小さな過剰マーカー染色体

小型過剰マーカー染色体（sSMC）
その他の名前	小さな過剰染色体
一次継代LX腫瘍細胞2からの代表的な核型。核型偏差：57XX、+2、i(6)(p10)、+7、+7、+8、+9、der(9)t(9 ;12)(p13 ;q11)ins(9;?)(p13;?)、+11、+11、+12、+14、+15、+16、−17、del(17)(p11.2)、+21、−22、+ mar。
専門	医学遺伝学、小児科、腫瘍学、婦人科、泌尿器科
合併症	先天異常、不妊、 腫瘍の発生
間隔	一生
原因	親の配偶子における異常な新生形成；完全なsSMCを有する親からの直接継承
防止	保因者の遺伝カウンセリング

小型過剰マーカー染色体（sSMC）は異常な余分な染色体です。1つまたは複数の正常染色体の一部のコピーが含まれており、正常染色体と同様に細胞の核にあり、細胞分裂中に複製されて各娘細胞に分配され、通常は発現される遺伝子を持っています。しかし、出生異常や新生物（腫瘍や癌など）の原因となることもあります。sSMCはサイズが小さいため、従来の細胞遺伝学的方法では事実上検出できません。細胞の正常染色体のDNAと遺伝子含有量がはるかに大きいため、 sSMCのそれらは不明瞭です。 ^{[1]これを研究するには、}蛍光in situハイブリダイゼーション、^[2]次世代シーケンシング、比較ゲノムハイブリダイゼーション、^[3]および高度に専門化された細胞遺伝学的Gバンド分析^[4]などの新しい分子技術が必要です。これらの方法を使用することで、sSMC内のDNA配列と遺伝子が特定され、個体に及ぼす可能性のある影響を定義および説明するのに役立ちます。^[5]

ヒトの細胞には通常、22対の常染色体と1対の性染色体がある。対になった常染色体の各メンバーは、1番から22番まで染色体として識別される。性染色体の対はX染色体とY染色体として識別され、女性の細胞は2つのX染色体を持ち、男性の細胞は1つのX染色体と1つの（男性の性別を決定する）Y染色体を持つ。sSMCは、定義上、より小さなヒト染色体の1つである20番染色体よりもサイズが小さい。^[6]それらは、46の染色体のうちの1つまたは複数の比較的小さな部分のコピーとして発生する。 sSMC ではすべての染色体が均等に表現されているわけではありません。全 sSMC の約 65% は15 番染色体の一部のコピーですが、5 つの末端動原体染色体、すなわち 13、14、15、21、22 番染色体のいずれかの一部のコピーは 7% のみです。 ^[5] sSMC の G バンド分析は、sSMC が由来する染色体、含まれる染色体の腕 (短腕は「p」、長腕は「q」)、および Gバンドの内容によって定義される染色体の腕の部分を識別するために一般的に使用されます。G バンド 11.2 と 13.1 の間にある 15 番染色体の q 腕の一部を含む sSMC は、15q11.2–q13.1 と記述されます。 sSMC はリング状またはセントロメア状の微小構造（中心にセントロメアを持つ線状構造）で存在し、遺伝物質の逆位反復を含むことがあり、同染色体であることもある。同染色体は、通常の染色体の 1 つの p 腕と 1 つの q 腕ではなく、2 つの重複した p 腕または 2 つの重複した q 腕を持つ。したがって、同染色体断片からなる sSMC を持つ細胞は、sSMC 内に遺伝物質のコピーが 2 つ余分に存在し、テトラソミックと呼ばれる。染色体の重複していない断片を含む sSMC を持つ細胞は、遺伝物質のコピーが 1 つ余分に存在し、トリソミックと呼ばれる。^[5]

