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| アルファ | |
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| 一般的な詳細 | |
|---|---|
| WHO指定 | アルファ |
| 系統 | B1.1.1.7 |
| 最初に検出された | ケント、イギリス |
| 報告日 | 2020年11月 |
| 状態 | 懸念される変異体 |
| 症状 | |
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| ケースマップ | |
 凡例: 10,000以上の確認済み配列 確認された配列は5,000～9,999個 確認された配列は1,000～4,999個 500～999の確認済み配列 100～499の確認済み配列 2～99の確認された配列 確認された配列 1 件 データが全くないか全くない | |
| 主な変種 | |
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アルファ変異株（B.1.1.7）は[2] [3]懸念されるSARS-CoV-2変異株でした。野生型のSARS-CoV-2よりも40～80％伝染性が高いと推定されました（ほとんどの推定値はこの範囲の中間から高い端を占めています）。科学者たちは、2020年12月初旬に英国ケント州のウイルス配列を示す系統樹が異常に見えたことから、この変異株に広く注目しました。[4]
この変異株は12月中旬までに急速に広がり始め、感染者数が急増したのとほぼ同時期だった。この増加は、少なくとも部分的にはウイルスのスパイクタンパク質の1つ以上の変異によるものと考えられている。この変異株は、通常よりも多くの変異があることでも注目された。[5] 2021年1月までに、SARS-CoV-2のゲノム配列の半分以上が英国で実施された。[6]これにより、他にどれだけの重要な変異株が未検出のまま世界中を循環しているのかという疑問が生じた。[7] [8]
2021年2月2日、イングランド公衆衛生局は「E484K変異を持つ限られた数のB.1.1.7 VOC-202012/01ゲノム」を検出したと報告し、[9]これを懸念変異体202102/02（VOC-202102/02）と名付けました。[10]変異の1つ（N501Y ）は、ベータ変異体とガンマ変異体にも存在していました。2021年5月31日、世界保健機関は、懸念変異体を公の場で使用するために「アルファ」とラベル付けすると発表した。[11] [12]
アルファ変異株は、さらに感染力の高い変異株との競争の結果、2021年後半に姿を消した。2022年3月、世界保健機関はアルファ変異株の指定を「以前に流行していた懸念される変異株」に変更した。
分類
名前
この変異体はいくつかの名前で知られています。英国外では、英国変異体、ブリティッシュ変異体、イングリッシュ変異体と呼ばれることもありますが、[13]英国で最初に特定されたエタ変異体（系統B.1.525）などの他のあまり一般的ではない変異体が存在するにもかかわらずです。英国内では、変異体が発見されたケントにちなんで、ケント変異体と呼ばれるのが一般的です。[14] [15] [16]
科学的な用法では、この変異株はもともと2020年12月にイングランド公衆衛生局（PHE）によって調査中の最初の変異株（VUI – 202012/01）に指定されていましたが、 [17] [a] Meera Chandと彼女の同僚は、2020年12月21日にPHEによって発表された報告書の中で、懸念される変異株（懸念される変異株 202012/01、略称VOC-202012/01）に再分類しました。 [b] COVID-19 Genomics UK（COG-UK）コンソーシアムに代わって書かれた報告書の中で、 Andrew Rambautと彼の共著者は、Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages（pangolin）ツールを使用して、この変異株を系統B.1.1.7と名付けました。[19] [20]
VOC-202102/02という名前は、E484K変異を持つ変異体を指します（下記参照）。[10]
遺伝子プロファイル
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![SARS-CoV-2アルファ変異体のアミノ酸変異を、スパイクに焦点を当てたSARS-CoV-2のゲノムマップ上にプロットした図。[21]](https://img-server.japedia.wiki/wikipedia/commons/thumb/7/7f/SARS-CoV-2_Alpha_variant.svg/500px-SARS-CoV-2_Alpha_variant.svg.png)
SARS-CoV-2アルファ変異体のアミノ酸変異を、スパイクに焦点を当てたSARS-CoV-2のゲノムマップ上にプロットした。[21]
SARS-CoV-2の変異は一般的であり、 COVID-19 Genomics UK（COG-UK）コンソーシアムによると、そのスパイクタンパク質だけで4,000を超える変異が検出されています。[22]
VOC-202012/01は、23の変異によって定義され、14の非同義変異、3つの欠失、および6つの同義変異[23]（つまり、タンパク質を変化させる変異が17個、変化させない変異が6個ある[5]）。
症状と徴候
インペリアル・カレッジ・ロンドンは、アルファ変異株が優勢だった時代にイギリスで100万人以上を調査し、新型コロナウイルスに関連するさまざまな症状を発見した。感染者の間で最も多く見られた症状は「悪寒、食欲不振、頭痛、筋肉痛」で、典型的な症状も見られた。[24]
診断
SARS-CoV-2の迅速抗原検査は、COVID-19の診断のために世界中で広く使用されています。これらの検査は、大規模な検査プログラムの一環として多数の症例を迅速に特定する手段を提供することで、ウイルスの感染連鎖を阻止するのに役立つと考えられています。VOC-202012/01の出現後、当初は迅速検査では検出されない可能性があると懸念されていましたが、英国公衆衛生庁は、英国で評価され使用された迅速検査でこの変異株が検出されたと判断しました。[25]
防止
2020年後半までに、いくつかのCOVID-19ワクチンが配備または開発中でした。
しかし、さらなる変異が起こるにつれて、ワクチン開発を変更する必要があるのではないかという懸念が高まった。SARS-CoV-2は、例えばインフルエンザウイルスほど急速に変異することはなく、2020年末までに有効性が証明された新しいワクチンは、必要に応じて調整できるタイプである。[26] 2020年末現在、ドイツ、イギリス、アメリカの保健当局と専門家は、既存のワクチンがVOC-202012/01に対しても、以前の変異株と同様に有効であると考えている。[27] [28]
12月18日、NERVTAGは「現時点では、抗原漏洩について結論を出すにはデータが不十分である」と判断した。[29]
2020年12月20日現在、イングランド公衆衛生局は、この新たな変異株が現在英国のワクチン接種プログラムで使用されているファイザー・ビオンテックのワクチンに耐性を持つ[update]という「証拠はない」と確認しており、人々は依然として保護されるはずだとしている。[30]
E484K変異
2021年2月2日、イングランド公衆衛生局は、「E484K変異を伴うB.1.1.7 VOC-202012/01ゲノムの限定的な数」を検出したと報告した。[9]これはベータ型およびガンマ型変異体にも存在し、 [14]この変異によりワクチンの有効性が低下する可能性がある。[14] 2021年2月9日、E484K変異を伴う症例が主にブリストルで約76件検出されたが、リバプールでもゲノム的に異なるグループがこの変異体を保持していることが判明した。[31] 1週間後、PHEの研究および分析レポートでは、英国全土で2つの変異体VUI-202102/01とVOC-202102/02（後者は「E484Kを伴うB.1.1.7」と説明されている）で合計77件のE484K変異を伴う確定症例および疑い症例が報告された。[10]
2021年3月5日、E484K変異を伴うB.1.1.7系統が米国の患者2名（オレゴン州とニューヨーク州）で検出されたと報告された。研究者らは、オレゴン変異体のE484K変異は独立して発生したと考えた。[32] [33]
特徴
伝染性
アルファ変異株（系統B.1.1.7）の伝染性は、一般的に、既存のSARS-CoV-2変異株よりも大幅に高いことが分かっている。この変異株はCOG-UKの科学者チームによって発見され、その初期の結果では伝染性が70％（50-100％）高いことが判明した。[16] [34]ロンドン大学衛生熱帯医学大学院の感染症数理モデルセンターによる研究では、この変異株は、伝染性の増加を評価するために使用された方法に応じて、英国で既存の変異株よりも43～90％（95％信頼区間の範囲、38～130％）伝染性が高いと報告された。系統B.1.1.7の同様の伝染性の増加は、デンマーク、スイス、米国でも測定された。[35]さらに、いくつかの国と世界でのB.1.1.7系統の急増を説明する単純なモデルでは、この変異株はこれら3か国と世界全体で地元の野生型よりも50％伝染性が高いことが判明しました。[36] 別の研究では、2020年10月から11月の間に英国で75％（70％～80％）伝染性が高くなったと結論付けられました。 [37]その後の研究では、これらの初期の推定値は変異株の伝染性を過大評価しており、伝染性の増加はこれらの範囲の下限であったことが示唆されました。[38] [39]
オランダ保健福祉スポーツ省は、陽性症例のゲノム配列に基づいて、毎週、変異株の伝染率を地元の野生型と比較し、2021年の最初の6週間で28％～47％高い変動を見せたことを発見した。[40]比較のために、デンマーク国立血清研究所は、 2021年1月4日から2月12日までの相対頻度の観察された推移に基づき、デンマークでは55％（48％～62％）伝染性が高いと計算した。[41]ベルン大学社会予防医学研究所（ISPM）は 、パンデミック全体を通じて観察されたすべてのCovid-19陽性者の割合の週ごとの推移に基づいて系統B.1.1.7の伝染性を計算し、野生型の再生産数Rw≈1、指数関数的世代時間5.2日の仮定の下で、95％信頼区間で伝染性が52％であることを発見した。デンマークの野生型と比較した場合、（45％～60％）高く、スイスの野生型と比較した場合、51％（42％～60％）高かった。[42]
2020年12月18日、変異株のリスク評価の初期段階で、英国の科学諮問機関である新興呼吸器ウイルス脅威諮問グループ（NERVTAG）は、VOC-202012/01は他の変異株よりも大幅に伝染性が高いという中程度の確信があるが、伝染性増加の根本的なメカニズム（ウイルス量の増加、ウイルス複製の組織分布、連続間隔など）、症例の年齢分布、または疾患の重症度について結論を出すにはデータが不十分であると結論付けた。[29] NERVTAGが確認したデータによると、相対再生産数（「乗法的利点」）は1.74と判定され、つまり、6.5日の世代間隔を想定すると、変異株は74％伝染性が高いことが示された。この変異株は他の変異株に比べて指数関数的に急速に増加したことが実証された。[43] [44] [45]この変異体は、2週間ごとに祖先変異体を1倍ずつ上回った。別のグループも同様の結論に達し、6.73日の世代ごとに2.24の複製上の利点を生み出し、「保護手段」とは無関係に、祖先変異体を2週間ごとに上回った。[46]同様に、アイルランドでは、歴史的にまれであったS遺伝子[c]の検出（S遺伝子標的不全[SGTF]）で示されるように、この変異体は2週間で症例の16.3％から46.3％に増加した。これは、116の陽性サンプルの統計に基づくと、この2週間の終わりまでに他のすべての変異体の平均増加と比較した場合、変異体が相対的に1倍高い成長を示したことを示しています。 [48]この変異体は、1〜2か月で低レベルからロンドン、イングランド東部、南東部で優勢な変異体になりました。新年早々のSARS-CoV-2感染の急増は、他の変異株が減少している一方で、この変異株の伝染力が高まったためだと[誰が？ ]見ています。 [49] [50] [51]
B.1.1.7系統における最も重要な変化の1つはN501Y [22]であると思われる。これはアミノ酸位置501のアスパラギン( N)からチロシン(Y) への変化である。 [52]これはスパイクタンパク質の受容体結合ドメイン(RBD) 内、より具体的には受容体結合モチーフ (RBM) [53]内、つまりRBD [54]の一部内にあるためである。RBDはヒトACE2に結合する。[55] RBDの変異は抗体認識とACE2結合特異性を変化させ[55]、ウイルスの感染力を高める可能性がある。[22] Chandらは、「N501Yがスパイクタンパク質の受容体結合親和性に影響を与える可能性が高く、この変異が単独で、またはN末端ドメイン(NTD)の69/70の欠失と組み合わさってウイルスの伝染性を高めている可能性がある」と結論付けた。[56] 2021年初頭に査読を受けた論文では、前述のHV69-70欠失が、レンチウイルスSARS- CoV-2擬似ウイルスにおいて「[野生型SARS-CoV-2]と比較して、1回の感染ラウンドで2倍の感染力を持つように見える」ことが判明した。[57]
Shahhosseiniらは、In Silicoアプローチを用いて、系統B.1.1.7のY501変異が野生型（WT）変異残基N501の対応するものよりも短い水素結合（長さ2.94Å）を形成することを実証し、系統B.1.1.7ではRBDとhACE2が安定した相互作用を持つことを示した。さらに、系統B.1.1.7のY501変異は、WT変異残基N501の対応するもの（-2.92 kcal/mol）よりも結合自由エネルギー（BFE）に負の寄与が大きい（-7.18 kcal/mol）。BFEと分子相互作用の結果を組み合わせた結果、RBDのN501Y変異は、SARS-CoV-2 RBDのhACE2への結合親和性を強化した。[58]
Spike RBDとACE2の相互作用の詳細な親和性と速度論的解析では、N501Y変異によりRBDとACE2の結合親和性が約10倍大幅に向上し、結合速度定数（kon）が1.8倍増加し、解離速度定数（koff）が7倍減少することが判明した。[59]
毒性
アルファ変異株（系統B.1.1.7）のマッチしたコホート研究では、全体的には以前に流行した変異株よりも死亡率が高いことがわかったが[60] [61]、入院患者ではそうではなかった。[62]生態学的研究では、全体的な死亡率に差はなかった。[63]
当初、NERVTAGは2020年12月18日に、病気の重症度に関する結論を出すにはデータが不十分であると述べた。翌日のボリス・ジョンソン首相のブリーフィングで、当局者は、その時点では、この変異株がより高い死亡率を引き起こしたり、ワクチンや治療によって異なる影響を受けたりしたという「証拠はない」と述べた。 [64] ヴィヴェック・ムルシーもこれに同意した。[65] NHSの検査追跡とイングランド公衆衛生局（PHE）の共同医療顧問であるスーザン・ホプキンスは、2020年12月中旬に「この株がより重篤な病気を引き起こすという証拠は現在ありませんが、特に症例の検出数が増加している地域では広い地域で検出されています」と宣言した。[22]しかし、約1か月後の2021年1月22日、ジョンソン首相は「新しい変異株[VOC-202012/01]が死亡率の上昇と関連している可能性があるという証拠がいくつかある」と述べたが、政府の首席科学顧問であるパトリック・ヴァランス卿は、これを完全に確信するにはまだ十分な証拠がないと強調した。[66]
B.1.1.7系統の死亡率に関する12の異なる研究を他の系統と比較して分析した論文では、B.1.1.7系統の死亡率が高いことが判明し（LSHTMによると71％、エクセター大学によると70％、イングランド公衆衛生局によると65％、インペリアル・カレッジ・ロンドンによると36％）、NERVTAGは「これらの分析に基づくと、VOC B.1.1.7に感染すると、非VOCウイルスに感染した場合と比較して入院や死亡のリスクが高まる可能性が高い」と結論付けた。[67]死亡研究の結果は、英国がCOVID-19による死亡者の8％のみのVOC状態を分析したという事実に関連するサンプルサイズが限られているため、不確実性と信頼区間がかなり高かった。[68]
2020年10月1日から2021年1月29日までの間にコミュニティ環境でSARS-CoV-2の検査で陽性となった54,906人の参加者（ケアセンターやその他の公共機関の脆弱な人は含まない）を対象とした英国の症例対照研究によると、アルファ変異株（VOC 202012/1）に感染した患者は、SARS-CoV-2の他の変異株が陽性であったマッチした患者と比較して、検査後28日以内の死亡のハザード比が1.64（95％信頼区間1.32～2.04）であったと報告されています。[69]また、英国では、2020年11月1日から2021年2月14日までの間にSARS-CoV-2の検査で陽性となった1,146,534人の参加者（地域住民、介護施設、老人ホームの入居者を含む）を対象とした生存分析が行われ、B.1.1.7系統に感染した個人が検査後28日以内に死亡するハザード比は1.61（95%信頼区間1.42～1.82）であった。B.1.1.7系統に関連する死亡の危険性の増加は、年齢、性別、民族、貧困レベル、居住地が異なる個人間で有意差は見られなかった。[61]両研究とも、地理的地域や時間経過によるCOVID-19死亡率の変化を調整し、検査率の違いや時間や場所による病院サービスの可用性の違いによる潜在的なバイアスを補正した。[要出典]
