概要 突然変異は、通常、遺伝子組換え によって、DNAの大きな部分の複製を 伴うことがあります。[ 8 ] [ 9 ] 遺伝子ファミリーに属しており、 配列相同性 によって検出できます。[ 10 ] [ 11 ] [ 12 ]
ここでは、タンパク質ドメインは モジュールとして機能し、それぞれが特定の独立した機能を持ち、これらを混合することで、新しい特性を持つ新しいタンパク質をコードする遺伝子が生成されます。[ 13 ] 人間の目は 光を感知する構造を作るために4つの遺伝子を使用します。3つは錐体細胞 または色覚用 、1つは桿体細胞 または夜間視用です。これら4つはすべて単一の祖先遺伝子から生じました。[ 14 ] 工学的冗長性 が高まることです。これにより、ペアの一方の遺伝子が新しい機能を獲得し、もう一方のコピーが元の機能を果たすことができます。[ 15 ] [ 16 ] 非コードDNA から新しい遺伝子を生成することがあります。[ 17 ] [ 18 ]
染色体 数の変化には、染色体内のDNA断片が切断され、その後再配置されるような、さらに大きな突然変異が関与している可能性がある。例えば、ヒト亜科 では、2つの染色体が融合してヒトの2 番染色体が生成された。この融合は他の類人猿の 系統 では起こらず、これらの別々の染色体を保持している。[ 19 ] 新しい種 に分化することを加速させ、それによってこれらの集団間の遺伝的差異を維持することかもしれない。[ 20 ]
トランスポゾン など、ゲノム内を移動できるDNA配列は、植物や動物の遺伝物質の大部分を占めており、ゲノムの進化において重要な役割を果たしてきた可能性がある。[ 21 ] 例えば、ヒトゲノム には100万個以上のAlu配列 が存在し、これらの配列は現在、遺伝子発現の 調節などの機能を果たすために利用されている。[ 22 ] [ 4 ]
非致死性突然変異は遺伝子プール 内に蓄積し、遺伝的変異の量を増加させる。[ 23 ] 自然選択 によって減少する可能性があるが、他の「より有利な」突然変異は蓄積し、適応的変化をもたらす可能性がある。
プロドリアス・ペルセフォネ 新世の 蝶例えば、蝶は新しい突然変異を持つ 子孫 を生み出すことがある。これらの突然変異の大部分は影響を及ぼさないが、そのうちの1つが蝶の子孫の色を 変え、捕食者に見つけにくく（または見つけやすく）する可能性がある。この色の変化が有利であれば、この蝶が生き残り、子孫を残す可能性が少し高くなり、時間の経過とともに、この突然変異を持つ蝶の数が個体群のより大きな割合を占めるようになる可能性がある。[ 24 ]
中立突然変異は 、個体の適応度 に影響を与えない突然変異と定義されます。これらは遺伝的浮動 により時間とともに頻度が増加する可能性があります。突然変異の圧倒的大多数は生物の適応度に大きな影響を与えないと考えられています。[ 25 ] [ 26 ] 体細胞を除去するための アポトーシス経路 などのメカニズムを持っています。[ 27 ]
有益な突然変異は生殖成功率を向上させる可能性がある。[ 28 ] [ 29 ]
原因 突然変異には4つの種類があります。(1)（1）自然発生的な 突然変異（分子崩壊）、（2）自然発生的なDNA損傷 のエラーを起こしやすい複製バイパスによる突然変異（エラーを起こしやすい損傷乗り越え合成とも呼ばれる）、（3）DNA修復中に導入されるエラー、（4）変異原 によって引き起こされる誘発突然変異。科学者は、科学実験のために、細胞や研究対象生物に意図的に突然変異を導入することがある。 [ 30 ]
2017年の研究では、がんを引き起こす突然変異の66%はランダムであり、29%は環境によるものであり（研究対象集団は69か国に及んだ）、5%は遺伝によるものであると主張した。[ 31 ]
人間は平均して60個の新しい突然変異を子供に伝えるが、父親は年齢に応じてより多くの突然変異を伝え、1年ごとに子供に2つの新しい突然変異が追加される。[ 32 ]
自然突然変異 自然突然変異は、 健康で汚染されていない細胞であっても、ゼロではない確率で発生します。自然発生的な酸化DNA損傷は、ヒトでは1日あたり細胞あたり10,000回、ラット では1日あたり細胞あたり100,000回発生すると推定されています。[ 33 ] [ 34 ]
誘発突然変異 誘発突然変異とは、遺伝子が突然変異原や環境要因に接触した後に生じる変化のことである。
誘発突然変異は、以下の原因によって引き起こされる可能性があります。
かつては突然変異は偶然に起こるか、変異原によって誘発されると考えられていたが、細菌や生命の系統樹全体で突然変異の分子メカニズムが発見されている。S. Rosenberg が述べているように、「これらのメカニズムは、ストレス応答によって一時的に上方制御され、細胞/生物が環境に適応していないとき、つまりストレスを受けたときに活性化され、適応を加速する可能性のある、高度に制御された突然変異の様相を明らかにしている。」[ 43 ] SOS 応答 [ 44 ] [ 45 ] [ 43 ]が含まれる。
タイプの分類
構造への影響により 染色体変異の5つのタイプ 小規模変異の種類 遺伝子の配列はさまざまな方法で変化する可能性があります。[ 46 ] [ 47 ]
大規模な突然変異 染色体 構造の大規模な突然変異には以下のようなものがある。
染色体セグメントの増幅（または遺伝子重複 ）または反復、あるいは染色体の余分な断片の存在、染色体の断片の切断が相同染色体または非相同染色体に付着し、一部の遺伝子が2倍以上の量で存在することになり、すべての染色体領域の複数のコピーが生じ、その領域内に存在する遺伝子の量が増加します。場合によっては、遺伝子の一部のみが重複し、元の遺伝子よりも短い遺伝子が生成されます。また、重複した遺伝子（または遺伝子の一部）がコピーされ、元のDNA配列の直後に挿入される（タンデム重複）ことで、より長い遺伝子が生成されます。長いレベルでは、このような乗法現象が遺伝子の長さの分布を支配します。[ 48 ] 倍数性とは 、染色体セット全体が重複することであり、結果として別の繁殖集団や種分化が 生じる可能性がある。染色体の大きな領域の欠失により、その領域内の遺伝子が失われる。 変異によって、以前は別々だったDNA断片が並置され、別々の遺伝子が結合して機能的に異なる融合遺伝子 （例：bcr-abl ）が形成される可能性がある。 染色体 構造の大規模な変化は染色体再編成 と呼ばれ、適応度の低下だけでなく、孤立した近親交配集団における種分化にもつながる可能性がある。これには以下が含まれる。 染色体転座 ：相同でない染色体間での遺伝子断片の交換。染色体逆位 ：染色体の一部が逆向きになること。非相同染色体交叉 。 間質性欠失：単一の染色体からDNA断片が除去される染色体内部の欠失であり、それによってこれまで離れていた遺伝子が近接するようになる。例えば、脳腫瘍の一種であるヒト星状細胞腫から分離された細胞では、 膠芽腫 融合遺伝子（FIG）と受容体型チロシンキナーゼ（ROS）の間の配列を除去する染色体欠失が認められ、融合タンパク質（FIG-ROS）が生成されていた。この異常なFIG-ROS融合タンパク質は、恒常的に活性なキナーゼ活性を有し、発癌性形質 転換（正常細胞から癌細胞への形質転換）を引き起こす。 ヘテロ接合性の喪失 ：以前は2つの異なる対立遺伝子を持っていた生物において、欠失または遺伝子組換えによって一方の対立遺伝子が失われること。
小規模な突然変異 小規模変異は、遺伝子の1つまたは少数のヌクレオチドに影響を与えます。（単一のヌクレオチドのみが影響を受ける場合は、点変異 と呼ばれます。）小規模変異には以下が含まれます。
挿入とは 、DNAに1つ以上の余分なヌクレオチドが挿入される現象です。通常、転移因子 、または反復配列の複製時のエラーによって引き起こされます。遺伝子のコード領域への挿入は、 mRNA のスプライシングを 変化させる（スプライス部位変異）か、 読み枠 のずれを引き起こす（フレームシフト ）可能性があり、いずれも遺伝子産物を 大きく変化させる可能性があります。挿入は、転移因子を除去することで元に戻すことができます。欠失とは 、DNAから1つ以上のヌクレオチドが除去される変異のことです。挿入と同様に、これらの変異も遺伝子の読み枠を変化させる可能性があります。一般的に、欠失は不可逆的です。理論的には、挿入によって全く同じ配列が復元される可能性はありますが、任意の 場所における非常に短い欠失（例えば1～2塩基）を元に戻すことができる転移因子は、存在しそうにないか、あるいは全く存在しません。置換突然変異は 、化学物質やDNA複製機能不全によって引き起こされることが多く、1つのヌクレオチドを別のヌクレオチドと交換します。[ 49 ] [ 50 ] ピリミジンをピリミジン に交換する遷移（C ↔ T）です。遷移は、亜硝酸、塩基ミスペアリング、またはBrdUなどの変異原性塩基アナログによって引き起こされる可能性があります。あまり一般的ではないのは転位で、プリンをピリミジンに交換するか、ピリミジンをプリンに交換します（C/T ↔ A/G）。転位の例としては、アデニン （A）がシトシン（C）に変換されることが挙げられます。点突然変異は、DNAの単一塩基対または遺伝子内の他の小さな塩基対の修飾です。点突然変異は、ヌクレオチドが元の状態に戻る別の点突然変異（真の復帰）またはセカンドサイト復帰（他の場所で相補的な突然変異が起こり、遺伝子機能が回復する）によって元に戻すことができます。後述するように、 遺伝子のタンパク質コード領域内で発生する点突然変異は、 同義置換 または非同義置換 に分類され、後者はさらにミスセンス 変異またはナンセンス変異 に分類されます。
タンパク質配列への影響により 真核 生物のタンパク質コード遺伝子の構造。タンパク質コード領域 （赤色）の変異は、アミノ酸配列の変化を引き起こす可能性があります。遺伝子の他の領域の変異は、多様な影響を及ぼす可能性があります。調節配列 （黄色と青色）内の変化は、遺伝子発現の 転写 および翻訳 調節に影響を与える可能性があります。タンパク質への影響に基づいて分類された点突然変異 アミノ酸 の遺伝暗号 の標準表における疾患原因変異の選択[ 51 ] 突然変異がタンパク質配列に及ぼす影響は、ゲノムのどの部分で突然変異が起こるか、特にそれがコード領域 か非コード領域 かによって部分的に左右される。プロモーター、エンハンサー、サイレンサーなどの遺伝子の非コード調節配列 における突然変異は、遺伝子発現レベルを変化させる可能性があるが、タンパク質配列を変化させる可能性は低い。イントロン 内および既知の生物学的機能を持たない領域（例えば、偽遺伝子 、レトロトランスポゾン ）における突然変異は、一般的に中立 であり、表現型に影響を与えない。ただし、イントロンの突然変異がmRNAスプライシングに影響を与える場合は、タンパク質産物を変化させる可能性がある。
ゲノムのコード領域で発生する突然変異は、タンパク質産物を変化させる可能性が高く、アミノ酸配列への影響によって分類することができる。
フレームシフト変異は 、DNA配列から3で割り切れない数のヌクレオチドが挿入または欠失することによって生じます。コドンによる遺伝子発現は3つ組の性質を持つため、挿入または欠失によって読み枠、つまりコドンのグループ化が破壊され、元のものとは全く異なる翻訳が生じる可能性があります。 [ 52 ] 終止コドン （xは次のヌクレオチドを表す）がコードされます。）対照的に、3で割り切れる挿入または欠失は、インフレーム変異 と呼ばれます。 点置換突然変異は、単一のヌクレオチドの変化をもたらし、同義置換または非同義置換のいずれかである。 同義置換とは、 あるコドンを同じアミノ酸をコードする別のコドンに置き換えることで、生成されるアミノ酸配列を変化させない変異のことです。同義変異は、遺伝暗号 の退化 性によって生じます。この変異が表現型に影響を与えない場合、それはサイレント変異 と呼ばれますが、すべての同義置換がサイレント変異であるとは限りません。（イントロンなど、コード領域外のヌクレオチドにもサイレント変異が生じる可能性があります。これは、コード領域ほど正確なヌクレオチド配列が重要ではないためですが、これらは同義置換とはみなされません。） 非同義置換とは、 あるコドンを別のアミノ酸をコードする別のコドンに置き換えることで、生成されるアミノ酸配列が変化する現象である。非同義置換は、ナンセンス変異とミスセンス変異に分類される。 ミスセンス変異は ヌクレオチドを変化させ、異なるアミノ酸の置換を引き起こします。これにより、結果として生じるタンパク質が機能しなくなる可能性があります。このような変異は、表皮水疱症 、鎌状赤血球症 、SOD1 を介したALS などの疾患の原因となります。[ 53 ] リジン と化学的に類似した分子であるアルギニン をコードします。後者の場合、変異は表現型にほとんどまたは全く影響を与えず、したがって中立 です。 ナンセンス変異 とは、DNA配列における点突然変異であり、転写されたmRNAに早期終止コドン（ナンセンスコドン）が生じ、場合によってはタンパク質が短縮され、機能不全となることが多い。この種の変異は 、先天性副腎過形成症 など、さまざまな疾患と関連付けられている。（終止コドン を参照。）
