| ハプログループ R1 | |
|---|---|
| 起源地の可能性 | シベリア、中央アジア、南アジアまたは南西アジア[1] [2] [3] |
| 祖先 | R(R-M207) |
| 子孫 | R1a (M420)、R1b (M343) |
| 突然変異の定義 | M173/P241/Page29、CTS916/M611/PF5859、CTS997/M612/PF6111、CTS1913/M654、CTS2565/M663、CTS2680、CTS2908/M666/PF6123、CTS3123/M670、CTS3321/M673、CTS4075/M682、CTS5611/M694、CTS7085/M716/Y481、CTS8116/M730、F93/M621/PF6114、F102/M625/PF6116、F132/M632、F211/Y290、F245/M659/Y477、 FGC189/Y305、L875/M706/PF6131/YSC0000288、L1352/M785/YSC0000230、M306/PF6147/S1、M640/PF6118、M643、M689、M691/CTS4862/PF6042/YSC0001281、M710/PF6132/YSC0000192、M748/YSC0000207、M781、P225、P231、P233、P234、P236、P238/PF6115、P242/PF6113、P245/PF6117、P286/PF6136、P294/PF6112、 PF6120 [4] |
ハプログループ R1、またはR-M173は、 Y 染色体 DNA ハプログループです。ハプログループ R (R-M207) の主要なサブクレードであり、 SNP M173によって定義されます。ハプログループ R のもう 1 つの主要なサブクレードは、ハプログループ R2 (R-M479) です。
現代の集団で R-M173 を持つ男性は、主にユーラシア大陸原産の集団(東アジアと東南アジアを除く)に見られるR1aとR1bの 2 つのサブクレードで構成されているようです。R-M173 には、サブクレード R1a と R1b の形でハプログループ R の代表者の大多数が含まれています(Rosser 2000、Semino 2000)。
構造
起源
R1とその兄弟系統R2(R-M79)は、ハプログループR(R-M207)の唯一の直接の子孫です。RはハプログループP1 (P-M45)の直接の子孫であり、したがってハプログループQ (Q-M242)の兄弟系統です。ハプログループR1の起源は現在証明されていません。SNPトラッカー(2023年5月現在)によると、それは西シベリアの南ウラル山脈とバルハシ湖の間で約25000年前/23000紀元前に進化しました。[5]
基底サブ系統群 R1*の例は、現生個体や古代の遺物ではまだ確認されていない。しかし、親系統群 R* は、シベリアのマルタ・ビュレト文化の後期旧石器時代(24,000 年前)の個体に存在していた。 [6]マルタ・ビュレト人の常染色体 DNA は、集団遺伝学の学者に古代北ユーラシア人(ANE)として知られるグループの一部である。最初の主要な子孫ハプログループは、その後、東ヨーロッパ ( R1a、13 kya) [7]および西ヨーロッパ ( R1b 、14 kya) [8]の狩猟採集民に出現し、その遺伝子型は ANE にさまざまな程度で由来している。[9]
一般配布
ユーラシア
ハプログループ R1 は、東アジアと東南アジアを除くユーラシア全域で非常に一般的です。その分布は、最終氷期極大期後のユーラシアの再定住に関連していると考えられています。その主なサブグループはR1aとR1bです。ハプログループ R1b のサブクレードの 1 つ (特に R1b1a2) は、西ヨーロッパとバシコルトスタンで最も一般的なハプログループです(Lobov 2009)。一方、ハプログループ R1a のサブクレードの 1 つ (特にハプログループ R1a1 ) は、南アジア、東ヨーロッパ、中央アジア、中国西部、南シベリアの大部分で最も一般的なハプログループです。[10]
Y 染色体が、Y-DNA ツリーの内部ノードに M207 (ハプログループ Rを定義) までの変異をすべて備えているが、ハプログループ R1 を定義する M173 変異もハプログループ R2 を定義する M479 変異も示さない個人は、グループR * (R-M207) に属すると分類されます。R* は、パキスタン北部のBurushoのサンプルの 10.3% (10/97) とKalashのサンプルの 6.8% (3/44)で発見されています(Firasat 2007)。
アメリカ大陸
先住民族グループにおけるハプログループ R1 の存在は議論の的となっている。現在、R1 はさまざまなQ-M242に次いで最も一般的なハプログループであり、特に北米ではオジブウェー族が 79%、チペワイアン族が62%、セミノール族が50%、チェロキー族が47%、ドグリブ族が40%、トホノ・オオダム族が38% である。
