ハプログループ CT

ハプログループ CT
ハプログループ CT
起源の可能性のある時期	約7万年前、約10万年前、または約10万1千年前
起源地の可能性	アフリカ、おそらく北東アフリカ
祖先	ハプログループ BT
子孫	ハプログループ CF、ハプログループ DE
突然変異の定義	P9.1、M168、M294、V9、V41、V54、V189、およびV226

ハプログループ CT は、ヒトの Y 染色体ハプログループです。 CT には、 CFとDEという 2 つの基底分岐があります。 DE は、主にアジアに分布するハプログループ D-CTS3946と、主にアフリカに分布するハプログループ E-M96に分かれており、 CF は、東アジア、アメリカ先住民、およびオセアニアのハプログループ C-M130と、ほとんどの非アフリカ系集団で優勢なハプログループ F-M89に分かれています。

分布

CT 系統の男性は、SNP変異 M168 を持つY 染色体のほか、P9.1 および M294 を持っています。これらの変異は、 AおよびB-M60を除くすべての現代人の男性系統に存在し、A およびB-M60はほぼアフリカにのみ見られます。

今日のCT男性の最も最近の共通男性系統祖先（TMRCA）は、おそらく、彼の子孫の一部が参加した最近の現代人のアフリカ起源よりも前のものである。したがって、彼はこの提案された移住の前にアフリカに住んでいたと考えられている。 ^[1]^[5]^{[4]現生人類すべての父系の祖先に与えられた「}Y染色体アダム」の概念に合わせて、CT-M168は、一般的な説明では「ユーラシアのアダム」または「アフリカ出身のアダム」の系統であるとも呼ばれている。なぜなら、多くのアフリカのY系統とともに、すべての非アフリカのY系統がこの系統から派生しているからである。^[8]^[7]^[6]

CT* の準グループに属する男性は、現代の集団では発見されていない。つまり、このハプログループを持つ男性はすべて、いくつかの主要な分岐系統のいずれかに属していると定義される。CT の既知の生存子孫系統はすべて、2 つの主要なサブ系統、CFとDEのいずれかに属している。また、DE は主にアジアに分布するハプログループ D-CTS3946と主にアフリカに分布するハプログループ E-M96に分かれており、CF は東アジア、アメリカ先住民、オセアニアのハプログループ C-M130と、ほとんどの非アフリカ集団で優勢なハプログループ F-M89に分かれている。 ^[6]

サブクラス

CF

ハプログループ CF は、ハプログループ CT のサブグループです。

ドイツ

ハプログループ DE は、ハプログループ CT のサブグループです。

系統樹

ハプログループ CT (M168/PF1416)

CF (P143/PF2587, CTS3818/M3690/PF2668, CTS6376/M3711/PF2697)シャン族
- C (M130/Page51/RPS4Y711, M216)アジア、オセアニア、北米
  - C1 F3393/Z1426
    - C1a CTS11043
      - C1a1 旧C1 (M8、M105、M131)日本
      - C1a2 西ユーラシア（38,000年前のコステンキを含む）では非常に低い頻度
    - C1b
      - C1b1
        C1b1a
        C1b1a1 旧C5 (M356)南アジア、中央アジア、南西アジア
      - C1b2
        C1b2a 旧C2 (M38)インドネシア、ニューギニア、メラネシア、ミクロネシア、ポリネシア
        
