ハプログループL1

ハプログループL1は、ヒトのミトコンドリアDNA （mtDNA）ハプログループです。中央アフリカと西アフリカで最も一般的です。約14万年前にL1-6から分岐しました（140.6 +33.7 −33.0 kya 95% CI )。^{[ 3 ]} その出現は、エーミアン期に解剖学的現代人がアフリカに初期移住したことと関連しており、現在では主に中央アフリカの狩猟採集民に見られます。

古代DNA

ヨーロッパの人口に見られるマクロハプログループLのサブグループの1%未満の中に、ハプログループL1bが存在する。西アフリカでよく見られるヨーロッパのハプログループL1bは、 10,000年前まで遡るとされている。^[⁴^]

分布

ハプログループ L1 は中央アフリカと西アフリカで最もよく見られます。ムベンガ族の間で最も高い頻度に達します。かつてはもっと広範囲に分布していたと考えられますが、バントゥー族の移住（主にハプログループL2と関連しています）の結果として現在の地域に限定されたと考えられます。^{[ 5 ]}ハプログループ L1 は、初期キリスト教時代（西暦 550 ～ 800 年）に遡るスーダンのクルブナルティ島の墓地の標本で観察されています。^[⁶^]スペインのカミーノ・デ・ラス・イェセラス（マドリード州サン・フェルナンド・デ・エナレス、[I4245 / RISE695] F）の古代ビーカー文化の個体も、L1b1a ミトコンドリアハプログループを持っていることがわかっています。^[⁷^]

サブクレード

L1c

L1c は約 85 kya 前に出現しました。中央アフリカで最も高い頻度に達し、特にムベンガ族の間で顕著です。^{[ 8 ]} (地図を参照。^{[ 8 ]} ) ムベンガ族では、バ・コラ族の 100%、バ・ベンゼレ族の 97% 、ビアカ族の 77% が L1c を保有しています。^{[ 9 ]} L1c が特に蔓延している他の集団には、ベドザン (ティカール) 族(100%)、ガボン(97%)カメルーン(90%)のバカ族^[¹⁰^] 、バコヤ族(97%)、バ・ボンゴ族(82%) が含まれます。^[⁸^]また、サントメ(20%) とアンゴラ(16〜24%)でも一般的です。^[¹¹^]

L1b

L1bははるかに新しく、約1万年前のものとされています。西アフリカでよく見られます。モザンビーク（1%）、エチオピア（2%）、エジプト（1%）、ナイル川流域（4%）、クン（1%）、カーボベルデ（8%）、セネガル（17～20%）、ニジェール/ナイジェリア（15%）、ギニアビサウ（11%）、モロッコ（4～5%）、アルジェリア（1～2 %）でも発見されています。^{[ 12 ]}

系統発生学

L1にはL1cとL1bの2つの系統がある（以前はハプログループL1d、L1k、L1a、L1fと呼ばれていたものは、ハプログループL0に再分類され、L0d、L0k、L0a、L0fとなった。L1eはL5となった）。

L1cの系統発生：^{[ 2 ]}

L1c
- L1c1'2'4'6
  - L1c1
    - L1c1a
      - L1c1a1
        L1c1a1a
        L1c1a1a1
        L1c1a1a1a
        L1c1a1a1b
        L1c1a1a1b1
        L1c1a1a2
        L1c1a1b
      - L1c1a2
        L1c1a2a
        L1c1a2a1
        L1c1a2a2
        L1c1a2b
        L1c1a2c
    - L1c1b'c'd
      - L1c1b
      - L1c1c'd
        L1c1c
        L1c1d
  - L1c2'4
    - L1c2
      - L1c2a
        L1c2a1
        L1c2a1a
        L1c2a1b
        L1c2a2
      - L1c2b
        L1c2b1
        L1c2b2
    - L1c4
      - L1c4a
      - L1c4b
  - L1c6
- L1c3
  - L1c3a
    - L1c3a1
    - L1c3a1a
  - L1c3b'c
    - L1c3b
      - L1c3b1
        L1c3b1a
        L1c3b1b
      - L1c3b2
    - L1c3c

L1bの系統発生：^{[ 2 ]}

L1b
- L1b1
  - L1b1a
    - L1b1a1'4
      - L1b1a1
      - L1b1a4
    - L1b1a2
      - L1b1a2a
    - 189
      - L1b1a3
        L1b1a3a
        L1b1a3a1
    - L1b1a5
    - L1b1a6
    - L1b1a7