機能への影響により 突然変異は、変異したタンパク質とその直接の相互作用因子との間の機能の正確さが変化すると、機能への影響を伴う突然変異となる。相互作用因子は、他のタンパク質、分子、核酸などである。機能への影響を伴う突然変異のカテゴリーに分類される突然変異は多数あるが、変化の特異性に応じて、以下に挙げる突然変異が発生する。[ 54 ]
機能喪失変異（不活性化変異とも呼ばれる）は、遺伝子産物の機能が低下したり、全く機能しなくなったり（部分的または完全に不活性化される）結果となる。対立遺伝子の機能が完全に失われている場合（ヌル対立遺伝子 ）、ミュラーの形態分類では 無形変異 または無形変異と呼ばれることが多い。このような変異に関連する表現型は、ほとんどの場合劣性で ある。例外は、生物が半数体で ある場合、または正常な遺伝子産物の減少した用量が正常な表現型に十分でない場合（これはハプロ不全 と呼ばれる）である。機能喪失変異によって引き起こされる疾患の例としては、ギテルマン症候群 や嚢胞性線維症 などがある。[ 55 ] 機能獲得型変異（活性化変異とも呼ばれる）は、遺伝子産物を変化させ、その効果を強めたり（活性化の増強）、あるいは異なる異常な機能に取って代わったりします。新しい対立遺伝子が生成されると、元の対立遺伝子と新しい対立遺伝子の両方を持つヘテロ接合体は新しい対立遺伝子を発現します。遺伝学的には、これは変異を 優性 表現型と定義します。ミュラーの形態分類のいくつかは、機能獲得に対応しており、ハイパーモルフ（遺伝子発現の増加）やネオモルフ（新しい機能）などが含まれます。 優性阻害変異（抗形態変異とも呼ばれる）は、野生型アレルと拮抗的に作用する遺伝子産物の変化をもたらします。これらの変異は通常、分子機能の変化（多くの場合不活性）を引き起こし、優性または半優性の 表現型を特徴とします。ヒトでは、優性阻害変異は癌に関与していることが示されています（例：p53 、ATM 、CEBPA 、PPARγ 遺伝子の変異）。マルファン症候群は、 細胞外マトリックス の糖タンパク質 成分であるフィブリリン-1をコードする15番染色体 上のFBN1 遺伝子の変異によって引き起こされます。マルファン症候群もまた、優性阻害変異とハプロ不全の例です。 致死突然変異は、発生段階で発生すると生物の急速な死をもたらし、成熟した生物の平均寿命を著しく短縮させる。優性致死突然変異によって引き起こされる疾患の例として、ハンチントン病 が挙げられる。 ヌル変異（無形変異とも呼ばれる）は、遺伝子の機能を完全に阻害する機能喪失型変異の一種である。この変異は表現型レベルでの完全な機能喪失を引き起こし、遺伝子産物も全く生成されない。アトピー性湿疹 や皮膚炎症候群は、フィラグリンを活性化する遺伝子のヌル変異によって引き起こされる一般的な疾患である。 サプレッサー変異は、二重変異を正常に見せるタイプの変異です。サプレッサー変異では、別の変異の表現型活性が完全に抑制されるため、二重変異が正常に見えるようになります。サプレッサー変異には、遺伝子内変異 と遺伝子外変異の2種類があります。遺伝子内変異は、最初の変異が発生した遺伝子で発生し、遺伝子外変異は、最初の変異の産物と相互作用する遺伝子で発生します。このタイプの変異によって引き起こされる一般的な疾患は、アルツハイマー病 です。[ 56 ] ネオモルフィック変異は機能獲得型変異の一部であり、新しいタンパク質産物の合成制御を特徴とする。新しく合成された遺伝子は通常、新しい遺伝子発現または分子機能を持つ。ネオモルフィック変異の結果、変異が生じた遺伝子の機能は完全に変化する。[ 57 ] 逆突然変異または復帰とは、元の配列、ひいては元の表現型を回復させる点突然変異のことである。[ 58 ]
遺伝学 では、突然変異を以下のように分類することが有用な場合がある。有害 中立 ）：
有害な、または有害な 必須遺伝子 の突然変異の多くは有害であるが、すべてが有害というわけではない（必須タンパク質のアミノ酸配列を変化させない突然変異は、ほとんどの場合無害である）。 有益な、あるいは有利な突然変異は、生物の適応度を高める。例えば、細菌における抗生物質耐性 につながる突然変異が挙げられる（これは細菌にとっては有益だが、通常は人間にとってはそうではない）。中立突然変異は、生物に有害または有益な影響を与えません。このような突然変異は一定の速度で発生し、分子時計 の基礎を形成します。分子進化の中立説 では、中立突然変異は分子レベルでのほとんどの変異の基礎となる遺伝的浮動を提供します。動物や植物では、ゲノムの大部分が非コード領域であるか、明らかな機能を持たない反復配列（「ジャンクDNA 」）で構成されているため、ほとんどの突然変異は中立です。 [ 59 ] 大規模な定量的突然変異スクリーニング では、数百万の突然変異がテストされ、必然的に、より多くの突然変異が有害な影響を及ぼすことが判明するが、同時に、有益な突然変異も必ず多数見つかる。たとえば、大腸菌 [ 60 ] 欠失は 遺伝子全体の除去を伴うため、点突然変異の影響はほとんどの場合はるかに小さい。肺炎連鎖 トランスポゾン 挿入で、挿入変異体の76%が中立と分類され、16%は適応度が著しく低下したが、6%は有利であった。[ 61 ]
この分類は明らかに相対的で、やや人為的です。有害な突然変異は、状況が変わるとすぐに有益な突然変異に変わる可能性があります。また、有害/有益から中立へのグラデーションがあり、多くの突然変異は小さく、ほとんど無視できる影響しか与えませんが、特定の条件下では重要になります。また、多くの形質は数百の遺伝子（または遺伝子座）によって決定されるため、各遺伝子座の影響はごくわずかです。たとえば、人間の身長は数百の遺伝子変異（「突然変異」）によって決定されますが、栄養 の影響を除けば、それぞれの遺伝子変異が身長に与える影響はごくわずかです[ 62 ]
突然変異 実験と分子配列データに適用された理論モデルを使用して、適応度効果の分布 (DFE) を推測する試みが行われてきました。 DFE は、異なるタイプの突然変異 (つまり、非常に有害、ほぼ中立、または有利) の相対的な存在量を決定するために使用され、遺伝的変異の維持 [ 63 ] ゲノムの劣化 の速度[ 64 ] 近親交配 とは対照的な異系交配による 有性生殖 の維持[ 65 ] 、および性別 と遺伝的組換え の進化[ 66 ] [ 67 ] 進化ダイナミクスの 予測において重要な役割を果たします。[ 68 ] [ 69 ]
水疱性口内炎ウイルス における突然変異の適応度効果分布（DFE）。この実験では、部位特異的変異誘発によりウイルスにランダムな突然変異を導入し、各変異体の適応度 を祖先型と比較した。適応度がゼロ、1未満、1、1より大きい場合は、それぞれ突然変異が致死的、有害、中立、有利であることを示している。[ 70 ] この図は、機能喪失型変異、機能転換型変異、機能獲得型変異、および機能保存型変異の簡略化された図を示しています。 DNA シーケンシング 技術の急速な発展により、膨大な量の DNA 配列データが利用可能になり、将来的にはさらに多くのデータが利用可能になる見込みです。DNA 配列データから DFE を推定するためのさまざまな方法が開発されています。[ 77 ] [ 78 ] [ 79 ] [ 80 ] [ 23 ] 適応度効果の分布に関する初期の理論的研究の 1 つは、影響力のある理論集団遺伝学者である 木村元夫 によって行われました。彼の分子進化 の中立理論は、ほとんどの新規突然変異は非常に有害であり、中立なのはごく一部であると提唱しています。[ 25 ] [ 81 ] 二峰性モデルでは、非常に有害な突然変異と中立突然変異を中心としたモードが提案されました。 [ 82 ] 水疱性口内炎ウイルス のランダム突然変異の DFE に関する研究です。[ 70 ] [ 75 ]
有利な突然変異は比較的少ないものの、有利な突然変異は進化の変化において重要な役割を果たします。[ 83 ] John H. Gillespie [ 84 ] H. Allen Orr [ 85 ] 指数関数的 であるべきだと提案しており、これは一般的に、少なくとも選択圧の強い有利な突然変異については、実験的研究によって裏付けられています。[ 86 ] [ 87 ] [ 88 ]
一般的に、変異の大部分は中立または有害であり、有利な変異はまれであると認められていますが、変異の種類の割合は種によって異なります。これは、次の 2 つの重要な点を示しています。1 つ目は、有効集団サイズ への依存により、実質的に中立な変異の割合が種間で異なる可能性が高いこと、2 つ目は、有害変異の平均効果は種間で大きく異なることです。[ 23 ] 非コーディング領域 でも異なり、非コーディング DNA の DFE には、より弱い選択を受けた変異が含まれています。[ 23 ]
相続により ある突然変異によって、このコケバラ は様々な色の花を咲かせるようになった。これは体細胞突然変異であり、 生殖細胞系列 にも受け継がれる可能性がある。 生殖細胞 が専用の多細胞生物 では、突然変異は生殖細胞を介して子孫に受け継がれる生殖細胞系列突然変異と、専用の生殖グループ以外の細胞に関与し、通常は子孫に伝達されない体細胞 突然変異 （獲得突然変異とも呼ばれる）[ 89 ]
二倍体生物（例えばヒト）は、各遺伝子を2コピーずつ（父方由来と母方由来の対立遺伝子）持っている。各染色体における突然変異の発生に基づいて、突然変異を3つのタイプに分類することができる。野生型 、すなわちホモ接合型の非突然変異生物とは、どちらの対立遺伝子にも突然変異がない生物のことである。
ヘテロ接合型突然変異とは、一方の対立遺伝子のみに生じる突然変異のことである。 ホモ接合型突然変異とは、父方由来の対立遺伝子と母方由来の対立遺伝子の両方に同一の突然変異が存在する状態を指す。 複合ヘテロ接合 変異または遺伝子複合体は、父方および母方の対立遺伝子における2つの異なる変異から構成される。[ 90 ]
生殖細胞系列の突然変異 個体の生殖細胞における生殖細胞系列突然変異は、子孫に体質突然変異 、すなわちすべての細胞に存在する突然変異を引き起こします。体質突然変異は、受精 後すぐに発生することもあれば、親の以前の体質突然変異から継続することもあります。[ 91 ]
生殖細胞を生成する専用の生殖細胞系を持つ動物では、生殖細胞系突然変異と体細胞突然変異の区別は重要である。しかし、専用の生殖細胞系を持たない植物における突然変異の影響を理解する上では、この区別はほとんど意味を持たない。また、出芽 などの無性 生殖を行う動物では、娘個体を生み出す細胞がその個体の生殖細胞系も生み出すため、この区別は曖昧になる。
両親のどちらからも遺伝していない新たな生殖細胞系列の突然変異は、de novo
特別クラス 条件付き突然変異 とは、特定の「許容」環境条件下では野生型（または軽度）表現型を示し、特定の「制限」条件下では変異表現型を示す突然変異のことである。例えば、温度感受性突然変異は高温（制限条件）では細胞死を引き起こすが、低温（許容条件）では有害な影響を及ぼさない可能性がある。[ 95 ] [ 96 ] 温度 [ 97 ] 、特定の化学物質 [ 98 ] [ 98 ] 、またはゲノム の他の部分の突然変異[ 96 ] 生体内 [ 99 ] [ 98 ] 特定の条件下で活性化されるプロモーター と組み合わせて使用されるCre-Lox 組換え などの DNA リコンビナーゼ システムを使用すると、条件付き突然変異を生成できます。デュアル リコンビナーゼ技術を使用すると、複数の遺伝子の同時突然変異の結果として現れる疾患を研究するために、複数の条件付き突然変異を誘導できます。[ 98 ] インテインが 特定されており、これにより不適切なタンパク質合成が起こり、他の温度では機能喪失突然変異が発生します。[ 100 ] [ 97 ] 複製タイミングに関わる量的形質遺伝子座は、