sSMCの遺伝子は明らかに細胞の遺伝子型、すなわち遺伝子プロファイルの一部ですが、活性化できず、したがって個体を変えることはできません。しかし多くの場合、sSMCの遺伝子は活性化され、過剰発現し、関連するsSMCの障害の原因であると考えられています。^[7] sSMCは、不完全なトリソミー救済、クロモトリプシス媒介部分トリソミー救済、U型鎖交換、および/またはまれなタイプの遺伝子組み換えの1つ以上の染色体イベントの結果として形成される可能性があります。これらのイベントは通常、精子または卵子、またはその後胎児に発達する接合子（受精卵）を形成する減数分裂中にsSMCから新たに発生します。ただし、まれに、親がsSMCを保有し、精子または卵子を介して子孫に受け継ぐ場合があります。どちらの場合でも、sSMCは受精卵の発達中またはその後いつでも遺伝物質にさらなる変化を起こす可能性がある。^[8]

世界中で、小型過剰マーカー染色体は 10,000 人あたり約 4.2 個の割合で発生します。^[5] sSMC を持つ人のうち、約 70% は親の精子、卵子、または接合子の形成中に発生した突然変異の結果として sSMC を獲得し、30% は完全な sSMC を持つ親から直接受け継いでいます (母親から 20%、父親から 10%)。腫瘍に関連する sSMC のまれな症例は、ゲノム内の後天的な突然変異 の結果として個人に発生します。sSMC を持つ人の約 70% には異常がなく、それに気付いていないか、偶然に知ります。^[7]残りの約 30% は出生前発育中に異常を獲得し、子宮内、出生時、または後になって現れることがあります。 sSMC保有者の約74％、および親から遺伝したsSMC保有者の98％以上は、発達上正常です。^[9] sSMC関連異常には、先天性（出生時）または胎児期に認識される軽度から重度の症候群、^[5]成人期または成人期近くで一般的に検出される不妊症、および事実上どの年齢でも発症する良性または悪性の腫瘍が含まれます。 ^{[10] [11]}同一または類似のsSMCを持つ個人間には、幅広い特徴と特性があります。これは、少なくとも3つのメカニズムによるものです。1 ） sSMCのゲノム内容および/または個人のゲノムの違い、^[12] 2）時間の経過とともに発生するsSMCの遺伝物質の可変的な変化、^[8] 3 ）遺伝的モザイク、すなわち、胚発生中またはその後に発生するさまざまな組織および臓器へのsSMCの分布の変動。^[7]

sSMC 関連疾患は数多く存在し、そのほとんどはごく少数の患者に発生すると報告されています。以下のセクションでは、多数の患者に見られ、遺伝学的によく特徴付けられ、特定の sSMC の新たな側面や影響を例示する sSMC 関連疾患について詳しく説明します。全体として、これらの疾患は次のように分類されます。幼少期、出生時、または胎児の発育中に診断される重篤な先天異常を引き起こす sSMC 関連症候群、通常成人に診断される sSMC 関連不妊症、およびあらゆる年齢で診断される可能性のある良性、前癌性、悪性腫瘍などのsSMC 関連腫瘍(つまり、組織の異常な過剰な増殖) 。^{[引用が必要]}

