Y-STRマーカーのリスト

以下のリストにあるY-STRマーカーは、法医学^[1]や系図DNA検査でよく使用されます。

DYS454 は最も多様性が低く、マルチコピーマーカー DYS464 は最も多様性の高いY-STRマーカーです。

番号付きY-STRマーカーのY染色体上の位置は、細胞遺伝学的局在によって大まかに特定できます。たとえば、DYS449はYp11.2に位置しており、これはY染色体、小腕、バンド1、サブバンド1、サブサブバンド2 - DYS449を意味します。^[2]

法医学研究所では通常、それぞれ 12 個または 17 個の Y-STR を検査する PowerPlex Y (Promega Corporation) キットと Yfiler (Applied Biosystems) キットを使用します。系図 DNA 検査研究所では最大 700 個の Y-STR を検査します。

突然変異率

突然変異率は、Chandler (2006) で推定された世代ごとのものです。^[3]引用された推定誤差は通常 +/- 15-20% です。観察された家系からの代替推定値 (法医学的使用のため、すべてのマーカーがカバーされているわけではありません) も、Y 染色体ハプロタイプ参照データベースで入手できます。

いくつかのトリヌクレオチドマーカーは、ある反復長では他の反復長よりも変異率がはるかに高いようです。たとえば、トリヌクレオチド DYS388 の変異は、ほとんどのハプログループで一般的に非常に遅く、11～13 の値をとります。しかし、ハプログループ Jでは、通常 14～18 の値をとり、変異が大きく、変異が急速であるようです。同様に、トリヌクレオチド DYS392 は、ハプログループNとQでは「速い」ことが報告されており、他のグループではまれな 14～16 の値をとります。^[4]

Y-STRマーカー

Y-STRアレル命名法

DNA検査会社や研究所は、場合によっては同じY-STRアレルを指定するために異なる命名法を使用する。したがって、これらの場合には、異なる会社から得られたY-STR結果を正確に比較するために変換を適用する必要がある。最も一般的な命名法は、歴史的にさまざまな会社によって異なって報告されてきたY-STRマーカーについてNISTが提供するガイダンスに基づいている。NIST標準は、遺伝子系譜学会社向けのISOGG（国際遺伝子系譜学会）の提案である。 ^[6]^[7]

注釈と参考文献

^ 「ジョン・バトラーとNISTヒューマン・アイデンティティ・プロジェクト・チームのメンバーへのインタビュー」。JoGG。2016年7月1日時点のオリジナルよりアーカイブ。2012年8月11日閲覧。
^ GDBヒトゲノムデータベースのDYS449
^ Chandler (2006) 2016-06-29にWayback Machineでアーカイブ（メーリングリストのディスカッションも参照）
^ 「GENEALOGY-DNA-L アーカイブ — DYS 388 変異率?」。2007 年 10 月 3 日時点のオリジナルよりアーカイブ。2007年 2 月 27 日閲覧。
^ abcdefghijkl トリヌクレオチド - #突然変異率を参照
^ 「マーカー標準」。ソレンソン分子系譜学財団。2012年7月21日時点のオリジナルよりアーカイブ。2012年8月11日閲覧。
^ マティセン、ダイアナ・ゲイル（2011年7月19日）。「SMGF、AncestryDNA、FamilyTreeDNA間のY-DNA STR検査結果の変換」。 2012年8月11日閲覧。

Kayser et al. (2004)、ヒトY染色体マイクロサテライトの包括的調査 Am. J. Hum. Genet.、74 1183–1197。NBオンラインのみのデータファイル
Krahn, Thomas. 「Y-STR 指紋 - パネル」(PDF)。価格表 DNA-指紋 - 系図検査サービス。2023年 3 月 27 日時点のオリジナル(PDF)からアーカイブ。2012年8 月 11 日閲覧。
Butler, John M. (2012年1月9日). 「Y染色体STR」. Short Tandem Repeat DNA . NIST標準参照データベースSRD 130. 2023年2月5日時点のオリジナルよりアーカイブ。2012年8月11日閲覧。
Butler, John; Kline, Decker (2009-06-29). 「Y染色体STR遺伝子座の概要リストと利用可能なファクトシート」。NIST標準参照データベースSRD 130。2019年6月9日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2012年8月11日閲覧。

参照

外部リンク

Y STR ファクトシート
Y-DNA検査会社 STRマーカー比較表
SMGF Yマーカーの詳細

[1] 「ジョン・バトラーとNISTヒューマン・アイデンティティ・プロジェクト・チームのメンバーへのインタビュー」。JoGG。2016年7月1日時点のオリジナルよりアーカイブ。2012年8月11日閲覧。

[2] GDBヒトゲノムデータベースのDYS449

[3] Chandler (2006) 2016-06-29にWayback Machineでアーカイブ（メーリングリストのディスカッションも参照）

[4] 「GENEALOGY-DNA-L アーカイブ — DYS 388 変異率?」。2007 年 10 月 3 日時点のオリジナルよりアーカイブ。2007年 2 月 27 日閲覧。

[trinucleotide-5] トリヌクレオチド - #突然変異率を参照

[6] 「マーカー標準」。ソレンソン分子系譜学財団。2012年7月21日時点のオリジナルよりアーカイブ。2012年8月11日閲覧。

[7] マティセン、ダイアナ・ゲイル（2011年7月19日）。「SMGF、AncestryDNA、FamilyTreeDNA間のY-DNA STR検査結果の変換」。 2012年8月11日閲覧。