現代人類の最近のアフリカ起源

古人類学では、現代人の最近のアフリカ起源説、あるいは「出アフリカ」説（OOA）^[a]は、解剖学的に現代人のホモ・サピエンスの地理的起源と初期の移住に関する主流の学術的モデルである^{[1] [2] [3] 。この説は}、ホモ・エレクトス、次いでホモ・ネアンデルターレンシスによって成し遂げられた、アフリカからのホミニンの初期の拡大を追うものである。

このモデルは、分類学上の意味でホモ・サピエンスの「単一起源」を提唱しており、解剖学的に現代的であると考えられる特徴が他の地域で並行進化した可能性を排除しているが、^{[4]ヨーロッパやアジアで}ホモ・サピエンスと旧人類が複数回混合した可能性は排除していない。^{[b] [5] [6]}ホモ・サピエンスは、おそらく30万年前から20万年前にアフリカの角で発達したが、 ^{[7] [8]}別の仮説では、ホモ・サピエンスの多様な形態的特徴がアフリカのさまざまな地域で局所的に出現し、同時期にさまざまな集団間の遺伝子流動によって収束したと主張している。 ^{[9] [10] 「最近のアフリカ起源」モデルは、すべての現代の非アフリカ集団は、その時期以降にアフリカを離れた}ホモ・サピエンスの集団から実質的に派生したものであると提唱している。

現代人の「アフリカ外」拡散は少なくとも数回あり、おそらく27万年前には始まっており、21万5千年前には少なくともギリシャに拡散していた^{[11] [12] [13]}、また13万年から11万5千年前には北アフリカとアラビア半島を経由していたことは確かである^[20]。現代人が約8万年前に中国に到達していたという証拠がある^[21] 。これらの初期の波のほとんどが絶滅したか後退したようで、アフリカ以外の現代人は主に約7万～5万年前の単一の拡大から派生したもので、^{[22] [23] [24] [7] [8] [25] [26] [過剰な引用]、}いわゆる「南ルート」を経由している。これらの人類はアジア沿岸に沿って急速に広がり、約65,000～50,000年前までにオーストラリアに到達しました。 ^{[27] [28] [c]}（一部の研究者はオーストラリアでのより早い日付に疑問を呈し、人類の到着を早くても50,000年前としています。^{[29] [30]}一方、他の研究者は、これらのオーストラリアの最初の入植者は、より重要なアフリカからの移住の前の古い波を表している可能性があり、したがって必ずしもこの地域の後の住民の祖先ではないと示唆しています^[24]）。一方、ヨーロッパには、55,000年未満前に近東とヨーロッパに定住した初期の分派が住んでいました。^{[31] [32] [33]}

2010年代には、集団遺伝学の研究により、ユーラシア、オセアニア、アフリカでホモ・サピエンスと旧人類の間で交雑が起こったという証拠が発見され、 ^{[34] [35] [36]}現代の集団は主に初期のホモ・サピエンスに由来しているが、程度は低いものの、旧人類の地域的変異体の子孫でもあることが示唆された。

「最近のアフリカ起源」または「出アフリカ II」は、解剖学的に現代的な人類(ホモ・サピエンス) が約 30 万年から 20 万年前に出現した後、アフリカから移住したことを指し、「出アフリカ I」は 180 万年前以前から最大 50 万年前までの古代人類がアフリカからユーラシアに移住したことを指す。エチオピア南部のオモ・キビシュ I (オモ I)は、現在知られている最も古い解剖学的に現代的なホモ・サピエンスの骨格 (約 233,000 年前) である。^{[38]モロッコの}ジェベル・イルフードからは、約 315,000 年前の現代と古代の特徴が混在するさらに古いホモ・サピエンスの化石が発見されている。^[39]

21世紀初頭以来、「最近の単一起源」移住の図は、現代人と古代人の混合の発見と、「最近のアフリカ外移住」が長い期間にわたって波状に起こったという証拠の増加により、大幅に複雑化している。2010年時点では、初期の解剖学的に現代人のアフリカ外移住については、「北ルート」（ナイル渓谷とシナイ経由）とバブ・エル・マンデブ海峡経由の「南ルート」の2つの主要な分散ルートが認められている。^[40]