命名法 変異をそのように分類するには、「正常」な配列を「正常」または「健康」な生物（「変異体」または「病気」の生物とは対照的に）のDNAから取得し、それを特定して報告する必要があります。理想的には、ヌクレオチドごとの直接比較のために公開し、標準 またはいわゆる「コンセンサス」配列を確立する責任を負う科学コミュニティまたは専門の遺伝学者と生物学者 のグループによって合意されるべきです。このステップには膨大な科学的努力が必要です。コンセンサス配列がわかれば、ゲノム内の変異を特定し、記述し、分類することができます。ヒトゲノム変異学会（HGVS）の委員会は、標準的なヒト配列変異命名法を開発しました[ 101 ] 。これは、研究者やDNA診断 センターが明確な変異記述を作成するために使用する必要があります。原則として、この命名法は他の生物の変異を記述するためにも使用できます。この命名法は、突然変異の種類と塩基またはアミノ酸の変化を特定するものです。
ヌクレオチド置換（例：76A>T） – 数字は5'末端からのヌクレオチドの位置を示し、最初の文字は野生型ヌクレオチド、2番目の文字は野生型ヌクレオチドを置換したヌクレオチドを表します。この例では、76番目の位置のアデニンがチミンに置換されています。 ゲノムDNA 、ミトコンドリアDNA 、RNA における突然変異を区別する必要がある場合は、簡単な表記法が用いられます。例えば、ヌクレオチド配列の100番目の塩基がGからCに突然変異した場合、ゲノムDNAで突然変異が起きた場合はg.100G>C、ミトコンドリアDNAで突然変異が起きた場合はm.100G>C、RNAで突然変異が起きた場合はr.100g>cと表記されます。なお、RNAにおける突然変異の場合、ヌクレオチドコードは小文字で表記されます。 アミノ酸置換（例：D111E） – 最初の文字は野生型アミノ酸の1文字コード、数字は N末端 からのアミノ酸の位置、2番目の文字は変異したアミノ酸の1文字コードです。ナンセンス変異は、2番目のアミノ酸にXを付けて表します（例：D111X）。 アミノ酸欠失（例：ΔF508） – ギリシャ文字のΔ（デルタ ）は欠失を示します。この文字は野生型に存在するアミノ酸を表し、数字は野生型と同様に存在する場合のアミノ酸のN末端からの位置を表します。
突然変異率 突然変異率は 種によって大きく異なり、突然変異を一般的に決定づける進化的な力については、現在も研究が続けられている。
ヒト では、突然変異率は 1世代あたりゲノムあたり約50～90個の新規 突然変異であり、つまり、各ヒトは両親には存在しなかった約50～90個の新規突然変異を蓄積する。この数は、数千組のヒトトリオ（両親2人と少なくとも1人の子供）のゲノム配列を解析する ことによって確立された。[ 102 ]
RNAウイルス のゲノムは、DNAではなくRNA を基盤としている。RNAウイルスのゲノムは、DNAと同様に二本鎖の場合もあれば、一本鎖の場合もある。これらのウイルスの中には（例えば一本鎖のヒト免疫不全ウイルス など）、複製が急速に進み、ゲノムの正確性をチェックする仕組みがないものがある。そのため、エラーが発生しやすく、しばしば突然変異が生じる。
生殖細胞系列か体細胞系列かを問わず、新規突然変異の発生率は生物種によって異なる。[ 103 ] [ 104 ] 遺伝的変異 のまれな形態に分類される。[ 105 ] 配偶子形成 のDNA複製過程におけるエラーの頻度、特に精子細胞の急速な産生で増幅されるエラーの頻度は、DNA修復機構によって制御されない新規突然変異の複製機会を増やす可能性がある。[ 106 ] この主張は、急速な精子形成 における突然変異の確率の増加という観察された効果と、修復機構の効率を制限する細胞分裂間の短い期間を組み合わせたものです。[ 107 ] 皮膚がんの発生は、細胞および皮膚ゲノムに突然変異を引き起こす 紫外線 への過剰曝露によって誘発されます。[ 108 ]
突然変異のランダム性 突然変異は、その結果（確率の観点から）に関して（完全に）「ランダム」であるという広く信じられている仮定がある。しかし、突然変異の頻度はゲノムの領域によって異なり、このようなDNA修復 と突然変異の偏りは さまざまな要因と関連していることから、これは誤りであることが示された。例えば、モンローらは、研究対象とした植物（シロイヌナズナ ）において、より重要な遺伝子は重要でない遺伝子よりも突然変異の頻度が低いことを実証した。彼らは、突然変異は「植物に利益をもたらす形で非ランダムである」ことを実証した。[ 109 ] [ 110 ] 変動テスト やレプリカプレーティング など）は、適応度全体ではなく、外部の選択的制約に関して突然変異がランダムであるという弱い主張のみを支持することが示された。[ 111 ]
病気の原因 DNAのコード領域の突然変異によって引き起こされるDNAの変化は、タンパク質配列のエラーを引き起こし、部分的にまたは完全に機能しないタンパク質が生じる可能性があります。各細胞は、正しく機能するために、適切な場所で適切なタイミングで機能する何千ものタンパク質に依存しています。突然変異が体内で重要な役割を果たすタンパク質を変化させると、医学的状態が発生する可能性があります。ショウジョウバエ の異なる種間の遺伝子の比較に関するある研究では、突然変異がタンパク質を変化させる場合、その突然変異はおそらく有害であり、アミノ酸多型の約70%が有害な影響を持ち、残りは中立またはわずかに有益であると示唆されています。[ 6 ] [ 112 ]
遺伝性疾患 生殖細胞 に突然変異が存在する場合、その突然変異を全ての細胞に持つ子孫が生まれる可能性があります。これは遺伝性疾患の場合に当てはまります。特に、生殖細胞内のDNA修復遺伝子に突然変異がある場合、そのような生殖細胞系列の突然変異を持つ人は、がんのリスクが高まる可能性があります。このような生殖細胞系列の突然変異34例のリストは、「DNA修復欠損症」という 記事に記載されています。その一例として、 OCA1 OCA2 白皮症 があります。この疾患を持つ人は、多くの種類のがんやその他の疾患にかかりやすく、視力障害も伴います。
DNA損傷はDNA複製時にエラーを引き起こし、この複製エラーは遺伝子変異を招き、ひいては遺伝性疾患を引き起こす可能性があります。DNA損傷は細胞のDNA修復システムによって修復されます。各細胞には、酵素がDNAの損傷を認識して修復するための複数の経路が存在します。DNAは様々な方法で損傷を受ける可能性があるため、DNA修復プロセスは体が病気から身を守るための重要な手段です。DNA損傷によって突然変異が生じると、その突然変異は修復できません。
発がんにおける役割 一方、突然変異は生物の体細胞で発生する可能性がある。このような突然変異は、同じ生物内のその細胞のすべての子孫に存在する。体細胞の世代を超えて特定の突然変異が蓄積することは、正常細胞から癌細胞への悪性形質転換 の原因の一部である。[ 113 ]
ヘテロ接合性の機能喪失変異（遺伝子の正常なコピーが1つと変異したコピーが1つ）を持つ細胞は、正常なコピーが自然に体細胞変異するまで、変異していないコピーで正常に機能する可能性がある。このような変異は生物で頻繁に起こるが、その頻度を測定することは難しい。この頻度を測定することは、人々が癌を発症する頻度を予測する上で重要である。[ 114 ]
点突然変異は、DNA複製中に起こる自然突然変異によって生じる可能性があります。突然変異の発生率は、変異原によって増加することがあります。変異原には、紫外線、 X線 、極度の熱などの物理的なもの、または塩基対の位置をずらしたり、DNAのらせん構造を破壊したりする分子などの化学的なものがあります。がんに関連する変異原は、がんやその予防法を解明するために研究されることがよくあります。
進化における役割 新規突然変異は、生物集団に新たな遺伝的特性をもたらすことで、進化変化の複合的な力において重要な役割を果たします。しかし、突然変異によって生じる遺伝的多様性の重みは、一般的に「弱い」進化力とみなされることが多いです。[ 104 ] 自然選択 、遺伝子流動、遺伝的浮動 によってもたらされる要因に依存します。たとえば、突然変異の流入が多い（突然変異率が高い）小さな集団は、遺伝的変異の増加につながり、将来の世代で種分化を引き起こしやすいです。対照的に、大きな集団では、新たに導入された突然変異形質の影響は小さくなる傾向があります。このような状況では、選択力によって、多くの場合有害な突然変異対立遺伝子の頻度が時間とともに減少します。[ 121 ]
代償された病原性偏差 補償された病原性変異とは、ある種では病原性を示すが、別の種では機能的に同等のタンパク質では野生型残基であるタンパク質配列中のアミノ酸残基を指します。そのアミノ酸残基は最初の種では病原性を示しますが、2番目の種では1つ以上のアミノ酸置換によって病原性が補償されるため、病原性を示しません。補償変異は、同じタンパク質内、または相互作用する別のタンパク質内で発生する可能性があります。[ 122 ]
固定化によって集団の適応度が低下するため、固定化された有害突然変異の文脈で補償突然変異の影響を理解することが重要である。[ 123 ] [ 124 ] [ 124 ] [ 123 ] [ 123 ]
RNAにおける代償性変異 RNA分子の機能はその構造に依存するため、[ 125 ] [ 126 ] [ 127 ]
代償作用の進化メカニズム 代償性突然変異は、ある突然変異の表現型効果が他の遺伝子座の突然変異に依存するという遺伝現象エピスタシスによって説明できます。エピスタシスはもともと異なる遺伝子間の相互作用の文脈で考えられていましたが、最近では遺伝子内エピスタシスも研究されています。[ 128 ] [ 122 ] 。つまり、個体は適応度の低い谷間を通って、ある適応度のピークから別の適応度のピークへと移動することができる。[ 128 ]
DePristo ら 2005 は、代償性病原性変異 (CPD) の動態を説明する 2 つのモデルを概説した。[ 129 ] [ 129 ] [ 129 ] [ 129 ] [ 130 ] [ 130 ]
代償性突然変異の実験的証拠
細菌を用いた実験 Lunzer ら[ 131 ] 緑膿菌の IMDH の野生型残基である大腸菌 IMDH の 168 個のアミノ酸を置換しました。彼らは、これらの置換の 3 分の 1 以上が大腸菌の 遺伝的背景で IMDH の酵素活性を損なうことを発見しました。これは、同一のアミノ酸状態が遺伝的背景に応じて異なる表現型状態をもたらす可能性があることを示しました。Corrigan ら 2011 は、補償変異により黄色ブドウ球菌が リポテイコ酸が存在しない場合でも正常に増殖できることを示しました。[ 132 ] [ 132 ]
研究によると、細菌は適応度を妨げない、またはほとんど影響を与えない代償変異によって薬剤耐性を獲得できることが示されています。[ 133 ] 結核 菌株は適応度が低下しているが、この病原性細菌の薬剤耐性臨床株は適応度が低下していないことがわかりました。[ 134 ] [ 133 ] [ 133 ] 同様の研究では、リファンピシン耐性大腸菌 の代償変異に関連する細菌の適応度を調査しました。[ 135 ] [ 135 ]
ウイルスを用いた実験 Gong ら[ 136 ] は [ 137 ] [ 122 ] [ 137 ] [ 138 ] Fisher の 適応進化の幾何学的モデルをテストしました。[ 139 ] 彼らの結果は、バクテリオ ファージ φ6 の適応度が急速に低下し、小さなステップで回復することを示しました。[ 139 ] [ 140 ] [ 140 ] [ 141 ] [ 135 ] [ 134 ]
