溶質輸送体ファミリー

膜輸送タンパク質の溶質キャリア（SLC）グループには、66のファミリーに分かれた400を超えるメンバーが含まれます。^{[1] [2]} SLCグループのメンバーのほとんどは細胞膜に位置しています。SLC遺伝子命名システムは、もともとHUGO遺伝子命名委員会（HGNC ）によって提案され、これらのトランスポーターをコードする遺伝子の公式HGNC名の基礎となっています。より一般的な膜貫通トランスポーターの分類は、TCDBデータベースにあります。

さまざまな SLC グループのメンバーによって輸送される溶質は非常に多様であり、荷電および非荷電の有機分子だけでなく、無機イオンやアンモニアガスも含まれます。

膜貫通タンパク質の典型であるように、SLC には、親水性の細胞内外ループによって互いに接続された多数の疎水性膜 貫通 アルファヘリックスが含まれています。SLC に応じて、これらのトランスポーターはモノマー、または絶対ホモまたはヘテロオリゴマーとして機能します。多くの SLC ファミリーは、主要な促進因子スーパーファミリーのメンバーです。

命名法の慣例により、個々のSLCファミリー内のメンバーは、互いに20〜25％以上の配列同一性を持っています。対照的に、SLCファミリー間の相同性は非常に低いか、まったくありません。^[3]したがって、ファミリーをSLCグループに含める基準は、他のSLCファミリーとの進化的関連性ではなく、むしろ機能的（つまり、溶質を輸送する膜貫通タンパク質）です。

SLC グループには、次のような輸送タンパク質の例が含まれます。

• 促進輸送体（電気化学的勾配を利用して溶質を下流に流す）
• 二次能動輸送体（全体の自由エネルギー変化が依然として好ましいように、勾配に沿って下り坂に流れる第 2 の溶質の輸送と結合することにより、溶質が電気化学的勾配に逆らって上り坂に流れることを可能にする）

SLC シリーズには、これまでに広く受け入れられている他の命名システムによって分類されていた以下の輸送タンパク質ファミリーのメンバーは含まれていません。

• ABC（ATP結合カセット）トランスポーターなどの主要な能動輸送体（電気化学的勾配に逆らって上流への流れを可能にする）は、輸送とATP加水分解などのエネルギー放出イベントを結合する。
• イオンチャネル
• アクアポリン（水チャネル）

SLC グループのメンバーのほとんどは細胞膜に存在しますが、一部のメンバーはミトコンドリア(最も有名なのは SLC ファミリー 25) や他の細胞内 小器官に存在します。

SLCメンバーの名前の形式は次の通りです: ^[4]

${\displaystyle {\ce {SLCnXm}}}$

どこ：

• SLCはルート名（S o L ute Carrier）です
• n = ファミリーを表す整数（例：1～52）
• X = サブファミリーを表す1文字（A、B、C、...）
• m = 個々のファミリーメンバー（アイソフォーム）を表す整数。

たとえば、SLC1A1 はSLC ファミリー 1 のサブファミリー A の最初のアイソフォームです。

例外はSLCファミリー21 ^[5] (有機アニオン輸送ポリペプチドトランスポーター)で、歴史的な理由からSLCOnXmという形式の名前が付けられています。ここで、n = ファミリー番号、X = サブファミリー文字、m = メンバー番号です。

HGNC はヒト遺伝子にのみ命名法を割り当てていますが、慣例によりこれらの遺伝子の脊椎動物オーソログは同じ命名法を採用しています (例: SLC10A1 の VGNC 割り当てオーソログ)。 げっ歯類の場合、記号の大文字/小文字はタイトルケースを使用するため、他の脊椎動物とは異なります。つまり、Slc1a1 はヒト SLC1A1 遺伝子のげっ歯類 オーソログを表します。

SLCでは以下のファミリーが命名されています: ^[6]

