サブクレード
A00 (A00-AF6)A00 は「ペリーの Y 染色体」(または単に「ペリーの Y」)としても知られています。このこれまで知られていなかったハプログループは、2012 年にFamilyTreeDNA に DNA を提出したアフリカ系アメリカ 人男性の Y 染色体で発見されました。彼はアルバート・ペリーの子孫であると特定されたため、この名前が付けられました。[ a ] メンデスら (2013) は、このこれまで知られていなかったハプログループの発見を発表し、その名称として「A00」を提案しました。[ 35 ] ペリーの Y は、後にカメルーン で類似しているが異なるグループが発見された後、A00a に改名されました。
A00の推定年代は約27万5千年前であり、[ 14 ] [ 15 ] ジェベル・イルホウド などの既知の最古の解剖学的現代人 の出現とほぼ同時期である。[ b ]
研究者らは後に、西カメルーン (バントゥー)のムボ族 男性11名(サンプル174名中、6.32%)がA00を保有していることを発見した。[ 36 ] その後の研究では、ムボ族におけるA00の全体的な割合はさらに高く、9.3%(86名中8名)であることが示唆された。ムボ族のサンプルは後に独自のサブグループA00b (A-A4987)として分類された。
2015年のさらなる研究によると、A00の濃度が最も高い現代の集団は、カメルーンのイェンバ語を話すグループである バンワ (またはヌウェ)(グラスフィールズ・バントゥー)であり、67のサンプルのうち27(40.3%)がA00a(L1149)陽性であった。バンワの1人はA00aにもA00bにも当てはまらなかった。[ 37 ]
さらに別のA00サブタイプとしてA00cが挙げられます。カメルーンからの現代サンプル「YSEQ5368」は、このサブタイプを持っていると報告されていますが、どの論文にも関連付けられていません。[ 38 ]
遺伝学者は、8000~3000年前にカメルーンのシュム・ラカ 遺跡に埋葬された4人のゲノムワイドDNAデータをシーケンスした。彼らは遺伝的にムブティ・ ピグミー族に最も類似していた。1人の個体はA00を持っていた。(「カバーできたすべてのサブタイプ特異的部位で、シュム・ラカA00は祖先アレルを持っていた。」)[ 39 ] シュム・ラカのこの個体のデータは現在、アレン古代ゲノム多様性プロジェクト/ジョン・テンプルトン古代DNAアトラスに「I10871」というコードで掲載されている。彼は3つのグループに分岐する前のA00の初期段階を表しているようだ。A00a、A00b、A00cの最後の共通祖先(A00-Y125399)は、彼から633 SNP離れている。[ 38 ]
A1b1b (A-M32)クレードA1b1b(M32、旧A3)は、ハプログループAの中で最も人口の多い系統を含み、主に東アフリカ と南部アフリカ で見られます。
A1b1b1 (A-M28)サブクレード(適切には独立したハプログループとみなされる)A1b1b1(M28、以前はA3a)は、アフリカの角 ではまれにしか観察されていません。エチオピアの南セム語 話者の混合サンプルの5%(1/20)[ 20 ] 、エチオピア人のサンプルの1.1%(1/88)[ 23 ] 、ソマリ 人の0.5%(1/201)[ 16 ] で、アラビア半島の東部、中部、南部でも観察されています。FTDNAによると、現在の結果では、A-V1127などのいくつかの分岐はアラビア半島で発生したことが示唆されています。さらに、YfullツリーのTMRCAで専門家が示唆しているように、このハプログループは、このハプログループを代表する人々が何らかの絶滅を経験し、数が急激に減少したボトルネック期を経たに違いありません。注目すべきは、セム語族以外の言語話者、つまりコイサン族、ニロット族、クシュ族にはこのハプログループが存在しないことである。
A1b1b2b (A-M13)サブクレードA1b1b2b(M13、旧A3b2)は、主に東アフリカとカメルーン北部のナイル系民族に分布している。これは、コイサン族のサンプルに見られるAサブクレードとは異なり、それらとは遠縁の関係にある(実際には、ハプログループA内の多くのサブクレードのうちの1つに過ぎない)。この発見は、古代に分岐したことを示唆している。
スーダン では、ハプログループA-M13は、南スーダン人 の28/53 = 52.8% 、中央スーダンのヌバ族の13/28 = 46.4%、 西スーダン 人の25/90 = 27.8% 、地元のハウサ族 の4/32 = 12.5% 、北スーダン人の5/216 = 2.3%で見つかっている。[ 41 ]
エチオピア では、ある研究で、アムハラ人 のサンプルの 14.6% (7/48)とオロモ人 のサンプルの 10.3% (8/78)にハプログループ A-M13 が見つかったと報告されている。[ 28 ] 別の研究では、エチオピア人の混合サンプルの 6.8% (6/88) にハプログループ A3b2b-M118 が、5.7% (5/88) にハプログループ A3b2*-M13(xA3b2a-M171、A3b2b-M118) が見つかり、合計で 12.5% (11/88) の A3b2-M13 が見つかったと報告されている。[ 23 ]