猫目症候群( CES) は、シュミット・フラッカーロ症候群とも呼ばれ、先天性心疾患、腎奇形、頭蓋顔面異常、男性生殖器異常、骨格異常、境界性から中等度知的障害、猫のような上下まぶたの間の下向きの開口部など、複数の先天異常を伴う重度の疾患です。CES は、通常、テトラソミー(つまり、正常な染色体から 1 つずつ、sSMC から 2 つずつ、合計 4 つの遺伝子コピー) または、それほど一般的ではありませんが、22 番染色体の p 腕全体とこの染色体の q 腕の一部 (つまり、G バンド 1 から 11) のトリソミー(つまり、正常な染色体から 1 つずつ、sSMC から 1 つずつ、合計 3 つの遺伝子コピー)を伴います。^[5]親の精子または卵子を産生する縮瞳細胞分裂中に発生する22番染色体対間の染色体再配列変異により、CES関連sSMCsが形成され、それが親の子孫に受け継がれます。^[13]まれに、CESは親の22番染色体対間の均衡転座によって発生します。均衡転座は2本の染色体間の均等な交換であり、遺伝情報に変化はなく、通常、その保因者に悪影響はありません。しかし、22番染色体に均衡転座がある親は、CESの子供を持つリスクが高くなります。これは、均衡の取れた22番染色体間の染色体再配列変異により、親の精子または卵子にsSMC関連sSMCsが形成され、それが親の子孫に受け継がれるためです。最後に、極めて稀なケースでは、モザイクにより親が一部の細胞にのみ CES 関連 sSMC を持ち、CES の欠陥がほとんどないか全くなく、この sSMC を精子や卵子を通して子孫に直接伝えることがあります。^[14] CES 関連 sSMC は小さい場合も大きい場合もリング状の場合もあり、通常は2 Mb、つまり 200 万 DNA塩基対を含み、CES 重要領域と呼ばれ、q アームのバンド 11.1 から 11.23 に位置します。^{[5] [15]}この領域には、CES の少なくとも一部の先天性欠陥を引き起こすか促進する有力な候補遺伝子であるCECR1、SLC22A18、およびATP6V1E1^{遺伝子が含まれています。 [16]}

マーカー染色体15症候群は、アイソジセントリック15、idic(15)、部分テトラソミー15q、または逆位重複15（inv dup 15）とも呼ばれ、幼少期の中央筋（四肢筋ではない）の筋力低下および筋緊張低下、正常発達の遅れ、知的障害、自閉症行動、てんかん[5]、[17]、および/または脳異常[18]を含む中等度から重度の先天性疾患です。この^症候群は^、次^のいずれかを含むsSMCに関連しています。a ) 15番染色体のq腕のバンド11と13の間に位置するプラダー・ウィリー症候群/アンジェルマン症候群の重要な領域（PWS/ASCR）の逆位重複（15q、q11、q13と表記）。または、 b) PWS/ASCRの外側にある、バンド11（15q11と表記）周辺の15番染色体のp腕上の領域（このsSMCの細胞遺伝学的記述はdic（15）（q11）である）。15q、q11、q13、15q11のsSMCを持つ人は、それぞれisodicentric（15）症候群、inv dup（15）症候群と診断されることがある。現在、この2つの症候群は、臨床症状が多少異なると思われるマーカー染色体15症候群の一種であると考えられている。[ ^5] PWS/ACRの特定の重複遺伝子、すなわちNDN、SNRPN、UBE3A、GABRB3は、この症候群の1つ以上の疾患に寄与している疑いがある。 ^[18]染色体15q11-q13重複症候群（Dup15qとも呼ばれる）は、マーカー染色体15症候群と同様の出生異常と関連している。これは、マーカー染色体15症候群のほとんどの症例におけるsSMCと同様に、PWS/ASCRおよび上記遺伝子を含む、染色体15上のq11からq13までのバンドの重複によって引き起こされる。 ^[19]マーカー染色体15および/または染色体15q11-q13重複症候群に関連する出生異常における上記遺伝子の役割を定義するには、さらなる研究が必要である。将来の研究では、isodicentric（15）症候群とinv dup（15）症候群が異なる疾患であると判明するかもしれない。

テトラソーム15qter症候群は、知的障害、身体または身体の一部の過成長、^[5] 頭蓋突出、短い眼瞼裂、長い人中、低位置耳、高口蓋、下顎後退（上顎または下顎の異常な後方位置）、関節拘縮、クモ指症、および/または、より頻度は低いが腎臓、泌尿生殖器^[20]および様々な血管および心臓の異常を伴う極めてまれな先天性症候群である。^[21]この症候群は、バンド23と26の間の様々な部位から始まり、この腕の末端まで走る15番染色体のq腕上の遺伝物質の2つのコピー（逆位重複）を持つs​​SMCによって引き起こされる。この領域は（15）q24–qterと表記される。したがって、この症候群の患者は、sSMCにある遺伝物質のコピーを4つ持っており、つまり、各正常染色体から2つ、sSMCから2つです。^[5] セントロメアは、対になった染色体の姉妹染色分体をそれぞれリンクし、それによって有糸分裂と減数分裂の細胞分裂中に対になった染色体の各メンバーを異なる娘細胞に分配するために必要な、染色体の特殊なDNA配列です。テトラソーム15qterのsSMCには通常のセントロメアがありません。代わりに、ネオセントロメア、つまり、コピーされた染色体のセントロメア（この場合は15番染色体）が位置する場所ではない染色体の場所に形成される新しいセントロメアがあります。^[20]あらゆる種類のネオセントロメアsSMCは、症例の90％で有害な転帰と関連しています。^[5] sSMC内のどの遺伝物質が前述の先天異常の発症に寄与するかは正確には特定されていない。^[21]

