SARS-CoV-2ゼータ変異株

ゼータ変異株は系統P.2としても知られ、^[a]COVID-19を引き起こすウイルスであるSARS-CoV-2の変異体です。リオデジャネイロ州で最初に検出されました。E484K変異を有していますが、N501Y変異とK417T変異は有していません。マナウスのガンマ変異株とは直接関連がなく、リオデジャネイロで独自に進化しました。^[1]^[2]

世界保健機関が提案した簡略化された命名体系では、P.2は「ゼータ変異体」と名付けられ、関心対象の変異体（VOI）ではあるものの、懸念対象の変異体とはみなされていなかった。^{[3] 2020年11月、}GISAIDデータベースに登録されたサンパウロ州の遺伝子配列におけるゼータ変異体の有病率の増加が第2波に先立って起こった。^[4] 2021年7月現在、ゼータはWHOによって関心対象の変異体とはみなされなくなった。^[5]

突然変異

ゼータゲノムには3つのアミノ酸変異、E484K、D614G、V1176Fがあり、これらはすべてウイルスのスパイクタンパク質コードに含まれています。^[6]米国疾病予防管理センターによると、F565Lはゼータ変異体の配列の一部で検出されていますが、すべてではありません。^[7]

SARS-CoV-2ゼータ変異体のアミノ酸変異を、スパイク部に焦点を当ててSARS-CoV-2のゲノムマップ上にプロットした図。^[6]

注記

^ B.1.1.28の亜系統

参考文献

^ 「PANGO系統系統P.2」。COV系統。2021年4月28日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年1月28日閲覧。P.2...B.1.1.28.2の別名、ブラジル系統
^ ヴォロック、カロリーナ M.ダ・シルバ・フランシスコ、ロナウド。デ・アルメイダ、ルイスGP。カルドーソ、シンシア C.ブルストリーニ、オタビオ J.ガーバー、アレクサンドラ L.ギマランイス、アナ・パウラ・デ・C。マリアーニ、ダイアナ。ダ・コスタ、ライッサ・ミレラ。フェレイラ、オーランドC。カヴァルカンティ、アドリアナ・コニー（2021年4月26日）。「ブラジル、リオデジャネイロの新規SARS-CoV-2系統のゲノム特性評価」。ウイルス学ジャーナル。95 (10)。土井：10.1128/JVI.00119-21。ISSN 0022-538X。PMC 8139668。PMID 33649194。
^ 「マナウスにおける新興SARS-CoV-2系統のゲノム特性：予備的調査結果」。Virological . 2021年1月12日。 2021年6月26日閲覧。
^ Ranzani, Otavio (2021). 「ブラジルにおけるガンマ変異体関連COVID-19流行時の高齢者人口におけるCoronaVacワクチンの有効性」medRxiv 10.1101/2021.05.19.21257472v3。
^ 「SARS-CoV-2変異体の追跡」who.int。世界保健機関。
^ ab 「スパイク変異体：ゼータ変異体、別名P.2」。covdb.stanford.edu。スタンフォード大学コロナウイルス抗ウイルスおよび耐性データベース。2021年7月1日。 2021年7月5日閲覧。
^ 「SARS-CoV-2 変異株の分類と定義」。CDC.gov。米国疾病予防管理センター。2020年2月11日。 2021年7月5日閲覧。

[1] B.1.1.28の亜系統

[2] 「PANGO系統系統P.2」。COV系統。2021年4月28日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年1月28日閲覧。P.2...B.1.1.28.2の別名、ブラジル系統

[3] ヴォロック、カロリーナ M.ダ・シルバ・フランシスコ、ロナウド。デ・アルメイダ、ルイスGP。カルドーソ、シンシア C.ブルストリーニ、オタビオ J.ガーバー、アレクサンドラ L.ギマランイス、アナ・パウラ・デ・C。マリアーニ、ダイアナ。ダ・コスタ、ライッサ・ミレラ。フェレイラ、オーランドC。カヴァルカンティ、アドリアナ・コニー（2021年4月26日）。「ブラジル、リオデジャネイロの新規SARS-CoV-2系統のゲノム特性評価」。ウイルス学ジャーナル。95 (10)。土井：10.1128/JVI.00119-21。ISSN 0022-538X。PMC 8139668。PMID 33649194。

[4] 「マナウスにおける新興SARS-CoV-2系統のゲノム特性：予備的調査結果」。Virological . 2021年1月12日。 2021年6月26日閲覧。

[5] Ranzani, Otavio (2021). 「ブラジルにおけるガンマ変異体関連COVID-19流行時の高齢者人口におけるCoronaVacワクチンの有効性」medRxiv 10.1101/2021.05.19.21257472v3。

[6] 「SARS-CoV-2変異体の追跡」who.int。世界保健機関。

[Stanford1-7] 「スパイク変異体：ゼータ変異体、別名P.2」。covdb.stanford.edu。スタンフォード大学コロナウイルス抗ウイルスおよび耐性データベース。2021年7月1日。 2021年7月5日閲覧。

[CDC_variants-8] 「SARS-CoV-2 変異株の分類と定義」。CDC.gov。米国疾病予防管理センター。2020年2月11日。 2021年7月5日閲覧。