ハプログループA-M13は、中央アフリカや東アフリカ以外でも時折観察されており、トルコ のエーゲ海地域 (2/30 = 6.7% [ 42 ] )、イエメン系ユダヤ人 (1/20 = 5% [ 25 ] )、エジプト (4/147 = 2.7% [ 27 ] 、 3/92 = 3.3% [ 20 ] )、パレスチナ系アラブ人 (2/143 = 1.4% [ 43 ] )、サルデーニャ島 (1/77 = 1.3% [ 44 ] 、 1/22 = 4.5% [ 23 ] ) 、ヨルダン の首都アンマン (1/101 = 1% [ 45 ] )、オマーン (1/121 = 0.8% [ 27 ] )などが挙げられる。
ハプログループA-M13は、スーダンのカドルカ遺跡から発掘された3つの新石器時代の化石の中に見つかっている。[ 46 ]
ハプログループA3-M13の地理的頻度分布。 ハプログループA-M13は、ポンペイのベスビオ山噴火の男性犠牲者からも発見された。[ 47 ]
系統発生学
系統発生史 2002年以前は、学術文献においてY染色体系統樹の命名法が少なくとも7種類存在し、大きな混乱を招いていました。2002年、主要な研究グループが集結し、Y染色体コンソーシアム(YCC)を結成しました。彼らは共同論文を発表し、全員が合意した単一の新しい系統樹を作成しました。その後、集団遺伝学と遺伝子系譜学に関心を持つ市民科学者グループがワーキンググループを結成し、何よりも最新の情報に基づいたアマチュア系統樹の作成に取り組みました。以下の表は、2002年のYCC系統樹という画期的な時点におけるこれらの研究成果をまとめたものです。これにより、古い文献をレビューする研究者は、複数の命名法を迅速に参照できるようになります。
Crucianiら(2011年)による改訂版Y染色体系統樹と、Karafetら(2008年)による系統樹との比較。(ここに示されている「A1a-T」は現在A1として知られており、「A2-T」は現在A1bとして知られている。) ヒトY染色体の初期配列決定では、Y染色体系統樹における最初の分岐は、ハプログループBTを Y染色体アダム およびより広義のハプログループAから分離する突然変異によって起こったことが示唆された。 [ 48 ] その後、Y染色体アダムとBTの間の多くの分岐も知られるようになった。
Y-DNA系統樹の理解における大きな転換は、( Cruciani 2011 ) の発表によってもたらされた。SNPマーカーM91はハプログループBTを識別する鍵と考えられていたが、M91周辺の領域は変異ホットスポットであり、繰り返し逆変異を起こしやすいことが分かった。さらに、ハプログループAの8T領域はM91の祖先状態を表し、ハプログループBTの9Tは1Tの挿入 後に生じた派生状態を表していた。このことから、ハプログループAの最も深い分岐であるサブクレードA1bとA1aの両方が8T領域を持っている理由が説明された。同様に、ハプログループAを識別するためにも使用されていたP97マーカーは、ハプログループAでは祖先状態であったが、ハプログループBTでは派生状態であった。[ 10 ] 最終的に、M91 の逆突然変異傾向と(それゆえ)信頼性の低さから、2016 年に ISOGG によって M91 は定義 SNP として除外されました。 [ 49 ] 逆に、P97 はハプログループ BT の定義マーカーとして保持されています。
YCCツリーの作成には、論文発表実績に基づき、以下の研究チームが参加しました。
系統樹 上記の系統樹は、ISOGG [ 17 ] YCC [ 50 ] および その後 の発表された研究に基づいています。
Y染色体アダム A00 (AF6/L1284)
A00a (L1149、FGC25576、FGC26292、FGC26293、FGC27741)A00b (A4987/YP3666、A4981、A4982/YP2683、A4984/YP2995、A4985/YP3292、A4986、A4988/YP3731)A00c (A12222、A12220、A12221) A0-T (L1085)
A0 (CTS2809/L991)旧A1b A1 (P305)旧A1a-T、A0、A1b A1a (M31)A1b (P108)旧A2-T A1b1 (L419/PF712) A1b1a (L602、V50、V82、V198、V224) A1b1a1 (M14)旧A2 A1b1a1a (M6) A1b1a1a1 (P28)旧称 A1b1a1a1b および A2b A1b1b (M32)旧A3 A1b1b1 (M28)旧A3a A1b1b2 (L427) A1b1b2a (M51/Page42)旧A3b1 A1b1b2b (M13/PF1374)旧A3b2 BT (M91)
参考文献 ↑ ヒトの Y-MRCA の年代推定値に相当します(そちらを参照)。A00 系統を含め、Karmin et al. (2015) と Trombetta et al. (2015) はそれぞれ 254,000 年前と 291,000 年前と推定しています。 ↑ Karmin ら (2015). 「Y染色体多様性の最近のボトルネックは、世界的な文化の変化と一致する」 . Genome Research . 25 (4): 459–66 . doi : 10.1101/gr.186684.114 . PMC 4381518. PMID 25770088 . 「我々は、アフリカにおけるY染色体の最新共通祖先(MRCA)を25万4千年前(95%信頼区間19万2千~30万7千年前)と推定し、アフリカ以外の主要な創始者ハプログループが4万7千~5万2千年前の狭い期間に集中していることを検出した。これは、アフリカからのボトルネック後のユーラシア大陸とオセアニア大陸への急速な初期移住モデルと一致する。