ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| SLC50A1 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | SLC50A1、HsSWEET1、RAG1AP1、SCP、SWEET1、slv、溶質キャリアファミリー50メンバー1 |
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| 外部ID | オミム:613683; MGI : 107417;ホモロジーン: 40647;ジーンカード:SLC50A1; OMA :SLC50A1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体3(マウス)[2] |
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| | バンド | 3 F1|3 39.04 cM | 始める | 89,175,553 bp [2] |
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| 終わり | 89,177,877 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 横行結腸粘膜
- 直腸
- 膵臓の体
- 右副腎
- ランゲルハンス島
- 右副腎皮質
- 左副腎
- 肝臓の右葉
- ベータ細胞
- 左副腎皮質
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| | トップの表現 | - 足首関節
- 一次視覚野
- 上前頭回
- 回腸上皮
- リップ
- ランゲルハンス島
- 頸動脈小体
- 胃の上皮
- 右腎臓
- 耳下腺
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- 核
- ゴルジ膜
- 膜
- 膜の不可欠な構成要素
- ゴルジ体
- 内膜系
- 細胞膜
| | 生物学的プロセス |
- 炭水化物輸送
- 転写能のある構造におけるクロマチンのエピジェネティックな維持
- グルコシド輸送
- ヘキソース膜輸送
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_001122837 NM_001122839 NM_001287586 NM_001287587 NM_001287588
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NM_001287589 NM_001287590 NM_001287591 NM_001287592 NM_018845 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_001116309 NP_001116311 NP_001274515 NP_001274516 NP_001274517
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NP_001274518 NP_001274519 NP_001274520 NP_001274521 NP_061333 |
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| 場所 (UCSC) | 1 章: 155.14 – 155.14 Mb | 3 章: 89.18 – 89.18 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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糖トランスポーターSWEET1は、 RAG1活性化タンパク質1や間質細胞タンパク質(SCP )としても知られ、ヒトではSLC50A1遺伝子によってコードされる膜タンパク質です。[5] SWEET1は、7つのトランスポーターを持つ線虫Caenorhabditis elegansを除くほとんどの動物種のゲノムに存在するSLC50(SWEET)遺伝子ファミリーからの唯一のトランスポーターです。[6]
SWEET1は広く発現しているグルコーストランスポーターである。[6] SWEETファミリーは比較的最近同定されたため、動物におけるその機能の全範囲はまだ明らかではない。[7]しかし、ウシのSLC50A1ホモログは牛乳中のラクトース濃度と関連しており、[8]ホヤのCiRGAホモログは胚発生中の組織分化、特に脊索の発達に不可欠である。 [ 9 ] SWEET
遺伝子は植物ゲノムに共通しており、約20のパラログ[6]がショ糖とヘキソースの両方のトランスポーターとして機能し、病原体感受性にも関連している。[6] [10]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000169241 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000027953 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「Entrez Gene: 溶質輸送体ファミリー 50 (糖排出輸送体)、メンバー 1」。
- ^ abcd Feng L, Frommer WB (2015). 「SemiSWEETおよびSWEET糖トランスポーターの構造と機能」.生化学の動向. 40 (8): 480– 486. doi : 10.1016/j.tibs.2015.05.005 . PMID 26071195.
- ^ Deng D, Yan N (2016). 「GLUT、SGLT、SWEET: グルコーストランスポーターの構造とメカニズムの調査」.タンパク質科学. 25 (3): 546– 558. doi :10.1002/pro.2858. PMC 4815417. PMID 26650681 .
- ^ Lopdell TJ、Tiplady K、Struchalin M、Johnson TJ、Keehan M、Sherlock R、Couldrey C、Davis SR、Snell RG、Spelman RJ、Littlejohn MD (2017)。「DNA および RNA 配列に基づく GWAS により、膜輸送遺伝子が牛乳のラクトース含有量の重要な調節因子として強調される」。BMC Genomics。18 ( 1 ) : 968。doi : 10.1186 / s12864-017-4320-3。PMC 5731188。PMID 29246110。
- ^ Hamada M, Wada S, Kobayashi K, Satoh N (2005). 「MtN3 /salivaファミリー膜貫通タンパク質をコードする遺伝子 Ci-Rga は、ホヤ類 Ciona intestinalis の胚発生中の組織分化に必須である」。分化。73 ( 7 ): 364– 376。doi :10.1111/j.1432-0436.2005.00037.x。PMID 16219040 。
- ^ Wright EM (2013). 「グルコース輸送ファミリーSLC5およびSLC50」.分子医学. 34 ( 2–3 ): 183–196 . doi :10.1016/j.mam.2012.11.002. PMID 23506865.
さらに読む
- Barnhill JC、Stokes AJ、Koblan-Huberson M、Shimoda LM、Muraguchi A、Adra CN、Turner H (2004 年 3 月)。「RGA タンパク質は生合成および輸送中に TRPV イオン チャネルと関連します」。Journal of Cellular Biochemistry。91 ( 4): 808– 20。doi : 10.1002/jcb.10775。PMID 14991772。S2CID 44629547 。
- Pankratz N、Beecham GW、DeStefano AL、Dawson TM、Doheny KF、Factor SA、Hamza TH、Hung AY、Hyman BT、Ivinson AJ、Krainc D、Latourelle JC、Clark LN、Marder K、Martin ER、Mayeux R、Ross OA、Scherzer CR、Simon DK、Tanner C、Vance JM、Wszolek ZK、Zabetian CP、Myers RH、Payami H、Scott WK、Foroud T (2012 年 3 月)。「パーキンソン病のメタ分析: 新規遺伝子座 RIT2 の特定」。Annals of Neurology。71 ( 3 ) : 370– 84。doi : 10.1002/ana.22687。PMC 3354734。PMID 22451204。
- Chen LQ, Hou BH, Lalonde S, Takanaga H, Hartung ML, Qu XQ, Guo WJ, Kim JG, Underwood W, Chaudhuri B, Chermak D, Antony G, White FF, Somerville SC, Mudgett MB, Frommer WB (2010 年 11 月). 「細胞間交換と病原体の栄養のための糖輸送体」. Nature . 468 (7323): 527– 32. Bibcode :2010Natur.468..527C. doi :10.1038/nature09606. PMC 3000469. PMID 21107422 .
- Tagoh H、Kishi H、Muraguchi A (1996 年 4 月)。「ヒトリンパ系前駆細胞における組換え活性化遺伝子 (RAG)-1 の遺伝子活性化を促進するタンパク質をコードする新規間質細胞由来 cDNA の分子クローニングと特性評価」。生化学および生物物理学的研究通信。221 (3): 744– 9。doi :10.1006/bbrc.1996.0667。PMID 8630032。