• ポストら（2017）は、ネアンデルタール人のミトコンドリアゲノムがデニソワ人よりもホモサピエンスに近いことから、初期のホモサピエンス、つまり「私たちと近縁のアフリカの別の種」が、約27万年前に初めてアフリカから移住した可能性があると示唆している。 [ ^41]

• 化石証拠もホモ・サピエンスの初期の移動を示唆しており、最も古い化石はギリシャのアピディマ洞窟で発見され、21万年前のものとされている。 ^[42]ミスリヤ洞窟で発見された8本の歯が付いた部分的な顎骨は、約18万5千年前のものとされている。同じ洞窟の25万年前から14万年前の地層にはルヴァロワ型の道具が含まれていたが、この道具が現代人の顎骨の発見と関連しているなら、最初の移動の時期はさらに早いものとなる可能性がある。^{[43] [44] [45]}

• 15万～13万年前に北東アフリカからアラビアへ東方へと拡散したという説は、ジェベル・ファヤで発見された12万7千年前の石器（2011年に発見）に基づいているが、この地域の化石証拠はそれよりかなり後の8万5千年前のものである。^{[14] [46]}この波に関連している可能性があるのは、中国南部の智人洞洞窟で発見された10万年以上前のものである。^[47]中国における現代人の存在を示す他の証拠は、8万年前のものとされている。^[21]

• アフリカからの最も重要な分散は、約5万～7万年前に、いわゆる南ルートを経由して起こった。これは、6万9千年前から7万7千年前に起こったトバ事件の前^[48]か後^{[32] [33]である。 [48]}この分散はアジアの南海岸に沿って進み、約6万5千～5万年前、あるいはいくつかの研究によれば早くても5万年前までにオーストラリアに到達した。^{[29] [30]}西アジアは、約5万年前にこの波とは異なる派生によって「再占領」され、約4万3千年前から西アジアからヨーロッパに人が移り住んだ。^[40]

• ウェルズ（2003）は、南の海岸ルートの後に、約45,000年前にヨーロッパへの北方への移動という追加の移動の波があったと説明しています。^[d]この可能性は、単一の海岸分散とヨーロッパへの初期の分岐を主張するマコーレーら（2005）とポストら（2016）によって否定されています。

135,000年前から、熱帯アフリカでは大規模な干ばつが発生し、人類は陸地から海岸へと追い出され、他の大陸へ渡ることを余儀なくされました。^{[49] [e]}

イスラエルのカフゼ洞窟とエスクル洞窟で初期のホモ・サピエンスの化石が発見され、8万～12万年前のものと年代が特定されている。^{[50] [51]}これらの人類は7万～8万年前に絶滅したか、アフリカに後退したとみられ、氷河期のヨーロッパの寒冷地域から南下したネアンデルタール人が代わりに現れた可能性がある。^[22] Hua Liuらは、約5万6千年前の常染色体マイクロサテライトマーカーを分析した。彼らは、この古生物学的化石をアフリカに後退した孤立した初期の分派であると解釈している。^[23]

2011年にアラブ首長国連邦のシャルジャのムレイハにあるファヤ1遺跡で石器が発見され、少なくとも12万5000年前に現代人が存在していたことが示され、^[14]「長い間無視されてきた」北アフリカルートの復活につながった。^{[15] [52] [16] [17]}アラビア人の拡散の役割に関するこの新しい理解は、考古学と遺伝学の研究結果から、アフリカからの人類の拡大の回廊として南アラビアの重要性が強調されたことを受けて変化し始めた。^[53]

オマーンでは、2011年にビエン・ジョベンによって、これまでスーダンの考古学的発掘調査でしか知られていなかった後期ヌビア複合体に属する石器の地表散乱が100点以上含まれた遺跡が発見された。2つの光刺激発光年代推定によると、アラビアのヌビア複合体は約106,000年前のものである。これは、海洋同位体ステージ5の初期頃、アラビア南部に独特の石器時代のテクノコンプレックスがあったことを示す証拠となる。^[54]

