子嚢菌類

子嚢菌類 時間範囲:デボン紀前期-現在[1] 前Ꞓ Ꞓ お ス だ Ｃ ポ T J け ページ いいえ
サルコシファ コッキネア
科学的分類
ドメイン：	真核生物
王国：	菌類
サブ王国:	ディカリヤ
分割：	子嚢菌門 ( Berk. ) Caval.-Sm. (1998) [2]
区分とクラス
ペジゾ菌綱 菌類 コニオシボミセス ドチデオミセテス ユーロチオミセテス ジオグロッソミケス ラブルベニオミセス レカノロミセス レオチオミセテス リキノミセテス 雑食菌類 オルビリオミセス ペジゾミセス ソルダリオ菌類 木質菌類 「未発注の注文」 ラミア目 イチクラハマディオン トリブリディア目 サッカロミコチナ サッカロミセス タフリノミコチナ アーキオリゾミセス ネオレクトミセス ニューモシスチス菌 分裂サッカロミセス タフリノミセス

子嚢菌門は菌類界に属する門で、担子菌門とともにディカリア亜界を形成する。子嚢菌門に属するものは一般に子嚢菌類または子嚢菌類として知られている。菌類の中では最大の門であり、64,000種以上が存在する。^[3]この菌類グループの特徴は「子嚢」（古代ギリシャ語のἀσκός ( askós )  「袋、皮袋」に由来）であり、子嚢胞子と呼ばれる運動しない胞子が形成される微細な有性構造である。しかし、子嚢菌門のいくつかの種は無性であり、子嚢や子嚢胞子を形成しない。子嚢菌のよく知られた例としては、アミガサタケ、トリュフ、ビール酵母とパン酵母、デッドマンズフィンガー、カップ菌などがある。クラドニアなどの地衣類の大部分（広義には「子嚢菌類」と呼ばれる）の菌類共生生物は子嚢菌門に属します。

子嚢菌類は単系統群（共通の祖先から派生したすべての種を含む）である。以前は他の菌類分類群の無性種とともに担子菌類に分類されていたが、現在では無性（またはアナモルフィック）子嚢菌類は、子嚢を持つ分類群との形態学的または生理学的類似性、およびDNA配列の系統解析に基づいて識別・分類されている。^{[4] [5]}

子嚢菌は、抗生物質などの医療上重要な化合物の供給源として、またパン、アルコール飲料、チーズの発酵のために、人間にとって特に有用である。子嚢菌の例には、チーズに生息するペニシリウム属の菌や、細菌感染症の治療に用いられる抗生物質を産生する菌などがある。

多くの子嚢菌は、人間を含む動物と植物の両方に対して病原体である。人間に感染症を引き起こす子嚢菌の例としては、カンジダ・アルビカンス、黒色コウジカビ、皮膚感染症を引き起こす数十種などがある。多くの植物病原性子嚢菌には、リンゴ黒星病、イネいもち病、麦角菌、黒星病、うどんこ病などがある。冬虫夏草属は昆虫病原菌であり、昆虫に寄生して殺す。ボーベリアなど他の昆虫病原性子嚢菌は、生物学的害虫駆除に効果的に使用されている。

子嚢菌類のいくつかの種は、実験室研究における生物学的モデル生物です。最も有名なのは、Neurospora crassa、いくつかの酵母種、およびAspergillus種であり、多くの遺伝学および細胞生物学の研究で使用されています。

子嚢菌類は「胞子発射菌」です。子嚢菌類は、特殊な細長い細胞または袋の中に微細な胞子を生成する菌類で、この胞子が子嚢菌類のグループ名の由来となっています。

無性生殖は子嚢菌類の繁殖の主な形態であり、これらの菌類が新しい地域に急速に広がる原因となっています。子嚢菌類の無性生殖は、構造的および機能的観点から非常に多様です。最も重要かつ一般的なのは分生子の生成ですが、厚膜胞子の生成も頻繁に行われます。さらに、子嚢菌類は出芽によって無性生殖も行います。

無性生殖は、栄養生殖胞子である分生子を通じて起こることがある。真菌の無性で運動性のない半数体胞子は、ギリシア語で塵を意味する「conia」にちなんで名付けられ、分生胞子とも呼ばれる。分生胞子は通常 1 つの核を含み、有糸分裂細胞分裂の産物であるため、有糸胞子と呼ばれることもある。有糸胞子は、その起源である菌糸と遺伝的に同一である。分生胞子は通常、特殊な菌糸である分生柄の末端に形成される。種によっては、風や水、動物によって散布されることがある。分生柄は菌糸から単純に枝分かれする場合もあれば、子実体の中で形成される場合もある。

胞子形成（分生子形成）の先端を形成する菌糸は、通常の菌糸の先端と非常によく似ている場合もあれば、分化している場合もあります。最も一般的な分化は、胞子が生成されるフィアライドと呼ばれるボトル型の細胞の形成です。これらの無性構造のすべてが単一の菌糸であるわけではありません。一部のグループでは、分生柄（分生子を持つ構造）が集まって厚い構造を形成します。

