種類 原核生物 (細菌および古細菌)の鞭毛は回転運動で動くのに対し、真核生物の鞭毛は屈曲運動で動く。原核生物の鞭毛は回転モーター を使用し、真核生物の 鞭毛は複雑な滑走フィラメントシステムを使用する。真核生物の鞭毛はATP駆動であるが、原核生物の鞭毛はATP駆動(古細菌)またはプロトン駆動(細菌)である。[ 12 ] 鞭毛には、細菌性、古細菌性、真核生物性の3種類がある。
真核生物の鞭毛には、屈曲機構で動くダイニン と微小管 がある。細菌と古細菌の鞭毛にはダイニンや微小管がなく、回転機構で動く。[ 13 ]
これら3つのタイプのその他の違いは以下のとおりです。
細菌の鞭毛
モーター
ここに示されているのは、基部にCリングがあり、FliGは赤、FliMは黄色、FliNは紫の濃淡で示されています。MSリングは青、MotABは茶色、LPリングはピンク、ロッドは灰色で示されています。
[ 27 ] 自然界の驚異的な回転モーター–
YouTube 細菌の鞭毛は、細胞内膜上の鞭毛の固定点に位置するタンパク質からなる回転エンジン( Mot複合体)によって駆動されます。このエンジンは 、プロトン駆動力 、すなわち細胞の代謝によって生じる濃度勾配 による細菌細胞膜を横切るプロトン(水素イオン)の流れによって駆動されます(ビブリオ 属には側方鞭毛と極性鞭毛の2種類があり、一部はプロトンポンプ ではなくナトリウムイオンポンプ によって駆動されます[ 28 ] )。ローターは膜を横切ってプロトンを輸送し、その過程で回転します。ローター単体では6,000~100,000rpmで動作できますが [ 29 ] 、 鞭毛フィラメントが付着している場合は通常200~1,000rpmにしかなりません。回転方向は、ローター内のFliG タンパク質の位置のわずかな変化によって引き起こされる鞭毛モータースイッチ によってほぼ瞬時に変更できます。 [ 30 ] トルク発生ユニットはステータであり、これはプロトン駆動の回転モーターで、細菌の主要な鞭毛モーターを駆動します。ステータから、MotB2 ダイマーの周りの MotA5 ペンタマーの回転は細胞壁に固定され、C リングの回転に直接結合されます。したがって、各トルク発生ステータユニットモーターと鞭毛モーターローターは、6.2 のギア比を持つ噛み合った歯車のように機能します。[ 31 ] [ 32 ] さまざまな細菌で、鞭毛モーターローターに直接関係する 11 ~ 16 個のステータモーターが観察されています。[ 33 ] トルクは MotAB から FliG の D5 ドメイン上のトルクヘリックスに伝達され、トルクまたは速度の要求が増加すると、より多くの MotAB が使用されます。[ 27 ] 鞭毛モーターにはオンオフスイッチがないため、タンパク質epsEは機械的なクラッチとして使用され、モーターをローターから切り離すことで鞭毛を停止させ、細菌をその場にとどまらせる。[ 34 ]
鞭毛の生成と回転には 大腸菌 細胞のエネルギー予算の最大 10% を消費する可能性があり、これは長期的には、適応度に不利になるものは時間の経過とともに排除される可能性があるという利点をもたらします。[ 22 ] その動作は、突然変異率を高める活性酸素種を生成します。 [ 22 ]
鞭毛の円筒形は微小生物の運動に適しています。これらの生物はレイノルズ数が 低い領域で活動しており、その領域では周囲の水の粘性が質量や慣性よりもはるかに重要です。[ 35 ]
鞭毛の回転速度はプロトン駆動力の強度に応じて変化するため、ある種の速度制御が可能となり、また一部の細菌は体の大きさに比べて驚異的な速度に達することができる。中には1秒間に約60細胞長に達するものもある。このような速度では、細菌が1kmを移動するのに約245日かかる 。これは遅く見えるかもしれないが、スケールの概念を導入すると見方が変わる。マクロな生命体と比較すると、1秒あたりの体長の数で表すと、実際には非常に速い。例えば、チーターは1秒間に約25体長しか到達しない。[ 36 ]