クールウィルムと共著者によると、ネアンデルタール人は 、約10万年前にアフリカ外で暮らしていた現代人に遺伝的に貢献した。現代人は約20万年前にすでに他の現代人から分岐しており、アフリカ外でのこの初期の現代人の波もアルタイネアンデルタール人に遺伝的に貢献した。[ ^{55]彼らは、「}アルタイ山脈のネアンデルタール人の祖先と初期現代人は、おそらく近東で、これまで考えられていたよりも何千年も早く出会い、交配した」ことを発見した。^[55]共著者のイラン・グロナウによると、「これは、約10万年前以前にアフリカから初期現代人が存在したという考古学的証拠を補完するものであり、そのような集団の最初の遺伝的証拠を提供するものである」。^[55]同様の遺伝的混合イベントは他の地域でも確認されている。 ^[56]

約5万～7万年前までに、ミトコンドリアハプログループL3の保有者の一部が東アフリカから近東に移住した。アフリカの人口2,000～5,000人のうち、紅海を渡ったのはおそらく150～1,000人ほどの小さな集団だけだったと推定されている。^{[57] [58]紅海を渡った集団は、}アラビアとペルシャ高原を回る海岸沿いのルートを通ってインドに至り、インドが最初の主要な定住地であったと思われる。^[59]ウェルズ（2003）は、約250キロメートル（155マイル）にわたるアジア南部の海岸線に沿ったルートを主張し、約5万年前までにオーストラリアに到達したとしている。

今日、バブ・エル・マンデブ海峡では紅海の幅は約20キロメートル（12マイル）ですが、5万年前は海面が70メートル（230フィート）低く（氷河作用のため）、水路ははるかに狭かったです。海峡は完全に閉鎖されたことはありませんでしたが、簡単ないかだを使って渡れるほど狭く、間に島があった可能性があります。^{[40] [60]}エリトリアでは12万5000年前の貝塚が発見されており、^[61]初期の人類の食事には海岸での漁で得られた魚介類が含まれていたことが示されています。

南方拡散の年代は議論の的となっている。^[48]これは、69,000年から77,000年前にインドネシアのスマトラ島にある現在のトバ湖の場所で起きた壊滅的な火山噴火であるトバ火山の噴火の前後に起こった可能性がある。インドで堆積した灰の層の下で発見された石器は、トバ火山以前の拡散を示している可能性があるが、その出所は議論の的となっている。^[48]トバ火山以後の拡散の兆候として、ハプログループL3が挙げられ、これは人類がアフリカから拡散する前に発生し、60,000年から70,000年前に遡ることができるため、「人類がトバ火山の数千年後にアフリカを去ったことを示唆している」。^[48] 2012年には、ヒトDNAの遺伝子変異が予想よりも遅いことを示す研究が発表され、移住の年代が90,000年から130,000年前と修正されたことが示唆されている。^[62]最近の研究では、現代の非アフリカ人の祖先が約5万～6万5千年前にアフリカから移住したと示唆されており、これまでの推定とほぼ同じである。^{[24] [63] [64]}

イスラエルのカフゼー洞窟とエスクル洞窟で発見された8万～12万年前の化石に続き、イスラエルのマノット洞窟で発見された5万4700年前のマノット1化石まで、レバント地方にはホモ・サピエンスの化石は見つかっていないが^[65] 、この年代はグルーカットら（2015）によって疑問視されている。レバント地方で現代人と確実に関連付けることができる化石や石器産業が存在しないことから、現代​​人は約5万5000年前までネアンデルタール人に競争で負けていたとされ、北ルートを通る現代人のアフリカからの拡散にネアンデルタール人が障壁を設けていたと考えられる。^{[66] [検証に失敗した]}気候再構築も現代人の南ルート拡散を支持しており、アフリカからの大規模な人類拡散の際、バブ・エル・マンデブ海峡はレバントへの北陸橋よりも人類の移動に適した気候を経験した。^[67]

2023年の研究では、ユーラシア人とアフリカ人は約10万年前に遺伝的に分岐したと提唱されている。主なユーラシア人はその後、少なくとも8万5千年前から遺伝的に隔離されたサウジアラビア半島に住み、5万4千年前に北に拡大した。参考までに、ホモ・サピエンスとネアンデルタール人は約50万年前に分岐した。^[68]