エマヌエル症候群（ES）は、過剰der(22)t(11;22)症候群としても知られ、頭蓋顔面異形、発達遅延、精神遅滞、 ^[5]耳の異常、口蓋裂または高口蓋、小顎症（顎が小さい）、小頭症（頭部が通常より短い）、腎臓異常、心臓欠陥、および男性における性器異常を含む複数の先天異常を特徴とする。 ^{[22] ESは、片方の親が持つ}派生染色体からの遺伝物質を含むsSMCに関連している。派生染色体には均衡型転座、すなわち2つの染色体間の均等な交換が含まれており、遺伝情報の増加も減少も生じず、一般に保因者に悪影響を及ぼさない。この派生染色体には、バンド11.2付近の22番染色体のq腕とバンド21付近の11番染色体のq腕の間に、t(11;22)、またはder22 (22) t (11;22)と呼ばれる交換が含まれています。約10%の症例で、この染色体の保因者がESの子供を持ち、男性保因者と女性保因者がそのような子供を育てる可能性はそれぞれ0.7%と3.4%です。 ^[5]これらの親の罹患した子供は、親の派生染色体の一部のみを含む、ESを産生するsSMCを持っています。このsSMCは派生22、der(22)、またはder(22)t(11;22)と呼ばれます。罹患個体の核型（すなわち染色体数）は、女性では47,XX,+der(22)t(11;22)、男性では47,XY,+der(22)t(11;22)である。ESにおけるsSMCは、親の派生染色体が、精子または卵子を形成する減数分裂中に、相同染色体、すなわち対になった染色体から適切に分離できない不分離^[23]、形成される。ESの欠陥を引き起こすsSMC der(22)t(11;22)の遺伝物質は確立されていない。 ^{[22] [24]}

Der(22)t(8;22)(q24.1;q11.1)症候群は、過剰der(22)t(8;22)症候群とも呼ばれ、出生体重および成長は正常であるものの、中程度の知的障害、顔面および頭部の異形性、突出して低く位置し未発達な外耳道および/または耳介前窩（外耳道の前および上部の小さな穴または嚢胞）、陰指症（1本以上の手指および/または足指の異常な湾曲）、異所性精巣（通常とは異なる位置にある精巣）または停留精巣（精巣が下降していない）を伴う症候群である。^[25]この症候群は、親が持つ異常な染色体に由来するsSMCに関連している。この染色体には、8番染色体の24.13バンド付近のq腕と22番染色体の11.1バンド付近のq腕の間に均衡転座がある。この染色体の保因者は、親の異常染色体に変化のあるsSMCを獲得したため、Der(22)t(8;22)(q24.1;q11.1)症候群の子孫を持つリスクがある。この変化は、精子または卵子を形成する減数分裂細胞分裂中に親の対になったt(8;22)染色体が分離しない結果として、親の卵子または精子に発生する。この症候群の欠陥を引き起こすsSMCの遺伝物質は、まだ特定されていない。^[25]