デンマークの研究によると、B.1.1.7系統に感染した人は、他の系統に感染した人に比べて入院する可能性が64%（32%～104%）高いことが分かりました。[70]
VOC-202012/01の遺伝子配列解析により、Q27stop変異が「ORF8タンパク質を切り捨てるか不活性にする」ことが示された。[19] ORF8遺伝子を削除したSARS-CoV-2変異体に関する以前の研究では、それらは「より軽い症状とより良い病気の転帰に関連している」と指摘された。[71]この研究ではまた、「SARS-CoV-2 ORF8は、病因を調節する免疫グロブリン（Ig）様タンパク質である」、「SARS-CoV-2 ORF8は主要組織適合性複合体I（MHC-I）の分解を媒介する」、「SARS-CoV-2 ORF8はI型インターフェロン（IFN）媒介抗ウイルス反応を抑制する」とも指摘されている。[71]
スパイクタンパク質内のアミノ酸位置501について、チャンドらは「この位置の変異がウイルスの中和効果に影響を与える可能性がある」と結論付けたが[56] 、 「現在、自然感染からのポリクローナル 血清からN501Yの中和データは入手できない」と指摘した。[56]しかし、HV 69-70の欠失は「一部の免疫不全患者の免疫反応を回避したウイルス」で発見されており[72] 、「他のRBDの変化と関連して」発見されている。[56]
疫学
アルファ変異株（系統B.1.1.7）の症例は、最も一般的に使用されている検査ではこの変異株と他のSARS-CoV-2変異株を区別できず、多くのSARS-CoV-2感染がまったく検出されないため、ほとんどの国で過小報告されていると推定されています。この変異株の検出にはRNAシークエンシングが必要ですが[ 82]、特定の変異株に対するRT-PCR検査[d]はアルファの代理検査として、または全ゲノムシークエンシングを行う前の補足的な第一スクリーニング検査として使用できます。[83] [75]
3月23日現在、アルファ変異株は241の主権国家および従属国のうち125か国（ WHO加盟国194か国のうち104か国）で検出されており[e] 、そのうちいくつかは市中感染の存在を報告しているが、他の国ではこれまでのところ旅行に関連した症例のみが見つかっている。[87] 3月16日現在、この変異株は21か国で優勢なCOVID-19変異株となっている：英国（第52週）、アイルランド（第2週）、ブルガリア（第4週）、スロバキア（第5週）、イスラエル（第5週）、ルクセンブルク（第5週）、ポルトガル（第6週）、デンマーク（第7週）、オランダ（第7週）、ノルウェー（第7週）、イタリア（第7週）、ベルギー（第7週）、フランス（第8週）、オーストリア（第8週）、スイス（第8週）、リヒテンシュタイン（第9週）、ドイツ（第9週）、スウェーデン（第9週）、スペイン（第9週）、マルタ（第10週）、ポーランド（第11週）。レバノンではこの新しい変異株の出現と急速な拡散が検出されており、1月の最初の12日間のSARS-CoV-2の感染強度と新しい変異株の頻度との間に関係が認められた。[88] 2月までに、アルファはレバノンで支配的な変異体となった。[89]
英国での広がり
最初の症例は、おそらく2020年9月中旬にロンドンまたは英国のケントで発生した。[90]変異株は9月に配列決定された。[91] 2020年12月13日の時点で、この変異株による症例が英国内の約60の地方自治体で1,108件確認されている。これらの症例は主にイングランド南東部で発生した。この変異株はウェールズとスコットランドでも確認されている。[92] 11月までに、ロンドンでのCOVID-19パンデミックの症例の約4分の1が新しい変異株によるものであり、12月までにその数は3分の1になった。[93] 12月中旬には、ロンドンの症例のほぼ60％がアルファに関係していると推定された。[94] 2021年1月25日までに、英国の確定症例と疑い症例の数は28,122件に増加した。[95]
ヨーロッパでの広がり
この変異型は、以下の点で優勢になりました。
- 2020年11月最終週の第48週の南東イングランド。 [43]
- 2020年第51週のイングランド。[96]
- 2020年第52週のイギリス。[77]
- 2021年第1週のスコットランドと北アイルランド。[79]
- 2021年第2週のウェールズ戦。 [79]
- 2021年第2週のアイルランド。[48]
ブルガリアでは、ゲノム配列解析により、変異体が第4週に52.1%で優勢であり、第9週には73.4%であったことが判明しました。[97]
また、スロバキアでは、B.1.1.7系統に特有の2つの欠失（ΔH69/ΔV70およびΔY144）を検出できるRT-PCRマルチプレックスDX検査[98]により、 2月3日（第5週）に全国で74％の症例で変異体が最初に検出され、続いて2月15日（第7週）には72％の症例で検出され、3月3日（第9週）には症例の90％に増加しました。[99]同じ検査で、1月8日にミハロフツェ地区で36％、ニトラで29％の割合で変異体の有病率が判明しました。[100]
イスラエルでは、2020年12月23日にゲノム配列解析によってこの変異体が初めて検出された。 [101]しかし、 Leumit Health Care Servicesは代理検査RT-PCR（SGTF）で分析し、12月15日に3〜4％の割合で変異体を発見した。[102]国立保健省はゲノム配列に基づいて、変異体の有病率が2月6日に優勢（70％）になり、[103] 2月16日には90％になったと推定した。[104]
ルクセンブルクでは、毎週のゲノム配列解析により、変異株が0.3%（第51週）から第5週には53.0%のシェアで優勢にまで増加したことが明らかになったが、接触者追跡、空港旅行者、地域発生による潜在的な標的バイアスによる補正が行われなかったため、結果は完全に代表的ではない可能性がある。標的バイアスのない人口代表ランダム化テストプールのゲノム配列解析は第6週から実施され、変異株が54.1%（第6週）から62.8%（第9週）に増加して優勢な状態にあることが確認された。一方、競合するベータ変異株（系統B.1.351）は第9週に18.5%であったことが判明した。[105]
デンマークでは、変異株は0.3%（2020年第46週）から65.9%（2021年第7週）で優勢となり、さらに92.7%（第10週）に増加しました。地域的な有病率は、北ユトランド地方の87.3%から中央デンマーク地方の96.1%に及びます。[106]観測された相対的な変異株シェアの増加は、以前のモデル予測[41]と完全に一致しており、2月中旬頃に優勢（50%以上）になり、3月上旬までに循環する変異株全体の約80%の有病率が予測されていました。[107]比較すると、ゲノム配列解析では、第10週の陽性症例の0.4%（2315回の検査のうち9回）でのみ競合するベータ変異株が見つかりました。[108] [109]
オランダでは、ランダムに実施されたゲノム配列解析により、この変異株は第49週の症例の1.3%から第7週には61.3%の優位なシェアに増加し、第9週には82.0%に続いたことが判明しました。一方、比較対象となっているベータ変異株は第9週に3.0%でした。[74]アムステルダムでは、アルファ変異株（系統B.1.1.7）が5.2%（第52週）から54.5%（第6週）に増加しました。[110]
ノルウェーでは、この変異株はゲノム配列解析により、5.7% (第1週) から58.4% (第7週) に増加し、続いて65.0% (第8週) に増加したことが判明しました。[111]ゲノム配列解析とPCR代理検査の両方の結果を含む別の大規模調査では、毎週1000件以上の検査を採取し(第4週以降)、同時に、この変異株は2.0% (第48週) から60.0% (第7週) に増加し、続いて10週目には72.7%に増加したことがわかりました。一方、比較すると、ベータ変異株であることが判明した症例はわずか2.2%でした。[112]この変異株は地域的にオスロ県とヴィケン県で最も高い割合を示し、[113] オスロでは1月20日から2月23日にかけて分析されたサンプルの18%から90%に増加した（ただし、データ修正後の推定値は2月23日には50-70%とやや低い）。一方、ヴィケンでは1月25日から2月23日にかけて分析されたサンプルの21%から80%に増加した（ただし、データ修正後の推定値は2月23日には50%とやや低い）。[114] 2月15日から3月14日の期間、ゲノム配列解析とPCRプロキシテストを組み合わせた調査では、アルファ変異株が11地域のうち8地域で50%を超える優勢な割合を示し、オスロでは82%と最も高い割合を示していることも判明した。一方、ノルドランド地方は、アルファ変異株の症例がわずか6％で、ベータ変異株が88％と圧倒的に多いという点で他の地域とは異なっていました。[112]
ポルトガルでは、国家ゲノム配列調査によると、変異株は1月10～19日（第2週）のCovid-19感染者の16.0%を占め、[115]第6週には58.2%と優勢でした。[116] SGTFとSGTLの観察に基づく国家RT-PCR代理検査では、第4週に変異株の割合が33.5%であったが、その後、変異株シェアの週ごとの上昇ペースが鈍化していることが観察され（理由は不明）、この研究によると、第8週に50.5% （SGTFL 55.0%の91.8%）で優勢になり、第10週には64.3% （SGTFL 70%の91.8%）で優勢になりました。 [75]
イタリアでは、アルファ変異株は2月4日～5日（第5週）に全国の症例の17.8%を占め、[117] 2月18日（第7週）には54.0%を占めた。第7週の地域的有病率は、ヴァッレ・ダオスタ州で0% （ただし、検査されたのは1つのサンプルのみ）からモリーゼ州で93.3%までの範囲であった。第7週では、競合するガンマ変異株の有病率は4.3%（地域的には0%～36.2%の範囲）、南アフリカ変異株の有病率は0.4%（地域的には0%～2.9%の範囲）であった。[118]
スイスでは、全国的に毎週ゲノム配列調査が行われ、アルファ変異株が0.05%（第51週）から第8週には58.2%の症例で優勢となり、第9週には71.1%となったことが判明した。 [76]これは、2月中旬頃に優勢になると予測していた2月9日のモデルと完全に一致していた。[119]比較すると、競合するベータ変異株は第9週の陽性症例の全国的な1.0%にしか見られなかった。[76]
ベルギーでは、地域的な発生や旅行に関連したアクティブな標的検査からのすべてのサンプルを除外した後、ランダムに選択されたサンプルのゲノム配列決定（COVID-19陽性検査全体の4.4％に相当する採取量で統計的に代表的な全国サンプルを作成）により、アルファ変異体の割合が第1週の7.1％から第7週には支配的な51.5％に増加し、第10週には79.3％になったことが判明した。[120]この変異体は第49週に標的ゲノム配列決定によって初めて検出されたが、サンプル採取が少なかった（ランダムではなく、週あたり100件未満の検査）ため、第1週より前には信頼できる変異体シェアデータを決定できなかった。[121]この変異体の代理検査（RT-PCR SGTF）も、COVID-19陽性検査全体の25.8％に相当する採取量で実施され、第10週のSGTF率は54.8％と支配的であった。これと比較して、競合する第10週のSGTF率は、第10週には54.8％と支配的であった。ベータ変異体は3.6％、ガンマ変異体は10週目に1.8％の有病率であったことが判明した。[120]
フランスでは、科学者らがアルファ変異株（VOC-202012/01）が2021年第8週から第11週頃に全国的に優勢になる可能性が高いと正確に予測した。[122]無作為に抽出されたCOVID-19陽性サンプルを最初にRT-PCRスクリーニング検査で分析し、その後ゲノム配列決定によって確認した全国調査では、変異株が1月7日～8日（第1週）の3.3%（388/11916）[123]から1月27日（第4週）には13.3%（475/3561） [85]に増加し、続いて2月16日（第7週）には44.3%（273/615）に増加したことが明らかになった。[85]週8日には、全COVID-19陽性検査の0.9％を占める週ごとのゲノム配列解析調査の解釈可能な結果によると、変異株は56.4％（758/1345）の優勢なシェアを占めていることが判明しました。また、全COVID-19陽性検査の54％を検査した変異株特有のRT-PCR調査によると、59.5％でした。[124]週10日には、全COVID-19陽性検査の56.9％を検査した変異株特有のRT-PCR調査によると、変異株は71.9％のシェアを占めていることが判明しました。変異株の広がりは、第10週のフランス本土96県で地域によって異なり、91県で50%を超え、5県で30%～50%であった（特にモゼル県は、競合するベータ変異株の割合が38.3%と高く、第8週の54.4%という優勢な値からは減少したものの、この特定の変異株の全国平均5.0%を大幅に上回っていたため注目に値した）。[125]
オーストリアでは、健康・栄養安全庁（AGES）がN501Y RT-PCR特異的検査とその後のゲノム配列解析からデータを収集し、変異体が7.2%（第1週）から61.3%（第8週）の優勢に増加し、第9週には61.2%、第10週には48.3%になったことを発見した。すべてのN501Y陽性検査がゲノム配列によってさらに分析されていた場合、これらの記載された割合はさらに高かった可能性があり、たとえば、第1週は2.4%、第7週は23.0%、第8週は4.0%、第9週は6.8%、第10週は25.4%高くなった可能性がある。競合するベータ変異体は、第1週の陽性症例の全国で0.3%にしか見られなかった。 10、最も蔓延していたチロル地方では、そのシェアは第4週の24.5％から第10週のわずか1.9％に減少しました。地域的には、チロルとフォアアールベルクの2つの例外を除き、9つの地域のうち7つの地域でアルファが50％を超えて優勢であることがわかりました。[126]
ドイツでは、ロベルト・コッホ研究所が発表した最大規模でおそらく最も代表的な全国調査（RKI-Testzahlerfassungと題）により、ゲノム配列解析またはRT-PCRプロキシテストのいずれかで53,272のCOVID-19陽性サンプルを分析し、最新週に循環しているCOVID-19変異体の割合が決定されました。データは、全国に均等に分布する大学/研究/臨床/外来部門の84の研究所から自主的に収集されました。この調査では、地理的代表性を確保するためにデータの重み付けやデータ選択基準を使用していませんでしたが、サンプル数が多いため、全国平均をある程度代表していると見なすことができます。RKI-Testzahlerfassung調査によると、この変異株はシェア2.0%（第2週）から54.5%（第9週）の支配的なシェアに増加し、第10週には63.5%となった。比較すると、競合するベータ変異株は第10週の陽性症例の全国的な0.9%にしか見られなかった。[127]
マルタでは、この変異株は2020年12月30日にゲノム配列解析によって初めて検出され、[128]第7週の陽性症例の8％を占めました。[129]監視のために新しいRT-PCR変異株特異的検査が導入され、[130] 3月10日に報告された最初の結果では、この変異株が現在全国の症例の61％を占めていることが明らかになりました。[131]
スウェーデンでは、当初当局は、元のウイルスと比較して伝染力が50%増加するという仮定の下、変異株が12～14週目頃に優勢になると予想していた。[132]平均すると、変異株の割合は、南部の5つの地域（スコーネ、ヴェストラ・イェータランド、ヴェストマンランド、イェヴレボリ、オレブロー）で10.8%（第4週）から36.9%（第7週）に増加していることが判明した。 [133]第7週には、変異株の割合が初めてスウェーデンの21地域のうち19地域で全体平均として30.4%と計算された（ブレーキンゲの3.3%からイェヴレボリの45%までの範囲）。第9週では、変異株の割合は19地域（クロノベリの16％からイェヴレボリの72％まで）の全体平均として56.4％と圧倒的に多かった。第10週では、変異株の割合はさらに増加し、19地域（クロノベリの40％からヨンショーピングの84％まで）の全体平均として71.3％と計算された。19地域の計算平均の地理的代表性を確保するために地理的重みは適用されなかったが、12,417件の変異株検査の全体的なサンプル取得は、第10週のすべてのCOVID-19陽性PCR検査の43.1％を占め、調査結果は国全体の実際の真の平均に近い可能性があると推測される。[86]
小国 リヒテンシュタインでは、2020年12月19日に最初のアルファ症例が検出されました。パンデミック全体を通じて、2021年3月18日現在、67件のVOC-N501Y PCR陽性症例が検出され、そのうち58件はアルファ症例、1件はベータ症例（2月1日に検出）、8件は未確認のN501Y症例（12月10日から2月22日まで）でした。検出されたすべてのVOC-N501Y症例の割合（リヒテンシュタインのアルファの良い代理指標）の7日間移動平均を各日に計算した週平均は、第5週に10.9％で、第9週には52.2％と圧倒的な割合となり（15回の検査のうち8回がアルファであることが判明）、第10週にはさらに73.4％に増加しました（9回の検査のうち6回がアルファであることが判明）。[134]
スペインでは、変異株のシェアは1月29日に全国で5%～10%と推定され[135] 、 2月18日には20%～25%と[136] [137]、2月22日には25%～30%と[138]、3月3日（第9週）の時点で50%を超えて優勢であると推定されました。[139]第10週の時点で、変異株の有病率は17の地域で18.3%～97.0%の範囲で、2つの地域を除くすべての地域で優勢率が50%を超えています。[140]
- エストレマドゥーラ州から報告されたデータはありません。
- アラゴンでは第10週で18.3% 。
- カナリア諸島では第7週で27.0% 。
