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重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）の変異体は、元のウイルスと類似しているものの、遺伝子変異が顕著であるため、ウイルス学者が別個にラベル付けするに至ったウイルスである。SARS-CoV-2は、新型コロナウイルス感染症（COVID-19）を引き起こすウイルスである。一部の変異体は、感染力の増大[1] 、毒性の増大、またはワクチンの有効性の低下の可能性があるため、特に重要であるとされている。 [2] [3]これらの変異体は、 COVID-19パンデミックの継続に寄与している。
2024年9月24日現在、世界保健機関[update]が指定する注目の変異株はBA.2.86とJN.1であり、監視対象の変異株はJN.1.7、KP.2、KP.3、KP.3.1.1、JN.1.18、LB.1、XECである。[4]
概要
SARS-CoV-2の起源は特定されていない。[5]しかし、SARS-CoV-2の出現は、コウモリのSARSのようなコロナウイルスとセンザンコウのコロナウイルスの異種間伝播による組み換えイベントの結果である可能性がある。 [6] [7]入手可能な最も古いSARS-CoV-2ウイルスゲノムは2019年12月に患者から収集され、中国の研究者はこれらの初期ゲノムをコウモリとセンザンコウのコロナウイルス株と比較して祖先のヒトコロナウイルス型を推定した。特定された祖先ゲノム型は「S」とラベル付けされ、その優勢な派生型は変異アミノ酸の変化を反映して「L」とラベル付けされた。西側の研究者らは独立して同様の分析を行ったが、祖先型を「A」、派生型を「B」とラベル付けした。 B型は、懸念される主要な世界的変異株の祖先であるB.1を含むさらなる型に変異し、2021年にWHOによってアルファ、ベータ、ガンマ、デルタ、オミクロン変異株として分類されました。[8] [9] [10]
パンデミックの初期には、感染者数が比較的少なかったため（パンデミックの後期と比較して）、ウイルスゲノムの変異の機会が少なく、したがって、分化した変異体の発生機会も少なかった。[11]変異体の発生が稀であったため、ACE2と相互作用する受容体結合ドメイン（RBD）領域におけるSタンパク質変異の観察も頻繁ではなかった。[12]
時間が経つにつれ、SARS-CoV-2のゲノムの進化（ランダムな突然変異による）により、より伝染性が高いと観察されるウイルスの変異体（つまり、遺伝子変異体）が自然淘汰されるようになりました。注目すべきことに、アルファ変異体とデルタ変異体はどちらも、以前に特定されたウイルス株よりも伝染性が高いことが観察されました。[13]
SARS-CoV-2の変異体の中には、感染からの回復やワクチン接種による集団免疫の高まりにもかかわらず複製適応度を維持（または増加）するものがあるとして懸念されている[14] 。懸念される変異体の中には、Sタンパク質のRBDに変異が見られるものがある[15]。
定義
COVID-19を引き起こすSARS-CoV-2の懸念される変異体（VOC）という用語は、スパイクタンパク質受容体結合ドメイン（RBD）の変異によりRBD-hACE2複合体における結合親和性が大幅に増加する（例：N501Y）ウイルスの変異体に使用されるカテゴリであり（遺伝データ）、同時にヒト集団における急速な拡散にも関連している（疫学データ）。[16]
このカテゴリーに分類される前に、出現した変異体は、関心対象の変異体（VOI）[17] 、または一部の国では調査中の変異体（VUI）[18]と分類されることがあります。関心対象の変異体としてより徹底的な評価が行われているか、または評価が行われた後に、変異体は通常、パンゴ命名システム[19]の系統と、ネクストストレイン[20]およびGISAID [21]システムの系統に割り当てられます。
歴史的に、WHOは懸念される変異株（VOC）に関する最新情報を定期的にリストアップしてきた。懸念される変異株とは、感染率、毒性、またはワクチンなどの緩和策に対する耐性が増加した変異株である。加盟国から提出された変異株はGISAIDに提出され、その後、変異株の現地調査が行われる。[22] 2023年10月4日に公表された更新された定義では、世界保健機関のSARS-CoV-2変異株の暫定定義に、関心のある変異株（VOI）と監視中の変異株（VUM）が追加されている。[23] [24]米国のCDCなどの他の組織では、懸念される変異株の定義が若干異なるのが一般的で、たとえば、CDCは2022年4月14日にデルタ変異株のエスカレーションを解除したが、[25] WHOは2022年6月7日に解除した。
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2023年3月15日現在[update]、[26] WHOはVOIを「伝染性、毒性、抗体回避、治療薬への感受性、検出可能性などのウイルス特性に影響を及ぼすことが予測される、または知られている遺伝子変化を伴う」変異体であり、世界的な公衆衛生リスクが示唆される程度にWHOの1つの地域以上で他の変異体よりも多く循環している変異体と定義しています。[27]さらに、更新では、「VOIは、NextstrainやPangoで使用されているような確立された科学的命名システムを使用して参照される」と述べられています。[27]
注目度の基準
ウイルスは一般的に時間の経過とともに突然変異を起こし、新しい変異体を生み出します。集団内で新しい変異体が増加しているように見える場合、それは「新興変異体」と呼ばれることがあります。SARS-CoV-2の場合、新しい系統はわずか数ヌクレオチドだけ互いに異なることがよくあります。[14]
新たな変異株の潜在的な影響としては、次のようなものがある: [28] [29]
- 感染力の上昇
- 罹患率の増加
- 死亡率の上昇
- 診断検査による検出を回避する能力
- 抗ウイルス薬に対する感受性の低下（そのような薬が利用可能になった場合）
- 治療（回復期血漿やモノクローナル抗体など）または実験室実験における中和抗体に対する感受性の低下
- 自然免疫を回避する能力（例：再感染を引き起こす）
- ワクチン接種を受けた個人に感染する能力
- 多臓器炎症症候群や長期COVIDなどの特定の病気のリスクが高まります。
- 子供や免疫不全患者など、特定の人口統計グループまたは臨床グループに対する親和性が向上します。
これらの基準の 1 つ以上を満たすと思われる変異体は、これらの特性の検証と妥当性確認を待つ間、 「調査中の変異体」または「関心のある変異体」と分類されることがあります。関心のある変異体の主な特徴は、それが症例数の増加または特有のアウトブレイク クラスターの原因であることを示す証拠を示していることです。ただし、国レベルでの蔓延または拡大が限定的でなければならず、そうでない場合は「懸念のある変異体」に分類が引き上げられます。[30] [31]特定の変異体に対する予防策または介入策の有効性が大幅に低下しているという明確な証拠がある場合、その変異体は「重大な影響のある変異体」と呼ばれます。[25]
命名法
SARS-CoV-2の変異株は、その系統と構成変異によって分類されている。[14]政府や報道機関を含む多くの組織は、懸念される変異株を、それらが最初に特定された国で口語的に呼んだ。[42] [43] [44]数か月に及ぶ議論の後、世界保健機関は2021年5月31日に重要な株にギリシャ文字の名前を発表した。 [45]これにより、シンプルで言いやすく、偏見のない方法で簡単に参照できるようになった。[46] [47]この決定は、ウイルスの変異株を指すために国名を使用することに対する政府からの批判が部分的に原因である可能性がある。WHOは、国名を挙げることで偏見を引き起こす可能性があると言及した。[48] WHOは、アルファからミューまでのすべての文字を使用した後（下記参照）、2021年11月にギリシャ語アルファベットの次の2文字であるヌとシを省略し、オミクロンを使用したため、中国の指導者である 習近平を怒らせないようにするためにシを省略したとの憶測が飛び交った。[49] WHOは、ヌは「新しい」と混同されやすく、シは一般的な姓であることを説明しました。[49] WHOがギリシャ語アルファベット全体を使用する場合、機関は将来の変種に星座にちなんで命名することを検討しました。[50]
系統と系統群
SARS-CoV-2には何千もの変異体が存在するが[51] 、ウイルスのサブタイプは系統やクレードなどのより大きなグループに分類することができる。[b]一般的に使用される3つの主要な命名法[52]が提案されている。
- 2021年1月現在[update]、GISAID（ SARS-CoV-2をhCoV-19と呼んでいる[33]）は、8つの世界的な系統（S、O、L、V、G、GH、GR、GV）を特定している。[53]
- 2017年、ハドフィールドらは「病原体の進化をリアルタイムで追跡する」ことを目的としたNextstrainを発表しました。 [54] Nextstrainはその後、SARS-CoV-2の追跡に使用され、2021年6月現在、13の主要な系統群[c]（19A–B、20A–20J、21A）を特定しています[update]。[55]
- 2020年、PANGOLIN（命名された世界的なアウトブレイク系統の系統分類） [56]ソフトウェアチームのRambautらは、論文[19]で「活発に循環しているウイルス系統と新しい場所に広がるウイルス系統に焦点を当てたSARS-CoV-2系統の動的な命名法」を提案しました。[52] 2021年8月現在[update]、1340の系統が指定されています。[57] [58]
各国の公衆衛生機関は、特定の変異体を追跡する目的で独自の命名システムを導入することもある。例えば、イングランド公衆衛生局は、追跡対象の各変異体を年、月、番号で[YYYY] [MM]/[NN]の形式で指定し、調査中の変異体には「VUI」、懸念される変異体には「VOC」をそれぞれ先頭に付けている。[30]このシステムは現在修正されており、[YY] [MMM]-[NN]の形式が使用されており、月は3文字のコードで表記されている。[30]
参照配列
現時点では、インデックスケースまたは「患者ゼロ」がいつ発生したかは不明であるため、特定の研究における参照シーケンスの選択は比較的恣意的であり、さまざまな注目すべき研究の選択は次のように異なります。
- 最も古い配列である武漢1号は2019年12月24日に収集された。[59]
- 1つのグループ（Sudhir Kumar et al.）[59]はNCBI 参照ゲノム（GenBankID:NC_045512; GISAID ID: EPI_ISL_402125）[60]を広範に参照しており、このサンプルは2019年12月26日に収集されましたが、[61]彼らはまた、WIV04 GISAID参照ゲノム（ID: EPI_ISL_402124）[62]も分析に使用しました。[63]
- 別の情報源（Zhukova et al.）によると、GISAID S系統/ PANGO A系統/ Nextstrain 19B系統に属する配列WIV04/2019は、ヒトに感染した元のウイルスの配列（「配列ゼロ」として知られる）に最も近いと考えられています。[35] WIV04/2019は2019年12月30日に症状のある患者から採取され、参照配列として広く使用されています（特にGISAIDと協力している人々によって）[64]。[35]
中国武漢で最初に採取され特定された変異体は、研究者らによって、3つの変異によって祖先ゲノムと異なると考えられている。[59] [65]その後、SARS-CoV-2の多くの異なる系統が進化した。[57]
懸念される、または監視されている過去の変異株の概要
以下の表は、現在および過去に流行していた懸念される変異株（VOC）に関する情報と相対リスクレベル[66]を示しています。 [d]特に明記しない限り、間隔は95％の信頼度または信憑性レベルを想定しています。現在、研究のためのデータが限られているため、すべての推定値は近似値です。アルファ、ベータ、ガンマ、デルタについては、検査精度に変化はなく、[67] [72]一部のモノクローナル抗体では中和抗体の活性が保持されています。[25] [73] PCR検査では、引き続きオミクロン変異株が検出されています。[74]
以前に流行し、以前に監視されていた変異株（WHO）
WHOは、以前に流行した変異株を「他の流行しているSARS-CoV-2変異株と比較して、もはや世界的な公衆衛生に大きな追加リスクをもたらさないことが実証されている」変異株と定義しているが、依然として監視する必要がある。[93]
2023年3月15日、WHOはVOCの追跡システムに関する最新情報を発表し、VOCのみにギリシャ文字を割り当てると発表した。[26]
以前に流行した懸念される変異株（VOC）
以下に挙げる変異株は、以前は懸念される変異株として指定されていたが、他の変異株に取って代わられた。2022年5月現在[update]、WHOは「以前に流行していた懸念される変異株」として以下を挙げている。[93]
アルファ（系統B.1.1.7）
