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| SLC24A5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| エイリアス | SLC24A5、JSX、NCKX5、OCA6、SHEP4、溶質キャリアファミリー24メンバー5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム：609802; MGI : 2677271;ホモロジーン：18400;ジーンカード：SLC24A5; OMA :SLC24A5 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ナトリウム/カリウム/カルシウム交換輸送体5（NCKX5 ）は、溶質輸送体ファミリー24メンバー5（SLC24A5）としても知られ、ヒトではSLC24A5遺伝子によってコードされるタンパク質であり、自然な皮膚の色の変化に大きな影響を与えます。[5] NCKX5タンパク質は、カリウム依存性ナトリウム/カルシウム交換輸送体ファミリーのメンバーです。SLC24A5遺伝子の配列変異、特にNCKX5の位置111のアミノ酸をアラニンからトレオニンに変化させる非同義SNPは、皮膚の色素沈着の違いと関連しています。[6]
SLC24A5遺伝子由来のスレオニンまたはAla111Thr対立遺伝子（rs1426654 [7]）は、サハラ以南のアフリカ人と比較してヨーロッパ人の肌の色が薄い主な要因であることが示されており、ヨーロッパ人と西アフリカ人の平均的な肌の色の違いの25～40％を占めると考えられています。[5] [8]おそらく19,000年前に起源を持ち、最近5,000年以内にヨーロッパ人の祖先の選択の対象となり、 [9]現代のヨーロッパ人集団に固定されています。[10] [11] [12]これは約2,000年前に「アフリカへの回帰」移住を通じてコイサン人に導入され、他のほとんどのアフリカ人集団と肌の色が異なる原因の一部となっています。[13]
遺伝子
ヒトのSLC24A5遺伝子は、 15番染色体の長腕（q腕）の21.1番の位置、塩基対46,200,461から塩基対46,221,881までに位置している。[5]
タンパク質
NCKX5は43kDaのタンパク質で、メラノサイトのトランスゴルジネットワークに部分的に局在しています。NCKX5タンパク質を除去すると、ヒトおよびマウスのメラノサイトでのメラニン生成が阻害され、メラニン色素の生成が大幅に減少します。SLC24A5の非同義一塩基多型に対応する部位特異的変異誘発により、NCKX5のナトリウム-カルシウム交換活性に重要なNCKX5の残基（A111T）が変化します。[6]
肌の色への影響
SLC24A5 は、ヨーロッパ系人間の明るい肌の進化に重要な役割を果たしたようです。この遺伝子の色素沈着における機能は、ペットショップでよく見かけるこの魚の「ゴールデン」品種の原因遺伝子の位置クローニングの結果、ゼブラフィッシュで発見されました。国際ハップマッププロジェクトのデータベースにある、人間集団の遺伝的変異の証拠によると、「CEU」集団に代表されるヨーロッパ人は、111番目のアミノ酸がアラニンからトレオニンに変化した、 わずか 1 つのヌクレオチドが異なる2 つの主要な対立遺伝子を持っていました(略して「A111T」)。[5] [14] [15]
派生したスレオニン対立遺伝子（Ala111Thr 、 A111TまたはThr111とも呼ばれる）は、ヨーロッパ人のサンプルの98.7～100％を占め、祖先型またはアラニン型は、サハラ以南のアフリカ人、東アジア人、およびアメリカ先住民のサンプルの93～100％に見られました。この変異はSNP多型rs1426654であり、これは以前に祖先情報マーカーとしてランク付けされた3011の表形式のSNPの中で2番目であることが示されていました。SLC24A5のこの単一の変化は、サハラ以南のアフリカ人とヨーロッパ人の祖先の間の皮膚メラニン指数の差の25～38％を説明します。 [5]
SNP rs2470102は南アジア人の皮膚の色素沈着の変異に独立して影響を及ぼす。[16]
さらに、ヨーロッパ人の突然変異は、CEU HapMap集団における遺伝的変異の減少が最も大きい領域と関連しており、A111T突然変異がヨーロッパ人の祖先の集団における単一の最も大きな選択の対象である可能性を示唆している。[5]派生した対立遺伝子の選択は、必須栄養素であるビタミンDを生成するために日光が必要であることに基づいていると仮定されている。北緯では、日光が少なく、寒冷な気候のために体を覆う必要性が高く、ビタミンDの少ない食事が多いため、より明るい肌が生存に適している。[17]
スレオニンアレルの最も古いサンプルは、ジョージアのサツルブリア洞窟で発見された13,000年前のものである。 [18]このアレルは新石器時代初期にはアナトリアからウクライナ、イランまで広く分布していた。[19] [20] [21]
この対立遺伝子は、法医学調査で色素沈着を推定するために使用されるHIrisplex DNA検査システムの一部を形成します。[22] [23]
参照
参考文献
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さらに読む
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外部リンク
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- SLC24A5+タンパク質、+ヒト、米国国立医学図書館医学件名表(MeSH)