- カスティーリャ・イ・レオン州では第8週で51.3% 。
- バレンシアでの第10週は52.2% 。
- カスティーリャ・ラ・マンチャの第10週は52.8% 。
- ガリシアでは第4週で53.3% 。
- ラ・リオハでの第9週は59.5% 。
- マドリードでの第10週は59.7% 。
- アンダルシアでは第11週で61.6% 。
- バレアレス諸島では第10週で76.1% 。
- ムルシアでの第10週は76.7% 。
- バスク地方では第10週で77.4% 。
- ナバラでの第10週は77.8% 。
- カンタブリアでの第10週は83.1% 。
- カタルーニャでは第9週で84.6% 。
- アストゥリアス州での第10週は97.0% 。
ポーランドでは、感染した教師を対象にした全国調査の結果、専門家は2月11日時点で変異株のシェアが全国で5～10％であると推定したが[ 141]、ECDCは2月15日時点で9％であると報告した。[142]アダム・ニェジエルスキ保健相によると、変異株は1月後半の最初の調査で5％の割合で発見され、その後10日ごとに10パーセントポイント増加し、3月16日（第11週）には52％の割合で全国的に優勢になった。[143] [144]地域的には、変異株は2月22日～23日（第8週）にヴァルミア・マズールィ県とポモージェ県ですでに70％を超えており[145] 、3月17日（第11週）にはヴィエルコポルスカ県で90％に達した。[146]
フィンランドでは、2021年2月時点で統計的に代表的な全国調査は実施されておらず、国レベルのゲノム解析は主に旅行者や地域の感染クラスターからのCOVID-19陽性サンプルのさらなる分析を対象としていた。[147]ヘルシンキ・ウーシマー病院地区で活動するヘルシンキ大学病院（HUS）は、2月14日の数日前に首都圏（ヘルシンキ選挙区、ウーシマー選挙区とも呼ばれる）で無作為に採取された全サンプルの10％で変異体を発見した。首都圏では、変異体が3月後半（第11週～第13週）に優勢（50％以上）になるとモデル化された。[148]
アイスランドでは、国当局が海外から入国するすべての人に対して厳格な3回の検査と検疫体制を実施し、これまでのところ、新たな感染性VOCが国内に定着するのをうまく防いでいる。3月4日現在、アイスランドの国境で合計90人の旅行者がアルファ変異株の検査で陽性となり、国内で新たに確認された20件の症例はすべて国境での症例と密接に関連しており、市中感染に関連する症例はなかった。[149]
北米での広がり
米国では、この変異株は2020年11月下旬に初めて出現し、[150] 1月下旬の1.2%から増加し、3月末頃には優勢になった。[151] [152]この変異株の拡散は主に米国中西部北部、特にミシガン州とミネソタ州に集中していたが、国内の他の地域に高濃度で広がることはなかった。[153]
カナダでは、この変異株は2020年12月下旬にオンタリオ州で初めて出現した。 [154] 2月13日までに、10州すべてに広がった。[155] COVID-19陽性サンプルにおけるアルファ変異株（系統B.1.1.7）の検査と確認は、全国で一貫していない。[156] 2月3日、アルバータ州は、懸念される変異株についてすべてのCOVID-19陽性サンプルをスクリーニングした最初の州となった。[156] [157] 3月23日の時点で、アルファ変異株は5812件の症例で検出されており、アルバータ州で最も蔓延している。[158]オンタリオ州では、RT-PCR（N501Y）とゲノム配列解析を組み合わせた研究により、1月20日（第3週）のCOVID-19陽性例全体の4.4％がすべてのVOCであり、そのうちアルファが99％を占めていることが判明した。[159] オンタリオ州公衆衛生局の研究所は、第5週にCOVID-19陽性者の約7％で変異体を発見し、検出されたVOCの97％（309/319）を占めました。[160]アルファ変異体は3月16日頃に優勢な変異体となり、陽性者の53％がVOCで、VOCの97％がアルファであると推定されました。[161]変異体が広まっていたケベック州では、3月下旬または4月までに優勢になると予想されていました。[162]
発達
以下の国では変異株の割合は報告されていないが、2021年3月13日時点で全ゲノム配列解析により50件以上の症例が確認されているため、かなりの割合で変異株が存在する可能性が高い。[176]
- トルコ（486件）
- フィンランド（268件）
- オーストラリア（140件）
- チリ（124件）
- クロアチア（121件）
- ナイジェリア（113件）
- 韓国（90件）
- スロベニア（87件）
- ラトビア（83件）
- インド（81件）
- ルーマニア（76件）
- ガーナ（67件）
- シンガポール（66件）
- ニュージーランド（63件）
- 北マケドニア（53件）
- ブラジル（53件）
- 台湾（32件）
COVID-19の全ゲノム配列を収録したGISAIDデータベースでは、提出されたサンプルについて過去4週間の各国の「相対的変異ゲノム頻度」の平均を計算している。しかし、これらの頻度はサンプリングや報告の偏りの影響を受けやすく、統計的代表性がないため、正確な変異体シェアの有病率を表すものではない。[176]
最初の症例を報告した国
2020年12月
変異株の症例は12月中に世界中で報告され始め、デンマーク[64] [177] 、ベルギー[178] 、オランダ、オーストラリア[64] [177] 、イタリア[179]で報告されました 。その後まもなく、他のいくつかの国でも最初の症例が確認され、最初はアイスランドとジブラルタルで発見され[180] [181]、続いて12月23日にシンガポール、イスラエル、北アイルランドで、 [182] [183] [184]、12月24日にドイツとスイスで、 [185] [186]、 12月25日にアイルランド共和国と日本で確認されました。[187] [188]
カナダ、フランス、レバノン、スペイン、スウェーデンでの最初の症例は12月26日に報告されました。[189] [190] [191] [192] ヨルダン、ノルウェー、ポルトガルでは12月27日に最初の症例が報告されました。[193] [194] フィンランドと韓国では12月28日に最初の症例が報告されました。 [195] [196]チリ、インド、パキスタン、アラブ首長国連邦では12月29日に最初の症例が報告されました。[197] [198] [ 199] [200]マルタと台湾で新しい変異体の最初の症例が12月30日に報告されました。[128] [201]中国とブラジルでは12月31日に新しい変異体の最初の症例が報告されました。[202] [203]英国とデンマークは、他のほとんどの国よりもかなり高い割合でSARS-CoV-2症例の遺伝子配列を調べており、[204]後日、他の国でも変異株が検出される可能性が高いと考えられていました。[205]
アメリカは12月29日にコロラド州で渡航歴のない症例を報告し、サンプルは12月24日に採取された。 [206] 2021年1月6日、米国疾病予防管理センターは、カリフォルニア州、フロリダ州、コロラド州、ジョージア州、ニューヨーク州で少なくとも52人の確認症例が見つかったと発表した。[207]その後数日で、他の州でも変異株の症例がさらに報告され、元CDC所長のトム・フリーデンは、アメリカがまもなく「最悪のシナリオに近い」状況に直面するだろうという懸念を表明した。[208]
2021年1月
トルコでは、 2021年1月1日にイングランド出身の15人から最初の症例が検出された。[209] 1月1日、デンマークでは合計86人の変異株の症例が見つかったと報告された。これは、11月中旬に国内で最初に検出されてから12月末までの期間に、シーケンスされた症例の全体的な頻度の1％未満に相当します。[210] [211]これは、11月中旬から2021年第2週までの期間にシーケンスされたテストの1.6％に増加し、今週だけでシーケンスされたテストの7％がアルファ変異株（系統B.1.1.7）でした。[212] ルクセンブルクとベトナムは、2021年1月2日にこの変異株の最初の症例を報告しました。[213] [214]
2021年1月3日、ギリシャとジャマイカでこの変異株の最初の4例が検出され[215] [216]、キプロスは12のサンプルからアルファ（VOC 202012/01）を検出したと発表した。[217] 同時に、ニュージーランドとタイでもこの変異株の最初の症例が報告され、ニュージーランドでは英国から5例、南アフリカから1例、合計6例が報告され[218]、タイではケントから到着した4人家族からの症例が報告された。[219] ジョージアでは最初の症例が報告され[220]、オーストリアでは1月4日にこの変異株の最初の4例とベータ変異株の1例が報告された。[221]
1月5日には、イラン、[222]、 オマーン、[223]、スロバキアでVOC-202012/01の初感染例が報告された。[224] 1月8日にはルーマニアでこの変異株の初感染例が報告され、ジュルジュ県出身の成人女性は最近国外に出国していないと申告していた。[225] 1月9日にはペルーで初感染例が確認された。[226] メキシコとロシアは1月10日にこの変異株の初感染例を報告し、[227]続いて1月11日にマレーシアとラトビアが報告した。[228] [229]
1月12日、エクアドルでこの変異株の最初の症例が確認された。[230]フィリピンとハンガリーはともに1月13日に変異株の存在を検出した。[231] [232]ガンビアでは1月14日に変異株の最初の症例が記録され、アフリカで変異株の存在が初めて確認された。[233] 1月15日、ドミニカ共和国で新しい変異株の最初の症例が確認され[234]、アルゼンチンでは1月16日に変異株の最初の症例が確認された。[235]チェコ共和国とモロッコでは1月18日に最初の症例が報告され[236] [237] 、ガーナとクウェートでは1月19日に最初の症例が確認された。[238] [239]ナイジェリアでは1月25日に最初の症例が確認された。[240] 1月28日、セネガルでこの変異株の最初の症例が確認された。[241]
1月初旬、オランダのベルクシェンフック地域で小学校に関連した感染の発生により、少なくとも30件の新しい変異株が検出され、地域的な感染が示唆されました。[242]
1月24日、アフリカからフェロー諸島へ旅行していた人物が島に到着した際に陽性反応を示し、直ちに隔離された。[243]
1月28日、北マケドニアは、すでに回復していた46歳の男性から変異株が検出されたことを確認した。[244]
2021年2月
2月1日、リトアニアは新系統の最初の症例を確認した。[要出典] 2月4日、ウルグアイの保健当局は、国内で最初の変異株の症例を発表した。症例は、2020年12月20日に入国した人物で検出され、それ以来隔離されている。[245] 2月10日、クロアチア保健省は、 1月20日以降に配列決定された61のサンプルのうち、ザグレブの50歳と3.5歳の男性と、ブロド・ポサヴィナ郡の34歳の男性の3つのサンプルで変異株が検出されたことを確認した。[246] 2月12日、スリランカの4つの地域で変異株が検出され、[247]カナダのニューファンドランド・ラブラドール州で変異株の発生が確認された。[248]
2021年3月
3月2日、インドネシアはサウジアラビアから帰国した移民労働者2名に変異株の初感染例が報告された。[249]同日、チュニジア[250]でも変異株の初感染例が報告された。コートジボワールで変異株の存在が確認されたのは3月25日である。[251]
N501Y変異の他の部分
N501Y 変異は、異なる場所で複数回独立して発生しました。
- 2020年4月、ブラジルでいくつかの孤立した配列で初めて確認された。[252]
- 2020年6月、この変異はオーストラリアの系統に現れた。[252]
- 2020年7月、（レスター大学のジュリアン・タン博士によると）N501Yは米国で循環している系統に出現した。[252] [出典が必要]
- 2020年9月、ウェールズの系統で発見されましたが、これは独立して進化しており、系統B.1.1.7とは異なっていました。[52]
- 2020年9月には[1] 、より伝染性が高く広範囲に分布する系統B.1.1.7（501Y.V1）がケント（イングランド）で初めて検出された。 [19]
- 2020年10月、ネルソン・メンデラ湾（南アフリカ）で、B.1.351系統（501Y.V2、ベータ変異体）と呼ばれる、感染力の高い別の懸念される変異体がゲノム配列解析によって初めて検出されました。 [253]系統地理学的解析によると、この系統は2020年7月か8月にはすでに出現していたことが示唆されています。 [254]
- 2020年12月には[255]、マナウス（ブラジル）で、系統P.1（501Y.V3、ガンマ変異体）と呼ばれる別の非常に伝染性の高い変異体が検出されました。[256]
統計
テーブル
グラフィックス
国別の感染者数
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- 政府、報道機関、役人など、さまざまな情報源から提供されるデータは、前回の公開以降毎週更新されます。
歴史
検出
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アルファ変異株（系統B.1.1.7）は、国の制限にもかかわらずケント州の感染率が低下していないという認識のもと、ゲノムデータの分析によって2020年12月初旬に初めて検出された。[5] [260]
B.1.1.7系統に属する最も古いゲノム2つは、2020年9月20日にケントで収集され、もう1つは2020年9月21日にグレーターロンドンで収集されました。[19]これらの配列は、 GISAID配列データベース（それぞれ配列アクセス番号EPI_ISL_601443とEPI_ISL_581117）に提出されました。 [261]
遺伝学的証拠を用いた遡及調査により、系統B.1.1.7は2020年9月に出現し、その後11月中旬まで人口内で非常に低いレベルで循環していたことが示唆されている。この変異株に関連する症例の増加は、公衆衛生イングランド（PHE）が国家的な制限にもかかわらずケントの感染率が低下していない理由を調査していた11月下旬に初めて明らかになった。その後、PHEは、この変異株に関連するクラスターがロンドンとエセックスに急速に広がっていることを発見した。[30]
また、英国で主に使用されているRT-PCR検査、サーモフィッシャーサイエンティフィックのTaqPath COVID-19の性質も重要でした。この検査は3か所でRNAと一致しましたが、B.1.1.7系統のスパイクタンパク質のHV 69-70欠失（それぞれ位置69と70のアミノ酸ヒスチジンとバリン欠失[262]）のためにスパイク遺伝子には機能しませんでした。これにより、ゲノム配列決定によりどの症例がB.1.1.7系統であるかをより正確に推測できるため、予備的な特定が容易になりました。[263]
この変異株は慢性的に感染した免疫不全の人に由来し、ウイルスが複製して進化する長い時間を与えた可能性が示唆されている。 [264] [5] [265] [266]
コントロール
より伝染性の高い変異株が存在する場合、指数関数的に増加する傾向にあるため、人口に負担をかけることを避けるために、より強力な物理的距離の確保とロックダウン措置が選択されました。[267]
2020年12月20日から、イギリス国内のすべての国が、少なくとも部分的にアルファウイルスに起因するウイルスの拡大への対応として、国内旅行制限の影響を受けた。 [268] [269] 2020年12月中、世界中のますます多くの国が、イギリスからの旅客旅行の一時禁止を発表、または禁止を検討していた。オランダやデンマークなどの他の国からの旅客旅行もいくつかあった。一部の国は航空便を禁止し、他の国はSARS-CoV-2の検査が陰性であれば自国民のみ入国を許可した。[270] WHOの広報担当者は、「感染が激しく広範囲に及んでいるヨーロッパでは、各国は制御と予防のアプローチを倍増させる必要がある」と述べた。EU諸国による禁止のほとんどは48時間で、12月21日に開催されるEU代表者による統合政治危機対応会議で新しい変異株の脅威を評価し、共同対応を調整するまで保留されていた。[271] [272]
世界中の多くの国が英国からの旅客渡航を制限し、隣国フランスも有人貨物車両の渡航を制限した（検査プロトコルを策定し、再度の通過を許可する前に全面禁止を課した）。[273]他の国からの渡航にも制限を課した国もあった。[274] [275] [276] [277] 2020年12月21日現在[update]、少なくとも42か国が英国からの航空便を制限しており[270]、日本は国内で新しい変異種の症例が検出された後、すべての外国人の入国を制限している。[278]
変異株がすでに到着している可能性が高い場合、特にウイルスの1週間あたりの推定増加率が地域的に高い場合には、渡航禁止令の有用性は限られていると議論されている。[279] [280]
絶滅
2021年10月、英国保健安全保障局のジェニー・ハリーズ最高経営責任者は、アルファ型などの以前流行していた変異株は「消滅」し、デルタ型に取って代わられたと述べた。[281] 2022年3月、世界保健機関は、過去数週間および数か月間に検出された症例がなかったことを理由に、アルファ型、ベータ型、ガンマ型の変異株を以前に流行していたものとしてリストアップした。[282]
参照
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注記
- ^ GISAID [283]とECDC [284]により、 VUI 202012/01 (調査中の変異体、2020年12月、変異体01)として記載。
- ^ 両者の違いはPHEによって次のように説明されている。