2020年10月にイギリスでCOVID-19パンデミックが起こった際に、前月にケントで採取されたサンプルから初めて検出された[94]系統B.1.1.7、[95] WHOによってアルファ変異体と分類されたこの変異体は、以前は2020年12月に最初の調査中の変異体（VUI – 202012/01） [96]として知られており、後にVOC-202012/01と表記された。[30]また、20I（V1）[75] 20I/501Y.V1 [97]（以前は20B/501Y.V1）[28] [98] [99]または501Y.V1 [100]としても知られている。2020年10月から12月にかけて、その有病率は推定世代間隔である6.5日ごとに倍増した。[101] [102]これは英国におけるCOVID-19感染率の大幅な増加と相関しており、部分的にはN501Y変異に関連している。[101]この変異株は伝染力が40～80%増加したという証拠がいくつかあり（ほとんどの推定値はこの範囲の中間から高めの範囲にある）、[103] [104]初期の分析では致死率の増加が示唆されたが、[105] [106]その後の研究では毒性の増加の証拠は見つからなかった。[107] 2021年5月現在、アルファ変異株は約120か国で検出されている。[108]
2022年3月16日、WHOはアルファ変異株とその亜変異株を「以前に流行していた懸念される変異株」に格下げした。[109] [110]
B.1.1.7 と E484K
懸念される変異株21FEB-02（以前はVOC -202102/02と表記されていた）は、イングランド公衆衛生局（PHE）によって「E484Kを伴うB.1.1.7」[30]と説明されており、パンゴ命名システムでは同じ系統であるが、追加のE484K変異を持っている。2021年3月17日現在、英国では39件のVOC -21FEB-02の確認症例があった。[30] 2021年3月4日、科学者らはオレゴン州でE484K変異を伴うB.1.1.7を報告した。分析された13の検査サンプルのうち1つにこの組み合わせがあり、輸入されたのではなく、自然発生的に地元で発生したようであった。[111] [112] [113]この変異体の他の名称には、B.1.1.7+E484K [114]やB.1.1.7 Lineage with S:E484Kなどがある。[115]
ベータ（系統 B.1.351）
2020年12月18日、501.V2変異株（501.V2、20H（V2）[75] 20H/501Y.V2 [97]（旧称20C/501Y.V2）、501Y.V2 [116] VOC-20DEC-02（旧称VOC -202012/02）、または系統B.1.351、[28]とも呼ばれる）が南アフリカで初めて検出され、同国の保健局によって報告された。[117]これはWHOによってベータ変異株と分類されている。研究者や当局は、この変異株の有病率は基礎疾患のない若者の間で高く、他の変異株と比較して、それらの場合に重篤な病気を引き起こす頻度が高いと報告した。[118] [119]南アフリカ保健省はまた、この変異株が他の以前のウイルスの変異株よりも急速に広がっていることから、同国におけるCOVID-19流行の第二波を引き起こしている可能性があると示唆した。 [117] [118]
科学者らは、この変異株には、ウイルスのスパイク糖タンパク質の受容体結合ドメイン（RBD）における以下の3つの変異、N501Y、 [117] [120] K417N、およびE484Kにより、ヒト細胞に付着しやすくなるいくつかの変異が含まれていると指摘した。[121] [122] N501Y変異は英国でも検出されている。[117] [123]
2022年3月16日、WHOはベータ変異株とその亜変異株を「以前に流行していた懸念される変異株」に格下げした。[109] [110]
ガンマ（系統P.1）
ガンマ変異株または系統P.1は、イングランド公衆衛生局によって懸念変異株21JAN-02 [30] (旧称VOC-202101/02) [30] 、ネクストストレインによって20J (V3) [75]または20J/501Y.V3 [97]、あるいは単に501Y.V3 [100]と呼ばれ、 2021年1月6日に国立感染症研究所 (NIID) によって東京で検出された。これはWHOによってガンマ変異株と分類されている。この新しい変異株は、2021年1月2日にブラジルのアマゾナス州から東京に到着した4人から初めて確認された。 [124] 2021年1月12日、ブラジル・英国CADDEセンターは、アマゾンの熱帯雨林で新しいガンマ変異株の現地症例13件を確認した。[125]このSARS-CoV-2の変異体は系統P.1と命名されており（B.1.1.28の子孫ではあるが、B.1.1.28.1 [67] [126]という名前は許可されていないため、結果としてP.1という名前となる）、17のユニークなアミノ酸変化があり、そのうち10はスパイクタンパク質に存在し、3つの関連する変異であるN501Y、E484K、K417Tを含む。[125] [126] [127] [128] ：図5
N501YおよびE484K変異は、安定したRBD-hACE2複合体の形成を促進し、RBDのhACE2への結合親和性を高めます。しかし、K417T変異はRBDとhACE2の複合体形成を阻害し、結合親和性を低下させることが実証されています。[1]
この新しい変異株は、2020年3月から11月にかけてアマゾナス州マナウスで採取されたサンプルには存在しなかったが、2020年12月15日から23日までの同市のサンプルの42％で検出され、続いて12月15日から31日までの間に52.2％、2021年1月1日から9日までの間に85.4％で検出された。 [125]ある研究によると、ガンマによる感染者は、ブラジルで確認された他の系統（B.1.1.28またはB.1.195）に感染した人と比較して、ほぼ10倍のウイルス量を生成する可能性がある。ガンマはまた、成人と高齢者の両方に感染する能力は同じで、伝染力が2.2倍高いことを示した。これは、P.1およびP.1に似た系統が、性別に関係なく若い人間に感染させるのに成功していることを示唆している。[129]
2020年11月から2021年1月の間にマナウスで収集されたサンプルの研究では、ガンマ変異株は1.4～2.2倍伝染性が高く、以前のコロナウイルス感染症からの遺伝免疫の25～61％を回避できることが示され、以前のCOVID-19感染から回復した後の再感染の可能性があることがわかりました。致死率に関しては、ガンマによる感染は10～80％致死率が高いことも判明しました。[130] [131] [132]
研究では、ファイザーまたはモデルナのワクチンを完全に接種した人はガンマに対する中和効果が大幅に低下していることが判明しましたが、病気の経過に対する実際の影響は不明です。4月初旬に発表されたオスワルド・クルス財団のプレプリント研究では、シノバックのコロナバックワクチンの初回投与を受けた人の実際のパフォーマンスは約50％の有効率でした。彼らは、2回目の投与後に有効性が高くなると予想しました。2021年7月現在、研究は進行中です。[133]
2つの研究からの予備データによると、オックスフォード-アストラゼネカワクチンはガンマ変異株に対して有効であることが示されていますが、正確な有効性のレベルはまだ発表されていません。[134] [135]ブタンタン研究所が実施した研究の予備データは、コロナバックがガンマ変異株に対しても有効であることを示唆しており、2021年7月現在、確定的なデータを得るためにはまだ拡大されていません。[136]
2022年3月16日、WHOはガンマ変異株とその亜変異株を「以前に流行していた懸念される変異株」に格下げした。[109] [110]
デルタ（系統 B.1.617.2）
デルタ変異株は、B.1.617.2、G/452R.V3、21A [75]または21A/S:478K [97]としても知られ、少なくとも185か国に広がった世界的に優勢な変異株であった。[137]インドで最初に発見された。調査中のカッパ変異株も含まれる系統B.1.617の子孫であるデルタ変異株は、2020年10月に初めて発見され、それ以来国際的に広がっている。[138] [139] [140 ] [141] [142] 2021年5月6日、英国の科学者は、B.1.617.2（特にE484Qの変異が欠如している）を「懸念される変異株」と宣言し、VOC-21APR-02と名付けた。これは、この変異株が元のウイルスよりも急速に広がり、アルファよりも速く、またはアルファと同じくらい速く広がる可能性があるという証拠を示したためである。[143] [68] [144] [145] SpikeではL452RとP681Rの変異を持ちます。[36] Kappaとは異なり、T478Kを持ちますが、E484Qは持ちません。
2021年6月3日、イングランド公衆衛生局は、イングランドでデルタ変異株による死亡者42人のうち12人がワクチン接種を完了した人々であり、アルファ変異株のほぼ2倍の速さで広がっていると報告した。[146]また、6月11日には、カナダのカルガリーにあるフットヒルズ医療センターが、デルタ変異株の症例22人のうち半数がワクチン接種を完了した人々であったと報告した。[147]
2021年6月、K417N変異を伴うデルタの変異体に関する報告が出始めた。[148]ベータ変異体とガンマ変異体にも存在するこの変異は、ワクチンや抗体治療の有効性の低下や再感染のリスク増加の可能性について懸念を引き起こした。[149]イングランド公衆衛生局によって「K417Nを伴うデルタ」と呼ばれるこの変異体には、パンゴ系統AY.1とAY.2に対応する2つの系統が含まれている。[150] 「デルタプラスK417N」から「デルタプラス」 [151]というニックネームが付けられている。[152]この変異の名称K417Nは、417番目の位置でリジン（K）がアスパラギン（N）に置き換わる交換を指す。 [153]インド保健家族福祉省は6月22日、インドで22件の変異例が報告されたことを受けて、COVID-19の「デルタプラス」変異体を懸念される変異体と宣言した。[154]発表後、主要なウイルス学者は、研究対象となった患者数が少ないことを指摘し、この変異体を明確な懸念される変異体として分類するにはデータが不十分であると述べた。[155] 2021年7月、英国ではAY.4.2が特定された。前述のものに加えて、Y145HとA222Vという追加の変異があることから、「デルタプラス」というニックネームも付けられた。これらはこの変異体に固有のものではないが、元のデルタ変異体とは区別される。[156]
2022年6月7日、WHOはデルタ変異株とその亜変異株を「以前に流行していた懸念される変異株」に格下げした。[110] [157]
以前に流通していた関心対象の変種（VOI）
イプシロン（系統 B.1.429、B.1.427、CAL.20C）
イプシロン変異体または系統B.1.429は、CAL.20C [158]またはCA VUI1、[159] 21C [75]または20C/S:452R、[97]としても知られ、5つの異なる変異（ ORF1ab遺伝子のI4205VおよびD1183Y、およびスパイクタンパク質のS遺伝子のS13I、W152C、L452R）によって定義され、そのうちL452R（以前は他の無関係な系統でも検出されていた）が特に懸念されていました。[38] [160] 2021年3月17日から6月29日まで、CDCはB.1.429と関連するB.1.427を「懸念される変異体」としてリストアップしました。[36] [161] [162] [163] 2021年7月現在、イプシロンはWHOによって関心対象の変異体とはみなされておらず、[24]アルファに追い抜かれたためである。[164]
2020年9月から2021年1月にかけて、カリフォルニア州では以前の変異株よりも19%から24%伝染力が高まった。自然感染やワクチン接種による抗体による中和は中程度に減少したが[165] 、ほとんどの診断検査で検出可能なままであった[166]。
イプシロン（CAL.20C）は、COVID-19の流行が始まって以来、ロサンゼルス郡で収集された1,230のウイルスサンプルの1つで、カリフォルニア州シーダーズ・サイナイ医療センターの研究者によって2020年7月に初めて確認されました。[167]カリフォルニア州のサンプルで再び現れた9月まで再び検出されませんでしたが、11月まで数は非常に少ないままでした。[168] [169] 2020年11月には、イプシロン変異体がシーダーズ・サイナイ医療センターで収集されたサンプルの36％を占め、2021年1月までにイプシロン変異体がサンプルの50％を占めました。[160]カリフォルニア大学サンフランシスコ校、カリフォルニア州公衆衛生局、サンタクララ郡公衆衛生局の共同プレスリリースによると、[170]この変異体は北カリフォルニアの複数の郡でも検出されました。 2020年11月から12月にかけて、北カリフォルニアで配列決定された症例における変異体の頻度は3％から25％に上昇した。[171]プレプリントでは、CAL.20Cは20C系統に属し、サンプルの約36％を占めると説明されているが、南カリフォルニアに焦点を当てた研究では、20G系統から出現した変異体がサンプルの約24％を占めている。ただし、米国全体では、2021年1月現在、20G系統が優勢であることに注意してください。[38]カリフォルニア州でのイプシロンの増加に続いて、この変異体はほとんどの米国の州でさまざまな頻度で検出されています。北米の他の国、ヨーロッパ、アジア、オーストラリアでも少数が検出されています。[168] [169]当初は増加したものの、より伝染性の高いアルファに負けたため、2021年2月から頻度は急速に低下しました。 4月には、イプシロンは北カリフォルニアの一部で比較的頻繁に発生していたが、州南部では事実上姿を消し、他の地域でも定着することができなかった。米国の全症例のうち、イプシロンはわずか3.2%で、アルファは3分の2以上を占めていた。[164]