オーストラリアには6万5000～5万年前に人が住んでいたと考えられている。2017年現在、オーストラリアにおける人類の最も古い証拠は少なくとも6万5000年前のものである^{[27] [28]。}一方、マクチェスニーは次のように述べている。

...遺伝学的証拠は、マーカーM168を持つ小さな集団がアフリカからアラビア半島とインドの海岸に沿ってインドネシアを経由して移住し、6万年から5万年前の非常に早い時期にオーストラリアに到達したことを示唆しています。このオーストラリアへの非常に早い移住は、ラスムッセンら（2011）によっても支持されています。^[31]

オーストラリアのマンゴ湖の化石は約42,000年前のものとされている。^{[69] [70]}マジェドベベと呼ばれる場所から発見された他の化石は少なくとも65,000年前のものとされているが、^{[71] [72]}一部の研究者はこの初期の推定に疑問を抱き、マジェドベベの化石は最も古いもので約50,000年前のものとしている。^{[29] [30]}

系統発生データによれば、初期の東ユーラシア人（東部非アフリカ人）のメタ集団が南アジア東部のどこかで三分岐し、オーストラロ・パプア人、古代祖先南インド人（AASI）、東アジア/東南アジア人が生まれたが、パプア人はさらに初期のグループ（xOoA）から約2％の遺伝子流入を受けていた可能性があり、^[73]サフル地域での追加の古代混合の次に。^{[74] [75]}

ある研究によると、パプア人は東ユーラシア人の系統と西アジア人および東アジア人の基底系統の混合から形成されたか、または東アジア人の姉妹系統として形成された可能性があり、その系統にはOoAまたはxOoAのわずかな基底的寄与があるか、またはない可能性がある。^[76]

南スラウェシ島 から採取された完新世の狩猟採集民のサンプル（Leang_Panninge）は、遺伝的に東ユーラシア人とオーストラリアパプア人の中間にあることがわかった。サンプルは、約50％がパプア人関連、約50％が基底東アジア人関連（アンダマン諸島オンゲまたはティアンユアン）としてモデル化できる。著者らは、基底東アジア人の祖先ははるかに広範囲に広がっており、島嶼東南アジアとオセアニアの人々の居住はこれまで予想されていたよりも複雑だったと結論付けた。^{[77] [78]}

中国では、柳江人（中国語：柳江人）が東アジアで発見された最古の現代人の一人である。^[79]最も一般的にその化石の年代とされているのは67,000年前である。^[80]さまざまな研究者が実施したさまざまな年代測定技術によってもたらされた大きな変動率により、最も広く受け入れられている年代範囲は67,000年前からとされているが、159,000年前という年代も排除されていない。^[80] Liu、Martinón-Torresら（2015）は、中国で少なくとも80,000年前の現代人の歯が発見されていると主張している。^[81]

中国の天元人は38,000年から42,000年前のものと推定され、同じ地域の劉江人は67,000年から159,000年前のものと推定される。2013年のDNA検査によると、天元人は「現代の多くのアジア人やアメリカ先住民」と関連がある。^{[82] [83] [84] [85] [86]}天元人は形態的に劉江人、日本で発見された縄文時代の現代人、現代の東アジア人や東南アジア人と類似している。^{[87] [88] [89]}

2021年に行われた東ユーラシアの人口史に関する研究では、独特の基底東アジア（東ユーラシア）祖先は紀元前5万年頃に南ヒマラヤのルートから東南アジア大陸に起源を持ち、南と北への複数の移住の波を経て拡大したと結論付けられました。 ^[90]

遺伝子研究の結果、アメリカ先住民は、約 36,000 年前に東南アジア本土のアジア東部基底集団から分岐した単一の創始集団の子孫であると結論付けられました。これは、本来の縄文人がアジア東部基底集団から分岐した時期と同時期で、祖先アメリカ先住民と共に、または別の拡大波の間に分岐した時期です。また、他のすべての先住民が属するアメリカ先住民の基底北部および南部の支流は、約 16,000 年前に分岐したことも示されています。^{[91] [92]紀元前16,000年の}アイダホ州の先住民のサンプルは、頭蓋計測学的には現代のアメリカ先住民や古シベリア人と類似しており、主に東ユーラシア人の祖先を持ち、現代の東アジア人や日本の縄文時代のサンプルと高い類似性を示し、祖先アメリカ先住民が東シベリアの東ユーラシア人の起源集団から分岐したことを裏付けている。^[93]