人類の進化と疾患への応用 ヒトゲノムでは、新規突然変異の頻度と特徴が、我々の進化における重要な文脈因子として研究されてきた。ヒト参照ゲノムと比較すると、典型的なヒトゲノムは約410万から500万の遺伝子座で異なり、この遺伝的多様性の大部分は人口の約0.5%で共有されている。[ 142 ] [ 143 ] 次世代シーケンシング （NGS）の最近の進歩により、ゲノム内のあらゆる種類の新規突然変異を直接研究できるようになり、その検出は希少および一般的な遺伝性疾患の原因に対する洞察を大きく提供する。現在、ヒト生殖細胞系列SNV変異率の平均値の最良推定値は1.18 x 10^-8であり、1世代あたり約78個の新規変異が発生している。親と子の全ゲノムシーケンス解析を行うことで、世代間の変異率を比較し、特定の遺伝性疾患の起源の可能性を絞り込むことができる。[ 144 ]
参考文献 ↑ 「突然変異｜Scitableで科学を学ぶ」。Nature。Nature Education 。 2018年9 月 24日 取得 。 ↑ Sfeir A、Symington LS (2015 年 11 月)。 「 マイクロホモロジーを介した末端結合：バックアップ生存メカニズムか専用経路か？」 。 Trends in Biochemical Sciences。40 ( 11 ) : 701–714。doi : 10.1016/ j.tibs.2015.08.006。PMC 4638128。PMID 26439531 。 ↑ Bertram JS (2000 年 12月 ). 「がんの分子生物学」. Molecular Aspects of Medicine . 21 (6): 167–223 . doi : 10.1016/S0098-2997(00)00007-8 . PMID 11173079. S2CID 24155688 . 1 2 Aminetzach YT、Macpherson JM、Petrov DA (2005 年 7 月)。「ショウジョウバエにおける転移を介した適応的遺伝子切断による殺虫剤 耐性 」 。Science。309 ( 5735 ) : 764–7。Bibcode : 2005Sci ... 309..764A。doi : 10.1126 / science.11 12699。PMID 16051794。S2CID 11640993 。 ↑ Burrus V、Waldor MK (2004 年 6 月)。 「 統合および接合要素による細菌ゲノムの形成」 。Research in Microbiology。155 ( 5 ) : 376–86。doi : 10.1016/j.resmic.2004.01.012。PMID 15207870 。 1 2 Sawyer SA、Parsch J、Zhang Z、Hartl DL (2007 年 4 月)。 「ショウジョウバエ における ほぼ 中立なアミノ酸置換における正の選択の普及率」 。 米国 科学 アカデミー 紀要 。104 ( 16 ): 6504–10。Bibcode : 2007PNAS..104.6504S。doi : 10.1073 / pnas.0701572104。PMC 1871816。PMID 17409186 。 ↑ Bernstein H 、Byerly HC、Hopf FA、Michod RE（1985年9 月 ）。「遺伝子損傷、突然変異、および性の 進化」。 サイエンス 。229 （ 4719 ）： 1277–81。Bibcode ： 1985Sci...229.1277B。doi ： 10.1126 / science.3898363。PMID 3898363 。 ↑ Hastings PJ、 Lupski JR 、Rosenberg SM、Ira G (2009年8月)。 「遺伝子コピー数の変化のメカニズム」 。Nature Reviews . Genetics . 10 (8): 551–64 . doi : 10.1038/nrg2593 . PMC 2864001. PMID 19597530 . ↑ Carroll SB 、 Grenier JK、Weatherbee SD (2005)。DNA から多様性へ：分子遺伝学と動物デザインの進化 （第2 版）。マサチューセッツ州モールデン： Blackwell Publishing。ISBN 978-1-4051-1950-4 . LCCN 2003027991 . OCLC 53972564 . ↑ Harrison PM、 Gerstein M (2002 年 5 月)。 「ゲノム を 何世紀にもわたって研究する: タンパク質ファミリー、偽遺伝子、およびプロテオームの進化」。Journal of Molecular Biology。318 ( 5 ): 1155–74。Bibcode : 2002JMBio.318.1155H。doi : 10.1016/S0022-2836(02 ) 00109-2。PMID 12083509 。 ↑ Orengo CA 、 Thornton JM ( 2005 年7 月)。「 タンパク質 ファミリーとその進化―構造 的 観点」。Annual Review of Biochemistry。74 ( 1): 867–900。Bibcode : 2005ARBio..74..867O。doi : 10.1146/annurev.biochem.74.082803.133029。PMID 15954844 。 ↑ Long M、Betrán E、Thornton K、Wang W (2003 年 11 月)。「新しい遺伝子の起源: 若き者と老いた者からの垣間見」。Nature Reviews. Genetics . 4 (11): 865–75 . doi : 10.1038 / nrg1204 . PMID 14634634. S2CID 33999892 . ↑ Wang M、 Caetano-Anollés G ( 2009年 1 月 )。 「プロテオームにおけるドメイン組織の進化メカニズムとタンパク質世界におけるモジュール 性 の 台頭」 。Structure。17 ( 1): 66–78。doi : 10.1016/ j.str.2008.11.008。PMID 19141283 。 ↑ Bowmaker JK (1998 年 5 月) 「 脊椎動物における色覚の進化」 Eye 12 ( Pt 3b): 541–7 . doi : 10.1038/eye.1998.143 . PMID 9775215 . S2CID 12851209 . ↑ Gregory TR 、 Hebert PD （1999 年 4月）。 「DNA含有量 の 変調：近因と究極的結果」 。Genome Research。9 （ 4 ） ： 317–24。doi ： 10.1101 / gr.9.4.317。PMID 10207154。S2CID 16791399 。 ↑ Hurles M (2004年7月) 「遺伝子重複：スペアパーツのゲノム取引」 PLOS Biology 2 ( 7) E206. doi : 10.1371/journal.pbio.0020206 . PMC 449868 . PMID 15252449 . ↑ Liu N, Okamura K, Tyler DM, Phillips MD, Chung WJ, Lai EC (2008 年 10 月). "動物マイクロ RNA 遺伝子の進化と機能的多様化" . Cell Research . 18 (10): 985–96 . doi : 10.1038/cr.2008.278 . PMC 2712117 . PMID 18711447 . ↑ Siepel A (2009年10月) 「ダーウィンの錬金術：非コードDNAからのヒト遺伝子」 Genome Research 19 ( 10): 1693–5 . doi : 10.1101/gr.098376.109 . PMC 2765273 . PMID 19797681 . ↑ Zhang J 、Wang X 、Podlaha O（2004年5 月 ）。 「ヒトとチンパンジー の染色体種 分化 仮説の検証」 。Genome Research。14 （ 5 ）： 845–51。doi ： 10.1101/ gr.1891104。PMC 479111。PMID 15123584 。 ↑ Ayala FJ 、Coluzzi M（2005年5 月 ）。 「染色体の種分化 ：ヒト 、 ショウジョウバエ、蚊」 。 米国 科学アカデミー紀要 。102 （ Suppl 1） ： 6535–42。Bibcode ： 2005PNAS..102.6535A。doi ： 10.1073 / pnas.0501847102。PMC 1131864。PMID 15851677 。 ↑ Hurst GD、Werren JH (2001 年 8 月) 「真核生物の進化における利己的な遺伝要素の役割」 Nature Reviews Genetics . 2 (8): 597– 606. doi : 10.1038/35084545 . PMID 11483984 . S2CID 2715605 . ↑ Häsler J、Strub K (2006 年11 月 )。 「遺伝子発現の調節 因子 として の Aluエレメント」 。Nucleic Acids Research。34 ( 19): 5491–7。doi : 10.1093 /nar/ gkl706。PMC 1636486。PMID 17020921 。 1 2 3 4 Eyre-Walker A 、 Keightley PD （2007年8月）。 「新規突然変異の適応度効果の分布」 （PDF） 。Nature Reviews Genetics。8 （ 8 ）： 610–8。doi ： 10.1038 /nrg2146。PMID 17637733。S2CID 10868777。 2016 年3月4日に オリジナル （PDF） から アーカイブ。 2010年 9 月6 日 に 取得 。 ↑ ダーウィン、チャールズ、ウォレス、アルフレッド（1858年8月）。 「種の変種形成傾向について、および自然選択による変種と種の永続性について」 。 ロンドン・リンネ協会紀要。動物学 。3 （ 9 ）： 45–62。doi ： 10.1111 /j.1096-3642.1858.tb02500.x 。 1 2 木村正治 （1983）。 分子進化の中立理論 。ケンブリッジ（英国）、ニューヨーク： ケンブリッジ大学出版 局 。ISBN 978-0-521-23109-1 . LCCN 82022225 . OCLC 9081989 . ↑ Bohidar HB (2015年1月). 高分子物理学と分子生物物理学の基礎 . Cambridge University Press. ISBN 978-1-316-09302-3 。↑ グリシャム、ジュリー（2014年5月16日）。 「アポトーシスとは？｜メモリアル・スローン・ケタリングがんセンター」 。www.mskcc.org 。 2024年 5月30日 取得 。 ↑ ドーバー GA、ダーウィン C (2000)。 『親愛なるダーウィン氏へ：生命の進化と人間性についての書簡 』カリフォルニア大学出版局 。ISBN 978-0-520-22790-3 。↑ Tibayrenc M (2017年1月12日). 感染症の遺伝学と進化 . Elsevier. ISBN 978-0-12-800153-0 。↑ Alberts, B (2002). "細胞の分子生物学：遺伝子発現と機能の研究" . 2024年 10月29日 取得。 ↑ 「がんの原因の一部は不運である、研究で判明」 。NPR.org 。 2017 年7月13日のオリジナルから アーカイブ。 ↑ Jha A (2012年8月22日) 「高齢の父親はより多くの遺伝子変異を子孫に伝えることが研究で判明」 ガーディアン 紙 。 ↑ Ames BN、Shigenaga MK、Hagen TM ( 1993 年 9 月 )。 「酸化剤、抗酸化物質、 および 老化 の 変性疾患」 。 米国 科学アカデミー紀要 。90 ( 17): 7915–22。Bibcode : 1993PNAS...90.7915A。doi : 10.1073 / pnas.90.17.7915。PMC 47258。PMID 8367443 。 ↑ Montelone BA (1998). "突然変異、変異原、およびDNA修復" . www-personal.ksu.edu . 2015年9月26日の オリジナルからアーカイブ済み 。 2015年 10月2日 取得。 ↑ Slocombe L、Al-Khalili JS、Sacchi M (2021 年 2 月)。 「DNA 点突然変異における量子効果と古典効果: AT および GC 塩基対におけるワトソン・クリック 互変 異性 」 。