例えば、モニリア目では、コアミアまたはシネマと呼ばれる集合体を除いて、すべてが単一の菌糸です。これらは、コーンストークスに似た構造を形成し、集合した分生柄から多くの分生子が大量に生成されます。

多様な分生子と分生柄は、異なる特徴を持つ無性胞子果（例えば、子嚢菌、分生子柄、胞子嚢菌）で発達することがある。子嚢菌類のいくつかの種は、植物組織内に寄生または腐生として構造を形成する。これらの菌類は、おそらく基質としての植物組織の培養条件の影響を受けて、より複雑な無性胞子構造を進化させた。これらの構造は胞子嚢菌と呼ばれる。これは、植物組織内の偽実質間質から作られた分生柄のクッションである。分生子柄は、球形からフラスコ形の実質構造で、内壁に分生柄が並んでいる。子嚢菌は、植物のクチクラの下に生成される平らな受け皿型の分生柄床で、最終的にはクチクラを突き破って散布される。

子嚢菌の無性生殖プロセスには、酵母ではっきりと観察される出芽も含まれています。これは「芽生えプロセス」と呼ばれます。菌糸の先端壁の吹き出しまたは気泡形成が伴います。芽生えプロセスはすべての細胞壁層に関係する場合もあれば、古い細胞壁から押し出された新しい細胞壁が合成される場合もあります。

出芽の初期段階は、芽が出現しようとしている地点の周囲にキチン質のリングが形成されることとみなすことができます。これにより細胞壁が強化され、安定化します。酵素の活動と膨圧により細胞壁が弱まり、押し出されます。この段階で新しい細胞壁物質が組み込まれます。細胞の内容物は子孫細胞に押し込まれ、有糸分裂の最終段階が終了すると、新しい細胞壁が内側に成長する地点である細胞板が形成されます。

• 子嚢菌類は形態的に多様です。このグループには、単細胞酵母から複雑なカップ菌類までの生物が含まれます。
• 地衣類の98％は、地衣類の菌類部分として子嚢菌類を持っています。^[6]
• 子嚢菌類には 2,000 の属と 30,000 の種が存在します。
• これらの多様なグループに共通する特徴は、子嚢と呼ばれる生殖器官の存在ですが、場合によっては、ライフサイクルにおけるその役割が縮小されます。
• 多くの子嚢菌は商業的に重要です。パン焼き、醸造、ワインの発酵に使用される酵母や、高級珍味とされるトリュフやアミガサタケなど、有益な役割を果たすものもあります。
• それらの多くは、オランダニレ病やリンゴ枯れ病などの樹木の病気を引き起こします。
• 植物病原性の子嚢菌には、リンゴ黒星病、イネいもち病、麦角菌、黒星病、うどんこ病などがあります。
• 酵母はアルコール飲料やパンの製造に使われます。ペニシリウムというカビは抗生物質ペニシリンの製造に使われます。
• 子嚢菌門に属する生物のほぼ半数が藻類と共生関係を形成して地衣類を形成します。
• その他、アミガサタケ（非常に貴重な食用菌類）などは、植物と重要な菌根関係を形成し、それによって水分や栄養素の吸収を促進し、場合によっては昆虫からの保護も提供します。
• 子嚢菌類のほとんどは陸生または寄生性である。しかし、一部は海洋または淡水環境に適応している。2015年現在、子嚢菌類には352属に分布する805種の海洋菌類が存在する。 ^[7]
• 菌糸の細胞壁は、担子菌類と同様に、キチンとβ-グルカンで多様に構成されています。しかし、これらの繊維は、ガラクトースとマンノースの糖を含む糖タンパク質のマトリックス内に配置されています。
• 子嚢菌類の菌糸は通常、隔壁のある菌糸から構成されます。しかし、それぞれの分裂における核の数は必ずしも一定ではありません。
• 隔壁は隔壁孔を有し、個々の菌糸全体にわたって細胞質の連続性を保つ。適切な条件下では、核は隔壁孔を通って隔壁区画間を移動することもある。
• 子嚢菌類のユニークな特徴は（すべての子嚢菌類に見られるわけではないが）、隔壁の孔を制御する菌糸セグメントを分ける隔壁の両側にウォロニン小体が存在することである。隣接する菌糸が破裂すると、ウォロニン小体が孔を塞ぎ、破裂した区画に細胞質が失われるのを防ぐ。ウォロニン小体は、結晶性タンパク質マトリックスを持つ球形、六角形、または長方形の膜結合構造である。

