731号室

東郷部隊は、ハルビンから南に100キロメートル（62マイル）南の満州鉄道沿いの北陰河村にある刑務所兼実験キャンプ、中馬要塞で活動を開始した。中馬に連行された囚人には、一般犯罪者、捕らえられた山賊、抗日パルチザンのほか、政治犯や憲兵隊によって冤罪で連行された人々が含まれていた。囚人たちは、実験開始時には健康状態を良好に保つため、米や小麦、肉、魚、時にはアルコールなどの食事を十分に与えられていた。その後、数日かけて囚人たちは徐々に血液を抜き取られ、栄養と水分を奪われた。彼らの健康状態の悪化は記録された。一部の囚人は生体解剖も行われた。また、ペスト菌やその他の微生物を意図的に感染させられた者もいた。 1934年秋の脱獄事件で施設の秘密が危うくなり、1935年の爆発事件は破壊工作によるものと考えられたため、石井は中馬要塞を閉鎖した。その後、ハルビンの南約24キロ（15マイル）にある平坊に移転し、より大規模な新施設を建設する許可を得た。^{[ 23 ]}  

731部隊の設立に加えて 、この布告では、関東軍軍馬疫病予防工場（後に満州部隊100と呼ばれる）と呼ばれる追加の生物兵器開発部隊と、関東軍技術試験部（後に満州部隊516と呼ばれる）と呼ばれる化学兵器開発部隊の創設も求められた。 1937年の日本による中国侵攻後、姉妹化学・生物兵器部隊が中国の主要都市に設立され、疫病予防給水部隊と呼ばれた。分遣隊には、北京の1855部隊、南京のEi 1644部隊、広州の8604部隊、そして後にシンガポール、マラヤ（現在のマレーシア）、インドネシア、フィリピン、パプアニューギニア、タイ、ビルマの9420部隊が含まれる。これらの部隊はすべて石井のネットワークを構成しており、1939年の最盛期には1万人以上の人員を統括していた。^{[ 24 ]}日本の医師や教授たちは、人体実験を行う稀有な機会と陸軍の強力な財政支援の両方に惹かれて、731部隊に加わった。^{[ 25 ]} 

捕虜収容所に収容された数千人の男性、女性、子供、乳児が生体解剖の対象となり、多くの場合麻酔なしで行われ、通常は致命的であった。^{[ 1 ] [ 34 ]}元731部隊員の大川福松はビデオインタビューで、 妊婦を生体解剖したことを認めた。^{[ 35 ]}捕虜にさまざまな病気を感染させた後、生体解剖が行われた。研究者は、病気が人体に及ぼす影響を研究するために、捕虜に侵襲的な手術を行い、臓器を摘出した。 ^{[ 36 ]}

捕虜は出血量を研究するために手足を切断された。切断された手足は、犠牲者の体の反対側に再接合されることもあった。捕虜の中には、胃を外科的に切除され、食道が腸に再接合された者もいた。脳、肺、肝臓などの臓器の一部が摘出された者もいた。^{[ 34 ]}大日本帝国陸軍の軍医、湯浅健は、人体実験は731部隊以外でも広く行われていたと述べ、^{[ 1 ]}少なくとも1,000人の日本人が中国本土でこの実験に関わっていたと推定している。^{[ 37 ]}湯浅は、捕虜に対して生体解剖を行った際は「研究のためではなく、すべて練習のため」であり、そのような実験は戦時中に中国に駐留していた日本人医師の間では「日常的」であったと述べている。^{[ 1 ]} 

ニューヨーク・タイムズ紙は、 731部隊の元隊員にインタビューを行った。匿名を条件に、この元日本人医療助手は、戦争用の「ペスト爆弾」開発を目的として、意図的にペストに感染させた生きた人間を解剖した最初の経験を語った。

「その男は自分の命が尽きたことを知っていたので、部屋に連れて行かれて縛り付けられても抵抗しなかったが、私がメスを手に取った途端、叫び始めた。胸から腹まで切開すると、彼はひどく叫び、顔は苦痛に歪んでいた。想像を絶するような悲鳴を上げ、恐ろしい叫び声だった。しかし、ついに彼は止まった。外科医にとっては日常茶飯事だったが、私にとっては初めての経験だったので、とても印象に残った。」^{[ 1 ]}

他の情報源によると、この部隊では外科医が囚人の悲鳴を抑えるために、生体解剖を開始する前に布（または医療用ガーゼ）を囚人の口に詰め込むのが通常の慣行であったという。^{[ 38 ]}

731部隊 とその関連部隊（1644部隊、100部隊など）は、第二次世界大戦中、中国の国民（軍人および民間人）に対する攻撃において、伝染病を引き起こす生物兵器 の研究、開発、実験的配備に関与していた。^{[ 7 ]}

1939年までに、石井は研究室での発見を6つの強力な病原体、すなわち炭疽菌、腸チフス、パラチフス、鼻疽、赤痢、そしてペストに感染したヒトノミに集約した。これらの病原体は、相当規模の流行を引き起こすのに十分な強さを持ち、空中散布にも耐性があった。これは、石井の綿密な計画の後半段階の始まりを意味した。すなわち、無防備な民間人を対象とした軍事遠征による野外実験を行い、病原体を最適な濃度で効率的に拡散させ、最大の破壊をもたらす方法を考案することを目指した。彼の実験には、病原体に感染した生きたネズミやノミを収容し、空中で爆発するように設計された生分解性爆弾の開発が含まれており、感染した生物が安全に地上に落下するように設計されていた。さらに、彼は炭疽菌に汚染された鳥や鳥の羽を低空飛行する航空機から散布した。^{[ 7 ]}マウスは施設内で繁殖され、毎月300匹のげっ歯類が施設から配布された。^{[ 39 ]}