ミトコンドリアDNAに基づく人口動態の再構築とは対照的に、我々は過去1万年以内にY染色体系統に2度目の強いボトルネックがあったと推測する。我々は、このボトルネックは男性の生殖成功率のばらつきに影響を与える文化的変化によって引き起こされたと仮説を立てる。」↑ Mendez, L.; et al. (2016). "ネアンデルタール人と現代人のY染色体の分岐" . The American Journal of Human Genetics . 98 (4): 728– 34. doi : 10.1016/j.ajhg.2016.02.023 . PMC 4833433 . PMID 27058445 . ↑ マーク・リプソン。イザベル・リボット。マリック、スワパン。ローランド、ナディン。オラルデ、イニーゴ;アダムスキー、ニコール。ブルーマンドホシュバハト、ナスリーン。ローソン、アン・マリー。ロペス、サイオア州。オッペンハイマー、ジョナス。スチュワードソン、クリスティン。アソンバン、レイモンド・ネバネ。ボシュレンス、エルヴェ。ブラッドマン、ニール。カレットン、ブレンダン J.エルス州コーネリッセン。イザベル・クレヴクール。ド・マレ、ピエール。フォミネ、フォルカ・レイペイ・マシュー。ラバチェリー、フィリップ。ミンジー、クリストフ・ムビダ。オルバン、ロシーヌ。エリザベス・ソーチャック。セマル、パトリック。トーマス、マーク G.ヴァン・ニール、ヴィム。ヴィーラマ、クリシュナ R.ケネット、ダグラス J.パターソン、ニック。 Hellenthal, Garrett; Lalueza-Fox, Carles; MacEachern, Scott; Prendergast, Mary E.; Reich, David (2020年1月30日). 「アフリカの人口史における古代西アフリカの採集民」 . Nature . 577 (7792): 665–670 . Bibcode : 2020Natur.577..665L . doi : 10.1038/ s41586-020-1929-1 . PMC 8386425. PMID 31969706 . ↑ Trombetta, Beniamino; d'Atanasio, Eugenia; Massaia, Andrea; Myres, Natalie M.; Scozzari, Rosaria; Cruciani, Fulvio; Novelletto, Andrea (2015). "Regional Differences in the Accumulation of SNPs on the Male-Specific Partion of the Human Y Chromosome Replicate Autosomal Patterns: Implications for Genetic Dating" . PLOS ONE . 10 (7) e0134646. Bibcode : 2015PLoSO..1034646T . doi : 10.1371/journal.pone.0134646 . PMC 4520482 . PMID 26226630 . ↑ "A00 YTree" 。 ↑ Crucianiらによると。 2011年、最も基底的な系統は西アフリカ 、北西 アフリカ、中央アフリカ で検出されており、Y-MRCAが北中央アフリカの一般的な地域に生息していた可能性を示唆している」。2204個のアフリカ人Y染色体のサンプルでは、8個の染色体がハプログループA1bまたはA1aに属していた。ハプログループA1aは、モロッコのベルベル人2人、ニジェールのフルベ人1人、トゥアレグ人1人で確認された。ハプログループA1bは、カメルーン南部のバコラ・ピグミー3人とアルジェリアのベルベル人1人で確認された。Cruciani , Fulvio; Trombetta, Beniamino; Massaia, Andrea; Destro-Bisol, Giovanni; Sellitto, Daniele; Scozzari, Rosaria (2011). "A Revised Root for the Human Y Chromosomal Phylogenetic Tree: The Origin of Patrilineal Diversity in Africa" 。 アメリカ人類遺伝学ジャーナル 88 (6): 814–8 . doi : 10.1016 / j.ajhg.2011.05.002 . PMC 3113241. PMID 21601174 . Scozzari et al. (2012) は、A1b ハプログループの出現場所として「アフリカ大陸の北西象限」が妥当であるという見解に同意し、「A1b ハプログループの起源がアフリカ大陸の北西象限であるという仮説は、中央西アフリカの古代 Y 系統の最近の発見と合わせて、ヒト MSY 多様性の地理的起源に関する新たな証拠を提供する」と述べている。Scozzari R; Massaia A; D'Atanasio E; Myres NM; Perego UA; et al. (2012). Caramelli, David (ed.). "Molecular Dissection of the Basal Clades in the Human Y Chromosome Phylogenetic Tree" . PLOS ONE . 