Macaulay et al. (2005) によると、ハプログループ N の南方拡散からの初期の分岐は、東アフリカからナイル川に沿って北上し、シナイを経由してアジアに渡った。このグループはその後分岐し、一部はヨーロッパに移動し、他の一部は東のアジアに向かった。^[32]この仮説は、現代人がヨーロッパに到着した時期が比較的遅いこと、および考古学的証拠と DNA 証拠によって裏付けられている。^[32]狩猟採集民の 55 人のヒトミトコンドリアゲノム (mtDNA) の分析に基づき、Posth et al. (2016) は「55,000 年前未満にすべての非アフリカ人が急速な単一の拡散を起こした」と主張している。45,000 年前までに、現代人は北西ヨーロッパに到達していたことが知られている。^[94]

ミトコンドリア・イブから分岐した最初の系統はL0である。このハプログループは南アフリカのサン族と東アフリカのサンダウェ族に多く見られる。また、ムブティ族にも見られる。^{[95] [96]}これらのグループは人類の歴史の初期に分岐し、それ以来比較的遺伝的に孤立したままである。ハプログループL1、L2、L3はL1～L6の子孫であり、主にアフリカに限定されている。アフリカ以外の世界の系統であるマクロハプログループMとNはL3の子孫である。L3は約7万年前のものであり、ハプログループMとNは約6万5千～5万5千年前のものである。 ^{[97] [64]}このような遺伝子ツリーと人口動態史の関係は、分散に適用するとまだ議論されている。^[98]

アフリカに存在するすべての系統のうち、ミトコンドリアDNAハプログループL3の1つの系統のみの女性の子孫がアフリカ外で発見されている。複数回の移住があった場合、複数の系統の子孫が見つかることが予想される。L3の女性の子孫であるMおよびNハプログループ系統は、アフリカで非常に低い頻度で発見されており（ハプログループM1の集団は非常に古く、北アフリカと北東アフリカで多様化しているが）、比較的最近到着したと思われる。^{[要出典]考えられる説明としては、これらの突然変異が大移動の直前に東アフリカで発生し、}創始者効果によってその後支配的なハプログループになったというものである。あるいは、突然変異はその後すぐに発生した可能性がある。

オラン・アスリと呼ばれるマレーシア先住民から採取されたmtDNAの結果は、ハプログループMとNが約85,000年前の元のアフリカのグループと特徴を共有し、約65,000年前にアフリカの祖先から分散して分かれたオーストラレーシア、インド亜大陸、大陸アジア全体などの東南アジア沿岸地域で見つかったサブハプログループと特徴を共有していることを示している。この南部沿岸の分散は、約45,000年前のレバントを通る分散よりも前に発生したと思われる。^{[32]この仮説は、ハプログループNがヨーロッパで優勢であり、ハプログループMがヨーロッパに存在しない理由を説明しようとするものである。沿岸部への移住の証拠は、}完新世の海面上昇によって破壊されたと考えられている。^[99]あるいは、当初ハプログループMとNを発現していた小さなヨーロッパの創始者集団が、ボトルネック（すなわち創始者効果）に起因するランダムな遺伝的漂流によってハプログループMを失った可能性もある。

紅海を渡ったグループは、アラビアとペルシャを回って海岸沿いのルートを旅し、インドに到達した。^[59] ハプログループMは、パキスタンとインドの南部沿岸地域で高頻度に見られ、インドで最も多様性が高いことから、突然変異が起こったのはこの場所である可能性が高い。^[59]インド人口の60%はハプログループMに属している。アンダマン諸島の先住民もM系統に属している。アンダマン人は、長い間本土から隔離されていたため、アジア最古の居住者の一部から派生したと考えられている。彼らは、インドからタイ、インドネシアを経てニューギニア東部にまで広がる初期移住者の海岸ルートの証拠である。 M はニューギニアの高地住民に高頻度に見られ、アンダマン人とニューギニア人は黒い肌とアフロ風の髪質であることから、一部の科学者は、彼らはすべて、約 6 万年前に紅海を渡って大海岸移住で出発した同じ移住者の波の一部であると考えています。ハプログループ M の割合は、アラビアからインドにかけて東に向かうにつれて増加します。インド東部では、M が N を 3:1 の比率で上回っています。東南アジアに渡ると、ハプログループ N (主に R サブクレードの派生型の形で) が優勢な系統として再び現れます。^{[出典が必要]} M は東アジアで優勢ですが、オーストラリア先住民の間では、N がより一般的な系統です。^{[出典が必要]ヨーロッパからオーストラリアにかけてのハプログループ N のこの無秩序な分布は、}創始者効果と人口ボトルネックによって説明できます。^[100]

