ギサイド

ギサイド

インフルエンザに関するあらゆるデータを共有する世界的取り組み
形成	2006年12月19日; 17年前[1] [2] [3] [4] ( 2006-12-19 )
タイプ	非営利団体[5]
目的	グローバルヘルス、研究
本部	ミュンヘン、ドイツ[6] [5]
方法	寄付と助成金
主要人物	ピーター・ボグナー（社長）[7] ヨルグ・パウラとクリストフ・ヴェッツラー（執行役員）[5] ロン・フーシェ（科学諮問委員会共同議長） [8]
Webサイト	https://gisaid.org

GISAID（/ ˈ ɡ ɪ s eɪ d /）、すなわちインフルエンザデータ共有に関する世界イニシアチブ^[9]は、以前は鳥インフルエンザデータ共有に関する世界イニシアチブ^{[10] [11]}と呼ばれ、インフルエンザウイルスのゲノムデータへのアクセスを提供するために2008年に設立された世界的な科学イニシアチブです。データベースは、COVID-19パンデミックの原因であるコロナウイルス^{[12] [13]}やその他の病原体も含むように拡張されました。このデータベースは、「COVID-19配列の世界最大のリポジトリ」と評されています。^[14] GISAIDは、ゲノム疫学とリアルタイム監視を促進し、地球全体での新しいCOVID-19ウイルス株の出現を監視します。^[15]

GISAIDは、従来のパブリックドメインアーカイブ^{[17]を介し}て鳥インフルエンザデータを共有する代替手段として設立されて以来、2009年のH1N1パンデミック[18] [19]、2013年のH7N9流行[20] [21]、COVID-19パンデミック[22] [23]、および2022～2023年のmpox流行[24]の際に、流行^{ゲノムデータ}の交換を^促進してき^ました[ 17 ^]。

1952年以来、インフルエンザ株は国立インフルエンザセンター（NIC）によって収集され、WHOの世界インフルエンザ監視・対応システム（GISRS）を通じて配布されてきた。^[25]各国はWHOにサンプルを提供したが、そのデータは製薬会社と無料で共有され、製薬会社はサンプルから製造されたワクチンの特許を取得できた。^[26] 2006年1月から、イタリアの研究者イラリア・カプアは、クローズドデータベースにデータをアップロードすることを拒否し、H5N1型鳥インフルエンザのゲノムデータをパブリックドメインにするよう求めた。^{[27] [28]} OIE/FAO動物インフルエンザ専門家ネットワークの会議で、カプアは参加者を説得して、インフルエンザ20株に関する各配列とデータを公開するよう求めた。科学者の中には、自分より先にデータを使った科学論文を他の人が発表するかもしれないという懸念から、データを共有することに懸念を抱く者もいたが、カプア氏はサイエンス誌に「どちらがより重要か？イラリア・カプア氏のチームのための新たな論文か、それとも重大な健康上の脅威への取り組みか？優先順位を明確にしよう」と語り、これを否定した。 ^[28] ピーター・ボグナー氏は、米国在住の40代のドイツ人で、以前は公衆衛生の経験はなかったが、カプア氏の呼びかけに関する記事を読み、GISAIDの設立と資金提供に協力した。^{[29 ] [30]}ボグナー氏は会議で、当時米国疾病予防管理センターのインフルエンザ部門を率いていたナンシー・コックス氏と出会い、コックスはその後GISAIDの科学諮問委員会の委員長となった。^[17]

GISAIDという頭字語は、2006年8月にネイチャー誌に掲載された書簡の中で造られた。 ^[30]当初の目標は、鳥インフルエンザデータ共有に関する新しい世界イニシアチブ（後に「Avian」が「All」に置き換えられる）のためのコンソーシアムを設立し、メンバー^[17]が分析と検証後6か月以内に公開データベースでデータを公開することだった。^[31]当初、この組織はオーストラリアの非営利団体Cambiaおよびクリエイティブ・コモンズ・プロジェクトScience Commonsと協力した。^[32]共有に関する基本的な基本ルールは確立されていなかったが、^[33]書簡には7人のノーベル賞受賞者を含む70人以上の著名な科学者が署名した。これは、世界保健機関の加盟国がウイルスゲノムを共有して所有権を危険にさらすことをためらっていたこともあり、病原性の高いH5N1人 獣共通ウイルスの最新の遺伝子データへのアクセスがしばしば制限されていたためである。^[34]