7 (11) e49170. Bibcode : 2012PLoSO...749170S . doi : 10.1371/ journal.pone.0049170 . PMC 3492319. PMID 23145109 . ↑ Kamin M、Saag L、Vincente M、et al. (2015 年 4 月) 「Y 染色体多様性の最近のボトルネックは、世界的な文化の変化と一致する」 Genome Research 25 ( 4): 459– 466. doi : 10.1101/gr.186684.114 . PMC 4381518 . PMID 25770088 . ↑ Batini C、Ferri G、Destro-Bisol G、et al. (2011 年 9 月)。 「初期 Y 染色体系統の系統地理学によって明らかになった、サハラ以南アフリカにおける農業以前の人類移住プロセスの痕跡」 。Mol . Biol. Evol . 28 (9): 2603–13 . doi : 10.1093/molbev/msr089 . hdl : 10400.13/4486 . PMID 21478374 。 1 2 3 4 クルチアーニ F、トロンベッタ B、マサイア A、デストロビソル G、セリット D、スコッツァーリ R (2011 年 6 月)。 「ヒト Y 染色体の系統樹の改訂されたルート: アフリカにおける父系多様性の起源」 。 午前。 J. ハム。ジュネット 。 88 (6): 814–8 . 土井 : 10.1016/j.ajhg.2011.05.002 。 PMC 3113241 。 PMID 21601174 。 1 2 Scozzari R、Massaia A、D'Atanasio E、et al . (2012)。 「ヒトY染色体系統樹における基底クレードの分子解剖 」 。PLOS ONE。7 ( 11 ) e49170。Bibcode : 2012PLoSO ... 749170S。doi : 10.1371 / journal.pone.0049170。PMC 3492319。PMID 23145109 。 ↑ Carina M. Schlebusch 他 (2017 年 9 月 28 日) 「南アフリカの古代ゲノムから、現代人の分岐は 35 万~ 26 万年前と推定される」 Science 358 ( 6363 ): 652–655 . Bibcode : 2017Sci...358..652S . doi : 10.1126/science.aao6266 . PMID 28971970 . ↑ フランカラッチ P、モレッリ L、アンギウス A、ベルッティ R、ライナー F、アッツェニ R、ピル R、ブゾネロ F、マスキオ A、ザラ I、サンナ D、ウセリ A、ウル MF、マルチェッリ M、クザーノ R、オッポ M、ゾレジェフスカ M、ピツァリス M、デイダ F、ポルキュ E、ポディ F、カン HM、ライオンズ R、タリエ B、グレシャム JB、リー B、トファネリ S、アロンソ S、デイ M、ライ S、ムーラス A、ホエーレン MB、ウザウ S、ジョーンズ C、シュレッシンジャー D、アベカシス GR、サンナ S、シドール C、クッカ F (2013)。 「1200人のサルデーニャ人を対象としたローパスDNA配列決定により、ヨーロッパのY染色体の系統発生が再構築される」 。 科学 。 341 (6145): 565–569 . Bibcode : 2013Sci...341..565F . doi : 10.1126/science.1237947 . PMC 5500864 . PMID 23908240 . Poznik GD、Henn BM、Yee MC、Sliwerska E、Euskirchen GM、Lin AA、Snyder M、Quintana-Murci L、Kidd JM、Underhill PA、Bustamante CD (2013) 「Y染色体の配列決定により、男性と女性の共通祖先までの時間の不一致が解消される」. Science . 341 ( 6145): 562– 565. Bibcode : 2013Sci...341..562P . doi : 10.1126/science.1237619 . PMC 4032117. PMID 23908239 . クルチアーニら。 (2011) 推定 142 kya。1 2 「Y染色体多様 性 の最近のボトルネックは 、 世界的な文化の変化と一致する」 。 ゲノム研究 。25 (4): 459–66 。 2015年 。doi : 10.1101 /gr.186684.114。PMC 4381518。PMID 25770088 。 1 2 「ヒトY染色体の男性特異的部分におけるSNP蓄積の地域差は常染色体のパターンを再現する:遺伝的デートへの示唆」 . PLOS ONE . 10 (7) e0134646. 2015. Bibcode : 2015PLoSO..1034646T . doi : 10.1371/journal.pone.0134646 . PMC 4520482 . PMID 26226630 . 1 2 Abu-Amero KK、Hellani A 、 González AM、Larruga JM、Cabrera VM、Underhill PA (2009)。 「 サウジアラビア の Y 染色体の多様性と近隣地域との関係」 。BMC Genet。10 59。doi : 10.1186 /1471-2156-10-59。PMC 2759955。PMID 19772609 。 