2002年に行われたアフリカ人、ヨーロッパ人、アジア人の研究では、アフリカ人の方がユーラシア人よりも遺伝的多様性が高く、ユーラシア人の遺伝的多様性は主にアフリカ人のサブセットであることがわかり、アフリカ起源モデルを裏付けています。^{[102] Coop}らによる大規模な研究（2009年）では、アフリカ以外での常染色体DNAの自然選択の証拠が見つかりました。この研究では、非アフリカ系スイープ（特に肌の色に関連するKITLGバリアント）、西ユーラシア系スイープ（SLC24A5）、東アジア系スイープ（肌の色に関連するMC1R）を区別しています。この証拠に基づき、研究では、人類集団はアフリカから拡大するにつれて新たな選択圧に遭遇したと結論付けています。^[103] MC1Rと肌の色との関係については、Hardingら（2000年）ですでに議論されていました。 1355。この研究によると、パプアニューギニア人は肌の色が濃いことに対する選択にさらされ続けたため、これらのグループは他の場所のアフリカ人とは異なっているものの、現代のアフリカ人、アンダマン人、ニューギニア人が共有する肌の色の濃い対立遺伝子は古いものである。Endicottら（2003）は収斂進化を示唆している。Gurdasaniらによる2014年の研究では、アフリカの遺伝的多様性の高さは、比較的最近のユーラシア人の移住によってアフリカの一部の地域でさらに増加し​​たことが示されている。^[104]

ヒトの遺伝的系譜を再構築するもう一つの有望な方法は、 JCウイルス（JCV）を介する方法です。JCVはヒトポリオーマウイルスの一種で、ヒトの70～90％が保有し、通常は親から子へと垂直に伝染するため、ヒト集団との共分岐を示唆しています。このため、JCVは人類の進化と移住の遺伝マーカーとして使用されてきました。^[105]この方法は、アフリカからの移動については信頼性が低いようです。ヒトの遺伝学とは対照的に、アフリカ集団に関連するJCV株は基底的ではありません。このことから、Shackeltonら（2006）は、JCVの基底的なアフリカ株が絶滅したか、JCVによる最初の感染がアフリカからの移動より後のものであると結論付けています。

2010年代に、アフリカの外で古代人類（ホモ・ハイデルベルゲンシスの子孫）が現代人と交配した証拠が発見された。これは主に、サハラ以南アフリカ人を除くすべての現代人集団におけるネアンデルタール人の混血に関するものだが、オーストラレーシアにおけるデニソワ人ホミニンの混血（メラネシア人、オーストラリア先住民、一部のネグリト人）の証拠も提示されている。 ^[106] 2017年時点でのヨーロッパ人とアジア人のネアンデルタール人の混血率は約2～3％と推定されている。^[107]

2011年、サハラ以南アフリカの狩猟採集民集団（ビアカ・ピグミー族とサン族）の一部で、約70万年前に現代人の系統から分岐した古代人類に由来する古代混血が発見された。混血率は2％と推定された。 ^[36] 2012年には、ピグミー族、ハッザ族、サンダウェ族の5つの部族で、さらに古い分岐時代の古代人類（推定120万～130万年前）からの混血が発見された。^{[108] [35]}

ムチン7は、アフリカの集団に特有の、約450万年前に他の変異体と融合したと推定される非常に異なるハプロタイプであり、アフリカの現代人と古代人の交配から派生したと推測されています。^[109]