SARS-CoV-2の変異体は、疫学的、免疫学的、または病原性に関して懸念される特性があると考えられる場合、正式な調査の対象となります。この時点で、変異体は年、月、番号とともに調査中の変異体（VUI）として指定されます。関連する専門委員会によるリスク評価の後、懸念される変異体（VOC）として指定されることがあります。[18]
- ^ ab SARS-CoV-2のS遺伝子はスパイクタンパク質をコードする。[47]
- ^ その一例はデルタ（Δ）-PCR検査で、SARS-CoV-2に関連して、この変異を持つ変異体のHV 69-70欠失を検出するために使用されてきました[83]。これは、 RT-PCR検査のサブセット（例：TaqPath COVID-19 RT-PCR検査、ThermoFisher）におけるスパイク（S）遺伝子[c]の「スパイク遺伝子標的不全」（SGTF）または「スパイク遺伝子ドロップアウト」[75 ]と呼ばれる検査を通じて行われます。 [84]スパイクタンパク質のHV 69-70欠失は、SARS-CoV-2の他のいくつかの変異体にも存在しますが、[75] B.1.1.7ゲノムの大部分に存在しており、デルタPCR検査を系統の代理検査として使用したり、全ゲノム配列決定を行う前に補足する最初のスクリーニング検査として使用したりすることができます。[83] [75]特定の変異体を検出することを目的としたRT-PCR検査の別の例としては、N501Y変異（アルファ変異体、ガンマ変異体、ベータ変異体など）を持つすべてのゲノムを検出する検査があり、現在ではいくつかの研究所や国（フランスの一部地域など）でゲノム配列決定に先立つ第一段階のスクリーニングツールとしても使用されています。[85]特定の変異体を検出することを目的とした3番目と4番目のRT-PCR検査では、それぞれN501Y+A570D変異（アルファ）とA570D変異のないN501Y（ベータ、ガンマ、その他のN501Y変異体）を持つ変異体についてサンプルを事前スクリーニングします。[86]
- ^ 2021年3月23日現在、104のWHO加盟国がアルファ変異株（系統B.1.1.7）の検出を報告している： アルバニア、アンゴラ、アルゼンチン、オーストラリア、オーストリア、アゼルバイジャン、バーレーン、バングラデシュ、バルバドス、ベラルーシ、ベルギー、ベリーズ、ボスニア・ヘルツェゴビナ、ブラジル、ブルネイ・ダルサラーム、ブルガリア、カーボベルデ、カンボジア、カナダ、チリ、中国、コスタリカ、クロアチア、キプロス、チェコ共和国、コンゴ民主共和国、デンマーク、ドミニカ共和国、エクアドル、エストニア、フィンランド、フランス、ガンビア、ジョージア、ドイツ、ガーナ、ギリシャ、ハンガリー、アイスランド、インド、インドネシア、イラン、イラク、アイルランド、イスラエル、イタリア、ジャマイカ、日本、ヨルダン、ケニア、クウェート、ラトビア、レバノン、リビア、リトアニア、ルクセンブルク、マレーシア、マルタ、モーリタニア、モーリシャス、メキシコ、モナコ、モンテネグロ、モロッコ、ネパール、オランダ、ニュージーランド、ナイジェリア、北マケドニア、ノルウェー、オマーン、パキスタン、ペルー、フィリピン、ポーランド、ポルトガル、大韓民国、モルドバ共和国、ルーマニア、ロシア、ルワンダ、セントルシア、サウジアラビア、セネガル、セルビア、シンガポール、スロバキア、スロベニア、南アフリカ、スペイン、スリランカ、スウェーデン、スイス、タイ、トリニダード・トバゴ、チュニジア、トルコ、ウクライナ、アラブ首長国連邦、英国、米国、ウルグアイ、ウズベキスタン、ベトナム。[87]
2021年3月23日の時点で、90人のWHO加盟国はアルファ変異体（系統B.1.1.7）の検出を報告していない： アフガニスタン、アルジェリア、アンドラ、アンティグア・バーブーダ、アルメニア、バハマ、ベニン、ブータン、ボリビア、ボツワナ、ブルキナファソ、ブルンジ、カメルーン、中央アフリカ共和国、チャド、コロンビア、コモロ、コンゴ、クック諸島、コートジボワール、キューバ、朝鮮民主主義人民共和国（北朝鮮）、ジブチ、ドミニカ、エジプト、エルサルバドル、赤道ギニア、エリトリア、エチオピア、フィジー、ガボン、グレナダ、グアテマラ、ギニアビサウ、ガイアナ、ハイチ、ホンジュラス、ギニア、カザフスタン、キリバス、キルギス、ラオス人民民主共和国、レソト、リベリア、マダガスカル、マラウイ、モルディブ、マリ、マーシャル諸島、ミクロネシア、モンゴル、モザンビーク、ミャンマー、ナミビア、ナウル、ニカラグア、ニジェール、ニウエ、パラオ、パナマ、パプアニューギニア、パラグアイ、カタール、セントクリストファー・ネイビス、セントビンセントおよびグレナディーン諸島、サモア、サンマリノ、サントメ・プリンシペ、セーシェル、シエラレオネ、ソロモン諸島、ソマリア、南スーダン、スーダン、スリナム、スワジランド、シリア・アラブ共和国、タジキスタン、東ティモール、トーゴ、トンガ、トルクメニスタン、ツバル、ウガンダ、タンザニア連合共和国、バヌアツ、ベネズエラ、イエメン、ザンビア、ジンバブエ。[87] - ^ abcdefgh 英国の毎週の感染調査では、SGTFが分析した民間家庭から収集されたPCR検査（病院、ケアセンター、公的機関からの検査を除く）からの生データと平均平滑化モデル化データのセットが英国の各国についてリストされています。ウェールズ、北アイルランド、スコットランドの生データとモデルデータは、収集されたサンプル数が少なく、データの不確実性が大きいため、慎重に扱う必要があります。[165] [166]
- すべてのPCR検査は、コロナウイルスに存在する3つの遺伝子、Nタンパク質、Sタンパク質、ORF1abについて分析されました（感染調査の表6Aを参照）。各PCR検査では、いずれか1つ、2つ、または3つすべての遺伝子が検出される可能性があります。コロナウイルス陽性は、綿棒でこれらの遺伝子の1つ以上が検出されたものです（S遺伝子のみが陽性の検査は除きます。S遺伝子は単独で検出された場合、ウイルスの信頼できる指標とはみなされません）。COVID-19の新しい変異体B.1.1.7では、S遺伝子に遺伝子変化があり、その結果、現在の検査ではS遺伝子が検出されなくなり、ORF1abとN遺伝子のみが陽性になります。この調査では、ORF1ab + Nタンパク質遺伝子陽性の場合「新しい英国変異体に適合」 、 ORF1ab + Nタンパク質+ Sタンパク質遺伝子陽性の場合「新しい英国変異体と適合しない」 、その他のすべての遺伝子パターンの場合「ウイルスが識別できないほど少ない」という用語を使用しています（COVID-19疾患の第一段階から採取された、識別可能な量のウイルスが存在するすべてのサンプルは、「ORF1ab + N」または「ORF1ab + N + S」のいずれかで陽性になることを考えると、合理的な定義です）。ただし、他の競合する変異体も同じテストパターンを示しているため、「新しい英国変異体に適合」するSGTF症例（ORF1abとN遺伝子は陽性だがS遺伝子は陽性ではない）のすべてが新しい英国変異体であるとは限らないため、さらに不確実性があります。また、2020年11月中旬より前のデータは、変異体の指標として解釈されるべきではありません。[165] [166]
- 週ごとの B.1.1.7 変異体シェアの生データは、表 6A から、「ORF1ab+N」の割合を「ORF1ab+N」と「ORF1ab+N+S」の割合の合計で割ることによって計算されます。表 6C では、表 6A の生データを入力として、コロナウイルス陽性である人口のそれぞれの割合 (「新しい UK 変異体と互換性のあるウイルス」、または「新しい UK 変異体と互換性のないウイルス」、または「識別できないほど低いウイルス」) について、モデル化された (平均平滑化および加重された)日次推定値を計算し、感染調査の以前の版をダウンロードすると、2020 年の以前の日付のデータも入手できます。この表では値 (m: %) として示されているアルファ変異体のモデル化された週平均値は、各週の記載されている 7 日間の「新しい UK 変異体と互換性のある割合」の平均を、「新しい UK 変異体と互換性のある割合」と「新しい UK 変異体と互換性のない割合」の合計で割って計算されます。[165] [166]
- ^ abcdefghij オーストリアでは、記載されているB.1.1.7変異体の割合は、ゲノム配列解析によりB.1.1.7であることが確認されたすべての陽性COVID-19検査の割合を表しています。しかし、多くのN501Y陽性RT-PCR検査はゲノム配列解析によってさらに変異体が決定されておらず、ゲノム配列解析が行われていれば、そのような検査の大部分でB.1.1.7陽性の結果が返されていた可能性があります。もしすべてのN501Y陽性検査がゲノム配列によってさらに分析されていたら、記載されている週ごとのB.1.1.7の割合は、第1週で9.6% （2.4%増）、第2週で23.8% （ 6.4%増）、第3週で19.6% （4.9%増）、第4週で28.6% （6.1%増）、第5週で37.2% （8.5%増）、第6週で45.4% （21.4%増）、第7週で58.1% （23.0%増）、第8週で65.3% （4.0%増）、第9週で68.0% （6.8%増）、第10週で73.7% （25.4%増）まで上昇していた可能性がある。[126]
- ^ スウェーデンでは、第4週の全国のSARS-CoV-2陽性PCRサンプルの11％を対象とした調査で、B.1.1.7の割合が10.8％（2244件中243件）であることが判明した。ただし、サンプルは5つの南部地域（スコーネ、ヴェストラ・イェータランド、ヴェストマンランド、イェヴレボリ、オレブロ）からのみ収集されており、スウェーデン全体の人口統計と地理を統計的に代表するものとは考えられていなかった。国家当局は、2021年2月の次の週に、毎週の調査を拡大してより多くの地域をカバーすることを計画している。[174] [133]
- ^ スウェーデンでは、第5週の全国のSARS-CoV-2陽性PCRサンプルの16%を対象とした調査で、B.1.1.7の割合が15.1%（488/3224）であることが判明した。しかし、サンプルは5つの南部地域（スコーネ、ヴェストラ・イェータランド、ヴェストマンランド、イェヴレボリ、オレブロ）からのみ収集されており、スウェーデン全体の人口統計と地理を統計的に代表するものとは考えられていなかった。国家当局はまた、21地域のうち19地域で2週間の平均（第5週+第6週）を計算し、2021年2月の次の週にはより多くの地域を対象に毎週の調査を拡大する予定である。[133]
- ^ スウェーデンでは、第6週の全国のSARS-CoV-2陽性PCRサンプルの18%を対象とした調査で、B.1.1.7の割合が27.3%（1021/3742）であることが判明した。しかし、サンプルは5つの南部地域（スコーネ、ヴェストラ・イェータランド、ヴェストマンランド、イェヴレボリ、オレブロ）からのみ収集されており、スウェーデン全体の人口統計と地理を統計的に代表するものとは考えられていなかった。国家当局はまた、21地域のうち19地域で2週間の平均（第5週+第6週）を計算し、2021年2月の次の週にはより多くの地域を対象に毎週の調査を拡大する予定である。[133]
- ^ スウェーデンでは、第7週の全国のSARS-CoV-2陽性PCRサンプルの47.8%を対象とした研究で、21地域のうち19地域（ゴットランド島とヴェステルボッテン島を除く）からサンプルを収集し、B.1.1.7の割合が単純な全体平均として30.4%（3316/10910）であることがわかりました（全体のサンプルにおける各地域の割合を正規化/補正するためのデータ重み付けが使用されていなかったため、計算において地理的に偏った誤った表現の可能性があります）。[86]
- ^ スウェーデンでは、第8週の全国のSARS-CoV-2陽性PCRサンプルの42.2%を対象とした研究で、21地域のうち19地域（ゴットランド島とヴェステルボッテン島を除く）からサンプルを収集し、B.1.1.7の割合が単純な全体平均として41.5%（4643/11191）であることがわかりました（全体のサンプルにおける各地域の割合を正規化/補正するためのデータ重み付けが使用されていなかったため、計算では地理的に偏った誤った表現の可能性があります）。[86]
- ^ スウェーデンでは、第9週の全国のSARS-CoV-2陽性PCRサンプルの37.8%を対象とした研究で、21地域のうち17地域（ゴットランド、ヴェステルボッテン、ノールボッテン、エステルイェートランドを除く）からサンプルを収集し、B.1.1.7の割合が単純な全体平均として56.4%（5939/10528）であることがわかりました（全体のサンプルにおける各地域の割合を正規化/補正するためのデータ重み付けが使用されていなかったため、計算では地理的に偏った誤った表現の可能性があります）。[86]
- ^ スウェーデンでは、第10週の全国のSARS-CoV-2陽性PCRサンプルの43.1%を対象とした研究で、21地域のうち18地域（ゴットランド、ヴェステルボッテン、エステルイェートランドを除く）からサンプルを収集し、B.1.1.7の割合が単純な全体平均として71.3%（8850/12417）であることがわかりました（全体のサンプルにおける各地域の割合を正規化/補正するためのデータ重み付けが使用されていなかったため、計算では地理的に偏った誤った表現の可能性があります）。[86]
参考文献
- ^ ab “B.1.1.7 レポート”. cov-lineages.org . 2021年1月29日閲覧。
- ^ 「SARS-CoV-2変異体の追跡」www.who.int . 2022年8月17日閲覧。
- ^ 「懸念される変異株」CDGN 。 2022年8月17日閲覧。
- ^ クプファーシュミット、カイ。「英国で変異コロナウイルスが警戒を呼ぶが、その重要性は不明のまま」。www.science.org。サイエンス。 2023年2月24日閲覧。
- ^ abcd ピーコック、シャロン（2020年12月22日）。「コロナウイルスの新しい変異体についてわかっていること」ガーディアン。
- ^ Donnelly, Laura (2021年1月26日). 「英国、世界中のCovid変異の配列を解析し、危険な新しい変異体を見つける」。The Telegraph。2022年1月11日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年1月28日閲覧。
- ^ レイチェル・シュラー（2020年12月22日）。「新型コロナ：英国の科学者の懸命な努力により新たな変異株が発見される」BBC。2021年1月30日閲覧。
- ^ サグデン、ジョアンナ（2021年1月30日）。「英国はいかにしてコロナウイルスゲノムの解析で世界的リーダーとなったか」ウォール・ストリート・ジャーナル。
- ^ ab 新型SARS-CoV-2変異株の調査 懸念される変異株202012/01: 技術ブリーフィング5 (PDF) (レポート)。イングランド公衆衛生局。2021年2月2日。 2021年2月2日閲覧。
- ^ abc Public Health England (2021年2月16日). 「変異株：症例データの分布」. Gov.UK. 2021年2月17日閲覧。
- ^ 「説明：WHOがインドで最初に発見されたCovid-19の変異株を「カッパ」と「デルタ」と名付けた理由 | インドニュース - タイムズ・オブ・インディア」タイムズ・オブ・インディア。2021年6月1日。 2021年6月2日閲覧。
- ^ 「WHO、関心と懸念のあるSARS-CoV-2変異株について、シンプルで発音しやすいラベルを発表」www.who.int 。 2021年6月6日閲覧。
- ^ これらの用語を使用しているニュースソースの広範なリストについては、UK Covid-19変異体、UKコロナウイルス変異体、UK変異体を参照してください。
- ^ abc Roberts, Michelle (2021年2月2日). 「英国の変異株が再び変異したと科学者らが発表」BBCニュース。 2021年2月2日閲覧。
- ^ Boseley, Sarah (2021年2月10日). 「変異したケント州の新型コロナ変異株は真剣に受け止めなければならない、と英国の科学者が警告」ガーディアン。 2021年2月10日閲覧。
- ^ ab 「『ケントではみんな違法レイブに行ったのか？』：新型コロナ捜査官とともに変異株を追跡」ガーディアン。2021年4月3日。 2022年9月23日閲覧。
- ^ 「PHE、COVID-19の新株を調査中」。イングランド公衆衛生局。2020年12月14日。
この記事には、British Open Government Licence v3.0 に基づいて公開されたテキストが組み込まれています。
- ^ 「変異株：症例データの分布」GOV.UK 2021年1月28日。「懸念される変異株と調査中の変異株の違い」にて。2021年2月19日閲覧。 この記事には、British Open Government Licence v3.0 に基づいて公開されたテキストが組み込まれています。
- ^ abcd Rambaut, Andrew; Loman, Nick; Pybus, Oliver; Barclay, Wendy; Barrett, Jeff; Carabelli, Alesandro; et al. (2020年12月19日). 英国で出現したSARS-CoV-2系統の予備的なゲノム特性評価は、一連のスパイク変異によって定義される（レポート）。COVID-19 Genomics Consortium UKに代わって執筆。2020年12月20日閲覧。
- ^ Callaway, Ewen (2021年1月15日). 「『血まみれの大混乱』：新型コロナの新たな変異体の命名をめぐり混乱が続く」Nature News & Comment . 589 (7842): 339. Bibcode :2021Natur.589..339C. doi : 10.1038/d41586-021-00097-w . PMID 33452513.