2006年末、インドネシアは鳥インフルエンザのサンプルをWHOと共有しないと発表し、流行が続いていたため世界的な健康危機を引き起こした。^[26] 2006年10月までにインドネシアはGISAIDとデータを共有することに同意した。^[35]インドネシアの保健大臣は、GISAIDがデータ共有の「公正で透明性のある」メカニズムを持っていると考えていた。^[36]インドネシアはそうした最初の国の一つだった。^[37] 2007年2月、GISAIDとスイスバイオインフォマティクス研究所（SIB）は協力協定を発表し、^[17] SIBはGISAIDに代わってEpiFluデータベースを構築し、管理することとなった。^{[38]最終的に、GISAIDは2008年5月、第61回世界保健総会の際に}ジュネーブで、コンソーシアムではなく登録ベースのデータベースとして立ち上げられた。 ^[17]

2009年にSIBは契約上の紛争によりGISAIDポータルからデータベースの接続を切断し、訴訟に発展した。^{[38] [4] [39]} 2010年4月、ドイツ連邦共和国はベトナムのハノイで開催された第7回鳥インフルエンザおよびパンデミックインフルエンザに関する国際閣僚会議で、GISAIDがドイツ政府と協力協定を締結し^[40]、ドイツがGISAIDプラットフォームの長期ホストとなると発表した。^[41]この協定に基づき、ドイツ連邦食糧農業消費者保護省は技術的なホスティング設備を提供することでこの取り組みの持続可能性を確保することとなり^[42]、連邦家畜衛生研究所であるフリードリヒ・レフラー研究所はGISAIDの科学的データの妥当性とキュレーションを確保することとなった。2021年までに、同省はデータベースのホスティングにもキュレーションにも関与しなくなった。^[43] 2013年にGISAIDはワシントンDCに拠点を置く非営利団体を解散し、この組織はドイツの団体Freunde von GISAID（GISAIDの友人）によって運営されるようになりました。^[29]

最も初期のSARS-CoV-2遺伝子配列の一部は、中国疾病予防管理センターによって公開され、2020年1月中旬にGISAIDを通じて共有されました。^[44] 2020年以降、何百万ものSARS-CoV-2ゲノム配列がGISAIDデータベースにアップロードされています。^[45]

2022年にGISAIDは、Mpoxウイルス^[46]と呼吸器合胞体ウイルス（RSV）^[47]をデータベースでサポートされている病原体のリストに追加しました。インドネシア保健省は2023年11月にバリ島にGISAIDアカデミーを設立し、バイオインフォマティクス教育、病原体ゲノム監視の推進、地域の対応能力の向上に重点を置くと発表しました。^[48]

データを寄託した人々にインセンティブを与え、それを評価するためのGISAIDモデルは、将来の取り組みのモデルとして推奨されています。^[49]この取り組みにより、この組織は「人類にとって重要な盾」と評されています。^[50]

GISAIDは、「世界最大のCOVID-19配列リポジトリ」^[14]および「断然世界最大のSARS-CoV-2配列データベース」^[7]と評されるものを管理している。 2021年4月中旬までに、GISAIDのSARS-CoV-2データベースには120万件を超える提出があり、これは170か国以上の研究者の努力の証である。^[51]わずか3か月後には、アップロードされたSARS-CoV-2配列の数は再び倍増し、240万件を超えた。^[52] 2021年末までに、データベースには500万を超えるゲノム配列が含まれていた。^[53] 2021年12月時点で、600万を超える配列が提出された。^[54] 2022年4月までに1000万の配列が蓄積され、2023年1月にはその数は1440万に達した。^[55]