1940年と1941年には、  731部隊と1644部隊の研究所で繁殖されたペストに感染したノミが、湖南省の寧波や常徳など の沿岸都市を含む中国の都市上空を低空飛行する飛行機によって散布された。 ^{[ 6 ]}これらの作戦により、腺ペストの流行で数万人が死亡した。南京への遠征では、チフス菌とパラチフス菌が市内の井戸、沼地、家屋に散布されたほか、地元住民に配布される軽食にも混入された。その後まもなく流行が発生し、多くの研究者が歓喜し、パラチフスが病原体の中で「最も効果的」であると結論付けた。^{[ 40 ] [ 41 ]： xii、173}

米国議会図書館には、 731部隊から機密解除された文書が3点所蔵されており、それぞれ100ページ以上あり、日本語から英語に翻訳されている。これらの文書には、日本人医師によって人体実験を受けた無力な囚人の体内で様々な病原体が日々どのように進行していくかについての包括的な臨床記録が記載されている。^{[ 42 ]}

日本兵の証言によると、この研究計画では毎月相当量の生物剤を製造する能力があったという。 ペスト菌300kg、 炭疽菌500～700kg、 腸チフス菌800～900kg、コレラ菌 1,000kgである。生産量は膨大であったが、これらの細菌は少量でも重篤な害や死を引き起こす可能性があった。^{[ 43 ]}

石井はノミがペストの効率的な媒介者であることを突き止め、731部隊は大量のノミの繁殖に注力した。この目的を達成するため、731部隊は約4500台のノミ孵化器を保有しており、それぞれが 1サイクルあたり少なくとも45kgのノミを生産することができた。生成された大量のペスト菌とノミ、そしてペスト感染に伴う重篤な疾患と死亡率を合わせると、日本軍が持つ恐るべき生物兵器生産能力が明らかになる。日本の研究者たちは、接種や空中細菌爆弾の製造に関する実験を行うために科学的方法を適用するために必要な材料を持っていた。 ^{[ 43 ]}

食品は細菌感染の好ましい伝達手段として浮上した。部隊は汚染されていない果物の備蓄を維持していた。第731部隊が行った特定の実験では、メロンとカンタロープに腸チフス菌が混入された。汚染過程の後、細菌密度が測定された。密度が一定のレベルに達すると、腸チフスをグループ全体に広めることを目的として、感染した果物が少数の囚人に配布された。^{[ 43 ]}

731部隊は、多くの中国民間人を攻撃することで生物兵器の野外実験を行った。1940年から1943年にかけて、日本の科学者たちは細菌爆弾による伝染は効果的ではないことを発見したが、微生物を散布する航空機を生物兵器の運搬手段として利用することには成功した。100部隊もまた、731部隊が調査した方法と同様の空中散布方法を展開した。^{[ 43 ]}

少なくとも12回の大規模な生物兵器野外実験が行われ、少なくとも11の中国の都市が生物兵器で攻撃された。 1941年の常徳への攻撃では、準備不足の日本軍兵士の間で約1万人の生物兵器による死傷者と1,700人の死者が出たと伝えられているが、そのほとんどはコレラによるものだった。^{[ 44 ]}日本の研究者は、捕虜に腺ペスト、コレラ、天然痘、ボツリヌス症、その他の病気を感染させて実験を行った。^{[ 45 ]}この研究により、腺ペストを蔓延させるために使用された落葉桿菌爆弾とノミ爆弾が開発された。 ^{[ 46 ]}これらの爆弾の中には、1938年に石井が提案したアイデアである磁器製のシェルで設計されたものもあった。

これらの爆弾により、日本兵は生物兵器攻撃を開始し、炭疽菌やペストを媒介するノミ、腸チフス、コレラ、その他の致死性の病原体で農業、貯水池、井戸、その他の地域を汚染した。生物爆弾実験中、防護服を着た研究者が死にゆく犠牲者を検査した。汚染された食料や衣類は、日本軍が占領していない中国の地域に飛行機で投下された。さらに、毒入りの食べ物やキャンディーが、何も知らない犠牲者に与えられた。ペストノミ、汚染された衣類、爆弾に包まれた汚染された物資がさまざまな標的に投下された。その結果、コレラ、炭疽菌、ペストにより、少なくとも40万人の中国民間人が死亡したと推定されている。^{[ 47 ]}野兎病も中国民間人に対して実験された。^{[ 48 ]}

生物兵器攻撃に関する多数の報告を受けて、蒋介石は1941年11月に陸軍と外国人医療関係者からなる代表団を派遣し、 証拠を記録し、感染者を治療させた。翌年には、日本軍が常徳でペストに感染したノミを使用したという報告が広く公開されたが、連合国は1943年にフランクリン・D・ルーズベルトが攻撃を非難する公式警告を発するまで、この問題に対処しなかった。^{[ 49 ] [ 50 ]}