テトラソミー9p（9p同染色体とも呼ばれる^[5]）は、子宮内発育遅延、顔面異形症、口唇裂および/または口蓋裂、四肢および骨格の奇形、および/または中枢神経系、心臓、および/または泌尿生殖器の異常を含む、広範囲の先天異常と関連している。 ^[7]テトラソミー9症例のsSMCは、3つの構成のいずれかの同染色体である： a）互いに鏡像である9番染色体の2つのp腕、 b）この染色体の2つのp腕と、バンド12から13までのq腕の小さな部分、または、 c)この染色体の2つのp腕とバンド21から22までのq腕の一部。これら3つのsSMC変異体タイプはすべて、p腕の遺伝物質のコピーを2つ含んでいるため、細胞はテトラソミー、つまりこの腕の遺伝物質の一部を4つのコピーで保有する状態になります。 ^[7]しかし、9pトリソミー関連の先天性疾患があり、これは異常な12番染色体が、一部の遺伝物質の単一コピーではなく重複コピーを含むためです。これらの個人は9pトリソミーであり、テトラソミー9pのものと類似した出生異常がありますが、それよりは軽度です。 ^{[26]出生異常を引き起こすテトラソミー9 [5]}とトリソミー9p ^[26]の遺伝物質は不明です。 a)成人におけるテトラソミー9pの症例7例は本質的に正常であったこと^[27]、およびb)遺伝学的に詳細なテトラソミー9pの症例の多くは他の染色体異常を有すること^[26]という知見は、引用されたsSMCsがテトラソミー9pで果たす役割についてはさらなる研究が必要であることを示唆している。

同染色体i（5p）（テトラソミー5pとも呼ばれる^{[28] [29]}）は、さまざまな先天異常を伴う先天性疾患であり、最も一般的なものは、発達遅延、筋緊張低下、低身長、発作、先天性心疾患、脳室拡大（脳の側脳室の拡大）、子宮内または出生後の生存期間の短縮、^[29] 精神運動遅滞、顔面変形、^[28]および/または摂食および/または呼吸困難です。^[29]同染色体i 5pのほとんどの症例は、0～5歳の個人で診断されますが、少数の症例では子宮内で診断されます。^[29] 2018年に遺伝子解析が行われた出生後症例15件を調査したところ、4件は染色体5のp腕の変異による増幅と関連し、8件はこの腕の部分的なコピー2つからなるsSMCと関連していることが判明した。12人全員にp腕の広い領域の余分なコピーが2つあった。しかし、この疾患に寄与するp腕の正確な遺伝物質は確立されていない。5p腕の余分な部分コピーが1つだけある人、つまりトリソミーの人は、テトラソミーi（5p）の人と同様の欠陥があるが、おそらくそれほど重症ではない。^[30]同染色体i（5P）sSMCの人に見られる欠陥の種類には大きなばらつきがあるが、これは少なくとも部分的には遺伝的モザイク、つまりこのsSMCの組織や臓器の分布の違いによるものである。^[29]

同染色体18p症候群^[5]はテトラソミー18pとも呼ばれ、小頭症（正常より頭が短い）、小さい腎臓、停留精巣、小陰茎、尿道下裂（陰茎の尿道口の位置が悪い）、斜視、哺乳困難、新生児黄疸、脊柱後弯症（脊椎の過剰な凸状湾曲）、側弯症（脊椎が横に湾曲している）、反復性中耳炎、難聴、便秘、哺乳困難、異形特徴^[31]、および/または中等度重度の精神遅滞を伴う出生障害である。 ^[5]この症候群のsSMcは、ほとんどの場合、親の卵子または精子の形成中または受精卵で発生する18番染色体の短腕の2つの余分なコピーで構成されていますが、sSMCが完全な遺伝性症例もまれに報告されています。 ^{[5] [32]}この症候群の発症に寄与する同染色体18p sSMC上の特定の遺伝物質は、一般的には特定されていない。 ^[32]しかし、この症候群の患者1人に関する最近の報告では、18番染色体のp腕のバンド11.21から11.32まで広がる少なくとも15MbのsSMCが明らかになった。 ^[31]

