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ハプログループR1、またはR-M173は、 Y染色体DNAハプログループです。ハプログループR （R-M207）の主要なサブクレードであり、 SNP M173によって定義されます。ハプログループRのもう1つの主要なサブクレードは、ハプログループR2 （R-M479）です。
現代の集団でR-M173を持つ男性は、主にユーラシア大陸原産の集団（東アジアと東南アジアを除く）に見られるR1aとR1bの2つのサブクレードから構成されているようです。R-M173は、サブクレードであるR1aとR1bの形で、ハプログループRの代表者の大部分を含んでいます（Rosser 2000、Semino 2000）。
R1とその姉妹クレードR2（R-M79）は、ハプログループR （R-M207）の唯一の直系の子孫です。RはハプログループP1 （P-M45）の直系の子孫であり、したがってハプログループQ （Q-M242）の姉妹クレードです。ハプログループR1の起源は現在証明されていません。SNP-Tracker（2023年5月現在）によると、R1は紀元前25,000年頃、南ウラル山脈とバルハシ湖の間の西シベリアで進化しました。[ 5 ]
基底サブクレードである R1*の例は、現生者や古代の遺物ではまだ確認されていません。しかし、親クレードである R* は、シベリアのマルタ・ブレト文化の後期旧石器時代(24,000 年前) の人々に存在していました。[ 6 ]マルタ・ブレト人の常染色体 DNA は、集団遺伝学の学者によって古代北ユーラシア人(ANE)として知られるグループの一部です。最初の主要な子孫ハプログループは、その後、東ヨーロッパ ( R1a、13 kya) [ 7 ]と西ヨーロッパ ( R1b、14 kya) [ 8 ]の狩猟採集民に現れ、遺伝子型はさまざまな程度で ANE に由来しています。[ 9 ]
ハプログループ R1 は、東アジアと東南アジアを除くユーラシア大陸全体で非常に一般的です。その分布は、最終氷期最盛期後のユーラシア大陸への再移住に関連していると考えられています。主なサブグループはR1aとR1bです。ハプログループ R1b のサブクレード (特に R1b1a2) は、西ヨーロッパとバシコルトスタンで最も一般的なハプログループです( Lobov 2009 )。一方、ハプログループ R1a のサブクレード (特にハプログループ R1a1 ) は、南アジア、東ヨーロッパ、中央アジア、中国西部、南シベリアの大部分で最も一般的なハプログループです。[ 10 ]
Y染色体がY-DNA系統樹の内部ノード上のM207（ハプログループRを定義する）までのすべての変異を持っているが、ハプログループR1を定義するM173変異もハプログループR2を定義するM479変異も示さない個人は、グループR * （R-M207）に属すると分類される。R*は、パキスタン北部のブルショ族のサンプルの10.3%（10/97）とカラシュ族のサンプルの6.8%（3/44）で発見されている（Firasat 2007 ）。
先住民アメリカ人のグループにおけるハプログループR1の存在は議論の的となっている。現在、様々なQ-M242に次いで最も一般的なハプログループであり、特に北米ではオジブワ族が79%、チペワイアン族が62%、セミノール族が50%、チェロキー族が47%、ドグリブ族が40%、トホノ・オオダム族が38%を占めている。[ 11 ]
一部の専門家は、北米で発見されたハプログループR1のサブクレードとシベリアで発見されたサブクレードとの類似性が高いことを指摘し（例えば、Lell [ 12 ]とRaghavan [ 13 ]）、アジアやベーリンジアからの先史時代の移住を示唆している。
現在R1b1a2（R-V88）として知られるサブクレードの一つは、フラニ族など西アフリカ原産の集団の間でのみ高頻度で見られ、ユーラシア大陸からアフリカ大陸への先史時代の逆移住を反映していると考えられている。