1944年12月、日本海軍はカリフォルニアの都市を生物兵器で攻撃する可能性を探った。これはPX作戦または夜桜作戦として知られている。この攻撃計画では、潜水艦「千徳」から発進した晴嵐機がアメリカ西海岸、具体的にはサンディエゴ、ロサンゼルス、サンフランシスコの各都市に向けられることになっていた。これらの航空機は生物兵器化された腺ペスト、コレラ、チフス、デング熱、その他の病原体を散布し、住民に対する生物テロ攻撃を行う予定だった。潜水艦の乗組員は自ら感染し、自殺任務として上陸するはずだった。^{[ 51 ] [ 52 ] [ 53 ] [ 1 ]} PX作戦の計画は1945年3月26日に最終決定されたが、その後すぐに梅津義次郎参謀総長の強い反対により棚上げされた。梅津は後に自身の決断を次のように説明した。「細菌戦が行われれば、日米間の戦争という次元から、人類と細菌との果てしない戦いへと発展するだろう。日本は世界の嘲笑を浴びることになるだろう。」^{[ 54 ]}

人間を標的として、さまざまな距離や位置から手榴弾の実験が行われた。火炎放射器も人間を標的として実験された。^{[ 55 ]}また、犠牲者は杭に縛り付けられ、病原体放出爆弾、化学兵器、さまざまな量の破片を含む榴散弾、爆発爆弾、銃剣、ナイフの実験の標的として使用された。

日本兵が戦場で負った様々な程度の榴散弾傷に対する最適な治療法を決定するため、中国人捕虜は爆弾の直撃に晒された。彼らは防護具なしで木の板に縛り付けられ、その板は爆弾の周囲に徐々に間隔を広げながら地面に打ち込まれた後、爆発させられた。ほとんどの捕虜は手術を受け、残りの捕虜は解剖された。

陸軍工兵の吉村久人は、捕虜を屋外に連れ出し、さまざまな部位をさまざまな温度の水に浸し、凍らせる実験を行った。^{[ 58 ]}凍った後、吉村は短い棒で患部を叩き、「板を叩いたときのような音」を出した。^{[ 1 ]}その後、氷を削り取り、患部にさまざまな治療を施した。部隊の軍人は、吉村の厳格さ、大量殺戮や非人道的な科学実験への関与、生後3日の乳児の指を氷と塩の入った水に浸すなどの行為から、吉村を「科学の悪魔」「冷血動物」と呼んだ。^{[ 59 ]}

731部隊の一員だった上園直治は、1980年代のインタビューで、吉村が「裸の男2人を氷点下40～50度の場所に置き、被験者が死ぬまでその過程を撮影した。被験者たちはあまりの苦痛に互いの肉に爪を立てていた」という凄惨な場面を語った。[ ^{60 ]吉村}の反省のなさは、1950年に日本生理学会誌に寄稿した論文にも表れており、その中で彼は20人の子供と生後3日の乳児を0度の氷と塩水にさらす実験に使ったことを認めている。^{[ 61 ]}この記事は批判を浴びたが、吉村は毎日新聞の記者から連絡を受けた際、一切の罪を否定した。^{[ 62 ]}

吉村は、氷水に浸してから5分から30分後の平均温度 、浸漬後の最初の温度上昇、および浸漬後の最初の温度上昇までの時間に基づいて、「凍傷耐性指数」を開発した。その後、いくつかの別々の実験で、これらのパラメータが、犠牲者の身体の一部が凍水に浸された時間帯、浸漬中の周囲の温度と湿度、浸漬前に犠牲者がどのように扱われたか（「一晩眠らずにいた後」、「24時間絶食した後」、「48時間絶食した後」、「大量の食事の直後」、「温かい食事の直後」、「筋肉運動の直後」、「冷水浴の直後」、「温水浴の直後」）、浸漬前の5日間に犠牲者に与えられた食事の種類（「高タンパク質（動物性）」、「高タンパク質（植物性）」、「低タンパク質摂取」、「標準食」）、および塩分摂取量（1日あたり45gの NaCl、1日あたり15g のNaCl、塩なし）にどのように依存するかが決定されました。^{[ 63 ]}この元のデータは添付の図に示されています。

刑務官の証言によると、梅毒を感染者間で感染させる方法を考案した件に関して、部隊のメンバーは感染者と非感染者の囚人の間で強制的な性行為を組織的に行い、病気を伝染させたことが明らかになっている。

注射による性病感染は中止され、研究者たちは囚人たちに互いに性行為を強要し始めた。実験を担当したのは、目と口だけが見えるように全身を覆った白い実験服を着た4、5人の研究員だった。梅毒に感染した男性と女性が独房に連れてこられ、互いに性行為を強要された。抵抗する者は射殺されることが明確に伝えられた。^{[ 64 ]}

感染した被害者は、病気の進行に合わせて内臓や外臓を観察できるよう、感染のさまざまな段階で生体解剖された。複数の看守の証言によると、女性被害者は強制的に感染させられたにもかかわらず、病気の宿主であったと非難されている。梅毒に感染した女性囚人の性器は、看守によって「ジャム入りのパン」と呼ばれていた。^{[ 64 ]}

731部隊の壁の中で育った子供たちの中には 、梅毒に感染した者もいた。731部隊で訓練を受けるために派遣された青年隊員は、 梅毒検査を受ける被験者の一団を目撃した時のことを回想している。「一人は乳児を抱いた中国人女性、一人は4、5歳の娘を連れた白系ロシア人女性、そして最後は6、7歳くらいの男の子を連れた白系ロシア人女性だった」 ^{[ 64 ]} 。これらの女性の子供たちは、親と同様の方法で検査を受けたが、特に感染期間が長いほど治療効果にどのような影響があるかを調べることに重点が置かれた。