記述され認められている亜門は3 つあります。

• ペジゾ菌亜門は最大の亜門で、子嚢菌亜門に属するNeolecta属を除く子嚢果（子実体）を形成するすべての子嚢菌類を含む。これは、以前の分類群である真正子嚢菌類とほぼ同等である。ペジゾ菌亜門には、トリュフ、麦角、子嚢菌類、カップ菌類（盤菌類）、ピレノマイセス類、ローケル菌類、冬虫夏草など、ほとんどの肉眼で見える「子嚢菌」が含まれる。^[8]また、うどんこ病菌、皮膚糸状菌、ラブールベニアル目などの微視的な菌類も含まれる。
• サッカロミコチナは、パン酵母やカンジダなどの「真の」酵母のほとんどを構成します。これらは単細胞菌で、出芽によって栄養繁殖します。これらの種のほとんどは、以前は半子嚢菌類と呼ばれる分類群に分類されていました。
• Taphrinomycotinaには、分子 ( DNA ) 分析によって認識された子嚢菌門内の異なる基底グループが含まれます。この分類群は、もともとArchiascomycetes (またはArchaeascomycetes ) と名付けられました。これには、菌糸菌 ( Neolecta、Taphrina、Archaeorhizomyces )、分裂酵母 ( Schizosaccharomyces )、および哺乳類の肺寄生虫Pneumocystisが含まれます。

形態学的特徴に基づくいくつかの時代遅れの分類名が、子嚢菌門の種に対して今でも時々使用されている。これらには、有性子実体の構造によって定義される以下の有性（テレオモルフ）グループが含まれる：子嚢菌綱（すべての種が子のう殻を形成する）、菌類綱（子のう殻または偽子のう殻、またはこれらの形態学的構造に類似する構造を形成するすべての嚢菌類）、およびプレクトマイセテス（閉子殻を形成する種を含む）。半子嚢菌綱には、現在サッカロ菌綱またはタフリノミコチナに分類されている酵母および酵母様菌類が含まれ、一方、真子嚢菌綱には、現在ペジゾ菌綱に分類されている子嚢菌門の残りの種と、タフリノミコチナに分類されている新レクタ種が含まれていた。

子嚢菌類の中には、有性生殖をしないものや子嚢を生成しないことが知られており、そのためアナモルフィック種と呼ばれるものもある。分生子（有糸分裂胞子）を生成するアナモルフィック種は、以前は有糸分裂胞子子嚢菌門と呼ばれていた。分類学者の中には、このグループを別の人工門である不完全菌門（または「不完全菌」）に分類した者もいる。最近の分子解析により子嚢を持つ分類群との密接な関係が特定された場合、定義となる子嚢がないにもかかわらず、アナモルフィック種は子嚢菌門に分類されている。同じ種の有性生殖分離株と無性生殖分離株は、通常、異なる二名法の種名を持ち、たとえば、同じ種の無性生殖分離株にはAspergillus nidulans、有性生殖分離株にはEmericella nidulansがそれぞれ付けられる。

不完全菌類の種は、分生子をフラスコや受け皿のような小さな分生子胞子（専門的にはピクニディアやアセルヴュリと呼ばれる）に形成する場合、体菌類に分類された。^[9]菌類は、分生柄（すなわち、分生子形成細胞を末端に運ぶ菌糸構造）が自由または緩く組織化された種である。それらはほとんどが孤立しているが、平行に並んだ細胞の束（シネマタルと表現される）として、またはクッション状の塊（スポロドキアと表現される）として現れることもある。^[10]

ほとんどの種は、糸状の微細構造である菌糸、または出芽した単一細胞（酵母）として成長する。多数の相互接続された菌糸が、通常菌糸体と呼ばれる仮根を形成し、肉眼（肉眼）で見える場合、一般にカビと呼ばれる。多くの子嚢菌類は、有性生殖中に、典型的には多数の子嚢を生成する。子嚢は、多細胞で、時折容易に目に見える果実構造である子嚢果（子嚢嚢とも呼ばれる）に含まれていることが多い。子嚢果の形状は非常に多様である：カップ形、棍棒形、ジャガイモ状、スポンジ状、種子状、滲出液およびニキビ状、サンゴ状、卵状、ゴルフボール形、穴の開いたテニスボール状、クッション形、小型で板状および羽毛状（ラブルベニア目）、微細な古典ギリシャの盾形、柄のあるまたは無柄。子嚢果は、単独で現れることもあれば、密集して現れることもある。子嚢菌の質感も同様に非常に多様で、炭のような肉質、革のような、ゴムのような、ゼラチンのような、ぬるぬるした、粉っぽい、またはクモの巣のような質感があります。子嚢菌は、赤、オレンジ、黄色、茶色、黒、まれに緑や青など、さまざまな色があります。サッカロミセス・セレビシエなどの子嚢菌類は単細胞の酵母として成長し、有性生殖中に子嚢に成長しますが、子実体を形成しません。

地衣類化した種では、菌類の葉状体が共生コロニーの形状を決定します。カンジダ・アルビカンスなどの一部の二形性種は、単細胞としての成長と糸状の多細胞菌糸としての成長を切り替えることができます。他の種は多形性であり、無性（アナモルフィック）および有性（テレオモルフィック）の成長形態を示します。

