ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ING4 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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2K1J、2M1R、2PNX、2VNF、4AFL |
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| 識別子 |
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| エイリアス | ING4、my036、p29成長阻害因子ファミリーメンバー4 |
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| 外部ID | オミム:608524; MGI : 107307;ホモロジーン: 22952;ジーンカード:ING4; OMA :ING4 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体6(マウス)[2] |
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| | バンド | 6 F2|6 59.17 cM | 始める | 125,016,723 bp [2] |
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| 終わり | 125,026,228 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 神経節隆起
- 単球
- 心室帯
- 小脳の右半球
- 右子宮管
- 顆粒球
- 甲状腺の右葉
- 甲状腺の左葉
- C1セグメント
- S状結腸の筋層
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| | トップの表現 | - 顆粒球
- 心室帯
- リップ
- 網膜の神経層
- ヘンレループの細い上行脚
- 右腎臓
- 精母細胞
- 太ももの筋肉
- 桑実胚
- 海馬歯状回顆粒細胞
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- 転写活性化因子活性
- 金属イオン結合
- メチル化ヒストン結合
- タンパク質結合
| | 細胞成分 |
- ヒストンアセチルトランスフェラーゼ複合体
- 核
- 核質
- 細胞質
- 中間径フィラメント細胞骨格
| | 生物学的プロセス |
- 成長のマイナス規制
- ヒストンH4-K5のアセチル化
- DNA複製
- ヒストンのアセチル化
- ヒストンH3のアセチル化
- アポトーシス過程の正の調節
- ヒストンH4-K16のアセチル化
- 細胞周期
- 転写の負の調節、DNAテンプレート
- ヒストンH4-K8のアセチル化
- ヒストンH4-K12のアセチル化
- 細胞集団増殖の負の調節
- タンパク質のアセチル化
- DNA損傷応答、p53クラスメディエーターによるシグナル伝達、その結果p21クラスメディエーターの転写が起こる
- アポトーシスの過程
- クロマチン組織
- 核酸テンプレート転写の正の制御
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_001127582 NM_001127583 NM_001127584 NM_001127585 NM_001127586
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NM_016162 NM_198287 |
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NM_133345 NM_144510 NM_001368695 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_001121054 NP_001121055 NP_001121056 NP_001121057 NP_001121058
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NP_057246 |
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| 場所 (UCSC) | 12 章: 6.65 – 6.66 Mb | 6 章: 125.02 – 125.03 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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成長タンパク質4阻害因子は、ヒトではING4遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、TP53と相互作用して細胞増殖を阻害し、アポトーシスを誘導する腫瘍抑制タンパク質であるING1に類似している。このタンパク質には、クロマチンリモデリングに関与するタンパク質に共通するモチーフであるPHDフィンガーが含まれている。このタンパク質は、ヒストンアセチルトランスフェラーゼ複合体の構成要素であるTP53およびEP300/p300に結合することができるため、TP53依存性制御経路に関与していることが示唆されている。選択的スプライシング転写バリアントが観察されているが、それらの生物学的妥当性は決定されていない。[6]
インタラクション
ING4はEP300、[5]、RELA [7]、P53と相互作用することが示されている。[5] [8]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000111653 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000030330 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ abc シセキ M、ナガシマ M、ペドゥ RM、北浜シセキ M、三浦 K、岡村 S、大野木 H、東本 Y、アペラ E、横田 J、ハリス CC (2003 年 5 月)。 「p29ING4 および p28ING5 は p53 および p300 に結合し、p53 活性を増強します。」がん研究。63 (10): 2373–8 . PMID 12750254。
- ^ ab 「Entrez Gene: ING4 成長ファミリーの阻害剤、メンバー 4」。
- ^ Garkavtsev I、Kozin SV、Chernova O、Xu L、Winkler F、Brown E、Barnett GH、Jain RK (2004 年 3 月)。「候補腫瘍抑制タンパク質 ING4 は脳腫瘍の成長と血管新生を制御する」。Nature . 428 ( 6980 ) : 328– 32。Bibcode : 2004Natur.428..328G。doi : 10.1038/nature02329。PMID 15029197。S2CID 4427531。
- ^ Tsai KW、Tseng HC、Lin WC (2008 年10 月)。「2 つのウォブルスプライシングイベントが ING4 タンパク質の核内局在と分解に影響を与える」。実験細胞研究。314 (17): 3130– 41。doi :10.1016/ j.yexcr.2008.08.002。PMID 18775696 。
さらに読む
- Ozer A、 Bruick RK (2005 年 9 月)。「プロリルヒドロキシラーゼによる HIF の制御: 候補腫瘍抑制タンパク質 ING4 のリクルートメント」。細胞周期。4 ( 9): 1153–6。doi : 10.4161/ cc.4.9.2040。PMID 16096374 。
- Bonaldo MF、 Lennon G、Soares MB (1996 年 9 月)。「正規化と減算: 遺伝子発見を容易にする2つのアプローチ」。ゲノム研究。6 (9): 791– 806。doi : 10.1101/ gr.6.9.791。PMID 8889548 。
- Hu RM、Han ZG、Song HD、Peng YD、Huang QH、Ren SX、Gu YJ、Huang CH、Li YB、Jiang CL、Fu G、Zhang QH、Gu BW、Dai M、Mao YF、Gao GF、Rong R、Ye M、Zhou J、Xu SH、Gu J、Shi JX、Jin WR、Zhang CK、Wu TM、Huang GY、Chen Z、Chen MD、Chen JL (2000 年 8 月)。「ヒト視床下部-下垂体-副腎系における遺伝子発現プロファイリングと完全長 cDNA クローニング」。米国科学アカデミー紀要。97 (17): 9543–8。Bibcode : 2000PNAS ...97.9543H。doi : 10.1073/pnas.160270997 . PMC 16901 . PMID 10931946.