1 2 国際遺伝子系図学会。 「Y-DNAハプログループツリー」 。 1 2 Berniell-Lee G、Calafell F、Bosch E、et al. (2009 年 7 月)。 「バントゥー族の拡大の遺伝的および人口統計学的意味:ヒトの父系系統からの洞察」 。Mol . Biol . Evol . 26 ( 7): 1581–9。doi : 10.1093 / molbev/msp069。PMID 19369595 。 1 2 Rosa A、Ornelas C、Jobling MA、Brehm A、Villems R (2007)。 「ギニアビサウの人口におけるY染色体の多様性:多民族の視点」 。BMC Evol. Biol . 7 (1): 124. Bibcode : 2007BMCEE...7..124R . doi : 10.1186/1471-2148-7-124 . PMC 1976131 . PMID 17662131 . 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 Wood ET、Stover DA、Ehret C、et al. (2005 年 7 月)。 「 アフリカにおける Y 染色体と mtDNA 変異の対照的なパターン: 性別による人口動態プロセスの証拠」 。Eur . J. Hum. Genet . 13 (7): 867–76 . doi : 10.1038/sj.ejhg.5201408 . PMID 15856073 . ↑ アンダーヒル PA、パッサリーノ G、リン AA 他(2001 年 1 月)。 「Y染色体二値ハプロタイプの系統地理と現生人類集団の起源」 。 アン。ハム。ジュネット 。 65 (Pt 1): 43–62 . 土井 : 10.1046/j.1469-1809.2001.6510043.x 。 PMID 11415522 。 S2CID 9441236 。 1 2 3 4 5 6 7 8 9 28/53 (ディンカ、ヌエル、シルク)、 Hassan HY、Underhill PA、Cavalli-Sforza LL、Ibrahim ME (2008 年 11 月)。「スーダン人の Y 染色体変異: 制限された遺伝子流動、言語、地理、歴史との一致」。Am . J. Phys. Anthropol . 137 ( 3) : 316–23。Bibcode : 2008AJPA..137..316H。doi : 10.1002 / ajpa.20876。PMID 18618658 。 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 Underhill PA、Shen P、Lin AA、et al. (2000 年 11 月) 。 「Y 染色体配列の変異と人類集団の歴史」。Nat . Genet . 26 (3): 358–61 . doi : 10.1038/81685 . PMID 11062480. S2CID 12893406 . 1 2 3 4 5 6 Cruciani F、Santolamasza P、Shen P、et al. (2002 年 5 月)。 「ヒト Y 染色体ハプロタイプの高解像度解析により 、 アジアからサハラ以南アフリカへの逆移住が裏付けられる」 。Am . J. Hum . Genet . 70 ( 5 ) : 1197–214。Bibcode : 2002AmJHG..70.1197C。doi : 10.1086 / 340257。PMC 447595。PMID 11910562 。 1 2 Shen P、Lavi T、Kivisild T、et al. (2004 年 9 月) 「Y 染色体およびミトコンドリア DNA 配列の変異からのサマリア人およびその他のイスラエル人集団の父系および母系系統の再構築」 Hum . Mutat . 24 (3): 248–60 . doi : 10.1002/humu.20077 . PMID 15300852. S2CID 1571356 . 1 2 クルチアーニ F、トロンベッタ B、セリット D 他(2010 年 7 月)。 「ヒト Y 染色体ハプログループ R-V88: 完新世中期初頭のサハラ横断的なつながりとチャド語の普及に関する父方の遺伝的記録」 。 ユーロ。 J. ハム。ジュネット 。 18 (7): 800– 7. 土井 : 10.1038/ejhg.2009.231 。 PMC 2987365 。 PMID 20051990 。 1 2 3 4 Luis JR、Rowold DJ、Regueiro M、et al. (2004 年 3 月)。 「レバントとアフリカの角:人類移動の双方向回廊の証拠」 。Am . J. Hum. Genet . 74 (3): 532–44 . doi : 10.1086/382286 . PMC 1182266 . PMID 14973781 . 1 2 3 4 セミノ O、サンタキアラ-ベネレセッティ AS、ファラスキ F、カヴァッリ-スフォルツァ LL、アンダーヒル PA (2002 年 1 月)。 「エチオピア人とコイサン人は、ヒトの Y 染色体の系統発生の最も深い分岐群を共有しています 。 」 午前。 J. ハム。ジュネット 。 70 (1): 265–8 . 土井 : 10.1086/338306 。 PMC 384897 。 PMID 11719903 。 