一部の専門家は、北米で発見されたハプログループR1サブクレードとシベリアで発見されたハプログループR1サブクレード(例えば、レル[11]とラガヴァン[12])の間に大きな類似性があることを指摘し、アジアやベーリング地峡からの先史時代の移民を示唆している。
アフリカ
現在 R1b1a2 (R-V88) として知られているサブクレードの 1 つは、フラニ族などの西アフリカ原住民の間でのみ高頻度に見られ、先史時代のユーラシアからアフリカへの逆移住を反映していると考えられています。[出典が必要]
サブクレード分布
R1a(R-M420)
R1a(M420)の分岐は、およそ25,000年前(95% CI:21,300–29,000 BP)、つまり最終氷期極大期と推定されている。2014年に実施された大規模な研究(Underhill et al. 2015)では、ユーラシア大陸全土の126を超える集団から16,244人を対象に、「ハプログループR1aの多様化の初期エピソードは、現在のイラン付近で発生した可能性が高い」という説得力のある証拠があると結論付けられた。[13] サブクレードM417(R1a1a1)は約5,800年前に多様化した。[14]中央および東ヨーロッパにおけるM417サブクレードR1-Z282(R1-Z280を含む)[15]とアジアにおけるR1-Z93 [15] [16]の分布は、R1a1aがユーラシアステップまたは中東およびコーカサス地域内で多様化したことを示唆している。[15]これらのサブクレードの起源地は、インド・ヨーロッパ人の起源に関する議論において重要な役割を果たしている。ハプログループR1aの頻度が高いのは、西ベンガル州 バラモン(72%)、 ウッタル・プラデーシュ州バラモン(67%)、イシュカシミ(68%)、パンジケントのタジク人(64%)、中央キルギスタンのキルギス人(63.5%)、ソルブ人(63.39%)、ビハール州バラモン(60.53%)、ショール人(58.8%)[17]、ポーランド人(56.4%)、テレウト人(55.3%)[17] 、南アルタイ人(58.1%)[18] 、ウクライナ人(50%)、ロシア人(50%)(セミノ2000年、ウェルズ2001年、ベハール2003年、シャルマ2007年)である。
R1b (R-M343)
ハプログループR1bは、おそらく最終氷期以前またはその最中にユーラシア大陸で発生した。西ヨーロッパとバシコルトスタンで最も一般的なハプログループである(Lobov 2009)。最終氷期極大期には、南ウラル山脈とエーゲ海付近の避難所で生き残った可能性がある[19](Lobov 2009)。
また、東ヨーロッパ全域でも低頻度で存在し、西ヨーロッパよりも多様性が高いことから、ハプログループR1bが東から古代に移住した可能性が示唆されている。[20]ハプログループR1bは、その起源地である可能性が高いウラル山脈や中央アジア付近の多くの異なる集団でも、さまざまな頻度で発見されている。
このハプログループと、南ヨーロッパおよび西ヨーロッパにおけるセンタム支族インド・ヨーロッパ語族の広がりとの間には相関関係がある可能性がある。例えば、R1bの現代的発生率は、スペイン、ポルトガル、フランス、イギリス、アイルランドのほとんどの地域で男性人口の60%から90%に達している。[21]この系統はチャド盆地でも最大90%の頻度で見られ、北アフリカにも存在し、アルジェリアの一部ではその頻度が10%を超えている。
南アジアでは稀ではあるが、いくつかの集団ではR1bの割合が比較的高い。これらには、37%を示すランバディ族 (Kivisild 2003) 、32 %のハザラ族 (Sengupta 2005)、30 %のアガリア族(東インド) (Sengupta 2005) が含まれる (これらのほかに、 バローチ族(8%)、ベンガル族(6.5%)、チェンチュ族 (2%)、マクラニ族(5%)、ネワール族(10.6%)、パラン族 (3.5%)、パンジャブ族(7.6%) でR1bが出現している (Kivisild 2003、Sengupta 2005、およびGayden 2007)。東南アジアでは、スペインとアメリカの植民地化によりフィリピンに存在2001年にスタンフォード大学アジア太平洋研究センターが実施した調査では、ヨーロッパY-DNA R1bを持つ男性は3.6%であったが、公共Y-DNA図書館では13%に増加した。[22] [23] [24]
R-M343(以前はHg1 [要出典]およびEu18 [要出典]と呼ばれていた)は、ヨーロッパで最も頻度の高いY染色体ハプログループです。これはR-M173の派生であり、M343マーカーによって特徴付けられます。[25] R-M343のメンバーの圧倒的多数はR-P25(P25マーカーによって定義)に分類され、残りはR-M343*に分類されます。その頻度は西ヨーロッパで最も高くなっています(現代のヨーロッパからの移民により、アメリカ大陸の一部でも高くなっています)。ヨーロッパ系のR-M343キャリアの大部分は、R-M269(R1b1a2)子孫に属します。