参考文献

↑ Soares, Pedro; Luca Ermini; Noel Thomson; Maru Mormina; Teresa Rito; Arne Röhl; Antonio Salas; Stephen Oppenheimer; Vincent Macaulay; Martin B. Richards (2009年6月4日). "Supplemental Data Correcting for Purifying Selection: An Improved Human Mitochondrial Molecular Clock" . The American Journal of Human Genetics . 84 (6): 82– 93. doi : 10.1016/j.ajhg.2009.05.001 . PMC 2694979 . PMID 19500773 .
1 2 3 van Oven, Mannis; Manfred Kayser (2008 年 10 月 13 日). "更新された包括的なヒトミトコンドリア DNA 変異の系統樹" . Human Mutation . 30 (2): E386– E394. doi : 10.1002/humu.20921 . PMID 18853457 . S2CID 27566749 .
↑ 「浄化選択の補正：改良されたヒトミトコンドリア分子時計補足資料」（PDF）。American Journal of Human Genetics：82。2009年。2009年12月29日にオリジナル（PDF）からアーカイブ。
↑ Borbély, Noémi (2024). "カルパティア盆地のハンガリー語話者コミュニティの遺伝的遺産に関する系統発生学的洞察" (PDF) . Scientific Reports . 14 : 11480. Bibcode : 2024NatSR..1411480B . doi : 10.1038/s41598-024-61978-4 . ISSN 2045-2322 . OCLC 10243951083 . PMC 11106325 . PMID 38769390 . S2CID 269928158 .
↑シルバ、マリーナ。ファリダ州アルシャマリ。シルバ、ポーラ。カリーリョ、カルラ。マンドラテ、フラヴィオ。イエス・トロヴォアダ、マリア。チェルニー、ヴィクトール。ペレイラ、ルイーサ。ソアレス、ペドロ (2015)。「アフリカの主要なミトコンドリアハプログループ L2 によって記録された中央アフリカと東部アフリカの間の 60,000 年間の相互作用」。科学。代表5 12526。Bibcode : 2015NatSR...512526S。土井：10.1038/srep12526。PMC 4515592。PMID 26211407。
↑ Sirak, Kendra; Frenandes, Daniel; Novak, Mario; Van Gerven, Dennis; Pinhasi, Ron (2016). "Abstract Book of the IUAES Inter-Congress 2016 - A community divided? Revealing the community genome(s) of Medieval Kulubnarti using next- generation sequencing" . Abstract Book of the Iuaes Inter-Congress 2016 . IUAES: 115. 2017-09-02 のオリジナルからアーカイブ済み。2016-09-06に取得。
↑イニゴ・オラルデ他「ビーカー文化現象と北西ヨーロッパのゲノム変革」、2017年
1 2 3 Quintana-Murci; et al. (2008). "ピグミー族の狩猟採集民とバントゥー語を話す農耕民の間の深い共通祖先の母系痕跡と非対称的な遺伝子流動" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 105 (5): 1596– 601. Bibcode : 2008PNAS..105.1596Q . doi : 10.1073/pnas.0711467105 . PMC 2234190 . PMID 18216239 .
↑ Sarah A. Tishkoff 他、2007年、「ミトコンドリアDNAとY染色体の遺伝的変異から推測されるアフリカのクリック音話者集団の歴史」、 Molecular Biology and Evolution 2007 24(10):2180-2195
↑ルイス・キンタナ＝ムルシら。中央アフリカのMtDNAの多様性：狩猟採集から農耕まで。 CNRS-パスツール研究所、パリ
↑バティーニ、キアラ他 2006、「ヒトミトコンドリアL1cハプログループの系統地理学：中央アフリカ先史時代の遺伝的特徴」 2012年3月24日にウェイバックマシンにアーカイブ済み
↑ローザ、アレクサンドラ。他。 (2004)。「西アフリカギニア人のMtDNAプロフィール: セネガンビア地域のより良い理解に向けて」(PDF)。人類遺伝学の年代記。68 (4): 340–52 .土井: 10.1046/j.1529-8817.2004.00100.x。hdl : 10400.13/3044。PMID 15225159。S2CID 15391342 。2017 年6 月 5 日に取得。

外部リンク

PhyloTree.org - mtDNA サブツリー L、van Oven & Kayser M. 2009.
ハプログループL1の拡散（ナショナルジオグラフィックより）
アフリカのハプログループLのミトコンドリアDNA配列は、時計のような進化の法則に反する結果を示している。
イアン・ローガンのハプログループL1b。
イアン・ローガンのハプログループL1c。
L1 YFull MTree 1.02.00 (開発中)