2020年に発表された研究によると、西アフリカのヨルバ族とメンデ族のゲノムの2％から19％は、現代人とネアンデルタール人やデニソワ人の祖先が分岐する前に分岐したと思われる、まだ特定されていない古代人類集団に由来していることが判明しました。^[110]

ペトラリアらは、遺伝子分析に加えて、インド亜大陸の小型石器（微石器）も調査し、古環境の復元に基づいて人口の拡大を説明した。彼は、南アジアでは石器の年代は35kaと推定され、新しい技術は環境の変化と人口圧力によって影響を受けた可能性があると提案した。^[111]

人間とアフリカの類人猿の分岐関係は、ロンドン動物園に展示されていたアフリカの類人猿の行動を研究した後、チャールズ・ダーウィンによって提唱された。^[113]解剖学者トーマス・ハクスリーもこの仮説を支持し、アフリカの類人猿は人間と進化的に密接な関係にあると示唆した。^{[114]これらの見解は、アジア起源説を主張していたドイツの生物学者}エルンスト・ヘッケルによって反対された。ヘッケルは、人間は東南アジアの霊長類とより近い関係にあると主張し、ダーウィンのアフリカ仮説を否定した。^{[115] [116]}

ダーウィンは『人間の由来』の中で、人間は類人猿の子孫であると推測した。類人猿は脳は小さいが直立歩行し、手を自由に使えるため知能を高めることができた。彼はそのような類人猿はアフリカの類人猿だと考えた。

世界のそれぞれの大地域では、現生の哺乳類は同じ地域の絶滅種と近縁である。したがって、かつてアフリカにはゴリラやチンパンジーに近い絶滅した類人猿が生息していた可能性が高い。そして、これら 2 つの種は現在では人間の最も近い仲間であるため、私たちの初期の祖先が他の場所よりもアフリカ大陸に住んでいた可能性がいくらか高い。しかし、この主題について推測するのは無意味である。なぜなら、人間とほぼ同じ大きさの類人猿、すなわち擬人化されたヒロバテスに近いラルテットのドリュオピテクスが、後期中新世のヨーロッパに存在していたからである。そして、これほど遠い時代以来、地球は確かに多くの大きな革命を経験しており、最大規模の移住を行うのに十分な時間があった。

— チャールズ・ダーウィン『人間の由来』^[117]

1871 年には、古代人類の化石はほとんど見つからなかった。それからほぼ 50 年後、人類学者がアフリカのいくつかの地域で古代の小脳人類の化石を発見し始めたとき、ダーウィンの推測は裏付けられた (人類の化石の一覧)。最近の(古代の ではなく) アフリカ起源の仮説は20 世紀に発展した。現代人の「最近のアフリカ起源」は「単一の起源」(単一起源) を意味し、多元説の反意語としてさまざまな文脈で使用されている。人類学における議論は 20 世紀半ばまでに単一起源説を支持する方向に傾いた。20 世紀半ばには、カールトン・クーンのような孤立した多元説の支持者が主張した。彼は 1962 年になっても、ホモ・サピエンスは5 か所でホモ・エレクトスから 5 回発生したと考えていた。 ^[118]

最近起源モデルに対する歴史的な代替案は、1980年代にミルフォード・ウォルポフによって最初に提唱された現代人の多地域起源である。この見解は、180万年前の更新世の初めにホモ・エレクトスから解剖学的に現代的な人類集団が派生したが、これは連続した世界集団の中で起こったと提唱している。この仮説は必然的に、古代ユーラシアとアフリカのホモ・エレクトス集団の間に不妊の壁があったという仮定を否定する。この仮説は1980年代後半から1990年代にかけて物議を醸した。^[119]現在使用されている「最近起源」および「アフリカ起源」という用語が使用されるようになったのは、1990年代のこの議論の文脈においてである。^[120]もともと、多地域仮説は、最近の起源モデルとは対照的な代替案とみなされていたが、その元の「強い」形態では時代遅れであり、そのさまざまな修正された弱い変種は、古い混合と組み合わされた「最近の起源」の見解の変種となっている。^[121]ストリンガー（2014）は、元の、または「古典的な」多地域モデルを1984年（その定式化）から2003年まで存在していたものと区別し、2003年以降の「弱い」変種は「同化モデルのそれに近づいている」としている。^{[122] [123]}