[...]スイスのベルン大学の分子疫学者、
エマ・ホドクロフト氏は
、SARS-CoV-2の命名活動「Nextstrain」に参加し、「英国変異体」を20I/501Y.V1と命名した。
- ^ スパイク変異株: アルファ変異株、別名 B.1.1.7、501Y.V1、20I/501Y.V1、および英国 COVID 変異株 2021 年 6 月 24 日、covdb.stanford.edu、2021 年 7 月 1 日にアクセス
- ^ abcd Wise, Jacqui (2020年12月16日). 「Covid-19: 英国で新たなコロナウイルス変異株が特定される」. BMJ . 371 : m4857. doi : 10.1136/bmj.m4857 . PMID 33328153. S2CID 229291003.
- ^ Chand et al.、5ページ。
- ^ 「デルタ変異株による頭痛と鼻水」BBCニュース。2021年6月14日。
- ^ 「迅速な評価により、ラテラルフローデバイスがCOVID-19の新たな変異体の検出に有効であることが確認された」Gov.UK。2020年12月27日閲覧。 この記事には、British Open Government Licence v3.0 に基づいて公開されたテキストが組み込まれています。
- ^ Patel-Carstairs, Sunita (2020年12月19日). 「COVID-19: ロンドンと南東部はティア4の規制対象に – 新たなCOVID変異株が「真の懸念材料」」スカイニュース。
- ^ 「急速に広がる変異株に対して、COVIDワクチンは『依然として有効』」メトロ。2020年12月20日。
- ^ 「ワクチンは新しいウイルス株に有効-ドイツ保健相」。インクワイアラー。AFP。2020年12月21日。
- ^ ab 「調査中のSARS-CoV-2変異体に関するNERVTAG会議：VUI-202012/01」。新興呼吸器ウイルス脅威諮問グループ。2020年12月18日。
- ^ ab 「COVID-19 (SARS-CoV-2): 新しいウイルス変異体に関する情報」。Gov.uk。イングランド公衆衛生局。2020年12月20日。 2020年12月21日閲覧。 この記事には、British Open Government Licence v3.0 に基づいて公開されたテキストが組み込まれています。
- ^ Brown, Faye (2021年2月9日). 「ブリストルで見つかった変異株が「懸念される変異株」に指定」Metro UK . 2021年2月10日閲覧。
- ^ Mandavilli, Apoorva (2021年3月5日). 「オレゴン州で科学者が懸念される突然変異を伴うウイルス変異体を発見」.ニューヨーク・タイムズ. ISSN 0362-4331. 2021年12月28日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年3月6日閲覧。
- ^ 「B.1.1.7 Lineage with S:E484K Report」。アウトブレイク。 2021年3月6日閲覧。
- ^ Volz E, Mishra S, et al. (2021年5月). 「イングランドにおけるSARS-CoV-2系統B.1.1.7の伝染性の評価」. Nature . 593 (7858): 266– 269. Bibcode :2021Natur.593..266V. doi : 10.1038/s41586-021-03470-x . hdl : 10044/1/87474 . ISSN 1476-4687. PMID 33767447. S2CID 232365193.
- ^ Davies NG、Abbott S、et al. (2021年4月9日). 「イングランドにおけるSARS-CoV-2系統B.1.1.7の推定伝染力と影響」. Science . 372 (6538): eabg3055. doi :10.1126/science.abg3055. PMC 8128288. PMID 33658326 .
- ^ Fort, Hugo (2021年8月). 「いくつかの国と世界でのSARS-CoV-2のアルファ変異体の急速な増加を説明する非常に単純なモデル」.ウイルス研究. 304 : 198531. doi :10.1016/j.virusres.2021.198531. PMC 8339456. PMID 34363849 .
- ^ Leung, Kathy; Shum, Marcus HH; Leung, Gabriel M; Lam, Tommy TY; Wu, Joseph T (2021年1月7日). 「2020年10月から11月にかけての英国におけるSARS-CoV-2のN501Y変異株の早期伝染性評価」。Eurosurveillance . 26 ( 1). doi :10.2807/1560-7917.ES.2020.26.1.2002106. PMC 7791602 . PMID 33413740.
- ^ Kraemer MU、Hill V、他。 （2021年7月22日）。 「SARS-CoV-2系統B.1.1.7出現の時空間侵入動態」。科学。373 (6557): 889–895。Bibcode :2021Sci...373..889K。土井：10.1126/science.abj0113。hdl : 10044/1/90624。ISSN 0036-8075。PMC 9269003。PMID 34301854。S2CID 236209853 。
- ^ Pinkstone, Joe (2021年7月23日). 「科学者はアルファ変異体の伝染性を過大評価していた」。The Telegraph。ISSN 0307-1235。 2022年1月11日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年8月10日閲覧。
- ^ van Dissel, Jaap (2021年2月24日). 「COVID-19 2e Kamer-briefing, 24 febr 2021」[コロナウイルスの動向に関する第2議会の技術ブリーフィング、2021年2月24日] (PDF) (オランダ語) 。2021年2月28日閲覧。
- ^ ab Ekspertrapport af den 21.februar 2021: smittetal og indlæggelser ved genåbningsscenarier d. の予知者。 1. マート [2021 年 2 月 21 日の専門家レポート: 3 月 1 日の再開シナリオにおける感染率と入院者数の予測] (PDF) (レポート) (デンマーク語)。スタテンス血清研究所。 2021 年 2 月 22 日。2021 年2 月 22 日に取得。
- ^ 「スイスにおけるSARS-CoV-2変異体の伝播」ベルン大学社会予防医学研究所（ISPM）。2021年3月5日。 2021年3月5日閲覧。
- ^ abc Volz E、Mishra S、et al. (2021年1月4日). 「イングランドにおけるSARS-CoV-2系統B.1.1.7の伝播：疫学データと遺伝学的データのリンクから得られた知見」medRxiv 10.1101/2020.12.30.20249034。
- ^ 「VUI-202012/01に関する新たな証拠と公衆衛生リスク評価の見直し」。2021年1月4日閲覧。
- ^ 「COG-UK ショーケースイベント」。YouTube 。 2020年12月25日閲覧。
- ^ フレデリック・グラボウスキー;プレイビッシュ、グジェゴシュ;ギジンスキ、スタニスワフ。コチャンチク、マレク。リプニアッキ、トマシュ（2021年3月1日）。 「懸念される SARS-CoV-2 変異体 202012/01 は約 2 倍の複製優位性を持ち、変異に関して獲得する」。ウイルス。13 (3): 392.土井: 10.3390/v13030392。PMC 8000749。PMID 33804556。
- ^ “UniProtKB - P0DTC2 (SPIKE_SARS2)”. UniProt . 2021年2月4日閲覧。
- ^ abcd National Public Health Emergency Team、保健省（2021年2月25日）。「NPHET COVID-19 Update – 2021年2月25日」（PDF）。新しい（B.1.1.7）変異体 - S遺伝子標的の失敗（p 31） 。 2021年3月4日閲覧。
{{cite web}}: CS1 maint: numeric names: authors list (link) - ^ Pylas, Pan (2021年1月2日). 「英国、感染者数57,725人で過去最高を突破、学校閉鎖を継続するよう要請」コロナウイルス。 2021年1月3日閲覧。
- ^ Mahase, Elisabeth (2020年12月23日). 「Covid-19: 英国における新たな変異株について何がわかったか?」BMJ . 371 : m4944. doi : 10.1136/bmj.m4944 . PMID 33361120. S2CID 229366003.
- ^カービー、トニー（2021年 2月）。「英国でSARS-CoV-2の新しい変異体がCOVID-19の急増を引き起こす」。ランセット呼吸器 医学。9（2）：e20- e21。doi：10.1016/S2213-2600（21）00005-9。PMC 7784534。PMID 33417829。
- ^ ab COG-UKによるSARS-CoV-2の特別な関心のあるスパイク変異に関する最新情報：レポート1 （PDF）（レポート）。COVID-19 Genomics UK Consortium（COG-UK）。2020年12月20日。7ページ。2020年12月22日時点のオリジナル（PDF）からアーカイブ。
- ^ COG-UK（2020年12月20日）、4頁。
- ^ Yi, C.; Sun, X.; Ye, J.; et al. (2020). 「ACE2および中和抗体と相互作用するSARS-CoV-2のスパイクタンパク質の受容体結合モチーフの重要な残基」. Cellular & Molecular Immunology . 17 (6): 621– 630. doi : 10.1038/s41423-020-0458-z . PMC 7227451. PMID 32415260 .
- ^ ab COG-UK（2020年12月20日）、1ページ。
- ^ abcd Chand et al.、6ページ。
- ^ Kemp, SA; Collier, DA; Datir, RP; Ferreira, IATM; Gayed, S.; Jahun, A.; et al. (2021). 「慢性感染症の治療中のSARS-CoV-2の進化」。Nature （加速 記事プレビュー）。592 （ 7853）：277– 282。doi ：10.1038/s41586-021-03291-y。PMC 7610568。PMID 33545711。S2CID 232113127 。
- ^ Shahhosseini, Nariman; Babuadze, George (Giorgi); Wong, Gary; Kobinger, Gary P. (2021年5月). 「懸念される新規SARS-CoV-2変異体の変異シグネチャとインシリコドッキング」.微生物. 9 (5): 926. doi : 10.3390/microorganisms9050926 . PMC 8146828. PMID 33925854.
- ^ Barton, Michael I; MacGowan, Stuart A; Kutuzov, Mikhail A; Dushek, Omer; Barton, Geoffrey John; van der Merwe, P Anton (2021年8月26日). Fouchier, Ron AM; Van der Meer, Jos W; Fouchier, Ron AM (編). 「SARS-CoV-2 Spike RBDとそのリガンドであるヒトACE2受容体の一般的な変異が結合親和性と速度論に及ぼす影響」. eLife . 10 : e70658. doi : 10.7554/eLife.70658 . ISSN 2050-084X. PMC 8480977 . PMID 34435953.
- ^ Challen R、Brooks-Pollock E、et al. (2021年3月9日). 「懸念されるSARS-CoV-2変異株202012/1に感染した患者の死亡リスク：マッチドコホート研究」. BMJ . 372 :n579. doi :10.1136/bmj.n579. PMC 7941603. PMID 33687922 .
- ^ ab Davies NG、Jarvis CI、et al. (2021年5月13日). 「SARS-CoV-2系統B.1.1.7のコミュニティ検査症例における死亡率の増加」。Nature . 593 ( 7858): 270– 274. Bibcode :2021Natur.593..270D. doi :10.1038/s41586-021-03426-1. ISSN 0028-0836. PMC 9170116 . PMID 33723411. S2CID 232245304.
- ^ Frampton D, Rampling T, et al. (2021年4月). 「英国ロンドンにおける新興SARS-CoV-2 B.1.1.7系統のゲノム特性と臨床効果：全ゲノム配列決定と病院ベースのコホート研究」. The Lancet Infectious Diseases . 21 (9): 1246– 1256. doi :10.1016/S1473-3099(21)00170-5. PMC 8041359 . PMID 33857406.
- ^ Graham MS、 Sudre CH、et al. (2021年5月)。「SARS-CoV-2変異体B.1.1.7に関連する症状、再感染、および伝染性の変化：生態学的研究」。The Lancet Public Health。6 （ 5 ）：e335- e345。doi ：10.1016 / S2468-2667 （21）00055-4。PMC 8041365。PMID 33857453。
- ^ abc 「新型コロナ：WHO、新たなウイルス変異種をめぐり英国と「緊密に連絡」」BBCニュース。2020年12月20日。
- ^ Berger, Miriam (2020年12月20日). 「ヨーロッパ各国、コロナウイルス変異に関する懸念から英国発着便を運休」ワシントンポスト. ISSN 0190-8286. 2020年12月20日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2020年12月20日閲覧。
- ^ 「英国の新たな変異株は『より致死的かもしれない』」BBCニュース。2021年1月22日。
- ^ Peter Horby、Catherine Huntley、Nick Davies、John Edmunds、Neil Ferguson、Graham Medley、Andrew Hayward、Muge Cevik、Calum Semple（2021年2月11日）。「COVID-19の懸念される変異株B.1.1.7に関するNERVTAGの論文：B.1.1.7の深刻度に関するNERVTAGの最新情報（2021年2月11日）」（PDF）。www.gov.uk。
- ^ ペストン、ロバート（2021年1月22日）。「ロバート・ペストンが知る、新型コロナの新たな株はより致死的かもしれない」ITVニュース。 2021年1月24日閲覧。
- ^ Challen, Robert; Brooks-Pollock, Ellen; Read, Jonathan M; Dyson, Louise; Tsaneva-Atanasova, Krasimira; Danon, Leon (2021年3月9日). 「懸念されるSARS-CoV-2変異株202012/1に感染した患者の死亡リスク：マッチドコホート研究」. BMJ . 372 :n579. doi :10.1136/bmj.n579. PMC 7941603. PMID 33687922 .
- ^ スタテンス血清研究所 (2021 年 2 月 24 日)。 「B.1.1.7 kan føre til flere indlæggelser」 [B.1.1.7 はさらに多くの入院を引き起こす可能性がある] (デンマーク語) 。2021 年2 月 25 日に取得。
- ^ ab Zinzula, Luca (2020). 「欠失により消失：SARS-CoV - 2の謎のORF8タンパク質」。 生化学および生物物理学的研究通信。538 ：116– 24。doi ：10.1016/j.bbrc.2020.10.045。PMC 7577707。PMID 33685621。
- ^ Kupferschmidt, Kai (2020年12月20日). 「英国で変異コロナウイルスが警戒を呼ぶが、その重要性は不明のまま」. Science . doi :10.1126/science.abg2626. S2CID 234564870.
また、COG-UK（2020年12月20日）4ページも参照してください：「69～70delは、免疫不全患者の免疫逃避に関連する変異体で特定されています...」 - ^ 「デンマークにおけるSARS-CoV-2のゲノム概要」。2021年1月30日。 2021年2月1日閲覧。
- ^ abc 国立公衆衛生環境研究所（RIVM） - 保健福祉スポーツ省（2021年3月23日）。「コロナウイルスSARS-CoV-2の変異体」www.rivm.nl。2021年3月23日閲覧。
- ^ abcdefg Borges, Vítor; et al. (2021年1月19日). 「ポルトガルにおけるSARS-CoV-2 VOC 202012/01（系統B.1.1.7）の拡散を追跡：全国RT-PCRスパイク遺伝子ドロップアウトデータからの洞察」。2021年3～10週目のデータを含む更新情報：2021年3月16日の記事の後に投稿。以前の更新の脚注では、SGTF+SGTL全体の91.8％（SGTFの約90％、SGTLの100％）がゲノム配列によってB.1.1.7変異体であることが確認されたと説明されている。B.1.1.7のシェアは、各週のSGTF+SGTLシェア全体の91.8％として計算された。 2021年3月16日閲覧。
- ^ abcd スイス国立COVID-19科学タスクフォース。「ゲノム特性評価」 。 2021年3月15日閲覧。
{{cite web}}: CS1 maint: numeric names: authors list (link) - ^ abcd 「スイスで懸念されるSARS-CoV-2変異株」IBZ Shiny 2021年1月。2021年2月17日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年2月18日閲覧。
- ^ データソース:
- デンマーク: [73]
- オランダ: [74]
- ポルトガル: [75]
- スイス：[76]
- イギリス: [77]
- アイルランド：[48]
- ^ abc 「英国におけるコロナウイルス（COVID-19）感染調査：2021年1月29日：10.英国の新しい変異株と一致する陽性検査」www.ons.gov.uk。2021年1月29日。 2021年2月1日閲覧。 この記事には、British Open Government Licence v3.0 に基づいて公開されたテキストが組み込まれています。
- ^ Walker, A. Sarah; Vihta, Karina-Doris; Gethings, Owen; Pritchard, Emma; Jones, Joel; House, Thomas; Bell, Iain; Bell, John I; Newton, John N; Farrar, Jeremy; Diamond, Ian; Studley, Ruth; Rourke, Emma; Hay, Jodie; Hopkins, Susan; Crook, Derrick; Peto, Tim; Matthews, Philippa C.; Eyre, David W.; Stoesser, Nicole; Pouwels, Koen B. (2021年1月15日). 「新しいSARS-CoV-2変異体による感染は増加するが、ウイルス量は増加しない」。medRxiv 10.1101/ 2021.01.13.21249721。
- ^ データソース:
- 英国国民（2021-01-21）: [77]
- 南東イングランド（2020-12-31）: [43]
- 英国諸国（2021-01-29）: [79]
- イングランドの地域（2021-01-15）: [80]
- ^ 「EU/EEAにおける懸念される新たなSARSCoV-2変異体の拡散に関連するリスク」（PDF） www.ecdc.europa.eu 2020年12月29日2021年2月1日閲覧。
- ^ abc Statens Serum Institut (2021年2月4日). 「Delta-PCR-testen」[デルタPCR検査] (デンマーク語) . 2021年2月11日閲覧。
- ^ Antonin Bal、Gregory Destras、Alexandre Gaymard、Karl Stefic、Julien Marlet、et al. (COVID-Diagnosis HCL研究グループ) (2021年1月21日). 「懸念されるSARS-CoV-2変異体202012/01およびスパイク欠失H69-V70を持つその他の変異体を特定するための2段階戦略; フランス; 2020年8月から12月」。Eurosurveillance . 26 ( 3). doi : 10.2807/1560-7917.ES.2021.26.3.2100008 . PMC 7848679 . PMID 33478625.
