Loading article…
.svg/500px-Tree_Of_Life_(with_horizontal_gene_transfer).svg.png){kind=spacer}
水平遺伝子伝達（HGT）または水平遺伝子伝達（LGT）[1] [2] [3]は、親から子（生殖）への（「垂直」） DNA伝達以外の生物間の遺伝物質の移動です。[4] HGTは多くの生物の進化において重要な要素です。[5] [6] HGTは、高次進化の科学的理解に影響を与えているだけでなく、細菌の進化に対する見方を大きく変えています。[7]
水平遺伝子伝播は細菌における抗生物質耐性の拡大の主なメカニズムであり[8] [5] [9] [10] 、人間が作り出した殺虫剤などの新規化合物を分解できる細菌の進化[11]や、毒性の進化、維持、伝達に重要な役割を果たしている。[12]これには温帯バクテリオファージやプラスミドが関与することが多い。[13] [14] [15]ある種の細菌における抗生物質耐性の原因遺伝子は、形質転換、形質導入、接合などのさまざまな水平遺伝子伝播メカニズムを通じて別の種の細菌に伝播し、抗生物質耐性遺伝子の受容体を抗生物質に対して武装させることができる。このように抗生物質耐性遺伝子が急速に広がることは、医学分野での管理が課題になりつつある。生態学的要因も抗生物質耐性遺伝子の水平遺伝子伝播に役割を果たしている可能性がある。[16]
水平遺伝子伝播は、異なる原核生物の系統間で遺伝子を分配する広範な進化プロセスとして認識されており[17]、真核生物にも関与する可能性があります。[18] [19] HGT イベントは、原核生物よりも真核生物ではあまり発生しないと考えられています。しかし、HGT は多くの真核生物種で比較的一般的であり、新しい環境への適応に影響を与える可能性があることを示す証拠が増えています。しかし、その研究は、真核生物ゲノムの複雑さと反復配列に富む領域の多さによって妨げられており、伝播した遺伝子の正確な識別と特徴付けが複雑になっています。[20] [21]
HGTは普遍的な生命生化学の維持を促進し、ひいては遺伝コードの普遍性を促進すると仮定されている。[22]
歴史
1928年にフレデリック・グリフィスによって報告されたグリフィスの実験[23]は、細菌が形質転換と呼ばれるプロセスを通じて遺伝情報を伝達できることを示唆した最初の実験でした。[24] [25] グリフィスの発見に続いて、 1930年代後半から1940年代初頭にかけて、この遺伝情報を伝達する物質として DNAを単離する研究が行われました。
水平遺伝子伝播は1951年にシアトルで発表され、その論文では、ウイルス遺伝子をジフテリア菌に伝播させることで非毒性株から毒性株が作り出されることを実証し、[26]同時にジフテリアのメカニズム（患者は細菌に感染しても症状が出ず、その後突然転換するか、転換しない）を明らかにし、[27]溶原性サイクルの関連性を示す最初の例を示した。[28]細菌間の遺伝子伝播は、1959年に日本で初めて発表され、異なる細菌種間での抗生物質耐性の伝播を実証した。[29] [30] 1980年代半ば、シバネン[31]は、生物学的に重要な水平遺伝子伝播は地球上の生命の始まりから存在し、進化の歴史全体を形作るのに関与してきたと仮説を立てた。
Jian、Rivera、Lake (1999) は次のように述べている。「遺伝子とゲノムの研究は、原核生物間でかなりの水平伝播が起こっていることをますます示しつつある」[32] (Lake and Rivera、2007 も参照)。[33]この現象は、単細胞真核生物にも何らかの意味を持っていたようだ。Bapteste ら (2005) は、「さらなる証拠は、遺伝子伝播が原生生物の進化においても重要な進化メカニズムである可能性を示唆している」と述べている。[34]
ある植物を別の植物に接ぎ木すると、葉緑体（光合成を行う植物細胞内の細胞小器官）、ミトコンドリアDNA、ゲノムを含む細胞核全体が移行し、新しい種が生まれる可能性があります。[35]一部の鱗翅目（オオカバマダラやカイコなど）は、スズメバチブラコウイルスからの水平遺伝子移行によって遺伝子組み換えが行われています。[36]サシガメ科の昆虫に刺されると、寄生虫を介してトリパノソーマ性シャーガス病に感染し、そのDNAがヒトゲノムに挿入される可能性があります。[37]細菌からヒトへの水平遺伝子移行ががんに関与している可能性が示唆されています。[38]
アーロン・リチャードソンとジェフリー・D・パーマーは次のように述べています。「水平遺伝子伝達（HGT）は細菌の進化に大きな役割を果たしており、特定の単細胞真核生物では非常に一般的です。しかし、多細胞真核生物の進化におけるHGTの普及と重要性は不明のままです。」[39]
これらの現象が進化にとって重要であることを示唆する証拠が増えているため（下記参照）、ピーター・ゴーガルテンなどの分子生物学者は、水平遺伝子伝達を「生物学の新しいパラダイム」と表現しています。[40]
メカニズム
水平遺伝子伝達にはいくつかのメカニズムがある: [5] [41] [42]
- 形質転換とは、外来遺伝物質（DNAまたはRNA）の導入、取り込み、発現によって生じる細胞の遺伝子改変である。 [43]このプロセスは細菌では比較的一般的であるが、真核生物ではそれほど一般的ではない。[44]形質転換は、実験や産業または医療用途のために細菌に新しい遺伝子を挿入するために研究室でよく使用される。分子生物学およびバイオテクノロジーも参照。[要出典]
- 形質導入とは、細菌のDNAがウイルス（バクテリオファージまたはファージ）によってある細菌から別の細菌へと移動されるプロセスである。[43]
- 細菌接合は、細胞間接触中にドナー細胞から組み換え受容体細胞へプラスミドを介してDNAを伝達するプロセスである。[43]
- 遺伝子導入因子は、アルファプロテオバクテリア目ロドバクテリアに見られる宿主によってコードされるウイルス様要素である。[45]
水平トランスポゾン伝達
転移因子（TE）（トランスポゾンまたはジャンピング遺伝子とも呼ばれる）は、耐性遺伝子を拾い上げてプラスミドまたは染色体に挿入し、抗生物質耐性の水平遺伝子伝達を誘発することがある可動性DNAセグメントである。[43]
水平転移遺伝子伝達（HTT）とは、親から子への遺伝以外の手段でゲノム間をある遺伝子座から別の遺伝子座に移動する能力を特徴とするDNA断片の通過を指す。水平遺伝子伝達は長い間、原核生物の進化に不可欠であると考えられてきたが、HTTは真核生物の進化においても一般的かつ広範囲にわたる現象であることを示すデータが増えている。[46]転移因子側では、水平伝達によるゲノム間の拡散は、浄化選択、突然変異の減衰、および/または宿主防御機構による排除を回避する戦略と見なすことができる。[47]
HTTはどのタイプの転移因子でも起こり得るが、DNAトランスポゾンとLTRレトロ因子の方がHTTが起こり得る可能性が高い。なぜなら、どちらも安定した二本鎖DNA中間体を持ち、非LTRレトロ因子の一本鎖RNA中間体（高度に分解される可能性がある）よりも頑丈であると考えられているからである。[46] 非自律因子は、自身の移動に必要なタンパク質をコードしていないため、自律因子に比べて水平伝播する可能性が低い可能性がある。これらの非自律因子の構造は、一般に、トランスポザーゼタンパク質をコードするイントロンのない遺伝子で構成されており、プロモーター配列がある場合とない場合がある。移動領域内にプロモーター配列がコードされていないものは、発現のために隣接する宿主プロモーターに依存する。[46]水平伝播はTEライフサイクルで重要な役割を果たすと考えられている。[46]植物では、コピアスーパーファミリーのLTRレトロトランスポゾン、特にアレ系統とイヴァナ系統のコピー数が少ないものは、異なる植物種間で水平伝播する可能性が高いようです。 [48]
HTTは植物[49]と動物(Ivancevic et al. 2013)の両方において種間および大陸間で発生することが示されているが、一部のTEは特定の種のゲノムに他の種よりもうまく定着することが示されている。[50]種の空間的および分類学上の近接性は、植物と動物の両方においてHTTに有利であると提案されている。[49]個体群の密度が個体群内のHTTイベントの速度にどのように影響するかは不明であるが、寄生による近接性と混雑による交差汚染は、植物と動物の両方においてHTTに有利であると提案されている。[49]植物では、つる植物と樹木の相互作用が自然生態系でHTTを促進することが示されている。[48] 転移因子の正常な伝達には、ドナーから宿主細胞(多細胞生物の場合は生殖細胞系)へのDNAの送達と、それに続く受容宿主ゲノムへの統合が必要である。[46]ドナー細胞から宿主細胞へのTEの輸送の実際のメカニズムは不明ですが、裸のDNAとRNAが体液中を循環できることは確立されています。[46]多くの提案されているベクターには、節足動物、ウイルス、淡水巻貝（Ivancevic et al. 2013）、共生細菌、 [47]および細胞内寄生細菌が含まれます。[46]場合によっては、TEでさえ他のTEの輸送を促進します。[50]
宿主ゲノムに新しい TE が出現すると、TE の移動性が突然変異を誘発する可能性があるため、有害な結果を招く可能性があります。しかし、HTT は、ゲノムに新しい遺伝物質を導入し、宿主間で遺伝子と TE ドメインのシャッフルを促進することで有益な場合もあります。これは、宿主ゲノムによって新しい機能を実行するために利用される可能性があります。[50]さらに、転座活性は TE コピー数を増加させ、染色体再編成ホットスポットを生成します。[51] HTT の検出は、宿主ゲノム内の TE の発生頻度と構成が常に変化している進行中の現象であるため、困難な作業です。さらに、HTT が分析された種はほとんどなく、種間の HTT イベントのパターンを確立することは困難です。これらの問題は、祖先種と現在の真核生物種間の HTT イベントの過小評価または過大評価につながる可能性があります。[51]
検出方法
水平遺伝子伝達は、典型的にはバイオインフォマティクスの手法を用いて、非定型的な配列シグネチャ（「パラメトリック」手法）を識別するか、特定の配列の進化史とその宿主の進化史の間に大きな相違があることを識別することによって推測されます。受容種で見つかった伝達遺伝子（異種遺伝子）は、予想以上にドナー種の遺伝子と密接に関連しています。[引用が必要]
ウイルス
ミミウイルスと呼ばれる ウイルスはアメーバに感染します。スプートニクと呼ばれる別のウイルスもアメーバに感染しますが、ミミウイルスがすでに同じ細胞に感染していない限り増殖することはできません。[52]
スプートニクのゲノムは、その生物学的側面をさらに詳しく明らかにしている。スプートニクの遺伝子のうち13個は他の既知の遺伝子とほとんど類似性がないが、3個はミミウイルスやママウイルスの遺伝子と密接に関連しており、おそらくこの小さなウイルスが歴史のどこかで粒子を包み込む際に共食いしたのだろう。これは、サテライトウイルスがウイルス間で水平遺伝子伝達を行う可能性があることを示唆しており、バクテリオファージが細菌間で遺伝子を運ぶのと似ている。[53]
水平伝播はジェミニウイルスとタバコ植物の間でも見られます。
原核生物
水平遺伝子伝達は細菌の間では一般的であり、非常に遠い関係にある細菌の間でも行われている。このプロセスは、1つの細菌細胞が耐性を獲得し、耐性遺伝子が他の種に伝達されるときに、薬剤耐性の増加の重要な原因であると考えられている[ 5] [54]。[ 55 ] [56]転座と水平遺伝子伝達は、強力な自然選択力とともに、 S. aureusや他の多くの病原細菌の多剤耐性株をもたらしました。[43]水平遺伝子伝達は、細菌間での外毒素や外酵素などの毒性因子の拡散にも役割を果たしています。[5]外毒素の拡散に関する主な例は、Shigella種の細菌による形質導入を介した水平遺伝子伝達による大腸菌の志賀毒素の適応進化です。[57]これらの特定の毒性因子と可動性遺伝要素を標的とすることで、特定の細菌感染症と戦う戦略が提案されています。[12]例えば、水平伝播する遺伝要素は、大腸菌、サルモネラ菌、連鎖球菌、ウェルシュ菌の毒性において重要な役割を果たしている。[5]
原核生物では、制限修飾システムは水平遺伝子伝達に対する免疫を提供し、可動性遺伝要素を安定化させることが知られています。制限修飾システムをコードする遺伝子は、プラスミド、プロファージ、挿入配列/トランスポゾン、接合要素（ICE）[58]、インテグロンなどの可動性遺伝要素（MGE）内で原核生物ゲノム間を移動することが報告されています。それでも、それらはMGEにコードされた細胞感染ツールというよりも、染色体にコードされたMGEに対する障壁であることの方が多いです。[59]
可動性遺伝要素、すなわち統合接合要素（ICE） Bs1を介した水平遺伝子伝達は、グラム陽性枯草菌の全体的DNA損傷SOS応答における役割が報告されている。[60]さらに、これは宇宙船のクリーンルーム施設から分離されたバチルス・プミルスSAFR-032胞子の放射線および乾燥耐性と関連付けられている。 [61] [62] [63] [64 ]
トランスポゾン挿入要素は、主要な転座またはゲノム再編成のいずれかによってグラム陰性大腸菌株の適応度を高め、突然変異率を上昇させることが報告されている。 [65] [66]非病原性大腸菌に対する模擬微小重力の長期曝露の影響に関する研究では、SOSストレス応答に関連する遺伝子座でトランスポゾン挿入が発生することが示された。[67]同じ大腸菌株を模擬微小重力と微量（背景）レベルの（広域スペクトル）抗生物質（クロラムフェニコール）の組み合わせに曝露したところ、トランスポゾン介在再編成（TMR）が起こり、細菌接着に関与する遺伝子が破壊され、運動性および走化性に関与するいくつかの遺伝子の一部が削除された。[68]これらの研究は両方とも、リアルタイムの宇宙条件における微生物の増殖、適応、抗生物質耐性に影響を与えている。