Physical Chemistry Chemical Physics。23 ( 7 ) : 4141–4150。Bibcode : 2021PCCP ... 23.4141S。doi : 10.1039 / D0CP05781A。ISSN 1463-9076。PMID 33533770。S2CID 231788542 。 ↑ Slocombe L 、 Sacchi M、Al-Khalili J (2022年5 月5 日 )。 「 DNA における プロトントンネル効果 に対する 開放量子システムアプローチ」 。Communications Physics。5 ( 1) 109。arXiv : 2110.00113。Bibcode : 2022CmPhy ...5..109S。doi : 10.1038 / s42005-022-00881-8。ISSN 2399-3650。S2CID 238253421 。 ↑ Stuart GR、Oda Y 、 de Boer JG 、Glickman BW (2000 年 3 月)。 「lacI トランスジェニック マウスの肝臓、膀胱、脳における突然変異の頻度と年齢による特異性」 。Genetics。154 ( 3 ) : 1291–300。doi : 10.1093 /genetics / 154.3.1291。PMC 1460990。PMID 10757770 。 ↑ Kunz BA、Ramachandran K、Vonarx EJ ( 1998 年4 月 )。 「Saccharomyces cerevisiae における 自然突然変異の DNA 配列解析」 。Genetics。148 (4): 1491–505。doi : 10.1093/genetics/ 148.4.1491。PMC 1460101。PMID 9560369 。 ↑ Lieber MR (2010年7月) 「非相同DNA末端結合経路による二本鎖DNA 切断 修復のメカニズム」 Annual Review of Biochemistry . 79 : 181–211 . doi : 10.1146/annurev.biochem.052308.093131 . PMC 3079308. PMID 20192759 . ↑ PDB 1JDG から作成。 2015年12月31日にWayback Machine に アーカイブ済み。 ↑ Pfohl-Leszkowicz A、Manderville RA（2007年1月）。「オクラトキシンA：動物およびヒト における毒性と発がん性 の 概要」。Molecular Nutrition & Food Research。51 （ 1）： 61–99。doi ： 10.1002 / mnfr.200600137。PMID 17195275 。 ↑ Kozmin S、Slezak G、Reynaud-Angelin A、Elie C、de Rycke Y、Boiteux S、Sage E (2005 年 9 月)。 「 UVA 放射線は、Saccharomyces cerevisiae の 7,8-ジヒドロ-8-オキソグアニンを修復できない細胞において非常に突然変異誘発性がある」 。 米国 科学 アカデミー 紀要 。102 ( 38 ) : 13538–43。Bibcode : 2005PNAS..10213538K。doi : 10.1073 / pnas.0504497102。PMC 1224634。PMID 16157879 。 1 2 Fitzgerald DM、Rosenberg SM (2019 年 4 月)。 「突然変異とは何か？微生物 が 現代総合説 をいかに「危うくする」 か シリーズの一章」 。PLOS Genetics。15 ( 4) e1007995。doi : 10.1371/ journal.pgen.1007995。PMC 6443146。PMID 30933985 。 ↑ Galhardo RS、Hastings PJ、Rosenberg SM (2007 年 1 月 1 日)。 「ストレス応答として の突然変異と進化可能 性 の調節」 。Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology。42 ( 5 ): 399–435。doi : 10.1080 /10409230701648502。PMC 3319127。PMID 17917874 。 ↑ Quinto-Alemany D、Canerina-Amaro A、Hernández-Abad LG、Machín F、Romesberg FE、Gil-Lamaignere C (2012年7月31日)。Sturtevant J (編)。 「 酵母 は適応突然変異により抗真菌薬治療に対する耐性を獲得する」 。PLOS ONE。7 ( 7 ) e42279。Bibcode : 2012PLoSO ... 742279Q。doi : 10.1371 / journal.pone.0042279。PMC 3409178。PMID 22860105 。 ↑ Rahman N. 「DNA配列変化の臨床的影響」 。Transforming Genetic Medicine Initiative 。 2017年8月4日の オリジナル からアーカイブ。 2017年 6月27日 取得 。 ↑ Brown, TA (2018年12月7日). Genomes 4 (第1 版). その他のタイトル: Genomes | Genomes four 説明: 第4版. | ニューヨーク州ニューヨーク : Garland Science, [2017] | 前版: Garland Science. doi : 10.1201/9781315226828 . ISBN 978-1-315-22682-8 。{{cite book}}: CS1メンテナンス: 場所 (リンク)↑ Muro, Enrique M.; Ballesteros, Fernando J.; Luque, Bartolo; Bascompte, Jordi (2025). "The emergence of eukaryotes as an evolutionary algorithmic phase transition" . PNAS . 122 ( 13) e2422968122. Bibcode : 2025PNAS..12222968M . doi : 10.1073/pnas.2422968122 . PMC 12002324. PMID 40146859 . ↑ Freese E (1959年4月) 「ファージT4の自然 発生的突然変異と塩基類似体誘発突然変異 の 違い」 米国 科学アカデミー紀要 45 (4): 622–33 . Bibcode : 1959PNAS...45..622F . doi : 10.1073/pnas.45.4.622 . PMC 222607. PMID 16590424 . ↑ Freese E (1959年6月)「塩基アナログのファージT4に対する特異的変異誘発効果」 分子生物学ジャーナル 1 ( 2): 87–105 . doi : 10.1016/S0022-2836(59)80038-3 . ↑ この画像の出典は、Wikimedia Commons のページCommons:File:Notable mutations.svg#References にあります。 ↑ Hogan CM (2010年10月12日)。 「突然変異」 。Monosson E (編) 『地球百科事典』 所収 。ワシントンDC：環境情報連合、 国立科学環境評議会 。OCLC 72808636。 2015年11月14日のオリジナルから アーカイブ 。 2015年 10月8日 取得 。 ↑ ボワイレS、ヴァンデヴェルデC、クリーブランドDW（2006年10月）。 「ALS：運動ニューロンとその隣接する非ニューロンの疾患」。 ニューロン 。 52 (1 ) : 39–59。CiteSeerX 10.1.1.325.7514 。 土井 ： 10.1016/j.neuron.2006.09.018 。 PMID 17015226 。 S2CID 12968143 。 ↑ Reva B、Antipin Y、Sander C (2011 年 9月)。 「タンパク質変異の機能的影響の予測：がんゲノミクスへの応用」 。Nucleic Acids Research。39 ( 17 ) : e118。doi : 10.1093/nar / gkr407。PMC 3177186。PMID 21727090 。 ↑ Housden BE、Muhar M、Gemberling M、Gersbach CA、Stainier DY、Seydoux G、et al. (2017 年 1 月)。 「 動物 モデル の ための機能喪失遺伝子ツール：種間およびプラットフォーム間の違い」 。Nature Reviews . Genetics。18 (1): 24–40。doi : 10.1038 / nrg.2016.118。PMC 5206767。PMID 27795562 。 ↑ Eggertsson G、Adelberg EA ( 1965 年8 月 )。 「 大腸菌 K-12 におけるサプレッサー変異の位置と特異性の地図」 。Genetics。52 ( 2 ) : 319–340。doi : 10.1093/genetics/ 52.2.319。PMC 1210853。PMID 5324068 。 ↑ Takiar V、Ip CK、Gao M、Mills GB、Cheung LW ( 2017 年3 月 )。 「がんにおける新形態変異は治療上の課題を生み出す 」 。Oncogene。36 ( 12 ) : 1607–1618。doi : 10.1038 / onc.2016.312。PMC 6609160。PMID 27841866 。 ↑ Ellis NA、Ciocci S、German J (2001 年 2 月)。 「バック突然変異 はブルーム症候群体細胞における表現型 の 逆転を 引き起こす可能性がある」。Human Genetics。108 ( 2): 167–73。doi : 10.1007 / s004390000447。PMID 11281456。S2CID 22290041 。 ↑ Doolittle WF、Brunet TD (2017 年 12 月)。 「 因果的役割と選択さ れた効果について：私たちのゲノムはほとんどがジャンクです」 。BMC Biology。15 ( 1 ) 116。doi : 10.1186 /s12915-017-0460-9。PMC 5718017。PMID 29207982 。 ↑ Nichols RJ、Sen S、Choo YJ 、Beltrao P、Zietek M、Chaba R、et al . (2011 年 1 月 ) 。 「 細菌 細胞の表現型ランドスケープ」 。Cell。144 ( 1 ) : 143–56。Bibcode : 2011Cell..144..143N。doi : 10.1016/j.cell.2010.11.052。PMC 3060659。PMID 21185072 。 ↑ van Opijnen T、Bodi KL、Camilli A (2009 年 10 月)。 「 Tn-seq: 微生物の適応度と遺伝子相互 作用 の 研究 のためのハイスループット並列シーケンス」 。Nature Methods。6 ( 10 ): 767–72。Bibcode : 2009NaMet ... 6..767V。doi : 10.1038 / nmeth.1377。PMC 2957483。PMID 19767758 。 ↑ Allen HL、Estrada K、Lettre G、Berndt SI、Weedon MN、Rivadeneira F、et al . (2010 年 10 月)。 「 ゲノム領域 と 生物学的経路にクラスター化 された数百の変異がヒト の 身長に影響を与える」 。Nature。467 ( 7317): 832–8。Bibcode : 2010Natur.467..832L。doi : 10.1038 / nature09410。PMC 2955183。PMID 20881960 。 ↑ Charlesworth D 、 Charlesworth B 、Morgan MT ( 1995 年12 月 )。 「背景選択モデル における中立分子変異 の パターン」 。Genetics。141 ( 4 ) : 1619–32。doi : 10.1093/genetics/ 141.4.1619。PMC 1206892。PMID 8601499 。 ↑ Loewe L (2006年4月) 「ヒトミトコンドリアDNAにおけるミュラーのラチェットによるゲノム崩壊のパラドックスの定量化」 Genetical Research . 87 (2): 133–59 . doi : 10.1017/S0016672306008123 . PMID 16709275 . ↑ Bernstein H、Hopf FA、Michod RE (1987)「性 の 進化の分子基盤」。 発生の分子遺伝学 。遺伝学の進歩。第24巻 、 323–70 頁。doi : 10.1016 /s0065-2660(08) 60012-7。ISBN 978-0-12-017624-3 PMID 3324702 ↑ Peck JR、Barreau G、Heath SC (1997 年 4 月)。 「 不完全 な 遺伝子 、 フィッシャー突然変異、および 性 の進化」 。Genetics。145 ( 4): 1171–99。doi : 10.1093/genetics/ 145.4.1171。PMC 1207886。PMID 9093868 。 ↑ Simcikova D、Heneberg P (2019 年 12 月) 「メンデル遺伝病の症状に関する臨床的証拠に基づく進化医学予測の改良」 Scientific Reports 9 ( 1) 18577. Bibcode : 2019NatSR...918577S . doi : 10.1038/s41598-019-54976-4 . PMC 6901466 . PMID 31819097 . ↑ Keightley PD、 Lynch M (2003 年 3 月)。「適応度に影響を与える突然変異の現実的なモデルに向けて」。Evolution ; International Journal of Organic Evolution。57 ( 3): 683–5 、議論 686–9。doi : 10.1554/ 0014-3820 (2003)057 [ 0683 :tarmom ] 2.0.co ; 2 。JSTOR 3094781 。PMID 12703958 。S2CID 198157678 。 ↑ Barton NH 、Keightley PD (2002 年 1 月)。「量的遺伝的変異の理解 」 。Nature Reviews Genetics。3 ( 1 ) : 11–21。doi : 10.1038 / nrg700。PMID 11823787。S2CID 8934412 。 1 2 3 Sanjuán R、Moya A、Elena SF (2004 年 6 月)。 「RNA ウイルス における 単一ヌクレオチド置換 によって 引き起こされる適応度効果 の 分布」 。 米国 科学アカデミー紀要 。101 ( 22 ) : 8396–401。Bibcode : 2004PNAS..101.8396S。doi : 10.1073/ pnas.0400146101。PMC 420405。PMID 15159545 。 ↑ Carrasco P、de la Iglesia F、Elena SF (2007 年 12 月)。 「 タバコエッチウイルス における 単一ヌクレオチド置換によって引き起こされる適応度と病原性効果の分布」 。Journal of Virology。81 ( 23 ) : 12979–84。Bibcode : 2007JVir ... 8112979C。doi : 10.1128/ JVI.00524-07。PMC 2169111。PMID 17898073 。 ↑ Sanjuán R (2010年6月) 「RNAウイルスと一本鎖DNAウイルスにおける突然変異適応度効果：部位特異的突然変異研究によって明らかになった共通パターン」 Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological Sciences . 365 (1548): 1975–82 . doi : 10.1098/rstb.2010.0063 . PMC 2880115 . PMID 20478892 . ↑ Peris JB 、 Davis P 、 Cuevas JM、Nebot MR、Sanjuán R (2010 年 6月)。 「バクテリオファージf1における単一ヌクレオチド置換によって引き起こされる適応度効果の分布」 。Genetics。185 ( 2 ) : 603–9。doi : 10.1534 / genetics.110.115162。PMC 2881140。PMID 20382832 。 ↑ エレナ SF、エクンウェ L、ハジェラ N、オーデン SA、 レンスキー RE (1998 年 3 月)。 「大腸菌におけるランダム挿入変異による適応度効果の分布」。 ジェネティカ 。 102–103 ( 1–6 ): 349–58 . Bibcode : 1998Gen...102..349E 。 土井 ： 10.1023/A:1017031008316 。 PMID 9720287 。 S2CID 2267064 。 1 2 Hietpas RT、Jensen JD、Bolon DN ( 2011 年 5 月)。 「適応 度 ランドスケープの実験的解明」 。 米国 科学 アカデミー 紀要 。108 ( 19 ) : 7896–901。Bibcode : 2011PNAS..108.7896H。doi : 10.1073 / pnas.1016024108。PMC 3093508。PMID 21464309 。 ↑ Davies EK、Peters AD、Keightley PD（1999 年 9月）。「線 虫 Caenorhabditis elegansにおける 隠れた有害突然変異の高頻度」。Science。285 （ 5434 ）： 1748–51。doi ： 10.1126 /science.285.5434.1748。PMID 10481013 。 ↑ Loewe L、Charlesworth B (2006 年 9 月)。 「ショウジョウバエ の 適応度に対する突然変異の 影響 の分布の推定」 。Biology Letters。2 ( 3 ): 426–30。doi : 10.1098 / rsbl.2006.0481。PMC 1686194。PMID 17148422 。 ↑ Eyre-Walker A、Woolfit M、Phelps T (2006年6月) 「ヒトにおける新規有害アミノ酸変異 の 適応度への影響の分布」 Genetics 173 ( 2): 891–900 . Bibcode : 2006Genet.173..891E . doi : 10.1534/genetics.106.057570 . PMC 1526495 . PMID 16547091 . ↑ Sawyer SA、Kulathinal RJ、 Bustamante CD 、Hartl DL (2003 年 8 月)。「ベイズ分析によると 、 ショウジョウバエのアミノ酸置換のほとんどは正の選択によって引き起こされている」 。Journal of Molecular Evolution。57 ( 1 ) : S154–64。Bibcode : 2003JMolE..57S.154S。CiteSeerX 10.1.1.78.65。doi : 10.1007 / s00239-003-0022-3。PMID 15008412。S2CID 18051307 。 ↑ Piganeau G、Eyre-Walker A (2003 年 9 月)。 「DNA 配列データからの適応度効果の分布の推定: 分子時計への示唆 」 。 米国 科学 アカデミー 紀要 。100 ( 18 ) : 10335–40。Bibcode : 2003PNAS..10010335P。doi : 10.1073 / pnas.1833064100。PMC 193562。PMID 12925735 。 ↑ 木村正人 （ 1968 年 2 月 ） 「 分子レベルでの進化速度」 Nature.217 （ 5129）： 624–6。Bibcode ： 1968Natur.217..624K.doi ： 10.1038 / 217624a0.PMID 5637732.S2CID 4161261 . ↑ Akashi H (1999年9月). 「種内および種間DNA配列変異と自然選択の「痕跡」」. Gene . 238 (1): 39– 51. doi : 10.1016/S0378-1119(99)00294-2 . PMID 10570982 . ↑ Eyre-Walker A (2006 年 10 月). 「適応進化のゲノム速度」 . Trends in Ecology & Evolution . 21 (10): 569–75 . Bibcode : 2006TEcoE..21..569E . doi : 10.1016/j.tree.2006.06.015 . PMID 16820244 . ↑ Gillespie JH (1984 年 9 月) 「突然変異の景観における分子進化」。Evolution . 38 ( 5): 1116– 1129. doi : 10.2307/2408444 . JSTOR 2408444 . PMID 28555784 . ↑ Orr HA (2003 年 4 月) 「有益な突然変異間の適応度効果の分布」 Genetics 163 ( 4 ): 1519–26 . doi : 10.1093/genetics/163.4.1519 . PMC 1462510 . PMID 12702694 . ↑ Kassen R、Bataillon T (2006 年 4 月)。 「細菌 の 実験集団における選択前の有益 な突然変異間 の 適応度 効果の分布」。Nature Genetics。38 ( 4 ) : 484–8。Bibcode : 2006NaGen..38..484K。doi : 10.1038/ ng1751。PMID 16550173。S2CID 6954765 。 ↑ Rokyta DR 、 Joyce P、Caudle SB、Wichman HA (2005 年 4 月 )。「一本鎖 DNA ウイルスを用いた適応の変異ランドスケープ モデルの実証的 検証 」 。Nature Genetics。37 ( 4 ) : 441–4。Bibcode : 2005NaGen..37..441R。doi : 10.1038 / ng1535。PMID 15778707。S2CID 20296781 。 ↑ Imhof M、Schlotterer C (2001 年 1 月) 「進化する大腸菌集団における有利な突然変異の適応度への影響」 米国 科学 アカデミー紀要 98 (3): 1113–7 . Bibcode : 2001PNAS...98.1113I . doi : 10.1073/pnas.98.3.1113 . PMC 14717 . PMID 11158603 . 1 2 「体細胞遺伝子変異」 。 ゲノム辞書 。ギリシャ、アテネ：Information Technology Associates。2007年6月30日。 2010年2月24日の オリジナルからアーカイブ。 2010年 6月6日 取得 。 ↑ 「複合ヘテロ接合体」 。MedTerms 。 ニューヨーク： WebMD 。2012年6月14日。 2016年3月4日の オリジナル からアーカイブ。 2015年 10月9日 取得 。 ↑ 「 RB1 Genetics」 。 デイジー眼がん基金 。英国オックスフォード。 2011年11月26日の オリジナルからアーカイブ。 2015年 10月9日 取得 。 ↑ 「体細胞突然変異｜遺伝学」 。 ブリタニカ百科事典 。 2017年3月31日時点のオリジナルより アーカイブ。 2017年 3月31日 取得 。 ↑ Hartl L、Jones EW (1998)。 遺伝学の原理と分析 。マサチューセッツ州サドベリー：Jones and Bartlett Publishers。