走化性を調べるための毛細管アッセイ。運動性のある原核生物は、周囲の化学物質を感知し、それに応じて運動性を変化させます。化学物質がない場合、動きは完全にランダムです。誘引物質または忌避物質が存在すると、移動距離が長くなり、転倒の頻度が減少します。その結果、化学物質に向かって、または化学物質から遠ざかるように(つまり、化学物質の濃度勾配に沿って上下に)正味の移動が生じます。この正味の移動はビーカー内で観察でき、細菌は誘引物質の発生源付近に集まり、忌避物質の発生源からは遠ざかります。 化学走性( chemo- + taxis から)は、化学刺激に対する生物または実体の運動です。[ 1 ] 体細胞 、細菌 、その他の単細胞 または多細胞 生物は、環境中の特定の化学物質に応じて運動の方向を定めます。これは、細菌が食物分子の濃度が最も高い場所に向かって泳ぐことで食物(グルコースなど)を見つけたり、 毒物 (フェノール など)から逃げたりするために重要です。多細胞生物では、化学走性は初期発生(受精時の 精子 の卵子への移動など)や発達(ニューロン やリンパ球 の移動など)だけでなく、正常な機能と健康(損傷や感染時の白血球 の移動など)にも不可欠です。 [ 2 ] さらに、動物の化学走性を可能にするメカニズムは、癌 転移 中に阻害されることが認識されており、[ 3 ] 化学走性を制御するこれらのネットワークの全体的な特性の異常な変化は、発癌 につながる可能性があります。[ 4 ] 白血球やリンパ球の異常な走化性も、動脈硬化、喘息、関節炎などの炎症性疾患の一因となっている。[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] 接合酵母によって生成される極性パッチなどの細胞内小器官も走化性を示すことがある。[ 9 ]
正の 走化性とは、対象となる化学物質の濃度が高い方向へ移動する現象であり、負の 走化性とは、その逆方向へ移動する現象である。化学物質によって誘発される運動(無秩序な方向への運動、または方向性のない運動)は、 化学運動性 と呼ばれることがある。
細菌の走化性 遊泳行動と鞭毛回転の相関関係
大腸菌 などの一部の細菌は 、細胞あたり複数の鞭毛 (通常4~10本)を持っています。これらの鞭毛は、次の2つの方法で回転することができます。
反時計回りの回転により鞭毛が1つの回転する束に整列し、細菌が直線的に泳ぐようになる。 時計回りの回転により鞭毛束がバラバラになり、それぞれの鞭毛が異なる方向を向くため、細菌はその場で回転する。[ 17 ] 回転方向は、細胞の外側から鞭毛を細胞に向かって見下ろしている観察者に対して示されている。[ 18 ] [ 11 ]
行動 細菌の全体的な動きは、回転運動と遊泳運動が交互に繰り返されることによって生じるもので、これを回転運動 と呼びます。[ 19 ] その結果、均一な環境を泳ぐ細菌の軌跡は、比較的まっすぐな遊泳と、細菌の向きを変えるランダムな回転運動が交互に繰り返される、偏ったランダムウォークを形成します。 [ 20 ] 細菌は、自分の進路を繰り返し評価し、間違った方向に動いている場合は調整することで、ランダムウォーク運動を好ましい場所に向けることができます。[ 21 ]
化学勾配 が存在する場合、細菌は走化性、つまり勾配に基づいて全体の運動方向を定めます。細菌が正しい方向(誘引物質に向かって/忌避物質から遠ざかる方向)に移動していることを感知すると、転がる前に直線でより長い時間泳ぎ続けます。しかし、間違った方向に移動している場合は、より早く転がります。大腸菌 などの周毛性 細菌は、時間的感知を使用して状況が改善しているかどうかを判断し、このようにして、濃度のわずかな違いさえも検出して、誘引物質の濃度が最も高い場所を見つけます。[ 22 ] [ 23 ] [ 24][25][26 ] [ 27 ] サルモネラ菌 も この よう に 振る舞う こと ができ、[ 28 ] また、シュードモナス・プティダ などのロフォトリカス 鞭毛細菌も、[ 29 ] 泳動フェーズ間の角度変化に積極的に影響を与えることができます。その結果、遊泳方向は細菌にとってより良い環境条件の方向に偏る。これは、自由経路長が制限され、走行距離の偏りが効果的でない組織や土壌などの自然生息地での遊泳に有利となる可能性がある。[ 27 ] [ 29 ]