水平遺伝子伝播は、二次代謝産物や特殊代謝産物の生産に関わる細菌ゲノムにおいて特に活発である。[69]これは、 P. aeruginosaや放線菌綱のactinomycetalesなどの特定の細菌群で明確に表れている。[70] ポリケチド合成酵素(PKS) と生合成遺伝子クラスターは、関連遺伝子のモジュール組織を提供し、これらの細菌が HGT を介して有用なモジュール修飾を獲得および破棄するのに適応できるようにしている。[要出典]ホットスポットとして知られる遺伝子の特定の領域は、水平伝播した二次代謝産物生産遺伝子の可能性をさらに高める。[71] 酵素の乱交性は、この特定の舞台で繰り返し登場するテーマである。[要出典]
細菌の変化
自然形質転換は、DNA転移（HGT）のための細菌の適応であり、このプロセスの原因となる多数の細菌遺伝子の発現に依存している。[72] [73]一般に、形質転換は複雑でエネルギーを必要とする発達過程である。細菌が外来DNAを結合し、取り込み、染色体に組み換えるためには、細菌はコンピテントになる、つまり特別な生理学的状態に入る必要がある。枯草菌におけるコンピテントの発達には約40個の遺伝子の発現が必要である。[74]宿主染色体に組み込まれるDNAは通常（まれな例外はあるが）、同じ種の別の細菌に由来し、したがって常在染色体と相同である。自然形質転換の能力は、少なくとも67種の原核生物で見られる。[73]形質転換の コンピテントは、通常、細菌増殖の定常期に関連する条件である高細胞密度および/または栄養制限によって誘導される。能力はDNA修復のための適応であると思われる。[75]細菌における形質転換は、2つの個体の相同DNAが相互作用して組み換えDNAを形成し、それが次の世代に受け継がれるため、原始的な性的プロセスと見なすことができます。形質導入はバクテリオファージに最もよく関連するHGTの形式ですが、特定のファージも形質転換を促進できる可能性があります。[76]
細菌接合
前述のように、接合は細胞間の接触による水平遺伝子伝達の方法である。[43]接合のプロセスを通じて、IV型分泌システム（T4SS）は、ドナー細胞からレシピエント細胞へのDNAの通過に使用される。[77]プラスミド内にコード化されたこれらのT4SSは、接合において細胞を補完するのに役立つ他のタンパク質や遺伝子を運ぶ。研究によると、接合プラスミド内にコード化された単一結合DNA結合タンパク質（SSB）も接合と細胞生存を助ける可能性があることがわかっている。[78]これは、SSBが一本鎖DNA（ssDNA）の安定化を助けるために自然に発現されるためであると考えられている。[79] SSBはまた、DNAの組み換え、修復、複製の際に発現するRadDやRecAなどの他のタンパク質もリクルートする。[80] [81]これは接合におけるそれらの可能性のある役割をさらに示している。役に立つかもしれないが、研究ではSSBのようなタンパク質が接合に必須ではないことも示されている。例えば、グラム陽性細菌であるエンテロコッカス・フェカリス由来のプラスミドpCF10にはPrgEと呼ばれるSSBのようなタンパク質があり、接合に必要ないと分類された。[82] ssDNAに結合するタンパク質が接合プラスミドにコード化されている理由については、さらなる研究が必要である。
マイクロバイオームと共生関係の場合、接合は非常に重要です。このプロセスから新しい遺伝子が獲得され、抗生物質耐性遺伝子の獲得など、遺伝的多様性と進化の増加につながります。結核菌は、抗生物質耐性を獲得しながら接合などの方法を通じて進化した種です。[83] [84]この進化または遺伝的多様性の増加は、他の多くの種でも見られます。[85]このため、病原性微生物がさらに病原性になる可能性があるため、接合または水平遺伝子伝達が人間の健康とマイクロバイオームにどれほどの影響を与えるかについて大きな懸念があります。研究によると、私たち自身のマイクロバイオームにも抗菌遺伝子が大量に存在し、それが病原性微生物に伝達されると有害となる可能性があります。[86]
Mycobacterium smegmatisにおける接合は、 E. coliにおける接合と同様に、ドナー株とレシピエント株との安定的かつ長期にわたる接触を必要とし、DNase 耐性があり、転移した DNA は相同組換えによってレシピエントの染色体に組み込まれる。しかし、E. coli の高頻度組換え接合(Hfr) とは異なり、結核菌の接合はプラスミドベースではなく染色体ベースの HGT の一種である。[87]さらに、 E. coli (Hfr) 接合とは対照的に、 M. smegmatisでは染色体のすべての領域が同等の効率で転移する。接合の結果、親ゲノムの大幅な混合が見られ、この混合は有性生殖の減数分裂産物に見られる混合を彷彿とさせると考えられた。[87] [88]
古細菌DNAの伝達
ハロアーキアは好気性好塩菌で、嫌気性メタン生成菌から進化したと考えられています。そのゲノムの大部分、126の複合遺伝子ファミリーは、細菌ゲノムの遺伝物質に由来しています。これにより、極めて塩分濃度の高い環境に適応することができました。[89] [90]
古細菌 サルフォロバス・ソルファタリカスは、紫外線を照射されると、 IV型線毛の形成を強く誘導し、それが細胞凝集を促進する。[91] [92] DNA損傷を引き起こす化学物質への曝露も細胞凝集を誘導する。[91]温度変化やpHなどの他の物理的ストレス因子は凝集を誘導しないため、DNA損傷が細胞凝集の特異的な誘導因子であることが示唆される。[要出典]
UV誘導性細胞凝集は細胞間染色体HGTマーカー交換を高頻度で媒介し[93]、UV誘導培養は非誘導培養を3桁も上回る組換え率を示す。S . solfataricus細胞は同種の他の細胞と優先的に凝集する。[93] Frolsら[91] [94]およびAjonら[93]は、 UV誘導性DNA転移は相同組換えによる損傷DNAの修復を促進する重要なメカニズムである可能性が高いと示唆した。このプロセスは単純な形態の性的相互作用とみなすことができる。
もう一つの好熱性種であるサルフォロバス・アシドカルダリウスは、HGTを起こすことができる。S . アシドカルダリウスは、 84℃までの温度で染色体マーカーを交換し、組み換えることができる。 [95]紫外線への曝露は、線毛形成と細胞凝集を誘発する。[93]凝集能力を持つ細胞は、凝集できない線毛を欠く変異体よりも生存率が高い。組み換えの頻度は、紫外線照射によって引き起こされるDNA損傷[96]とDNA損傷化学物質によって増加する。[97]
5つの遺伝子を含むupsオペロンは、紫外線照射によって高度に誘導される。upsオペロンによってコードされるタンパク質は、紫外線誘導性の線毛組み立ておよび細胞凝集に使用され、細胞間DNA交換および相同組換えを引き起こす。[ 98 ]このシステムは紫外線曝露後のS. acidocaldarius細胞の適応度を高めるため、Wolferenら[98] [99]は、紫外線誘導性のDNA損傷を相同組換えによって修復するためにDNAの移動が起こる可能性が高いと考えた。
真核生物
「配列比較は、系統発生の「ドメイン」の境界を越えて、多様な種の間で多くの遺伝子が最近水平伝播したことを示唆している。したがって、種の系統発生の歴史を決定することは、単一の遺伝子の進化樹を決定することによって決定的に行うことはできない。」[100]
細胞小器官から核ゲノムまで
- DNA配列の解析により、真核生物内では葉緑体とミトコンドリアゲノムから核ゲノムへの水平遺伝子伝播が起こっていることが示唆されている。細胞内共生説で述べられているように、葉緑体とミトコンドリアは真核細胞の祖先である細菌の細胞内共生生物として発生したと考えられる。 [101]
細胞小器官から細胞小器官へ
- ミトコンドリア遺伝子は宿主からラフレシア科植物の寄生虫へ移動した[102] [103]。また、未だ特定されていない植物の葉緑体からインゲンマメのミトコンドリアへ移動した[ 104] 。
細菌から真菌まで
- 水平伝播は細菌から酵母サッカロミセス・セレビシエなどの一部の真菌に起こる。[105]
細菌から植物へ
- アグロバクテリウムは、細胞をクラウンゴールや増殖する根として増殖させる病原細菌であり、植物に遺伝子を伝達できる細菌の一例であり、これは植物の進化において重要な役割を果たしている。[106]
- 陸上植物とその近縁種であるシャジクモ類緑藻類は、一連のグリコシル加水分解酵素を共有している。これらの酵素は、陸上植物の起源以前に、細菌や真菌からこれらの生物の最後の共通祖先に伝わったものと考えられる。[107]
動物に対する細菌
- HhMAN1はコーヒーノキイロショウジョウバエ（Hypothenemus hampei）のゲノム中の遺伝子で、細菌の遺伝子に似ており、甲虫の腸内の細菌から転移したと考えられている。[108] [109]
- oskarはホロメタボラの生殖細胞系列の特定に必須の遺伝子であり、その起源はHGTイベントとそれに続くLOTUSドメインとの融合によるものと考えられている。[110]
- 現在、ワムシ科動物は、その遺伝子の約8%が細菌由来であり、動物におけるHGTの「記録」を保持している。[111] クマムシは17.5%のHGTで記録を破ったと考えられていたが、その発見は細菌汚染によるものであった。[112]
- ある研究では、40匹の動物（霊長類10匹、線虫4匹、ショウジョウバエ12匹を含む）のゲノムに、細菌や真菌から水平遺伝子伝達によって移されたと研究者らが結論付けた遺伝子が含まれていることが判明した。[113]研究者らは、一部の線虫やショウジョウバエではこれらの遺伝子が比較的最近獲得されたと推定した。[114]
- バクテリオファージを介したメカニズムにより、原核生物と真核生物の間で遺伝子が伝達される。[115]バクテリオファージ末端タンパク質（TP）の核局在シグナルはDNA複製を開始し、ウイルスゲノムと共有結合する。細菌のHGTにおけるウイルスとバクテリオファージの役割は、TPを含むゲノムが進化を通じて界間の遺伝情報伝達の媒体となる可能性があることを示唆している。[116]
- アズキコガネムシは、その（有益ではない）共生細菌であるウォルバキアから遺伝物質を獲得している。[117]ウォルバキア細菌が節足動物やフィラリア線 虫の遺伝物質の重要な潜在的供給源であることを実証する新たな例が最近報告されている。[118]
- キジラミPachypsylla venustaは、現在の共生菌であるCarsonellaから遺伝子を獲得しているが、歴史的に共生していた多くの菌からも遺伝子を獲得している。[119]
植物から植物へ
- 寄生性の真正 双子葉植物であるStriga hermonthicaは、核ゲノムにソルガム（ Sorghum bicolor ）の遺伝子を受け継いでいる。 [120]この遺伝子の機能は不明である。
- シダ植物が暗い森林で生き残ることを可能にする遺伝子は、川岸や木の上に敷物状に生えるツノゴケから来たものである。ネオクロム遺伝子は約1億8000万年前に到来した。[121]
- オウロバンカ科植物の宿主植物と従属栄養植物間のmRNAの転移は直接観察されている。したがって、mRNA転写物は従属栄養生物における外来DNAの転移と統合に関与する因子である可能性がある。[122]
植物から動物へ
- 東部エメラルドウミウシであるElysia chloroticaは、蛍光in situハイブリダイゼーション（FISH）分析により、餌に含まれる藻類（Vaucheria litorea）から得られた光合成をサポートする遺伝子を含んでいることが示唆されている。 [123] SacoglossaのLGTは現在では人工物であると考えられており[124] 、 Elysia chloroticaのゲノム配列を解析してもLGTの痕跡は発見されなかった。[125]
- コナジラミ（Bemisia tabaci）は植物毒素を中和する植物解毒遺伝子を獲得した。[126]
植物から菌類へ
- 植物と菌類の間の遺伝子伝達は、イネ（Oryza sativa）を含む多くの事例で想定されている。[要出典]
- 植物からの遺伝子転移の証拠は、コレトトリクム菌で記録されている。[127]
- 植物のエクスパンシン遺伝子は真菌に移され、真菌が植物に感染する能力がさらに高まりました。[128]
植物から細菌へ
- 植物のエクスパンシン遺伝子は細菌に移され、細菌が植物に感染することも可能になった。[128]
菌類から昆虫まで
- エンドウアブラムシ（Acyrthosiphon pisum ）には、真菌由来の遺伝子が複数含まれています。[129] [130]植物、真菌、微生物はカロテノイドを合成できますが、エンドウアブラムシが作るトルレンは、動物界で生物によって合成されることが知られている唯一のカロテノイドです。[129]
菌類から菌類へ
- 毒素α-アマニチンは、テングタケ属、レピオタ属、ガレリナ属など、一見無関係に見える多数の菌類に含まれています。α-アマニチンの生成に関与する2つの生合成遺伝子は、P450-29とFMO1です。これらの遺伝子の系統学的および遺伝学的解析は、これらの遺伝子が水平遺伝子伝達によって属間で伝達されたことを強く示唆しています。[131]
- ToxAタンパク質（小麦毒性タンパク質）は、コード領域と非コード領域の両方を含む約14kbの要素に含まれており、異なる真菌性小麦病原体であるParastagonospora nodorum、Pyrenophora tritici-repentis、およびBipolaris sorokiniana間で伝達されました。[132]