- Garkavtsev I、Kozin SV、Chernova O、Xu L、Winkler F、Brown E、Barnett GH、Jain RK (2004 年 3 月)。「候補腫瘍抑制タンパク質 ING4 は脳腫瘍の成長と血管新生を制御する」。Nature。428 ( 6980 ) : 328– 32。Bibcode : 2004Natur.428..328G。doi : 10.1038 / nature02329。PMID 15029197。S2CID 4427531。
- Zhang X、Xu LS、Wang ZQ、Wang KS、Li N、Cheng ZH、Huang SZ、Wei DZ、Han ZG (2004 年 7 月)。「ING4 は HepG2 細胞における G2/M 細胞周期停止を誘導し、DNA 損傷因子に対する化学感受性を高める」。FEBS Letters。570 ( 1–3 ) : 7–12。doi : 10.1016 / j.febslet.2004.06.010。PMID 15251430。S2CID 12379202 。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、Shenmen CM、Grouse LH、Schuler G、Klein SL、Old S、Rasooly R、Good P、Guyer M、Peck AM、Derge JG、Lipman D、Collins FS、Jang W、Sherry S、Feolo M、Misquitta L、Lee E、Rotmistrovsky K、Greenhut SF、Schaefer CF、Buetow K、Bonner TI、Haussler D、Kent J、Kiekhaus M、Furey T、Brent M、Prange C、Schreiber K、Shapiro N、Bhat NK、Hopkins RF、Hsie F、Driscoll T、Soares MB、Casavant TL、Scheetz TE、Brown-stein MJ、Usdin TB、Toshiyuki S、Carninci P、Piao Y、Dudekula DB、Ko MS、Kawakami K、Suzuki Y、Sugano S、Gruber CE、Smith MR、Simmons B、Moore T、Waterman R、Johnson SL、Ruan Y、Wei CL、Mathavan S、Gunaratne PH、Wu J、Garcia AM、Hulyk SW、Fuh E、Yuan Y、Sneed A、Kowis C、Hodgson A、Muzny DM、McPherson J、Gibbs RA、Fahey J、Helton E、Ketteman M、Madan A、Rodrigues S、Sanchez A、Whiting M、Madari A、Young AC、Wetherby KD、Granite SJ、Kwong PN、Brinkley CP、Pearson RL、Bouffard GG、Blakesly RW、Green ED、Dickson MC、Rodriguez AC、Grimwood J、Schmutz J、Myers RM、Butterfield YS、Griffith M、Griffith OL、Krzywinski MI、リャオ N、モリン R、モリン R、パームクイスト D、ペトレスク AS、スカルスカ U、スマイラス DE、ストット JM、シュナーヒ A、シャイン JE、ジョーンズ SJ、ホルト RA、バロス A、マーラ MA、クリフトン S、マコウスキー KA、ボサック S、マレック J (2004 年 10 月)。 「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。ゲノム研究。14 (10B): 2121–7 .土井:10.1101/gr.2596504。PMC 528928。PMID 15489334。
- Kim S、Chin K、Gray JW、Bishop JM (2004 年 11 月)。「接触阻害の消失を抑制する遺伝子のスクリーニング: ヒト癌における腫瘍抑制遺伝子候補としての ING4 の特定」。米国科学アカデミー 紀要。101 ( 46 ): 16251–6。Bibcode :2004PNAS..10116251K。doi : 10.1073 / pnas.0407158101。PMC 528940。PMID 15528276。
- Zhang X、Wang KS、Wang ZQ、Xu LS、Wang QW、Chen F、Wei DZ、Han ZG (2005 年 6 月)。「ING4 の核局在シグナルは p53 への結合において重要な役割を果たす」。生化学および生物物理学的研究通信。331 (4): 1032– 8。doi :10.1016/ j.bbrc.2005.04.023。PMID 15882981 。
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- ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實=岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ=グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグDS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサク S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M ( 2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
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- ラホ G、ミランダ C、タンボリーニ E、ピエロッティ MA、グレコ A (2007 年 8 月)。 「ヒトING4腫瘍抑制遺伝子の新規mRNAスプライス変異体の検出」。がん遺伝子。26 (36): 5247–57 .土井: 10.1038/sj.onc.1210335。PMID 17325660。
- Zhang X、Lin DH、Jin Y、Wang KS、Zhang Y、Babilonia E、Wang Z、Wang Z、Giebisch G、Han ZG、Wang WH (2007 年 5 月)。「成長抑制因子 4 (ING4) は、カリウム摂取量が少ないとアップレギュレーションされ、MAPK 刺激によって腎外髄質カリウムチャネル (ROMK) を抑制する」。米国 科学アカデミー紀要。104 ( 22): 9517– 22。Bibcode : 2007PNAS..104.9517Z。doi : 10.1073/ pnas.0703383104。PMC 1890526。PMID 17517644。
外部リンク
- 米国国立医学図書館の医学主題標目表(MeSH)における ING4+タンパク質、+ヒト
この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。