- ^ abcdef サンテ・パブリック・フランス（2021年3月11日）。 「COVID-19: Point épidémiologi que hebdomadaire du 11 mars 2021」 [COVID-19: 2021 年 3 月 11 日の週間疫学最新情報] (フランス語) 。2021 年3 月 12 日に取得。
- ^ abcdefg "Statistik om SARS-CoV-2virusvarianter av särskild betydelse" [懸念される SARS-CoV-2 変異体に関する統計] (スウェーデン語)。 Folkhälsomyndigheten。 2021 年 3 月 18 日。2021 年3 月 18 日に取得。
- ^ abc 「COVID-19週間疫学的アップデート、2021年3月23日」（PDF）。WHO。2021年3月23日。 2021年3月23日閲覧。
- ^ Younes M、Hamze K、et al. (2021年1月26日). 「レバノンにおけるB.1.1.7系統の出現と急速な拡散」medRxiv 10.1101/2021.01.25.21249974。
- ^ Younes M、Hamze K、et al. (2021年3月17日). 「B.1.1.7がレバノンで優勢な変異株となった」medRxiv 10.1101/2021.03.17.21253782。
- ^ Higgins-Dunn, N. (2020年12月19日). 「英国は、より急速に広がる新しいCovid-19株を特定しました。彼らが知っていることは次のとおりです」。MSNBC。
- ^チーム、The Lockdown Files（2023年3月9日）。「クリスマスを台無しにしたCovidの変異種、科学者らは数か月間大臣らから隠していた」。The Telegraph。ISSN 0307-1235。2023年3月13日閲覧。
- ^ 「COVID-19 Genomics UK (COG-UK) コンソーシアム - ウェルカムサンガー研究所」www.sanger.ac.uk . 2020年12月23日閲覧。
- ^ ギャラガー、ジェームズ（2020年12月20日）。「新しいコロナウイルス変異株：私たちは何を知っているのか？」BBCニュース。 2020年12月21日閲覧。
- ^ Ross, T.; Spence, E. (2020年12月19日). 「英国が新型ウイルスと戦う中、ロンドンが緊急ロックダウンを開始」ブルームバーグニュース。
- ^ 「変異株 - 症例データの分布：2021年1月25日までのデータ」。Gov.uk。イングランド公衆衛生局。2021年1月26日。 2021年1月27日閲覧。 この記事には、British Open Government Licence v3.0 に基づいて公開されたテキストが組み込まれています。
- ^ ab Public Health England (2021年2月1日). 「新型SARS-CoV-2変異体の調査：202012/01。技術ブリーフィング5データ」。データレポート-「図1」は、SGTF+KentシェアとNot SGTF+Kentシェアを加算して、VOC202012/01の全ゲノム配列の週ごとの割合を示しています。レポートでは、VOC202012/01の略称として「Kent」という単語を使用しています。 2021年2月5日閲覧。 この記事には、British Open Government Licence v3.0 に基づいて公開されたテキストが組み込まれています。
- ^ ab "(09.03.2021 Г.) ЕПИДЕМИЯ ОТ ОСТЪР РЕСПИРАТОРЕН СИНДРОМ, СВЪРЗАНА С НОВ КОРОНАВИРУС SARS-COV-2、УХАН、КИТАЙ: АКТУАЛНА ИНФОРМАЦИЯ」 [(09.03.2021) 急性呼吸器新型コロナウイルスSARS-COV-2に関連した症候群の流行、中国・武漢：実際の情報] (in （ブルガリア語）2021年3月3日。 2021年3月10日閲覧。
- ^ Kovacova, V.; et al. (2021年2月5日). 「系統B.1.1.7を残りのSARS-CoV-2系統と区別するための、新しい室温で安定したマルチプレックスRT-qPCRアッセイ」。virological.org 。 2021年2月21日閲覧。
- ^ ab Ján Mitos、hlavný hygienik Slovenskej Republiky (2021 年 3 月 9 日)。 「Britskývariant Potvrdený na Slovensku v 90% vyšetrených vzoriek」[検査サンプルの 90% でスロバキアで英国の変異種が確認された] (スロバキア語)。スロバキア共和国公衆衛生局。 2021年5月13日のオリジナルからアーカイブ。2021 年3 月 17 日に取得。
- ^ “Aktuálna epidemiologická situácia na Slovensku (prezentácia, 8. január 2021)” [スロバキアの現在の疫学状況 (プレゼンテーション、2021 年 1 月 8 日)] (PDF) (スロバキア語)。スロバキア共和国公衆衛生局。 2021 年 1 月 9 日。2021年 7 月 14 日のオリジナル(PDF)からアーカイブされました。2021 年2 月 21 日に取得。
- ^ 「プレスリリース：英国で見つかったCOVID-19変異株の4例がイスラエルで発見される」保健省。2020年12月23日。 2021年2月26日閲覧。
- ^ abc エイドリアン・パイロット (2021年1月5日)。 「המוטציה הבריטית נמצאת ב-10% עד 20% ממאומתי הקורונה」［英国の変異株は全国のコロナの10～20％］（ヘブライ語）。カルカリスト。2021 年2 月 26 日に取得。
- ^ ab Toi Staff (2021年2月2日). 「イスラエルの専門家は、我々はCOVID-19と長い間付き合わなければならないだろうと語る」 Times of Israel . 2021年2月26日閲覧。
- ^ ab Ynet (2021年2月16日). 「上級保健当局者：COVID-19症例の90％は英国の変異株が原因」 。 2021年2月25日閲覧。
- ^ ab Laboratoire National de Santé (LNS) (2021年3月18日). “Respiratory Viruses Surveillance – REVILUX: Respiratory Viruses Sentinelle Newsletter, REVILUX bulletin hebdomadaire” [Respiratory Viruses Surveillance – REVILUX: Respiratory Viruses Sentinelle Newsletter, REVILUX weekly update]. 2021年12月17日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年3月18日閲覧。
- ^ ab "Status for udvikling af SARS-CoV-2 Variants of Concern (VOC) i Danmark" [デンマークにおけるSARS-CoV-2 Variants of Concern (VOC) の発生状況] (デンマーク語)。Statens Serum Institut。2021年3月20日。 2021年3月20日閲覧。
- ^ Notat om prognoser for smittetal og indlæggelser ved scenarier for genåbning af 0.-4. klasse i grundskolen [小学校の 0 年生から 4 年生のクラス再開シナリオにおける感染率と入院者数の予測に関する覚書] (PDF) (レポート) (デンマーク語)。スタテンス血清研究所。 2021 年 1 月 31 日。2021 年2 月 2 日に取得。
- ^ 「デンマークにおけるSARS-CoV-2 変異株（VOC）の発生状況」（デンマーク語）。Status of development of SARS-CoV-2 Variants of Concern (VOC) in Danmark（デンマーク語）。Statens Serum Institut。2021年3月12日。 2021年3月20日閲覧。
- ^ 「デンマークにおけるSARS-CoV-2 変異株（VOC）の発生状況」（デンマーク語）。Status of development of SARS-CoV-2 Variants of Concern (VOC) in Danmark（デンマーク語）。Statens Serum Institut。2021年3月19日。 2021年3月20日閲覧。
- ^ ファン・フォルクスゲゾントハイト大臣、Welzijn en Sport (2021年2月23日)。 「Advies VWS na OMT 101」 [新型コロナウイルス感染症に関する第 101 回 OMT 後の VWS からのアドバイス] (PDF)。overheid.nl (オランダ語) 。2022 年4 月 13 日に取得。
- ^ ab Folkehelseinstituttet (2021年3月3日). 「COVID-19 Ukerapport – uke 8, onsdag 3. mars 2021」[COVID-19 週報 第8週（2021年3月3日水曜日）] (PDF) (ノルウェー語). 2021年11月19日時点のオリジナル(PDF)からアーカイブ。 2021年3月4日閲覧。
- ^ abc Folkehelseinstituttet (2021年3月17日). 「COVID-19 Ukerapport – uke 10, onsdag 17. mars 2021」[COVID-19 週報 第10週（2021年3月17日水曜日）] (PDF) (ノルウェー語). 2021年3月17日時点のオリジナル(PDF)からアーカイブ。 2021年3月17日閲覧。
- ^ Folkehelseinstituttet (2021 年 2 月 26 日)。 「Statistikk over meldte tilfeller av den engelske og den sør-afrikanskevarianten av coronavirus」[英語および南アフリカのコロナウイルス変異種の報告症例に関する統計] (ノルウェー語) 。2021 年2 月 28 日に取得。
- ^ Folkehelseinstituttet (2021 年 2 月 27 日)。 「Engelskvirusvariant dominerer i Oslo og Viken」[英語のウイルス亜種はオスロとビケンで優勢] (ノルウェー語)。 2021年4月17日のオリジナルからアーカイブ。2021 年2 月 28 日に取得。
- ^ Instituto Nacional de Saúde (INSA)、ドトール・リカルド・ホルヘ (2021 年 2 月 5 日)。 「Diversidade genética do novo コロナウイルス SARS-CoV-2 (COVID-19) em Portugal」[ポルトガルにおける新型 SARS-CoV-2 コロナウイルス (COVID-19) の遺伝的多様性] (PDF) (ポルトガル語) 。2021 年2 月 7 日に取得。
- ^ Instituto Nacional de Saúde (INSA)、ドトール・リカルド・ホルヘ (2021 年 3 月 3 日)。 「Diversidade genética do novo コロナウイルス SARS-CoV-2 (COVID-19) em Portugal (3 de Março de 2021)」 [ポルトガルにおける新型 SARS-CoV-2 コロナウイルス (COVID-19) の遺伝的多様性 (2021 年 3 月 3 日) ] (PDF) (ポルトガル語) 。2021 年3 月 4 日に取得。
- ^ ab Istituto Superiore di Sanità (2021 年 2 月 15 日)。 「イタリアにおける Prevalenza dellavariante VOC 202012/01、系統 B.1.1.7 (Studio di prevalenza 4-5 febbraio 2021)」 [イタリアにおける VOC 変異 202012/01、系統 B.1.1.7 の有病率 (有病率調査 2 月) 4–5、2021)] (イタリア語) 。2021 年2 月 17 日に取得。
- ^ ab Istituto Superiore di Sanità (2021 年 3 月 2 日)。 「CS N° 14/2021 - イタリアでは 54% delle infezioni dovute a 'variante inglese'、il 4,3% a quella 'brasiliana' e lo 0,4% a quella 'sudafricana'」 [CS N° 14/ 2021年 - イタリアでは感染の54%が「英語変異体」によるもの、4.3%が「英語変異体」によるもの「ブラジル」のもの、「南アフリカ」のものに0.4％]（イタリア語）。2021 年3 月 5 日に取得。
- ^ 「Wissenschaftliches update 09 februar 2021」[2021年2月9日の科学的アップデート]（ドイツ語）。スイス国立COVID-19タスクフォース。2021年2月9日。 2021年2月17日閲覧。
- ^ abcd Sciensano (2021年3月19日)。 「Covid-19 Wekelijks Epidemiologisch Bulletin (19 Maart 2021)」 [Covid-19 Weekly Epidemiological Bulletin (19 March 2021)] (PDF)。SARS-CoV-2 の分子監視 (p.20-22) (オランダ語) 。2021 年3 月 19 日に取得。
- ^ abc サイエンサーノ (2021 年 2 月 19 日)。 「Covid-19 Wekelijks Epidemiologisch Bulletin (2021 年 2 月 19 日)」[Covid-19 Wekelijks Epidemiologisch Bulletin (2021 年 2 月 19 日)] (PDF)。SARS-CoV-2 の分子監視 (p.21-24) (オランダ語) 。2021 年2 月 25 日に取得。
- ^ 「フランスにおけるVOC-202012/01株の優勢推定日と予測シナリオ」（PDF）。2021年1月16日。
- ^ ab Santé Publique France (2021 年 1 月 28 日)。 「COVID-19: Point épidémiologi que hebdomadaire du 28 janvier 2021」 [COVID-19: 2021 年 1 月 28 日の週間疫学最新情報] (フランス語) 。2021 年2 月 1 日に取得。
- ^ abc サンテ パブリック フランス (2021 年 3 月 4 日)。 「COVID-19: Point épidémiologi que hebdomadaire du 4 mars 2021」 [COVID-19: 2021 年 3 月 4 日の週間疫学最新情報] (フランス語) 。2021 年3 月 5 日に取得。
- ^ abc サンテ パブリック フランス (2021 年 3 月 18 日)。 「COVID-19: Point épidémiologi que hebdomadaire du 18 mars 2021」 [COVID-19: 2021 年 3 月 18 日の週間疫学最新情報] (フランス語) 。2021 年3 月 21 日に取得。
- ^ abcd 「エスターライヒのSARS-CoV-2-Varianten」（ドイツ語）。 Österreichische Agentur für Gesundheit und Ernährungssicherheit GmbH (AGES)。 2021 年 3 月 19 日。2021 年3 月 19 日に取得。
- ^ abc "Aktualisierter Bericht zu Virusvarianten von SARS-CoV-2 in Deutschland, insbesondere zur Variant of Concern (VOC) B.1.1.7: Stand: 17. März 2021" [SARS-CoV-2 のウイルス変異体に関する最新レポートドイツ、特に懸念される変異体（VOC）についてB.1.1.7: 2021 年 3 月 17 日現在] (PDF)。www.rki.de/DE/Content/InfAZ/N/Neuartiges_Coronavirus/DESH/Berichte-VOC-tab.html (ドイツ語)。ロベルト・コッホ研究所 (Bundesinstitut im Geschäftsbereich des Bundesministeriums für Gesundheit)。 2021 年 3 月 17 日。2021年3月20日閲覧。
- ^ ab 「マルタで新たなCOVID変異株3例検出」。タイムズ・オブ・マルタ。2020年12月30日。
- ^ Laura Calleja (2021年2月24日). 「COVID-19: バーやバンドクラブは3月も閉鎖のまま、クリス・ファーン氏が語る」. マルタ・トゥデイ. 2021年3月13日閲覧。
- ^ 「マルタ、新型コロナの変異株を特定できる新たなスワブ検査を導入へ」マルタ・インディペンデント、2021年3月4日。 2021年3月13日閲覧。
- ^ ab Claire Farrugia (2021年3月10日). 「英国の新型コロナ新規感染者の60%に変異種が検出」Times of Malta . 2021年3月10日閲覧。
- ^ Folkhälsomyndigheten (2021 年 2 月 4 日)。 「シナリオ・フォー・フォートサット・スプリドニング – 暫定協定」[継続的な普及のためのシナリオ – 中間報告書] (スウェーデン語) 。2021 年2 月 8 日に取得。
