ショウジョウバエ ( 1 ] [ 2 ] ギリシャ語の , drósos 「 露 」 と φίλος , phílos 「 愛する 」 に ) はに 属するハエのしばしば「小型果実バエ」または果実バエ、酢バエ、ワインバエと呼ばれ、これは多くの種が熟しすぎた果実や腐った果実の周りにとどまるという特徴に由来する。これらは、同じく果実バエ(「真の果実バエ」と呼ばれることもある)と呼ばれる関連科であるミバエ科と混同 し て は なら ない 。
特にショウジョウバエ の一種であるキイロショウジョウバエは 、遺伝学 の研究で広く用いられており、発生生物学 における一般的なモデル生物 である。現代の生物学文献では、「ショウジョウバエ」と「ショウジョウバエ」という用語は、しばしば キイロショウジョウバエ と同義語として用いられる。しかし、この属全体では1,500種以上[ 3 ] を含み、外見、行動、繁殖生息地において非常に多様である。
語源 「 Drosophila 」という用語は、「露を好む」という意味で、ギリシャ 語の「δρόσος , drósos 」 (露 )と「 φίλος , phílos 」(好む)から現代科学のラテン語に翻案されたものです。
形態学 ショウジョウバエ は、通常淡黄色から赤褐色、黒色で、赤い目を持つ小型のハエです。目(基本的にレンズの膜)を取り除くと、脳が現れます。ショウジョウバエの脳の構造と機能は、 幼虫 から成虫の段階にかけて大きく発達し、老化します。発達中の脳構造により、これらのハエは神経遺伝学研究の有力候補となっています。[ 4 ] 2024年10月にNature に掲載された研究によると、成虫の雌ショウジョウバエの脳を調べた科学者によって、13万個のニューロン と5000万個のシナプス の形状と位置が特定されました。この研究では、成虫の脳に対してこれまでに行われた中で最も詳細な分析が示されています。[ 5 ] [ 6 ] 有名なハワイのピクチャーウィングを含む多くの種は、翅に特徴的な黒い模様があります。羽毛状の芒、 頭部と胸部の剛毛、翅脈は、この科を診断するために使用される特徴です。ほとんどは小さく、体長は約2~4ミリメートル(0.079~0.157 インチ) だが、特にハワイの多くの種はイエバエ よりも大きい。
生物学
再生 この属のオスは、地球上で研究されている生物の中で最も長い精子細胞 を持つことが知られており、D. bifurca という種では精子細胞の長さが58 mm (2.3 インチ) にもなります。[ 18 ] 細胞は主に長い糸状の尾で構成されており、絡まったコイル状でメスに届けられます。ショウジョウバエ 属の他のメンバーも、比較的少数の巨大精子細胞を作り、D. bifurca の精子細胞が最も長いです。[ 19 ] D. melanogaster の 精子細胞は、長さが 1.8 mm と控えめですが、それでも人間の精子の約 35 倍の長さです。D . melanogaster種群のいくつかの種は、 外傷性受精 によって交尾することが知られています。[ 20 ]
ショウジョウバエの 種によって繁殖能力は大きく異なります。D . melanogaster のように、比較的希少な資源が豊富な場所で繁殖する種は、一度 に 10 ~ 20 個の卵を成熟させ、一箇所にまとめて産卵することができます。一方、葉など、豊富ではあるものの栄養価の低い基質で繁殖する種は、1 日に 1 個の卵しか産まない場合があります。卵の前端付近には 1 個以上の呼吸糸があり、その先端が表面から突き出て、胚に酸素が届くようになっています。幼虫は植物質そのものではなく、腐敗した繁殖基質に存在する酵母 や微生物を餌としています。発育期間は種によって大きく異なり (7 日から 60 日以上)、 温度 、繁殖基質、密度などの環境要因によって左右されます。
ショウジョウバエは環境サイクルに応じて産卵する。生存の可能性が高い時間帯(夜間など)に産卵された卵は、他の時間帯(昼間など)に産卵された卵よりも多くの幼虫を生み出す。他の条件が同じであれば、 この「有利な」時間帯に産卵する習慣は、他の時間帯に産卵する習慣よりも多くの生存する子孫と孫を生み出すことになる。この繁殖成功率の差が、ショウジョウバエが 環境サイクルに適応する原因となる。なぜなら、この行動は繁殖上の大きな利点 をもたらすからである。[ 21 ]
彼らの平均寿命は35~45日である。[ 22 ]
エージング ショウジョウバエの 腸幹細胞 では、加齢とともにDNA損傷 が蓄積する。 [ 23 ] ショウジョウバエの DNA損傷応答の欠陥、特にDNA損傷修復 に関与する遺伝子の発現の欠陥は、腸幹細胞(腸上皮細胞 )の老化を加速させる。[ 24 ] シャープレスとデピニョ[ 25 ] は、幹細胞が内在的な老化を起こすという証拠をレビューし、幹細胞が老化する原因の一つとして、DNA損傷が挙げられると推測した。