細菌は鞭毛を使って、偏った ランダムウォークによって誘引物質に向かって素早く移動し、忌避物質から遠ざかることができる。このランダムウォークでは、鞭毛を反時計回り と時計回り に回転させることで、それぞれランとタンブルが 発生する。回転の2つの方向は(鞭毛の動きに関して)同一ではなく、分子スイッチによって選択される。[ 37 ] 時計回りの回転は、体が鞭毛に追従する牽引モード と呼ばれ、反時計回りの回転は、鞭毛が体の後ろに遅れる推進モード と呼ばれる。 [ 38 ]
組み立て 鞭毛形成中、鞭毛の構成要素は基底体と新生フィラメントの空洞コアを通過する。形成中、タンパク質成分は基部ではなく鞭毛の先端に付加される。[ 39 ] 試験管内 では、精製されたフラジェリンを唯一のタンパク質として含む溶液中で鞭毛フィラメントが自発的に形成される。[ 40 ]
進化 細菌の鞭毛の少なくとも 10 種類のタンパク質成分は、多くのグラム陰性細菌に見られるIII 型分泌系(T3SS) と相同タンパク質を共有しており、 [ 41 ] 片方がもう一方から進化した可能性が高い。T3SS は鞭毛装置と同様の数の成分 (約 25 種類のタンパク質) を持つため、どちらが先に進化したかを判断するのは難しい。しかし、鞭毛系はさまざまな調節因子やシャペロンを含む全体的に多くのタンパク質に関与しているように見えるため、鞭毛は T3SS から進化したと主張されている。しかし、鞭毛が先に進化したか、または 2 つの構造が並行して進化した可能性も示唆されている[ 42 ] 。初期の単細胞生物の運動性 (移動性) の必要性は、より移動性の高い鞭毛が進化によって先に選択されることを裏付けているが[ 42 ] 、鞭毛から T3SS が進化することは「還元進化」と見なされ、系統 樹からトポロジー的な裏付けが得られていない。[ 43 ] 2つの構造が共通の祖先から別々に進化してきたという仮説は、2つの構造間のタンパク質の類似性、およびそれらの機能的多様性を説明する。[ 44 ]
一部の著者は、鞭毛はすべてのタンパク質が揃っている場合にのみ適切に機能すると仮定して、鞭毛は進化していないと主張してきた。言い換えれば、鞭毛装置は「還元不可能なほど複雑 」である。[ 45 ] しかし、多くのタンパク質が欠失または変異しても、鞭毛は効率が低下する場合もあるものの、依然として機能する。[ 46 ] さらに、多くのタンパク質が種間で一定数に固有のものであるため、細菌の鞭毛の構成の多様性は予想よりも高かった。[ 47 ] したがって、鞭毛装置は進化の観点から明らかに非常に柔軟であり、タンパク質成分を失ったり獲得したりすることが完全に可能である。たとえば、 大腸菌 の運動性を高める 多くの変異が見つかっている。[ 48 ] 細菌の鞭毛の進化に関する追加の証拠には、痕跡鞭毛、鞭毛の中間形態の存在、および鞭毛タンパク質配列間の類似性のパターンが含まれる。これには、ほぼすべてのコア鞭毛タンパク質が非鞭毛タンパク質と既知の相同性を持っているという観察が含まれる。[ 41 ] さらに、単純な繰り返しサブユニットの自己集合、遺伝子重複とその後の分岐、他のシステムからの要素の採用(「分子ブリコラージュ」)、および組換えなど、鞭毛の進化において重要な役割を果たすいくつかのプロセスが特定されている。[ 49 ]
鞭毛の配置 細菌の種類によって鞭毛の数や配置が異なり、[ 50 ] [ 51 ] 鞭毛はギリシャ語で毛を 意味するtrichos からtricho という用語で命名されている。[ 52 ]
一方、スピロヘータは 、細胞の両極から生じる内鞭毛と呼ばれる鞭毛を持ち、外膜を破って観察したり、電子クライオトモグラフィー顕微鏡で観察したりすることで、ペリプラズム空間内に位置していることが 示されています。 [ 55 ] 細胞 体 に対するフィラメントの回転により、細菌全体がコルク栓抜きのような動きで前進し、通常の鞭毛を持つ細菌の通過を妨げるほど粘性の高い物質の中をも進みます。
セレノモナス 属の大型種の中には、30本以上の鞭毛が細胞体の外側に配置され、互いにらせん状に巻き付いて「束 」と呼ばれる太い構造(光学顕微鏡で容易に観察できる)を形成しているものがある。