参照
遺伝学
Y-DNA R-M207サブクラス
参考文献
- ^ キヴィシルド 2003
- ^ ソアレス 2010
- ^ (Wells 2001) [リンク切れ ]
- ^ Y-DNA ハプログループ R とそのサブクレード – 2008 ISOGG より
- ^ 「SNPトラッカー」。
- ^ ヴォルフガング、ハーク;ラザリディス、イオシフ。パターソン、ニック。ローランド、ナディン。マリック、スワパン。ラマ、バスティアン。ブラント、グイド。ノルデンフェルト、スザンヌ。ハーニー、イーダオイン。スチュワードソン、クリスティン。フー、チャオメイ(2015 年 2 月 10 日)。 「草原からの大規模な移住は、ヨーロッパにおけるインド・ヨーロッパ語族の源となっている。」bioRxiv : 013433.arXiv : 1502.02783。土井:10.1101/013433。S2CID 196643946。
- ^ サーグ、レーティ;ワシリエフ、セルゲイ V.ヴァルル、リーヴィ。コソルコワ、ナタリア V。ゲラシモフ、ドミトリ V.。オシブキナ、スヴェトラーナ V.グリフィス、サミュエル J.ソルニク、アヌ。サーグ、ラウリ。ダタナシオ、エウジェニア。メツパル、エネ(2021年1月)。 「東ヨーロッパ平原における石器時代から青銅器時代への移行における遺伝的祖先の変化」。科学の進歩。7 (4): eabd6535。Bibcode :2021SciA....7.6535S。土井:10.1126/sciadv.abd6535。PMC 7817100。PMID 33523926。
- ^ Fu Q, Posth C, Hajdinjak M, Petr M, Mallick S, Fernandes D, et al. (2016年6月). 「氷河期ヨーロッパの遺伝史」. Nature . 534 (7606): 200–5. Bibcode :2016Natur.534..200F. doi :10.1038/nature17993. hdl : 10211.3/198594. PMC 4943878. PMID 27135931.
- ^ ヴォルフガング、ハーク;ラザリディス、イオシフ。パターソン、ニック。ローランド、ナディン。マリック、スワパン。ラマ、バスティアン。ブラント、グイド。ノルデンフェルト、スザンヌ。ハーニー、イーダオイン。スチュワードソン、クリスティン。フー・チャオメイ(2015年6月)。 「草原からの大規模な移住は、ヨーロッパにおけるインド・ヨーロッパ語族の源となった。」自然。522 (7555): 207–211。arXiv : 1502.02783。Bibcode :2015Natur.522..207H。土井:10.1038/nature14317. ISSN 1476-4687。PMC 5048219。PMID 25731166。
- ^ “Results for R1b1 Members”. 2009年3月13日時点のオリジナルよりアーカイブ。2019年12月27日閲覧。
- ^ Lell Jeffrey T.; Sukernik Rem I.; Starikovskaya Yelena B.; Su Bing; Jin Li; Schurr Theodore G.; Underhill Peter A.; Wallace Douglas C. (2002). 「ネイティブアメリカンの二重起源とシベリアとの類似性」.アメリカ人類遺伝学ジャーナル. 70 (1): 192–206. doi :10.1086/338457. PMC 384887. PMID 11731934 .
- ^ ラガヴァン・マアナサ;スコグランド・ポントゥス。グラフ・ケリー・E.メツパル・メイト。アルブレヒツェン・アンダース;モルトケ・アイダ;ラスムッセン・シモン。トーマス・W・スタッフォード・ジュニア;オーランド・ルドヴィック;メツパル・エネ。カーミン・モニカ。タンベツ・クリスティーナ。ルーツィ・シリ。マギ・リードク;カンポス ポーラ F.バラノフスカ・エレナ。バラノフスキー・オレグ;クスナットディノワ・エルザ。リトビノフ・セルゲイ。オシポワ・ルドミラ・P.フェドロワ・サルダナ・A.ヴォエヴォダ ミハイル I.デジョルジオ・マイケル;シケリッツ・ポンテン・トーマス;ブルナク・ソレン。他。 (2013年)。 「(2014 年 1 月 2 日)。「上部旧石器時代のシベリアのゲノムは、アメリカ先住民の二重祖先を明らかにする」。自然。505 (7481): 87–91. Bibcode : 2014Natur.505 ...87R. doi :10.1038/nature12736. PMC 4105016. PMID 24256729.