- 「ワラビー」と名付けられた約500kbの大きなゲノム要素が、チーズ製造に使用される2つのペニシリウム種、P. camembertiとP. roquefortiの間で最近転移されました。ワラビーには約250の遺伝子が含まれており、その中には微生物の競争に役割を果たすと考えられる遺伝子もいくつか含まれています。[133]
菌類から卵菌類まで
- イネいもち病菌Magnaporthe griseaの4つの遺伝子は、 Phytophthora属から水平伝播したと疑われ、菌類が植物病原菌へと進化する上で役割を果たしているのではないかと仮説が立てられた。[134]
卵菌類から真菌類まで
- 卵菌類のPhytophthora ramorum、Phytophthora sojae、Phytophthora infestans、およびHyaloperonospora parasiticaは、真菌から33の水平遺伝子転移を受けたと推定されています。転移された遺伝子は、植物の免疫反応を回避するための分泌タンパク質や植物細胞壁の分解など、植物組織の定着を促進する機能に関与していると考えられています。[135]
動物から動物へ
動物から細菌まで
- Photobacterium leiognathi [137]の驚くほど魚に似た銅/亜鉛スーパーオキシドディスムターゼは、その魚類宿主の祖先からの遺伝子の転移という観点から最も簡単に説明されます。
人間から原生動物へ
- マラリア 病原体である 三日熱マラリア原虫は、ヒトから遺伝物質を獲得し、それが体内での長期滞在を容易にしている可能性がある。[138]
ヒトゲノム
- ある研究では、ヒトの約2万個の遺伝子のうち、水平遺伝子移動によって生じたと考えられる約100個が特定されましたが[139]、この数字には、水平遺伝子移動の候補となるこれらの遺伝子は、進化速度の違いと組み合わされた遺伝子損失の結果である可能性が高いと主張する研究者が何人かいます。[要出典]
水平遺伝子伝達を促進する化合物が発見される
抗生物質耐性の増大する問題に関する研究を通じて[140]、特定の化合物が遺伝子の水平伝播を促進することが観察されている。[141] [142] [143] [144]細菌に非致死レベルで投与された抗生物質が抗生物質耐性の原因になることは知られているが[144]、新たな研究では、抗生物質以外の特定の医薬品（イブプロフェン、ナプロキセン、ゲムフィブロジル、ジクロフェナク、プロプラノロールなど）も、抗生物質耐性の原因となる遺伝子の遺伝子水平伝播（HGT）を促進する能力を通じて、抗生物質耐性を促進する役割を果たしていることが現在示されている。接合による抗生物質耐性遺伝子（ARG）の伝播は、プラスミドを持つドナー細胞とレシピエント細胞が、いずれかの医薬品の存在下で互いに導入されると、大幅に加速される。 [141]非抗生物質医薬品も、細菌のSOS反応に関与するlexA、umuC、umuD、soxR遺伝子の発現増加や、抗生物質への曝露中に発現する他の遺伝子など、抗生物質に対する反応と同様の反応を細菌に引き起こすことが判明した。[141]これらの調査結果は2021年のものであり、非抗生物質医薬品の広範な使用により、この問題をさらに理解するためにはさらなる研究を行う必要がある。[141]
非抗生物質医薬品と並んで、抗生物質耐性に関連する他の化合物、例えばマラカイトグリーン、エチルベンゼン、スチレン、2,4-ジクロロアニリン、トリオキシメチレン、o-キシレン溶液、p-ニトロフェノール（PNP）、p-アミノフェノール（PAP）、フェノール（PhOH）などが検査されている。[142] [143]廃水処理場でARGが発見されていることは世界的な懸念となっている。[142] 繊維廃水には、他の廃水サンプルよりも3～13倍多くの可動性遺伝要素が含まれていることがわかっている。 [142]この原因は、繊維の染色に使用される有機化合物（o-キシレン、エチルベンゼン、トリオキシメチレン、スチレン、2,4-ジクロロアニリン、マラカイトグリーン）[142]であり、これらの分子の存在下で細菌とプラスミド（ドナーを含む）が導入されると、接合伝達の頻度が上昇する。 [142]繊維廃水が家庭下水からの廃水と混ざると、廃水中のARGは繊維染色化合物の添加により高速度で移行し、HGTの発生が増加する。[要出典]
廃水中によく見られる他の有機汚染物質も同様の実験の対象となっている。[143] 2021年の研究では、ドナーにプラスミドを使用し、化合物の存在下でそれを受容体と混合するという同様の方法を使用して、抗生物質耐性遺伝子の水平遺伝子伝達をテストしたが、今回はフェノール化合物の存在下で行われた。[143]フェノール化合物は廃水中によく見られ、廃水処理プロセス中に微生物群集の機能と構造を変化させることがわかっている。 [143]さらに、HGTは、p-ニトロフェノール（PNP）、p-アミノフェノール（PAP）、およびフェノールの存在下で頻度が増加します。これらの化合物は、HGTの2〜9倍の増加をもたらします（p-ニトロフェノールは2倍の増加の下限であり、p-アミノフェノールとフェノールは最大9倍の増加です）。[143]このHGTの増加は、イブプロフェン、ナプロキセン、ゲムフィブロジル、ジクロフェナク、プロプラノロール、o-キシレン、エチルベンゼン、トリオキシメチレン、スチレン、2,4-ジクロロアニリン、マラカイトグリーンなどの化合物の増加よりも平均的には少ないですが[141] [142]、これらの増加は依然として顕著です。[143]この結論に至った研究は、2021年に行われたという点で、水平遺伝子伝達と非抗生物質医薬品に関する研究と似ており、特に活性汚泥という研究の焦点において、さらなる研究の余地を残しています。[143]
重金属は抗生物質耐性遺伝子の接合伝達を促進することもわかっています。[144]この発見につながった論文は、化合物研究を補助する水平遺伝子伝達という新興分野で2017年に発表されました。[144]金属は、共耐性と交差耐性の両方のメカニズムを通じて抗生物質耐性の拡大を助けます。[144]環境に関連する量では、Cu(II)、Ag(I)、Cr(VI)、およびZn(II) は、大腸菌のドナー株と受容体株からの接合伝達を促進します。[144]これらの金属の存在は、細菌細胞からのSOS応答を引き起こし、細胞の透過性を高めます。これらは、環境中の低レベルの重金属汚染でも接合伝達に影響を与え、結果として抗生剤耐性遺伝子の拡散に影響を与えるメカニズムです。
人工的な遺伝子水平伝播
遺伝子工学は、合成発現カセットを使用するとはいえ、本質的には水平遺伝子伝達である。スリーピングビューティートランスポゾンシステム[145] （SB）は、 Tc1/marinerトランスポゾンが極めて多様な種のゲノムに侵入する既知の能力に基づいた合成遺伝子伝達因子として開発された。 [146] SBシステムは、多種多様な動物ゲノムに遺伝子配列を導入するために使用されてきた。[147] [148]
進化の中で
水平遺伝子伝播は、1つの遺伝子の配列に基づいて系統樹を推測する際の潜在的な交絡因子です。 [149]たとえば、遺伝子を交換した2つの遠縁の細菌がある場合、それらの種を含む系統樹は、他のほとんどの遺伝子が異なっていても、その遺伝子は同じであるため、それらが密接に関連していることを示します。このため、多くの場合、遺伝子の有無などの他の情報を使用して堅牢な系統樹を推測するか、より一般的には、系統解析にできるだけ広い範囲の遺伝子を含めることが理想的です。
例えば、原核生物の系統関係を構築するために最もよく使われる遺伝子は16SリボソームRNA遺伝子である。これは、その配列が系統的距離が近いメンバー間で保存される傾向があるが、違いを測定できるほどに可変性があるためである。しかし、近年では16s rRNA遺伝子も水平伝播する可能性があると主張されている。これはまれかもしれないが、16s rRNAで構築された系統樹の妥当性は再評価されなければならない。[150]
生物学者ヨハン・ペーター・ゴーガルテンは、「樹木という元々の比喩は、最近のゲノム研究のデータにはもはや当てはまらない」ため、「生物学者は、個々のゲノムに組み合わされたさまざまな歴史を説明するためにモザイクの比喩を使用し、微生物間のHGTの豊富な交換と協力効果を視覚化するためにネットの比喩を使用する必要がある」と示唆している。[40]このような系統ネットワークを推測する方法はいくつか存在する。
単一遺伝子を系統発生マーカーとして使用した場合、水平遺伝子伝播が存在する生物の系統発生をたどることは困難である。分岐進化の単純な合体モデルと稀なHGT水平遺伝子伝播イベントを組み合わせると、3つの生命ドメインに共有されている遺伝子の祖先となる遺伝子をすべて含む単一の最新共通祖先は存在しないことが示唆される。現代の分子はそれぞれ独自の歴史を持ち、個々の分子の祖先にまで遡る。しかし、これらの分子の祖先は、異なる時期に異なる生物に存在していた可能性が高い。」[151]
生命の木への挑戦
水平遺伝子伝播は、カール・ウーゼが最初に定式化した生命の樹の根源にある最後の普遍的共通祖先（LUCA）の概念に対する潜在的な挑戦を提起し、彼はこの概念に基づいて古細菌を生命の3番目のドメインとして提案した。[152]実際、水平遺伝子伝播が複雑な問題として浮上したのは、生命の新しい3ドメイン観を検討しているときだった。アーキオグロバス・フルギドゥスは、酵素HMGCoA還元酵素のコード化に基づく系統樹に関して異常とみなされていた。問題の生物は明らかに古細菌であり、古細菌に期待されるすべての細胞脂質と転写機構を備えているが、HMGCoA遺伝子は細菌起源である。[152]科学者は、共生説、真核生物のミトコンドリアはアルファプロテオバクテリア細胞に由来し、葉緑体は摂取したシアノバクテリアに由来すること、その他の遺伝子転移が初期の真核生物に影響を与えた可能性があるという点については広く合意している。（対照的に、多細胞真核生物は、分離された生殖細胞を含む水平遺伝子転移を防ぐメカニズムを持っている。）継続的で広範な遺伝子転移があった場合、LUCAにつながる明確に区別された系統を持つ生命の樹ではなく、多くの祖先を持つ複雑なネットワークが存在するはずである。[152] [153]しかし、LUCAは特定できるため、水平転移は比較的限られていたに違いない。[154]
他の初期のHGTも起こったと考えられています。LUCAの最も古い祖先である最初の共通祖先（FUCA）には、独自の系統を持つ他の子孫がいました。[155] FUCAから派生した、現在は絶滅したLUCAの姉妹系統は、その遺伝子の一部をLUCAの初期の子孫のゲノムに水平伝播したと考えられています。[155]
HGTの系統情報
複雑ではあるが、水平遺伝子伝達の検出は貴重な系統発生情報や年代測定情報をもたらすと指摘されている。[156]
HGTが系統樹の年代測定に利用できる可能性が最近確認された。[157] [158]
水平遺伝子伝達の染色体構成
新しい遺伝子の獲得は、他の遺伝要素を混乱させ、細菌細胞の機能を妨げ、細菌の競争力に影響を与える可能性があります。したがって、細菌の適応は、有益な遺伝子を獲得することの利点と、ゲノムの残りの構成を維持する必要性との間の矛盾にあります。水平伝播する遺伝子は通常、染色体の約 1% にのみ集中しています (ホットスポットと呼ばれる領域)。この集中は、ゲノム サイズと伝播速度とともに増加します。ホットスポットは、急速な遺伝子ターンオーバーによって多様化します。その染色体分布は、ローカル コンテキスト (隣接するコア遺伝子) と可動性遺伝要素のコンテンツに依存します。ホットスポットは、遺伝子レパートリーのほとんどの変化を集中させ、ゲノムの多様化と構成のトレードオフを減らし、株固有の適応遺伝子の宝庫となるはずです。可動性遺伝要素と抗生物質耐性遺伝子のほとんどはホットスポットに存在するが、多くのホットスポットには認識可能な可動性遺伝要素がなく、隣接するコア遺伝子で相同組換えが頻繁に起こる。自然に形質転換可能な細菌において可動性遺伝要素の少ないホットスポットが過剰に出現していることは、相同組換えと水平遺伝子伝達がゲノム進化において密接に関連していることを示唆している。[159]
遺伝子
以下の遺伝子の歴史的水平伝播の証拠があります。
- カロテノイド生合成のためのリコピンシクラーゼ、緑藻類と「シアノバクテリア」の間。[160]
- カンピロバクター・ジェジュニ間でテトラサイクリン耐性を付与するTetO遺伝子。[161]
- ネオクロムは、一部のシダ植物に含まれる遺伝子で、薄暗い場所でも生存する能力を高める。白亜紀のある時期に藻類から獲得されたと考えられている。[162] [163]
- 細菌のシステイン合成酵素を植物食性ダニ やチョウ目昆虫に移入し、宿主植物が産生するシアン生成配糖体の解毒を可能にする。 [164]
- LINE1配列はヒトから淋病菌に伝わった。[165]
参照
- アグロバクテリウムは、自分自身と植物の間で DNA を伝達する能力があることでよく知られている細菌です。
- 内因性レトロウイルス
- 遺伝子組み換え生物
- 水平遺伝子伝播の推測
- インテグロン
- 可動性遺伝要素
- 系統ネットワーク
- 系統樹
- プロウイルス
- 再集合
- レトロトランスポゾン
- 共生
- 生命の樹（生物学）
- 異種生物学
参考文献
- ^ Ochman H 、Lawrence JG、Groisman EA (2000 年 5 月)。「遺伝子水平伝播と細菌の革新の性質」。Nature . 405 ( 6784 ): 299–304。Bibcode :2000Natur.405..299O。doi :10.1038/35012500。PMID 10830951。S2CID 85739173 。
- ^ Dunning Hotopp JC (2011年4月). 「細菌と動物の間の水平遺伝子伝達」. Trends in Genetics . 27 (4): 157–63. doi :10.1016/j.tig.2011.01.005. PMC 3068243. PMID 21334091 .