1 2 King TE、Parkin EJ、Swinfield G、et al. (2007 年 3 月)。 「ヨークシャーのアフリカ人?イギリスの系図における Y 系統樹の最も根深いクレード」 。Eur . J. Hum. Genet . 15 (3): 288–93 . doi : 10.1038/sj.ejhg.5201771 . PMC 2590664 . PMID 17245408 . ニュース記事: 「ヨークシャーの一族がアフリカとつながり」 。BBC ニュース 。2007年1月24日。 2007年1月27日 閲覧 。 ↑ 16/26、Hassan et al. 2008 ↑ Batini, Chiara; et al. (2011年9月) 「補足データ:初期Y染色体系統の系統地理学によって明らかになったサハラ以南アフリカにおける農業以前の人類移住プロセス の 痕跡 」 。Molecular Biology and Evolution。28 ( 9 ) : 2603–2613。doi : 10.1093 / molbev / msr089。hdl : 10400.13 / 4486。ISSN 0737-4038。OCLC 748733133。PMID 21478374。S2CID 11190055 。 1 2 Di Giacomo F、Luca F、Anagnou N、et al. (2003 年 9 月)。「イタリア本土とギリシャにおけるヒト Y 染色体多様性の勾配パターンは、遺伝的浮動と創始者効果によって支配されている」。Mol . Phylogenet . Evol . 28 ( 3): 387–95。Bibcode : 2003MolPE..28..387D。doi : 10.1016/S1055-7903(03 ) 00016-2。PMID 12927125 。 ↑ ゴンサルベス R、フレイタス A、ブランコ M、他 。 (2005 年 7 月)。 「ポルトガル、マデイラ島、アソーレス島のY染色体系統には、セファルディムとベルベル人の祖先の要素が記録されている。」 アン。ハム。ジュネット 。 69 (Pt 4): 443–54 . 土井 : 10.1111/j.1529-8817.2005.00161.x 。 hdl : 10400.13/3018 。 PMID 15996172 。 S2CID 3229760 。 ↑ Capelli C、Redhead N、Romano V、et al. (2006 年 3 月)。「地中海盆地の集団構造:Y 染色体の観点」。Ann . Hum. Genet . 70 (Pt 2): 207–25 . doi : 10.1111/j.1529-8817.2005.00224.x . hdl : 2108/37090 . PMID 16626331. S2CID 25536759 . ↑ Mendez, Fernando L.; Krahn, Thomas; Schrack, Bonnie; Krahn, Astrid-Maria; Veeramah, Krishna R.; Woerner, August E.; Fomine, Forka Leypey Mathew; Bradman, Neil; Thomas, Mark G.; Karafet, Tatiana M.; Hammer, Michael F. (2013 年 3 月). "アフリカ系アメリカ人の父系系統がヒト Y 染色体の系統樹に極めて古い根を追加" . The American Journal of Human Genetics . 92 (3): 454– 459. doi : 10.1016/j.ajhg.2013.02.002 . PMC 3591855 . PMID 23453668 . 商業遺伝子検査施設に提出されたDNAサンプルの遺伝子型判定により、このアフリカ系アメリカ人のY染色体は、既知のすべてのY染色体SNPの祖先状態を保持していることが示されました。提案された命名法のためにA00と名付けたこの系統をさらに特徴付けるために、Cruciani et al. [2011]の基底枝をA0(以前はA1b)と改名し、現在報告されている系統をA00とします。今後発見される深い枝については、A000などの命名法を継続することを提案します。 ↑ Mendez et al. (2013), p. 455. 引用:「10か国からの5,648サンプルからなる大規模な汎アフリカデータベースを検索した結果、6つのY-STRのうち5つにおいてA00染色体と同一で不変な11個のY染色体を特定しました(11個の染色体のうち2つはDYS19-16を、残りの1つはDYS19-15を保有していました)。これらの11個の染色体はすべて、西カメルーンの174人(約6.3%)のMbo個体のサンプルで見つかりました(図2)。これらのMbo染色体のうち7つはさらなる検査に利用可能であり、A00染色体由来であることが知られている39個のSNPのうち37個で遺伝子型が同一であることがわかりました(つまり、これらの遺伝子型が判明したSNPのうち2つはMboサンプルで祖先型でした)。」 ↑ カメルーンのどの民族にハプログループA00のメンバーがいるのか? // experiment.com 資金提供を受けた研究の更新 (Schrack/Fomine Forka)がオンラインで公開されています。引用: 40%がA00であることから、バンワ族はこの地域、そしておそらく世界でもA00の中心地であることがはっきりとわかります。