ゼータ（系統P.2）
エタ（紀元前1525年）
Eta変異体または系統B.1.525は、英国公衆衛生局（PHE）によってVUI -21FEB-03 [30]（以前はVUI-202102/03）とも呼ばれ、以前はUK1188 [30] 、 21D [75]または20A/S:484K [97]として知られていましたが、 Alpha、Beta、Gammaに見られるのと同じN501Y変異は持たないが、Gamma、Zeta、Beta変異体に見られるのと同じE484K変異を持ち、またAlpha、N439K変異体（B.1.141およびB.1.258）およびY453F変異体（クラスター5 ）に見られるのと同じΔH69/ΔV70欠失（位置69および70のアミノ酸ヒスチジンおよびバリンの欠失）も持っています。[175]イータは、E484K変異と新しいF888L変異（スパイクタンパク質のS2ドメインでフェニルアラニン（F）がロイシン（L）に置換）の両方を持つ点で、他のすべての変異体と異なります。2021年3月5日の時点で、23か国で検出されています。 [176] [177] [178]また、フランスの海外県/地域であるマヨットでも報告されています。[176]最初の症例は2020年12月に英国とナイジェリアで検出され、2021年2月15日の時点で、後者の国のサンプルで最も頻繁に発生していました。[178] 2月24日の時点で、56件の症例が英国で見つかりました。[30]すべてのCOVID-19症例の配列を解析しているデンマークは、2021年1月14日から2月21日の間にこの変異体の症例を113件発見し、そのうち7件はナイジェリアへの外国渡航に直接関連していました。[177]
2021年7月現在、英国の専門家は、どの程度のリスクがあるかを調べるために研究を行っている。現在は「調査中の変異体」とされているが、さらなる研究が待たれる中、「懸念される変異体」になる可能性がある。ケンブリッジ大学のラヴィ・グプタ氏はBBCのインタビューで、系統B.1.525には、他の新しい変異体のいくつかですでに見られる「重大な変異」があるようで、その影響はある程度予測可能であることを意味していると述べた。[179]
シータ（系統P.3）
2021年2月18日、フィリピン保健省は、患者から採取したサンプルをゲノム配列解析に送った後、中部ビサヤ地方でCOVID-19の2つの変異が検出されたことを確認した。変異は後にE484KとN501Yと命名され、50のサンプルのうち37で検出され、そのうち29のサンプルで両方の変異が同時に発生していた。[180]
3月13日、保健省は、この変異がP.3系統と指定された変異体を構成することを確認した。[181]同日、同国でガンマ変異体による最初のCOVID-19症例も確認された。フィリピンでは3月13日時点でシータ変異体の症例が98件あった。 [182] 3月12日には、日本でもシータが検出されたと発表された。[183] [184] 3月17日、英国は最初の2症例を確認し、[185] PHEはこれをVUI-21MAR-02と名付けた。[30] 2021年4月30日、マレーシアはサラワク州でシータ変異体の症例を8件検出した。[186]
2021年7月現在、シータはWHOによって関心対象の変異株とはみなされなくなった。[24]
イオタ（系統 B.1.526）
イオタ変異体[187]は、系統B.1.526としても知られ、COVID-19を引き起こすウイルスであるSARS-CoV-2の変異体の1つです。2020年11月にニューヨーク市で初めて検出されました。この変異体は、ウイルスが抗体を回避するのに役立つ可能性のあるE484Kスパイク変異と、ウイルスがヒト細胞にさらに強く結合するのに役立つS477N変異という2つの注目すべき変異を伴って出現しました。[188]
2021年7月末までにデルタ変異株が優勢となり、イオタ変異株に代表される米国の症例の割合は急激に減少した。[189]
カッパ（系統 B.1.617.1）
カッパ変異体[190]は、 COVID-19を引き起こすウイルスであるSARS-CoV-2の変異体です。パンゴ系統B.1.617の3つの亜系統の1つです。SARS-CoV-2カッパ変異体は系統B.1.617.1としても知られ、2020年12月にインドで初めて検出されました。[191] 2021年3月末までに、カッパ亜変異体はインドから提出された配列の半分以上を占めました。[192] 2021年4月1日、イングランド公衆衛生局によって調査中の変異体（VUI-21APR-01）に指定されました。[193]
ラムダ（系統 C.37）
ムー（系譜 B.1.621）
Mu変異株は、系統B.1.621またはVUI-21JUL-1としても知られ、COVID-19を引き起こすウイルスであるSARS-CoV-2の変異株の1つです。2021年1月にコロンビアで初めて検出され、 2021年8月30日にWHOによって懸念される変異株に指定されました。[199] 2022年3月16日、WHOはMu変異株とその亜種を「以前に循環していた懸念される変異株」に格下げしました。[200] [201]
以前に監視されていた変異株（WHO）
以下に挙げる変異株はかつては監視対象の変異株として分類されていたが、もはや有意なレベルで循環していない、状況に大きな影響を与えていない、または変異株が懸念される特性を持たないという科学的証拠があるために再分類された。[93]
オミクロン
系統 B.1.1.529
オミクロン変異株はB.1.1.529系統として知られ、2021年11月26日に世界保健機関によって懸念される変異株として宣言されました。[202]
この変異株には多数の変異があり、そのいくつかは懸念される。この変異株は再感染のリスクが高いことを示す証拠もある。感染性、死亡率、その他の要因への正確な影響を評価するための研究が進行中である。[203]
WHOによってオミクロンと名付けられたこのウイルスは、 [202] [204] 2021年11月にボツワナと南アフリカで確認され、[205] 1件は香港に渡航しており、[206] [93] [207]マラウイから帰国した旅行者1名がイスラエルで確認され、[208]南アフリカから帰国した2名とマダガスカルから帰国した1名が確認した。[209]ベルギーは、2021年11月26日に、11月11日にエジプトから帰国した個人で、ヨーロッパで最初の症例を確認した。 [ 210]インドのSARS-CoV-2ゲノミクスコンソーシアム（INSACOG）は、2022年1月の速報で、オミクロンはインドで市中感染しており、新規症例が急増していると指摘した。[211]
BA. 亜系統
WHOによると、2022年2月時点で、BA.1、BA.1.1、およびBA.2がオミクロンの最も一般的な亜系統であった[update]。[212] BA.2には、スパイクタンパク質に4つを含む28のユニークな遺伝子変化があり、BA.1は、祖先の武漢株以来すでに60の変異を獲得しており、スパイクタンパク質に32の変異を含む。[213] BA.2はBA.1よりも伝染性が高い。[214] 2022年3月中旬までにイギリスでほとんどの症例を引き起こし、3月末までにBA.2は米国で優勢になった。[215] [213] 2022年5月現在[update]、BA.1からBA.5までの亜系統とそのすべての子孫は、WHO、[93]、 CDC、[25]、ECDC [216]（後者はBA.3を除く）によって懸念される変異体として分類されています。
XBB の亜系統
2022年には、オミクロンのXBB株から進化したXBB.1.5を含む、さらに多くの新しい株がさまざまな地域で出現しました。イングランドでXBBに関連する最初の症例は、2022年9月10日に採取された検体サンプルから検出され、それ以来、イングランドのほとんどの地域でさらなる症例が確認されています。年末までに、XBB.1.5は米国全体の新規症例の40.5％を占め、主要な株でした。懸念される変異株BQ.1は18.3％で推移し、BQ.1.1は新規症例の26.9％を占め、BA.5株は3.7％で減少していました。この段階では、他の多くの国では珍しいことで、たとえば英国では、UKHSAの配列データによると、新規症例の約7％を占めていました。[217]
2022年12月22日、欧州疾病予防管理センターは、推定値を提供するのに十分な量の配列解析または遺伝子型解析により、XBB株がEU5か国における新規症例の約6.5％を占めていると要約で述べた。[217]
XBB.1.9.2の亜種であるEG.5（一部のメディアでは「エリス」というニックネームが付けられている[218]）は、2023年2月に出現した。[219] 2023年8月6日 、英国保健安全保障庁は、7月の第3週に英国で発生した新規症例の7件中1件がEG.5株によるものであると報告した。[220]
リネージュ BA.2.86
2023年、SARS-CoV-2は世界中の人々の間で循環し続け、進化し、多くの新しい亜種が出現しました。検査、配列決定、報告率は低下しました。[221]
BA.2.86は2023年7月24日のサンプルで初めて検出され 、2023年8月17日に世界保健機関によって監視対象の変異株として指定された。[222]
BA.2.86の亜変異株であるJN.1（「ピローラ」と呼ばれることもある）は、2023年8月にルクセンブルクで出現した。2023年12月までに、英国と米国を含む12か国で検出された。[223] [224] 12月19日、WHOはJN.1を親株BA.2.86とは独立して注目の変異株と宣言したが、公衆衛生に対する全体的なリスクは低いと判断された。[225]シンガポールではJN.1が症例の約60％を占めており、2023年12月にはシンガポールとインドネシアが空港でのマスク着用を推奨した。[226] CDCは、この変異株が2023年12月22日に米国の症例の44％、2024年1月5日に症例の62％を占めると推定した。[227]
2024年2月9日現在[update]、WHOはJN.1がSARS-CoV-2の最も一般的な変異体であると推定している（世界の6つの地域のうち4つの地域で70～90%の有病率、東地中海地域とアフリカ地域ではデータが不十分）。COVID -19ワクチンのXBB.1.5ブースターバージョンによる集団免疫と免疫の一般的なレベルは、JN.1に対してある程度の保護（交差反応性）を提供すると予想された。[228]
年ごとの系統
2024
2024年4月下旬、CDCのデータによると、KP.2は米国で最も一般的な変異体であり、全症例の4分の1を占め、JN.1をわずかに上回った。KP1.1は米国の症例の7％を占めた。[229]これら2つは、ウイルスのスパイクタンパク質のフェニルアラニン（F）からロイシン（L）への変異とアルギニン（R）からスレオニン（T）への変異 を特徴とするため、 「FLiRT」変異体と呼ばれることもある。 [230] 2024年7月までに、スパイクタンパク質Q493Eの余分なアミノ酸変化を伴うKP.2の子孫は、KP.3、非公式には「FLuQE」と名付けられ、オーストラリアの冬の間ニューサウスウェールズで主要な変異体となった。初期の研究では、Q493Eの変化により、KP.3はKP.2よりもヒト細胞への結合がより効果的になる可能性があることが示唆された。[231]
2024年9月現在、ドイツで最初に発見されたXECが次の主要な変異株になると予想されています。XECは、KS.1.1とKP.3.3という2つの亜変異株の組み換えです。米国では数例しか検出されていませんが[232]、伝染性の点で他の変異株よりもわずかに優れていると報告されています。[233]
オミクロン変異株は監視中（WHO、2022/2023年）
2022年5月25日、世界保健機関は、懸念される広範な変異体の潜在的に懸念される亜系統の新しいカテゴリーを導入しました。当初は監視中のVOC系統（VOC-LUM）と呼ばれていました。この決定は、2022年2月にGISAIDで配列決定されたサンプルの98％以上が、変異体の進化の多くが起こったオミクロンファミリーに属していたことを反映して行われました。[234] 2023年2月9日までに、このカテゴリーは「監視中のオミクロン変異体」に改名されました。[235]
その他の注目すべき変種
系統B.1.1.207は、2020年8月にナイジェリアで初めて配列決定されました。[237]伝染と毒性への影響は不明ですが、米国疾病予防管理センターによって新興変異体としてリストされています。[28]ナイジェリアのアフリカ感染症ゲノム研究センターによって配列決定されたこの変異体には、アルファ変異体と共通するP681H変異があります。アルファ変異体と他の変異を共有しておらず、2020年12月下旬の時点で、この変異体はナイジェリアで配列決定されたウイルスゲノムの約1％を占めていますが、この割合は増加する可能性があります。[237] 2021年5月現在、系統B.1.1.207は10か国で検出されています。[238]
系統B.1.1.317は、懸念される変異株とはみなされていないが、クイーンズランド州保健省が、オーストラリアのブリスベンでホテル隔離中の2人に対し、この変異株に感染していることが確認された後、義務付けられている14日間に加えてさらに5日間の隔離を強制したことは注目に値する。[239]
2021年1月初旬にフランス西部のブルターニュ地方で特定され、2021年3月にWHOによって「調査中の変異株」に指定された系統B.1.616は、コロナウイルス検出の鼻咽頭スワブ採取法では検出が困難であり、ウイルスの検出は下気道からのサンプルに頼る必要があると報告されている。[要出典]