周毛性鞭毛細菌の場合、この偏ったランダムウォークは、回転運動と直線遊泳という2つのランダム運動方法のどちらかを選択することによって生じる。[ 30 ]
個々の鞭毛フィラメントのらせん構造は、この運動が起こるために重要である。鞭毛フィラメントを構成するタンパク質構造であるフラジェリン は、すべての鞭毛細菌で保存されている。[ 31 ] 脊椎動物は、この保存されたタンパク質を認識するように設計された免疫受容体( TLR5 )を持つことで、この事実を利用しているようだ。[ 32 ]
生物学の多くの例と同様に、この規則に従わない細菌も存在する。ビブリオ などの多くの細菌は単鞭毛性で、細胞の一方の極に1本の鞭毛を持つ。これらの細菌の走化性の方法は異なる。また、細胞壁内に1本の鞭毛を持つ細菌もある。これらの細菌は、コルク栓抜きのような形をした細胞全体を回転させることで移動する。[ 33 ] また、シュードモナス・プティダなどのロフォトリカス鞭毛細菌は、異なる遊泳様式を示す。[ 34 ] [ 35 ]
シグナル伝達 Aspに対する走化性受容体のドメイン構造
化学勾配は、メチル受容性走化性タンパク質 (MACP)と呼ばれる複数の膜貫通型受容体 を介して感知され、これらの受容体は検出する分子が異なります。[ 36 ] 細菌界全体で数千のMACP受容体がコードされていることが知られています。[ 37 ] これらの受容体は、ペリプラズム空間 のタンパク質との相互作用を介して、直接的または間接的に誘引物質または忌避物質に結合する可能性があります。[ 38 ] これらの受容体からの信号は、細胞膜を介して 細胞質 に伝達され、そこでCheタンパク質 が活性化されます。[ 39 ] Cheタンパク質は回転頻度を変化させ、受容体を変化させます。[ 39 ]
鞭毛の調節 タンパク質 CheW と CheA は受容体に結合します。受容体が活性化されないと、ヒスチジンキナーゼ CheAの単一の高度に保存されたヒスチジン残基で自己リン酸化が起こります。 [ 40 ] CheA は、リン酸基を応答調節因子 CheB と CheY の保存されたアスパラギン酸残基に転移します。CheA はヒスチジンキナーゼであり、リン酸基を能動的に転移するのではなく、応答調節因子CheB が CheA からリン酸基を受け取ります。このシグナル伝達のメカニズムは二成分系 と呼ばれ、細菌における一般的なシグナル伝達の形態です。CheYは鞭毛スイッチタンパク質 FliM と相互作用して、鞭毛の回転を反時計回りから時計回りに変化させることで、タンブリングを誘発します。単一の鞭毛の回転状態の変化は、鞭毛束全体を破壊し、タンブリングを引き起こす可能性があります。
受容体調節 大腸菌のシグナル伝達経路
CheBは、CheAによって活性化されると、メチルエステラーゼ として働き、受容体の細胞質側の グルタミン酸 残基からメチル基を除去します。また、同じグルタミン酸残基にメチル基を付加するメチルトランスフェラーゼであるCheRとは拮抗的に作用します。 [ 36 ] 誘引物質のレベルが高いままであれば、CheA(したがってCheYとCheB)のリン酸化レベルは低いままとなり、細胞はスムーズに泳ぎ、MCPのメチル化レベルは上昇します(脱メチル化を行うCheB-Pが存在しないため)。[ 36 ] MCPが完全にメチル化されると、誘引物質に反応しなくなります。そのため、誘引物質のレベルが高いままであっても、CheA-P(およびCheB-P)のレベルが上昇し、細胞は回転し始めます。[ 36 ] MCPはCheB-Pによって脱メチル化され、そうなると受容体は再び誘引物質に反応するようになる。[ 36 ] 忌避物質に関しては状況は逆で、完全にメチル化されたMCPは忌避物質に最もよく反応し、メチル化が最も少ないMCPは忌避物質に最も反応しにくい。この調節により、細菌は数秒前の化学濃度を「記憶」し、現在経験している濃度と比較することで、勾配を上っているのか下っているのかを「知る」ことができる。 [ 41 ] 細菌が化学勾配に反応するということは、特定の背景における感度の絶対値を増加させる他のメカニズムが関与しているということである。よく知られている例としては、モーターのCheY-Pシグナルに対する超高感度な反応と化学受容体のクラスター化がある。[ 42 ] [ 43 ]