1980年代、アラン・ウィルソンはレベッカ・L・キャン、マーク・ストーンキングとともに、現代人の母系最新共通祖先（「ミトコンドリア・イブ」と呼ばれる）の遺伝子年代測定に取り組んだ。人類の進化の歴史を追跡するための有益な遺伝子マーカーを特定するために、ウィルソンは母系で受け継がれるミトコンドリアDNA（mtDNA）に注目した。このDNA物質は急速に変異するため、比較的短期間での変化をプロットすることが容易である。人間のmtDNAはチンパンジーのmtDNAよりも遺伝的に多様性がはるかに低いことを発見したウィルソンは、現代人の集団は最近単一の集団から分岐し、ネアンデルタール人やホモ・エレクトスなどの古い人類種は絶滅したと結論付けた。^{[124] 1990年代の}考古遺伝学の出現により、ミトコンドリアとY染色体のハプログループの年代測定がある程度確実に可能になった。 1999年までに、 mt-MRCAの推定年数は約15万年、アフリカからの移動の推定年数は6万～7万年とされた。^[125]

2000年から2003年にかけて、「マンゴマン3 」（LM3）のミトコンドリアDNAとそれが多地域起源仮説に及ぼす影響について論争があった。LM3は、現代人のDNA（ CRS）と比較した場合、予想以上の配列の違いがあることが判明した。 ^[126]ミトコンドリアDNAを古代および現代のアボリジニのDNAと比較した結果、マンゴマンはオーストラリア先住民に見られる遺伝的変異の範囲外にあるという結論に至り、多地域起源仮説を裏付けるために使用された。2016年に発表されたLM3とこの地域の他の古代標本の再分析では、それが現代のオーストラリア先住民の配列に類似していることが示され、以前の研究の結果とは矛盾していた。^[127]

父系遺伝のY染色体は組み換えがあまり起こらないため、継承後もほとんど同じままである。ミトコンドリア・イブと同様に、これを研究することで男性の最も最近の共通祖先（「Y染色体アダム」またはY-MRCA）を追跡することができる可能性がある。^[128]

最も基本的な系統は西アフリカ、北西アフリカ、中央アフリカで検出されており、Y-MRCAが「中央北西アフリカ」の一般的な地域に生息している可能性が高いことを示唆している。^[16]

スタンフォード大学医学部の研究は、異なる地理的地域出身の男性69人のY染色体配列とmtDNAを比較し、家系図を作成するというものでした。その結果、Y-MRCAは12万年から15万6千年前に生息し、ミトコンドリア・イブは9万9千年から14万8千年前に生息していたことが判明しました。これは、提案されている移住の波よりも古いだけでなく、両者がほぼ同時期にアフリカ大陸に生息していたことも意味します。 ^[129]

別の研究では、A1bハプログループの出現場所として「アフリカ大陸の北西象限」が妥当な位置にあることが示されています。^[130]現在のカメルーン西部のMbo族の間で発見されたハプログループA00に関する2013年の報告もこの図と一致しています。^[131]

2011 年以降の Y 染色体系統発生の改訂は、Y-MRCA の地理的起源の推定と時間的深さの推定に影響を与えています。同じ理由で、現在知られていない現生人類の古代ハプログループが将来発見された場合、再びそのような改訂につながるでしょう。特に、ユーラシア人のゲノムに 1% から 4% のネアンデルタール人由来の DNAが存在する可能性があることは、ネアンデルタール人の父系系統を示すユーラシア人男性が 1 人現生で発見されるという (ありそうもない) 出来事が起これば、T-MRCA (「MRCA までの時間」) が現在の推定値の少なくとも 2 倍に直ちに押し戻されることを意味しています。しかし、Mendezらによるネアンデルタール人の Y 染色体の発見は、この発見が...この説は、ネアンデルタール人の遺伝子配列から推定される系統が現代人の遺伝的変異の範囲外にあるため、ネアンデルタール人の父系が絶滅したことを示唆する2016年の研究によって和らげられた。 ^{[132]地理的起源の問題は、}ホモ・エレクトスからのネアンデルタール人の進化に関する議論の一部となるだろう。