最近、一卵性双生児の女性、すなわち両親の染色体と本質的に同一のコピーを持つ双生児が研究されたが、その理由は、片方の双生児が明らかに同染色体 18p 症候群を患っていたのに対し、もう片方は完全に正常に見えたからである。遺伝子解析により、罹患双生児の頬の内側、毛包、皮膚線維芽細胞から分離されたほぼすべてまたはすべての細胞に同染色体 18p の sSMC が存在する証拠が見つかったのに対し、正常な双生児ではこれらのサンプル中の sSMC 陽性細胞が 5% 以下であった。どちらの親にも sSMC の証拠は見られなかった。したがって、正常な双生児は、同染色体 15p 症候群に関連する出生異常を引き起こすには sSMC が組織細胞にほとんど存在しない極端な形態のモザイクであるように思われる。この疾患およびおそらく他の sSMC 関連疾患における極端なレベルの sSMC モザイクは、忍容性が高く、出生異常とは関連がなく、現在考えられているよりも一般的である可能性がある。^[32]

パリスター・キリアン症候群（PKS）は、非常に幅広い先天異常を伴う先天性疾患です。最も一般的なものは、顔面異形症、皮膚色素異常、重度の知的障害、筋緊張低下、および/または発作です。まれに、難聴、乳房過剰乳首、先天性横隔膜ヘルニア、および/または局所的皮膚欠損などがあります。 ^{[33] PKSは、通常、}染色体12の2つのp腕からなる同染色体であるsSMCによって引き起こされます^が、まれに、この染色体の4つのp腕によって引き起こされることもあります。 ^[33]最近のPKS患者2名を対象とした研究では、sSMCは12番染色体のバンド11からpアーム末端までの2つの小さな重複で構成されていることが判明した。PKS臨界領域と呼ばれるこの領域には、 ING4、CHD4、 MFAP5（ MAGP2遺伝子とも呼ばれる）の3つの遺伝子が含まれており、そのうちの1つ以上がこの症候群の原因候補である。 ^[33]

ターナー症候群は、女性が典型的にはX染色体を1本しか持たず、Y染色体を全く持たないか、Y染色体の一部しか持たない状態である。これらの個人は、すべてのケースで低身長、ほとんどの場合で卵巣不全と不妊、まれに骨異常、リンパ浮腫、難聴、および/または心血管疾患、甲状腺疾患、胃腸疾患など、比較的軽度から中等度の幅広い先天異常を呈する。 ^{[34] [35]}ターナー症候群の個人のごく一部は、X染色体または、はるかに少ない頻度でY染色体の遺伝物質の一部を含むsSMCを持っている。これらのsSMCには、 XIST遺伝子が含まれる場合と含まれない場合がある。 ^[36]正常な女性では、 XIST遺伝子は母親から受け継いだX染色体上に存在し、父親から受け継いだX染色体上には存在しない。この遺伝子はY染色体上に存在せず、正常な女性では自身の母親のX染色体上に存在する多くの遺伝子を不活性化する働きをするが、父親のX染色体の遺伝子には存在しない。XIST遺伝子を含まない部分的なX染色体からなるsSMCを持つターナー症候群の女性は、このsSMCの遺伝物質の少なくとも一部を発現し、したがってこの物質を過剰に含んでいる。その結果、彼女たちは中等度から極めて重度にわたるターナー症候群のより重篤な形態を呈している。極めて重篤な症例では、無脳症（脳、頭蓋骨、頭皮の大部分が欠損している）、脳梁無形成症（左右の大脳半球をつなぐ太い神経線維の束が欠損している）、複雑な心臓変形がみられる。 XIST遺伝子を持つ部分的なX染色体を含むsSMCsを持つターナー症候群の患者は、このsSMCsの遺伝物質を発現せず、この症候群のより重篤な症状を呈さない。 ^[5]