1. 高親和性グルタミン酸および中性アミノ酸トランスポーター^[7]
   • ( SLC1A1、SLC1A2、SLC1A3、SLC1A4、SLC1A5、SLC1A6、SLC1A7 )
2. 促進性GLUTトランスポーター^[8]
   • ( SLC2A1、SLC2A2、SLC2A3、SLC2A4、SLC2A5、SLC2A6、SLC2A7、SLC2A8、SLC2A9、SLC2A10、SLC2A11、SLC2A12、SLC2A13、SLC2A14 )
3. ヘテロ二量体アミノ酸トランスポーターの重サブユニット^[9]
   • ( SLC3A1、SLC3A2 )
4. 重炭酸イオントランスポーター^[10]
   • ( SLC4A1、SLC4A2、SLC4A3、SLC4A4、SLC4A5、SLC4A6、SLC4A7、SLC4A8、 SLC4A9 、 SLC4A10 、SLC4A11 )
5. ナトリウム・グルコース共輸送体^[11]
   • ( SLC5A1、SLC5A2、SLC5A3、SLC5A4、SLC5A5、SLC5A6、SLC5A7、SLC5A8、 SLC5A9 、 SLC5A10 、 SLC5A11 、SLC5A12 )
6. ナトリウムおよび塩素依存性ナトリウム:神経伝達物質共輸送体^[12]
   • ( SLC6A1、SLC6A2、SLC6A3、SLC6A4、SLC6A5、SLC6A6、 SLC6A7 、SLC6A8 、SLC6A9、 SLC6A10 、SLC6A11、SLC6A12、SLC6A13、SLC6A14、SLC6A15、 SLC6A16、 SLC6A17、SLC6A18、SLC6A19、SLC6A20）
7. カチオン性アミノ酸トランスポーター/糖タンパク質関連^[13]
   • カチオン性アミノ酸トランスポーター（SLC7A1、SLC7A2、SLC7A3、SLC7A4）
   • ヘテロ二量体アミノ酸トランスポーターの糖タンパク質関連/軽鎖または触媒サブユニット（SLC7A5、SLC7A6、SLC7A7、SLC7A8、SLC7A9、SLC7A10、SLC7A11、SLC7A13、SLC7A14）
8. Na+/Ca2+交換輸送体^[14]
   • ( SLC8A1、SLC8A2、SLC8A3)
9. Na+/H+交換輸送体^[15]
   • ( SLC9A1、SLC9A2、SLC9A3、SLC9A4、SLC9A5 、SLC9A6、SLC9A7、SLC9A8、SLC9A9、SLC9A10、SLC9A11、SLC9B1、SLC9B2 )
10. ナトリウム胆汁酸塩共輸送^[16]
    • ( SLC10A1、SLC10A2、SLC10A3、 SLC10A4 、 SLC10A5 、 SLC10A6 、SLC10A7 )
11. プロトン結合金属イオントランスポーター^[17]
    • ( SLC11A1、SLC11A2 )
12. 電子中性カチオン-Cl共輸送体^[18]
    • ( SLC12A1、SLC12A1、SLC12A2、SLC12A3、SLC12A4、SLC12A5、SLC12A6、SLC12A7、SLC12A8、SLC12A9 )
13. Na+硫酸/カルボキシレート共輸送体^[19]
    • (SLC13A1、SLC13A2、SLC13A3、SLC13A4、SLC13A5 )
14. 尿素トランスポーター^[20]
    • ( SLC14A1、SLC14A2 )
15. プロトンオリゴペプチド共輸送体^[21]
    • ( SLC15A1、SLC15A2、 SLC15A3 、SLC15A4 )
16. モノカルボキシレートトランスポーター^[22]
    • ( SLC16A1、SLC16A2、SLC16A3、SLC16A4、SLC16A5、 SLC16A6 、SLC16A7、SLC16A8 、 SLC16A9、SLC16A10、SLC16A11、 SLC16A12 、 SLC16A13 、 SLC16A14 )
17. 小胞グルタミン酸トランスポーター^[23]
    • ( SLC17A1、 SLC17A2 、SLC17A3、 SLC17A4 、SLC17A5、 SLC17A6 、SLC17A7、SLC17A8、SLC17A9 )
18. 小胞アミントランスポーター^[24]
    • ( SLC18A1、SLC18A2、SLC18A3 )
19. 葉酸/チアミントランスポーター^[25]
    • ( SLC19A1、SLC19A2、SLC19A3 )
20. III型Na+-リン酸共輸送体^[26]
    • ( SLC20A1、SLC20A2 )
21. 有機アニオン輸送^[27]
    • サブファミリー 1 ( SLCO1A2、SLCO1B1、SLCO1B3、SLCO1C1 )
    • サブファミリー 2 ( SLCO2A1、SLCO2B1 )
    • サブファミリー3 ( SLCO3A1 )
    • サブファミリー4 ( SLCO4A1、SLCO4C1)
    • サブファミリー5 (SLCO5A1)
    • サブファミリー6 (SLCO6A1)
22. 有機カチオン/アニオン/両性イオントランスポーター^[28]
    • ( SLC22A1、SLC22A2、SLC22A3、SLC22A4、SLC22A5、SLC22A6、SLC22A7、SLC22A8、SLC22A9、SLC22A10、SLC22A11、SLC22A12、SLC22A13、SLC22A14、SLC22A15、SLC22A16、SLC22A17 、SLC22A18、SLC22A18AS、SLC22A19、SLC22A20、SLC22A23、SLC22A24、SLC22A25、SLC22A31)
23. Na+依存性アスコルビン酸トランスポーター^[29]
    • ( SLC23A1、SLC23A2、SLC23A3、SLC23A4)
24. Na+/(Ca2+-K+)交換輸送体^[30]
    • (SLC24A1、SLC24A2、SLC24A3、SLC24A4、SLC24A5、SLC24A6)
25. ミトコンドリアキャリア^[31]
    • ( SLC25A1、 SLC25A2 、SLC25A3 、 SLC25A4 、 SLC25A5 、SLC25A6、UCP1(SLC25A7)、UCP2(SLC25A8)、UCP3(SLC25A9)、SLC25A10、SLC25A11、SLC25A12、SLC25A13、SLC25A14、SLC25A15、SLC25A16、SLC25A17、SLC25A18 、SLC25A19、SLC25A20 、 SLC25A21、SLC25A22、SLC25A23、SLC25A24、SLC25A25、 SLC25A26、SLC25A27、SLC25A28 、 SLC25A29、 SLC25A30 、SLC25A31 、 SLC25A32、SLC25A33、SLC25A34、SLC25A35、SLC25A36、SLC25A37、SLC25A38、SLC25A39、SLC25A40、 SLC25A41、SLC25A42、SLC25A43、SLC25A44、SLC25A45、SLC25A46 )、SLC25A47、SLC25A48、MTCH1(SLC25A49)、MTCH2(SLC25A50)、SLC25A51、SLC25A52、SLC25A53