- ^ Robinson KM、Sieber KB、Dunning Hotopp JC (2013 年 10 月)。「細菌と動物の遺伝子水平伝播のレビューは、がんなどの疾患の理解に役立つ可能性がある」。PLOS Genetics。9 ( 10 ) : e1003877。doi : 10.1371 / journal.pgen.1003877。PMC 3798261。PMID 24146634。
- ^ Keeling PJ、Palmer JD （2008年8 月）。 「真核生物の進化における水平遺伝子移動」。ネイチャーレビュー。遺伝学。9（8）：605–18。doi ：10.1038/nrg2386。PMID 18591983。S2CID 213613。
- ^ abcdef Gyles C、Boerlin P（2014 年3月）。 「水平伝播遺伝要素と細菌性疾患の病因におけるその役割」。獣医病理学。51 （2）：328–40。doi ：10.1177 / 0300985813511131。PMID 24318976。S2CID 206510894 。
- ^ Vaux F, Trewick SA, Morgan-Richards M (2017). 「鏡を通して見る種分化」リンネ協会生物学誌120 (2): 480–488. doi : 10.1111 /bij.12872 .
- ^ Ochman H、Lerat E、Daubin V (2005 年 5 月)。「遺伝子の伝達と交換の脅威の下での細菌種の調査」。米国科学アカデミー 紀要。102 ( Suppl 1): 6595–6599。Bibcode :2005PNAS..102.6595O。doi : 10.1073 /pnas.0502035102。PMC 1131874。PMID 15851673。
- ^ Huddleston JR (2014). 「ヒトの消化管における水平遺伝子伝達：抗生物質耐性遺伝子の潜在的拡散」.感染と薬剤耐性. 7 : 167–176. doi : 10.2147/idr.s48820 . PMC 4073975. PMID 25018641 .
- ^ Koonin EV、Makarova KS 、 Aravind L (2001)。 「 原核生物における遺伝子水平伝播：定量化と分類」。Annual Review of Microbiology。55 (1): 709–42。doi :10.1146/ annurev.micro.55.1.709。PMC 4781227。PMID 11544372。
- ^ Nielsen KM (1998). 「土壌細菌における自然形質転換による水平遺伝子伝達の障壁」APMIS . 84 (S84): 77–84. doi :10.1111/j.1600-0463.1998.tb05653.x. PMID 9850687. S2CID 26490197.
- ^ McGowan C, Fulthorpe R, Wright A, Tiedje JM (1998 年 10 月). 「2,4-ジクロロフェノキシ酢酸分解菌の進化における種間遺伝子転移の証拠」.応用環境微生物学. 64 (10): 4089–92. Bibcode :1998ApEnM..64.4089M. doi :10.1128 / AEM.64.10.4089-4092.1998. PMC 106609. PMID 9758850.
- ^ ab Keen EC (2012 年 12 月). 「病因のパラダイム: 疾患の可動性遺伝要素をターゲットにする」. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology . 2 : 161. doi : 10.3389/fcimb.2012.00161 . PMC 3522046. PMID 23248780.
- ^ Naik GA、Bhat LN、Chpoade BA、Lynch JM (1994)。「土壌ミクロコスムにおける広宿主域抗生物質耐性プラスミドの伝達」。Curr . Microbiol . 28 (4): 209–215. doi :10.1007/BF01575963. S2CID 21015053。
- ^ ヴァルガ M、クントヴァー L、パントゥチェク R、マシュラジェノヴァー I、ルジチコヴァー V、ドシュカシュ J (2012 年 7 月)。 「メチシリン耐性黄色ブドウ球菌 USA300 クローン内への形質導入による抗生物質耐性プラスミドの効率的な導入」。FEMS 微生物学レター。332 (2): 146-52。土井：10.1111/j.1574-6968.2012.02589.x。PMID 22553940。
- ^ Varga M、Pantu Ček R 、 Ru Žičková V、Doškař J (2016 年 1 月)。「メチシリン耐性黄色ブドウ球菌で同定された新しい効率的な形質導入バクテリオファージの分子特性」。The Journal of General Virology。97 ( 1): 258–268。doi : 10.1099/jgv.0.000329。PMID 26537974。
- ^ Cairns J、Ruokolainen L、Hultman J、Tamminen M、Virta M、Hiltunen T (2018-04-19)。「生態学は、抗生物質の低濃度がコミュニティの構成と耐性遺伝子の水平伝播にどのように影響するかを決定します」。Communications Biology。1 ( 1 ) : 35。doi : 10.1038/s42003-018-0041-7。PMC 6123812。PMID 30271921。
- ^ Zhou H、 Beltrán JF 、 Brito IL（2021年10月）。「機能が遺伝子の水平伝播と抗生物質耐性の出現を予測する」。Science Advances。7（43）：eabj5056。Bibcode ： 2021SciA....7.5056Z。doi ：10.1126/sciadv.abj5056。PMC 8535800。PMID 34678056。
- ^ Sieber KB、Bromley RE 、 Dunning Hotopp JC (2017年9月)。「原核生物と真核生物間 の遺伝子水平伝播」。実験細胞研究。358 (2):421–426。doi : 10.1016 /j.yexcr.2017.02.009。PMC 5550378。PMID 28189637。
- ^ Gabaldón T (2021年10月). 「真核細胞の起源と初期進化」. Annual Review of Microbiology . 75 (1): 631–647. doi :10.1146/annurev-micro-090817-062213. PMID 34343017. S2CID 236916203.
- ^ Brockhurst MA、Harrison E、Hall JP、Richards T、McNally A、MacLean C（2019年10月）。「パンゲノムの生態と進化」。Current Biology。29 （20 ）：R1094–R1103。Bibcode ： 2019CBio ...29R1094B。doi ： 10.1016/j.cub.2019.08.012。ISSN 0960-9822。PMID 31639358 。
- ^ Van Etten J、Bhattacharya D（2020年12月）。「真核生物における遺伝子水平伝播：あるかどうかではなく、どの程度か？」。遺伝学の動向。36 （12）：915–925。doi ： 10.1016 /j.tig.2020.08.006。PMID 33012528 。
- ^ Kubyshkin V 、Acevedo-Rocha CG、 Budisa N (2018年2月)。「タンパク質生合成における普遍的なコーディングイベントについて」。Bio Systems。164 :16–25。Bibcode : 2018BiSys.164 ...16K。doi : 10.1016/j.biosystems.2017.10.004。PMID 29030023。
- ^ Griffith F (1928年1月). 「肺炎球菌の種類の重要性」. The Journal of Hygiene . 27 (2). Cambridge University Press: 113–59. doi :10.1017/S0022172400031879. JSTOR 4626734. PMC 2167760. PMID 20474956 .
- ^ Lorenz MG、Wackernagel W (1994 年 9 月)。 「環境における自然な遺伝子変換による細菌の遺伝子伝達」。Microbiological Reviews。58 ( 3 ): 563–602。doi : 10.1128 / MMBR.58.3.563-602.1994。PMC 372978。PMID 7968924 。
- ^ Downie AW (1972年11月). 「肺炎球菌による形質転換 - 過去を振り返る。第4回グリフィス記念講演」(PDF) . Journal of General Microbiology . 73 (1): 1–11. doi : 10.1099/00221287-73-1-1 . PMID 4143929. 2012年3月2日時点のオリジナルよりアーカイブ(PDF) 。 2018年5月23日閲覧。
- ^ Freeman VJ (1951 年 6 月)。「バクテリオファージ感染したジフテリア菌株の毒性に関する研究」。Journal of Bacteriology 61 (6): 675–88. doi :10.1128/JB.61.6.675-688.1951. PMC 386063. PMID 14850426 。
- ^ Margulies P (2005).ジフテリア. 伝染病: 歴史を通じての致命的な病気 (第 1 版). ニューヨーク: Rosen Publishing Group. ISBN 978-1-4042-0253-5。
- ^ Lwoff A (1965). 「ウイルス、細胞、生物間の相互作用」。ノーベル生理学・医学賞受賞記念講演。2010年10月16日時点のオリジナルよりアーカイブ。
- ^ 落合 健・山中 孝文・木村 健・澤田 修 (1959). 「赤痢菌株間および赤痢菌と大腸菌株間の薬剤耐性の継承とその伝達」秘本医事新書. 1861 : 34.
- ^ Akiba T, Koyama K, Ishiki Y, Kimura S, Fukushima T (1960年4月). 「Shigellaの多剤耐性クローンの発生機構について」. Japanese Journal of Microbiology . 4 (2): 219–27. doi : 10.1111/j.1348-0421.1960.tb00170.x . PMID 13681921.
- ^ Syvanen M (1985年1月). 「異種間の遺伝子転移; 新たな進化理論への影響」(PDF) . Journal of Theoretical Biology . 112 (2): 333–43. Bibcode :1985JThBi.112..333S. doi :10.1016/S0022-5193(85)80291-5. PMID 2984477. 2017年7月6日時点のオリジナルよりアーカイブ(PDF) . 2009年1月13日閲覧。
- ^ Jain R, Rivera MC, Lake JA (1999年3月). 「ゲノム間の遺伝子水平伝播：複雑性仮説」.米国科学アカデミー紀要. 96 (7): 3801–6. Bibcode : 1999PNAS ...96.3801J. doi : 10.1073/pnas.96.7.3801 . PMC 22375. PMID 10097118.
