1210/me.14.8.1257 . PMID 10935549。
^ ab 「Entrez Gene: LGR6 ロイシンリッチリピート含有 G タンパク質結合受容体 6」。
^ Huang, Phillips Y.; Kandyba, Eve; Jabouille, Arnaud; Sjolund, Jonas; Kumar, Atul; Halliwill, Kyle; McCreery, Melissa; DelRosario, Reyno; Kang, Hio Chung (2017). 「Lgr6 はマウス皮膚扁平上皮癌の幹細胞マーカーである」。Nature Genetics . 49 (11): 1624–1632. doi :10.1038/ng.3957. PMC 5662105. PMID 28945253 .

さらに読む

Bonaldo MF、Lennon G、Soares MB (1997)。「正規化と減算: 遺伝子発見を容易にする 2 つのアプローチ」。Genome Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548。
Takeda S, Kadowaki S, Haga T, et al. (2002). 「ヒトゲノム配列からのGタンパク質共役受容体遺伝子の同定」. FEBS Lett . 520 (1–3): 97–101. doi :10.1016/S0014-5793(02)02775-8. PMID 12044878. S2CID 7116392.
Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
Clark HF、Gurney AL、Abaya E、他 (2003)。「分泌タンパク質発見イニシアチブ (SPDI)、新規ヒト分泌タンパク質および膜貫通タンパク質を同定するための大規模な取り組み: バイオインフォマティクス評価」。Genome Res . 13 (10): 2265–70. doi :10.1101/gr.1293003. PMC 403697. PMID 12975309 。
太田孝文、鈴木勇、西川孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
Gregory SG、 Barlow KF、 McLay KE、他 (2006)。「ヒト染色体 1 の DNA 配列と生物学的注釈」。Nature . 441 ( 7091 ): 315–21。Bibcode :2006Natur.441..315G。doi : 10.1038/nature04727。PMID 16710414。

この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000133067 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000042793 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid10935549-5] Hsu SY、Kudo M、Chen T、Nakabayashi K、Bhalla A、van der Spek PJ、van Duin M、Hsueh AJ (2001 年 1 月)。「ロイシンリッチリピート含有 G タンパク質結合受容体 (LGR) の 3 つのサブファミリー: LGR6 と LGR7 の同定および LGR7 のシグナル伝達メカニズム」。Mol Endocrinol . 14 (8): 1257–71. doi : 10.1210/me.14.8.1257 . PMID 10935549。

[entrez-6] 「Entrez Gene: LGR6 ロイシンリッチリピート含有 G タンパク質結合受容体 6」。

[7] Huang, Phillips Y.; Kandyba, Eve; Jabouille, Arnaud; Sjolund, Jonas; Kumar, Atul; Halliwill, Kyle; McCreery, Melissa; DelRosario, Reyno; Kang, Hio Chung (2017). 「Lgr6 はマウス皮膚扁平上皮癌の幹細胞マーカーである」。Nature Genetics . 49 (11): 1624–1632. doi :10.1038/ng.3957. PMC 5662105. PMID 28945253 .