ヒトY染色体DNAハプログループ

ハプログループAは、現代の父系ハプログループすべてが由来するNRY（非組換えY ）マクロハプログループです。アフリカではまばらに分布しており、南西部のコイサン族と北東部のナイル川流域のナイル系民族に集中しています。BTはハプログループAのサブクレードであり、より正確にはA1bクレード（Cruciani et al. 2011ではA2-T）に属し、以下のように分類されます。

• ハプログループA
  • ハプログループA00
  • ハプログループA0（旧称A1b）
  • ハプログループA1（A1a-Tとも呼ばれる）
    • ハプログループA1a（M31）
    • ハプログループA1b（別名A2-T；P108、V221）
      • ハプログループA1b1a1（別名A2、M14）
      • ハプログループA1b1b（別名A3、M32）
      • ハプログループBT（M91、M42、M94、M139、M299）
        • ハプログループB（M60）
        • ハプログループCT

CT（AとBを除くすべてのハプログループ）を区別する決定的な変異はM168とM294です。起源の場所はおそらくアフリカです。その年齢は88,000年前^{[ 13 ] [ 14 ]}と推定され、最近では約100,000年前^{[ 15 ]}または101,000年前^{[ 16 ]と推定されています。}

• ハプログループC（M130、M216）はアジア、オセアニア、北アメリカで発見されている。
  • ハプログループC1（F3393/Z1426）
    • ハプログループC1a（CTS11043）
      • ハプログループC1a1（M8、M105、M131）は日本で低頻度で発見されている。
      • ハプログループC1a2（V20）は、ヨーロッパ、アルメニア人、ネパールで低頻度で発見されている。
    • ハプログループC1b（F1370、Z16480）
      • ハプログループC1b1（AM00694/K281）
        • ハプログループC1b1a（B66/Z16458）
          • ハプログループC1b1a1（M356）は、南アジア、南西アジア、および中国北部で低頻度で発見される。
          • ハプログループC1b1a2（B65）
            • ハプログループC1b1a2a（B67）はインドネシアのボルネオ島に住むレボ族の間で発見された。
            • ハプログループC1b1a2b（F725）は、漢民族（広東省、湖南省、陝西省）、タイ族（雲南省）、ムルット族（ブルネイ）、マレー族（シンガポール）、アエタ族（フィリピン）の間で見られる。
          • ハプログループC1b1a3（Z16582）はサウジアラビアとイラクで低頻度で発見されている。
        • ハプログループC1b1b（B68）は、ドゥスン族（ブルネイ）の間で発見された。
      • ハプログループC1b2（B477/Z31885）
        • ハプログループC1b2a（M38）は、インドネシア、ニューギニア、メラネシア、ミクロネシア、ポリネシアで発見されている。
        • ハプログループC1b2b（M347、P309）オーストラリアの先住民の間で発見された
      • ハプログループC1b3（C-Z16582）
  • ハプログループC2（M217、P44）は、ユーラシア大陸と北アメリカ大陸全域に分布するが、特にモンゴル人、カザフ人、ツングース系民族、古シベリア人、ナ・デネ語族に多く見られる。

• ハプログループD（CTS3946）
  • ハプログループD1（M174）は、日本、中国（特にチベット）、アンダマン諸島で発見されている。
    • ハプログループD1a（CTS11577）
      • ハプログループD1a1（Z27276、Z27283、Z29263）
        • ハプログループD1a1a（M15）は、主にチベット人、チャン族、イ族、モン・ミエン族に見られる。
        • ハプログループD1a1b（P99）は、主にチベット人、チャン族、ナシ族、テュルク系民族に見られる。
      • ハプログループD1a2（M55、M57、M64.1、M179、P12、P37.1、P41.1（M359.1）、12f2.2）主に日本で発見される
      • ハプログループD1a3（Y34637）はアンダマン諸島の人々（オンゲ族、ジャラワ族）に見られる。
    • ハプログループD1b（L1366、L1378、M226.2）はフィリピンのマクタン島で発見された。
  • ハプログループD2（A5580.2）はナイジェリア、サウジアラビア、シリアで発見されている。