- ^ Rivera MC, Lake JA (2004 年 9 月). 「生命の輪は真核生物のゲノム融合起源の証拠を提供する」(PDF) . Nature . 431 (7005): 152–5. Bibcode :2004Natur.431..152R. doi :10.1038/nature02848. PMID 15356622. S2CID 4349149. 2007 年 9 月 27 日のオリジナル(PDF)からアーカイブ。
- ^ Bapteste E、Susko E、Leigh J、MacLeod D 、 Charlebois RL、Doolittle WF (2005 年 5 月)。「相同遺伝子系統樹は本当にツリー思考をサポートするのか?」 BMC Evolutionary Biology。5 ( 1): 33。Bibcode : 2005BMCEE ... 5...33B。doi : 10.1186/1471-2148-5-33。PMC 1156881。PMID 15913459。
- ^ Le Page M (2016-03-17). 「農民は数千年にわたって偶然にGMOを作ってきた可能性がある」。ニューサイエンティスト。2018年10月1日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2016年7月11日閲覧。
- ^ Gasmi L, Boulain H, Gauthier J, Hua-Van A, Musset K, Jakubowska AK, et al. (2015年9月). 「Bracoviruses を介した鱗翅目昆虫による寄生虫由来遺伝子の反復的栽培化」. PLOS Genetics . 11 (9): e1005470. doi : 10.1371/journal.pgen.1005470 . PMC 4574769. PMID 26379286 .
- ^ Yong E (2010-02-14). 「シャーガス病原体の遺伝子は人間に伝わり、子供に受け継がれる可能性がある」ナショナルジオグラフィック。2013年1月6日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2016年7月13日閲覧。
Hecht MM、Nitz N、Araujo PF、Sousa AO、Rosa Ad、Gomes DA、他 (2010 年 2 月 12 日)。「アメリカトリパノソーマからヒト宿主へ伝達された DNA の継承」。PLOS ONE。5 ( 2 ) : e9181。Bibcode : 2010PLoSO ...5.9181H。doi : 10.1371/ journal.pone.0009181。PMC 2820539。PMID 20169193。 - ^ Riley DR, Sieber KB, Robinson KM, White JR, Ganesan A, Nourbakhsh S, et al. (2013). 「細菌-ヒト体細胞間の遺伝子水平伝播は癌サンプルで豊富である」. PLOS Computational Biology . 9 (6): e1003107. Bibcode :2013PLSCB...9E3107R. doi : 10.1371/journal.pcbi.1003107 . PMC 3688693. PMID 23840181 .
- ^ Richardson AO, Palmer JD (2007). 「植物における遺伝子の水平伝播」(PDF) . Journal of Experimental Botany . 58 (1): 1–9. doi : 10.1093/jxb/erl148 . PMID 17030541. 2007-09-27にオリジナル(PDF)からアーカイブ。
- ^ ab Gogarten P (2000). 「水平遺伝子移動：生物学の新しいパラダイム」。エサレン理論研究センター会議。2012年7月21日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2007年3月18日閲覧。
- ^ Todar K.「細菌の抗生物質耐性」。微生物の世界：微生物学の講義。ウィスコンシン大学マディソン校細菌学部。2012年1月15日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2012年1月6日閲覧。
- ^ Maloy S (2002年7月15日). 「Horizontal Gene Transfer」. サンディエゴ州立大学. 2019年2月14日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2012年1月6日閲覧。
- ^ abcdef Stearns SC、Hoekstra RF (2005)。進化論入門（第2版）。オックスフォード、ニューヨーク：オックスフォード大学出版局。pp. 38–40。ISBN 978-0-19-925563-4。
- ^ Renner SS、Bellot S (2012)。「真核生物における水平遺伝子移動：菌類から植物、植物から植物へのオルガネラDNAの移動」。葉緑体とミトコンドリアのゲノム科学。光合成と呼吸の進歩。第35巻。Springer Science+Business Media BV pp. 223–235。doi : 10.1007/ 978-94-007-2920-9_10。ISBN 978-94-007-2919-3。
- ^ Maxmen A (2010). 「ウイルスのような粒子が細菌の進化を加速させる」Nature . doi :10.1038/news.2010.507.
- ^ abcdefg Schaack S、Gilbert C、Feschotte C (2010 年 9 月)。「無差別 DNA: 転移因子の水平伝播とそれが真核生物の進化にとって重要である理由」。Trends in Ecology & Evolution。25 ( 9): 537–46。Bibcode :2010TEcoE..25..537S。doi : 10.1016/j.tree.2010.06.001。PMC 2940939。PMID 20591532。
- ^ ab Dupeyron M, Leclercq S, Cerveau N, Bouchon D, Gilbert C (2014年1月). 「甲殻類と昆虫の間および甲殻類と昆虫内におけるトランスポゾンの水平伝播」. Mobile DNA . 5 (1): 4. doi : 10.1186/1759-8753-5-4 . PMC 3922705. PMID 24472097 .
- ^ ab Aubin E, Llauro C, Garrigue J, Mirouze M, Panaud O, El Baidouri M (2023年10月). 「自然生態系からの非モデル野生種における水平伝播のゲノムワイド解析により、植物における遺伝子交換に関する新たな知見が明らかに」. PLOS Genetics . 19 (10): e1010964. doi : 10.1371/journal.pgen.1010964 . PMC 10586619. PMID 37856455 .
- ^ abc El Baidouri M, Carpentier MC, Cooke R, Gao D, Lasserre E, Llauro C, et al. (2014年5月). 「植物における転移因子の広範囲かつ頻繁な水平移動」.ゲノム研究. 24 (5): 831–8. doi :10.1101/gr.164400.113. PMC 4009612. PMID 24518071 .
- ^ abc Ivancevic AM、Walsh AM、 Kortschak RD 、Adelson DL（2013年12月）。「種間の細い線を飛び越える：動物における転移因子の水平伝播がゲノム進化を触媒する」。BioEssays。35 （12 ）：1071–82。doi ：10.1002/bies.201300072。PMID 24003001。S2CID 6968210 。
- ^ ab Wallau GL、Ortiz MF 、Loreto EL (2012)。「真核生物における水平トランスポゾン移動：検出、バイアス、展望」。ゲノム生物学と進化。4 (8): 689–99。doi : 10.1093/gbe/evs055。PMC 3516303。PMID 22798449。
- ^ La Scola B、Desnues C、Pagnier I、Robert C、Barrassi L、Fournous G、他。 (2008 年 9 月)。 「巨大なミミウイルスのユニークな寄生虫としてのビロファージ」。自然。455 (7209): 100-4。Bibcode :2008Natur.455..100L。土井：10.1038/nature07218. PMID 18690211。S2CID 4422249 。
- ^ ピアソンH（2008年8月）。「『ヴィロファージ』はウイルスが生きていることを示唆している」。Nature . 454 (7205): 677. Bibcode :2008Natur.454..677P. doi :10.1038/454677a. PMID 18685665. S2CID 205040157.
- ^ Barlow M (2009)。「抗菌薬耐性が教えてくれた水平遺伝子伝達について」水平遺伝子伝達。分子生物学の方法。第532巻。ニュージャージー州トトワ：ヒューマナ・プレス。pp. 397–411。doi :10.1007/ 978-1-60327-853-9_23。ISBN 978-1-60327-852-2. PMID 19271198。
- ^ Hawkey PM、Jones AM（2009年9月）。 「耐性の疫学の変化」。抗菌化学療法ジャーナル。64 （Suppl 1）：i3-10。doi ：10.1093/jac/ dkp256。PMID 19675017 。
- ^ Francino MP編 (2012)。微生物における遺伝子水平伝播。Caister Academic Press。ISBN 978-1-908230-10-2。
- ^ Strauch E、Lurz R、Beutin L (2001 年 12 月)。「Shigella sonnei のShiga 毒素をコードする温帯バクテリオファージの特性」。感染と免疫。69 (12): 7588–95。doi : 10.1128 /IAI.69.12.7588-7595.2001。PMC 98851。PMID 11705937。
- ^ Johnson CM、Grossman AD (2015 年 11 月)。「統合要素と 接合要素 (ICE): その機能と仕組み」。Annual Review of Genetics。42 (1): 577–601。doi : 10.1146 /annurev-genet - 112414-055018。PMC 5180612。PMID 26473380 。
- ^ Oliveira PH、Touchon M、Rocha EP ( 2014年 9 月)。「制限修飾システムと可動性遺伝要素およびその原核生物宿主との相互作用」。 核酸研究。49 ( 16): 10618–10631。doi : 10.1093/nar/gku734。PMC 4176335。PMID 25120263。
- ^ Auchtung JM、Lee CA、Garrison KL、Grossman AD (2007 年 6 月)。「枯草菌の可動性遺伝要素 ICE Bs1 を制御する免疫抑制因子 (ImmR) の同定と特性評価」。PLOS Genet . 64 (6): 1515–1528. doi :10.1111/j.1365-2958.2007.05748.x. PMC 3320793 . PMID 17511812。
- ^ Tirumalai MR、Fox GE（2013年9月）。「ICEBs1のような要素は、Bacillus pumilus SAFR-032胞子の極度の放射線および乾燥耐性に関連している可能性がある」。Extremophiles。17 （ 5 ）：767–774。doi ： 10.1007 /s00792-013-0559-z。PMID 23812891。S2CID 8675124。 2021年11月28日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2020年9月 16日閲覧。
- ^ Link L、Sawyer J、Venkateswaran K、Nicholson W (2004 年 2 月)。「超クリーンな宇宙船組立施設から得られた Bacillus pumilus 分離株の極度の胞子 UV 耐性」。Microb Ecol . 47 ( 2 ) : 159–163。Bibcode :2004MicEc..47..159L。doi :10.1007/s00248-003-1029-4。PMID 14502417。S2CID 13416635 。
- ^ Newcombe DA、 Schuerger AC、Benardini JN、Dickinson D、Tanner R、Venkateswaran K (2005 年 12 月)。「火星の紫外線照射をシミュレートした環境下における宇宙船関連微生物の生存」。Appl Environ Microbiol。71 ( 12 ): 8147–8156。Bibcode :2005ApEnM..71.8147N。doi : 10.1128 /AEM.71.12.8147-8156.2005。PMC 1317311。PMID 16332797。
- ^ Kempf MJ、Chen F、Kern R 、 Venkateswaran K (2005年6月)。「宇宙船組立施設からのBacillus pumilusの過酸化水素耐性胞子の反復分離」。アストロバイオロジー。5 (3): 391–405。Bibcode :2005AsBio...5..391K。doi : 10.1089/ast.2005.5.391。PMID 15941382。2022 年3月7日時点のオリジナルよりアーカイブ。2020年9月16日閲覧。
- ^ Biel SW, Hartl DL (1983年6月). 「トランスポゾンの進化：大腸菌K12におけるTn5の自然選択」.遺伝学. 103 (4): 581–592. doi :10.1093/genetics/103.4.581. PMC 1202041. PMID 6303898. 2021-08-19にオリジナルからアーカイブ。 2020-09-16に取得。
- ^ Chao L, Vargas C, Spear BB, Cox EC (1983). 「進化における突然変異遺伝子としての転移因子」. Nature . 303 (5918): 633–635. Bibcode :1983Natur.303..633C. doi : 10.1038/303633a0. PMC 1202041. PMID 6303898.
- ^ Tirumalai MR、Karouia F、Tran Q、Stepanov VG、Bruce RJ、Ott M、他 (2017 年 5 月)。「長期間にわたり模擬微小重力下で培養された大腸菌細胞の適応は、表現型とゲノムの両方に関係している」。npj Microgravity。3 ( 15 ) : 15。doi :10.1038/s41526-017-0020-1。PMC 5460176。PMID 28649637。
- ^ Tirumalai MR、Karouia F、Tran Q、Stepanov VG、Bruce RJ、Ott M、他 (2019 年 1 月)。「長期の低せん断モデル微小重力およびバックグラウンド抗生物質曝露にさらされた大腸菌の獲得抗生物質耐性の評価」 。mBio . 10 ( e02637-18 )。doi : 10.1128/mBio.02637-18。PMC 6336426。PMID 30647159。
- ^ Ginolhac A, Jarrin C, Robe P, Perrière G, Vogel TM, Simonet P, et al. (2005 年 6 月). 「I 型ポリケチド合成酵素は水平遺伝子伝達によって進化した可能性がある」. Journal of Molecular Evolution . 60 (6): 716–25. Bibcode :2005JMolE..60..716G. doi :10.1007/s00239-004-0161-1. PMID 15909225.