- ^ アンダーヒル、ピーター A. (2015)、「Y染色体ハプログループR1aの系統学的および地理的構造」、ヨーロッパ人類遺伝学ジャーナル、23 (1): 124–131、doi :10.1038/ejhg.2014.50、PMC 4266736、PMID 24667786
- ^ アンダーヒル2014、130ページ。
- ^ abc パムジャブ 2012.
- ^ アンダーヒル 2014年。
- ^ ab Miroslava Derenko et al 2005、「バイカル湖とアルタイ・サヤン地域の南シベリアの人口におけるY染色体変異の対照的なパターン」Wayback Machineで2022年3月30日にアーカイブ
- ^ Khar'kov, VN (2007)、「Y染色体ハプログループのデータから推定される北部アルタイ人と南部アルタイ人の遺伝子プールの違い」、Genetika、43 (5): 675–87、doi :10.1134/S1022795407050110、PMID 17633562、S2CID 566825
- ^ Robino C, Crobu F, Di Gaetano C, et al. (2008年5月). 「アルジェリア人集団サンプルにおけるY染色体SNPハプログループとSTRハプロタイプの分析」. Int. J. Legal Med . 122 (3): 251–5. doi :10.1007/s00414-007-0203-5. PMID 17909833. S2CID 11556974.
- ^ “Variations of R1b Ydna in Europe: Distribution and Origins | WorldFamilies.net”. www.worldfamilies.net . 2018年10月9日時点のオリジナルよりアーカイブ。2019年12月27日閲覧。
- ^ 「ヨーロッパ人男性の大半はツタンカーメン王と血縁関係:DNA検査でヨーロッパ人の間に奇妙な遺伝的つながりが判明、エジプト人のほとんどはツタンカーメン家系ではない」。メトロNY。ロイター。2011年8月2日。2012年3月23日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2011年9月14日閲覧。
- ^ 「アプライドバイオシステムズ社がフィリピン人105人のサンプル集団を対象に、平均的なフィリピン人のY-DNAを分析したところ、サンプルの約0.95%がY-DNAハプロタイプ「H1a」を持っていることがわかった。これは南アジアで最も一般的で、ヒンズー教を広め、セブやブトゥアンのようなインド系ラジャスタンを建設した植民地時代以前のインド人宣教師を通じてフィリピンに広まった。R1bの頻度が13%であることもスペイン人との混血を示している」。2017年5月25日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年10月20日閲覧。
- ^ “Manual Collation”. 2022年10月26日時点のオリジナルよりアーカイブ。2022年10月26日閲覧。
- ^ フィリピンDNAプロジェクト 2023年2月4日アーカイブ- Y-DNAクラシックチャート
- ^ 以前の文献では、「R1b」ハプログループを定義するために、M343 ではなく M269 マーカーが使用されていたことに注意してください。その後、しばらくの間 (2003 年から 2005 年まで)、現在の R1b1c は R1b3 と指定されていました。
引用文献
- Gayden, T; Cadenas, AM; Regueiro, M; Singh, NB; Zhivotovsky, LA; Underhill, PA; Cavalli-Sforza, LL; Herrera, RJ (2007)、「遺伝子流動に対する方向性障壁としてのヒマラヤ山脈」、American Journal of Human Genetics、80 (5): 884–94、doi :10.1086/516757、PMC 1852741、PMID 17436243
- Behar、Thomas、MG、Skorecki、K、Hammer、MF、Bulygina、E、Rosengarten、D、Jones、AL、Held、K、Moses、V (2003)、「アシュケナージ・レビ人の複数の起源:近東およびヨーロッパの祖先の両方に対するY染色体の証拠」(PDF)、Am. J. Hum. Genet.、vol. 73、no. 4、pp. 768–779、doi:10.1086/378506、PMC 1180600、PMID 13680527
- ルイジ・ルカ・カヴァッリ=スフォルツァ(1994年)『人類遺伝子の歴史と地理』プリンストン大学出版、ISBN 978-0-691-08750-4
- Cinnioğlu, C; et al. (2004)、「アナトリアにおける Y 染色体ハプロタイプ層の発掘」、Hum Genet、114 (2): 127–48、doi :10.1007/s00439-003-1031-4、PMID 14586639、S2CID 10763736
- Firasat, S.; Khaliq, S.; Mohyuddin, A.; Papaioannou, M.; Tyler-Smith, C.; Underhill, PA; Ayub, Q. (2007). 「パキスタンのパタン族人口に対するギリシャ人の限定的寄与を示すY染色体証拠」。European Journal of Human Genetics . 15 (1): 121–26. doi :10.1038/sj.ejhg.5201726. PMC 2588664. PMID 17047675 .