交配システム
求愛行動 以下はD. simulans とD. melanogaster に基づいています。
雄ショウジョウバエ の求愛行動は魅力的な行動である。[ 26 ] 雌は雄が示す行動を知覚することで反応する。[ 27 ] 雄と雌のショウジョウバエは 、さまざまな感覚的手がかりを使用して、潜在的な交尾相手の求愛準備を開始および評価する。[ 26 ] [ 27 ] [ 28 ] 手がかりには、位置、フェロモンの分泌、雌の後をついていく、脚で叩く音を出す、歌う、翅を広げる、翅を振動させる、生殖器を舐める、腹部を曲げる、交尾を試みる、および交尾行為自体などの行動が含まれる。[ 29 ] [ 26 ] [ 27 ] [ 28 ] D. melanogaster とD. simulans の歌は広範囲に研究されている。これらの誘惑の歌は正弦波状であり、種内および種間で変化する。[ 28 ]
ショウジョウバエ の求愛行動は、オスとメスの両方の求愛行動に関与している性関連遺伝子についても評価されている。[ 26 ] 最近の実験では、性行動に関連する遺伝子群であるfruitless ( fru ) と doublesex ( dsx )の役割が調べられている。 [ 30 ] [ 26 ]
ショウジョウバエ のfruitless (fru )遺伝子は、 雄の求愛行動のネットワークを制御するのに役立ちます。この遺伝子に突然変異が起こると、雄の同性間の性的行動の変化が観察されます。[ 31 ] fru 変異を持つ雄のショウジョウバエは 、通常雌に向けられる求愛行動とは異なり、他の雄に求愛行動を向けます。[ 32 ] fru 変異が失われると、通常の求愛行動に戻ります。[ 32 ]
フェロモン 11種の砂漠に生息するショウジョウバエ 亜属において、新しいクラスのフェロモン が保存されていることが発見された。 [ 33 ] これらのフェロモンは、オスのみが射精球から分泌し、交尾中にメスに伝達するトリアシルグリセリドである。フェロモンの機能は、メスをその後の求愛者にとって魅力的でなくし、他のオスによる求愛を阻害することである。
精子競争 以下のセクションは、Drosophila の 次の種に基づいています: D. melanogaster 、D. simulans 、およびD. mauritiana 。精子競争は、多夫性の ショウジョウバエの 雌が子孫の適応度を高めるために使用するプロセスです。 [ 39 ] [ 40 ] [ 41 ] [ 42 ] [ 43 ] ショウジョウバエ の雌は、精子貯蔵器官として受精嚢と受精嚢の 2 つを持ち、卵子に受精させる精子を選択できます。[ 43 ] しかし、ショウジョウバエ のいくつかの種は、どちらか一方のみを使用するように進化しました。[ 44 ] 雌は、隠れた雌の選択 に関してはほとんど制御できません。[ 42 ] [ 40 ] ショウジョウバエ の雌は、いくつかの交尾後メカニズムの 1 つである隠れた選択によって、近親交配の可能性を減らす精子を検出して排出することができます。[ 41 ] [ 40 ] Manier et al. (2013) は 、D. melanogaster 、D. simulans 、およびD. mauritiana の交尾後の性的選択を、受精、精子貯蔵、および受精可能な精子の 3 つの段階に分類しました。[ 42 ] 上記の種の間には、自然選択のプロセスで役割を果たす各段階の変異があります。[ 42 ] この精子競争は、種分化中の生殖隔離の確立の原動力であることがわかっています。[ 45 ] [ 46 ]
単為生殖と雌性発生 ショウジョウバエで は単為生殖は 起こらないが、gyn-f9 変異体では雌性発生が 低頻度で起こる。D . mangebeirai の自然集団はすべて雌であり、ショウジョウバエの中で唯一の絶対的単為生殖種である。parthenogeneticaとmercatorumでは単 為 生殖は任意である。[ 47 ] [ 48 ]
マイクロバイオーム 他の動物と同様に、ショウジョウバエの 腸内には様々な細菌が生息している。ショウジョウバエの腸内細菌叢(マイクロバイオーム)は、ショウジョウバエの 適応度や生活史特性に重要な影響を与えていると考えられている。ショウジョウバエ の腸内細菌叢 は、現在活発な研究分野となっている。