- ^ Jagannathan SV、Manemann EM、Rowe SE、Callender MC、Soto W（2021年7月）。「海洋放線菌、バイオテクノロジー製品の新たな供給源」。 海洋医薬品。19 （7）：365。doi ：10.3390 / md19070365。ISSN 1660-3397。PMC 8304352。PMID 34201951。
- ^ Gross H、Loper JE (2009年11月)。「Pseudomonas sppによる二次代謝産物生産のゲノム科学」。Natural Product Reports。26 ( 11): 1408–46。doi :10.1039/b817075b。PMID 19844639 。
- ^ Chen I, Dubnau D (2004 年 3 月). 「細菌の形質転換中の DNA の取り込み」. Nature Reviews. Microbiology . 2 (3): 241–9. doi :10.1038/nrmicro844. PMID 15083159. S2CID 205499369.
- ^ ab Johnsborg O, Eldholm V, Håvarstein LS (2007年12月). 「自然な遺伝子変換：発生率、メカニズム、機能」.微生物学研究. 158 (10): 767–78. doi : 10.1016/j.resmic.2007.09.004 . PMID 17997281.
- ^ Solomon JM、 Grossman AD (1996 年 4 月)。 「誰がいつ有能か: 細菌における自然な遺伝的能力の調節」。Trends in Genetics。12 ( 4): 150–5。doi :10.1016/0168-9525(96)10014-7。PMID 8901420。
- ^ Michod RE, Bernstein H, Nedelcu AM (2008年5月). 「微生物病原体における性別の適応価値」(PDF) .感染・遺伝学・進化. 8 (3): 267–85. Bibcode :2008InfGE...8..267M. doi :10.1016/j.meegid.2008.01.002. PMID 18295550. 2020年5月11日時点のオリジナルより アーカイブ(PDF) . 2016年10月4日閲覧。
- ^ Keen EC、Bliskovsky VV、Malagon F、Baker JD、Prince JS、Klaus JS、他 (2017 年 1 月)。「新型「スーパースプレッダー」バクテリオファージが形質転換により水平遺伝子転移を促進」。mBio . 8 ( 1): e02115-16. doi :10.1128/mBio.02115-16. PMC 5241400. PMID 28096488 。
- ^ Cooke MB、Herman C (2023)。「接合のツールキット ：細菌の性行為における非構造タンパク質の役割」。Journal of Bacteriology。205 ( 3): e0043822。doi : 10.1128 /jb.00438-22。PMC 10029717。PMID 36847532。
- ^ Porter RD 、 Black S (1991 年 4 月)。「大腸菌 F 因子によってコードされる一本鎖 DNA 結合タンパク質は、染色体 ssb 遺伝子の欠失を補完できる」。Journal of Bacteriology。173 ( 8 ): 2720–2723。doi : 10.1128 / jb.173.8.2720-2723.1991。ISSN 0021-9193。PMC 207845。PMID 2013585 。
- ^ Maffeo C, Aksimentiev A (2017-12-01). 「一本鎖DNA結合タンパク質とDNAの会合の分子メカニズム」. Nucleic Acids Research . 45 (21): 12125–12139. doi :10.1093/nar/gkx917. ISSN 0305-1048. PMC 5716091. PMID 29059392 .
- ^ Gupta S、 Yeeles JT、Marians KJ (2014 年 9 月)。「リーディング鎖テンプレートの損傷により停止した複製フォークの回帰」。Journal of Biological Chemistry。289 ( 41): 28388–28398。doi : 10.1074/ jbc.M114.587907。PMC 4192491。PMID 25138217。
- ^ Chen SH, Byrne-Nash RT, Cox MM (2016 年 9 月). 「大腸菌 RadD タンパク質は一本鎖 DNA 結合タンパク質と機能的に相互作用する」. Journal of Biological Chemistry . 291 (39): 20779–20786. doi : 10.1074/jbc.M116.736223 . PMC 5034066. PMID 27519413 .
- ^ Breidenstein A、Lamy A、 Bader CP、Sun WS、Wanrooij PH、Berntsson RP（2024年8月）。「PrgE：プラスミドpCF10由来のOBフォールドタンパク質で、典型的な細菌SSBとは著しく異なる」。 ライフサイエンスアライアンス。7 （ 8 ）：e202402693。doi ：10.26508/lsa.202402693。ISSN 2575-1077。PMC 11137577。PMID 38811160。
- ^ Parsons LM、Jankowski CS、Derbyshire KM (1998 年4 月)。「Mycobacterium smegmatis における染色体 DNA の接合伝達」。 分子微生物学。28 (3): 571–582。doi : 10.1046 /j.1365-2958.1998.00818.x。ISSN 0950-382X。PMID 9632259 。
- ^ Supply P、Marceau M、Mangenot S、Roche D、Rouanet C、Khanna V、他 (2013 年 2 月)。「滑面結核菌のゲノム解析により、結核菌の祖先と病態適応に関する知見が得られる」。Nature Genetics 45 ( 2): 172–179. doi :10.1038/ng.2517. ISSN 1061-4036. PMC 3856870. PMID 23291586 .
- ^ Palmer KL、Kos VN、Gilmore MS (2010-10-01)。「水平遺伝子伝達と腸球菌抗生物質耐性のゲノミクス」。Current Opinion in Microbiology . Antimicrobials/Genomics. 13 (5): 632–639. doi :10.1016/j.mib.2010.08.004. ISSN 1369-5274. PMC 2955785 . PMID 20837397.
- ^ Sommer MO, Dantas G, Church GM (2009-08-28). 「ヒト微生物叢における抗生物質耐性リザーバーの機能的特徴」. Science . 325 (5944): 1128–1131. Bibcode :2009Sci...325.1128S. doi :10.1126/science.1176950. ISSN 0036-8075. PMC 4720503. PMID 19713526 .
- ^ ab Gray TA、Krywy JA、Harold J、Palumbo MJ、Derbyshire KM（2013年7月）。「マイコバクテリアの分配接合伝達により、減数分裂のようなゲノム全体のモザイク現象を持つ子孫が生成され、交配アイデンティティ遺伝子座のマッピングが可能になる」。PLOS Biology。11 （ 7 ）：e1001602。doi：10.1371 / journal.pbio.1001602。PMC 3706393。PMID 23874149。
- ^ Derbyshire KM、Gray TA (2014) 。 「分配的接合伝達：マイコバクテリアにおける水平遺伝子伝達と遺伝子交換に関する新たな知見」。Microbiology Spectrum。2 ( 1 ): 61–79。doi : 10.1128 /microbiolspec.MGM2-0022-2013。PMC 4259119。PMID 25505644。
- ^ Méheust R、Watson AK、 Lapointe FJ、Papke RT、Lopez P、Bapteste E (2018年6月)。「細菌起源の数百の新規複合遺伝子とキメラ遺伝子がハロアーキアの進化に貢献」。ゲノム生物 学。19 ( 1): 75。doi : 10.1186/ s13059-018-1454-9。PMC 5992828。PMID 29880023。
- ^ Martijn J、Schön ME、Lind AE、Vosseberg J、Williams TA、Spang A、他。 （2020年10月）。 「ヒカルチャエイアは、メタン生成菌から好塩菌への移行の中間段階を示しています。」ネイチャーコミュニケーションズ。11 (1): 5490. Bibcode :2020NatCo..11.5490M。土井：10.1038/s41467-020-19200-2。PMC 7599335。PMID 33127909。
- ^ abc Fröls S, Ajon M, Wagner M, Teichmann D, Zolghadr B, Folea M, et al. (2008年11月). 「UV誘導性細胞凝集は超好熱性古細菌Sulfolobus solfataricus がピリ形成を介する」(PDF) . Molecular Microbiology . 70 (4): 938–52. doi : 10.1111/j.1365-2958.2008.06459.x . PMID 18990182. 2023-04-15にオリジナルからアーカイブ(PDF) . 2020-06-23に取得。
- ^ Allers T (2011年11月). 「生き残るための遺伝子の交換 - 古細菌IV型ピリの新たな役割」.分子微生物学. 82 (4): 789–91. doi :10.1111/j.1365-2958.2011.07860.x. PMID 21992544. S2CID 45490029.
- ^ abcd Ajon M, Fröls S, van Wolferen M, Stoecker K, Teichmann D, Driessen AJ, et al. (2011年11月). 「UV誘導性DNA交換はIV型ピリによって媒介される超好熱性古細菌において起こる」(PDF) . Molecular Microbiology . 82 (4): 807–17. doi : 10.1111/j.1365-2958.2011.07861.x . PMID 21999488. 2021年10月10日時点のオリジナルより アーカイブ(PDF) . 2020年6月23日閲覧。
- ^ Fröls S、White MF、 Schleper C (2009 年 2 月)。「モデル古細菌 Sulfolobus solfataricus における紫外線損傷に対する反応」。生化学協会誌。37 (パート 1): 36–41。doi :10.1042/BST0370036。PMID 19143598 。
- ^ Grogan DW (1996 年 6 月). 「古細菌 Sulfolobus acidocaldarius における極度に高い温度での遺伝マーカーの交換」Journal of Bacteriology . 178 (11): 3207–11. doi :10.1128/jb.178.11.3207-3211.1996. PMC 178072 . PMID 8655500.
- ^ Wood ER、Ghané F、 Grogan DW (1997年9 月)。「短波長 UV 光に対する好熱性古細菌 Sulfolobus acidocaldarius の遺伝的応答」。Journal of Bacteriology。179 ( 18): 5693–8。doi : 10.1128 /jb.179.18.5693-5698.1997。PMC 179455。PMID 9294423。
- ^ Reilly MS、Grogan DW (2002 年2月)。「超好 熱性古細菌Sulfolobus acidocaldariusにおけるDNA損傷の生物学的影響」。FEMS Microbiology Letters。208 ( 1):29–34。doi : 10.1016/s0378-1097(01)00575-4。PMID 11934490。
- ^ ab van Wolferen M 、 Ajon M、Driessen AJ、 Albers SV (2013年12月)。「Sulfolobus acidocaldarius由来 のUV誘導性ピリオペロンの分子解析」。MicrobiologyOpen 。2 (6):928–37。doi : 10.1002/mbo3.128。PMC 3892339。PMID 24106028。
- ^ van Wolferen M, Ma X, Albers SV (2015年9月). 「Sulfolobalesの紫外線誘発ストレス応答に関与するDNA処理タンパク質」. Journal of Bacteriology . 197 (18): 2941–51. doi :10.1128/JB.00344-15. PMC 4542170. PMID 26148716 .
- ^ Melcher U (2001). 「分子遺伝学：遺伝子水平伝播」。米国オクラホマ州スティルウォーター：オクラホマ州立大学。2016年3月4日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2015年8月20日閲覧。
- ^ Blanchard JL 、 Lynch M (2000 年 7 月)。「オルガネラ遺伝子: 核内で最終的に移動する理由」。Trends in Genetics。16 ( 7): 315–20。doi :10.1016/S0168-9525(00)02053-9。PMID 10858662 。ミトコンドリアと葉緑体の遺伝子がどのように核に移されるか、またこのプロセスを完了するために遺伝子がどのようなステップを経る必要があるかについての理論について説明します。
- ^ Davis CC、 Wurdack KJ (2004年7 月)。「顕花植物における宿主から寄生虫への遺伝子伝達: Malpighiales の系統発生学的証拠」。Science。305 ( 5684): 676–8。Bibcode : 2004Sci ...305..676D。doi : 10.1126 / science.11 00671。PMID 15256617。S2CID 16180594。
- ^ Nickrent DL、Blarer A、Qiu YL、Vidal-Russell R、Anderson FE（2004年10月）。「ラフレシア目の系統学的推論：速度異質性と遺伝子水平伝播の影響」BMC Evolutionary Biology。4 （1）：40。doi ：10.1186 /1471-2148-4-40。PMC 528834。PMID 15496229。
- ^ Woloszynska M、Bocer T、Mackiewicz P 、 Janska H (2004 年 11 月)。「葉緑体 DNA の断片が、おそらく非真正双子葉植物から Phaseolus のミトコンドリアゲノムに水平移動した」。植物分子生物学。56 (5): 811–20。doi : 10.1007/s11103-004-5183-y。PMID 15803417。S2CID 14198321 。
- ^ Hall C、Brachat S 、 Dietrich FS（2005年6月）。「Saccharomyces cerevisiaeの進化に対する水平遺伝子伝達の寄与」。 真核細胞。4 （6）：1102–15。doi ：10.1128 /EC.4.6.1102-1115.2005。PMC 1151995。PMID 15947202。
- ^ Quispe-Huamanquispe DG、Gheysen G、 Kreuze JF (2017)。「アグロバクテリウムT-DNA」。Frontiers in Plant Science。8：2015年。doi：10.3389 / fpls.2017.02015。PMC 5705623。PMID 29225610。
- ^ Kfoury B, Rodrigues WF, Kim SJ, Brandizzi F, Del-Bem LE (2024). 「複数の水平遺伝子伝達イベントが植物のグリコシルヒドロラーゼの多様性と機能を形作った」New Phytologist . 242 (2): 809–824. Bibcode :2024NewPh.242..809K. doi : 10.1111/nph.19595 . PMID 38417454.