556 ページ 。ISBN 978-0-7637-0489-6 。↑ Milholland B、Dong X、Zhang L、Hao X、Suh Y、Vijg J (2017 年 5 月)。 「 ヒト と マウス における 生殖 細胞系突然変異率と体細胞突然変異率の違い」 。Nature Communications。8 15183。Bibcode : 2017NatCo ... 815183M。doi : 10.1038/ ncomms15183。PMC 5436103。PMID 28485371 。 ↑ Alberts B (2014). Molecular Biology of the Cell (6 ed.). Garland Science. p. 487. ISBN 978-0-8153-4432-2 。1 2 Chadov BF、Fedorova NB、Chadova EV (2015 年 7 月 1 日)。「ショウジョウバエにおける条件付き突然変異：G. メンデルのブリュンでの報告から 150 周年を記念して」。Mutation Research / Reviews in Mutation Research。765 ： 40–55。Bibcode ： 2015MRRMR.765 ... 40C。doi ： 10.1016 / j.mrrev.2015.06.001。PMID 26281767 。 1 2 Landis G、Bhole D 、 Lu L、Tower J (2001 年 7 月)。 「ショウジョウバエの発生と寿命に影響を与える条件付き突然変異の高頻度発生」 。Genetics。158 ( 3 ) : 1167–76。doi : 10.1093/genetics/158.3.1167。PMC 1461716。PMID 11454765。2017 年3 月 22 日の オリジナル からアーカイブ 。2017 年 3 月 21 日 取得 。 1 2 3 4 Gierut JJ、Jacks TE、Haigis KM (2014 年 4 月)。 「マウスにおける条件付き遺伝子変異を実現するための戦略」 。Cold Spring Harbor Protocols。2014 ( 4 ) : 339–49。doi : 10.1101 / pdb.top069807。PMC 4142476。PMID 24692485 。 ↑ Spencer DM (1996 年 5 月)「哺乳類における条件付き突然変異の作成」 Trends in Genetics . 12 (5): 181–7 . doi : 10.1016/0168-9525(96)10013-5 . PMID 8984733 . ↑ ↑ den Dunnen JT、 Antonarakis SE (2000 年 1 月 )。 「変異命名法の拡張と複雑な変異 を記述するため の 提案: 議論」 。Human Mutation。15 (1): 7– 12。doi : 10.1002/(SICI)1098-1004(200001) 15 :1 < 7::AID-HUMU4 > 3.0.CO ; 2-N 。PMID 10612815 。S2CID 84706224 。 ↑ Jónsson H、Sulem P、Kehr B、Kristmundsdottir S、Zink F、Hjartarson E、et al . (2017 年 9 月)。「アイスランドの 1,548 トリオにおけるヒト生殖細胞系 de novo 変異に対する 親 の 影響 」 。Nature。549 ( 7673 ) : 519–522。Bibcode : 2017Natur.549..519J。doi : 10.1038 / nature24018。PMID 28959963。S2CID 205260431 。 ↑ Bromham, Lindell (2009). "なぜ種 によって 分子進化の速度が異なるのか？" . Biology Letters . 5 (3): 401–404 . doi : 10.1098/rsbl.2009.0136 . PMC 2679939. PMID 19364710 . 1 2 Loewe, Laurence; Hill, William G. (2010). "突然変異の集団遺伝学: 良い、悪い、そしてどちらでもない" . Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological Sciences . 365 (1544). Philosophical transactions of the Royal Society of London: 1153– 1167. doi : 10.1098/rstb.2009.0317 . PMC 2871823 . PMID 20308090 . ↑ Mohiuddin, Mohiuddin; Kooy, R. Frank; Pearson, Christopher E. (2022). "DE novo変異、遺伝的モザイク現象、および遺伝性疾患" . Frontiers in Genetics . 13 . doi : 10.3389/fgene.2022.983668 . PMC 9550265 . PMID 36226191 . ↑ Mohiuddin, Mohiuddin; Kooy, R. Frank; Pearson, Christopher E. (2022). " de novo mutations, genetic mosaicism, and genetic disease" . Frontiers in Genetics . 13. doi : 10.3389/fgene.2022.983668 . PMC 9550265. PMID 36226191 . ↑ Acuna-Hidalgo, Rocio; Veltman, Joris A.; Hoischen, Alexander (2016). "健康と疾患における新規突然変異の発生と役割に関する新たな知見" . Genome Biology . 17 (1): 241. doi : 10.1186/s13059-016-1110-1 . PMC 5125044 . PMID 27894357 . ↑ 池端博信;小野哲也 (2011) 「UV突然変異誘発のメカニズム」 。 放射線研究ジャーナル 。 52 (2)。 J Radiat Res: 115–125 。 Bibcode : 2011JRadR..52..115I 。 土井 ： 10.1269/jrr.10175 。 PMID 21436607 。 ↑ 「DNA変異はランダムであるという進化論に異議を唱える研究」 。UC Davis 。 2022年 2月12日 取得 。 ↑ Monroe JG、Srikant T、Carbonell - Bejerano P、Becker C、Lensink M、Exposito-Alonso M、et al . (2022年2月)。 「 突然変異 バイアスはシロイヌナズナの自然選択を反映する 」 。Nature。602 ( 7895 ) : 101–105。Bibcode : 2022Natur.602..101M。doi : 10.1038 / s41586-021-04269-6。PMC 8810380。PMID 35022609 。 ↑ Bartlett, J. (2023). "適応度に関してランダムか外部選択か？重要だが見落とされがちな区別". Acta Biotheoretica . 71 (2) 12. doi : 10.1007/s10441-023-09464-8 . PMID 36933070 . S2CID 257585761 . ↑ Doniger SW、Kim HS、Swain D、Corcuera D、Williams M、Yang SP、Fay JC (2008 年 8 月)。Pritchard JK ( 編)。 「酵母 における 中立および有害な多型のカタログ」 。PLOS Genetics。4 ( 8 ) e1000183。doi : 10.1371 / journal.pgen.1000183。PMC 2515631。PMID 18769710 。 ↑ Ionov Y、Peinado MA、Malkhosyan S 、Shibata D、Perucho M (1993 年 6 月)。「単純反復配列における遍在的な体細胞変異が、大腸癌発生の新しい メカニズム を 明らかにする 」 。Nature。363 ( 6429 ) : 558–61。Bibcode : 1993Natur.363..558I。doi : 10.1038 / 363558a0。PMID 8505985。S2CID 4254940 。 ↑ Araten DJ 、Golde DW、Zhang RH、Thaler HT、Gargiulo L、Notaro R、Luzzatto L（2005年9月）。 「 ヒト 体 細胞 突然変異 率の定量的測定」 。Cancer Research。65 （18）： 8111–7。Bibcode ： 2005CaRes..65.8111A。doi ： 10.1158 / 0008-5472.CAN- 04-1198。PMID 16166284 。 ↑ Sullivan AD、Wigginton J、Kirschner D (2001 年 8 月) 「共受容体変異 CCR5Delta32 は HIV 流行の動態に影響を与え、HIV によって選択される」 米国 科学アカデミー紀要 98 (18): 10214–9 . Bibcode : 2001PNAS ...9810214S . doi : 10.1073/pnas.181325198 . PMC 56941 . PMID 11517319 . ↑ 「黒死病の謎」 。Secrets of the Dead 。シーズン3。エピソード2。2002年10月30日 。PBS 。 2015年10月12日にオリジナルから アーカイブ済み 。 2015年 10月10日 に取得。 ↑ Galvani AP、 Slatkin M (2003 年 12 月)。 「CCR5-Delta 32 HIV 耐性アレルに対する歴史的選択圧としてのペストと天然痘の評価」 。 米国 科学 アカデミー 紀要 。100 ( 25 ) : 15276–9。Bibcode : 2003PNAS..10015276G。doi : 10.1073 / pnas.2435085100。PMC 299980。PMID 14645720 。 ↑ Konotey-Ahulu F. "よくある質問 [ FAQ ] " . sicklecell.md . 2011年4月30日の オリジナルからアーカイブ済み。 2010年 4月16日 取得 。 ↑ Hughes D、Andersson DI (2017 年 9 月)。 「抗生物質 耐性 への進化の軌跡」 。Annual Review of Microbiology。71 : 579–596。doi : 10.1146 / annurev - micro-090816-093813。PMID 28697667 。 ↑ Ségurel L、Bon C （ 2017 年 8月）。「ヒトにおける乳糖分解酵素持続性の進化について」。Annual Review of Genomics and Human Genetics。18： 297–319。doi ： 10.1146 / annurev - genom - 091416-035340。PMID 28426286 。 ↑ Amicone, Massimo; Gordo, Isabel (2021). "資源競争の分子シグネチャー: クローン干渉は生態学的多様化を促進し、初期種分化につながる可能性がある" . Evolution; International Journal of Organic Evolution . 75 (11). International Journal of Organic Evolution: 2641– 2657. Bibcode : 2021Evolu..75.2641A . doi : 10.1111/evo.14315 . PMC 9292366 . PMID 34341983 . 1 2 3 Barešić, Anja; Martin, Andrew CR (2011年8月1日). "補償された病原性逸脱" . BioMolecular Concepts . 