• ハプログループE（M40、M96）アフリカ、中東の一部、ヨーロッパで発見される
  • ハプログループE1（P147）
    • ハプログループE1a（M33、M132）旧E1
    • ハプログループE1b（P177）
      • ハプログループE1b1（P2、DYS391p）；旧E3
        • ハプログループE1b1a（V38）
          • ハプログループE1b1a1（M2）アフリカ、特にニジェール・コンゴ語族の人々に多く見られる。旧称E3a
          • ハプログループE1b1a2（M329）アフリカ、特にエチオピアのオモ語族の間で見られる。旧称E3*
        • ハプログループE1b1b（M215）
          • ハプログループE1b1b1（M35）アフリカの角、北アフリカ、中東、ヨーロッパ（特に地中海沿岸地域とバルカン半島周辺地域）に分布。以前はE3bと呼ばれていた。
  • ハプログループE2（M75）

ハプログループFに由来する集団は世界人口の約90％に見られるが、ほぼ例外なくサハラ以南のアフリカ以外に分布している。

F  xG,H,I,J,K は現代の集団ではまれで、南アジア、特にスリランカでピークを迎えます。^{[ 12 ]}また、東南アジアにも長い間存在していたようで、スラウェシ島とレンバタ島では 4～5% の割合で報告されています。F-M89 の他のサブクレード (GHIJK のサブクレードの一部を含む) を包括的にスクリーニングしなかったある研究では、SNP P14/PF2704 (M89 と同等) を持つインドネシア人男性は、西ティモールの男性の 1.8%、フローレス島の男性の 1.5%、レンバタ島の男性の 5.4%、スラウェシ島の男性の 2.3% 、スマトラ島の男性の 0.2%を占めていることがわかりました。^{[ 17 ] [ 18 ]} F* (F  xF1,F2,F3) は、スリランカと南インドの男性の 10%、パキスタンの男性の 5%、タマン族(ネパール) およびイランの男性のより低いレベルで報告されています。F1 (P91)、F2 (M427)、F3 (M481; 以前は F5) はすべて非常にまれで、スリランカ、インド、ネパール、中国南部、タイ、ビルマ、ベトナムの地域/少数民族にほぼ限定されています。ただし、このような場合、誤認の可能性は比較的高いと考えられており、一部はハプログループ GHIJKの誤認されたサブクレードに属している可能性があります。^{[ 19 ]}

ハプログループG（M201）は約4万8000年前に起源を持ち、その最も近い共通祖先は2万6000年前に中東に生息していたと考えられている。新石器革命とともにヨーロッパに広まった。

ユーラシアの多くの民族グループに見られ、コーカサス、イラン、アナトリア、レバントで最も一般的です。ヨーロッパのほぼすべての国で見られますが、ガガウジア、ルーマニア南東部、ギリシャ、イタリア、スペイン、ポルトガル、チロル、ボヘミアで最も一般的で、地中海のいくつかの島で最も集中しています。北ヨーロッパではまれです。^{[ 20 ] [ 21 ]}

G-M201は、中国北西部、インド、バングラデシュ、パキスタン、スリランカ、マレーシア、北アフリカにも少数ながら分布している。

• ハプログループG1
• ハプログループG2
  • ハプログループG2a
    • ハプログループG2a1
    • ハプログループG2a2
    • ハプログループG2a3
      • ハプログループG2a3a
      • ハプログループG2a3b
        • ハプログループG2a3b1
    • ハプログループG2b
    • ハプログループG2c（旧ハプログループG5）
      • ハプログループG2c1

ハプログループH（M69）は、約4万8000年前に中央アジア南部、南アジア、または西アジアで出現したと考えられており、現在もH1（M69）とH3（Z5857）の形でこれらの地域に広く分布している。そのサブクレードは、イラン、中央アジア、中東全域、アラビア半島でも低頻度で見られる。