- ^ Lee Phillips M (2012). 「細菌遺伝子がコーヒーノキの栄養補給に役立つ」Nature . doi :10.1038/nature.2012.10116. S2CID 211729274.
- ^ Acuña R, Padilla BE, Flórez-Ramos CP, Rubio JD, Herrera JC, Benavides P, et al. (2012年3月). 「コーヒーの侵略的害虫への細菌遺伝子の適応的水平伝播」米国科学アカデミー紀要. 109 (11): 4197–202. Bibcode :2012PNAS..109.4197A. doi : 10.1073/pnas.1121190109 . PMC 3306691. PMID 22371593 .
- ^ Blondel L、Jones ET、Extavour GC（2020年2月）。 「新規 生殖細胞系列決定因子oskarの起源に対する細菌の寄与」。eLife。24 （ 9）：e45539。doi ：10.7554 / eLife.45539。PMC 7250577。PMID 32091394。
- ^ Watson T (2012年11月15日). 「Bdelloids Surviving on Borrowed DNA」. Science/AAAS News. 2023年5月6日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2022年6月30日閲覧。
- ^ Koutsovoulos G, Kumar S, Laetsch DR, Stevens L, Daub J, Conlon C, et al. (2016年5月). 「クマムシHypsibius dujardiniのゲノムにおける広範な水平遺伝子移動の証拠はない」。米国 科学アカデミー紀要。113 (18): 5053–8。Bibcode : 2016PNAS..113.5053K。doi : 10.1073 / pnas.1600338113。PMC 4983863。PMID 27035985。
- ^ Crisp A、Boschetti C、Perry M、Tunnacliffe A 、 Micklem G (2015 年 3 月)。「水平獲得された複数の遺伝子の発現は、脊椎動物と無脊椎動物のゲノムの両方の特徴である」。 ゲノム生物学。16 (1): 50。doi : 10.1186 / s13059-015-0607-3。PMC 4358723。PMID 25785303。
- ^ Madhusoodanan J (2015-03-12). 「水平遺伝子移動は動物ゲノムの特徴か?」The Scientist。2016-07-09時点のオリジナルよりアーカイブ。2016-07-14に閲覧。
- ^ Daugavet MA、Shabelnikov S、Shumeev A、Shaposhnikova T、Adonin LS、Podgornaya O (2019-01-19)。「ホヤ類Styela rustica由来の新規タンパク質rusticalinの特徴は祖先の水平遺伝子伝播イベントを明らかにする」。 モバイルDNA。10 ( 1 ) : 4. doi : 10.1186/ s13100-019-0146-7。PMC 6339383。PMID 30675192。
- ^ Redrejo-Rodríguez M、Muñoz-Espín D、Holguera I、Mencía M、Salas M (2012 年 11 月)。「機能的な真核生物の核局在シグナルはバクテリオファージの末端タンパク質に広く分布している」。米国科学アカデミー紀要。109 (45): 18482–7。Bibcode : 2012PNAS..10918482R。doi : 10.1073 / pnas.1216635109。PMC 3494942。PMID 23091024。
- ^ Kondo N, Nikoh N, Ijichi N, Shimada M, Fukatsu T (2002年10月). 「Wolbachia 内共生菌のゲノム断片が宿主昆虫のX染色体に移される」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 99 (22): 14280–5. Bibcode :2002PNAS...9914280K. doi : 10.1073/pnas.222228199 . PMC 137875 . PMID 12386340.
- ^ Dunning Hotopp JC、Clark ME、Oliveira DC、Foster JM、Fischer P、Muñoz Torres MC、他 (2007 年 9 月)。「細胞内細菌から多細胞真核生物への広範な遺伝子水平伝播」。Science。317 ( 5845 ) : 1753–6。Bibcode : 2007Sci ...317.1753H。doi : 10.1126/science.1142490。PMID 17761848。S2CID 10787254 。
- ^ Sloan, DB, Nakabachi, A., Richards, S., Qu, J., Murali, SC, Gibbs, RA, & Moran, NA (2014). 水平遺伝子伝達の並行した歴史が、樹液摂食昆虫における共生ゲノムの極端な減少を促進した。分子生物学と進化、31(4), 857-871。
- ^吉田 誠、丸山 聡、野崎 秀、白須 功 (2010 年 5 月)。「寄生植物 Striga hermonthica による水平遺伝子伝達」。Science。328 ( 5982 ) : 1128。Bibcode : 2010Sci ... 328.1128Y。doi :10.1126/science.11 87145。PMID 20508124。S2CID 39376164 。
- ^ Zimmer C (2014年4月17日). 「遺伝子工学を実践する植物」. New York Times . 2022年12月26日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2017年2月27日閲覧。
- ^ David‐Schwartz R, Runo S, Townsley B, Machuka J, Sinha N. 2008.「Cuscutaにおける宿主‐寄生虫接合部を介した実質細胞および師管を介したmRNAの長距離輸送」New Phytologist 179: 1133– 1141.
- ^ Schwartz JA、Curtis NE、Pierce SK（2014年12月）。「FISH標識により、藻類（Vaucheria litorea）の核遺伝子がウミウシ （ Elysia chlorotica）の染色体上に水平移動していることが判明」。The Biological Bulletin。227 （ 3 ）：300–12。doi ：10.1086/BBLv227n3p300。PMID 25572217。S2CID 21742354 。
- ^ Rauch C, Vries J, Rommel S, Rose LE, Woehle C, Christa G, et al. (2015年8月). 「光合成ナメクジにおける藻類遺伝子以外のものに注目するべき理由」.ゲノム生物学と進化. 7 (9): 2602–7. doi :10.1093/gbe/evv173. PMC 4607529. PMID 26319575 .
- ^ Bhattacharya D、Pelletreau KN、Price DC、Sarver KE、Rumpho ME (2013 年 8 月)。「Elysia chlorotica 卵 DNA のゲノム解析では、この Kleptoplastic Mollusc の生殖細胞系列への水平遺伝子伝達の証拠は得られなかった」。Molecular Biology and Evolution。30 ( 8 ) : 1843–52。doi :10.1093/molbev/mst084。PMC 3708498。PMID 23645554。
- ^ Xia J, Guo Z, Yang Z, Han H, Wang S, Xu H, et al. (2021年4月). 「コナジラミが植物毒素を中和する植物解毒遺伝子を乗っ取る」. Cell . 184 (7): 1693–1705.e17. doi : 10.1016/j.cell.2021.02.014 . PMID 33770502. S2CID 232359463.
- ^ Armijos Jaramillo VD、Vargas WA、Sukno SA、Thon MR（2013年11月）。「Colletotrichumの植物様サブチリシン（CPLS）の進化と構造に関する新たな知見」。Communicative & Integrative Biology。6 （6）：e25727。doi ：10.4161/cib.25727。PMC 3917961。PMID 24563701。
- ^ ab Nikolaidis N、Doran N、Cosgrove DJ (2014年2月)。「細菌と真菌の植物エクスパンシン：水平遺伝子伝達と独立ドメイン融合による進化」。分子生物学と進化。31 (2): 376–86。doi :10.1093/ molbev /mst206。PMID 24150040 。
- ^ ab Moran NA、 Jarvik T (2010 年 4 月)。「真菌からの遺伝子の水平伝播がアブラムシのカロテノイド生成の基盤となっている」。Science。328 ( 5978 ): 624–7。Bibcode : 2010Sci ... 328..624M。doi :10.1126/science.1187113。PMID 20431015。S2CID 14785276 。
- ^ Fukatsu T (2010年4月). 「進化。昆虫の色彩における真菌の過去」. Science . 328 (5978): 574–5. Bibcode :2010Sci...328..574F. doi :10.1126/science.1190417. PMID 20431000. S2CID 23686682.
- ^ Luo H, Hallen-Adams HE, Lüli Y, Sgambelluri RM, Li X, Smith M, et al. (2022年5月). 「有毒キノコにおけるアマニチン生合成経路の遺伝子と進化的運命」。米国科学 アカデミー紀要。119 ( 20): e2201113119。Bibcode : 2022PNAS..11901113L。doi : 10.1073 / pnas.2201113119。PMC 9171917。PMID 35533275。S2CID 248668772 。
- ^ McDonald MC、Taranto AP、Hill E、Schwessinger B、Liu Z、Simpfendorfer S、et al. (2019-10-29). Di Pietro A (ed.). 「3種類の真菌性小麦病原体間の宿主特異的毒性タンパク質ToxAのトランスポゾン媒介水平伝播」mBio . 10 (5). doi :10.1128/mBio.01515-19. ISSN 2161-2129. PMC 6737239 . PMID 31506307.
- ^ Cheeseman K, Ropars J, Renault P, Dupont J, Gouzy J, Branca A, et al. (2014-01-10). 「チーズ製造菌類における大規模ゲノム領域の最近の多重水平移動」. Nature Communications . 5 (1): 2876. Bibcode :2014NatCo...5.2876C. doi :10.1038/ncomms3876. ISSN 2041-1723. PMC 3896755. PMID 24407037 .
- ^ Richards TA、Dacks JB、Jenkinson JM、Thornton CR 、 Talbot NJ (2006 年 9 月)。「糸状植物病原体の進化: 真核生物界間の遺伝子交換」。Current Biology。16 ( 18): 1857–1864。Bibcode : 2006CBio ...16.1857R。doi :10.1016/ j.cub.2006.07.052。PMID 16979565 。
- ^ Richards TA、Soanes DM、Jones MD、Vasieva O、Leonard G、Paszkiewicz K、他 (2011 年 9 月)。「水平遺伝子移動は卵菌類における植物寄生機構の進化を促進した」。米国科学 アカデミー紀要。108 (37): 15258–15263。Bibcode : 2011PNAS..10815258R。doi : 10.1073 / pnas.1105100108。PMC 3174590。PMID 21878562 。
- ^ Wilcox C (2021-06-09). 「DNAは動物種間を飛び回る。その頻度は誰にも分からない」Quanta Magazine。2021-06-14時点のオリジナルよりアーカイブ。2021-06-15閲覧。
- ^ Martin JP、Fridovich I (1981 年 6 月)。「ポニーフィッシュからその発光細菌共生菌 Photobacter leiognathi への自然な遺伝子伝達の証拠。硬骨魚類のバクテリオクプレインと銅亜鉛スーパーオキシドディスムターゼの密接な関係」。The Journal of Biological Chemistry。256 ( 12): 6080–6089。doi : 10.1016/ S0021-9258 (19)69131-3。PMID 6787049。
- ^ Bar D (2011年2月16日). 「ヒトと三日熱マラリア原虫の間の大規模な水平遺伝子転移の証拠」. Nature Precedings . doi : 10.1038/npre.2011.5690.1 . 2019年3月31日時点のオリジナルよりアーカイブ。2011年5月13日閲覧。
- ^ 「人類の祖先は日常的に他の種から遺伝子を盗んできた」エコノミスト誌。2015年3月14日。2015年3月16日時点のオリジナルよりアーカイブ。2015年3月17日閲覧。
- ^ Andersson DI、Hughes D（2014 年7 月）。「致死量以下の抗生物質の微生物学的影響」。Nature Reviews。微生物学。12 （7）：465–478。doi ：10.1038/nrmicro3270。PMID 24861036。S2CID 3351736。
- ^ abcde Wang Y, Lu J, Zhang S, Li J, Mao L, Yuan Z, et al. (2021年9月). 「非抗生物質医薬品は、属内および属間の接合を通じて多剤耐性プラスミドの伝播を促進する」. The ISME Journal . 15 (9): 2493–2508. Bibcode :2021ISMEJ..15.2493W. doi :10.1038/s41396-021-00945-7. PMC 8397710. PMID 33692486.
- ^ abcdefg Jiao YN、Chen H、Gao RX 、 Zhu YG、 Rensing C (2017年10月)。「有機化合物は混合廃水処理システムにおける抗生物質耐性遺伝子の水平伝播を刺激する」。Chemosphere。184 : 53–61。Bibcode : 2017Chmsp.184...53J。doi :10.1016/j.chemosphere.2017.05.149。PMID 28578196 。
- ^ abcdefgh Ma X、Zhang X、Xia J、Sun H、Zhang X、Ye L（2021年12月）。「フェノール化合物は活性汚泥における抗生物質耐性遺伝子の水平伝播を促進する」。総合環境科学。800 ：149549。Bibcode ：2021ScTEn.80049549M。doi ：10.1016/ j.scitotenv.2021.149549。PMID 34392203 。
- ^ abcdef Zhang Y, Gu AZ, Cen T, Li X, He M, Li D, et al. (2018年6月). 「重金属の抑制濃度以下は、水環境におけるプラスミド媒介抗生物質耐性遺伝子の水平伝播を促進する」.環境汚染. 237 : 74–82. Bibcode :2018EPoll.237...74Z. doi : 10.1016/j.envpol.2018.01.032 . PMID 29477117. S2CID 4911120.