地衣類を除いて、ほとんどの子嚢菌類の非生殖（栄養）菌糸は、通常、土壌などの基質に埋め込まれているか、生きた宿主の表面または内部で成長するため目立たず、子嚢菌のみが果実を形成しているときにのみ見られる。菌糸壁のメラニンなどの色素沈着と表面での増殖により、目に見えるカビのコロニーが発生することがある。例としては、浴室のコーキングやその他の湿った場所に黒い斑点を形成するCladosporium属が挙げられる。多くの子嚢菌類は食品の腐敗を引き起こすため、ジャム、ジュース、その他の食品に発生するペリクルまたはカビの生えた層は、これらの種の菌糸、または時にはMucoromycotinaであり、担子菌類であることはほとんどない。特に熱帯地方の植物に発生するすす病菌は、多くの種の葉状体である。^{[説明が必要]}

酵母細胞の大きな塊、子嚢または子嚢のような細胞、または分生子も、肉眼で見える構造を形成することがあります。例えば、ニューモシスティス属は肺腔に定着し（X線で見える）、肺炎の一種を引き起こすことがあります。^[11] Ascosphaeraの子嚢はミツバチの 幼虫と蛹を満たし、チョークのような外観のミイラ化を引き起こすため、「チョークブルード」という名前が付けられています。^{[12]酵母は}体外および体内で小さなコロニーを形成し、口や膣内でのカンジダ属の過剰な増殖は、カンジダ症の一種である「カンジダ症」を引き起こします。

子嚢菌の細胞壁には、ほとんどの場合キチンとβ-グルカンが含まれており、菌糸内の「隔壁」と呼ばれる区画が個々の細胞（または区画）の内部境界となっている。細胞壁と隔壁は菌糸に安定性と剛性を与え、細胞壁と細胞膜が局所的に損傷した場合に細胞質が失われるのを防ぐことができる。隔壁は、通常、中央に小さな開口部があり、隣接する細胞間の細胞質接続として機能するほか、菌糸内で核が細胞から細胞へ移動できるようにすることもある。ほとんどの子嚢菌の栄養菌糸には、細胞あたり核が1つしか含まれていない（単核菌糸）が、多核細胞（特に成長中の菌糸の先端部）が存在することもある。

他の菌門と同様に、子嚢菌門はエネルギー源として有機化合物を必要とする従属栄養生物です。これらは、死骸、食品、または他の生物の内外の共生生物など、さまざまな有機基質を食べることで得られます。子嚢菌類は、周囲からこれらの栄養素を得るために、有機物質をより小さな分子に分解する強力な消化酵素を分泌し、それが細胞に取り込まれます。多くの種は、葉、小枝、丸太などの植物の死骸を食べて生活します。いくつかの種は、植物、動物、または他の菌類に寄生または共生共生生物として定着し、宿主の組織から栄養素の形で代謝エネルギーをすべて得ます。

子嚢菌類は長い進化の歴史を経て、ほぼあらゆる有機物を分解する能力を発達させてきた。ほとんどの生物と異なり、子嚢菌類はセルロースやリグニンなどの植物性バイオポリマーを自身の酵素を使って消化することができる。動物に豊富に含まれる構造タンパク質であるコラーゲンや、髪や爪を形成するタンパク質であるケラチンも食料源となる。珍しい例としては、壁のペンキを食べるアウレオバシジウム・プルランスや、航空機燃料を食べ（航空業界に時折問題を引き起こす）、燃料パイプを詰まらせることもある灯油菌のアモルフォテカ・レシネなどが^{ある。 [13]他の種は高}浸透圧ストレスに耐えることができ、例えば塩漬けの魚で成長し、いくつかの子嚢菌は水生である。

子嚢菌門は高度に特殊化していることが特徴で、例えば、ラブルベニア目の特定の種は、特定の昆虫種の特定の脚1本だけを攻撃する。多くの子嚢菌門は、地衣類などの共生関係（緑藻類やシアノバクテリアとの共生関係）に従事し、共生菌は光合成の産物を直接得る。多くの担子菌類やグロメロ菌門と同様に、一部の子嚢菌は根に定着して菌根関係を形成することで植物と共生する。子嚢菌門には、アメーバなどの小型原生生物や、線虫（線虫）、ワムシ、クマムシ、トビムシ（トビムシ）などの小型節足動物を捕獲するための菌糸トラップを発達させた肉食菌もいくつか含まれる。

子嚢菌門は世界中のあらゆる陸上生態系に存在し、南極大陸を含むすべての大陸に生息している。^[14]胞子と菌糸の断片は、大気や淡水環境、海岸や潮汐帯を通じて拡散する。種の分布は多様で、すべての大陸で見られる種もあれば、白トリュフ Tuber magnatumのようにイタリアと東ヨーロッパの孤立した場所にのみ生息する種もある。^[15]植物寄生種の分布は、多くの場合、宿主の分布によって制限される。例えば、Cyttariaは南半球ではNothofagus（南部ブナ）でのみ見られる。

無性生殖は子嚢菌類における主要な繁殖形態であり、これらの菌類が新しい地域に急速に広がる原因となっている。これは栄養生殖胞子、分生子を介して起こる。分生子胞子は通常 1 つの核を含み、有糸分裂細胞分裂の産物であるため、有糸胞子と呼ばれることもある。分生子胞子は、その起源である菌糸と遺伝的に同一である。分生子胞子は通常、特殊な菌糸、分生柄の端に形成される。種によっては、風や水、動物によって 散布されることもある。