女性囚人は実験のために妊娠させられた。特に梅毒などの病気の垂直感染（母から子への感染）の可能性が、拷問の理由として挙げられた。胎児の生存と母親の生殖器への損傷が関心の対象であった。「多数の赤ちゃんが収容所で生まれた」にもかかわらず、731部隊の生存者（子供を含む）の記録はない。女性囚人の子供は出生後に殺されたか、中絶された と疑われている。^{[ 64 ]}

男性囚人は、実験結果が他の変数によって歪められないように、単独の研究に用いられることが多かったが、女性は細菌学的または生理学的実験、性実験、そして性犯罪の被害者として利用されることもあった。警備員を務めていた部隊員の証言は、この現実を如実に物語っている。

私が連絡を取った元研究者の一人は、ある日、人体実験の予定があったものの、まだ時間があったと話してくれた。そこで彼ともう一人の研究員は独房の鍵を取り、中国人女性が収容されている独房を開けた。研究員の一人が彼女をレイプし、もう一人が鍵を取って別の独房を開けた。そこには凍傷実験に使われた中国人女性がいた。彼女は指が何本か欠損し、骨は壊疽を起こして黒くなっていた。彼はとにかく彼女をレイプしようとしたが、彼女の性器が化膿して膿が表面に滲み出ているのを見て、その考えを諦め、部屋を出て鍵をかけ、その後実験作業に戻った。^{[ 64 ]}

731部隊は生物兵器にとどまらず、拷問、化学物質への曝露、生理学的操作などを含む幅広い実験を行った。以下に、実施された実験の種類をまとめる。

刑務所は厳重な警備体制が敷かれているにもかかわらず、少なくとも2件の脱獄未遂事件が発生した。

最初の試みは1943年5月から6月の間​​に起こり、囚人の1人が不注意な看守を殴って気絶させ、鍵を盗んだ。囚人はその後、独房のドアを開け、少なくとも100人の囚人を解放した。しかし、囚人たちは刑務所建物の内庭に閉じ込められたままで、そこから脱出することはできなかった。研究者たちは貴重な研究を失うことを恐れて実験対象の囚人を殺したくなかったので、無害な催涙ガスだと信じていた殺虫剤クロロピクリンをその地域に撒くことにした。しかし、クロロピクリンは中庭の囚人にとって致命的であることが判明し、全員が窒息死した。^{[ 90 ]}

2度目の試みは1945年の夏に起こった。菊池則光伍長は、別の隊員から、ある囚人が「暴力的になり、実験者をドアノブで殴った」後、「独房から飛び出して廊下を走り、鍵を奪って鉄扉といくつかの独房を開けた」と聞かされたと証言した。囚人の中には飛び出すことに成功した者もいたが、それは勇敢な者だけだった。勇敢な者たちは射殺された。^{[ 4 ]： 373-374}

森村誠一は著書『悪魔の饗宴』の中で、2度目の脱獄未遂事件についてより詳しく述べている。ロシア人男性囚人2人が手錠をかけられた状態で独房に入れられており、そのうち1人が床にうつ伏せになって病気のふりをしていた。職員が不審に思い、独房に入ってみると、床に横たわっていたロシア人が突然飛び起き、警備員を突き倒した。2人のロシア人は手錠を外し、鍵を奪い、叫びながら他の独房の扉を開けた。ロシア人や中国人を含む囚人たちは、廊下を狂ったように歩き回り、叫び声を上げ続けた。あるロシア人は 731部隊の隊員に向かって、実験台にされるくらいなら射殺してくれと叫んだ。このロシア人は射殺された。この脱走未遂を目撃した職員の一人は、「精神的に、自由も武器も持たない『マルタ』の前では、私たちは皆途方に暮れていました。その時、私たちは心の中で、正義は私たちの側にはないのだと悟りました」と回想している。^{[ 91 ]}

残念ながら、731ユニットの囚人たちにとって 脱走は不可能だった。たとえ彼らが中庭（それ自体が職員でいっぱいの厳重に要塞化された建物）から脱出できたとしても、複合施設を囲む高さ3メートル（9.8フィート）のレンガの壁を乗り越え、さらに複合施設の周囲を走る電線で満たされた空堀を渡らなければならなかっただろう。 ^{[ 92 ]} 

731部隊の隊員も実験の被験者となることを免れなかった。特別チームの助手だった田村義雄は、731部隊第一課の職員だった須藤義雄が、同部隊の生産過程で腺ペスト に感染したことを回想している。その後、特別チームは須藤の生体解剖を命じられた。田村は次のように回想している。

数日前までは女性の話をしたがっていた須藤だったが、今は熊手のように痩せこけ、全身に紫色の斑点がいくつもできていた。胸には広範囲に引っ掻き傷があり、出血していた。彼は苦痛に泣き叫び、呼吸も苦しそうだった。私は彼の全身を消毒液で消毒した。彼が動くたびに、首に巻かれた縄が締め付けられた。外科医が須藤の体を念入りに診察した後、私はメスを外科医に手渡した。外科医はメスを逆手に持ち、須藤の腹部の皮膚に触れ、下に向かって切り裂いた。須藤は「野蛮人！」と叫び、その最期の言葉を残して息絶えた。