ここで言う不妊症は、他の明らかな出生異常がない人に起こる。 ^[35]そのため、sSMCを持つ人では不妊症と診断される頻度が3倍高く、不妊症全体の0.125％に起こる。^[37]不妊男性は妊娠できない、妊娠率が異常に低い、またはパートナーを妊娠させるが妊娠後の自然流産率が異常に高い。^{[3] 2015年に発表されたレビューでは、不妊男性のsSMCには10番染色体、19番染色体、X番染色体以外の染色体の一部が含まれており、15番染色体、14番染色体、22番染色体、13番染色体/21番染色体（つまり、13番}染色体と21番染色体の一部からなる複雑なsSMC）が最も一般的であると報告されている。^[38]臨床的には、これらの男性は無精子症（精子が存在しない）、乏精子症（精子数が異常に少ない）、または無精子無力症奇形精子症（乏精子症、奇形精子症（異常な形状の精子が存在する）、精子無力症（運動性が低下した精子）の3つすべて）のいずれかです。^[3]女性におけるsSMCに関連する不妊症は男性に比べて約7.5倍少ないですが^[37]、男性と同様に、女性のsSMCはほぼすべての染色体で構成されていますが、特に15番、14番、22番、13番/21番染色体で構成されています。臨床的には、sSMC関連不妊症の女性は、無月経および/または原発性卵巣機能不全、すなわち早発閉経または40歳までに卵巣によるエストロゲン、プロゲステロン、アンドロステンジオン、アクチビン、および/またはインヒビン産生の部分的または完全な喪失などの閉経前イベントに関連する症状の履歴があります。 ^[38] sSMCによる不妊症に関与する染色体領域はごく一部しか特定されていませんが、次のようなものがあります：(15)q11.1、早発卵巣不全に関連。(13)q11.2、乏精子症および奇形精子症に関連。^[38] (14)q11.1、不妊症に関連。(22)q11、反復流産に関連。^[39]これらのsSMCにおいて不妊症を引き起こす特定の遺伝物質は、一般的には明確に定義されていません。

非定型脂肪腫（ALT）は、高分化型 脂肪肉腫の一種です。ALTという用語は、皮膚、口腔、眼窩などの外科的にアクセス可能な部位に発生した腫瘍によく適用されますが、高分化型脂肪肉腫という用語は、後腹膜などの外科的にアクセスしにくい深部の中心に位置する軟部組織の腫瘍に適用されます。^{[11] [40]}ここでは、2つの用語は同じ意味で使用されます。悪性の低分化型脂肪肉腫とは異なり、ALTは、局所浸潤性があり、外科的切除後に再発することはありますが、転移することはなく、低分化型で転移の可能性がある形態に進行することはめったにありません。そのため、一般的に良性または前癌状態の腫瘍と見なされています。^{[40] [41]} ALTの腫瘍細胞には、1つ以上のリング状のsSMC、またはバンド13から15に染色体12のqアームの余分なコピーを含む1つの巨大マーカー染色体（つまり、自分自身または1つ以上の他の染色体の重複によって拡大した染色体）が含まれます。この12番染色体の領域には、バンド15に位置するMDM2 プロトオンコゲン（潜在的に腫瘍を引き起こす遺伝子）^[42]と、バンド14.1に位置するCDK4（さまざまな腫瘍の発生に関連する遺伝子）が含まれます。^{[43] [44]}これら2つの遺伝子の存在は、脂肪腫性腫瘍が別のタイプの脂肪腫性腫瘍ではなくALTであることの非常に感度が高く特異的な指標です。^[44] ALTに関与するsSMCと巨大マーカー染色体には、他の染色体の配列が含まれている可能性があります。さらに、環状sSMCは頻繁に破損し、再封鎖され、棒状になり、遺伝物質の増加や喪失を生じます。これらの要因は、ATM内のsSMCを有する腫瘍細胞の生存と成長を促進するのに役立つ可能性があります。^[45]これらの複雑な要因の結果として、ALTの発生に関与するsSCMと巨大マーカー染色体の特定の遺伝物質は確立されていません。