        C1b2b 旧C4 (M347)オーストラリア先住民
  - C2 旧 C3 (M217, P44)ユーラシア大陸と北アメリカ全域に見られるが、特にモンゴル人、カザフ人、ツングース人、古シベリア人、ナ・デネ語族の間で多く見られる。
- F (M89, M213)ユーラシア、オセアニア、アメリカ大陸全域に分布
  - F1（P91、P104）
  - F2（M427、M428）
  - F3（P96）
  - F4（M481）
- GHIJK F1329/M3658/PF2622/YSC0001299、CTS2254/M3680/PF2657、FGC2045/Z12203ユーラシア全土、アメリカ大陸、アフリカとオセアニアの少数民族の間では低レベル
  - G M201、P257主にコーカサス地方で、また、ヨーロッパ、北アフリカ、南西アジア、中央アジアの少数民族の間でも低レベルで見られる
  - HIJKユーラシア全土、アメリカ大陸、アフリカとオセアニアの少数民族の間では低いレベル
    - H M69、M370南アジア、中央アジア、南西アジア
    - IJK L15/S137、L16/S138ユーラシア、北アフリカ、オセアニア、アメリカ大陸、東アフリカ
    - IJ M429/P125ヨーロッパ、西アジア、北アフリカ、東アフリカ
      - I M170、M258、P19、P38、P212、U179ヨーロッパ
      - J 12f2.1、M304ヨーロッパ、西アジア、南アジア、北アフリカ、東アフリカ
    - K M9ユーラシア全土に分布。アメリカ大陸やオセアニアでも顕著。北アフリカや東アフリカでも少量分布。
      - LT（K1）L298/P326
        L M11、M20、M22、M61、M185、M295インド亜大陸
        
        T M70、M184/USP9Y+3178、M193、M272（旧K2）南西アジア、南アジア、北アフリカ、アフリカの角、チャド盆地、南ヨーロッパ
      - K2 M526ユーラシア、オセアニア、アメリカ大陸、オーストラリア先住民およびアフリカの少数民族
        NO ( K2a ) M214ブイ族および日本人の男性に少数見られると報告されている。
        N M231東ヨーロッパ、北アジア、東アジア
        
        O M175オセアニア、東南アジア、東アジア
        
        K2b 旧 MPS P331ユーラシア、アメリカ、オセアニア、アフリカの少数民族
        K2b1 旧 MS P397/P399 メラネシア人、ミクロネシア人、オーストラリア先住民、ポリネシア人。
        M P256インドネシア東部、パプアニューギニア、メラネシア
        
        S M230、P202、P204（旧K5）インドネシア東部、パプアニューギニア、メラネシア
        
        P ( K2b2 ) 92R7, M45, M74/N12, P27.1/P207ユーラシア大陸、アメリカ大陸、アフリカの一部少数民族
        Q M242アメリカ大陸とユーラシア大陸
        
        R M207/UTY2、M306/S1ヨーロッパ、近東、南アジア、チャド盆地、カナリア諸島
        
        K2c P261バリ島の低レベル
        
        K2d P402/P403 Javaの低レベル
        
        K2e M147南アジアでは低レベル
ハプログループ DE (M1/YAP、M145/P205、M203/Page36、P144、P153、P165、P167、P183)アジア、アフリカ、南ヨーロッパ、東ヨーロッパ。オセアニアでも低レベル
- ハプログループD（M174）主に日本、チベット、アンダマン諸島民。東アジア、中央アジア、ミクロネシア、メラネシアの少数民族にも低レベルで存在する。
  - ハプログループ D1 (CTS11577)主にチベット、中央アジア、東アジア、東南アジアの少数民族
    - ハプログループ D1a Z27276東アジアおよび中央アジア
      - D1a1 (M15) (旧D1)チャン族; 東アジアと中央アジア全域に低レベルで分布
      - ハプログループ D1a2 P99 (旧 D3)チベットと中央アジア
    - ハプログループ D1b (旧 D2) (M64.1/Page44.1、M55、M57、M179/Page31、M359.1/P41.1、P37.1、P190、12f2.2)主に日本。韓国、中国、ミクロネシア、メラネシアの少数民族にも低レベルで存在する。
  - ハプログループ D2 L1366 (旧 D1a)フィリピン
- ハプログループE（M40、M96）アフリカ、中東、南ヨーロッパ、東ヨーロッパ
  - ハプログループE1（P147）アフリカ全土で高い割合で見られるが、中東とヨーロッパでは低い割合で見られる。
    - ハプログループ E1a (旧 E1) (M132)主にアフリカ
    - ハプログループ E1b (P177/PF1939)
      - ハプログループ E1b1 (旧 E3) (P2、DYS391p)
        ハプログループ E1b1a (V38)
        