無性胞子の種類は、色、形、個々の胞子として放出される方法によって識別できます。胞子の種類は、子嚢菌類の分類における分類学的特徴として使用できます。最も一般的な種類は単細胞胞子で、アメロスポアと呼ばれます。胞子が交差壁 (隔壁) によって 2 つに分かれている場合は、二分胞子と呼ばれます。

2つ以上の横壁がある場合、胞子の形状によって分類されます。隔壁が梯子の横木のように横向きの場合は隔壁胞子、網状の構造の場合はディクチオスポアです。スタウロスポアでは、放射状の腕が中心体から放射状に伸びています。その他の胞子（ヘリコスポア）では、胞子全体がバネのように螺旋状に巻き付いています。長さと直径の比が15:1を超える非常に長い虫のような胞子は、スコレコスポアと呼ばれます。

子嚢菌類の無形生物の重要な特徴は、胞子形成と裂開（親構造からの分離）を含む分生子形成である。分生子形成は動物と植物の発生学に対応し、2つの基本的な発達形態に分けられる。分生子形成では、胞子は分生子形成菌糸から分離する前にすでに明らかであり、体状分生子形成では、交差壁が形成され、新しく生成された細胞が胞子に発達する。胞子は、それらを拡散するのに役立つ大規模な特殊構造で生成される場合と、生成されない場合がある。

これら 2 つの基本タイプは、さらに次のように分類できます。

• 芽胞性頂花序（分生子形成菌糸の先端で繰り返し出芽し、先端に最も若い胞子を持つ胞子の連鎖が形成される）、
• 分裂同期（中心細胞から同時に胞子が形成され、最初の胞子から二次的な頂花胞子連鎖が形成されることもある）、
• 胞子形成型（主胞子の後ろから横向きに胞子が繰り返し形成され、最も古い胞子が主先端に位置する）
• 胞子環形胞子（各胞子が分離し、前の胞子が残した傷跡の内側にリング状の傷跡を残す）、
• 芽胞性フィアライド（胞子はフィアライドと呼ばれる、長さが一定である特殊な分生子形成細胞の開口端から発生し、排出される）、
• 基底分裂（分生子の連鎖が、発育段階が若い順に母細胞から放出される）
• 分裂退行型（胞子は分生子形成菌糸の先端近くに横壁を形成して分離し、次第に短くなる）、
• 節足動物（二重細胞壁が分生子形成菌糸を細胞に分割し、分生子が分生子と呼ばれる短い円筒形の胞子に成長する。時には細胞が2つに1つ死滅し、分生子だけが残る）、
• 孤立性（大きな膨らんだ細胞が分生子形成菌糸から分離し、内壁を形成し、隔壁胞子に発達する）。

分生子は肉眼で見える構造で生成される場合があり、胞子の拡散に役立ちます。これらの構造は「分生子腫」（単数形：分生子腫）と呼ばれ、分生子（フラスコ型で菌類組織で発生）または胞子嚢（クッション型で宿主組織で発生） の形をとることがあります。

裂開は 2 つの方法で起こります。分裂裂開では、細胞間に中央のラメラ (層) を持つ二重の分割壁が形成され、中央の層が崩壊して胞子が放出されます。裂開裂では、外側で胞子を結合している細胞壁が退化し、分生子が放出されます。

子嚢菌類のいくつかの種は、有性周期を持たないことが知られています。そのような無性種は、異核症や準性生殖を伴うプロセスによって、個体間で遺伝子組み換えを起こすことができる可能性があります。

パラセクシュアルとは異核共生の過程を指し、^[16]異なる個体に属する2つの菌糸が融合することで引き起こされる吻合と呼ばれる過程に続いて、菌糸体内に遺伝的に異なる細胞核をもたらす一連の事象が起こる。^{[17]核の融合の後には}配偶子形成などの減数分裂事象 は起こらず、核あたりの染色体数の増加をもたらす。有糸分裂交差により組換え、すなわち相同染色体間の遺伝物質の交換が可能になる場合がある。その後、染色体数は核分裂によって半数体状態に戻り、それぞれの娘核は元の親核とは遺伝的に異なる。^[18]あるいは、核が染色体の一部を失い、異数体細胞となる場合もある。 カンジダ・アルビカンス（サッカロミセス綱）は、性交代周期を持つ真菌の一例です（カンジダ・アルビカンスおよび性交代周期を参照）。

子嚢菌類における有性生殖は子嚢の形成につながり、子嚢はこの菌類グループを定義し、他の菌類門と区別する構造です。子嚢は管状の容器である減数胞子嚢で、その中に減数分裂によって生成された有性胞子（子嚢胞子）が含まれます。