26. 多機能陰イオン交換体^[32]
    • (SLC26A1、SLC26A2、SLC26A3、SLC26A4、SLC26A5、SLC26A6、SLC26A7、SLC26A8、SLC26A9、SLC26A10、SLC26A11)
27. 脂肪酸輸送タンパク質^[33]
    • ( SLC27A1、SLC27A2、SLC27A3、SLC27A4、SLC27A5、SLC27A6 )
28. Na+共役ヌクレオシド輸送^[34]
    • ( SLC28A1、SLC28A2、SLC28A3)
29. 促進性ヌクレオシドトランスポーター^[35]
    • ( SLC29A1、SLC29A2、 SLC29A3 、SLC29A4 )
30. 亜鉛トランスポーター^[36]
    • ( SLC30A1、SLC30A2、SLC30A3、SLC30A4、SLC30A5、SLC30A6 、SLC30A7 、 SLC30A8、SLC30A9、SLC30A10 )
31. 銅輸送体^[37]
    • ( SLC31A1、SLC31A2 )
32. 小胞阻害アミノ酸トランスポーター^[38]
    • ( SLC32A1 )
33. アセチルCoAトランスポーター^[39]
    • ( SLC33A1 )
34. II型Na+-リン酸共輸送体^[40]
    • ( SLC34A1、SLC34A2、SLC34A3 )
35. ヌクレオチド糖輸送体^[41]
    • サブファミリー A ( SLC35A1、SLC35A2、 SLC35A3 、 SLC35A4 、 SLC35A5 )
    • サブファミリーB (SLC35B1、SLC35B2、SLC35B3、SLC35B4 )
    • サブファミリーC ( SLC35C1、SLC35C2 )
    • サブファミリーD (SLC35D1、SLC35D2、SLC35D3)
    • サブファミリー E (SLC35E1、SLC35E2A、SLC35E2B、SLC35E3、SLC35E4)
    • サブファミリー F ( SLC35F1、 SLC35F2 、 SLC35F3 、 SLC35F4 、 SLC35F5 )
    • サブファミリー G (SLC35G1、SLC35G3、SLC35G4、SLC35G5、SLC35G6)
36. プロトン結合アミノ酸トランスポーター^[42]
    • ( SLC36A1、SLC36A2、SLC36A3、SLC36A4)
37. 糖リン酸/リン酸交換体^[43]
    • ( SLC37A1、SLC37A2、SLC37A3、SLC37A4 )
38. システムAとN、ナトリウム結合型中性アミノ酸トランスポーター^[44]
    • ( SLC38A1、SLC38A2、SLC38A3、SLC38A4、SLC38A5、SLC38A6、SLC38A7、SLC38A8、SLC38A9、SLC38A10、SLC38A11)
39. 金属イオントランスポーター^[45]
    • ( SLC39A1、SLC39A2、SLC39A3、SLC39A4、SLC39A5、SLC39A6 、 SLC39A7 、 SLC39A8 、SLC39A9、SLC39A10、SLC39A11、SLC39A12、SLC39A13、SLC39A14)
40. 基底外側鉄トランスポーター^[46]
    • ( SLC40A1 )
41. MgtE様マグネシウムトランスポーター
    • ( SLC41A1、 SLC41A2 、SLC41A3 )
42. アンモニアトランスポーター^{[47] [48]}
    • ( RHAG(SLC42A1)、RHBG(SLC42A2)、RHCG(SLC42A3) )
43. Na+非依存性、システムL様アミノ酸トランスポーター
    • ( SLC43A1、SLC43A2、SLC43A3)
44. コリン様トランスポーター
    • ( SLC44A1、SLC44A2、 SLC44A3 、SLC44A4、 SLC44A5 )
45. 推定糖輸送体
    • ( SLC45A1、SLC45A2、SLC45A3、SLC45A4 )
46. 葉酸トランスポーター
    • ( SLC46A1、 SLC46A2 、SLC46A3 )
47. 多剤および毒素の排出
    • ( SLC47A1、SLC47A2 )
48. ヘムトランスポーターファミリー
    • （SLC48A1）
49. ヘムトランスポーター
    • ( FLVCR1(SLC49A1)、FLVCR2(SLC49A2)、 SLC49A3、 SLC49A4)
50. SWEETファミリーの糖排出トランスポーター
    • ( SLC50A1 )
51. ステロイド由来分子の輸送体
    • ( SLC51A、SLC51B )
52. リボフラビントランスポーターファミリー RFVT/SLC52
    • (SLC52A1、SLC52A2、SLC52A3 )
53. リン酸キャリア
    • ( XPR1(SLC53A1)
54. ミトコンドリアピルビン酸キャリア
    • ( MPC1 (SLC54A1)、MPC2 (SLC54A2)、 MPC1L(SLC54A3))
55. ミトコンドリア陽イオン/陽子交換体
    • ( LETM1 (SLC55A1)、LETM2(SLC55A2)、LETMD1 (SLC55A3))
56. シデロフレキシン
    • ( SFXN1(SLC56A1)、SFXN2(SLC56A2)、SFXN3(SLC56A3)、SFXN4(SLC56A4)、SFXN5(SLC56A5))
57. NiPA様マグネシウムトランスポーターファミリー
    • ( NIPA1(SLC57A1)、NIPA2(SLC57A2)、NIPAL1(SLC57A3)、NIPAL2(SLC57A4)、NIPAL3(SLC57A5)、NIPAL4 (SLC57A6))
58. MagT 様マグネシウムトランスポーターファミリー
    • ( MAGT1(SLC58A1)、TUSC3(SLC58A2 ))
59. ナトリウム依存性リゾホスファチジルコリン共輸送体ファミリー
    • ( MFSD2A (SLC59A1)、MFSD2B(SLC59A2))
60. グルコーストランスポーター
    • ( MFSD4A (SLC60A1)、MFSD4B(SLC60A2))
61. モリブデン酸トランスポーターファミリー
    • （MFSD5（SLC61A1））
62. ピロリン酸トランスポーター
    • （アンク（SLC62A1））
63. スフィンゴシンリン酸トランスポーター
    • (SPNS1(SLC63A1)、SPNS2 (SLC63A2)、SPNS3(SLC63A3))
64. ゴルジ体Ca2+/H+交換輸送体
    • ( TMEM165 (SLC64A1))
65. NPC型コレステロールトランスポーター
    • ( NPC1(SLC65A1)、 NPC1L1(SLC65A2))
66. カチオン性アミノ酸輸出体
    • (SLC66A1、SLC66A2、SLC66A3、CTNS(SLC66A4)、MPDU1 (SLC66A5))