        ハプログループ E1b1a1 (旧 E3a) (M2)西アフリカ、中央アフリカ、南東アフリカ、南アフリカ
        
        ハプログループ E1b1b (旧E3b) (M215)アフリカの角 (エチオピア人、ソマリア人、エリトリア)、北アフリカ (ベルベル人、アラブ人^[9] )、中東、ヨーロッパ (特に地中海沿岸地域)
  - ハプログループ E2 (M75)東アフリカ

出典

ISOGG : いいえ
- Y-DNA ハプログループツリー 2015
- Y-DNA ハプログループ C とそのサブクレード - 2015
- Y-DNA ハプログループ F とそのサブグループ - 2015

参照

遺伝学

Y-DNA Cサブクラス

メガハプログループ CF
メガハプログループ CT
C-M130
C-M208
C-M210
C-M216
C-M217
C-M38
C-M8
C-M93
C-P33
C-P44

参考文献

^ ab Karafet et al. (2008) は、Hammer と Zegura (2002) の「68,500±6000 年」を引用して「70,000 年」としています。Karafet TM、Mendez FL、Meilerman MB、Underhill PA、Zegura SL 、Hammer MF (2008)。「新しいバイナリ多型により、ヒト Y 染色体ハプログループツリーの形状が変わり、解像度が向上します」。ゲノム研究。18 (5): 830–8。doi :10.1101/gr.7172008。PMC 2336805。PMID 18385274 。 CF と DE の分裂（CT* のパラグループがない場合、CT の年代に相当）は、70,000～75,000 年前と推定されています。上部旧石器時代のシベリアのゲノムがネイティブアメリカンの二重祖先を明らかにする、Nature 505、87～91 ページ（2014 年 1 月 2 日）
^ ab Kamin M, Saag L, Vincente M, et al. (2015年4月). 「Y染色体の多様性の最近のボトルネックと世界的な文化の変化が一致」.ゲノム研究. 25 (4): 459–466. doi :10.1101/gr.186684.114. PMC 4381518. PMID 25770088 .
^ Haber M、Jones AL、Connel BA、Asan、Arciero E、Huanming Y、Thomas MG、Xue Y、Tyler-Smith C (2019年6月)。「希少な深根性D0アフリカY染色体ハプログループと現代人のアフリカ外への拡大への影響」。遺伝学。212 ( 4 ) :1421–1428。doi : 10.1534 /genetics.119.302368。PMC 6707464。PMID 31196864。
^ ab Underhill および Kivisild; Kivisild, T (2007). 「人類の移動の追跡における Y 染色体とミトコンドリア DNA の集団構造の利用」Annu. Rev. Genet . 41 (1): 539–64. doi :10.1146/annurev.genet.41.110306.130407. PMID 18076332. S2CID 24904955.
^ ab ストーン、リンダ、ポール F. ルルキン、ルイジルカカヴァッリスフォルツァ(2007)。「航海、先史時代の人類の拡大」。遺伝子、文化、人類の進化。ワイリー。p. 187。ISBN 978-1-4051-5089-7。
^ abc Karafet; et al . (2008). 「新しいバイナリ多型がヒトY染色体ハプログループツリーの形状を変え、解像度を向上」。ゲノム研究。18 (5): 830–8。doi :10.1101/gr.7172008。PMC 2336805。PMID 18385274 。
^ ab ダーウィンの探偵：遺伝子とゲノムの自然史を明らかにする、ノーマン・A・ジョンソン著、2007年、ISBN 0-19-530675-9、ISBN 978-0-19-530675-0
^ 遺伝子、文化、そして人類の進化：統合、リンダ・ストーン、ポール・F・ラーキン著、2007年、ISBN 1-4051-5089-0、187ページ
^ Pereira et al. (2010)「サハラ以南と西ユーラシアの遺伝子プールのつながり：アフリカ・サヘルのトゥアレグ遊牧民の母系と父系の遺産」、European Journal of Human Genetics (2010) 18, 915–923; doi :10.1038/ejhg.2010.21