カンジダ・アルビカンスなどのいくつかの例外を除けば、ほとんどの子嚢菌は半数体、すなわち核ごとに1セットの染色体を持つ。有性生殖では二倍体期があり、これは通常非常に短く、減数分裂によって半数体状態に戻る。子嚢菌門のよく研究されている代表種の1つであるNeurospora crassaの性周期は、この属でより詳細に説明されている。また、子嚢菌門の菌類における有性生殖の維持に関する適応基盤は、 WallenとPerlinによってレビューされている。^{[19]彼らは、この能力が維持される最も妥当な理由は、}減数分裂中に起こる組み換えを利用して DNA損傷を修復する ことの利点であると結論付けた。^[19] DNA損傷は、栄養制限などのさまざまなストレスによって引き起こされる可能性がある。

ライフサイクルの有性生殖の部分は、2 つの菌糸構造が交配することで開始します。ホモタリック種の場合、同じ菌類クローンの菌糸間での交配が可能ですが、ヘテロタリック種の場合、2 つの菌糸は遺伝的に異なる菌類クローン、つまり異なる交配型の菌類クローンに由来する必要があります。交配型は菌類に特有のもので、植物や動物の性別にほぼ相当します。ただし、1 つの種が 2 つ以上の交配型を持つ場合があり、その結果、複雑な栄養不和合性システムが生じることがあります。交配型の適応機能についてはNeurospora crassaで説明されています。

配偶子嚢は菌糸から形成される有性構造であり、生殖細胞である。非常に細い菌糸はトリコギネと呼ばれ、一方の配偶子嚢である子嚢から発生し、もう一方の菌類の配偶子嚢（造精器）と融合する。造精器の核は次に子嚢に移動し、原形質融合（細胞質の混合）が起こる。動物や植物とは異なり、原形質融合の直後に核の融合（核融合と呼ばれる）は起こらない。その代わりに、2 つの菌糸の核が対になり、有性周期の二核期が開始され、その間に対の核は同期して分裂する。対になった核の融合により遺伝物質の混合と組み換えが起こり、その後に減数分裂が続く。同様の性周期は紅藻類（紅藻類）にも存在する。廃止された仮説では、子嚢形成の前に子嚢内で2回目の核融合が起こり、その結果4倍体の核が形成され、それが減数分裂によって4つの二倍体核に分裂し、その後短減数分裂と呼ばれるプロセスによって8つの半数体核に分裂したとされていたが、この仮説は1950年代に反証された。^[20]

受精した子嚢からは、各細胞に 2 つの核が含まれる二核菌糸が出現します。これらの菌糸は子嚢菌糸または稔菌糸と呼ばれます。これらは、無菌の単核菌糸を含む栄養菌糸によって支えられています。無菌菌糸と稔菌糸の両方を含む菌糸は、子嚢果と呼ばれる子実体に成長し、子嚢果には何百万もの稔菌糸が含まれることがあります。

子嚢果は子嚢菌類の有性生殖期の子実体です。子嚢果には形態的に異なる 5 つの種類があります。

• 裸の子嚢: 単純な子嚢菌に発生し、子嚢は生物の表面に生成されます。
• 子嚢殻：子嚢はフラスコ状の子嚢（子嚢殻）の中にあり、上部に孔（口）があります。
• 閉鎖子嚢殻：子嚢果（閉鎖子嚢殻）は球形で閉じている。
• 子嚢殻: 子嚢はボウル型の子嚢（子嚢殻）の中にあります。これらは「カップ菌類」と呼ばれることもあります。
• 偽子嚢殻：子嚢は2層で、擬子嚢殻に似た形で形成される。子嚢胞子は不規則に配列する。^[21]

生殖構造は子嚢果の子実層、すなわち菌糸層に形成される。子嚢形成菌糸の一端では、特徴的なU字型のフックが発達し、菌糸の成長方向と反対方向に湾曲する。各菌糸の先端部に含まれる2つの核は、有糸分裂紡錘体の糸が平行に走るような方法で分裂し、遺伝的に異なる2対の核を形成する。一方の娘核はフックの近くに移動し、もう一方の娘核は菌糸の基部に位置する。次に、2つの平行な横壁の形成により、菌糸は3つのセクションに分割される。1つは核が1つあるフックの部分、1つは核が1つある元の菌糸の基部の部分、そしてもう1つは他の2つの核を含むU字型の部分を分ける部分である。

核の融合（核融合）は子実層のU字型細胞で起こり、二倍体の接合子が形成される。接合子は子嚢、つまり細長い管状または円筒状のカプセルに成長する。その後、減数分裂で4つの半数体の核が生じ、通常はさらに有糸分裂が起こり、各子嚢に8つの核が生じる。核は細胞質とともに膜と細胞壁に囲まれ、子嚢胞子が生じる。子嚢胞子は、さやの中のエンドウ豆のように子嚢の中に整列する。

子嚢が開くと、子嚢胞子は風によって拡散する可能性があり、場合によっては胞子が強制的に子嚢から放出されることもあります。特定の種は胞​​子砲を進化させ、子嚢胞子を最大 30 cm 離れた場所まで放出することができます。胞子が適切な基質に到達すると、発芽して新しい菌糸を形成し、真菌のライフサイクルを再開します。