しかし、H2（P96）は新石器時代からヨーロッパに存在し、H1a1（M82）は中世にロマの人々の移住とともに西へ広がった。

ハプログループI（M170、M258）は主にヨーロッパとコーカサス地方で見られます。

• ハプログループI1（M253）は主に北ヨーロッパで発見された。
• ハプログループI2（P215）は主にバルカン半島、南東ヨーロッパ、サルデーニャ島で見られますが、I2B1（m223）は西ヨーロッパ、中央ヨーロッパ、北ヨーロッパで中程度の頻度で見られます。

ハプログループJ （M304、S6、S34、S35）は主に中東、コーカサス、南東ヨーロッパで見られます。

• ハプログループJ*（J-M304*）はソコトラ島以外では稀である。
  • ハプログループJ1 （M267）は、ダゲスタンの北東コーカサス人や中東、エチオピア、北アフリカのセム語を話す人々と関連があり、ハプログループTと同様に、地中海沿岸のヨーロッパでも少数ながら見られます。
  • ハプログループJ2 （M172）は主にセム語を話す人々、アナトリア、ギリシャ、バルカン半島、イタリア、イラン、コーカサス、南アジア、中央アジアで見られます。

ハプログループK （M9）は、ユーラシア大陸、オセアニア、そしてアメリカ先住民の間で広く分布している。

K(xLT,K2a,K2b)、つまりK*、K2c、K2dまたはK2eは、主にメラネシア、オーストラリア先住民、インド、ポリネシア、東南アジアの島嶼部で見られます。

ハプログループL（M20）は、南アジア、中央アジア、南西アジア、地中海地域で見られる。

ハプログループT（M184、M70、M193、M272）は、アフリカの角（主にクシ語を話す人々）、南アジアの一部、中東、地中海で高い頻度で見られます。T-M184は、シャッチェンシ人、スティルフザー人、エジプト人、オマーン人、セファルディ系ユダヤ人^{[ 22 ]} 、イビサ人（エイヴィセンク）、トゥブー人の少数派にも見られます。また、地中海や南アジアの他の地域でも低い頻度で見られます。

基底パラグループK2*を保有していると報告されている唯一の生存男性は、オーストラリア先住民である。2014年と2015年に発表された主要な研究によると、オーストラリア先住民男性の最大27%がK2*を保有しており、その他はK2のサブクレードを保有している。

ハプログループN（M231）は、北ユーラシア、特にウラル語族の話者の間で見られます。

ハプログループNは東アジアで発生し、北と西の両方に広がり、シベリアにまで達したと考えられており、ウラル語族の一部の人々に最も多く見られるグループである。

ハプログループO （M175）は、東アジアと東南アジアで最も高い頻度で見られ、南太平洋、中央アジア、南アジア、およびインド洋の島々（マダガスカル、コモロなど）では頻度が低くなっています。

• ハプログループO1（F265/M1354、CTS2866、F75/M1297、F429/M1415、F465/1422）
  • ハプログループO1a（M119、CTS31、F589/Page20、L246、L466）は、中国本土の東部、中部、南部、台湾、東南アジア、特にオーストロネシア系民族とタイ・カダイ系民族に多く見られる。
  • ハプログループO1b（P31、M268）
    • ハプログループO1b1（M95）は、日本、中国、台湾、東南アジア、インド亜大陸、特にオーストロアジア語族およびタイ・カダイ語族の人々、マレー人、インドネシア人の間で見られる。
    • ハプログループO1b2（SRY465、M176）は、日本、韓国、満州、東南アジアで発見されている。
• ハプログループO2（M122）は、東アジア、東南アジア、ポリネシアを含むオーストロネシア全域で見られる。

基底パラグループK2b1*の例は確認されていません。K2b1のサブクレードを持つ男性は、主にパプア人、ミクロネシア人、オーストラリア先住民、ポリネシア人に見られます。

その主要なサブクレードは、2つの主要なハプログループである。

• ハプログループS （B254）はK2b1aとしても知られ、パプアニューギニアの高地で発見され、
• ハプログループM（P256）はK2b1bとしても知られ、ニューギニアとメラネシアで発見されている。