2020年1月、SARS-CoV-2の遺伝子配列データはGISAIDを通じて共有された。^[56] COVID-19パンデミックの最初の1年間を通じて、世界中で生成され共有されたSARS-CoV-2の全ゲノム配列のほとんどは、GISAIDを通じて提出された。^{[57]南アフリカで}SARS-CoV-2オミクロン変異体が検出されたとき、同国の国立感染症研究所は、その配列をGISAIDに迅速にアップロードすることで、ボツワナと香港でも同じ遺伝子配列を持つ症例が報告されていることを知ることができた。^[58]

2023年3月、GISAIDは一部の科学者のデータベースへのアクセスを一時的に停止し、SARS-CoV-2の起源の調査に関連する生データを削除した。^{[59] [60] [61]} GISAIDは、データベースから記録を削除しないが、更新または修正中にデータが一時的に見えなくなる可能性があると述べた。^{[62] [63] [64]}データは利用可能になったが、それに基づく分析は一般に公開されないという追加の制限が課された。^[65]

Friends of GISAIDの理事会は、ピーター・ボグナーと2人のドイツ人弁護士で構成されており、彼らは組織の日常業務には関与していない。^[29]組織への科学的助言は、WHOインフルエンザ協力センターなどの主要な公衆衛生研究所の所長を含む科学諮問委員会によって提供される。^{[66] 2023年には、}欧州委員会やロックフェラー財団 など、GISAIDの一部資金提供者からGISAIDの透明性の欠如が批判され、国際製薬団体連合会（IFPMA）から長期資金提供が拒否された。^{[67] [68]} 2023年6月、ヴァニティ・フェア誌は、ボグナーが「GISAIDはまもなく『幅広いガバナンス問題に対処する責任を負う』独立したコンプライアンス委員会を立ち上げる」と述べたと報じた。^[10]テレグラフ紙も同様に、GISAIDの社内弁護士が透明性を確保し、ボグナー氏の関与なしに科学的紛争を解決できるようにするための新たなガバナンスプロセスを開発していると報じた。^[50]

GISAIDデータベースの作成は、発展途上国の研究者らが提起した懸念が一因となった。^[69] Scientific Americanは2009年に「WHOが運営していた以前のデータ共有システムでは、研究者らはウイルスサンプルをWHOに送る際に、その知的財産権を放棄することを余儀なくされた。ウイルスサンプルはその後、民間製薬会社によってワクチンの製造に使用され、特許が付与され、多くの貧困国が購入できない価格で利益を上げて販売されることになる」と指摘した。^{[4] 2022年の}The Lancetの記事では、北米とヨーロッパの科学者が無制限のアクセスを求めており、「アフリカの科学者は、GISAIDの利用規約に従ってデータを生成し共有する人々に対して十分な保護を求めている」とさらに指摘されている。^[69] GenBankやEMBLなどのパブリックドメインのデータベースとは異なり、GISAIDのユーザーは本人確認を行い、GISAIDデータの使用方法を規定するデータベースアクセス契約に同意する必要がある。^{[50] [70]}これらの利用規約は「データ提供者に有利に調整されており、データ提供者がアップロードする遺伝子データに対する永続的な管理権をデータ提供者に与えている」。^[50]これらの利用規約は、ユーザーが同意していない他のユーザーとデータを共有することを禁止し、データのユーザーは、公開された作品でデータ生成者をクレジットし、データ生成者と協力し、データを使用する研究や分析に参加させるよう合理的な努力をすることを要求している。^{[10] [50]}

