細菌接合の模式図。1-ドナー細胞が線毛 を 生成する。2-線毛が 受容細胞に付着し、2つの細胞を近づける。3-可動プラスミドが切断され、DNAの一本鎖が受容細胞に転移される。4-両方の細胞がプラスミドを再環状化し、2本目の鎖を合成し、線毛を再生する。両方の細胞が 生存可能なドナーとなる。 ピルス(ラテン語 で「毛」、複数形 :ピリ)は 、多くの 細菌 や古細菌 に見られる毛状の細胞表面付属器官 です。[ 1 ] ピルス とフィムブリア (ラテン語で「房飾り」、複数形:フィムブリア ) という用語は互換的に使用できますが、一部の研究者は細菌の接合 に必要な付属器官にピルス という用語を限定しています。すべての接合性ピルスは主にオリゴマーで あるピリン 繊維状タンパク質 で構成されています。
細菌や古細菌の表面には、このような構造が数十個存在する可能性がある。一部の細菌、ウイルス 、またはバクテリオファージは、 増殖 サイクルの開始時に線毛上の受容体 に結合する。
ピリは抗原性を 持つ。また、ピリは脆弱で絶えず置き換えられ、時には組成の異なるピリに置き換えられるため、抗原性が変化する。古いピリ構造に対する特異的な宿主応答は、新しい構造には効果がない。一部の(すべてではない)ピリの遺伝子間の組換えにより、ピリの可変(V)領域と定常(C)領域がコードされる(免疫グロブリンの多様性と同様)。腸内細菌科、 シュードモナス 科 、ナイセリア科 を含むグラム陰性 菌および一部のグラム陽性菌 の細胞表面における主要な抗原決定因子、病原性因子、および免責因子として、接着のオルガネラおよびワクチン成分としてのピリの研究には大きな関心が寄せられている。ピリの最初の詳細な研究は、ブリントンらが1つの細菌株内に2つの異なる相(ピリ形成型(p+)と非ピリ形成型)が存在することを実証したことによって行われた[ 2 ]。
機能別分類 ピリにはその機能によっていくつかの名前が付けられています。収斂進化 が起こるため、分類は構造や進化に基づくタイプと必ずしも一致するとは限りません。[ 3 ]
接合性線毛 接合性線毛は、細菌接合 の過程で細菌間でDNA を伝達することを可能にする。有性生殖になぞらえて「性線毛」と呼ばれることもあり、これは「接合ペア」の形成を介して遺伝子の交換を可能にするためである。おそらく最もよく研究されているのは、 F性因子 によってコードされる大腸菌 のF線毛であろう。
接合 中の大腸菌 。細菌は、隣接する2つの細胞をつなぎ、DNAの伝達のための物理的な通路として機能する、性線毛と呼ばれる長い細胞外付属器官を生成する。 [ 4 ]より改変。 性線毛は通常、直径が 6 ~ 7 nm です。接合中、ドナー細菌から伸びる線毛が受容細菌を捕らえ、引き寄せ、最終的に接合橋 の形成を引き起こします。これにより直接接触が確立され、ドナーから受容細菌への DNA の転送を可能にする制御された孔が形成されます。通常、転送される DNA は線毛の作成と転送に必要な遺伝子 (多くの場合、プラスミド にコードされている) で構成されているため、一種の利己的な DNA です。ただし、他の DNA 断片が共転送されることも多く、これにより、抗生物質耐性 などの遺伝的形質が細菌集団全体に拡散する可能性があります。F 線毛によって確立される接続は、F 線毛の堅牢な特性のおかげで機械的にも熱化学的にも非常に耐性があり、さまざまな環境で遺伝子転送が成功することが保証されます。[ 5 ] すべての細菌が接合線毛を作成できるわけではありませんが、接合は異なる種の細菌間でも起こり得ます。[ 6 ] [ 7 ]
古細菌(左)と細菌(右)におけるドナー細胞とレシピエント細胞間の接合機構の提案。模式図は、ドナー古細菌細胞ではHerA-NurA機構によって、細菌ではプラスミドにコードされたリラキソソームによってssDNA基質がどのように生成されるかを示している。この図は[ 8 ]から転載したものである。 超好熱性古細菌は 、細菌の接合性線毛と構造的に類似した線毛をコードしている。[ 8 ] しかし、接合装置が通常、プラスミドやトランスポゾンなどの可動遺伝因子の伝達を媒介する細菌とは異なり、Ced(Crenarchaeal system for exchange of DNA)[ 9 ] およびTed(Thermoproteales system for exchange of DNA)[ 8 ] と呼ばれる超好熱性古細菌の接合機構は、同種のメンバー間での細胞DNAの伝達を担っているようである。これらの古細菌では、接合機構は可動遺伝因子の拡散ではなく相同組換えによるDNA修復を促進するために完全に家畜化されていると考えられている。[ 8 ]