低悪性度骨肉腫（LGO）は、低悪性度中心性骨肉腫および骨傍性骨肉腫を含め、他のほとんどのタイプの骨肉腫骨腫瘍よりもはるかに悪性度が低い。^[46] LGOの腫瘍細胞には、過剰環状sSMCまたは巨大桿体マーカー染色体（巨大桿体染色体またはRGMとも呼ばれる）が含まれている。RGMは過剰（つまり余分な）染色体であり、20番染色体より大きいため、ここではsSMCとして分類するには大きすぎると見なされている。^[47] LGOのsSMCとRGMには、バンド13からバンド15（12q13–15と表記）を含む12番染色体のq腕の一部が含まれている。他の様々な種類の癌の腫瘍細胞で増幅されるいくつかの遺伝子は、LGO関連のsSMCおよび巨大桿体染色体にあり、したがってLGO関連のsSMCおよび巨大桿体染色体で増幅される可能性がある。これらの遺伝子には、MDM2、CDK4、FRS2、HMGA2、YEATS4（YEATS4はYEATSドメイン4 ^[48]を含む）、およびCPMが含まれる。MDM2、CDK4、およびFRS2遺伝子は、すべてのLGO症例の67％から100％で増幅されており、LGOの発生および/または進行に寄与している疑いがある。^[10]しかし、LGOのsSMCとRGMはどちらも、他の様々な染色体の一部を含むのが一般的で、複数存在する可能性があり、細胞分裂中に遺伝物質が変化することが多い。その結果、LGOの形成と発達の原因となる特定の遺伝物質を特定することは困難であった。^[45]

ターナー症候群の人のほとんどは、X染色体を1本持ち、Y染色体を1本もっていません。しかし、ターナー症候群の人の約5.5%は、Y染色体の一部を含むsSMCを持っています。この部分的にY染色体を持つsSMCには、Y染色体のp腕のバンド11.2（Yp11.2と表記）に位置するSRY遺伝子が含まれている可能性があります。この遺伝子は、精巣決定因子タンパク質（性別決定領域Yタンパク質としても知られています）をコードしています。このSRY遺伝子を含むsSMCを持つターナー症候群の人は、性腺芽細胞腫やin situ セミノーマ（この腫瘍は精巣腫瘍であるセミノーマの病理学を持ちますが、卵巣で発生するため、未分化胚細胞腫とも呼ばれます^[49]）などの性腺組織腫瘍の発生率が高くなります。それ以外の点では、これらの個人は、多毛症および/または陰核肥大を伴う少数の例外を除いて、ターナー症候群の典型的な特徴を有する。^[50]これらのsSMC関連腫瘍を発症する脅威を除去するために、生殖腺の外科的切除が推奨されている。 ^{[50] [51] [52]} SRY遺伝子を欠くsSMCを有するターナー症候群の個人は、これらの癌を発症するリスクが高くない。^[50]

アイソクロモソーム i (5p)(p10) を含む sSMC (アイソクロモソーム 18p 症候群に関する上記のセクションを参照) は、特定の種類の癌の悪性細胞に存在することが文書化されています。これらの細胞でこの細胞が存在するのは遺伝によるものではなく、むしろ患者のゲノムにおける癌関連の変異によるものです。^{[5] sSMC i(5)(p10) は、}膀胱の移行上皮癌で最も一般的な再発性構造染色体異常であり、この疾患のほとんどの症例の悪性細胞に存在しています。この sSMS に関連する膀胱移行上皮癌は、関連しない癌よりも悪性度と浸潤性が高いです。^[53] sSMC i(5)(p10)は、多くの場合2つ以上のコピーで、個人の悪性子宮頸がん細胞にも見られます^[54]。また、最も古く、最も一般的に研究されている不死化細胞株であるHeLa細胞にも見られます。これらの細胞は、1951年にがんで亡くなった31歳のアフリカ系アメリカ人、ヘンリエッタ・ラックスの子宮頸がんから単離されました。 ^[55] sSMC i (5)(p10)は、まれに卵巣がんや非常にまれに乳がんでも検出されます。^[5]これらのsSMCがこれらのがんの発生や進行を促進するメカニズムは不明です。^[56]

• マーカー染色体