2 (4): 281– 292. doi : 10.1515/bmc.2011.025 . ISSN 1868-503X . PMID 25962036 . S2CID 6540447 . 1 2 3 Whitlock, Michael C.; Griswold, Cortland K.; Peters, Andrew D. (2003). "メルトダウンの補償：有害な突然変異と補償的突然変異を持つ集団の臨界有効サイズ". Annales Zoologici Fennici . 40 (2): 169– 183. ISSN 0003-455X . JSTOR 23736523 . 1 2 Lanfear, Robert; Kokko, Hanna; Eyre-Walker, Adam (2014年1月1日). "個体群サイズと進化速度" . Trends in Ecology & Evolution . 29 (1): 33– 41. Bibcode : 2014TEcoE..29...33L . doi : 10.1016/j.tree.2013.09.009 . ISSN 0169-5347 . PMID 24148292 . ↑ Doudna, Jennifer A. (2000年11月1日). " RNAの構造ゲノミクス" . Nature Structural Biology . 7 : 954–956 . doi : 10.1038/80729 . PMID 11103998. S2CID 998448 . ↑ Cowperthwaite, Matthew C.; Bull, JJ; Meyers, Lauren Ancel (20 October 2006). "From Bad to Good: Fitness Reversals and the Ascent of Deleterious Mutations" . PLOS Computational Biology . 2 (10) e141. Bibcode : 2006PLSCB...2..141C . doi : 10.1371/journal.pcbi.0020141 . ISSN 1553-7358 . PMC 1617134. PMID 17054393 . ↑ Cowperthwaite, Matthew C.; Meyers, Lauren Ancel (2007 年 12 月 1 日). "変異ネットワークが進化をどのように形作るか: RNA モデルからの教訓" . Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics . 38 (1): 203– 230. doi : 10.1146/annurev.ecolsys.38.091206.095507 . ISSN 1543-592X . 1 2 Azbukina, Nadezhda; Zharikova, Anastasia; Ramensky, Vasily (2022 年 10 月 1 日). "Intragenic compensation through the lens of deep mutational scanning" . Biophysical Reviews . 14 (5): 1161– 1182. doi : 10.1007/s12551-022-01005-w . ISSN 1867-2469 . PMC 9636336 . PMID 36345285 . 1 2 3 4 DePristo, Mark A.; Weinreich, Daniel M.; Hartl, Daniel L. (2005 年 9 月). "配列空間におけるミスセンスの迷走: タンパク質進化の生物物理学的観点". Nature Reviews. Genetics . 6 (9): 678–687 . doi : 10.1038/nrg1672 . ISSN 1471-0056 . PMID 16074985. S2CID 13236893 . 1 2 Ferrer-Costa, Carles; Orozco, Modesto; Cruz, Xavier de la (2007 年 1 月 5 日). "構造的および物理化学的特性の観点からの補償変異の特性評価" . Journal of Molecular Biology . 365 (1): 249– 256. doi : 10.1016/j.jmb.2006.09.053 . ISSN 0022-2836 . PMID 17059831 . ↑ Lunzer, Mark; Golding, G. Brian; Dean, Antony M. (2010年10月21日). "分子進化における遍在する隠れたエピスタシス" . PLOS Genetics . 6 (10) e1001162. doi : 10.1371/journal.pgen.1001162 . ISSN 1553-7404 . PMC 2958800 . PMID 20975933 . 1 2 Corrigan, Rebecca M.; Abbott, James C.; Burhenne, Heike; Kaever, Volkhard; Gründling, Angelika (2011年9月1日). "c-di-AMPは黄色ブドウ球菌における細胞サイズとエンベロープストレスの制御に関与する新しいセカンドメッセンジャーである" . PLOS Pathogens . 7 (9) e1002217. doi : 10.1371/journal.ppat.1002217 . ISSN 1553-7366 . PMC 3164647 . PMID 21909268 . 1 2 3 コマ、イニャキ。ボレル、ソニア。ロッツァー、アンドレアス。ローズ、グラハム。マラ、ビジャヤ;加藤・前田みどり；ギャラガン、ジェームズ。ニーマン、ステファン。ガニュー、セバスチャン（2012 年 1 月）。 「リファンピシン耐性結核菌株の全ゲノム配列決定により、RNA ポリメラーゼ遺伝子の代償性変異が特定されました。 」 自然遺伝学 。 44 (1): 106–110 。 Bibcode : 2012NaGen..44..106C 。 土井 ： 10.1038/ng.1038 。 ISSN 1546-1718 。 PMC 3246538 。 PMID 22179134 。 1 2 Gagneux, Sebastien; Long, Clara Davis; Small, Peter M.; Van, Tran; Schoolnik, Gary K.; Bohannan, Brendan JM (2006年6月30日). "結核菌における抗生物質耐性の競争コスト". Science . 312 (5782): 1944–1946 . Bibcode : 2006Sci...312.1944G . doi : 10.1126 / science.11 24410. ISSN 1095-9203 . PMID 16809538. S2CID 7454895 . 1 2 3 Reynolds, MG (2000 年 12 月). 「リファンピシン 耐性 大腸菌における代償進化」 . Genetics . 156 (4): 1471–1481 . doi : 10.1093/genetics/156.4.1471 . ISSN 0016-6731 . PMC 1461348. PMID 11102350 . ↑ Gong, Lizhi Ian; Suchard, Marc A; Bloom, Jesse D (2013年5月14日). Pascual, Mercedes (編). "安定性を介したエピスタシスがインフルエンザタンパク質の進化を制約する" . eLife . 2 e00631. Bibcode : 2013eLife...200631G . doi : 10.7554/eLife.00631 . ISSN 2050-084X . PMC 3654441 . PMID 23682315 . 1 2 Davis, Brad H.; Poon, Art FY; Whitlock, Michael C. (2009 年 5 月 22 日). "補償変異はタンパク質内で繰り返し発生し、クラスター化している" . Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences . 276 (1663): 1823– 1827. doi : 10.1098/rspb.2008.1846 . ISSN 0962-8452 . PMC 2674493 . PMID 19324785 . ↑ Azbukina, Nadezhda; Zharikova, Anastasia; Ramensky, Vasily (2022年10月1日). "Intragenic compensation through the lens of deep mutational scanning" . Biophysical Reviews . 14 (5): 1161– 1182. doi : 10.1007/s12551-022-01005-w . ISSN 1867-2469 . PMC 9636336 . PMID 36345285 . 1 2 Burch, Christina L; Chao, Lin (1 March 1999). "RNAウイルスϕ6における小さなステップと険しい地形による進化" . Genetics . 151 (3): 921– 927. doi : 10.1093/genetics/151.3.921 . ISSN 1943-2631 . PMC 1460516 . PMID 10049911 . 1 2 Rimmelzwaan, GF; Berkhoff, EGM; Nieuwkoop, NJ; Smith, DJ; Fouchier, RAM; Osterhaus, ADMEYR 2005 (2005). "インフルエンザAウイルス細胞傷害性Tリンパ球逃避変異体のヌクレオプロテインにおける複数の補償的共変異によるウイルス適応度の完全な回復" . Journal of General Virology . 86 (6): 1801– 1805. doi : 10.1099/vir.0.80867-0 . hdl : 1765/8466 . ISSN 1465-2099 . PMID 15914859 . {{cite journal}}: CS1 maint: 数値名: 著者リスト (リンク)↑ 木村元夫（ 1985 年 7月1 日 ）「分子進化における代償性中立突然変異の 役割」遺伝 学 ジャーナル 64 （1）： 7-19。doi ： 10.1007 /BF02923549。ISSN 0973-7731。S2CID 129866 。 ↑ 1000 Genomes Project Consortium; et al. (2015). "ヒトの遺伝的変異に関するグローバルリファレンス" . Nature . 526 (7571): 68– 74. Bibcode : 2015Natur.526...68T . doi : 10.1038/nature15393 . PMC 4750478 . PMID 26432245 . {{cite journal}}: CS1 maint: 数値名: 著者リスト (リンク)↑ Lupski, James R.; Belmont, John W.; Boerwinkle, Eric; Gibbs, Richard A. (2011). "クランゲノミクスとヒト疾患の複雑な構造" . Cell . 147 (1): 32– 43. doi : 10.1016/j.cell.2011.09.008 . PMC 3656718 . PMID 21962505 . ↑ Veltman, Joris A.; Brunner, Han G. (2012). "ヒト遺伝性疾患における新規突然変異" . Nature Reviews Genetics . 13 (8): 565– 575. doi : 10.1038/nrg3241 . PMID 22805709 . S2CID 21702926 . 2023年 12月9日 取得 . 