- Kivisild, T.; Rootsi, S.; Metspalu, M.; Mastana, S.; Kaldma, K.; Parik, J.; Metspalu, E.; Adojaan, M.; Tolk, H.-V.; Stepanov, V.; Gölge, M.; Usanga, E.; Papiha, SS; Cinnioğlu, C.; King, R.; Cavalli-Sforza, L.; Underhill, PA; Villems, R. (2003). 「最古の入植者の遺伝的遺産はインディアン部族とカースト集団の両方に残っている」。アメリカ人類遺伝学ジャーナル。72 (2): 313–332。doi : 10.1086 /346068。ISSN 0002-9297。PMC 379225 。PMID 12536373。
- Lobov AS, et al. (2009). 「バシキール人亜集団の遺伝子プールの構造」(PDF) (ロシア語)。2011年8月16日時点のオリジナル(PDF)からアーカイブ。
- Pamjav (2012 年 12 月)、「短報: 新しい Y 染色体バイナリ マーカーによりハプログループ R1a1 内の系統分類の解像度が向上」、American Journal of Physical Anthropology、149 (4): 611–615、doi :10.1002/ajpa.22167、PMID 23115110
- Passarino ら (2002)、「mtDNA と Y 染色体多型の分析によって明らかになったノルウェー人の異なる遺伝的要素」、Eur. J. Hum. Genet.、vol. 10、no. 9、pp. 521–9、doi : 10.1038/sj.ejhg.5200834、PMID 12173029
- Saha; et al. (2005)、「Y染色体遺伝子流動を反映したインドの5つの異なる人口グループ間の遺伝的親和性」、J. Hum. Genet.、vol. 50、no. 1、pp. 49–51、doi : 10.1007/s10038-004-0219-3、PMID 15611834
- Semino; et al. (2000)、「現存するヨーロッパ人における旧石器時代のホモ・サピエンス・サピエンスの遺伝的遺産」(PDF)、Science、vol. 290、no. 5494、pp. 1155–9、Bibcode :2000Sci...290.1155S、doi :10.1126/science.290.5494.1155、PMID 11073453、 2003年11月25日時点の オリジナル(PDF)からアーカイブ
- セングプタら (2005)、「インドにおける高解像度 Y 染色体分布の極性と時間性は、先住民族と外来族の両方の拡大を識別し、中央アジアの牧畜民のわずかな遺伝的影響を明らかにする」、Am. J. Hum. Genet.、vol. 78、no. 2、pp. 202–21、doi :10.1086/499411、PMC 1380230、PMID 16400607
- シャルマ、スワーカー。ライ、エクタ。バート、オーデシュ K;アマルジット・S・バンワー;バメザイ、ラメシュワル NK (2007)。 「インドにおけるヒトY染色体ハプログループQの新規サブグループQ5」。BMC進化生物学。7 (1): 232。ビブコード:2007BMCEE...7..232S。土井: 10.1186/1471-2148-7-232。PMC 2258157。PMID 18021436。
- Soares; et al. (2010)、「ヨーロッパの考古遺伝学」、Current Biology、20 (4): R174–83、Bibcode :2010CBio...20.R174S、doi : 10.1016/j.cub.2009.11.054、PMID 20178764、S2CID 7679921
- Wells; et al. (2001)、「ユーラシアのハートランド: Y染色体の多様性に関する大陸的視点」、Proc. Natl. Acad. Sci. USA、vol. 98、no. 18、pp. 10244–9、Bibcode :2001PNAS...9810244W、doi : 10.1073/pnas.171305098、PMC 56946、PMID 11526236また[1]
- Rosser ZH、Zerjal T、Hurles ME、Adojaan M、Alavantic D、Amorim A、Amos W、Armenteros M、他 (2000)。「ヨーロッパの Y 染色体の多様性は、言語よりも地理によって主に影響を受ける、臨床的である」。アメリカ人類遺伝 学ジャーナル。67 (6): 1526–1543。doi : 10.1086/ 316890。PMC 1287948。PMID 11078479。