線毛 大腸菌 線毛 (ラテン語 で「縁」、複数形 :線毛類 )は、細菌を表面に付着させるために使用される短い線毛、付属器官を表す用語であり、「付着線毛」 [ 10 ] または接着線毛 とも呼ばれる。 「線毛」という用語は、さまざまな(構造的)タイプの線毛を指すことができる。実際、さまざまなタイプの線毛が接着に使用されており、これは収斂進化 の一例である。[ 3 ] 遺伝子オントロジー システムでは、線毛類を個別の付属器官タイプとして扱わず、代わりに一般的な線毛(GO:0009289)タイプを使用している。
この付属器官は直径が3~10ナノメートル、長さは数マイクロメートルにも達します。線毛は細菌が互いに付着したり、動物細胞や一部の無生物に付着したりするために用いられます。細菌は最大1,000本の線毛を持つことがあります。線毛は電子顕微鏡 でなければ観察できません。線毛はまっすぐなものもあれば、柔軟なものもあります。
線毛には接着因子 があり、これによって細菌は基質に付着し、せん断力に 耐え、栄養素を獲得することができる。例えば、大腸菌は 線毛を使ってマンノース受容体 に付着する。
好気性細菌 の中には、培養液 の表面に非常に薄い層を形成するものがある。この層はペリクル と呼ばれ、線毛によって表面に付着した多数の好気性細菌から構成されている。このように、線毛のおかげで好気性細菌は栄養分を摂取する培養液上にとどまり、同時に空気の近くにも存在することができる。
線毛は、感染時に細菌を宿主表面に付着させて定着させるため、バイオフィルム の形成に不可欠である。線毛は細胞の両極に位置するか、細胞表面全体に均一に分布している。
この用語は、性毛を特に指すために「pilus」を使用する人々によって、すべての毛を指す緩やかな意味でも使用されました。[ 11 ]
組み立てシステムまたは構造による分類
移行 Tra(トランスファー)ファミリーには、既知の性線毛がすべて含まれています(2010年現在)。これらはIV型分泌系 (T4SS)に関連しています。[ 3 ] これらはF線毛にちなんでF型とP型に分類できます。分泌系の線毛と同様に、この線毛は物質(この場合はDNA)を別の細胞に注入します。[ 12 ]
IV型毛髪 IV型線毛の痙攣運動 1. Pre-PilAは細胞質で作られ、内膜に移動します。 2. Pre-PilAは内膜に挿入されます。 3. ペプチダーゼで あるPilDはリーダー配列を除去し、Pre-PilAを短くして、線毛の主要構成要素タンパク質であるPilAにします。 4. PilFはNTP 結合タンパク質で、IV型線毛の組み立てにエネルギーを供給します。 5. 細胞の外膜にある分泌タンパク質PilQは、線毛の発達/伸長に必要です。PilCは線毛を形成する最初のタンパク質であり、線毛全体の付着に責任があります。 6. IV型線毛が必要なものと付着または相互作用すると、収縮を開始します。これは、PilTが線毛内のPilAの最後の部分を分解し始めることによって起こります。 PilTのメカニズムはPilFと非常によく似ている。7 . ピルスが利用される成分に分解され、再びPilAに合成される。 [ 13 ] タイプIVa毛髪製造機の建築モデル IV型線毛 (T4P)と呼ばれる一部の線毛は、運動 力を発生させます。[ 14 ] 線毛の外側の端は、細菌が付着している表面または他の細菌などの固体基質に付着します。そして、線毛が収縮すると、グラップリングフックのように細菌を前方に引っ張ります。IV型線毛によって生み出される動きは通常ぎこちないため、鞭毛 によって生み出されるような他の形態の細菌運動とは対照的に、痙攣運動 と呼ばれます。ただし、Myxococcus xanthus などの一部の細菌は滑走運動 を示します。細菌のIV型線毛は、アーキエラ の構成タンパク質(アーキア鞭毛)と構造が似ており、両方ともII型分泌系 (T2SS)に関連しています。[ 15 ] これらはIV型フィラメント 系のグループによって統一されています。古細菌以外にも、多くの古細菌は接着性のタイプ4ピリを産生し、これにより古細菌細胞はさまざまな基質に付着することができる。古細菌のタイプ4ピリンとアーケリンのN末端αヘリックス部分は、細菌のT4Pの対応する領域と相同性があるが、C末端βストランドに富むドメインは、細菌と古細菌のピリンでは無関係であるように見える。[ 16 ]