R1a (M420) の分岐は約 25,000 年前 (95% CI: 21,300–29,000 BP)、つまり最終氷期最盛期と推定されている。2014 年に実施された大規模な研究 (Underhill et al. 2015) では、ユーラシア大陸の 126 以上の集団から 16,244 人の個人を用いて、「ハプログループ R1a の多様化の最初のエピソードは、現在のイラン付近で発生した可能性が高い」という説得力のある証拠があると結論付けた。[ 14 ] サブクレード M417 (R1a1a1) は約 5,800 年前に多様化した。[ 15 ]中央ヨーロッパおよび東ヨーロッパにおけるM417 サブクレード R1-Z282 (R1-Z280 を含む) [ 16 ]およびアジアにおける R1-Z93 [ 16 ] [ 17 ]の分布は、 R1a1a がユーラシアのステップまたは中東およびコーカサス地域で多様化したことを示唆している。[ 16 ]これらのサブクレードの起源地は、インド・ヨーロッパ人の起源に関する議論において重要な役割を果たしている。ハプログループR1aの高頻度は、西ベンガル州のバラモン（72％）、 ウッタル・プラデーシュ州のバラモン（67％）、イシュカシミ（68％）、パンジケントのタジク人（64％）、中央キルギスタンのキルギス人（63.5％）、ソルブ人（63.39％）、ビハール州のバラモン（60.53％）、ショル人（58.8％）、[ 18 ]ポーランド人（56.4％）、テレウト人（55.3％）、[ 18 ]南アルタイ人（58.1％）、[ 19 ]ウクライナ人（50％）、ロシア人（50％）の間で見られる（Semino 2000、Wells 2001、Behar 2003、Sharma 2007）。
ハプログループR1bは、おそらく最後の氷河期以前または氷河期中にユーラシアで発生したと考えられます。これは西ヨーロッパとバシコルトスタンで最も一般的なハプログループです（Lobov 2009 ） 。最後の氷河期最盛期を、ウラル山脈南部とエーゲ海付近の避難地で生き延びた可能性があります（Lobov 2009 ）。
また、東ヨーロッパ全体では低い頻度で存在し、西ヨーロッパよりも多様性が高いことから、ハプログループR1bが東から古代に移動してきたことが示唆される。[ 21 ]ハプログループR1bは、ウラル山脈や中央アジア付近の多くの異なる集団でもさまざまな頻度で見られ、そこが起源の地域である可能性が高い。
このハプログループと、南ヨーロッパおよび西ヨーロッパにおけるインド・ヨーロッパ語族のケンタウム語派の広がりとの間には相関関係があるかもしれない。例えば、スペイン、ポルトガル、フランス、イギリス、アイルランドのほとんどの地域では、R1bの現代における発生率は男性人口の60%から90%に達している。[ 22 ]このクレードはチャド盆地でも最大90%の頻度で見られ、北アフリカにも存在し、アルジェリアの一部地域ではその頻度が10%を超えている。
南アジアではまれですが、一部の集団では R1b の割合が比較的高くなっています。これには、ランバディ族の 37% ( Kivisild 2003 ) 、ハザラ族の32% ( Sengupta 2005 )、アガリア族(東インド) の 30% ( Sengupta 2005 )が含まれます。これらに加えて、R1b は バローチ族(8%)、ベンガル人(6.5%)、チェンチュ族 (2%)、マクラニ族 ( 5%)、ネワール族(10.6%)、パラン族 (3.5%)、パンジャブ人(7.6%) にも出現しています ( Kivisild 2003、Sengupta 2005、Gayden 2007 )。東南アジアでは、スペインとアメリカの植民地化によりフィリピンに存在しており、その頻度についてはさまざまな研究で異なっています。スタンフォード大学アジア太平洋研究センターが2001年に実施した調査では、男性人口の3.6%がヨーロッパのY-DNA R1bを持っていたが、公共のY-DNAライブラリーでは13%に増加した。[ 23 ] [ 24 ] [ 25 ]
R-M343（以前はHg1およびEu18と呼ばれていた）は、ヨーロッパで最も頻繁に見られるY染色体ハプログループである。これはR-M173の派生であり、M343マーカーによって特徴付けられる。[ 26 ] R-M343のメンバーの圧倒的多数はR-P25（P25マーカーによって定義される）に分類され、残りはR-M343*である。その頻度は西ヨーロッパで最も高く（そして現代のヨーロッパからの移民により、アメリカ大陸の一部でも）、ヨーロッパ系のR-M343保有者の大多数はR-M269（R1b1a2）の子孫系統に属している。