さらに、 731部隊青年隊員の篠塚義雄は、友人である後輩助手・平川光雄が、偶然ペストに感染した結果、生体解剖されたと証言した。^{[ 93 ]}

731部隊の著名なメンバーには以下が含まれる。

• 石井四郎中将- 総​​司令官
• 北野正次少将– 司令官 (1942–1945)
• 内藤良一中佐 –グリーンクロス創設者
• 竹田恒良親王
• 東久邇宮徳彦王
• 篠塚義雄– 後に証言
• 金子康二氏― 後に証言を行った
• 藤田茂
• 湯浅健
• 尾関茂雄、木尾林嶺井、斉藤正輝、古市芳雄などの軍人・学生^{[ 4 ] : 243}

1949年、ハバロフスク戦争犯罪裁判において、731部隊および関連部隊の元隊員12名がソ連によって裁かれた。以下の表は、彼らの階級、役割、および判決を示している。

2018年4月、国立公文書館は、滋賀医科大学の西山勝夫教授に、731部隊に所属していた3,607名のほぼ完全なリストを公開した。西山教授は、さらなる研究を促進するために、このリストをオンラインで公開する意向を表明した。^{[ 95 ]} 2023年8月、明治学院大学の松野誠也教授が、国立公文書館でより詳細な職員リストを発見した。^{[ 96 ]}

 731部隊は林口（支店 162）、牡丹江、海林（支店 643）、孫武（支店 673）、ハイラル（支店 543）に支店を持っていた。^{[ 4 ] : 60、84、124、310​​​}

第二次世界大戦中、東京新宿区 には第731部隊に属する医学校と研究施設があった。2006年、戦時中に同校で看護師として働いていた石井豊雄氏が、 1945年の日本の降伏直後に同校の敷地内に遺体や遺体の一部を埋めるのを手伝ったことを明らかにした。これを受けて、2011年2月、厚生労働省は同地の発掘調査を開始した。^{[ 99 ]}  

東京裁判所は2002年に 731部隊が生物兵器研究に関与していたことを認めたが、2011年現在日本政府は、実験対象者に対して行われた残虐行為を公式には認めておらず、陸軍医学校の近くで発見された人骨（頭蓋骨や骨を含む）の身元確認のためのDNAサンプル提供を求める中国政府の要請を拒否した。^{[ 100 ]}

第二次世界大戦が終結に向かうにつれ、証拠隠滅のため収容所内の囚人は全員殺害され、生存者は記録に残っていない。^{[ 101 ]} 1945年8月に赤軍が進軍すると、部隊は急いで任務を放棄せざるを得なくなった。東京の省庁は、平坊にあるものを含め、すべての有罪証拠となる資料の破棄を命じた。残っていた300人の囚人などの潜在的な証人はガス室で殺害されるか毒を飲まされ、600人の中国人と満州人の労働者は射殺された。石井は、グループのメンバー全員に姿を消し、「秘密を墓場まで持っていく」よう命じた。^{[ 102 ]}残りの人員が捕虜になった場合に備えて、シアン化カリウムの小瓶が支給された。石井の日本軍の残された少数の部隊は、戦争末期に活動の証拠を消すために収容所を爆破したが、多くは頑丈で、ある程度無傷のまま残っていた。 

元731部隊員の清水秀雄は、ソ連の満州侵攻の際、中庭で犠牲者を焼却し、その場に残った骨を集め、爆発物で遺体を破壊することで証拠を消すよう指示されたと述べている。^{[ 33 ] [ 103 ]}出発する列車に乗車する際、シアン化物化合物を渡され、捕まるより自殺するよう指示された。^{[ 33 ]}

1945年の降伏後、日本にいた人物の中には、1945年9月にアメリカの船スタージェス号で横浜に到着したマレー・サンダース中佐がいた。サンダースは高く評価された微生物学者で、アメリカの生物兵器に関する軍事センターのメンバーだった。サンダースの任務は、日本の生物兵器活動を調査することだった。日本に到着した時点では、彼は731部隊が何であるかを知らなかった。^{[ 64 ]}サンダースが最終的にソ連を巻き込むと日本を脅すまで、生物兵器に関する情報はほとんどアメリカに共有されていなかった。日本はソ連の法制度の下で訴追されることを避けたかったので、脅した翌朝、サンダースは日本の生物兵器への関与を記述した原稿を受け取った。  

サンダースはこの情報を連合国最高司令官であり、連合国占領下の日本復興の責任者であったダグラス・マッカーサー将軍に伝えた。マッカーサーは日本の情報提供者と取引をした。^{[ 104 ]}彼は生物兵器の研究と人体実験のデータへの独占的なアクセスをアメリカに提供する代わりに、731部隊の医師たち（リーダーを含む）に秘密裏に免責を与えた。 ^{[ 8 ]}アメリカ占領当局は元部隊員の活動を監視し、彼らの郵便物を閲覧・検閲した。^{[ 105 ]}アメリカは研究データが貴重であると信じており、他の国、特にソ連が生物兵器に関するデータを入手することを望んでいなかった。^{[ 106 ]} 