前回のラボノートでお伝えしたように、これまでのところ、異なるY-SNP変異によって定義されるA00には2つの主要なサブグループがあり、当然ながら民族によって分かれています。バンワ族ではA00a、ムボ族ではA00bです。また、どちらのサブグループにも属さないバンワ族のサンプルも1つ見つかりました。 1 2 "A00 YTree" . www.yfull.com . ↑ リプソン、M;リボット、私。マリック、S;ローランド、N;オラルデ、私。アダムスキー、N;ブルーマンドホシュバハト、N;午前、ローソン。ロペス、S;オッペンハイマー、J;スチュワードソン、K;アソンバン、RN;ボヘレンス、H;ブラッドマン、N;カレットン、BJ。コーネリッセン、E;クレヴクール、私。デ・マレット、P;フォーミネ、FLM。ラバチェリー、P;ミンジー、CM。オルバン、R;ソーチャック、E;セマル、P;トーマス、MG;ヴァン・ニール、W;ヴィーラマ、KR;ケネット、DJ。パターソン、N;ヘレンタール、G;ラルーザ・フォックス、C;マックイーチャーン、S;メイン州プレンダーガスト。ライヒ、D (2020 年 1 月)。 「アフリカ の 人口史における古代西アフリカの採集民」 . Nature . 577 (7792): 665–670 . Bibcode : 2020Natur.577..665L . doi : 10.1038/s41586-020-1929-1 . PMC 8386425. PMID 31969706 . ; Lipson Mark 他「アフリカ人口史の文脈におけるシュム・ラカ(カメルーン)の古代人類DNA」// SAA 2019↑ Gonçalves R、Rosa A、Freitas A、et al. (2003 年 11 月)。「カーボベルデ諸島の Y 染色体系統は、最初の男性入植者の地理的起源の多様性を示している」。Hum . Genet . 113 (6): 467–72 . doi : 10.1007/s00439-003-1007-4 . hdl : 10400.13/3047 . PMID 12942365. S2CID 63381583 . ↑ ヒシャム・Y・ハッサンら。 (2008年)。 「南スーダン人」にはディンカ人 26 人、シルク人 15 人、ヌエル人 12 人が含まれます。 「西スーダン人」にはボルグ26人、マサリット32人、ファー32人が含まれる。 「北スーダン人」にはヌビア人39人、ベジャ人42人、コプト人33人、ガーリアン50人、メセリア人28人、アラキエン人24人が含まれる。 ↑ Cinnioğlu C、King R、Kivisild T、et al. (2004 年 1 月)「アナトリアにおける Y 染色体ハプロタイプ層の発掘」 Hum . Genet . 114 (2): 127–48 . doi : 10.1007/s00439-003-1031-4 . PMID 14586639. S2CID 10763736 . {{cite journal}}: CS1 maint: 複数の名前: 著者リスト (リンク)↑ Nebel A、Filon D、Brinkmann B、Majumder PP、Faerman M、Oppenheim A (2001年11月)。 「中東の遺伝的景観の一部としてのユダヤ人のY染色体プール」 。Am . J. Hum. Genet . 69 (5): 1095–112 . doi : 10.1086/324070 . PMC 1274378 . PMID 11573163 . ↑ Semino O、Passarino G、Oefner PJ 他 (2000 年 11 月) 「現存するヨーロッパ人における旧石器時代のホモ・サピエンス・サピエンスの遺伝的遺産:Y 染色体の観点」 Science . 290 (5494): 1155– 9. Bibcode : 2000Sci...290.1155S . doi : 10.1126/science.290.5494.1155 . PMID 11073453 . ↑ Flores C、Maca-Meyer N、Larruga JM、Cabrera VM、Karadsheh N、Gonzalez AM (2005)。 「移住回廊における孤立集団:ヨルダンにおけるY染色体変異の高解像度解析」 。J . Hum. Genet . 50 (9): 435–41 . doi : 10.1007/s10038-005-0274-4 . PMID 16142507 。 ↑ Yousif, Hisham; Eltayeb, Muntaser (2009年7月). Y染色体およびミトコンドリアDNA変異の遺伝パターンとスーダンへの人類移住への影響 (学位論文)。 2022年8月25日に オリジナルからアーカイブ済み。 2022年8月25日 に取得 。 ↑ スコッラーノ、ガブリエレ。ビバ、セレナ。ピノッティ、トーマス。ファッブリ、ピエル・フランチェスコ。リッカーズ、オルガ。マッチャルディ、ファビオ(2022年5月26日)。 「西暦 79 年のヴェスヴィオ火山の噴火中に死亡した 2 人のポンペイ人の生物考古学的および古遺伝学的肖像画」 。 科学的報告書 。 12 (1): 6468。 ビブコード : 2022NatSR..12.6468S 。 土井 : 10.1038/s41598-022-10899-1 。 PMC 9135728 。 PMID 35618734 。 ↑ Karafet TM、Mendez FL、Meilerman MB、Underhill PA、Zegura SL、Hammer MF (2008)。 「 新しいバイナリ多型 が ヒトY染色体ハプログループツリーを再構築し、解像度を高める」 。Genome Research。18 ( 5 ) : 830–8。doi : 10.1101 / gr.7172008。PMC 2336805。PMID 18385274 。 ↑ ISOGG、2016年、「Y-DNAハプログループツリー2016」 。(アクセス日:2017年8月29日) ↑ Krahn, Thomas. "YCC Tree" . FTDNA. 2011年7月26日に オリジナル からアーカイブ済み。
