アダム・C・シーペル

アダム・シーペル
2009 年のアダム・シーペル。
生まれる	アダム・C・シーペル ( 1972-06-24 )1972年6月24日（52歳） アメリカ合衆国
母校	コーネル大学（学士） ニューメキシコ大学（MS） カリフォルニア大学サンタクルーズ校（博士号）
知られている	進化的に保存された配列
受賞歴	パッカードフェローシップ（2007） マイクロソフト リサーチ ファカルティ フェローシップ (2007) 国立科学財団キャリア賞（2007） スローンフェローシップ（2009） グッゲンハイムフェローシップ（2012）
科学者としてのキャリア
フィールド	ゲノミクス 分子進化 計算生物学 遺伝子制御 集団遺伝学[1]
機関	コールドスプリングハーバー研究所 コーネル大学 ロスアラモス国立研究所 国立ゲノム資源センター
論文	比較哺乳類ゲノミクス：進化モデルと機能要素の検出 （2005）
博士課程の指導教員	デビッド・ハウスラー
Webサイト	シーペルラボ

アダム・C・シーペル（1972年生まれ）は、比較ゲノム学と集団遺伝学、特に進化的に保存された配列を識別するための統計的手法とソフトウェアツールの開発に関する研究で知られるアメリカの計算生物学者です。^{[1] [2] [3] [4]シーペルは現在、}コールドスプリングハーバー研究所 のシモンズ定量生物学センターの議長とワトソン生物科学学校の教授を務めています。^[5]

シーペル氏は、1994年にコーネル大学で農業生物工学の学士号を取得し、その後1996年までロスアラモス国立研究所に勤務しました。1996年から2001年にかけては、サンタフェにある国立ゲノム資源センターでソフトウェア開発者として勤務する一方、ニューメキシコ大学でコンピュータサイエンスの修士号を取得しました。2005年にはカリフォルニア大学サンタクルーズ校でコンピュータサイエンスの博士号を取得しました。 2006年から2014年までコーネル大学の教授を務め、 2014年に コールドスプリングハーバー研究所に異動しました。

シーペルは、コンピュータサイエンス、統計学、進化生物学、ゲノミクスが交わる領域におけるさまざまな問題に取り組んできました。ロスアラモス国立研究所では、 HIVの組み換え株を検出するための系統学的手法を開発し、^[6]国立ゲノム資源センターでは、異種のバイオインフォマティクスデータベース、分析ツール、視覚化プログラムを統合する技術であるISYSの開発を主導しました。^{[7]シーペルはまた、}ニューメキシコ大学のバーナード・モレと共同で、ゲノム再構成に基づく系統樹再構築 のアルゴリズムに関する理論的研究も行いました。^{[8]シーペルはソフトウェア開発を離れ}、カリフォルニア大学サンタクルーズ校のデビッド・ハウスラーの研究室 に参加した後、比較ゲノミクスの計算問題に取り組みました。ハウスラーのグループでは、系統学的隠れマルコフモデルに基づくいくつかの解析手法を開発しました。その中には、ゲノム配列中の進化的に保存された配列を識別するためのphastConsと呼ばれる広く使用されているプログラムも含まれています。^[9]

コーネル大学では、シーペルの研究グループは保存された非コード配列の特定と特徴づけの研究を続けました。彼らはまた、ヒトの加速領域を含むコード領域^[10]と非コード領域^[11]の両方で急速に進化する配列を研究しました。近年、シーペル研究室はヒト集団遺伝学にますます重点を置いており、主要な集団グループが最初に分岐した初期の人類史の時期を推定する方法^[12] 、転写因子結合部位に対する自然選択の影響を測定する方法^[13]、およびヒトゲノム全体の突然変異が適応度の結果をもたらす確率を推定する方法^{[14]を開発しています。このグループはまた、}ジョン・T・リスの研究室 と密接に協力して、転写制御 の研究プログラムを活発に実施しています。

シーペルの研究の共通テーマは、ゲノムが時間の経過とともに進化する複雑なプロセスに対する正確な数学モデルの開発です。彼の研究グループは、これらのモデルをコンピューターサイエンスと統計の技術と組み合わせて、過去を覗き見るとともに、人間の健康にとって実際的に重要な問題に取り組んでいます。^[15]

シーペルは2012年にグッゲンハイムフェローシップを受賞しました。 ^[15] また、2007年にはデイビッド・アンド・ルシール・パッカード科学工学フェローシップ、2007年にはマイクロソフトリサーチファカルティフェローシップ、 2009年にはスローンリサーチフェローシップも受賞しました。