[Soares-1] Soares, Pedro; Luca Ermini; Noel Thomson; Maru Mormina; Teresa Rito; Arne Röhl; Antonio Salas; Stephen Oppenheimer; Vincent Macaulay; Martin B. Richards (2009年6月4日). "Supplemental Data Correcting for Purifying Selection: An Improved Human Mitochondrial Molecular Clock" . The American Journal of Human Genetics . 84 (6): 82– 93. doi : 10.1016/j.ajhg.2009.05.001 . PMC 2694979 . PMID 19500773 .

[vanOven-2] 1 2 3 van Oven, Mannis; Manfred Kayser (2008 年 10 月 13 日). "更新された包括的なヒトミトコンドリア DNA 変異の系統樹" . Human Mutation . 30 (2): E386– E394. doi : 10.1002/humu.20921 . PMID 18853457 . S2CID 27566749 .

[soares_supplementary-3] 「浄化選択の補正：改良されたヒトミトコンドリア分子時計補足資料」（PDF）。American Journal of Human Genetics：82。2009年。2009年12月29日にオリジナル（PDF）からアーカイブ。

[Borbély-4] Borbély, Noémi (2024). "カルパティア盆地のハンガリー語話者コミュニティの遺伝的遺産に関する系統発生学的洞察" (PDF) . Scientific Reports . 14 : 11480. Bibcode : 2024NatSR..1411480B . doi : 10.1038/s41598-024-61978-4 . ISSN 2045-2322 . OCLC 10243951083 . PMC 11106325 . PMID 38769390 . S2CID 269928158 .

[5] シルバ、マリーナ。ファリダ州アルシャマリ。シルバ、ポーラ。カリーリョ、カルラ。マンドラテ、フラヴィオ。イエス・トロヴォアダ、マリア。チェルニー、ヴィクトール。ペレイラ、ルイーサ。ソアレス、ペドロ (2015)。「アフリカの主要なミトコンドリアハプログループ L2 によって記録された中央アフリカと東部アフリカの間の 60,000 年間の相互作用」。科学。代表5 12526。Bibcode : 2015NatSR...512526S。土井：10.1038/srep12526。PMC 4515592。PMID 26211407。

[6] Sirak, Kendra; Frenandes, Daniel; Novak, Mario; Van Gerven, Dennis; Pinhasi, Ron (2016). "Abstract Book of the IUAES Inter-Congress 2016 - A community divided? Revealing the community genome(s) of Medieval Kulubnarti using next- generation sequencing" . Abstract Book of the Iuaes Inter-Congress 2016 . IUAES: 115. 2017-09-02 のオリジナルからアーカイブ済み。2016-09-06に取得。

[IOlalde-7] イニゴ・オラルデ他「ビーカー文化現象と北西ヨーロッパのゲノム変革」、2017年

[Quintana08-8] 1 2 3 Quintana-Murci; et al. (2008). "ピグミー族の狩猟採集民とバントゥー語を話す農耕民の間の深い共通祖先の母系痕跡と非対称的な遺伝子流動" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 105 (5): 1596– 601. Bibcode : 2008PNAS..105.1596Q . doi : 10.1073/pnas.0711467105 . PMC 2234190 . PMID 18216239 .

[Tishkoff-9] Sarah A. Tishkoff 他、2007年、「ミトコンドリアDNAとY染色体の遺伝的変異から推測されるアフリカのクリック音話者集団の歴史」、 Molecular Biology and Evolution 2007 24(10):2180-2195

[10] ルイス・キンタナ＝ムルシら。中央アフリカのMtDNAの多様性：狩猟採集から農耕まで。 CNRS-パスツール研究所、パリ

[Batini-11] バティーニ、キアラ他 2006、「ヒトミトコンドリアL1cハプログループの系統地理学：中央アフリカ先史時代の遺伝的特徴」 2012年3月24日にウェイバックマシンにアーカイブ済み

[Rosa2004-12] ローザ、アレクサンドラ。他。 (2004)。「西アフリカギニア人のMtDNAプロフィール: セネガンビア地域のより良い理解に向けて」(PDF)。人類遺伝学の年代記。68 (4): 340–52 .土井: 10.1046/j.1529-8817.2004.00100.x。hdl : 10400.13/3044。PMID 15225159。S2CID 15391342 。2017 年6 月 5 日に取得。

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