系統B.1.618は2020年10月に初めて分離された。この株は他のいくつかの変異体と共通するE484K変異を持ち、2021年4月にインドの西ベンガル州で大きな広がりを示した。[240] [241] 2021年4月23日現在、PANGOLINデータベースではインドで135の配列が検出され、世界の他の8か国ではそれぞれ1桁の数字が示されている。[242]
2021年7月、科学者らは2022年2月に学術誌に掲載されたプレプリントで、ニューヨーク市の下水監視により異常な無名の宿主不明SARS-CoV-2系統が検出されたことを報告した。彼らは「これらの系統はサンプル採取されていないヒトCOVID-19感染に由来するか、ヒト以外の動物のリザーバーの存在を示している」と仮説を立てた。[243] [244]
系統B.1.640.2（IHU変異体[245]としても知られる）は、2021年10月にマルセイユの大学病院研究所（IHU）の研究者によって検出されました。 [246]彼らは、カメルーンからフランスに帰国した旅行者からこの変異体を発見し、12人を感染させたと報告されています。[247] [248] B.1.640系統（B.1.640.2を含む）は、2021年11月22日に世界保健機関（WHO）によって監視下の変異体（VUM）に指定されました。 [249]しかし、WHOは、系統B.1.640.2はオミクロン変異体よりもはるかにゆっくりと広がっているため、比較的懸念は少ないと報告しています。[248] [250] プレプリント研究によると、系統B.1.640.2には、合計46のヌクレオチド置換と37の欠失のうち、すでに知られている2つのスパイクタンパク質変異（E484KとN501Y）があります。[247] [251] [252]
2022年3月、研究者らはデルタとオミクロンの要素を含むSARS-CoV-2変異体の組み換えウイルス、デルタクロン（別名「デルタミクロン」）を報告した。[253] [254] [255] [256] [257]組み換えは、ウイルスが自身のコピーを組み立てる際に、関連するウイルスの部分をその遺伝子配列と組み合わせるときに発生する。デルタクロン（ 1月に報告された「デルタクロン」と混同しないように注意する必要があるが、最初の検出も1月であった[257] [258]）がオミクロンと競合できるかどうか、またそれが健康に有害であるかどうかは不明である。[259]
2023年7月、ウォーリック大学のウイルス学者ローレンス・ヤング教授は、インドネシアの症例の綿棒検査から、113の固有の変異があり、そのうち37がスパイクタンパク質に影響を与える超変異デルタ変異体を発表しました。[260]
組み換え変異体
2022年、英国政府はSARS-CoV-2の組換え変異体を多数報告した。[261]これらの組換え系統には、パンゴ系統識別子XD、XE、XFが与えられている。[262]
XEはパンゴ系統BA.1とBA.2の組み換え系統である。[263] 2022年3月現在、[update]XEの成長率はBA.2より9.8%高いと考えられている。[261]
多重変異体のインキュベーション理論
研究者らは、免疫不全患者の持続感染の過程で、特に抗体や回復期血漿治療による選択圧を受けてウイルスが逃避変異を起こした場合、複数の変異が発生する可能性があることを示唆しており、 [264] [265]表面抗原の同じ欠失が異なる患者で繰り返し発生する。[266]
注目すべきミスセンス変異
SARS-CoV-2 では多数のミスセンス変異が観察されています。
69-70 より
変異の名称であるdel 69-70、または69-70 del、あるいは他の同様の表記は、69番目から70番目のアミノ酸の欠失を指す。この変異はアルファ変異体に見られ、「スパイク遺伝子標的の失敗」につながり、PCRウイルス検査で偽陰性の結果をもたらす可能性がある。[267]
RSILPGD246-253N
del 246-252とも呼ばれるこの表現は、スパイクタンパク質のN末端ドメインの246番目から252番目のアミノ酸が欠失し、253番目のアスパラギン酸（D）がアスパラギン（N）に置き換わることを指す。[268] [269]
7つのアミノ酸欠失変異は現在、ラムダ変異体に特有であると説明されており、プレプリント論文によると、この株が中和抗体から逃れる能力を高めた原因の1つと考えられています。[270]
N440K
この変異の名前であるN440Kは、位置440のアスパラギン（N）がリジン（K）に置き換わる交換を指します。[271]
この変異は、細胞培養において、以前広く普及していたA2a株（RdRP配列のA97V置換）と比較して10倍、あまり普及していなかったA3i株（SpikeのD614G置換とRdRPのP323L置換）と比較して1000倍の感染力があることが観察されている。[272]これは、2021年5月にインドでCOVID-19症例の急増に関与していた。[273] N440K変異変異体の割合が最も高いのはインドで、次いで米国、ドイツとなっている。[274]
G446V
この変異の名前G446Vは、位置446でグリシン（G）がバリン（V）に置き換わる交換を指します。[271]
この変異は、5月から日本国内の入国者や、2020年東京オリンピック・パラリンピック競技大会関係者33人の検体で確認されており、抗体医薬品の使用に対する臨床的影響はまだ分かっていないものの、複数のモノクローナル抗体の親和性に影響を与える可能性があると言われている。 [275]
L452R
この変異の名称であるL452Rは、位置452でロイシン（L）がアルギニン（R）に置き換わる交換を指します。[271]
L452R は、インドで最初に流行し、その後世界中に広がったデルタとカッパの両方の変異株に見られます。L452R はこの株に関連する変異で、ACE2 受容体の結合能力を高め、ワクチン刺激による抗体がこの変化したスパイクタンパク質に付着するのを減少させます。
いくつかの研究によると、L452RはコロナウイルスをT細胞に対して耐性にさえする可能性がある。T細胞は、ウイルスに感染した細胞を標的にして破壊するのに必要なものである。T細胞は、コロナウイルス粒子をブロックして増殖を防ぐのに役立つ抗体とは異なる。[139]
Y453F
Y453Fという変異名は、453番目の位置でチロシン（Y）がフェニルアラニン（F）に置き換わる変異を指します。この変異は、2020年にオランダのミンクの間でSARS-CoV-2が広がったことと関連している可能性があることが判明しました。[276]
S477G/N
SARS-CoV-2の受容体結合ドメイン（RBD）内の残基475から残基485まで続く非常に柔軟な領域が、いくつかの研究でバイオインフォマティクスと統計的手法を用いて特定されました。グラーツ大学[277]とバイオテクノロジー企業Innophore [278]は最近の出版物で、構造的には位置S477が最も高い柔軟性を示していることを示しました。[279]
同時に、S477はこれまでSARS-CoV-2変異体のRBDで最も頻繁に交換されたアミノ酸残基である。hACE2への結合プロセス中のRBDの分子動力学シミュレーションを使用することで、S477GとS477Nの両方がSARS-COV-2スパイクとhACE2受容体の結合を強化することが示された。ワクチン開発者のBioNTech [280]は、2021年2月に発表されたプレプリントで、このアミノ酸交換が将来のワクチン設計に関連するものとして言及した。[281]
E484Q
この変異の名前であるE484Qは、位置484でグルタミン酸（E）がグルタミン（Q）に置き換わる交換を指します。[271]
インドで流行しているカッパ変異体にはE484Qがある。これらの変異体は当初（しかし誤解を招く形で）「二重変異体」と呼ばれていた。[282] E484QはACE2受容体の結合能力を高め、ワクチン刺激抗体がこの変異したスパイクタンパク質に結合する能力を低下させる可能性がある。[139]
E484K
この変異の名前であるE484Kは、位置484でグルタミン酸（E）がリジン（K）に置き換わる交換を指します。[271]この変異は「Eeek」というニックネームで呼ばれています。[283]
E484Kは、SARS-CoV-2に対する少なくとも1つのモノクローナル抗体からの回避変異（すなわち、ウイルスが宿主の免疫システムを回避する能力を向上させる変異[284] [285] ）であると報告されており、「抗原性の変化の可能性」があることを示している。[286]ガンマ変異体（系統P.1）[125]ゼータ変異体（系統P.2、系統B.1.1.28.2としても知られる）[128]およびベータ変異体（501.V2）がこの変異を示す。[286] E484K変異を持つ系統B.1.1.7ゲノムも限られた数検出されている。[287]モノクローナル抗体および血清由来抗体は、E484K変異を持つウイルスを中和する効果が10〜60倍低いと報告されている。[288] [289] 2021年2月2日、英国の医学者は、214,000サンプル中11サンプルでE484Kが検出されたと報告した。これは、現在のワクチンの有効性を損なう可能性のある変異である。[290] [291]
F490S
F490Sはアミノ酸位置490のフェニルアラニン（F）からセリン（S）への変化を示す。[292]
これはラムダ株に見られる変異の一つであり、他の株に感染した人が生成した抗体に対する感受性の低下と関連しており、このような変異を持つ株に感染した人に対する抗体治療の効果は低下することを意味する。[293]
N501Y
N501Yはアミノ酸位置501のアスパラギン（N）からチロシン（Y）への変化を示す。[294] N501Yは「ネリー」というニックネームが付けられている。[283]
PHEは、この変化は、ヒト細胞内でACE2に結合するスパイク糖タンパク質の受容体結合ドメインの内部に位置するため、結合親和性を高めると信じており、データもこの変化による結合親和性の増加の仮説を支持している。 [88]分子相互作用モデリングと結合自由エネルギー計算により、変異N501YがhACE2に対する懸念RBD変異体の中で最も高い結合親和性を持つことが実証されている。[1] N501Yを含む変異体には、ガンマ、[286] [125]アルファ（VOC 20DEC-01）、ベータ、およびCOH.20G/501Y（オハイオ州コロンバスで特定）がある。[1]この最後の変異体は、2020年12月下旬から1月にかけてコロンバスでウイルスの優勢な形態となり、他の変異体とは独立して進化したと思われる。[295] [296]
N501S
N501Sはアミノ酸位置501のアスパラギン（N）からセリン（S）への変化を示す。[297]
2021年9月現在、このN501S変異を特徴とするデルタ変異体に感染した患者は世界中で8例いる。N501Yに類似した変異と考えられているため、ウイルスの感染力を高めると考えられているN501Y変異と同様の特徴を持つと疑われているが、正確な影響はまだ不明である。[298]
D614G
D614Gは、SARS-CoV-2のスパイクタンパク質に影響を及ぼすミスセンス変異である。2020年初頭に中国東部で早期に出現して以来、パンデミックの初期に世界中のウイルス集団におけるこの変異の頻度が増加した。[300]ヨーロッパでは614番目の位置でG（グリシン）が急速にD（アスパラギン酸）に置き換わったが、中国と東アジアの他の地域ではよりゆっくりとした変化が見られ、Gが感染率を高めたという仮説を裏付けており、これはin vitroでのウイルス力価と感染力の上昇と一致している。[35] PANGOLINツールの研究者はこの変異を「ダグ」と名付けた。[283]
2020年7月には、より感染力の高いD614G SARS-CoV-2変異体がパンデミックの主流となったことが報告された。[301] [302] [303] [304] PHEは、D614G変異が「伝染性に中程度の影響」を与え、国際的に追跡されていることを確認した。[294] [305]
D614Gの世界的な有病率は、COVID-19の症状である嗅覚喪失（無嗅覚症）の有病率と相関しており、これはRBDのACE2受容体への結合率が高いことや、タンパク質の安定性が高く、嗅上皮の感染性が高いことなどによって媒介されている可能性がある。[306]
D614G変異を含む変異体は、GISAID [35]のG系統とPANGOLINツールのB.1系統で発見されています。[35]
Q677P/H
この変異の名称であるQ677P/Hは、677番目の位置でグルタミン（Q）がプロリン（P）またはヒスチジン（H）に置き換わる変異を指す。 [271] Q677P変異を含む亜系統はいくつかあるが、そのうち6つは他の変異の様々な組み合わせも含み、鳥の名前で呼ばれている。例えば、初期に発見されたものの1つは「ペリカン」として知られており、2021年初頭の時点で最も一般的なものは暫定的に「ロビン1」と名付けられている。[307]
この変異は、2020年後半現在、米国内で循環している複数の系統で報告されており、国外のいくつかの系統でも報告されています。「ペリカン」はオレゴンで最初に検出され、2021年初頭の時点で「ロビン1」は米国中西部で頻繁に発見され、別のQ667Hサブ系統である「ロビン2」は主に米国南東部で発見されました。[307]このような変異の記録頻度は、2020年後半から2021年初頭にかけて増加しています。[308]
P681H
この変異の名称であるP681Hは、位置681でプロリン（P）がヒスチジン（H）に置き換わる交換を指します。 [299]