ショウジョウバエ種は、 ボルバキア やスピロプラズマ などの垂直伝達される内部共生体も保有している。これらの内部共生体は、ボルバキア によって誘発される細胞質不和合性や、 D. melanogaster Spiroplasma poulsonii (MSRO と命名)によって誘発される雄殺しなど、生殖操作因子として機能することがある。D. melanogaster MSRO 株の雄殺し因子は 2018 年に発見され、数十年来の雄殺しの原因の謎が解明された。これは、性特異的な方法で真核細胞に影響を与える最初の細菌因子であり、雄殺し表現型について特定された最初のメカニズムである。[ 59 ] あるいは、宿主を感染から保護することもある。ショウジョウバエのボルバキアは 感染時にウイルス量を減少させることができ、これらのボルバキアを 病原体媒介蚊に伝達することによってウイルス性疾患(例えばデング熱)を制御するメカニズムとして研究されている。 [ 60 ] ショウジョウバエ のS. poulsonii株は、宿主で はなく寄生虫を優先的に攻撃する毒素を使用して、宿主を寄生バチや線虫から保護する。[ 61 ] [ 62 ] [ 63 ]
ショウジョウバエ は最もよく使われるモデル生物の一つであるため、遺伝学において広く利用されてきました。しかし、温度などの非生物的要因 [ 64 ] がショウジョウバエ のマイクロバイオーム に及ぼす影響は、近年大きな関心を集めています。温度の特定の変動はマイクロバイオームに影響を与えます。高温(31 ℃(88 °F) )では、低温( 13 ℃(55 °F) )と比較して、D. melanogaster の腸内マイクロバイオーム におけるAcetobacterの 個体数が増加することが観察されました。低温では、ハエはより耐寒性があり、Wolbachiaの濃度も最も高くなりました。 [ 65 ]
腸内微生物叢は生物間で移植することもできる。低温で飼育されたショウジョウバエの腸内微生物叢を移植すると、ショウジョウバエの耐寒性が向上することがわかった。これは、腸内微生物叢が生理学的プロセスと関連していることを示し て いる。[ 66 ]
さらに、マイクロバイオームは攻撃性、免疫、産卵嗜好、運動、代謝 に役割を果たします。攻撃性に関しては、求愛行動中に一定の役割を果たします。無菌のハエは野生型のオスに比べて競争力が低いことが観察されました。ショウジョウバエ種のマイクロバイオームは、オクトパミンOAシグナル伝達によって攻撃性を促進することも知られています。マイクロバイオームは、これらのショウジョウバエの社会的相互作用、特に 求愛行動 や交尾行動 中に見られる攻撃行動に影響を与えることが示されています。[ 67 ]
神経化学 ショウジョウバエは、ヒトに見られるものと同様の、速効性の神経伝達物質をいくつか利用しており、これによってニューロン間の情報伝達や行動の調整が可能になっている。アセチルコリン、グルタミン酸、γ-アミノ酪酸(GABA)、ドーパミン、セロトニン、ヒスタミンはすべてヒトにも見られる神経伝達物質だが、ショウジョウバエにはノルアドレナリンのアナログである オクトパミン という別の神経伝達物質も存在する。アセチルコリンはショウジョウバエの中枢神経系で主に利用される興奮性神経伝達物質であり、GABAは主に抑制性神経伝達物質である。ショウジョウバエでは、 多くの神経伝達物質の効果は、関与する受容体やシグナル伝達経路によって変化するため、状況に応じて興奮性または抑制性のシグナルとして作用することができる。このような多様性によって、複雑な神経処理と行動の柔軟性が実現されている。
グルタミン酸は、特にショウジョウバエの神経筋接合部において、興奮性神経伝達物質として機能する。これは、脊椎動物ではこれらの接合部でアセチルコリンが用いられるのとは異なる。
ショウジョウバエ において、ヒスタミンは主に視覚系における神経伝達物質として機能する。光受容細胞から放出され、眼から脳へ視覚情報を伝達するため、視覚に不可欠な物質である。
多くの真核生物と同様に、ショウジョウバエは SNARE を発現し、他のいくつかの生物と同様に、SNARE複合体の構成要素はある程度代替可能であることが知られています。神経SNAREの構成要素であるSNAP-25の欠損は致命的ですが、 SNAP-24は それを完全に代替できます。別の例として、シナプス には通常存在しないR-SNAREが シナプトブレビン を代替することができます。[ 69 ]
体系学 D. setosimentum 、ハワイに生息するハエの一種現在定義されているショウジョウバエ 属は 側系統群 であり(下記参照)、記載されている種は1,450種であるが[ 3 ] [ 75 ] 、種の総数は数千種と推定されている[ 76 ] 。種 の大部分は、ショウジョウバエ亜属 (約1,100種)とソフォフォラ亜属 (D. (S.) melanogaster を含む;約330種)の2つの亜属に属している。