遺伝子形質転換 とは、受容細菌細胞が隣接する細胞からDNAを取り込み、相同組換え によってこのDNAをゲノムに組み込むプロセスである。髄膜炎菌 (髄膜炎菌とも呼ばれる)では、DNA形質転換には、ドナーDNAのコード領域 に存在する9〜10個のモノマーからなる短いDNA取り込み配列(DUS)の存在が必要である。DUSの特異的認識は、IV型 ピリン によって媒介される。[ 17 ] 髄膜炎菌のIV型ピリは、フィラメント表面に露出すると予測される電気陽性ストライプを介して、マイナーピリンComPを介してDNAに結合する。ComPは、特定のDUSに対して極めて高い結合特異性を示す。N . meningitidis ゲノム内のDUSの分布は特定の遺伝子を優先しており、ゲノムの維持と修復に関与する遺伝子に偏りがあることを示唆している。[ 18 ] [ 19 ] インフルエンザ菌 などのパスツレラ 科 の細菌は、ナイセリア科 の細菌とは関係のない取り込みシグナル配列をDNA内に持ち、効率的な形質転換を媒介する。[ 20 ]
このファミリーは、顕微鏡下での外観から、当初は「IV型線毛」として識別されました。この分類は、たまたまクレードに対応しているため、存続しています。[ 21 ] 一部の古細菌のIV型ピリンは4つの異なるコンフォメーションで存在でき、構造が劇的に異なる2つのピリを生成することが示されています。[ 22 ] 驚くべきことに、2つのピリは同じ分泌機構によって生成されます。しかし、どちらのピリが形成されるかは成長条件に依存するようで、2つのピリは機能的に異なっていることを示唆しています。[ 22 ]
カーリー この図は線毛の付着を示しています。この過程では、細菌細胞(右)の線毛が、宿主細胞(左)の外膜にある受容体と呼ばれる特定のタンパク質に付着します。これは、宿主細胞の受容体と細菌の線毛にある完全に一致する接着部位との間の特異的な相互作用によって起こります。細菌が宿主細胞に付着するこの過程は、周囲にますます多くの細菌が集まることで宿主細胞への定着につながり、細菌の生存を継続させ、組織や臓器全体に感染することを可能にするために不可欠です。 [ 26 ] 「グラム陰性細菌は、カーリーと呼ばれる 機能的なアミロイド 表面繊維を組み立てる。」[ 27 ] カーリーは線毛の一種である。[ 23 ] カーリーはカーリンと呼ばれるタンパク質で構成されている。[ 27 ] 関与する遺伝子には、CsgA 、CsgB 、CsgC 、CsgD 、CsgE 、CsgF 、CsgG などがある。[ 27 ]
毒性 ピリは、大腸菌 、コレラ菌 、および多くの連鎖球菌 株を含む多くの細菌の病原性株の毒性に関与しています。[ 28 ] [ 29 ] これは、ピリの存在が細菌の体組織への結合能力を大幅に高め、それによって複製速度と宿主生物との相互作用能力が増加するためです。[ 28 ] ある細菌種に複数の株があり、そのうちの一部のみが病原性である場合、病原性株にはピリがあり、非病原性株にはない可能性が高いです。[ 30 ] [ 31 ]
付着線毛の発達は、さらなる病原性形質の発達につながる可能性がある。線毛は、大腸菌 、百日咳菌 、ブドウ球菌 、連鎖 球菌の主要な病原性 メカニズムの1つである。線毛の存在は、細菌が宿主に付着して病気を引き起こす能力を大幅に高める。[ 32 ] 非病原性のコレラ 菌株は最初に線毛を進化させ、ヒト組織に結合して微小コロニーを 形成できるようにした。[ 28 ] [ 31 ] これらの線毛は、病気を引き起こす毒素を運ぶ 溶原性バクテリオファージ の結合部位として機能した。[ 28 ] [ 31 ] この毒素の遺伝子は、細菌のゲノムに組み込まれると、線毛をコードする遺伝子が発現するときに発現する(そのため「毒素媒介線毛」という名前が付けられている)。[ 28 ]
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