進化ダイナミクスは、遺伝的変化と表現型変化の両方をモデル化するために微分方程式を使用する研究から発展した、数理進化生物学の一分野です。[ 1 ]したがって、遺伝的変化に焦点を当てる集団遺伝学や量的遺伝学、および時間の経過に伴う個体群サイズの変化を記述するものの遺伝的変化を含まない個体群ダイナミクスとは異なります。メイナード・スミスとプライス[ 2 ]によって生物学に初めて適用された進化ゲーム理論は、頻度依存選択の重要性を示すことで生態学と進化の間の重要なつながりを導入しましたが、当初は個体群ダイナミクスの変化への柔軟なつながりを提供しませんでした。
1990年代、研究者たちは微分方程式を用いて生態学的モデルと遺伝学的モデルを結び付け、進化ダイナミクスを導き出す可能性を理解し始めた。[ 3 ]一部の研究者は適応ダイナミクス[ 4 ]または進化的侵入分析[ 5 ]という用語を好む。この研究の共通の特徴は、生態学的概念や表現型および遺伝的変化を考慮できる方法で進化的変化をモデル化するために微分方程式を使用することである。
微分方程式を時間経過に伴う変化を記述する手段として用いる手法は、ライプニッツとニュートンによる微積分学の発明、そしてその直後のヤコブ・ベルヌーイの研究にまで遡る。しかし、微分方程式が生物学に応用されるようになったのは、ずっと後のことである。
アルフレッド・J・ロトカとヴィト・ヴォルテラは、捕食者と被食者の種の個体群動態相互作用の単純な記述モデルを生成する一対の微分方程式であるロトカ・ヴォルテラ方程式を独立に開発しました。これは20世紀初頭に行われました。このモデルには、微分方程式がそうであるように、時間を表すパラメータと、2種の個体数を表す他のパラメータが含まれています。[ 6 ]基本的なロトカ・ヴォルテラ方程式は、より多くの種または個体群間の相互作用を表すように、また捕食者と被食者の相互作用よりも競争的な相互作用を表すように拡張できます。
個体数の経時的な変化だけでは、進化的な変化を完全に理解するには不十分である。たとえ進化的な変化が同時に起こっているとしても、個体数だけでは遺伝的な詳細を説明できないからである。
遺伝学は通常、グレゴール・メンデルの実験に端を発すると考えられているが、残念ながら、彼の貢献は、現在メンデル遺伝学として知られるものが再発見され、現代の集団遺伝学の基礎が提供されるまで、見過ごされてきた。[ 7 ]集団遺伝学は、離散的な遺伝形質の数学的モデル化を可能にする。単純な仮定は進化の時間における離散的な変化から始まるが、より複雑な仮定では微分方程式の解法が必要となる。[ 7 ] : 119集団遺伝学に含まれないものは、集団動態などの生態学的特徴である。
連続遺伝形質の進化を研究する場合、量的遺伝学は数学的な方法でそれらを理解する手段を提供する。[ 8 ] [ 9 ]集団遺伝学と同様に、集団動態は考慮しない。
メイナード・スミスとプライスは、 1973年に経済学の手法を動物の闘争戦略に適用した。[ 2 ]これは進化ゲーム理論であり、その後メイナード・スミス[ 10 ]や他の研究者[ 11 ]によって進化生物学全般に応用されるよう大きく拡張された。生物学に応用される進化ゲーム理論の重要な概念は、進化的に安定な戦略(ESS)である。メイナード・スミスが定義したように、「ESSとは、集団のすべての個体がそれを採用すれば、自然選択の影響下で突然変異した戦略が集団に侵入できないような戦略である」[ 10 ] : 11という点が重要である。
このように、進化ゲーム理論は、集団遺伝学や量的遺伝学を考慮することなく、行動戦略による進化の結果を記述する手段を提供する。しかし、何かが欠けている。進化的にESSは実際に到達できるのだろうか?テイラーとヨンカー(1978)は、進化的にESSの周りのダイナミクスは微分方程式で記述できることを示した。[ 12 ]その後、ノワク(1990)[ 13 ]は、進化的に決して到達できないESSが存在する可能性があることを示した。
これらの発見は進化ゲーム理論を無意味なものにしたのではなく、むしろ2つの非常に重要な点を示した。
数学的手法を用いて進化の変化を研究するための膨大な技術が既に存在する中で、なぜ進化ダイナミクスという数学生物学の別の分野が必要とされ、どのようにして生まれたのだろうか?