ハワイのショウジョウバエ 種(推定500種以上、記載されている種は約380種)は、独立した属または亜属であるIdiomyiaとして認識されることもあるが [ 3 ] [ 77 ] 、これは広く受け入れられていない。約250種は、ハワイのショウジョウバエから発生し、後に大陸地域に再定着した Scaptomyza 属に属している。
系統発生学的 研究からの証拠は、これらの属がショウジョウバエ 属内から発生したことを示唆している。[ 72 ] [ 73 ]
亜属名や属名のいくつかは、 Drosophila のアナグラムに基づいており、Dorsilopha 、Lordiphosa 、Siphlodora 、Phloridosa 、Psilodorha などが含まれる。
遺伝学 ショウジョウバエ 属は、遺伝学(集団遺伝学を含む)、細胞生物学、生化学、特に発生生物学においてモデル生物として広く利用されています。そのため、ショウジョウバエのゲノム配列決定に多大な努力が払われています。これらの種のゲノムは、2010年までに(ほぼ)完全に配列決定されました。[ 78 ]
このデータは、進化ゲノム比較など、さまざまな目的に使用されてきました。D . simulans とD. sechellia は姉妹種であり、交配すると生存可能な子孫が得られますが、D. melanogaster とD. simulansを交配すると不妊の 雑種 子孫が生まれます。ショウジョウバエのゲノムは、ミツバチ Apis mellifera や蚊Anopheles gambiae など、より遠縁の種のゲノムと比較されることがよくあります。
ショウジョウバエのmodEncodeプロジェクトは、 ショウジョウバエの ゲノムの注釈付け、転写産物、ヒストン修飾、転写因子、制御ネットワーク、およびショウジョウバエの 遺伝学のその他の側面のプロファイル作成、遺伝子発現の予測など、広範な作業を行った。[ 79 ]
FlyBaseは、 ショウジョウバエ の厳選されたゲノムデータの中央データベースとして機能します。[ 80 ]
の2007年にDrosophila 12 Genomes Consortiumは [ 81 ] 10個の新しいゲノムを発表し、 D. melanogaster とD. pseudoobscura の以前に公開されたゲノムと組み合わせて、属の進化の歴史と共通のゲノム構造を分析しました。これには、転移因子 (TE)の発見と、その進化の歴史の解明が含まれます。 [ 82 ] Bartoloméら(2009)は 、 D. melanogaster 、 D. simulans 、 D. yakuba のTEの少なくとも1/3が水平伝達によって獲得されたことを発見しました。 彼ら は 、100万年あたりTEファミリーあたり0.035の水平伝達イベントの平均率を発見しました。Bartoloméはまた、TEの水平伝達が他の関連性の指標に従っており、 D. melanogasterと D. simulans間の伝達イベントは、 D. yakuba との伝達イベントの2倍の頻度であること。 [ 82 ]
(ほぼ)全ゲノム配列が解読されたショウジョウバエ 属の種リストは増え続けている。2026年 3月現在 NCBI Genomes のページには、この属の下に 626 のゲノムアセンブリがリストされており、そのうち 254は参照とみなさ れ、91 は注釈が付けられています。[ 83 ] 成長の大部分は、シーケンス技術の向上によるものです。173 種の 183 の新規 単一ショウジョウバエゲノムを発表した 2024 年の研究では、サンプルあたり 150 ドルの費用が報告され、単一の研究室によって完了しました。[ 74 ] 16 か国にわたる 100 の研究室が参加した 2007 年のコンソーシアムの取り組みに必要な大規模な国際的な取り組みと比較してください。[ 81 ]
既に配列決定済みの種のゲノムは継続的に改良されている。例えば、 2015年のD. melanogaster (ISO-1株)参照ゲノムのリリース6は、「マッピングとシーケンスのためのクローンベースの技術を効果的に使い尽くし」、以前のリリースと比較して多数の修正を生み出した。反復配列は、将来のロングリードシーケンス技術によって埋められるべきギャップとして残っている。[ 84 ] 2024年には、 D. melanogaster Canton S株のほぼ完全な「テロメアからテロメアまで 」のゲノムアセンブリが作成され、リリース6ゲノムのギャップの93.28%が埋められた。[ 85 ]
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