2021年1月、科学者らはプレプリントで、アルファ変異体と系統B.1.1.207（ナイジェリアで特定）の特徴的な変異P681Hが、世界中で顕著な指数関数的増加を示しており、ロジスティクス曲線の下肢で予想される傾向を示していると報告した。これは、現在世界的に蔓延しているD614Gの傾向と比較することができる。[299] [309]
P681R
この変異の名称であるP681Rは、 681番目の位置でプロリン（P）がアルギニン（R）に置き換わる交換を指します。[271]
インドSARS-CoV-2ゲノミクスコンソーシアム（INSACOG）は、E484QとL452Rの2つの変異の他に、系統B.1.617に3つ目の重要な変異であるP681Rがあることを発見しました。3つの懸念される変異はすべて、体内の受容体細胞に結合するコロナウイルスの作動部分であるスパイクタンパク質にあります。[139]
A701V
当初のメディア報道によると、マレーシア 保健省は2020年12月23日、サバ州ベンテン・ラハド・ダトゥのクラスターから採取された60のサンプルの中に、SARS-CoV-2ゲノムの変異を発見し、これをA701B(sic)と命名したと発表した。この変異は、当時南アフリカ、オーストラリア、オランダで最近発見されたものと類似していると特徴付けられているが、この変異が以前よりも感染力や攻撃性が高まったかどうかは不明である[説明が必要] 。 [310]隣国フィリピンのスールー州政府は、「A701B」の発見を受けて、変異の性質が不透明であることを理由にサバ州への渡航を一時停止した。[311]
2020年12月25日、マレーシア保健省は、マレーシアでA701V変異が循環しており、症例の85％に存在している（D614Gは症例の100％に存在）と発表した。[312] [313]これらの報告書では、ベンテン・ラハド・ダトゥのクラスターから収集されたサンプルについても言及されている。[312] [313]この発表文は、マレー人の保健局長ヌール・ヒシャム・アブドゥラーのフェイスブックページにそのまま掲載されており、いくつかのニュース記事でも引用されている。[313]
A701V変異は、スパイクタンパク質の701番目の位置にあるアミノ酸アラニン（A）がバリン（V）に置換されたものである。世界的には、南アフリカ、オーストラリア、オランダ、イギリスでもマレーシアとほぼ同時期にA701Vが報告されている。 [312] GISAIDでは、この変異の有病率は症例の約0.18％であることが判明している。[312]
2021年4月14日、マレーシア保健省は、サバ州で始まった第3波では、D614GとA701Vの変異を伴う変異体の導入が関与していると報告した。[314]
データと方法
現代のDNAシークエンシングは、利用可能な場合、病気の発生時に病原体に現れる遺伝子変異の迅速な検出（「リアルタイム検出」と呼ばれることもある）を可能にする可能性がある。[315]系統樹可視化ソフトウェアを使用することで、ゲノム配列の記録を、すべて同じ一連の変異を含む同一ゲノムのグループにクラスター化することができる。各グループは「変異体」、「系統群」、または「系統」を表し、配列を比較することでウイルスの進化の経路を推測することができる。SARS-CoV-2の場合、2021年3月までに、世界中の分子疫学研究によって33万を超えるウイルスゲノム配列が生成されていた。[316]
新しい変異体の検出と評価
2021年1月26日、英国政府は、ゲノムシークエンシング率の向上と新たな変異体の追跡を目的として、自国のゲノムシークエンシング能力を他国と共有するとし、「新たな変異体評価プラットフォーム」を発表した。[317] 2021年1月時点で、COVID-19のゲノムシークエンシングの半分以上が英国で実施された。[318][update]
廃水監視は、 SARS-CoV-2の変異体を検出し[244]、関連する進行中の感染動態を研究するためにその増加を追跡するための1つの技術であることが実証されました。[319] [320] [321]
テスト
RT-PCR検査で確認できる1つまたは複数の変異が変異体を特定するために信頼性をもって使用できるかどうかは、現在同じ集団内で循環している他の変異体の有病率に依存する。[322] [323]
異種間の伝播
COVID-19がヒトから他の動物集団に感染し、他の動物ウイルスと結合してヒトにとって危険なさらなる変異体を生み出すリスクがある。[325] 逆人獣共通感染症の流出は、ヒトに逆流する変異体のリザーバーとなる可能性があり、免疫不全の人々に加えて、懸念される変異体のもう一つの発生源となる可能性がある。[326]
クラスター5
2020年11月初旬、デンマーク国立血清研究所（SSI）によってΔFVIスパイクとも呼ばれるクラスター5 [327] がデンマークの北ユトランドで発見されました。ミンク農場を介してミンクから人間に広がったと考えられています。2020年11月4日、この変異の可能性のある拡散を防ぎ、新しい変異が発生するリスクを減らすために、デンマークのミンクの個体数を駆除すると発表されました。COVID -19パンデミックへの国内または国際的な対応を損なう可能性のある変異の拡散を防ぐため、北ユトランドの7つの自治体でロックダウンと旅行制限が導入されました。2020年11月5日までに、約214人のミンク関連のヒト症例が検出されました。[328]
WHOは、クラスター5は「中和抗体に対する感受性が中程度に低下している」と述べた。[329] SSIは、この変異により開発中のCOVID-19ワクチンの効果が低下する可能性があるが、ワクチンが無効になる可能性は低いと警告した。ロックダウンと大量検査の後、SSIは2020年11月19日にクラスター5はほぼ絶滅したと発表した。[330] 2021年2月1日現在、査読済み論文の著者（全員がSSI所属）は、クラスター5はヒト集団に循環していないと評価した。[331]
ワクチン
COVID-19パンデミックの間、さまざまなワクチンが開発されました。ワクチンは、通常、最も脆弱な人口グループから始めて、幅広い対象者に投与するために展開されました。
ワクチンの効果の違い
SARS-CoV-2ウイルスとヒト宿主との相互作用は当初は自然なものでしたが、2021年にワクチンの利用可能性が高まったことで変化し始めました。 [332] COVID-19ワクチンによって引き起こされる抗体反応に対して中程度または完全に耐性のあるSARS-CoV-2変異体の出現の可能性があるため、ワクチンの改良が必要になる可能性があります。[333]ワクチン耐性変異体の出現は、感染が制御されていないワクチン接種率の高い集団でより起こりやすくなります。[334]
2021年2月現在、米国食品医薬品局は、 FDAが承認したすべてのワクチンがSARS-CoV-2の流行株に対する予防に有効であると信じていました。[333]
変異体による免疫回避
これまでに調査された他の変異株とは対照的に、SARS-CoV-2オミクロン変異株[335] [336 ] [337] [338] [339]とそのBA.4/5亜変異株[340]はワクチンによって誘導される免疫を回避しており、最近のワクチン接種にもかかわらずブレイクスルー感染につながる可能性がある。しかし、ワクチンはオミクロンによる重症化、入院、死亡に対する防御を提供すると考えられている。[341]
ワクチンの調整
2022年6月、ファイザーとモデルナは、SARS-CoV-2野生型とオミクロン変異体に対する防御として二価ワクチンを開発した。二価ワクチンは忍容性が高く、従来のmRNAワクチンよりも優れたオミクロンに対する免疫を提供する。 [342] 2022年9月、米国食品医薬品局（FDA）は二価ワクチンを承認した。[343] [344] [345]
2023年6月、FDAは製造業者に対し、米国で使用するCOVID-19ワクチンの2023～2024年製剤を、オミクロン変異体のXBB.1.5系統を使用した一価COVID-19ワクチンに更新するよう勧告した。[346] [347] 2024年6月、FDAは製造業者に対し、米国で使用するCOVID-19ワクチンの2024～2025年製剤を、JN.1系統を使用した一価COVID-19ワクチンに更新するよう勧告した。[348]
2024年10月、欧州医薬品庁（EMA ）のヒト用医薬品委員会（CHMP）は、オミクロンXBB.1.16亜種を標的としたワクチンであるビメルバックスの成分を更新することに肯定的な意見を示しました。[349]参照
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- SARS-CoV-2 オミクロン変異体
- GX P2Vは、hACE2ヒト化マウスにとって致命的なCOVID-19の変異株です。
- RaTG13、SARS-CoV-2に2番目に近い既知の類似体
- パンデミック予防 § 監視とマッピング
- COVID-19変異株の俗称
- COVID-19ワクチン § 有効性
注記
- ^ ab 別の情報源では、GISAIDはO系統を除くがGV系統を含む7つの系統群に名前を付けている。[21]
- ^ WHOによれば、「系統または系統群は、系統発生的に決定された共通の祖先を共有するウイルスに基づいて定義できる」。[52]
- ^ 2021年1月現在[update]、Nextstrainシステムで系統としてカウントされるためには、以下の基準の少なくとも1つを満たす必要があります（出典からの引用）：[20]
- 系統群が2か月以上にわたって世界頻度の20%以上に達する
- 系統群が2か月以上にわたって地域頻度の30%以上に達する
- VOC（「懸念される変異体」）が認識されています（現在[2021年1月6日]501Y.V1および501Y.V2に適用）
- ^ さまざまなトラッカー[24] [25] [30] [67] [68]および定期レポート[69] [70] [71]に基づく。
- ^ TaqPath で S 遺伝子ターゲット障害 (SGTF)を生成します。
- ^ abc 融解曲線法を用いたTIB MolBiolアッセイで検出可能。
参考文献
- ^ abcd Shahhosseini N、Babuadze GG、Wong G、Kobinger GP （2021年4月）。「懸念される新規 SARS - CoV - 2変異体の変異シグネチャとインシリコドッキング」。微生物。9 （5）：926。doi ：10.3390/ microorganisms9050926。PMC 8146828。PMID 33925854。S2CID 233460887 。
- ^ 「コロナウイルスの変異株と突然変異：科学が解説」BBCニュース。2021年1月6日。2021年2月22日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年2月2日閲覧。
- ^ Kupferschmidt K (2021年1月15日). 「新たなコロナウイルス変異株は再感染を引き起こす可能性があり、ワクチンの改良が必要」. Science . doi :10.1126/science.abg6028. S2CID 234141081. 2021年2月22日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年2月2日閲覧。
- ^ 「WHOコロナウイルスネットワーク（CoViNet）」 。 2024年9月1日閲覧。
- ^ 「コロナウイルスの起源」。NIH.gov。米国国立衛生研究所。2022年3月16日。2023年1月21日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2023年2月3日閲覧。
現在まで、COVID-19パンデミックを引き起こしたSARS-CoV-2の起源は特定されていません。
- ^ Shahhosseini N、Wong G、Kobinger GP 、 Chinikar S（2021年6月）。「組み換えイベントによるSARS-CoV-2のスピルオーバー伝播」。Gene Reports。23 ：101045。doi：10.1016 / j.genrep.2021.101045。PMC 7884226。PMID 33615041。
- ^ 「SARS-CoV-2の起源に関する実験室漏洩仮説の興亡 | Science-Based Medicine」。sciencebasedmedicine.org。2022年8月1日。 2022年11月4日閲覧。
- ^ Tang X, Wu C, Li X, Song Y (2020年3月3日). 「SARS-CoV-2の起源と継続的な進化について」National Science Review . 7 (6): 1012–1023. doi : 10.1093/nsr/nwaa036 . PMC 7107875 . PMID 34676127. (正誤表: doi :10.1093/nsr/nwaa036、Retraction Watch )
- ^ Forster P, Forster L, Renfrew C, Forster M (2020年4月8日). 「SARS-CoV-2ゲノムの系統ネットワーク解析」. Proceedings of the National Academy of Sciences . 117 (17): 9241–9243. Bibcode :2020PNAS..117.9241F. doi : 10.1073/pnas.2004999117 . ISSN 0027-8424. PMC 7196762 . PMID 32269081.