真核生物の走化性 原核生物と真核生物における勾配感知の違い
真核 細胞が用いる走化性のメカニズムは、細菌 である大腸菌のそれとはかなり異なりますが、化学勾配の感知は依然としてその過程における重要なステップです。[ 50 ] 大腸菌は 、その小さなサイズやその他の生物物理学的制約のため、濃度勾配を直接検出することはできません。[ 51 ] その代わりに、時間勾配感知を採用しており、自身の幅の数倍のより長い距離を移動し、知覚した化学濃度の変化率を測定します。[ 52 ] [ 53 ]
真核細胞は原核細胞よりもはるかに大きく、細胞膜 全体に均一に埋め込まれた受容体を持っています。[ 52 ] 真核生物の走化性は、細胞の両端にあるこれらの受容体の非対称的な活性化を比較することによって、空間的に濃度勾配を検出することを含みます。[ 52 ] これらの受容体の活性化は、化学誘引物質に向かって、または化学忌避物質から遠ざかる移動をもたらします。[ 52 ] 非運動性の交配酵母では、細胞皮質上の極性タンパク質のパッチが、フェロモン勾配に沿って走化性的に移動することができます。[ 54 ] [ 9 ]
原核細胞と真核細胞の両方が走化性記憶能力を持つことも示されている。[ 53 ] [ 55 ] 原核生物では、このメカニズムはメチル受容走化性タンパク質 (MCP)と呼ばれる受容体のメチル化 を伴う。[ 53 ] これにより受容体の脱感作が起こり、原核生物は化学勾配を「記憶」して適応することができる。[ 53 ] 一方、真核生物の走化性記憶は、局所興奮全体抑制(LEGI)モデルで説明できる。[ 55 ] [ 56 ] LEGIは、 Ras 活性化やPIP3 産生などの下流シグナル伝達を制御する、急速な興奮と遅延した抑制のバランスを伴う。[ 57 ]
受容体のレベル、細胞内シグナル伝達経路、およびエフェクター機構はすべて、多様な真核生物型の構成要素を表しています。真核単細胞細胞では、アメーバ運動と繊毛または真核鞭毛が主なエフェクターです(例:アメーバ またはテトラヒメナ )。[ 58 ] [ 59 ] 免疫細胞 など、高等脊椎動物 由来の真核細胞の一部も、必要な場所に移動します。免疫担当細胞(顆粒球 、単球 、リンパ球 )に加えて、以前は組織に固定されていると考えられていた大きな細胞群も、特別な生理的状態(例:肥満細胞 、線維芽細胞 、内皮細胞 )または病理的状態(例:転移 )で運動性を示します。[ 60 ] 化学走性は、胚葉 の発達がシグナル分子の勾配によって誘導されるため、胚発生 の初期段階で非常に重要です。[ 61 ] [ 62 ]
化学誘引物質の濃度勾配の検出 真核細胞が化学誘引物質リガンドの勾配を検出することを可能にする特定の分子(つまり、化学誘引物質の方向を検出する一種の分子コンパス)は、関与する細胞や化学誘引物質受容体、あるいは化学誘引物質の濃度によって変化するようです。しかし、これらの分子は明らかに細胞の運動性とは無関係に活性化されます。つまり、不動化した細胞でも化学誘引物質の方向を検出できます。[ 63 ] 外部の走化性勾配が感知され、細胞内のRasとPIP3 勾配に変換され、勾配とシグナル伝達経路の活性化をもたらし、最終的にアクチン フィラメントの重合 に至るメカニズムがあるようです。アクチンフィラメントの成長中の遠位端は、さまざまなペプチドセットを介して細胞膜の内表面と結合し、前部仮足 と後部尾足 の形成につながります。[ 64 ] [ 65 ] 真核細胞の繊毛 も走化性を生み出すことができる。この場合、それは主に基底体の 微小管 系のCa2 + 依存性誘導と繊毛内の9 + 2微小管の拍動である。数百本の繊毛の協調的な拍動は、基底体間に構築された膜下システムによって同期される。シグナル伝達経路の詳細はまだ完全には解明されていない。
走化性に関連する移動反応
走化性とは、化学物質の濃度勾配に応じて細胞が方向性を持って移動する現象を指し、以下に挙げるように、化学物質によって誘発される移動にはいくつかの種類が存在する。