東京裁判では、中国民間人に対する「毒血清」を用いた日本の実験に関する言及は1件のみであった。これは 1946年8月に中国検察官補佐のジョセフ・R・マッセイによって提起された。日本側の弁護人は、この主張は曖昧で裏付けがないと主張し、裁判長のウィリアム・ウェッブ卿は証拠不十分としてこれを却下した。マッセイは、おそらく731部隊 の活動を知らなかったため、この件をそれ以上追及しなかった。裁判での彼の言及は偶然だったと考えられている。その後1981年、東京裁判の最後の生存メンバーの1人であるローリング判事は、731部隊の証拠隠蔽を知らされていなかったことへの憤りを表明し、「中央集権的に命令された最も忌まわしい日本の戦争犯罪が米国政府によって法廷から隠蔽されていたことを今知らされたのは、私にとって苦い経験である」と記した。^{[ 107 ]}

日本の科学者が生物兵器に関する情報を開示し始めたとき、アメリカによる日本の戦争犯罪の調査は中止された。人体実験の被験者、投与システムの理論、および成功した野外実験を含む、日本から提供されたデータの潜在的な価値はアメリカにとって計り知れないものであった。しかし、歴史家のシェルドン・H・ハリスは、日本のデータはアメリカの基準を満たしておらず、むしろこの部隊からの発見はせいぜい重要性が低いと結論付けた。ハリスは、日本のキャンプからの研究結果を期待外れと評し、実験を「粗雑」で「効果がない」と評したマレー・サンダースの評価に同意した。^{[ 43 ]}米国の生物兵器計画は、1944年にはすでに731部隊の能力を上回っていた可能性が高い。隠蔽工作は、ソ連が生物兵器研究で優位に立つことを阻止したいという米国の願望によっても動機付けられていた。^{[ 10 ]}

ドイツ人医師は裁判にかけられ、その犯罪が公表された一方で、米国は日本の生物兵器実験に関する情報を隠蔽し、加害者を免責した。人種差別が、異なる国籍の人々に対して行われた実験に対する米国の戦後対応における二重基準につながったと主張されている。^{[ 108 ]} 731部隊の加害者は訴追を免れたが、米国は1948年に横浜で法廷を開き、捕虜となったアメリカ人パイロットに生体解剖を行ったとして、日本人医師教授と医学生9人を起訴した。教授2人は死刑、その他は15～20年の懲役刑を宣告された。^{[ 108 ]}

東京裁判ではこの問題について公には沈黙していたものの、ソ連は事件を追及し、ハバロフスク戦争犯罪裁判で、 731部隊とその関連生物兵器収容所である南京の1644部隊 と長春の100部隊の最高位の軍幹部と科学者12人を起訴した。細菌兵器を含む戦争犯罪で告発された者の中には、満州を占領していた100万人規模の関東軍の最高司令官、山田大三将軍も含まれていた。 

日本人加害者の裁判は1949年12月にハバロフスク で行われた。裁判手続きの長文の部分的な記録は翌年、モスクワ外国語出版社によって英語版を含むさまざまな言語で出版された。^{[ 109 ]}ハバロフスク裁判の主任検察官は、ニュルンベルク裁判でソ連のトップ検察官の一人であったレフ・スミルノフであった。731部隊の実験を行った日本人医師と軍司令官は、ハバロフスク裁判所からシベリアの労働収容所で2年から25年の刑を言い渡された。米国は、この裁判を共産主義のプロパガンダだと非難し、認めなかった。^{[ 110 ]}日本人加害者に下された判決はソ連の基準からすると異例に寛大であり、被告人全員が1956年までに日本に帰国した。^{[ 11 ]}  

プロパガンダだという非難に加えて、米国は、この裁判はソ連が数十万人の日本人捕虜に対して行った扱いから目をそらすためのものだったと主張した。一方、ソ連は、米国が人体実験に関する情報と引き換えに日本に外交的寛大さを与えたと主張した。しかし、元731部隊の隊員も司法上の寛大さと引き換えに生物実験に関する情報をソ連政府に渡していた可能性が高い。^{[ 11 ]}ソ連は満州の731部隊から押収した文書を使ってスヴェルドロフスクに生物兵器施設 を建設した。^{[ 12 ]}

上記のように、アメリカによる日本占領中、 731部隊の隊員や他の実験部隊の隊員は釈放された。 1947年5月6日、連合軍最高司令官ダグラス・マッカーサーはワシントンに書簡を送り、 「石井からの証言など、追加データは、関係する日本人に対し、情報は諜報機関の経路で保持され、戦争犯罪の証拠としては使用されないことを伝えることで入手できる可能性がある」と伝えた。^{[ 8 ]}

オブザーバー紙の調査によると、終戦後、ワクチン開発を口実に、731部隊の元隊員らは日本人捕虜、乳幼児、精神病患者を対象に人体実験を行った。オブザーバー紙の記事は資金が米国政府から提供されたと主張したが、その主張を裏付ける証拠は提示しなかった。^{[ 111 ]} 1644部隊の卒業生である北岡正美は、1947年から1956年にかけて、日本人被験者の同意なしに実験を続けた。彼は日本の国立衛生研究所で働きながら実験を行った。彼は捕虜にリケッチアを感染させ、精神病患者にチフスを感染させた。^{[ 112 ]}部隊長であった石井四郎は、人体実験の研究材料を米国占領当局に提供したため、戦争犯罪の訴追を免除された。 1948年から1958年にかけて、文書の5パーセント未満がマイクロフィルムに移され、日本に送り返される前に米国国立公文書館に保管された。 ^{[ 113 ]}