子嚢の形状は分類に重要であり、単鰓蓋型、単鰓蓋無型、複鰓蓋型、原鰓蓋型の 4 つの基本型に分けられます。詳細については、 子嚢に関する記事を参照してください。

子嚢菌類は、ほとんどの陸上生態系で中心的な役割を果たしています。子嚢菌類は重要な分解者であり、枯れ葉や動物などの有機物を分解し、分解物を食べる動物が栄養素を得るのを助けます。子嚢菌類は他の菌類とともに、セルロースやリグニンなどの大きな分子を分解できるため、炭素循環などの栄養循環で重要な役割を果たしています。

子嚢菌類の子実体は、昆虫やナメクジ、カタツムリ（腹足類）からげっ歯類、シカやイノシシなどの大型哺乳類に至るまで、多くの動物の食料となります。

多くの子嚢菌は、植物や動物を含む他の生物と 共生関係を形成します。

おそらく進化の歴史の初期から、子嚢菌門は緑藻類（緑藻類）や他の種類の藻類やシアノバクテリアと共生関係を築いてきた。これらの共生関係は一般に地衣類として知られ、北極、南極、砂漠、山頂など、他の生物が生息できず、極端な温度と湿度を特徴とする地球上の陸地で成長し、存続することができる。光合成独立栄養の藻類のパートナーが光合成によって代謝エネルギーを生成する一方で、菌類は安定した支持基質を提供し、細胞を放射線や脱水から保護する。子嚢菌門（約18,000種）の約42％が地衣類を形成し、地衣類の菌類のパートナーのほぼすべてが子嚢菌門に属する。

子嚢菌類は、菌根菌と内生菌という 2 つの重要な関係を植物と形成します。菌根菌は植物の根系と共生関係にあり、植物の成長と持続にとって極めて重要です。菌の微細な菌糸ネットワークにより、土壌に低濃​​度で存在するミネラル塩の吸収が促進されます。その見返りとして、植物は光合成産物の形で菌に代謝エネルギーを提供します。

内生菌は植物の内部に生息し、宿主と共生関係や片利共生関係を形成する菌は宿主に害を及ぼさない。内生菌と宿主の関係は菌種によって異なり、菌類が植物に定着すると昆虫、線虫、細菌に対する抵抗力が高まる場合がある。草本内生菌の場合、菌類の共生菌は有毒なアルカロイドを生成し、これが植物食（草食）哺乳類の健康に影響を及ぼし、草食昆虫の生息を阻止または殺す可能性がある。^[22]

Xylaria属のいくつかの子嚢菌類は、ハキリアリやAttini族の菌類を生育する他のアリの巣、およびシロアリ(等翅目)の菌類庭園に生息する。昆虫が巣を離れるまで子実体を生成しないため、担子菌類のいくつかの事例で確認されているように、栽培できる可能性があると疑われている。^{[説明が必要]}

キクイムシ（キクイムシ科）は子嚢菌類の重要な共生パートナーである。雌のキクイムシは、皮膚に特徴的な窪みである菌嚢を使って真菌の胞子を新しい宿主に運ぶ。キクイムシは木材にトンネルを掘り、大きな部屋に入り、そこに卵を産む。菌嚢から放出された胞子は発芽して菌糸となり、木材を分解する。その後、キクイムシの幼虫は真菌の菌糸を食べ、成熟すると新しい胞子を運び、感染サイクルを繰り返す。よく知られている例としては、ヨーロッパニレキクイムシ（ Scolytus multistriatus）が媒介するOphiostoma ulmiによって引き起こされるオランダニレ病がある。^[23]

最も有害な役割の 1 つは、多くの植物病害の原因となることです。例:

• オランダニレ病は、近縁種のOphiostoma ulmiとOphiostoma novo-ulmiによって引き起こされ、ヨーロッパと北アメリカで多くのニレの枯死を引き起こしました。
• もともとアジア原産のCryphonectria parasiticaは、甘栗（Castanea sativa）を襲い、かつては広く分布していたアメリカ栗（Castanea dentata）を事実上絶滅させました。
• 特に北米で蔓延しているトウモロコシ（Zea mays ）の病気は、 Cochliobolus heterostrophusによって引き起こされます。
• Taphrina deformationans は桃の葉巻病を引き起こします。
• Uncinula necator はブドウの木に発生するうどんこ病の原因です。
• モニリニア属の種は、モモ（ Prunus persica）やサワーチェリー（Prunus ceranus ）などの核果類に褐色腐敗病を引き起こします。
• スタキボトリス・チャータラムなどの子嚢菌類は、ウール織物の色あせの原因となり、特に熱帯地方では一般的な問題となっています。
• 青緑、赤、茶色のカビは食品を侵して腐らせます。例えば、ペニシリウム・イタリカムはオレンジを腐らせます。
• フザリウム・グラミネアラムに感染した穀物にはデオキシニバレノール（DON）などのマイコトキシンが含まれており、豚が食べるとフザリウム穂腐病や皮膚・粘膜病変を引き起こします。