一部のビブリオ 属(特にビブリオ・パラヘモリティカス [ 56 ] )や、アエロモナス などの関連細菌 では、2つの鞭毛システムが共存し、異なる遺伝子セットと異なるイオン勾配をエネルギー源として利用している。極性鞭毛は恒常的に発現し、流体中で運動性を提供する一方、側方鞭毛は極性鞭毛が方向転換に抵抗が大きすぎる場合に発現する。[ 57 ] [ 58 ] [ 59 ] [ 60 ] [ 61 ] [ 62 ] これらは表面上または粘性流体中で群泳運動性を提供する。
バンドル販売 束状化とは、多鞭毛細胞において鞭毛が束になって同期的に回転し、移動を促進する現象である。左巻きらせん構造を特徴とするこれらの鞭毛は、分子ローターが反時計回りに回転すると、一体となって回転し、細胞を環境中を前進させる。ローターが時計回りに回転すると、鞭毛は束からほどけ、協調運動が崩れる。このほどけによって、タンブリングと呼ばれる現象が引き起こされる。タンブリングでは、細胞は前進運動を停止し、その場で小刻みに揺れ動く。タンブリングによって細胞はランダムに方向転換し、結果としてその後の前進運動の方向が変化する。このプロセスは、大腸菌などの細菌にとって非常に重要であり、 方向性のある遊泳とランダムな方向転換を交互に行うことで、複雑な環境を移動することを可能にする。束状化とタンブリングのメカニズムは、微生物の複雑な運動戦略を浮き彫りにし、環境刺激への応答を可能にしている。この挙動は細菌の走化性においてよく研究されており、細胞は好ましい環境に向かって経路を調整する。
走化性 (「意図的な運動」)を説明するモデルでは、鞭毛の時計回りの回転は、細胞にとって好ましい化学物質(例えば食物)によって抑制されます。好ましい方向に移動しているときは、そのような化学誘引物質の濃度が増加するため、回転運動は継続的に抑制され、前進運動が可能になります。同様に、細胞の移動方向が好ましくない場合(例えば、化学誘引物質から遠ざかる方向)、回転運動はもはや抑制されず、より頻繁に発生するため、細胞が正しい方向に再配向される可能性があります。
しかし、たとえ全ての鞭毛が時計回りに回転したとしても、幾何学的および流体力学的な理由から、鞭毛が束を形成することはしばしばできない。[ 63 ] [ 64 ]
回転スイッチングの分子メカニズム 鞭毛モーターは完全にタンパク質で構成されている。ステーターはトルク発生ユニットであり、プロトン駆動の回転モーターで、細菌の鞭毛モーターの主動力源となる。ステーターから、MotB2 ダイマーの周りの MotA5 ペンタマーの回転は、歯車のように細胞壁に固定され、C リングの回転に直接連動するため、ローターの C リングと相互作用することで力発生器として機能する。[ 31 ] C リングは双方向に回転できるが、ステーター複合体自体は一方向に回転するため、C リングは内部再配置を受ける必要がある。この再配置の間、C リングは分解して再構築されるのではなく、タンパク質ドメインが協調的な構造変化を受ける。[ 65 ]
Cリングには、リン酸化CheYタンパク質などのスイッチングシグナルの結合部位があり、これが一連の内部再編成を引き起こします。Cリング内の複数のタンパク質ドメインが再配向し、FliGNドメインとFliGMドメインの両方がFliGCドメインとともに回転して位置を変えます。これらの協調的なドメイン反転により、ステータはCリングに対して位置が切り替わります。ステータがCリングの外側から力を加えると、ローターは反時計回りに回転します(束ねる)。ステータがCリングの内側に力を加えるように位置を変えると、ローターは時計回りに回転します(転がる)。ステータ自身の回転機構は一定ですが、Cリングに力を加える方向によってローターの回転方向が決まります。これらの知見は、サルモネラ菌(Salmonella Typhimurium)の 鞭毛モーターの構造に基づいています。コアモーターコンポーネントは細菌種間で高度に保存されているが、この特定のスイッチングメカニズムが普遍的に保存されているのか、あるいは異なる細菌種がこの戦略のバリエーションを採用しているのかは不明である[ 65 ] 。