731部隊の活動に関する日本の議論は、アメリカによる日本占領が終わった後の1950年代に始まった。1952年、名古屋市立小児病院で乳児の女児が大腸菌に感染して死亡した。この事件は、731部隊の元科学者と公に結びつけられた。^{[ 114 ]}その後、ジャーナリストたちは、政府が平沢貞道の仕業とした殺人事件は、実際には731部隊の隊員によって行われたのではないかと疑った 。1957年、日本の作家遠藤周作は、福岡での人体実験を題材にした『海と毒』を出版したが、これは実際の事件に基づいていると考えられている。

1950年、北野正治を含む731部隊の元隊員らが血液バンク兼製薬会社グリーンクロスを設立し、マレー・サンダースもコンサルタントを務めた。同社は1980年代に、医薬品医療機器庁が安全でないと判断した血液製剤の流通と使用により、最大3,000人の日本人がHIVに感染したことでスキャンダルの標的となった。^{[ 115 ] [ 116 ]}

森村誠一は1981年に『悪魔の飽食』を出版し、 1983年には続編『悪魔の飽食』を出版 した。これらの本は731部隊の「真の」作戦を明らかにすると謳っていたが、無関係な写真を誤って部隊に帰属させており、その正確性に疑問が呈された。^{[ 117 ] [ 118 ]}また、1981年には湯浅健が中国で初めて人体解剖の直接証言を行った。それ以来、日本ではより詳細な証言がなされている。2001年のドキュメンタリー『日本の悪魔』は、中国に捕らえられ後に釈放された731部隊の職員14人へのインタビューを大部分で構成した。^{[ 119 ]}裕仁親王の弟である三笠宮は、中国の731部隊本部を視察し、回顧録の中で、中国人捕虜が「満州の平原を行進させられ、人体への毒ガス実験をさせられた」様子を映した映像を見たことを記している。 ^{[ 1 ]}後に1941年に首相となる東條英機も、この実験の映像を見せられ、「不快だった」と述べている。^{[ 120 ]} 

731部隊青年隊員の清水秀雄は、731部隊本部の戦時中の写真が展示されている博物館を訪れた後、部隊への関与について公に語った。清水は731部隊について講演やインタビューを行ったが、一部の日本のインターネットユーザーは彼の発言を否定し、日本が戦時中に犯した残虐行為を否定した。^{[ 121 ]} 2025年8月、清水は中国を訪れ、ハルビンにある731部隊犯罪証拠展示館を訪れ、そこで自身の行為について謝罪した。^{[ 121 ] [ 122 ]}

科学実験を行ったにもかかわらず、731部隊はこれらの実験から得られたデータの有用性について精査を受けた。^{[ 43 ]}日本の生物兵器作戦は第二次世界大戦中、群を抜いて最大規模であり、「おそらく、両世界大戦間のフランス、ハンガリー、イタリア、ポーランド、ソ連の[生物兵器]生産国を合わせたよりも多くの人員と資源を投入していた」。 ^{[ 123 ]}明らかな成功にもかかわらず、731部隊は効果をさらに最大化するための十分な科学的および工学的基盤を欠いていた。^{[ 124 ] [ 125 ]}ハリスは、米国の科学者は一般的に禁断の果実の概念のためにそれを入手したがっており、合法的および倫理的な禁止が研究結果に影響を与える可能性があると信じていたと結論付けた。^{[ 126 ]}

歴史家のティル・ヴィンフリート・ベルニグハウゼンは、731部隊の多くの実験における科学的厳密性の欠如を批判したが、いくつかの例外を指摘した。彼は、マスタードガス、凍結、結核の実験は信頼性が高く妥当なデータ収集プロセスを備えており、より厳密な方法で実施されたと指摘した。^{[ 43 ]}

1969年、731部隊に所属していた医師の池田直雄は、流行性出血熱（EHF）に関する自身の研究を発表した。彼の論文は、1942年1月に中ソ国境の軍病院で行われた実験を記録したものであった。これらの実験は、人体への感染を伴うもので、シラミやノミによるEHFの地域住民への伝播が確認され、感染者の中には死亡者も出た。致死的な病原体接種による人体実験を行ったことを明示的に認めているにもかかわらず、池田の報告は査読を通過し、日本の学術誌に掲載された。池田によるこの研究の受理は、731部隊で行われた人体実験が日本の医療界で広く認識されていたことを強調するものであった。^{[ 127 ]}

戦時中、吉村久人は中国の731部隊で低温生理学、特に凍傷のメカニズムに関する研究を行った。戦後、彼は日本生物気象学会を設立した。中国での研究は、生理学と環境ストレスの関係を探求する彼の出発点となった。^{[ 127 ]}

731部隊の研究者のほとんどは、自分たちが参加した実験を隠蔽するための組織的な努力は行わなかった。彼らは自分たちの犯罪を公に認めることは控えたものの、医療関係者の間では様々な詳細を共有していた。その結果、特にEHFと凍傷の研究に関しては、誰がどのような人体実験を行ったのかを比較的容易に特定することができた。日本の医療関係者のほぼ全員が731部隊で行われた人体実験を認識していたため、同部隊の研究者は後に医学論文で研究成果を発表することができた。戦後も、人体実験の結果を詳細に記した報告書が紛れもなく配布され、同部隊の記録は医学雑誌に掲載された。これは、日本の医療関係者の間で731部隊で行われた実験が広く認識されていたことを示している。^{[ 127 ]}