- ^ Rambaut A, Holmes EC, OToole A, Hill V, McCrone JT, Ruis C, et al. (2020年7月15日). 「ゲノム疫学を支援するためのSARS-CoV-2系統の動的命名提案」. Nature Microbiology . 5 (11): 1403–1407. doi : 10.1038/s41564-020-0770-5 . PMC 7610519. PMID 32669681 .
- ^ Tregoning JS、Flight KE、Higham SL、Wang Z、Pierce BF（2021年8月9日）。「COVID-19ワクチン開発の進展：ウイルス、ワクチン、変異株と有効性、効果、回避」Nature Reviews Immunology 21 （ 10）：626–636。doi ：10.1038/ s41577-021-00592-1。PMC 8351583。PMID 34373623。
- ^ Piplani S、Singh PK、Winkler DA、Petrovsky N（2021年12月）。「SARS-CoV-2スパイクタンパク質-ACE2結合親和性の種間におけるインシリコ比較とウイルス起源への影響」。Scientific Reports。11 （1 ）：13063。Bibcode：2021NatSR..1113063P。doi ：10.1038/s41598-021-92388-5。PMC 8225877。PMID 34168168。
- ^ Gallagher J (2021年6月12日). 「Covid: Is there a limit to how much wrong alternatives can get?」. BBC . 2021年6月15日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年6月12日閲覧。
- ^ abc Tao K, Tzou PL, Nouhin J, Gupta RK, de Oliveira T, Kosakovsky Pond SL, et al. (2021年9月17日). 「新興SARS-CoV-2変異体の生物学的および臨床的意義」. Nature Reviews Genetics . 22 (12): 757–773. doi :10.1038/s41576-021-00408-x. PMC 844712 1. PMID 34535792 .
- ^ Hendy M、Kaufman S、Ponga M（2021年12月）。「SARS-CoV-2とその変異体の抗体結合と回避のための分子戦略」。Scientific Reports。11 （1）： 21735。Bibcode ：2021NatSR..1121735H。doi ：10.1038 /s41598-021-01081-0。PMC 8571385。PMID 34741079。
- ^ Shahhosseini N、Babuadze G(、Wong G、Kobinger GP (2021年5月)。「懸念される新規SARS-CoV- 2変異体の変異シグネチャとインシリコドッキング」。 微生物。9 ( 5):926。doi : 10.3390 / microorganisms9050926。PMC 8146828。PMID 33925854。
- ^ 「SARS-CoV-2変異体の追跡」www.who.int . 2021年11月28日閲覧。
- ^ 「変異株：症例データの分布」GOV.UK 2021年1月28日 「懸念される変異株と調査中の変異株の違い」2021年2月19日閲覧。SARS
-CoV-2変異株は、疫学的、免疫学的、または病原性に懸念があると考えられる場合、正式な調査の対象となります。この時点で、年、月、番号が付けられた調査中の変異株（VUI）として指定されます。関連する専門家委員会によるリスク評価の後、懸念される変異株（VOC）として指定される場合があります。
- ^ abc Rambaut A, Holmes EC, O'Toole Á, Hill V, McCrone JT, Ruis C, et al. (2020年11月). 「ゲノム疫学を支援するためのSARS-CoV-2系統の動的命名提案」. Nature Microbiology . 5 (11): 1403–1407. doi : 10.1038/s41564-020-0770-5 . PMC 7610519. PMID 32669681. S2CID 220544096. Alm et al. に引用
- ^ abcde Bedford T、Hodcroft B、Neher RA（2021年1月6日）。「Nextstrain SARS-CoV-2クレード命名戦略の更新」。nextstrain.org 。 2021年1月18日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年1月19日閲覧。
- ^ ab “clade tree (from 'Clade and lineage nomenclature')” GISAID 2020年7月4日。2021年1月9日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年1月7日閲覧。
- ^ 「SARS-CoV-2変異株の歴史的作業定義と主な対策」（PDF）。世界保健機関。 2024年9月9日閲覧。
- ^ 「SARSCoV2変異株の作業定義と主な対策の更新」www.who.int 。 2024年9月9日閲覧。
- ^ abcd 「SARS-CoV-2変異体の追跡」。who.int。世界保健機関。2021年6月18日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年6月22日閲覧。頻繁に更新されます。
- ^ abcdefghij 「SARS-CoV-2 変異株の分類と定義」。CDC.gov。米国疾病予防管理センター。2020年2月11日。2021年6月29日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年6月18日閲覧。頻繁に更新されます。
- ^ ab 「SARS-CoV-2の懸念される変異体と関心のある変異体に関するWHOの作業定義と追跡システムの更新に関する声明」www.who.int 。 2023年12月29日閲覧。
- ^ ab 「SARSCoV2変異株の作業定義と主な対策の更新」www.who.int . 2023年12月29日閲覧。
- ^ abcdefg 「新興SARS-CoV-2変異株」。CDC.gov（科学概要）。米国疾病予防管理センター。2021年1月28日。2021年5月15日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年1月4日閲覧。
この記事には、パブリック ドメインであるこのソースからのテキストが組み込まれています。
- ^ IDSA寄稿者「COVID「メガ変異株」とすべての変異株を評価するためのテンプレートの8つの基準」。Science Speaks: Global ID News。2021年2月2日。2021年4月21日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年2月20日閲覧。
- ^ abcdefghijklm 「変異株：症例データの分布」。イングランド公衆衛生局。政府デジタルサービス。2021年6月7日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年2月16日閲覧。頻繁に更新されます。2021 年 7 月 2 日の更新には 2021 年 5 月 19 日までのデータが含まれています。
- ^ Griffiths E, Tanner J, Knox N, Hsiao W, Van Domselaar G (2021年1月15日). CanCOGeN 懸念されるSARS-CoV-2変異体の命名、識別、報告に関する暫定勧告(PDF) . CanCOGeN (nccid.ca) (レポート). 1.0. 2021年4月17日時点のオリジナルよりアーカイブ(PDF) 。
- ^ この表はAlmらの図1を改変して拡張したものです。
- ^ ab Alm E、Broberg EK、Connor T、Hodcroft EB、Komissarov AB、Maurer-Stroh S、et al. (WHOヨーロッパ地域シーケンシング研究所およびGISAID EpiCoVグループ) (2020年8月)。「WHOヨーロッパ地域におけるSARS-CoV-2系統の地理的および時間的分布、2020年1月から6月」。Euro Surveillance . 25 ( 32 )。doi : 10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410。PMC 7427299。PMID 32794443。
- ^ 「Nextclade」（クレードとは何か？）nextstrain.org。2021年1月19日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年1月19日閲覧。
- ^ abcdef ジューコバ A、ブラッセル L、ルモワンヌ F、モレル M、ヴォズニカ J、ガスキュエル O (2020 年 11 月)。 「SARS-CoV-2の起源、進化、そして世界的な広がり」。レンダス・バイオロジーズをコンテスします。344 : 57–75。土井：10.5802/crbiol.29。PMID 33274614。
- ^ abcd 「SARS-CoV-2 変異株の分類と定義」。CDC.gov。米国疾病予防管理センター。2021年6月29日。2021年6月16日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年2月19日閲覧。頻繁に更新されます。
- ^ 「新型コロナウイルスのゲノム疫学 - グローバルサブサンプリング（B.1.617にフィルタリング）」。nextstrain.org。2021年7月13日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年5月5日閲覧。
- ^ abcd Zhang W, Davis B, Chen SS, Martinez JS, Plummer JT, Vail E (2021). 「南カリフォルニアにおける新型SARS-CoV-2変異体の出現」. JAMA . 325 (13): 1324–1326. doi :10.1001/jama.2021.1612. ISSN 0098-7484. PMC 7879386. PMID 33571356. 2021年10月2日閲覧。
- ^ 「クレードとは何か？」clades.nextstrain.org . 2021年11月29日閲覧。
- ^ “PANGO lineages-Lineage B.1.1.28”. cov-lineages.org . 2021年2月24日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年2月4日閲覧。[検証に失敗しました]
- ^ “Variant: 20J/501Y.V3”. covariants.org . 2021年4月1日. 2021年3月23日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年4月6日閲覧。
- ^ 「『英国型』と呼ばないでください。正しい名前を使用してください：B.1.1.7」。STAT 。 2021年2月9日。2021年6月4日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年2月12日閲覧。
- ^ Flanagan R (2021年2月2日). 「WHOがこれを『英国変異株』と呼ばない理由、そしてあなたもそうすべきではない理由」CTVニュース。2021年5月1日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年2月12日閲覧。
- ^ 変異株が最初に確認された国を示す名前を使用している情報源のリストについては、たとえば、Talk:南アフリカのCOVID変異株やTalk:英国のコロナウイルス変異株を参照してください。
- ^ 「本日、@WHO は #SARSCoV2 の懸念される変異株 (VOC) と関心のある変異株 (VOI) について、簡単に言える新しいラベルを発表します」。2021年7月7日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年7月7日閲覧。
- ^ Branswell H (2021年5月31日). 「コロナウイルス変異株の命名ゲームが少し簡単になった」. Stat News . 2021年6月17日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年6月28日閲覧。
- ^ 世界保健機関（2021年1月15日）。「新型コロナウイルス感染症（COVID-19）パンデミックに関する国際保健規則（2005）緊急委員会第6回会合における声明」。2021年2月7日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年1月18日閲覧。
- ^ “Covid: WHO、英国などの変異株をギリシャ文字で改名”. BBCニュース. 2021年5月31日. 2021年5月31日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年7月7日閲覧。
- ^ ab 「WHO、コロナウイルス変異株の命名でギリシャ語のアルファベット2文字を省略」AP通信。2021年11月27日。
- ^ 「ギリシャ語のアルファベットが使い切られたら、新たなCOVID変異株に星座の名前が付けられる可能性」スカイニュース。2021年8月8日。 2021年11月30日閲覧。
- ^ Koyama T, Platt D, Parida L (2020年7月). 「SARS-CoV-2ゲノムの変異体解析」.世界保健機関紀要. 98 (7): 495–504. doi : 10.2471/BLT.20.253591 (2024年12月5日現在非アクティブ) . PMC 7375210. PMID 32742035.