- ^ abcd "Publicerad statistik för SARS-CoV-2virusvarianter av särskild betydelse under vecka 8 2021" [2021 年第 8 週の懸念される SARS-CoV-2 変異体に関する統計] (スウェーデン語)。 Folkhälsomyndigheten。 2021年3月15日。2021年10月11日のオリジナルからアーカイブ。2021 年3 月 15 日に取得。
- ^ ab 「COVID-19 スイス 2021年3月18日現在の状況に関する情報：主要な数値、リヒテンシュタイン」。データのダウンロード：.csvファイルのデータ。連邦保健局。2021年3月18日。 2021年3月18日閲覧。
- ^ ab 「スペイン保健省、英国変異株がスペインの陽性者最大10%を占めると推定」murciatoday.com 2021年1月30日2021年2月3日閲覧。
- ^ アルバロ・ソト (2021年2月18日)。 「Lavariante británica replacea ya el 20% de los casos en España」[イギリス型はすでにスペインの感染者数の20%を占めている]。msn.com (スペイン語) 。2021 年2 月 22 日に取得。
- ^ ab "Autoridades sanitarias afirmaron que la cepa británica circula "ampliamente" en España" [保健当局は英国株がスペインで「広く」循環していると断言した] (スペイン語)。テラム。 2021 年 2 月 18 日。2021 年3 月 17 日に取得。
- ^ ab マヌエル・ビラセロ (2021 年 2 月 22 日)。 「Detectadas en España las nuevasvariantes nigeriana y de Río de Janeiro del コロナウイルス」[スペインで検出されたコロナウイルスのナイジェリアとリオデジャネイロの新しい変異種] (スペイン語) 。2021 年3 月 1 日に取得。
- ^ ab ミゲル・イダルゴ・ペレス (2021 年 3 月 3 日)。 「ダリアス：「Lavariante británica ya es la dominante en España」」 [ダリアス：「スペインではイギリスの変種がすでに主流となっている」]（スペイン語）。2021 年3 月 17 日に取得。
- ^ ab "Actualización de la situación epidemiológica de lasvariants de importancia en salud pública en España (18 de marzo de 2021)" [スペインにおける公衆衛生において重要な変異株の疫学状況の最新情報 (2021 年 3 月 18 日)] (PDF)（スペイン語で）。サニダード大臣、消費者とビエネスター社会。 2021 年 3 月 18 日。2021 年3 月 18 日に取得。
- ^ エイドリアン・ダベック (2021年2月11日)。 「Brytyjski warant coronawirusa - jaka jest skala jego obecności w Polsce?」 [コロナウイルスの英国型変異体 - ポーランドにおけるその存在の規模はどれくらいですか?] (ポーランド語)。メドネット。2021 年2 月 17 日に取得。
- ^ 欧州疾病予防管理センター（2021年2月15日）。「迅速リスク評価：EU/EEAにおけるSARS-CoV-2の懸念される変異株の循環増加とワクチン展開、第14回更新、2021年2月15日」（PDF）。www.ecdc.europa.eu。2021年2月18日閲覧。
- ^ “Od 20 marca w całej Polsce obowiązują rozszerzone zasady bezpieczeństwa” [3 月 20 日より、拡張安全規則がポーランド全土に適用される]。gov.pl (ポーランド語)。ポーランド政府。 2021 年 3 月 17 日。2021 年3 月 17 日に取得。
- ^ ab シルウィア・ダブコウスカ＝ポジツカ;エディタ・ロス。ウィクトリア・ニカレク。カロル・コストジェワ。アレクサンドラ・レベリンスカ（2021年3月17日）。 「Nowe obostrzenia w calym kraju od 20 marca do 9 kwietnia」【3月20日から4月9日まで全国で新たな規制】。pap.pl (ポーランド語)。ポルスカ アジェンチャ プラソワ。2021 年3 月 17 日に取得。
- ^ ピョートル・カララス (2021年3月2日)。 「Brytyjski wariant oronawirusa może dominować na Pomorzu」[コロナウイルスのイギリス型変異株がポメラニアで優勢である可能性がある]。trojmiasto.pl (ポーランド語) 。2021 年3 月 17 日に取得。
- ^ “コロナウイルス。Brytyjski wariant w Wielkopolsce. Najnowsze dane” [コロナウイルス。グレーターポーランドにおけるイギリスの変種。最新データ】。Onet.pl (ポーランド語)。 2021 年 3 月 17 日。2021 年3 月 17 日に取得。
- ^ 終了健康福祉研究所、TLH (2021 年 2 月 17 日)。 「Uppföljning av hybridstrategin för covid-19-epidemin: Separat översikt, varierande tema (Uppföljning av muterade コロナウイルス 17.2.2021)」 [新型コロナウイルス感染症流行に対するハイブリッド戦略のフォローアップ: 個別の概要、さまざまなテーマ (フォローアップ)変異したコロナウイルスの影響 2021 年 2 月 17 日)] (inスウェーデン語）。 2021年7月14日のオリジナルからアーカイブ。2021 年3 月 2 日に取得。
- ^ 「フィンランドで広がる英国のコロナ変異種」Yle。2021年2月14日。 2021年3月2日閲覧。
- ^ Jelena Ćirić (2021年3月4日). 「アイスランドのCOVID-19：国境で南アフリカの変異株が検出」. アイスランドレビュー. 2021年3月13日閲覧。
- ^ Washington NL、Gangvarapu K、et al. (2021年2月7日)。「ゲノム疫学により、米国におけるSARS-CoV-2 B.1.1.7の出現と急速な伝播が特定」medRxiv 10.1101/2021.02.06.21251159v1。
- ^ CDC (2020年3月28日). 「COVIDデータトラッカー」.米国疾病予防管理センター. 2021年4月30日閲覧。
- ^ Galloway SE、Paul P、et al. (2021年1月22日). 「SARS-CoV-2 B.1.1.7系統の出現 — 米国、2020年12月29日〜2021年1月12日」。疾病 および死亡週報。70 (3): 95– 99。doi :10.15585/ mmwr.mm7003e2。PMC 7821772。PMID 33476315。
- ^ 「さらなるコロナの謎」ニューヨーク・タイムズ。2021年7月30日。
- ^ Aziz, Saba (2020年12月27日). 「カナダ、英国のコロナウイルス変異株の初症例を報告。知っておくべきこと」グローバルニュース。 2021年2月14日閲覧。
- ^ トンプソン、ニコール（2021年2月13日）。「COVID-19の伝染性変異体が現在10州すべてで特定されている」。ザ・スターフェニックス。カナディアン・プレス。 2021年2月14日閲覧。
- ^ ab 「アルバータ州で変異株の症例がさらに多く確認されているのに、オンタリオ州でより多く発生していると考えられる理由 | CBCニュース」CBC 。 2021年4月1日閲覧。
- ^ 「懸念されるSARS-CoV-2変異株」（PDF）。アルバータ州保健サービス。
- ^ 「カナダにおける懸念される変異株（VOC）」カナダ政府。2020年4月19日。 2021年3月24日閲覧。
- ^ 「懸念されるSARS-CoV-2変異株：時点有病率調査の結果」（PDF）。オンタリオ州公衆衛生局。2021年2月12日。 2021年3月13日閲覧。
- ^ Barbara Yaffe (2021年2月16日). 「コロナウイルス：オンタリオ州保健当局は、検査された症例の約7％が州内の変異株によるものだと述べている」グローバルニュース。 2021年3月13日閲覧。
- ^ 「オンタリオダッシュボード：懸念される新たな変異株の正体を明らかにする」。オンタリオ州COVID-19科学諮問委員会。2021年3月16日。2021年3月17日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年3月16日閲覧。
- ^ Kalina Laframboise (2021年2月17日). 「3月までにモントリオールで感染力の強いCOVID-19変異株が優勢になる可能性：INSPQ」. Global News . 2021年3月13日閲覧。
- ^ イングランド公衆衛生局（2021年3月11日）。「イングランドで懸念されるSARS-CoV-2変異株の調査：技術ブリーフィング7」（PDF）。SGTFによるイングランドのピラー2のCOVID-19症例の週ごとの数と割合（図10） 。 2021年3月12日閲覧。
- ^ Public Health England (2021年2月13日). 「イングランドで懸念されるSARS-CoV-2変異株の調査：技術ブリーフィング6」（PDF） . 2021年第4週以降、VOC 202012/01であるピラー2のΔ69-70配列の割合（表7）。100%の値が記録されている。2021年2月14日閲覧。
- ^ abc Public Health England (2021年3月19日). 「データセット：コロナウイルス（COVID-19）感染調査」。表6A：英国のCOVID-19症例の割合とサイクル閾値（Ct）値。表6C：英国の新しい変異体と互換性がある、新しい英国の変異体と互換性がなく、変異体を識別できないほどウイルスが低すぎる、モデル化された毎日の陽性推定値、英国。 2021年3月19日閲覧。 この記事には、British Open Government Licence v3.0 に基づいて公開されたテキストが組み込まれています。
- ^ abc Public Health England (2021年3月19日). 「英国におけるコロナウイルス（COVID-19）感染調査：2021年3月19日」 。 2021年3月19日閲覧。 この記事には、British Open Government Licence v3.0 に基づいて公開されたテキストが組み込まれています。
- ^ Ido Efreti (2021年1月12日). 「コロナウイルスライブ：イスラエル、ワクチン接種14日後に感染者数が減少（午後4時50分 変異はイスラエルの最近のCOVID-19感染者の最大20％を占める）」. Haaretz . 2021年2月26日閲覧。
- ^ 「上級保健当局者：英国のウイルス変異種、妊婦にさらなるリスク」www.timesofisrael.com 2021年1月21日2021年1月23日閲覧。
- ^ スチュアート・ワイナー（2021年1月25日）。「保健当局：英国の変異株が猛威を振るい、心配な割合で子供たちを襲っている」。タイムズ・オブ・イスラエル。 2021年2月25日閲覧。
- ^ Maayan Lubell、Ari Rabinovitch（2021年2月9日）。「ワクチン対変異株：パンデミック克服に向けたイスラエルの競争における有望なデータ」ロイター。 2021年2月26日閲覧。
- ^ Folkehelseinstituttet (2021年2月24日). 「COVID-19週報 – uke 7, onsdag 24. februar 2021」[COVID-19週報第7週（2021年2月24日水曜日）] (PDF) (ノルウェー語). 2021年5月6日時点のオリジナル(PDF)からアーカイブ。 2021年2月28日閲覧。
- ^ Santé Publique フランス (2021 年 2 月 18 日)。 「COVID-19: Point épidémiologi que hebdomadaire du 18 février 2021」 [COVID-19: 2021 年 2 月 18 日の週間疫学最新情報] (フランス語) 。2021 年2 月 20 日に取得。
- ^ ab Santé Publique France (2021 年 2 月 25 日)。 「COVID-19: Point épidémiologi que hebdomadaire du 25 février 2021」 [COVID-19: 2021 年 2 月 25 日の週間疫学最新情報] (フランス語) 。2021 年2 月 26 日に取得。
- ^ “Stickprov tyder på ökad spridning av den brittiskavirusvarianten i Sverige” [ランダムサンプルは、スウェーデンにおけるイギリスのウイルス変異種の拡散増加を示している] (スウェーデン語)。Folkhälsomyndigheten。 2021年2月2日。2021年5月12日のオリジナルからアーカイブ。2021 年2 月 2 日に取得。
- ^ abc Helix. 「Helix® COVID-19 監視ダッシュボード」。S遺伝子標的不全 (SGTF) の傾向、インタラクティブ データ マップ: B.1.1.7 の週次シェアは、週の毎日の B.1.1.7 シェアの平均として計算されます。毎日の B.1.1.7 シェアは、「毎日の陽性サンプルの SGTF の割合」と「シーケンスされた SGTF 陽性の B.1.1.7 の割合」を掛けて算出されます。2021年3 月 17 日閲覧。
- ^ ab 「変異株の追跡：VUI202012/01 GR/501Y.V1（B.1.1.7）」GISAID 。 2021年2月19日閲覧。
- ^ ab ヘンリー、ジョン、ジョーンズ、サム、ジュフリーダ、アンジェラ、ホームズ、オリバー（2020年12月20日）。「EU、新型コロナの新型ウイルスをめぐり英国からの渡航を各国がブロックする中、危機協議を開催へ」ガーディアン。
- ^ ホープ、アラン（2020年12月20日）。「オランダ、新型コロナの変異により英国発着便を禁止」ブリュッセルタイムズ。
- ^ “Coronavirus, in Italia un soggetto positivo allavariante inglese” [コロナウイルス、イタリアで英語変異株の検査で 1 人が陽性]。ラ・レプッブリカ（イタリア語）。 2020年12月20日。
- ^ ケランド、ケイト（2020年12月21日）。「解説 - 英国の新たなコロナウイルス変異株：どれほど心配か？」ロイター。
- ^ スクワイアズ、ニック、オレンジ、リチャード（2020年12月21日）。「ジブラルタルからオーストラリアまで、世界中で新たなコロナウイルス株が検出される」。テレグラフ。2022年1月11日時点のオリジナルよりアーカイブ。
- ^ 「シンガポール、英国から最近帰国した17歳の学生が英国由来の新型コロナ株の初感染者と確認」ザ・ストレーツ・タイムズ。2020年12月23日。 2020年12月24日閲覧。
- ^ 「イスラエル、新型コロナの新たな変異株の感染例を4件確認」ガーディアン紙、2020年12月23日。
- ^ モリアーティ、ジェリー（2020年12月23日）。「北アイルランドで新型コロナウイルスの英国変異株の初感染例を確認」アイリッシュ・タイムズ。 2020年12月24日閲覧。
- ^ バーガー、ルートヴィヒ（2020年12月24日）。「ドイツ、英国でコロナウイルス変異株が広がる最初の症例を報告」ロイター。
- ^ “新型コロナウイルス感染症19: Nouvellevariante du cancerdécouverte dans deux échantillons en Swiss” [新型コロナウイルス感染症19: スイスの2つのサンプルで発見されたコロナウイルスの新たな変異種] (フランス語)。連邦公衆衛生局 (スイス)。 2020年12月24日。
- ^ Moloney, Eoghan (2020年12月25日). 「アイルランドで新型コロナの新たな英国変異種が確認される一方、新規感染者1,025人と死亡者2人が確認される」Irish Independent 。 2020年12月25日閲覧。
- ^ グラハム・ハリソン、エマ（2020年12月25日）。「日本、英国でコロナウイルス変異株5例発見と報告」ガーディアン。
- ^ 「オンタリオ州、州内で初のCOVID-19英国変異株感染例を確認」カナダ放送協会（CBCニュース）。2020年12月26日。
- ^ 「コロナウイルス：欧州で新たなCovid変異株の症例がさらに見つかる」BBC。2020年12月26日。 2020年12月26日閲覧。
- ^ 「フランス、レバノン、新型コロナウイルス変異株の初感染者を確認」アルジャジーラ、2020年12月26日。 2020年12月26日閲覧。
- ^ “Fall av den brittiskavirusvarianten upptäckt i Sverige” [スウェーデンで発見された英国ウイルス変異体の事例] (スウェーデン語)。 SVT。 2020年12月26日。
- ^ 「ノルウェー、ポルトガル、英国からの旅行者にコロナウイルス変異株の初感染を確認」。Newshub。2020年12月27日。2020年12月30日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2020年12月28日閲覧。
- ^ 「ヨルダン、コロナウイルス変異株2例を発見：大臣」ガルフニュース。2020年12月27日。 2020年12月28日閲覧。
- ^ 「フィンランドで新たな英国変異株のCovid株が検出」Yle News。2020年12月28日。
- ^ 「韓国、COVID変異株の症例を報告 ― 英国から来たと主張」スカイニュース、2020年12月28日。
- ^ 「チリで新型コロナウイルスの英国変異株の初感染例が確認 保健省」ロイター2020年12月29日。
- ^ 「コロナウイルス：インド、新たなCovid変異株の症例を6件確認」BBCニュース。2020年12月29日。
- ^ 「パキスタンで新型コロナの新たな株の初確認例が検出」ヒンドゥスタン・タイムズ、2020年12月29日。
- ^ 「UAEの新型コロナ：これまでにわかっていること」Khaleej Times。2020年12月30日。