真核生物の鞭毛 真核生物の鞭毛。1–軸糸、2–細胞膜、3–IFT(鞭毛内輸送)、4–基底体、5–鞭毛の横断面、6–基底体の微小管三連構造 軸糸 の断面図クラミドモナス・ラインハルティ の鞭毛領域の縦断面図。細胞頂端には、鞭毛の固定部位である基底体がある。基底体は中心体から発生し、中心体と同様の微細構造を持ち、9本の周辺微小管三連構造を有する(画像下部中央の構造を参照)。この軸糸の断面顕微鏡写真には、「9+2」構造が確認できる。
用語 細菌の鞭毛と真核生物の繊毛および鞭毛との区別を強調するために、一部の著者は、これら 2 つの真核生物構造の名前を「ウンデュリポディア 」に置き換えようと試みました (例: 1970 年代以降のMargulis のすべての論文) [ 66 ] または両方を「繊毛」に置き換え (例: Hülsmann、1992 年; [ 67 ] Adl ら、2012 年; [ 68 ] Cavalier-Smith のほとんどの論文)、細菌の構造には「鞭毛」を残しました。しかし、本稿で採用した真核生物に対する「繊毛」と「鞭毛」という用語の区別的な使用 (下記の§ 鞭毛と繊毛 を参照) は依然として一般的です (例: Andersen ら、1991 年; [ 69 ] Leadbeater ら、2000 年) [ 70 ] 。
内部構造 真核生物の鞭毛の中心は軸糸 と呼ばれ、 2本の中央の単一微小管(一重線 )を取り囲む9対の融合した微小管(二 重線 )の束です。この9+2軸糸は 真核生物の鞭毛の特徴です。真核生物の鞭毛の基部には基底体 、すなわち「ブレファロプラスト」またはキネトソームがあり、これは鞭毛微小管の微小管形成中心 であり、長さは約500ナノメートルです。基底体は中心体 と構造的に同一です。鞭毛は細胞の形質膜 に包まれているため、鞭毛の内部は細胞の細胞質 にアクセスできます。
形態が比較的安定している軸糸と基底体の他に、鞭毛装置の他の内部構造としては、移行帯(軸糸と基底体が接する部分)と根系(基底体から細胞質に伸びる微小管状または線維状の構造)があり、これらはより多様で、真核生物の系統関係の指標として有用である。その他のまれな構造としては、副鞭毛(または副軸、副軸糸)ロッド、R線維、S線維がある。[ 71 ] : 63-84 表面構造については、以下を参照。
機構 外側の9本の二重微小管はそれぞれ、隣接する微小管に向かって一対のダイニン アーム(「内側」アームと「外側」アーム)を伸ばしており、これらはATP加水分解によって力を発生させる。鞭毛軸糸には、外側の9本の二重微小管から中央のペアに向かって伸びるポリペプチド複合体である放射状スポーク も含まれており、スポークの「頭部」は内側を向いている。放射状スポークは鞭毛運動の調節に関与していると考えられているが、その正確な機能と作用機序はまだ解明されていない。[ 72 ]
鞭毛と繊毛 真核生物の「鞭毛」と「繊毛」の拍動パターン。両者の構造が解明される以前の伝統的な区別。 真核生物の繊毛 や鞭毛の規則的な拍動パターンは、細胞レベルで運動を生み出す。その例としては、精子の遊泳のような単一細胞の推進から、 呼吸器系 のような静止した細胞層に沿った体液の輸送まで多岐にわたる。[ 73 ]
真核生物の繊毛 と鞭毛は究極的には同じものですが、その構造が知られる以前から、運動パターンによって分類されることがあります。鞭毛の場合、運動は平面的で波状であることが多いのに対し、運動性繊毛は、パワーとリカバリーのストロークを伴う、より複雑な三次元運動を行うことが多いです。[ 73 ] また、別の伝統的な区別方法は、細胞上の9+2個の細胞小器官の数によるものです。[ 72 ]
鞭毛内輸送 鞭毛内輸送 、すなわち軸糸サブユニット、膜貫通受容 体、その他のタンパク質が鞭毛の長さに沿って上下に移動されるプロセスは、運動性とシグナル伝達の両方において鞭毛の適切な機能に不可欠である。[ 74 ]