合計65776の変異体を検出し、5775の異なる変異体を検出しました。
{{cite journal}}: CS1 maint: DOI inactive as of December 2024 (link) - ^ abc WHO本部（2021年1月8日）。「3.6 ウイルスの命名と命名法に関する考慮事項」。公衆衛生目標のためのSARS-CoV-2ゲノム配列決定：暫定ガイダンス、2021年1月8日。世界保健機関。6ページ。2021年1月23日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年2月2日閲覧。
- ^ “Global phylogeny, updated by Nextstrain”. GISAID. 2021年1月18日. 2021年1月20日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年1月19日閲覧。
- ^ Hadfield J、Megill C、Bell SM、Huddleston J、Potter B、Callender C、et al. (2018年12月)。Kelso J (編)。「Nextstrain: 病原体進化のリアルタイム追跡」。バイオインフォマティクス。34 (23): 4121–4123。doi :10.1093 / bioinformatics /bty407。PMC 6247931。PMID 29790939。
- ^ “Nextstrain COVID-19”. Nextstrain . 2021年1月21日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年6月1日閲覧。
- ^ 「cov-lineages/pangolin: SARS-CoV-2ゲノム配列をグローバル系統に割り当てるためのソフトウェアパッケージ」。Github。2021年2月15日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年1月2日閲覧。
- ^ ab “Lineage descriptions”. cov-lineages.org . Pangoチーム. 2021年6月4日時点のオリジナルよりアーカイブ。2020年12月24日閲覧。
- ^ Rambaut A、Holmes EC、O'Toole Á、Hill V、McCrone JT、Ruis C、et al. (2021年3月)。「補遺：ゲノム疫学を支援するためのSARS-CoV-2系統の動的命名法提案」。Nature Microbiology。6 （3 ）：415。doi：10.1038 / s41564-021-00872-5。PMC 7845574。PMID 33514928 。
- ^ abc Kumar S, Tao Q, Weaver S, Sanderford M, Caraballo-Ortiz MA, Sharma S, et al. (2021年5月). 「COVID-19パンデミックにおける祖先SARS-CoV-2とその主要な派生種の進化的肖像」.分子生物学と進化. 38 (8): 3046–3059. doi :10.1093/molbev/msab118. PMC 8135569. PMID 33942847 .
- ^ Wu F, Zhao S, Yu B, Chen YM, Wang W, Song ZG, et al. (2020年3月). 「中国におけるヒト呼吸器疾患に関連する新たなコロナウイルス」. Nature . 579 (7798): 265–269. Bibcode :2020Natur.579..265W. doi :10.1038/s41586-020-2008-3. PMC 7094943. PMID 32015508 .
- ^ Chiara M、 Horner DS、Gissi C、Pesole G（2021年5月）。「比較ゲノミクスにより、SARS-CoV-2の早期出現と偏った時空間分布が明らかに」。 分子生物学と進化。38 （6）：2547–2565。doi ： 10.1093/ molbev /msab049。PMC 7928790。PMID 33605421。
- ^ Zhou P、Yang XL、Wang XG、Hu B、Zhang L、Zhang W、et al. (2020年3月)。「コウモリ起源と思われる新しいコロナウイルスによる肺炎の発生」。Nature。579 ( 7798 ) : 270–273。Bibcode : 2020Natur.579..270Z。doi : 10.1038 /s41586-020-2012-7。PMC 7095418。PMID 32015507。
- ^ オカダ P、ブアトン R、フイグン S、タナダチャクン T、パーンメン S、ウォンブート W 他（2020年2月）。 「武漢からタイへの旅行者における2019年コロナウイルス感染症（COVID-19）の初期感染パターン、2020年1月」。ユーロ監視。25 (8)。土井：10.2807/1560-7917.ES.2020.25.8.2000097。PMC 7055038。PMID 32127124。
- ^ 「Official hCoV-19 Reference Sequence」www.gisaid.org . 2021年5月6日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年5月14日閲覧。
- ^ 「SARS-CoV-2の武漢株の祖先は2019年10月下旬に流行していた」。News Medical。2021年7月24日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2020年5月10日閲覧。
ジャーナル参考文献：Kumar, S. et al. (2021). An evolutionary Portrait...
- ^ 「SARS-CoV-2 変異株：リスク評価フレームワーク」（PDF）。GOV.UK 。政府デジタルサービス。イングランド公衆衛生局。2021年5月22日。GOV-8426。2021年5月27日時点のオリジナルよりアーカイブ（ PDF ）。2021年6月22日閲覧。
- ^ abcde 「生きた証拠 - SARS-CoV-2 変異体」。臨床イノベーション庁。nsw.gov.au。ニューサウスウェールズ州保健省。2021年7月23日。2021年4月16日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年3月22日閲覧。頻繁に更新されます。
- ^ abc 「懸念されるSARS-CoV-2変異体」。ECDC.eu。欧州疾病予防管理センター。2021年4月30日。2021年6月16日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年5月12日閲覧。頻繁に更新されます。
- ^ 「コロナウイルス感染症（COVID-19）状況報告」。who.int。世界保健機関。2020年1月26日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年6月14日閲覧。頻繁に更新されます。
- ^ 「SARS-CoV-2変異体の調査：技術ブリーフィング」。GOV.UK。政府デジタルサービス。イングランド公衆衛生局。 2021年11月18日閲覧。頻繁に更新されます。
- ^ 「懸念されるSARS-CoV-2変異体の調査：変異体リスク評価」。GOV.UK。政府デジタルサービス。イングランド公衆衛生局。2021年6月19日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年6月19日閲覧。頻繁に更新されます。
- ^ abcdefg COVID-19に関する週刊疫学的アップデート – 2021年7月20日（状況報告）。世界保健機関。2021年7月20日。2021年7月23日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年7月24日閲覧。
- ^ Planas D、Veyer D、Baidaliuk A、Staropoli I、Guivel-Benhassine F、Rajah MM、他 (2021年5月27日)。「感染性SARS-CoV-2変異体B.1.617.2のモノクローナル抗体および回復期およびワクチン接種者からの血清に対する感受性の低下」bioRxiv 10.1101/2021.05.26.445838。
- ^ ab 「オミクロン（B.1.1.529）の分類：懸念されるSARS-CoV-2変異株」。世界保健機関。2021年11月26日。 2021年11月26日閲覧。
- ^ abcdefg COVID-19に関する週刊疫学的アップデート – 2021年6月22日（状況報告）。世界保健機関。2021年6月22日。2021年6月29日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年6月26日閲覧。
- ^ イングランドで懸念されるSARS-CoV-2変異体と調査中の変異体、技術ブリーフィング10 （PDF） （ブリーフィング）。イングランド公衆衛生局。2021年5月7日。GOV-8226。 2021年5月8日時点のオリジナルよりアーカイブ（PDF） 。 2021年6月6日閲覧。
- ^ abcd Campbell F, Archer B, Laurenson-Schafer H, Jinnai Y, Konings F, Batra N, et al. (2021年6月). 「2021年6月現在、懸念されるSARS-CoV-2変異体の伝染力と世界的拡散の増加」. Euro Surveillance . 26 (24): 2100509. doi :10.2807/1560-7917.ES.2021.26.24.2100509. PMC 8212592 . PMID 34142653.
- ^ Sheikh A、McMenamin J、Taylor B、Robertson C（ 2021年6月）。「スコットランドにおけるSARS-CoV-2 Delta VOC：人口統計、入院リスク、ワクチンの有効性」。Lancet。397 （10293）：2461–2462。doi ： 10.1016/ S0140-6736 （21）01358-1。PMC 8201647。PMID 34139198。
- ^ ab 「イングランドで懸念されているSARS-CoV-2変異体と調査中の変異体 技術ブリーフィング21」（PDF）。イングランド公衆衛生局。2021年8月20日。16ページと22ページ。2021年8月29日時点のオリジナルよりアーカイブ（PDF） 。 2021年8月29日閲覧。
- ^ ab SARS-CoV-2変異株デルタのリスク評価（PDF）（評価）。イングランド公衆衛生局。2021年7月23日。2021年7月25日時点のオリジナルよりアーカイブ（PDF） 。 2021年7月24日閲覧。
- ^ Yadav PD、Sapkal GN、Abraham P、Ella R、Deshpande G、Patil DY、et al. (2021年5月)。「調査中の変異株B.1.617のBBV152ワクチン接種者の血清による中和」。臨床感染症。74 （ ciab411） 。オックスフォード大学出版局：366–368。bioRxiv 10.1101 /2021.04.23.441101。doi ： 10.1093/cid/ciab411。PMID 33961693 。
- ^ Callaway E (2021年11月25日). 「重度変異コロナウイルス変異株、科学者を警戒させる」Nature . 600 (7887): 21. Bibcode :2021Natur.600...21C. doi : 10.1038/d41586-021-03552-w . PMID 34824381. S2CID 244660616.