- ^ 「台湾、英国で見つかった新型コロナウイルス変異株の初感染例を報告」サウスチャイナ・モーニング・ポスト、2020年12月30日。
- ^ 「中国、英国コロナウイルス変異株の初感染例を確認」France24. 2020年12月31日。
- ^ 「ブラジル、英国で発見された新型コロナウイルス変異株の2例を検出」ロイター2020年12月31日。
- ^ タイ王国クヌーセン (2020 年 12 月 20 日)。 「Dansk Oxford-professor: Danmark skal gore alt for, at nyvirusvariant ikke spreder sig」 [デンマークのオックスフォード教授: デンマークは新しいウイルスの変異種が広がらないようにあらゆることをしなければならない] (デンマーク語)。DR。
参照：「グローバルシークエンシングカバレッジ」。covidcg.org 。 2020年12月23日閲覧。 - ^ マンダビリ、アプールバ、ランドラー、スティーブン・キャッスル（2020年12月20日）。「科学者らはコロナウイルスの変異について冷静になるよう促すが、これは予想外ではない」ニューヨーク・タイムズ。
- ^ Casiano, Louis (2020年12月29日). 「コロラド州保健当局、州内で新たなCOVID-19変異株を確認」. Fox News . 2020年12月29日閲覧。
- ^ マイケル・ネデルマン（2021年1月6日）。「CDCは英国で最初に特定されたコロナウイルス変異体の米国での症例を50件以上発見」CNN 。 2021年1月7日閲覧。
- ^ ライマン、ニコラス（2021年1月8日）。「『最悪のシナリオに近い』―元CDC長官が新型コロナの『恐ろしい』見通しを発表」フォーブス。 2021年1月15日閲覧。
- ^ “Son dakika haberi... Bakan Koca açıkladı, 15 kişide mutasyonlu virüs! İngiltere'den irişler tamamen durduruldu” 【速報…コジャ大臣発表、15人に変異ウイルス！英国からの入国は完全に停止されている] (ビデオ)。CNN トルコ。2021 年1 月 4 日に取得。
- ^ “SSI: Meget smitsom コロナ変異 fra England spreder sig i Danmark” [SSI: イングランド発の非常に感染力の高いコロナ変異 [原文ママ] がデンマークで広がる]。DR（デンマーク語）。 2021 年 1 月 2 日。2021 年1 月 3 日に取得。
- ^ “Udvikling i smitte med engelskvirusvariant af SARS-COV-2 (cluster B.1.1.7)” [SARS-COV-2 の英語のウイルス変異体 (クラスター B.1.1.7) による感染の展開] (PDF) (デンマーク語で）。スタテンス血清研究所。 2021 年 1 月 1 日。2021 年1 月 2 日に取得。
- ^ “Status for udvikling af B.1.1.7 i Danmark d. 17. januar 2021” [2021 年 1 月 17 日のデンマークにおける B.1.1.7 の進行状況].スタテンス血清研究所。 2021年1月18日のオリジナルからアーカイブ。2021 年1 月 19 日に取得。
- ^ 「ベトナム、英国から帰国した女性に新型コロナウイルス変異株の初感染を報告」。テレグラフ。2021年1月2日。2022年1月11日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年1月2日閲覧。
- ^ “ルクセンブルクで新型コロナの新たな株が見つかる”. luxtimes.lu . 2021年2月22日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年1月4日閲覧。
- ^ 「ギリシャ、新たなコロナウイルス変異株の感染例を4件確認」ロイター2021年1月3日。
- ^ “ジャマイカでCOVID-19変異株の4例が確認される”. 2021年1月3日. 2021年1月3日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年1月22日閲覧。
- ^ ターナー、ケイティ。「コロナウイルス：キプロスで急速に広がる新たな英国変異種が見つかる｜キプロスメール」 。 2021年1月4日閲覧。
- ^ 「ニュージーランド国境で新型コロナウイルスの変異株に感染した6人が確認、過去3日間で計19人に」TVNZ 2021年1月4日閲覧。
- ^ The Thaiger (2021年1月3日). 「タイに到着した英国人、新型コロナ英国変異株の検査で陽性」The Thaiger . 2021年1月4日閲覧。
- ^ 「ジョージア州、英国関連のコロナウイルス株の初感染者を確認」2021年1月4日。
- ^ 「オーストリアで英国、南アフリカのコロナウイルス変異体検出」ロイター。ベルリン。2021年1月4日。 2021年1月6日閲覧。
- ^ 「イラン、新型コロナの新たな変異株の初感染例を確認」。France 24。テヘラン。2021年1月5日。 2021年1月6日閲覧。
- ^ 「オマーン、英国からの旅行者に新たなウイルス変異体の初感染例を確認」ロイター通信。ドバイ。2021年1月5日。 2021年1月6日閲覧。
- ^ 「スロバキアで新たな英国コロナウイルス変異株の症例が確認された」Expats.cz、2021年1月5日。
- ^ 「ルーマニア、英国型コロナウイルス変異株の初感染例を確認」ロイター2021年1月8日。
- ^ 「ペルー、COVID-19変異株の初感染例を確認」2021年1月9日。
- ^ メキシコで英国で初めて確認された新型コロナウイルス株の症例が初めて確認される、2021年1月11日www.business-standard.com、2021年1月15日にアクセス
- ^ 「Covid-19の英国変異株がマレーシアに到達したとヌール・ヒシャム博士が確認」マレー・メール、2021年1月11日。
- ^ 「ラトビアで新たなCovid-19変異株が見つかる」。バルティックニュースネットワーク。2021年1月4日。
- ^ 「エクアドルで新型コロナウイルス変異株の初感染例が確認」2021年1月12日。
- ^ 「LIVE UPDATES: COVID-19 パンデミック」CNN Philippines . 2021年1月13日. 2021年11月21日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年1月15日閲覧。
- ^ 「ハンガリー、コロナウイルスの英国変異種を検出、公衆衛生局長官が発表」ロイター2021年1月13日。
- ^ 「ガンビア、英国型COVID-19変異株の初感染者2人を記録」ロイター2021年1月14日。
- ^ 「新たなCOVID-19株がロンドンからドミニカ共和国に到着したことが確認された」2021年1月15日。
- ^ 「アルゼンチンで英国型ウイルス変異体の初感染例が確認」MedicalXpress、2021年1月16日。
- ^ 「UPDATE 1-チェコ共和国、英国のコロナウイルス変異株を検出、ロックダウン措置継続」ロイター2021年1月18日。
- ^ 「クウェートとモロッコ、英国コロナウイルス変異株の初感染例を報告」アラブウィークリー、2021年1月19日。
- ^ “COVID-19: 英国、南アフリカの変異種がガーナで発見 – 上級研究員”.スターFM。 2021 年 1 月 19 日。2021 年2 月 12 日に取得。
- ^ 「クウェート、新たなウイルス変異体の初感染例を確認」ロイター2021年1月19日。
- ^ Adebowale、Nike（2021年1月25日）。「更新：英国で不安を引き起こしているCOVID-19変異株がナイジェリアで発見される - 公式」。The Premium Times 。 2021年1月29日閲覧。
- ^ 「UPDATE 1-セネガル、コロナウイルスの英国変異種の存在を確認」ロイター2021年1月28日。
- ^ 「自治体、6万人の住民に英国株のコロナウイルス検査を実施」DutchNews 2021年1月11日2021年1月12日閲覧。
- ^ トロンドゥル・オルセン (2021年1月24日)。 「英国の新型コロナウイルス株がフェロー諸島で確認された」。クリングヴァープ・フォロヤ。2021 年3 月 25 日に取得。
- ^ 「北マケドニア、英国型コロナウイルス変異株の初感染例を報告」ロイター2021年1月28日。
- ^ 「ウルグアイでウイルス SARS-CoV-2 を検出」 (スペイン語)。 2021年2月4日。
- ^ Telegram.hr. 「Potvrđena prva tri slučajabritanskog soja coronavirusa u Hrvatskoj」。Telegram.hr (クロアチア語) 。2021 年2 月 10 日に取得。
- ^ “英国の新型コロナウイルス株がスリランカで発見 - チャンディマ・ジーワンダラ博士”.スリランカ ニュース - ニュースファースト。 2021 年 2 月 12 日。2021 年2 月 12 日に取得。
- ^ 「コロナウイルス変異種によりNLが再びロックダウン、対面投票は一時停止」CBCニュース。 2021年2月13日閲覧。
- ^ “メンケス・セブト 2 カサス・ムタシ・コロナ・イングリス・マスク・ダリ・サウジ”. CNNインドネシア（インドネシア語）。 2021 年 3 月 2 日。2021 年3 月 8 日に取得。
- ^ チュニジアで英国型変異株の初感染例が発生 2021年3月2日www.theguardian.com、2021年3月3日アクセス
- ^ “Covid-19: levariant anglais détecté en Côte d'Ivoire (ministère de la Santé)”. Educarriere.ci。 2021 年 3 月 25 日。2021 年4 月 9 日に取得。
- ^ abc 「専門家の反応：新たな制限と新たなSARS-CoV-2変異体」サイエンスメディアセンター。2020年12月21日。 2020年12月21日閲覧。
レスター大学名誉准教授/臨床ウイルス学者のジュリアン・タン博士は、「世界的なGISAID SARS-COV-2配列データベースの調査により、このN501Y変異は実際には英国以外では今年ずっと以前から散発的に流行していたことがわかった。オーストラリアでは2020年6月から7月、米国では7月、ブラジルでは4月に流行していた。」と述べた。
- ^ Global Report B.1.351 (レポート). cov-lineages.org. 2021年3月10日. 2021年3月10日閲覧。
- ^ Tegally H、Wilkinson E、et al. (2020年12月22日). 「南アフリカで複数のスパイク変異を伴う新しい重症急性呼吸器症候群関連コロナウイルス2（SARS-CoV-2）系統の出現と急速な拡大」medRxiv 10.1101/2020.12.21.20248640。
- ^ グローバルレポート P.1（レポート）。cov-lineages.org。2021年3月11日。 2021年3月11日閲覧。
- ^ Nuno R. Faria; et al. (2021年1月12日). 「マナウスにおける新興SARS-CoV-2系統のゲノム特性：予備的調査結果」Virological.org . 2021年3月11日閲覧。
- ^ 「GISAID - hCov19 変異株」www.gisaid.org . 2021年8月13日閲覧。
- ^ 「カナダにおける新型コロナウイルスの変異株の追跡」CTVニュース。2021年2月4日。 2021年8月13日閲覧。
- ^ 「コロナウイルスの状況最新情報 - コロナウイルスの変異株」フィンランド保健福祉研究所。2021年8月11日。 2021年8月11日閲覧。
アルファ変異株: 7,953
- ^ チャンド、ミーラ;ホプキンス、スーザン。ダブレラ、ギャビン。アチソン、クリスティーナ。バークレー、ウェンディ。ファーガソン、ニール。他。 （2020年12月21日）。新規 SARS-COV-2 変異体の調査: 懸念される変異体 202012/01 (PDF) (レポート)。イングランド公衆衛生局。 p. ２．2020 年12 月 22 日に取得。 この記事には、British Open Government Licence v3.0 に基づいて公開されたテキストが組み込まれています。
- ^ フレデリック・グラボウスキー;プレイビッシュ、グジェゴシュ;ギジンスキ、スタニスワフ。コチャンチク、マレク。リプニアッキ、トマシュ（2021年3月）。 「懸念される SARS-CoV-2 変異体 202012/01 は約 2 倍の複製優位性を持ち、変異に関して獲得する」。ウイルス。13 (3): 392.土井: 10.3390/v13030392。PMC 8000749。PMID 33804556。
- ^ 「SARS-CoV-2のスパイクタンパク質の69-70del変異がTaqPath COVID-19コンボキットに与える影響」（PDF）。サーモフィッシャーサイエンティフィック。 2021年2月13日閲覧。
- ^ アンドレア・ソーン博士：SARS-CoV-2の新たな変異insidecorona.net、2021年2月7日にアクセス
- ^ 「レポート42 - イングランドにおけるSARS-CoV-2系統B.1.1.7の伝播：疫学的データと遺伝学的データのリンクから得られた知見」インペリアル・カレッジ・ロンドン。 2021年3月26日閲覧。
- ^ 「新たなコロナウイルス変異株：何がわかっているのか？」BBCニュース。2020年12月20日。 2020年12月22日閲覧。
- ^ Ellyatt, Holly (2021年2月11日). 「英国のコロナウイルス変異株は『世界を席巻する』方向だと一流科学者が語る」CNBC . 2021年3月26日閲覧。
- ^ 「完全なロックダウンへの復帰は新型コロナの新たな変異株の制御に十分ではないかもしれない、とセージ氏が警告」インディペンデント。 2020年12月31日。 2020年12月31日閲覧。
- ^ 「Covid-19: イングランド、スコットランド、ウェールズのクリスマス規則が強化」BBCニュース。2020年12月20日。 2020年12月20日閲覧。
- ^ フェアニー、ロバート（2020年12月19日）。「国境が閉鎖されているため、クリスマス期間中のスコットランドと英国の他の地域間の旅行は禁止されています」。edinburghlive 。 2020年12月20日閲覧。
- ^ ab ハリデイ、ジョシュ（2020年12月21日）。「新型コロナの感染拡大抑制のためイングランドで全国的なロックダウンを求める」ガーディアン。
- ^ ヘンリー、ジョン、ジョーンズ、サム、ジュフリーダ、アンジェラ、ホームズ、オリバー（2020年12月20日）。「EU、新型コロナの変異種をめぐり英国からの渡航を各国がブロックする中、危機協議を開催へ」ガーディアン。
- ^ マイケルズ、ダニエル（2020年12月20日）。「各国、新型コロナの新たな変異株を阻止すべく英国からの渡航を禁止」WSJ。
- ^ 「ケントのトラックの列、国境閉鎖後60台に減少」www.bbc.co.uk 2020年12月29日2020年12月30日閲覧。
- ^ GRIESHABER, KIRSTEN; HUI, SYLVIA (2020年12月21日). 「ウイルス変異種を恐れ、EU諸国が英国からの渡航を禁止」AP通信。
- ^ Berger, Miriam (2020年12月20日). 「ヨーロッパ各国、コロナウイルス変異に関する懸念から英国発着便を運休」ワシントンポスト. ISSN 0190-8286. 2020年12月20日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2020年12月20日閲覧。
- ^ クイン、エドナ・モハメド（現ベン）、デイヴィス（以前）、キャロライン、デイビッドソン、ヘレン、ウォールキスト（以前）、カラ、ウォーカー、ショーン（2020年12月20日）。「英国外で新たな変異株の症例が報告される - 発生時の様子」。ガーディアン。ISSN 0261-3077 。 2020年12 月21日閲覧。
- ^ 「Covid-19: 渡航禁止国が増えるにつれ、英国の隔離が拡大」BBCニュース。2020年12月21日。
- ^ 小倉順子「日本、新型コロナ変異種検出を受け外国人の入国禁止へ」CNN 2020年12月27日閲覧。
- ^ 「カリフォルニア州でウイルス変異体の国内2例目確認」APニュース2020年12月30日2021年1月3日閲覧。
- ^ Mallapaty, Smriti (2020年12月22日). 「国境閉鎖とCOVIDの拡散に関するデータが示すこと」. Nature . 589 (7841): 185. doi : 10.1038/d41586-020-03605-6 . PMID 33361805. S2CID 229692296.
- ^ 「COVID-19: 『デルタ航空は他のコロナウイルス変異株を絶滅させている』 - しかしそれは英国にとって何を意味するのか？」スカイニュース。 2022年8月17日閲覧。
- ^ レイチェル・レットナー（2022年3月23日）。「コロナウイルスの変異体：オミクロン、デルタ、その他のCOVID-19変異体に関する事実」。livescience.com 。 2022年8月17日閲覧。
- ^ 「英国、VUI 202012/01と呼ばれる新たな変異株を報告」GISAID。2020年12月20日時点のオリジナルよりアーカイブ。2020年12月20日閲覧。
- ^ 脅威評価概要：英国で複数のスパイクタンパク質変異を伴うSARS-CoV-2変異体の急増が確認（PDF）（レポート）。欧州疾病予防管理センター（ECDC）。2020年12月20日。
外部リンク
Scholia には、SARS-CoV-2 Alpha 変異体 (Q104376647) のプロファイルがあります。
- コルム、ジョナサン。カール・ジマー（2021年1月18日）。 「B.1.1.7 コロナウイルス亜種の内部」。ニューヨークタイムズ紙。
- イングランド公衆衛生局: 変異株: 英国での分布 - 4 か国での分布の概要
- PANGO 系統: 新しい変異体レポート - 系統 B.1.1.7 の世界的分布に関するレポート
- GISAID シークエンシング データベース - COVID-19 変異体の追跡