類型論 鞭毛や繊毛に関連する用語は、真核生物の特徴付けに用いられる。[ 77 ] [ 80 ] [ 71 ] : 60-63 [ 81 ] [ 82 ] 表面構造に基づいて、鞭毛は以下のように分類される。
鞭毛の数に応じて、細胞は次のように分類される可能性があります(一部の著者は「鞭毛を持つ」の代わりに「繊毛を持つ」を使用していることに注意してください)[ 68 ] [ 85 ]
鞭毛の挿入位置による分類:[ 86 ]
後生動物:鞭毛が後方に挿入されている細胞。例えば、後生動物 (Vischer、1945)。ハプト藻類 では、鞭毛は側方から末端に挿入されているが、高速遊泳時には後方に向けられる。[ 87 ] アクロコント:鞭毛が頂端側に挿入された細胞。 亜頂端細胞:鞭毛が頂端下側に挿入された細胞。 側生細胞:鞭毛が側面に挿入された細胞。 拍動パターンによると:
滑走:基質上を這う鞭毛[ 84 ] 異形運動:異なる拍動パターンを持つ鞭毛(通常、一方の鞭毛は食物の捕獲に機能し、もう一方の鞭毛は滑走、固定、推進、または「操舵」に機能する)。[ 88 ] 等動性:鞭毛が同じパターンで拍動する。 鞭毛の種類に関連するその他の用語:
古細菌の鞭毛 古細菌 の一部の種が持つアーケラムは 、表面的には細菌の鞭毛に似ています。1980年代には、大まかな形態と行動に基づいて相同であると考えられていました。[ 89 ] 鞭毛とアーケラムはどちらも細胞外に伸びるフィラメントで構成され、回転して細胞を推進します。古細菌の鞭毛は、中央のチャネルがないという独特の構造を持っています。細菌のタイプIVピリン と同様に、古細菌のタンパク質(アーケリン)はクラス3シグナルペプチドで作られ、タイプIVプレピリンペプチダーゼ様酵素によって処理されます。アーケリンは通常、適切な組み立てや機能に必要なN結合型グリカンの付加によって修飾されます。 [ 4 ]
1990年代の発見により、古細菌と細菌の鞭毛には数多くの詳細な違いがあることが明らかになった。それらには以下のようなものがある。
細菌の鞭毛の回転は、プロトン駆動力( H + イオン の流れ)または場合によってはナトリウム駆動力( Na + イオンの流れ)によって駆動されます。古細菌の鞭毛の回転はATP によって駆動されます。[ 90 ] 細菌細胞には多くの場合、それぞれが独立して回転する多数の鞭毛フィラメントがあるのに対し、古細菌の鞭毛は多数のフィラメントの束で構成され、単一の集合体として回転する(出典?Pyrococcus furiosus [ 91 ] ではそうではないようだ)。 細菌の鞭毛は先端にフラジェリンサブユニットが付加されることで成長するが、古細菌の鞭毛は基部にサブユニットが付加されることで成長する。 細菌の鞭毛はアーケラよりも太く、細菌のフィラメント内部には鞭毛タンパク質のサブユニットがフィラメント内部を流れ上がって先端に付着できるほど大きな中空の「管」があるが、アーケラムは薄すぎる(12~15 nm)ため、これは不可能である。[ 92 ] 細菌鞭毛の多くの構成要素は、 III型分泌系 の構成要素と配列類似性を共有しているが、細菌鞭毛とアーケラの構成要素は配列類似性を共有していない。その代わりに、アーケラの一部の構成要素は、 II型分泌系 の作用によって組み立てられるIV型線毛 の構成要素と配列および形態学的類似性を共有している(線毛とタンパク質分泌系の命名法は一貫していない)。[ 92 ] これらの違いは、細菌の鞭毛とアーケラが相同性 ではなく、生物学的類似性 、または収斂進化 の典型的な例であるという理論を裏付けている。[ 93 ] [ 94 ] [ 95 ] アーケラの構造に関する研究は、2010年代初頭から大きく進展し、アーケラタンパク質の最初の原子分解能構造、アーケラの追加機能の発見、ナノアーケオータとタウマルカエオータにおけるアーケラの最初の報告が行われた。[ 96 ] [ 97 ]
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