ハプログループP（P295）には、P1（P-M45）と非常にまれなP2（P-B253）の2つの主要な分岐があります。^{[ 23 ]}

P*、P1*、P2はフィリピンのルソン島でのみ一緒に見られます。^{[ 23 ]}特に、P*とP1*はルソン島のアエタ族（またはアグタ族）の間で高い割合で見られます。^{[ 24 ]}一方、P1*は現在、東シベリアと中央アジアの生きている人々の間でより一般的ですが、東南アジア本土と南アジアでも低いレベルで見られます。これらの分布を総合的に考えると、P*は東南アジアのK2bから出現したことを示唆する傾向があります。^{[ 24 ] [ 25 ]}

P1は、2つの主要な系統群の親ノードでもある。

• ハプログループQ（Q-M242）および；
• ハプログループR（R-M207）。これらは、少なくとも18個の他のSNPに加えて、共通のマーカーM45を共有している。

ハプログループQ（MEH2、M242、P36） ：シベリアとアメリカ大陸で発見 。ハプログループR（M207、M306）：ヨーロッパ、西アジア、中央アジア、南アジアで発見。

QはSNP M242によって定義されます。約32,000年前に中央アジアで発生したと考えられています。 ^{[ 26 ] [ 27 ]} 2008 ISOGGツリー^{[ 28 ]}によると、ハプログループQのサブクレードとその定義となる変異を以下に示します。ss4 bp、rs41352448はSTRの値であるため、ISOGG 2008ツリーには表示されていません。この低頻度の値は、インド人集団で新しいQ系統（Q5）として発見されています^{[ 29 ]。}

2008年のISOGGツリー

• Q（M242）
  • Q*
  • Q1 (P36.2)
    • Q1*
    • Q1a (MEH2)
      • Q1a*
      • Q1a1 (M120、M265/N14)ブータン人^{[ 30 ]}ドゥンガン人、漢民族、日本人、韓国人、モンゴル人^{[ 31 ]}ナシ族、チベット人^{[ 32 ] [ 33 ]}の間で低頻度で発見されています。
      • Q1a2（M25、M143）は、西南アジア、中央アジア、シベリアの一部の集団で低～中程度の頻度で見られる。
      • Q1a3 (M346)
        • Q1a3*パキスタン、インド、チベットで低頻度で発見される
        • Q1a3a (M3)アメリカ大陸の先住民に典型的な
          • Q1a3a*
          • Q1a3a1 (M19)南米の先住民族の一部、例えばティクナ族やワユー族の間で見られる^{[ 34 ]}
          • Q1a3a2 (M194)
          • Q1a3a3 (M199、P106、P292)
      • Q1a4 (P48)
      • Q1a5 (P89)
      • Q1a6（M323）イエメン系ユダヤ人のかなりの割合に見られる
    • Q1b（M378）ハザラ人とシンド人のサンプルで低頻度で発見された

ハプログループRはSNP M207によって定義されます。ハプログループRの大部分は、シベリアを起源とする子孫サブクレードR1 （M173）に代表されます。R1には、 R1aとR1bという2つの子孫サブクレードがあります。

R1aは原インド・イラン語族およびバルト・スラブ語族と関連があり、現在では主に中央アジア、南アジア、東ヨーロッパで見られる。

ハプログループR1bは西ヨーロッパで最も優勢なハプログループであり、アジアやアフリカの様々な民族にも散発的に分布している。そのサブクレードであるR1b1a2（M269）は、現代の西ヨーロッパの集団で最も一般的に見られるハプログループであり、イタリア・ケルト系民族やゲルマン系民族と関連付けられている。

• ハプログループR1（M173）は西ユーラシア全域に分布している。
  • ハプログループR1a（M420）は、中央アジア、南アジア、中央ヨーロッパ、北ヨーロッパ、東ヨーロッパ、バルカン半島で発見された。
  • ハプログループR1b（M343）は、西ヨーロッパ、西アジア、中央アジア、北アフリカ、およびカメルーン北部で発見された。
• ハプログループR2（M124）は、南アジア、コーカサス、中央アジア、東ヨーロッパで発見されている。