推定SLCは非定型SLCとも呼ばれ、既知のSLCと祖先的背景を共有する、新規で妥当な二次活性または促進性トランスポータータンパク質です。^{[2] [49]}しかし、MFS型の非定型SLCは15の推定MFSトランスポーターファミリー（AMTF）に分類できます。^[49]

推定上の SLC はすべて、妥当な SLC トランスポーターです。命名法に関しては「非典型的」なものもあります。遺伝子には SLC が割り当てられていますが、これは別名であり、すでに割り当てられている「非 SLC」遺伝子シンボルが承認シンボルとして保持されています。

ここにいくつかの推定SLCを挙げる：OCA2、CLN3、TMEM104、SPNS1、SPNS2、SPNS3 、SV2A 、 SV2B、SV2C、SVOP、SVOPL、MFSD1、^[50] MFSD2A、MFSD2B、MFSD3、^[50] MFSD4A、^[51] MFSD4B、MFSD5、^[52] MFSD6、MFSD6L、MFSD8、MFSD9、^[51] MFSD10、MFSD11、^[52] MFSD12、MFSD13A、MFSD14A、^[53] MFSD14B、^[53] UNC93A ^{[54] [55]}およびUNC93B1。

SLC テーブル。SLCtables

• 家族の概要
• 溶質キャリアファミリーのデータセットと試薬
• HGNCウェブサイトのタンパク質リスト