COVID-19パンデミックの間、一部の科学者は、ヒトと病原体の相互作用に関するデータが疫学者によるパンデミック制御に役立つ可能性があるため、731部隊の実験データを国際医療コミュニティに公開するよう求めた。^{[ 128 ]}この情報は米国政府と日本政府の両方によって隠蔽されている。

1983年、日本の歴史家、家永三郎氏に対し、731部隊が数千人の中国人に対して人体実験を行ったとする記述を教科書から削除するよう要請した。文部省は、この主張を裏付ける学術研究はないと主張した。1984年、日本の歴史家、常石啓一氏が、日本の生物兵器に関する4000ページを超える米国文書を翻訳・出版した。日本で新たな研究が発表され、米国で重要な証拠が明らかになった後、文部省は方針を撤回した。^{[ 129 ]}

日本の歴史教科書には通常 、731部隊への言及があるが、教科書には同施設で行われた活動に関する具体的な詳細は記載されていない。^{[ 130 ] [ 131 ]}家永三郎の『日本新史』には、将校の証言に基づいた詳細な記述が含まれている。文部省は、証言が不十分であるとして、公立学校での教科書の配布前にこの記述を削除しようとした。しかし、1997年に最高裁判所は、証言は十分であり、削除を要求することは言論の自由の違法な侵害であるとの判決を下した。^{[ 132 ]}

1997年、国際弁護士の土屋耕年は立教大学の上田誠教授が提出した証拠に基づき、731部隊の行為に対する賠償を求めて日本政府を相手取って集団訴訟を起こした。日本の裁判所は全ての段階でこの訴訟を根拠がないと判断した。人体実験の存在に関する事実認定はなされなかった。2002年8月、東京地方裁判所は初めて日本が生物兵器を使用したと判決を下した。岩田浩二裁判長は、731部隊が大日本帝国陸軍本部の命令により、1940年から1942年にかけて衢州、寧波、常徳の各都市でペストや腸チフスなどの病気を蔓延させ、中国の民間人に対して細菌兵器を使用したと認定した。彼は、被害者の賠償請求は既に国際平和条約で解決済みであるとして却下した。^{[ 133 ]}   

2003年10月、日本の衆議院議員が調査を申し立てた。小泉純一郎首相は、当時日本政府は 731部隊に関する記録を保有していないが、事案の重大性を認識しており、今後発見された記録は公表すると回答した。^{[ 134 ]} 2018年4月 、滋賀医科大学の西山勝夫教授の要請に応じて、国立公文書館は731部隊の 隊員3,607名の名前を公開した。 ^{[ 135 ] [ 136 ]} 

第二次世界大戦後 、特別捜査局（OSI）は、米国への入国を禁止された枢軸国協力者および迫害者の疑いのある人物の監視リストを作成した。監視リストには6万人以上の名前が追加されたが、特定された日本人参加者は100人未満だった。1998年に司法省 とアブラハム・クーパー師の間で交わされた書簡の中で、OSI長官のエリ・ローゼンバウムは、その理由として2つの要因を挙げている。

1. 米国がヨーロッパで押収した文書のほとんどは、それぞれの政府に返還される前にマイクロフィルム化されたが、国防総省は、日本政府に返還するにあたり、膨大な量の文書をマイクロフィルム化しないことを決定した。
2. 日本政府は戦後、OSIにこれらの記録や関連記録への実質的なアクセスを許可しなかったが、ヨーロッパ諸国は概ね協力的であった。^{[ 137 ]}その結果、これらの人物を特定するために必要な情報は、事実上回収不可能となった。

• 『灰の中の危機』（1999年）は、ウィリアム・W・ジョンストンによる小説。ユニット 731の科学者の孫が、疫病を兵器として利用する物語。
• 『歴史を終わらせた男：ドキュメンタリー』（2011年）、ケン・リュウによる中編小説。タイムトラベルの方法を発明した男が、その発明を利用して 731部隊の残虐行為に人々の注意を向けさせる。
• 僕のヒーローアカデミア（2014年～2024年）、堀越耕平による漫画。当初「志賀丸太」という名前だったキャラクターが、 731号機の人体実験の被験者を連想させるとして反発を招いた。 ^{[ 138 ]}その後、名前は変更された。 ^{[ 139 ]}
• 『ソロモンの呪い』 （2015年）は、クライブ・カッスラーとラッセル・ブレイクによる小説。731部隊に関連した秘密の人体実験に関するサブプロットが含まれている 。
• 『トリッキー・トゥエンティ・ツー』（2015年）は、ジャネット・エヴァノヴィッチによる小説。悪役の生物学教授が、731部隊による疫病散布を再現しようとする物語 。
• 『コレクター – ユニット731』（2021年）は、ダークホースコミックスから出版されたコミックミニシリーズで、ロッド・モンテイロが脚本を、ウィル・コンラッドが作画を担当している。ユニット731に捕らえられ、人体実験を受けた捕虜の物語を描く。

• 731部隊 ― 天皇は知っていたのか？（1985年）、テレビサウス制作のドキュメンタリー。大日本帝国が 731部隊について知っていたかどうかを調査する。 ^{[ 140 ]}
• 731（中国語：七三一）（2015年）は、 CCTV制作の全5部構成のドキュメンタリー番組。731部隊の犯罪と戦後の影響を記録したものである。 
• NHKドキュメンタリー番組『 731部隊の真実：エリート医学生と人体実験』（2017年）。731部隊 関係者へのインタビューや回収された資料を収録。