• アスペルギルス・フミガーツスは、免疫不全患者の肺における真菌感染症の最も一般的な原因であり、死に至ることも少なくありません。また、嚢胞性線維症や喘息の患者によく見られるアレルギー性気管支肺アスペルギルス症の最も一般的な原因でもあります。
• 粘膜を攻撃する酵母菌であるカンジダ・アルビカンスは、カンジダ症と呼ばれる口内または膣の感染症を引き起こす可能性があり、「酵母アレルギー」の原因とも言われています。
• エピデルモフィトンのような真菌は皮膚感染症を引き起こしますが、健康な免疫系を持つ人にとってはそれほど危険ではありません。しかし、免疫系が損傷すると命を脅かす可能性があります。たとえば、ニューモシスチス・イロベチイはエイズ患者に起こる重度の肺感染症の原因です。
• 麦角（Claviceps purpurea）は、小麦やライ麦を侵して非常に有毒なアルカロイドを生成し、摂取すると麦角中毒を引き起こすため、人間にとって直接的な脅威となります。症状には、幻覚、胃けいれん、手足の灼熱感（「聖アントニウスの火」）などがあります。
• ピーナッツやその他の宿主上で増殖するアスペルギルス・フラバスは、肝臓にダメージを与え、非常に発がん性が高いアフラトキシンを生成します。
• ヒストプラズマ・カプスラツムは、免疫不全患者に影響を与えるヒストプラズマ症を引き起こします。
• ブラストミセス・デルマティティディスは 、真菌が風土病となっている地域では人間や他の動物に時折見られる、侵襲性で重篤な真菌感染症であるブラストミセス症の原因物質です。
• パラコクシジオイデス・ブラジリエンシスとパラコクシジオイデス・ルッツィはパラコクシジオイデス症の原因菌です。
• Coccidioides immitisおよびCoccidioides posadasii は、コクシジオイデス症(谷熱) の原因菌です
• タラロミセス・マルネフェイ（旧称ペニシリウム・マルネフェイ）はタラロミセス症を引き起こす

一方、子嚢菌は人類にいくつかの重要な利益をもたらしました。

• 最も有名な例は、おそらく競合する細菌を攻撃するためにペニシリウム・クリソゲナム（旧称ペニシリウム・ノタタム）というカビの例でしょう。このカビは、ペニシリンという名前で20世紀の細菌感染症の治療に革命を起こした抗生物質を生成します。
• 免疫抑制剤としてのトリポクラジウム・ニベウムの医学的重要性は、誇張しすぎることはありません。トリポクラジウム・ニベウムはシクロスポリンを分泌しますが、シクロスポリンは臓器移植の際の拒絶反応防止に投与されるほか、多発性硬化症などの自己免疫疾患にも処方されます。しかし、治療の長期的な副作用については疑問が残ります。

• 一部の子嚢菌類は遺伝子工学の手法で簡単に改変することができ、インスリン、ヒト成長ホルモン、TPaなどの有用なタンパク質を生成して血栓を溶かすのに利用することができます。
• いくつかの種は生物学において一般的なモデル生物であり、その中にはSaccharomyces cerevisiae、Schizosaccharomyces pombe、Neurospora crassaなどがあります。いくつかの子嚢菌類のゲノムは完全に配列決定されています。
• パン酵母 (サッカロミセス・セレビシエ) はパン、ビール、ワインの製造に使用され、その過程でグルコースやスクロースなどの糖が発酵されてエタノールと二酸化炭素が作られます。パン職人は酵母を二酸化炭素生成に使用してパンを膨らませ、調理中にエタノールを蒸発させます。ほとんどのワイン醸造家は酵母をエタノール生成に使用し、発酵中に二酸化炭素を大気中に放出します。醸造家や伝統的なスパークリングワインの生産者は両方を使用しており、一次発酵でアルコールを生成し、二次発酵で二酸化炭素の泡を生成します。この炭酸の泡により、ワインの場合は飲み物に「スパークリング」な質感が与えられ、ビールの場合は望ましい泡が得られます。
• Penicillium camembertiの酵素はカマンベールチーズやブリーチーズの製造に役立ち、一方Penicillium roquefortiの酵素はゴルゴンゾーラチーズ、ロックフォールチーズ、スティルトンチーズの製造に役割を果たします。
• アジアでは、醤油を作るために浸した大豆の果肉に麹菌を加え、米や他の穀物のでんぷんを単糖に分解して、黄酒や日本酒などの東アジアのアルコール飲料に発酵させるために使われています。
• 最後に、子嚢菌類の一部は食用として好まれます。アミガサタケ( Morchella spp. )、トリュフ( Tuber spp. )、ロブスターマッシュルーム( Hypomyces lactifluorum ) は、最も人気のある菌類の珍味です。
• 冬虫夏草は、免疫系のサポート、炎症の軽減、抗酸化作用、代謝の健康増進、運動能力の向上、呼吸器系の健康促進など、数多くの薬効があることで知られています。冬虫夏草には、コルジセピン、コルジセピン酸、アデノシン、多糖類、ベータグルカン、エルゴステロールなどの生理活性化合物が含まれています。^{[24] [25] [26]}

• 子嚢菌門incertae sedisのリスト
• 子嚢菌属incertae sedisの一覧

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