化学運動と は、周囲の環境中の化学物質に反応して細胞運動性が増加する現象を指します。走化性とは異なり、化学運動によって刺激される移動には方向性がなく、代わりに環境探索行動が増加します。 [ 66 ] ハプトタキシス では、化学誘引物質の勾配が 表面に発現または結合しているのに対し、古典的な化学走性モデルでは勾配は可溶性液体中に形成される。[ 67 ] 最も一般的な生物学的に活性なハプトタキシス表面は細胞外マトリックス(ECM)であり、結合した リガンド の存在が血管内皮透過と血管新生 の誘導に関与している。壊死走性は 、壊死細胞 またはアポトーシス 細胞から化学誘引物質が放出される際に生じる特殊なタイプの走化性である。放出される物質の化学的性質によって、壊死走性は細胞を集積させたり、反発させたりする可能性があり、この現象の病態生理学的意義を際立たせている。
受容体 一般的に、真核細胞は、ゲノム の大部分を占める7回膜貫通型(または蛇行型)ヘテロ三量体Gタンパク質共役受容体 を用いて走化性刺激の存在を感知する。[ 68 ] この遺伝子スーパーファミリーの一部は、視覚(ロドプシン )や嗅覚 (匂い)にも利用されている。[ 69 ] [ 70 ] 走化性受容体の主なクラスは、以下の刺激によって活性化される。
しかし、幅広い膜受容体(例えば、環状ヌクレオチド 、アミノ酸 、インスリン 、血管作動性ペプチド)の誘導も細胞の遊走を引き起こす。[ 72 ]
化学走性選択 化学走性選択
走化性受容体の中には、遺伝的に決定され、長期的特性を持つ表面膜に発現するものもあれば、リガンドの存在下でアドホックに組み立てられ、短期的動態を示すものもある。 [ 73 ] 走化性受容体とリガンドの多様な特徴により、単純な走化性アッセイで走化性応答細胞を選択できる可能性がある。走化性選択 により、まだ特性が解明されていない分子が長期受容体経路または短期受容体経路のどちらを介して作用するかを判断できる。[ 74 ] 走化性選択 という用語は、セレクターリガンドに対する走化性応答性に基づいて真核細胞または原核細胞を分離する技術を指すためにも使用される。[ 75 ]
走化性リガンド ケモカインクラスの構造
ケモカインの三次元構造
走化性反応を引き起こす分子の数は比較的多く、一次走化性分子と二次走化性分子を区別することができる。一次リガンドの主なグループは以下のとおりである。
Formyl peptides are di-, tri-, tetrapeptides of bacterial origin, formylated on the N-terminus of the peptide.[ 76] They are released from bacteria in vivo or after decomposition of the cell, a typical member of this group is the N-formylmethionyl-leucyl-phenylalanine (abbreviated fMLF or fMLP). Bacterial fMLF is a key component of inflammation and has characteristic chemoattractant effects in neutrophil granulocytes and monocytes. The chemotactic factor ligands and receptors related to formyl peptides are summarized in the related article, Formyl peptide receptors .Complement 3a (C3a ) and complement 5a (C5a ) are intermediate products of the complement cascade. Their synthesis is joined to the three alternative pathways (classical, lectin-dependent, and alternative) of complement activation by a convertase enzyme. The main target cells of these derivatives are neutrophil granulocytes and monocytes as well.Chemokines