ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| SLC36A1 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | SLC36A1、Dct1、LYAAT1、PAT1、TRAMD3、溶質キャリアファミリー36メンバー1 |
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| 外部ID | オミム:606561; MGI : 2445299;ホモロジーン: 121860;ジーンカード:SLC36A1; OMA :SLC36A1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 11番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 11|11 B1.3 | 始める | 55,095,176 bp [2] |
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| 終わり | 55,127,156 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 小腸粘膜
- 十二指腸
- 小脳の右半球
- 回腸粘膜
- 海綿骨
- 三叉神経節
- 結腸粘膜
- 直腸
- 上腕二頭筋の腱
- S状結腸粘膜
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| | トップの表現 | - 上頸部神経節
- 脊髄神経節
- 腰椎神経節
- 視覚野
- 左結腸
- 小腸
- 骨髄間質
- 卵黄嚢
- 一次視覚野
- ランゲルハンス島
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- アミノ酸:プロトン共輸送活性
- L-プロリン膜トランスポーター活性
- 中性アミノ酸膜トランスポーター活性
- プロトン膜輸送活性
- L-アラニン膜トランスポーター活性
- グリシン膜輸送活性
- 共輸送体活性
- アミノ酸膜輸送活性
| | 細胞成分 |
- 膜の不可欠な構成要素
- 膜
- 細胞膜
- リソソーム膜
- 小胞体
- リソソーム
| | 生物学的プロセス |
- L-アラニン輸送
- プロトン膜輸送
- プロリン膜輸送
- イオン輸送
- プロリン輸送
- アミノ酸輸送
- グリシン輸送
- 中性アミノ酸輸送
- 膜輸送
- アミノ酸膜輸送
- 輸送
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001308150 NM_001308151 NM_078483 NM_001349740 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001295079 NP_001295080 NP_510968 NP_001336669 |
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| 場所 (UCSC) | 5 章: 151.44 – 151.49 Mb | 11 章: 55.1 – 55.13 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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プロトン結合アミノ酸トランスポーター1は、ヒトではSLC36A1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
この遺伝子は、真核生物特異的アミノ酸/オーキシンパーミアーゼ(AAAP) 1トランスポーターファミリーのメンバーをコードしています。コードされているタンパク質は、プロトン依存性の小さなアミノ酸トランスポーターとして機能します。この遺伝子は、染色体5q33.1上に関連するファミリーメンバーとともにクラスター化されています。[7]
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000123643 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000020261 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Boll M、Foltz M、Rubio - Aliaga I、Kottra G、Daniel H (2002 年 6 月)。「2 つの新規哺乳類電気発生性プロトン依存性アミノ酸共輸送体の機能的特徴」。J Biol Chem . 277 (25): 22966–73。doi : 10.1074/ jbc.M200374200。PMID 11959859。
- ^ Sagne C, Agulhon C, Ravassard P, Darmon M, Hamon M, El Mestikawy S, Gasnier B, Giros B (2001 年 6 月). 「小さな中性アミノ酸のリソソーム輸送体の同定と特徴付け」Proc Natl Acad Sci USA . 98 (13): 7206–11. Bibcode :2001PNAS...98.7206S. doi : 10.1073/pnas.121183498 . PMC 34647 . PMID 11390972.
- ^ ab "Entrez Gene: SLC36A1 溶質キャリア ファミリー 36 (プロトン/アミノ酸共輸送体)、メンバー 1"。
さらに読む
- Hartley JL、Temple GF、Brasch MA (2001)。「In Vitro 部位特異的組換えを用いた DNA クローニング」。Genome Res . 10 (11): 1788–95. doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948 . PMID 11076863。
- Wiemann S、Weil B、Wellenreuther R、他 (2001)。「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログに向けて:ヒトcDNAをコードする新規完全タンパク質500種の配列決定および分析」。Genome Res . 11 (3): 422–35. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166 。
- Simpson JC、Wellenreuther R、Poustka A、et al. (2001)。「大規模cDNAシーケンシングによって同定された新規タンパク質の系統的細胞内局在」。EMBO Rep . 1 (3): 287–92. doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614 。
- Chen Z、Fei YJ、Anderson CM、他 (2003)。「ヒト腸管細胞株 Caco-2 におけるプロトン結合アミノ酸トランスポーター (hPAT1) の構造、機能および免疫局在」。J . Physiol . 546 ( Pt 2): 349–61。doi :10.1113/ jphysiol.2002.026500。PMC 2342508。PMID 12527723。
- Wreden CC、Johnson J、Tran C、他 (2003)。「H+ 結合型電気発生性リソソームアミノ酸トランスポーター LYAAT1 は海馬ニューロンの軸索と細胞膜に局在する」。J . Neurosci . 23 (4): 1265–75. doi :10.1523/JNEUROSCI.23-04-01265.2003. PMC 6742289. PMID 12598615 。
- Boll M、Foltz M、Rubio-Aliaga I、Daniel H (2004)。「ヒトおよびマウスゲノムにおけるプロトン/アミノ酸トランスポーター遺伝子のクラスター」。ゲノミクス。82 ( 1): 47–56。doi : 10.1016 /S0888-7543(03)00099-5。PMID 12809675 。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Bermingham JR、Pennington J (2004)。「アミノ酸トランスポーター遺伝子のSLC36クラスターの構成と発現」。Mamm . Genome . 15 (2): 114–25. doi :10.1007/s00335-003-2319-3. PMID 15058382. S2CID 21418124.
- Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). 「ORFeome から生物学へ: 機能ゲノミクスパイプライン」Genome Res . 14 (10B): 2136–44. doi :10.1101/gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336 .
- Anderson CM、Grenade DS、Boll M、他 (2004)。「H+/アミノ酸トランスポーター1 (PAT1) はイミノ酸キャリアー: ヒトおよびラットの腸管栄養素/薬物トランスポーター」。消化 器病学。127 (5): 1410–22。doi : 10.1053/ j.gastro.2004.08.017。PMID 15521011。
- Anderson CM、Thwaites DT (2005)。「腸管H+結合アミノ酸トランスポーターhPAT1(SLC36A1)の間接的調節」。J . Cell. Physiol . 204(2):604–13。doi : 10.1002 /jcp.20337。PMID 15754324。S2CID 31443973 。
- Abbot EL、Grenade DS、Kennedy DJ、他 (2006)。「ヒト腸管上皮 (Caco-2) 刷子縁膜を介したビガバトリンの輸送は、H+ 結合アミノ酸トランスポーター hPAT1 を介して行われる」。Br . J. Pharmacol . 147 (3): 298–306. doi :10.1038/sj.bjp.0706557. PMC 1751303. PMID 16331283 。
- Mehrle A、Rosenfelder H、 Schupp I 、他 (2006)。「2006 年の LIFEdb データベース」。Nucleic Acids Res . 34 (データベース号): D415–8。doi : 10.1093/nar/gkj139。PMC 1347501。PMID 16381901。
- Kuan YH、Gruebl T、Soba P、et al. (2007)。「PAT1a はアミロイド前駆体タンパク質 (APP)、APLP1、および APLP2 の細胞内輸送と処理を調節する」。J . Biol. Chem . 281 (52): 40114–23。doi : 10.1074/ jbc.M605407200。PMID 17050537。
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