- ^ Ivics Z、 Hackett PB、Plasterk RH、Izsvák Z (1997 年 11 月)。「魚類由来の Tc1 様トランスポゾンである Sleeping Beauty の分子再構築とヒト細胞におけるその転座」。Cell。91 ( 4 ) : 501–510。doi : 10.1016 /S0092-8674(00) 80436-5。PMID 9390559。S2CID 17908472 。
- ^ Plasterk RH (1996)。「Tc1/Marinerトランスポゾンファミリー」。Saedler H、Gierl A (編)。「転移因子」。微生物学と免疫学の最新トピック。第204巻。ベルリン、ハイデルベルク：Springer。pp. 125–143。doi : 10.1007 / 978-3-642-79795-8_6。ISBN 978-3-642-79797-2. PMID 8556864。
- ^ Izsvák Z、Ivics Z 、 Plasterk RH (2000 年 9 月)。「Sleeping Beauty、脊椎動物の遺伝的形質転換のための広範囲の宿主域を持つトランスポゾンベクター」。Journal of Molecular Biology。302 ( 1): 93–102。doi : 10.1006 /jmbi.2000.4047。PMID 10964563 。
- ^ Kurtti TJ、Mattila JT、Herron MJ、Felsheim RF、Baldridge GD、Burkhardt NY、他 (2008 年 10 月)。「ダニ細胞株における遺伝子発現とサイレンシング: 機能的ダニゲノム解析のモデルシステム」。昆虫生化学および分子生物学。38 (10): 963–968。Bibcode : 2008IBMB ...38..963K。doi : 10.1016 / j.ibmb.2008.07.008。PMC 2581827。PMID 18722527。
- ^ Lawton G (2009年1月21日). 「なぜダーウィンは生命の樹について間違っていたのか」。ニューサイエンティスト誌。2015年4月14日時点のオリジナルよりアーカイブ。
- ^ Badger JH、Eisen JA、Ward NL (2005 年 5 月)。「Hyphomonas neptunium のゲノム解析は 16S rRNA 遺伝子に基づく系統解析と矛盾する: Rhodobacterales 目と Caulobacterales 目の分類学への影響」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology。55 ( Pt 3 ): 1021–1026。doi : 10.1099/ijs.0.63510-0。PMID 15879228。
- ^ Zhaxybayeva O、Gogarten JP (2004 年4 月)。「分岐発生、合体、そして生命の 3 つのドメインの進化」。遺伝学の動向。20 (4): 182–7。doi : 10.1016 /j.tig.2004.02.004。PMID 15041172 。
- ^ abc Doolittle WF (2000年2月). 「生命の木を根こそぎ破壊する」. Scientific American . 282 (2): 90–5. Bibcode :2000SciAm.282b..90D. doi :10.1038/scientificamerican0200-90. PMID 10710791.
- ^ Woese CR (2004年6月). 「新世紀のための新しい生物学」. Microbiology and Molecular Biology Reviews . 68 (2): 173–86. doi :10.1128/MMBR.68.2.173-186.2004. PMC 419918. PMID 15187180.
- ^ Theobald DL (2010年5月). 「普遍的共通祖先理論の正式なテスト」. Nature . 465 (7295): 219–22. Bibcode :2010Natur.465..219T. doi :10.1038/nature09014. PMID 20463738. S2CID 4422345.
- ^ ab Harris HM 、 Hill C (2021) 。「生命の樹におけるウイルスの位置」。Frontiers in Microbiology。11 : 604048。doi : 10.3389/ fmicb.2020.604048。PMC 7840587。PMID 33519747。
- ^ Huang J、Gogarten JP (2009)。「系統学的再構築のツールとしての古代遺伝子移転」。水平遺伝子移転。分子生物学の方法。第532巻。Humana Press。pp. 127–39。doi : 10.1007 / 978-1-60327-853-9_7。ISBN 978-1-60327-852-2. PMID 19271182。
- ^ Davín AA、Tannier E、Williams TA、Boussau B、Daubin V 、 Szöllősi GJ (2018年5月)。「遺伝子転移は生命の樹の年代を特定できる」。Nature Ecology & Evolution。2 ( 5 ): 904–909。Bibcode : 2018NatEE ...2..904D。doi :10.1038/s41559-018-0525-3。PMC 5912509。PMID 29610471。
- ^ Wolfe JM、Fournier GP（2018年5月）。「水平遺伝子移動がメタン生成菌の進化のタイミングを制限する」。Nature Ecology & Evolution。2 （5）：897–903。Bibcode ：2018NatEE...2..897W。doi ：10.1038/s41559-018-0513-7。hdl ： 1721.1 / 118329。PMID 29610466。S2CID 4968981 。
- ^ Oliveira PH、Touchon M、Cury J、Rocha EP（2017年10月）。「細菌における水平遺伝子伝達の染色体構成」。Nature Communications。8（1）：841。Bibcode ： 2017NatCo ... 8..841O。doi ： 10.1038/ s41467-017-00808 -w。PMC 5635113。PMID 29018197。
- ^ Bryant DA、Frigaard NU (2006 年 11月)。「原核生物の光合成と光栄養の解明」。Trends in Microbiology 14 ( 11): 488–96。doi :10.1016/j.tim.2006.09.001。PMID 16997562 。
- ^ Avrain L、Vernozy-Rozand C、Kempf I (2004)。「鶏におけるCampylobacter jejuni株間のtetO遺伝子の自然な水平伝播の証拠」。応用微生物学ジャーナル。97 (1):134–40。doi : 10.1111 / j.1365-2672.2004.02306.x。PMID 15186450。S2CID 19184139 。
- ^ Darkened Forests, Ferns Stole Gene From an Unlikely Source — and Then From Each Other Archived 2016-03-07 at the Wayback Machine by Jennifer Frazer (May 6, 2014). Scientific American .
- ^ Li FW、Rothfels CJ、Melkonian M、Villarreal JC、Stevenson DW、Graham SW 、他 (2015)。「フォトトロピンの起源と進化」。Frontiers in Plant Science。6 : 637。doi : 10.3389 / fpls.2015.00637。PMC 4532919。PMID 26322073。
- ^ Wybouw N, Dermauw W, Tirry L, Stevens C, Grbić M, Feyereisen R, et al. (2014年4月). 「細菌から水平伝播した遺伝子が節足動物を宿主植物のシアン化物中毒から保護する」eLife . 3 : e02365. doi : 10.7554/eLife.02365 . PMC 4011162 . PMID 24843024.
- ^ Yong E (2011-02-16). 「淋病がヒトのDNAを拾った（そしてそれは始まりに過ぎない）」ナショナルジオグラフィック。2013年1月6日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2016年7月14日閲覧。
さらに読む
- クアメン・D (2018)。『絡み合った木：生命の根本的新史』。サイモン＆シュスター。ISBN 978-1-4767-7662-0。
- Gyles C、Boerlin P (2014 年 3 月)。 「水平伝播する遺伝要素と細菌性疾患の病因におけるその役割」。獣医病理学。51 (2): 328–40。doi : 10.1177 / 0300985813511131。PMID 24318976。S2CID 206510894 。
- – マイケル・シヴァネン博士による水平遺伝子伝達に関する論文は、2022年2月27日にウェイバックマシンにアーカイブされています
- Salzberg SL、 White O、Peterson J、 Eisen JA (2001 年 6 月)。「ヒトゲノムにおける微生物遺伝子: 水平伝播か遺伝子消失か?」(PDF)。Science。292 ( 5523): 1903–6。Bibcode : 2001Sci ...292.1903S。doi : 10.1126 /science.1061036。PMID 11358996。S2CID 17016011。2006年 9 月 1 日に オリジナル(PDF)からアーカイブ。2005年 12 月 29 日に取得。
約 40 個の遺伝子がヒトと細菌にのみ共通していることがわかり、細菌から脊椎動物への水平伝播の候補例です。遺伝子消失とサンプル サイズ効果および進化速度の変化を組み合わせると、より生物学的に妥当な別の説明が得られます。
- Qi Z、Cui Y、Fang W、Ling L、Chen R (2004 年 1 月)。「真核生物ゲノムの比較により明らかになった常染色体の類似性」。Journal of Biological Physics。30 ( 4): 305–12。doi : 10.1007 /s10867-004-0996-0。PMC 3456315。PMID 23345874。
- Woese CR (2002 年 6 月). 「細胞の進化について」.米国科学アカデミー紀要. 99 (13): 8742–7. Bibcode :2002PNAS...99.8742W. doi : 10.1073/pnas.132266999 . PMC 124369. PMID 12077305 .この記事は、初期の系統適応における遺伝子の垂直移動から水平移動への重点の移行を試みています。彼は、進化のメカニズムが主に水平移動から主に垂直移動へと大きく移行した時期、および「種分化の起源」を「ダーウィンの閾値」と呼んでいます。
- Snel B、Bork P、 Huynen MA (1999 年 1 月)。「遺伝子含有量に基づくゲノム系統学」。Nature Genetics 21 ( 1): 108–10。doi :10.1038/5052。PMID 9916801。S2CID 10296406 。この記事では、遺伝子の水平伝播などの交絡因子を避けるために、遺伝子セットの有無を利用して系統発生を推測することを提案しています。
- 「Nature の Webfocus に無料レビュー記事が掲載されました」。2005 年 11 月 2 日にオリジナルからアーカイブされました。
- Patil PB、Sonti RV (2004 年 10 月)。「イネの細菌性葉枯れ病原菌 Xanthomonas oryzae pv. oryzae のリポ多糖 (lps) 生合成遺伝子座における水平遺伝子伝達を示唆する変異」。BMC Microbiology。4 ( 1 ) : 40。doi : 10.1186 /1471-2180-4-40。PMC 524487。PMID 15473911。
- Jin G、Nakhleh L、Snir S、 Tuller T (2006年11 月)。「系統ネットワークの最大尤度」。バイオインフォマティクス。22 (21): 2604–11。doi : 10.1093/bioinformatics/ btl452。PMID 16928736。
- Jain R、Rivera MC、Lake JA (1999年3 月)。「ゲノム間の遺伝子水平伝播: 複雑性仮説」。米国科学アカデミー紀要。96 (7): 3801–6。Bibcode : 1999PNAS ... 96.3801J。doi : 10.1073/ pnas.96.7.3801。PMC 22375。PMID 10097118。
- Ochman H、Lawrence JG 、 Groisman EA (2000 年 5 月)。「遺伝子水平伝播と細菌の革新の性質」。Nature . 405 ( 6784): 299–304。Bibcode :2000Natur.405..299O。doi : 10.1038/35012500。PMID 10830951。S2CID 85739173。
- プレストン・R（1999年7月12日）。「冷凍庫の悪魔」。ニューヨーカー誌。pp. 44–61。2023年3月18日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2020年2月20日閲覧。
天然痘はマウスのタンパク質の作り方を知っている。天然痘はどうやってそれを学んだのか？「ポックスウイルスは宿主から遺伝子を捕獲することに無差別性がある」とエスポジト氏は言う。「それは天然痘がかつてマウスか他の小型げっ歯類の体内にいたことを物語っている」
- Szpirer C、Top E、Couturier M、Mergeay M (1999 年 12 月)。「レトロトランスファーまたは遺伝子捕捉: 生態学的および進化学的意義を持つ接合プラスミドの特徴」。Microbiology。145 ( Pt 12 ) : 3321–3329。doi : 10.1099 /00221287-145-12-3321。PMID 10627031。2007 年 2 月 23 日にオリジナルからアーカイブ。2006年 5 月 12 日に取得。
- 「遺伝子組み換え植物の遺伝子は微生物に吸収され、このように拡散する可能性があるか？」。GMO の安全性: 水平遺伝子伝達に関する研究結果。2011 年 7 月 21 日にオリジナルからアーカイブ。
- Whitaker JW、McConkey GA、Westhead DR (2009)。「代謝遺伝子のトランスフェロームの調査：単細胞真核生物における酵素コード遺伝子の水平伝播の分析」。ゲノム生物学。10 (4): R36。doi : 10.1186 / gb -2009-10-4- r36。PMC 2688927。PMID 19368726。
外部リンク
Scholia には、水平遺伝子移動に関するトピックプロファイルがあります。
- シチズンディウム:水平遺伝子伝達
- Citizendium:原核生物における遺伝子水平伝播
- Citizendium:植物における水平遺伝子伝達
- Citizendium:遺伝子水平伝播（歴史）