進化的に安定な戦略から離れた進化ゲーム理論のダイナミクスの研究は、表現型レベルでの進化変化のすべての側面を説明できないことを示した。進化を理解する手段としての集団遺伝学と量的遺伝学の成功は、進化変化に集団ダイナミクスを含める機会をもたらさなかった。生態学と進化を結びつける以前の研究に基づいた新しいモデルが必要とされた。[ 1 ]
進化ダイナミクスのモデル例を以下に説明します。これは、ディークマンとロー(1996)の研究[ 14 ]に基づいており、後述するように、彼ら以前の他の進化研究者の研究を参考にしています。
ディークマンとロー[ 14 ]は、以下の仮定に基づいて研究を行った。
上記の仮定に基づいて、ディークマンとロー[ 14 ]: 581は次の式を提案している。
式(1)は、適応形質値の時間経過に伴う変化率を表す。生態系コミュニティにおいて種。
特性値を持つ個体の進化的な適応度を測定する特性値を持つ居住人口を背景に。進化変化の速度を尺度化する。これらは非負でなければならない。
なぜ負の値であってはなりませんか? 1つ以上が負の値の場合、研究対象の他の種に対する1つ以上の種の適応度値が反転します。ゼロにすることもできますが、その場合は1つ以上の種が研究から除外されるだけです。
式( 1)の一般形の式は以前から提案されており[ 20 ] [ 21 ] 、はるか以前に( Sewall Wrightによって)提唱された適応度ランドスケープの概念に関連している。
式( 1 )の利点は、適応表現型形質の進化ダイナミクスに関する幅広いシナリオの探索を可能にし、これがさらなる応用を促進したことである。
設定これにより、形質値の進化ダイナミクスがゼロとなる点を特定できます。これらのいくつかは、達成可能であると仮定すれば、進化的に安定な戦略となります[ 21 ]。つまり、収束安定性を備えているということです[ 22 ] 。
これらの点の中には、進化的な変化によって形質値の進化動態がゼロになる点を超えてしまう可能性がある、三次関数の鞍点に似ているものもあるかもしれない。
進化形質ダイナミクスのゼロ点の他のポイントは、適応度の最小値である可能性がある。これらのポイントが収束安定である場合、これらのポイントで選択が起こり(破壊的選択と呼ばれる)、形質空間の複数の方向で形質値がゼロ形質ダイナミクスのポイントから進化的に分岐する。これは進化的分岐として説明されている。進化的分岐は、種分化を理解するために研究されてきた。[ 23 ]
進化ダイナミクスがゼロとなるこれら3種類の進化ポイントを分類する際、特定のパラメータを設定せずにどのタイプがどこで発生するかを記述することは不可能であるため、上記の段落では「一部は…」、「その他は…かもしれない」という表現が用いられている。これらのポイントの分類の詳細については、[ 4 ]: 310-314および特に[ 24 ]を参照のこと。[ 24 ]: 65
これらのモデルはどのようなことに適用されるのでしょうか?種分化については既に述べました。[ 25 ] Ferriere et al. (2002) は、上記の進化ダイナミクスモデルに基づくモデルを使用して、相利共生の安定性に関する生態学的問題を扱いました。 [ 26 ] Bonsall et al. (2004) は、関連するモデルを生活史トレードオフの進化に適用しました。 [ 27 ]反対種に適応する種の継続的な進化に関する赤の女王仮説(『鏡の国のアリス』の赤の女王のレースにちなんで名付けられました)も、この種のモデルを使用して実証されています。[ 28 ]
ブルームとリヒター(2007)は、盗み寄生(盗みの進化)のゲーム理論モデルを拡張し、微分方程式を用いてモデル化できるようにした。 [ 29 ]これにより、彼らは新しい混合戦略を発見することができた。もう1つの活発な応用分野は、宿主-寄生生物または宿主-病原体の相互作用の進化である。[ 30 ] [ 31 ]
他の研究者たちは独自に、幹細胞の進化をよりよく理解するために、細胞レベルで進化ダイナミクスの概念を適用した。[ 32 ]彼らの研究から得られたインスピレーションは、将来の医療療法に役立つ可能性がある。
これらは、進化ダイナミクスという、現在も発展を続ける研究分野の応用例の一部である。