[Karafet-1] Karafet et al. (2008) は、Hammer と Zegura (2002) の「68,500±6000 年」を引用して「70,000 年」としています。Karafet TM、Mendez FL、Meilerman MB、Underhill PA、Zegura SL 、Hammer MF (2008)。「新しいバイナリ多型により、ヒト Y 染色体ハプログループツリーの形状が変わり、解像度が向上します」。ゲノム研究。18 (5): 830–8。doi :10.1101/gr.7172008。PMC 2336805。PMID 18385274 。 CF と DE の分裂（CT* のパラグループがない場合、CT の年代に相当）は、70,000～75,000 年前と推定されています。上部旧石器時代のシベリアのゲノムがネイティブアメリカンの二重祖先を明らかにする、Nature 505、87～91 ページ（2014 年 1 月 2 日）

[A_recent_bottleneck_of_Y_chromosome-2] Kamin M, Saag L, Vincente M, et al. (2015年4月). 「Y染色体の多様性の最近のボトルネックと世界的な文化の変化が一致」.ゲノム研究. 25 (4): 459–466. doi :10.1101/gr.186684.114. PMC 4381518. PMID 25770088 .

[3] Haber M、Jones AL、Connel BA、Asan、Arciero E、Huanming Y、Thomas MG、Xue Y、Tyler-Smith C (2019年6月)。「希少な深根性D0アフリカY染色体ハプログループと現代人のアフリカ外への拡大への影響」。遺伝学。212 ( 4 ) :1421–1428。doi : 10.1534 /genetics.119.302368。PMC 6707464。PMID 31196864。

[UnderhillandKivisild-4] Underhill および Kivisild; Kivisild, T (2007). 「人類の移動の追跡における Y 染色体とミトコンドリア DNA の集団構造の利用」Annu. Rev. Genet . 41 (1): 539–64. doi :10.1146/annurev.genet.41.110306.130407. PMID 18076332. S2CID 24904955.

[stone-5] ストーン、リンダ、ポール F. ルルキン、ルイジルカカヴァッリスフォルツァ(2007)。「航海、先史時代の人類の拡大」。遺伝子、文化、人類の進化。ワイリー。p. 187。ISBN 978-1-4051-5089-7。

[Karafet1-6] Karafet; et al . (2008). 「新しいバイナリ多型がヒトY染色体ハプログループツリーの形状を変え、解像度を向上」。ゲノム研究。18 (5): 830–8。doi :10.1101/gr.7172008。PMC 2336805。PMID 18385274 。

[Johnson-7] ダーウィンの探偵：遺伝子とゲノムの自然史を明らかにする、ノーマン・A・ジョンソン著、2007年、ISBN 0-19-530675-9、ISBN 978-0-19-530675-0

[8] 遺伝子、文化、そして人類の進化：統合、リンダ・ストーン、ポール・F・ラーキン著、2007年、ISBN 1-4051-5089-0、187ページ

[Pereira2010-9] Pereira et al. (2010)「サハラ以南と西ユーラシアの遺伝子プールのつながり：アフリカ・サヘルのトゥアレグ遊牧民の母系と父系の遺産」、European Journal of Human Genetics (2010) 18, 915–923; doi :10.1038/ejhg.2010.21

分布

サブクラス

CF

ドイツ

系統樹

出典

参照

遺伝学

参考文献

関連するトピック

アフリカ

北東アフリカ

ハプログループ BT

ハプログループ CF