belong to a special class of cytokines ; not only do their groups (C, CC, CXC, CX3 C chemokines) represent structurally related molecules with a special arrangement of disulfide bridges but also their target cell specificity is diverse. CC chemokines act on monocytes (e.g., RANTES ), and CXC chemokines are neutrophil granulocyte-specific (e.g., IL-8 ). Investigations of the three-dimensional structures of chemokines provided evidence that a characteristic composition of beta-sheets and an alpha helix provides expression of sequences required for interaction with the chemokine receptors. Formation of dimers and their increased biological activity was demonstrated by crystallography of several chemokines, e.g. IL-8.Metabolites of polyunsaturated fatty acids
臨床的意義 細胞の遊走能の変化は、いくつかの臨床症状や症候群の発症において比較的高い重要性を持つ。細胞外(例:大腸菌 )または細胞内(例:リステリア・モノサイトゲネス )病原体の走化性活性の変化自体が、重要な臨床標的となる。これらの微生物の内因性走化性能力を薬剤で修飾することで、感染率や感染症の蔓延を減少または抑制することができる。感染症以外にも、走化性の障害が主な病因となる疾患がいくつかあり、例えばチェディアック・ヒガシ症候群 では、巨大な細胞内小胞が細胞の正常な遊走を阻害する。
走化性の測定 細胞の走化性活性やリガンドの化学誘引性・化学忌避性を評価するための様々な手法が利用可能である。測定の基本的な要件は以下のとおりである。
濃度勾配は比較的速やかに発生し、システム内で長時間持続する可能性がある。 走化性活性と化学運動活性は区別される 細胞の移動は濃度勾配軸に沿って自由に行われる。 検出された反応は、細胞の活発な移動の結果である。 理想的な走化性アッセイは まだ確立されていませんが、上記条件によく適合するプロトコルや機器がいくつか存在します。最も一般的に使用されているものを以下の表にまとめました。
寒天平板アッセイ 二室アッセイ ボーデンチャンバー ジグモンド・チェンバー ダン・チェンバース マルチウェルチャンバー 毛細管技術 その他
人工走化性システム 人工走化性を利用して自律的に移動する化学ロボット が設計されている。[ 92 ] [ 93 ] 応用例としては、体内の標的部位への薬剤送達などが挙げられる。[ 94 ] さらに最近では、酵素分子も基質の濃度勾配において正の走化性挙動を示すことが分かっている。[ 95 ] 酵素が特定の基質に熱力学的に有利に結合することが、酵素走化性の起源として認識されている。[ 96 ] また、カスケード内の酵素も基質駆動型の走化性凝集を示すことが分かっている。[ 97 ]
活性酵素以外にも、非反応性分子も走化性挙動を示す。これは、疎水性相互作用によってポリマー溶液の勾配中で方向性を持って移動する色素分子を用いることで実証されている。[ 98 ]
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さらに読む
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外部リンク 走化性 好中球走化性 細胞遊走ゲートウェイ ダウンロード可能なMatlab走化性シミュレーター 細菌走化性インタラクティブシミュレーター(ウェブアプリ)