参考文献 Mendez FL、Krahn T、Schrack Bら (2013年3月)「アフリカ系アメリカ人の父系系統がヒトY染色体の系統樹に極めて古い根を加える」 . Am . J. Hum. Genet . 92 (3): 454–9 . doi : 10.1016/j.ajhg.2013.02.002 . PMC 3591855. PMID 23453668 . PDFファイルとして保存(2019年9月24日、 Wayback Machine にアーカイブ済み) 「YハプログループA系統樹」 。2013年3月。 2018年8月18日にオリジナルからアーカイブ済み。2013年3月30日 に取得。 (2013年3月にA系統樹に追加された新しい枝を強調表示した図)
換算表の出典 Capelli, Cristian; Wilson, James F.; Richards, Martin; Stumpf, Michael PH; et al. (2001 年 2 月). 「東南アジアおよびオセアニアの島嶼部に住むオーストロネシア語族の人々の、主に先住民族の父系遺伝」 . The American Journal of Human Genetics . 68 (2): 432–443 . doi : 10.1086/318205 . PMC 1235276 . PMID 11170891 . Hammer, Michael F.; Karafet, Tatiana M.; Redd, Alan J.; Jarjanazi, Hamdi; et al. (2001年7月1日). "ヒトY染色体の多様性の階層的パターン" . Molecular Biology and Evolution . 18 (7): 1189– 1203. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906 . PMID 11420360 . Jobling, Mark A.; Tyler-Smith, Chris (2000)、「新しいハプロタイプの新しい用途」、Trends in Genetics 、16 (8): 356–62 、doi : 10.1016/S0168-9525(00)02057-6、PMID 10904265 カラジェヴァ、ルバ。カラフェル、フランセスク。ジョブリング、マークA;アンジェリチェワ、ドーラ。他 。 (2001 年 2 月)。「Y染色体とミトコンドリアDNA系統によって明らかにされたVlax Romaの集団間および集団内の遺伝的多様性のパターン」。欧州人類遺伝学ジャーナル 。9 (2): 97–104 .土井 : 10.1038/sj.ejhg.5200597 。PMID 11313742。 Karafet, Tatiana; Xu, Liping; Du, Ruofu; Wang, William; et al. (2001年9月) 「 東アジアの父系集団史:起源、パターン、および微小進化プロセス」『アメリカ人類遺伝学ジャーナル 』 69 ( 3 ): 615–628。Bibcode : 2001AmJHG..69..615K。doi : 10.1086 / 323299。PMC 1235490。PMID 11481588 。 Semino, O.; Passarino, G; Oefner, PJ; Lin, AA; et al. (2000)、「現生ヨーロッパ人における旧石器時代のホモ・サピエンス・サピエンスの遺伝的遺産:AY染色体の観点から」、Science 、290 (5494):1155–9 、Bibcode :2000Sci...290.1155S、doi :10.1126/science.290.5494.1155、PMID 11073453 Su, Bing; Xiao, Junhua; Underhill, Peter; Deka, Ranjan; et al. (1999年12月) 「最終氷期における現代人類の東アジアへの北上移動を示すY染色体証拠」『アメリカ人類遺伝学ジャーナル 』65 (6): 1718–1724 . Bibcode : 1999AmJHG..65.1718S . doi : 10.1086 / 302680 . PMC 1288383. PMID 10577926 . Underhill, Peter A.; Shen, Peidong; Lin, Alice A.; Jin, Li; et al. (2000年11月)「Y染色体配列の 変異と人類集団の歴史」Nature Genetics . 26 (3): 358–361 . doi : 10.1038/81685 . PMID 11062480. S2CID 12893406 .
外部リンク 家系図DNA — YハプログループAプロジェクト FTDNAのアフリカハプログループプロジェクト ハプログループAの拡散(ナショナルジオグラフィック より)