GISAIDのデータアクセス協定が対処しようとしている困難は、インフルエンザの配列データを共有すると、ワクチン業界などによる知的財産権の主張を通じてデータが不正使用され、高額な費用がかかるか技術移転が妨げられることで、開発途上国でのワクチンやその他の品目へのアクセスが妨げられるのではないかと多くの研究者が懸念していることである。ほとんどの公益専門家はインフルエンザの配列データを公開すべきだという点でGISAIDに同意しており、これは多くの研究者の同意事項であるが、特許を請求した後にのみ情報を提供する専門家もいれば、ヒトゲノム計画で物議を醸したように、特許やその他の知的財産権の主張が提出されていないという条件でのみ情報にアクセスすべきだという専門家もいる。^[71] GISAIDのデータアクセス協定は、データの共有を促進するためにこれを直接取り上げている。GISAIDの手順ではさらに、EpiFluデータベースにアクセスする人は遺伝子配列の原産国と配列を発見した研究者に相談することを提案している。^[72]しかし、これらの制限はオープンデータモデルに対する一般的な批判を証明している。^{[73] [74]}

GISAIDは自らを「オープンアクセス」と称しており、これは当然メディアや学術雑誌の出版物にも反映されている。この説明は確かにコンソーシアムの当初の発表と一致しており^{[31] 、} INSDCに参加しているデータベースにデータを預けることも言及されていた。2023年3月現在、これは当てはまらず、「GISAIDは他のデータベースにデータを公開するメカニズムを提供していない」。^[75]いくつかの学術論文ではGISAIDのライセンスモデルを制限のないオープンデータベースと比較しており^{[76] [72] [77]、}その違いを強調している一方、他の研究者はINSDCの制限のないデータベースの使用を求める公開書簡に署名している。^{[78] [79]}

2017年、GISAIDの編集委員会は「研究データのデジタルオブジェクト識別子（DOI）の世界的大手プロバイダーであるre3data.orgとDataCiteは、GISAIDのデータベースとデータへのアクセスをオープンアクセスとして指定することを確認した」と述べた。 ^{[80]しかし、2023年3月に}サイエンス誌^[81]や他の報道機関が報じたように、数人の研究者のアカウントが停止された後、^[82]研究データリポジトリレジストリ（re3data）によってオープンアクセスのステータスが取り消され、現在は「アクセス制限付きリポジトリ」に分類されている。^[83] 2020年、世界保健機関の主任科学者ソウミヤ・スワミナサンはこの取り組みを「ゲームチェンジャー」と呼び、^[12]欧州バイオインフォマティクス研究所（EBI）の共同所長ロルフ・アプワイラーは、配列を公開で再共有できないため、コロナウイルスや新しい変異体の急増を理解する取り組みを妨げていると主張している。^[78]

GISAIDのアクセス制限は、「公衆衛生保護という当面の優先事項ではなく、学術的な優先事項を持つ研究室や機関」との対立を招いている。^[50] 2021年1月、GISAIDのアクセス制限をきっかけに、科学者のグループがSARS-CoV-2の配列をオープンデータベースに登録するよう求める公開書簡を書き、^{[84]これは}Nature ^{[73] [85]}およびScience誌にも掲載された。^{[7]さらに、} Science誌の記事では、 データベースへのアクセスの透明性の欠如により、多くの科学者がプラットフォームを批判することさえできないと指摘している。^[7] GISAIDの成功を記した2017年の論文では、研究者の資格を取り消すことはまれであったが、実際に行われたと述べている。^[86]同じ出版物では、「管理と公開の必要性のバランスをとるGISAIDの方式にはメリットがあると認識されている」と述べている。2023年4月、Science誌とThe Economist誌は、これらの問題が続いていることに加え、ガバナンスの透明性が欠如していると報じた。^{[68] [67]}サイエンス誌の主張に関するテレグラフ紙の調査では、この分野における様々な潜在的競争相手にとってGISAIDは同分野の統制強化の障害となっているというインセンティブが指摘され、またGISAIDの立場は必然的に科学者グループ間の紛争の中心となり、その結果、敗訴側がGISAIDを非難する傾向にあると指摘された。^[50]

• 命名された世界的流行系統の系統分類 (PANGOLIN)  – SARS-CoV-2 系統命名法
• Nextstrain  – ウイルスの進化を追跡するウェブサイト

• 「完璧な科学ではない」（音声）。On the Media。WNYC。 2021年5月28日。 2021年5月30日閲覧。

• 公式サイト