- ^ イングランドで懸念されるSARS-CoV-2変異体と調査中の変異体、技術ブリーフィング29 （PDF） （ブリーフィング）。イングランド公衆衛生局。2021年11月26日。GOV-10481。 2021年11月27日時点のオリジナルよりアーカイブ（PDF） 。 2021年11月26日閲覧。
- ^ abc SARS-CoV-2変異株オミクロンのリスク評価（PDF）（評価）。イングランド公衆衛生局。2021年12月22日。GOV-10869 。 2021年12月23日閲覧。
- ^ ab Nyberg T, Ferguson NM, Nash SG, Webster HH, Flaxman S, Andrews N, et al. (2022年3月16日). 「イングランドにおけるSARS-CoV-2オミクロン（B.1.1.529）およびデルタ（B.1.617.2）変異体に関連する入院および死亡のリスクの比較分析：コホート研究」。The Lancet。399 （10332 ）：1303–1312。doi ： 10.1016 /S0140-6736（ 22 ）00462-7。ISSN 0140-6736。PMC 8926413。PMID 35305296。
- ^ Rambaut A、Loman N、Pybus O、Barclay W、Barrett J、Carabelli A、et al. (2020年12月18日). 「英国で出現したSARS-CoV-2系統の予備的ゲノム特性評価は、一連のスパイク変異によって定義される」。Virological。2020年12月21日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年6月14日閲覧。
- ^ 新型SARS-COV-2変異株の調査、技術ブリーフィング1 （PDF）（ブリーフィング）。イングランド公衆衛生局。2020年12月21日。 2021年6月15日時点のオリジナルよりアーカイブ（PDF） 。 2021年6月6日閲覧。
- ^ ab Chand et al. (2020)、p. 6、スパイク変異体N501Yの潜在的な影響。
- ^ Nyberg T、Twohig KA、Harris RJ、Seaman SR、Flannagan J、Allen H、et al. (2021年6月)。「SARS-CoV-2変異体B.1.1.7の患者の入院リスク：コホート分析 」。BMJ。373 ： n1412。arXiv ： 2104.05560。doi ： 10.1136 / bmj.n1412。PMC 8204098。PMID 34130987。S2CID 235187479 。
- ^ 「英国で確認されたCOVID-19変異株の症例」GOV.UK。イングランド公衆衛生局。2021年1月15日。2021年5月7日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年3月5日閲覧。
- ^ Horby P, Barclay W, Gupta R, Huntley C (2021年1月27日). NERVTAG論文：変異型P.1に関する注記（注記）. Public Health England. 2021年6月6日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年6月6日閲覧。
- ^ Horby P、Barclay W、Huntley C（2021年1月13日）。NERVTAG論文：SARS-CoV-2変異体に関する簡単なメモ（注）。イングランド公衆衛生局。2021年6月6日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年6月6日閲覧。
- ^ abcdef 「SARS-CoV-2変異体の追跡」www.who.int . 2022年5月26日閲覧。頻繁に更新されます。
- ^ “Covid: アイルランド、イタリア、ベルギー、オランダが英国発着便を禁止”. BBCニュース. 2020年12月20日. 2020年12月21日時点のオリジナルよりアーカイブ。2020年12月23日閲覧。
- ^ Chand M, Hopkins S, Dabrera G, Achison C, Barclay W, Ferguson N, et al. (2020年12月21日). 新型SARS-COV-2変異体の調査：懸念される変異体202012/01 (PDF) (レポート). Public Health England. 2021年2月22日時点のオリジナルよりアーカイブ(PDF) 。 2020年12月23日閲覧。
- ^ 「PHE、COVID-19の新株を調査中」。イングランド公衆衛生局（PHE）。2020年12月14日。
- ^ abcdef 2021年6月8日のCOVID-19に関する週間疫学的アップデート（状況報告）。世界保健機関。2021年6月8日。2021年6月15日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年6月14日閲覧。
- ^ Rambaut A, Loman N, Pybus O, Barclay W, Barrett J, Carabelli A, et al. (2020). 英国で出現したSARS-CoV-2系統の予備的なゲノム特性評価は、一連のスパイク変異によって定義される（レポート）。COVID-19 Genomics Consortium UKに代わって執筆。2021年2月22日時点のオリジナルよりアーカイブ。2020年12月20日閲覧。
- ^ Kupferschmidt K (2020年12月20日). 「英国で発生した変異コロナウイルスは警戒を呼び起こすが、その重要性は依然不明」。サイエンス誌。2020年12月21日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2020年12月21日閲覧。
- ^ ab Collier DA, De Marco A, Ferreira IA, Meng B, Datir RP, Walls AC, et al. (2021年5月). 「SARS-CoV-2 B.1.1.7のmRNAワクチン誘発抗体に対する感受性」. Nature (出版). 593 (7857): 136–141. doi : 10.1038/s41586-021-03412-7 . PMC 7899479 . PMID 33706364.
そこで、追加のE484K置換の有無にかかわらずB.1.1.7スパイク変異を持つ擬似ウイルスを生成し、BNT162b2 mRNAワクチンの1回目と2回目の投与後に得られた血清、および回復期血清に対してこれらをテストしました。 2回目のワクチン接種後、B.1.1.7スパイク変異およびE484Kを持つ擬似ウイルスに対する中和活性の大幅な低下が観察されました（図3d、e）。野生型スパイクタンパク質と比較した、E484Kを含むB.1.1.7スパイク変異体の平均変化倍率は6.7であったのに対し、B.1.1.7変異体では1.9でした（図3a～cおよび拡張データ図5）。同様に、中和力価の範囲で回復期血清のパネルをテストしたところ（図1f、gおよび拡張データ図5）、E484Kを持つ変異B.1.1.7スパイクに対する活性のさらなる低下が観察され、野生型スパイクタンパク質と比較した変化倍率は11.4でした（図3f、gおよび拡張データ図5）。
- ^ ab 「VUI-202012/01に関する新たな証拠と公衆衛生リスク評価の見直し」。ナレッジハブ。2020年12月15日。2020年12月21日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2020年12月25日閲覧。
- ^ “COG-UK ショーケースイベント”. 2020年12月18日. 2021年6月14日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2020年12月25日閲覧– YouTube経由。
- ^ Davies NG、Abbott S、Barnard RC 、 Jarvis CI、Kucharski AJ、Munday JD、他 (2021年4月)。「イングランドにおけるSARS-CoV-2系統B.1.1.7の推定伝染力と影響」。サイエンス。372 ( 6538): eabg3055。doi : 10.1126/ science.abg3055。PMC 8128288。PMID 33658326。
- ^ Volz E, Mishra S, Chand M, Barrett JC, Johnson R, Geidelberg L, et al. (2021年5月). 「イングランドにおけるSARS-CoV-2系統B.1.1.7の伝染性評価」. Nature . 593 (7858): 266–269. Bibcode :2021Natur.593..266V. doi : 10.1038/s41586-021-03470-x . hdl : 10044/1/87474 . PMID 33767447.
- ^ Horby P, Huntley C, Davies N, Edmunds J, Ferguson N, Medley G, et al. (2021年2月11日). 「COVID-19の懸念変異株B.1.1.7に関するNERVTAG論文：B.1.1.7の重症度に関するNERVTAG更新ノート（2021年2月11日）」（PDF）。GOV.UK。2021年4月13日時点のオリジナルよりアーカイブ（PDF） 。 2021年2月26日閲覧。
- ^ Gallagher J (2021年1月22日). 「コロナウイルス：英国の変異株は『より致死的かもしれない』」BBCニュース。2021年5月23日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年1月22日閲覧。
- ^ Frampton D、Rampling T、Cross A、Bailey H、Heaney J、Byott M、他 (2021年4月)。「英国ロンドンにおける新興SARS-CoV-2 B.1.1.7系統のゲノム特性と臨床効果：全ゲノム配列決定と病院ベースのコホート研究」。The Lancet 。感染症。21 (9): 1246–1256。doi :10.1016/S1473-3099 ( 21)00170-5。PMC 8041359。PMID 33857406。
- ^ “PANGO lineages Lineage B.1.1.7”. cov-lineages.org . 2021年5月15日. 2021年6月16日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年5月15日閲覧。
- ^ abc 「SARS-CoV-2変異株の追跡（2022年3月16日更新）」www.who.int 2022年3月16日。2022年3月17日時点のオリジナルよりアーカイブ。2022年3月17日閲覧。
- ^ abcd 「SARS-CoV-2変異株の追跡（2022年3月7日更新）」www.who.int 2022年3月7日。2022年3月15日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2022年5月21日閲覧。
- ^ Mandavilli A (2021年3月5日). 「オレゴン州で、科学者が心配な突然変異を持つウイルスの変異体を発見 - 遺伝学者は、単一のサンプルで、英国で最初に特定されたコロナウイルスの変異体を発見した。これはもともと南アフリカで報告されていたものだった」。ニューヨーク・タイムズ。2021年3月6日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年3月6日閲覧。
- ^ Chen RE, Zhang X, Case JB, Winkler ES, Liu Y, VanBlargan LA, et al. (2021年4月). 「モノクローナル抗体および血清由来ポリクローナル抗体による中和に対するSARS-CoV-2変異体の耐性」. Nature Medicine . 27 (4): 717–726. doi : 10.1038/s41591-021-01294-w . PMC 8058618. PMID 33664494 .
- ^ “B.1.1.7 Lineage with S:E484K Report”. Outbreak.info . 2021年3月5日. 2021年3月7日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年3月7日閲覧。
- ^ Moustafa AM、Bianco C、Denu L、Ahmed A、Neide B、Everett J、他 (2021年4月21日)。「ペンシルベニア州で新たに発見されたB.1.1.7+E484K SARS-CoV-2分離株の比較分析」。bioRxiv 10.1101 /2021.04.21.440801。
- ^ “B.1.1.7 Lineage with S:E484K Report”. Outbreak.info . 2021年7月3日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年5月28日閲覧。
- ^ EU/EEAにおける懸念される新たなSARS-CoV-2変異体の拡散に関連するリスク - 最初の更新（リスク評価）。欧州疾病予防管理センター。2021年2月2日。2021年3月25日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年3月22日閲覧。
- ^ abcd 「南アフリカ、新たなコロナウイルス変異種を発表」。ニューヨーク・タイムズ。2020年12月18日。2020年12月21日時点のオリジナルよりアーカイブ。2020年12月20日閲覧。
- ^ ab Wroughton L, Bearak M (2020年12月18日). 「南アフリカコロナウイルス：第二波は新たな株と10代の「怒りのフェスティバル」によって促進される」ワシントンポスト。2020年12月27日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2020年12月20日閲覧。
- ^ Mkhize Z (2020年12月18日). 「Covid-19の最新情報（2020年12月18日）」（プレスリリース）。南アフリカ。COVID-19南アフリカオンラインポータル。2021年5月4日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2020年12月23日閲覧。
私たちの臨床医はまた、状況は変化しており、若く以前は健康だった人々が現在非常に重症になっていると警告しています。
- ^ Abdool Karim SS (2020年12月19日). 「南アフリカにおける新型コロナウイルス第2波：伝染性と501.V2変異株、第11スライド」www.scribd.com。2021年1月6日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2020年12月23日閲覧。
- ^ Lowe D (2020年12月22日). 「新たな変異」.パイプライン内.アメリカ科学振興協会. 2021年1月29日時点のオリジナルよりアーカイブ。2020年12月23日閲覧。
ここで、南アフリカに同様の懸念を引き起こしている別の株があることを指摘しておくべきだろう。この株はスパイクタンパク質に8つの変異があり、そのうち3つ（K417N、E484K、N501Y）は何らかの機能的役割を果たしている可能性がある。
- ^ 「英国と南アフリカのSARS-CoV-2の新変異株に関するWHO COVID-19動物モデル作業部会（WHO-COM）の声明」（PDF） 。世界保健機関。2020年12月22日。 2021年5月4日時点のオリジナルよりアーカイブ（PDF）。2020年12月23日閲覧。
- ^ 「スパイク受容体結合部位における新たな変異の組み合わせ」（プレスリリース）。GISAID。2020年12月21日。2021年2月22日時点のオリジナルよりアーカイブ。2020年12月23日閲覧。
- ^ “日本、ブラジルからの旅行者に新たなコロナウイルス変異種を発見”. Japan Today . 日本. 2021年1月11日. 2021年1月11日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年1月14日閲覧。
- ^ abcde Faria NR、Claro IM、Candido D、Moyses Franco LA、Andrade PS、Coletti TM、他 (2021年1月12日)。「マナウスにおける新興SARS-CoV-2系統のゲノム特性：予備的調査結果」。CADDEゲノムネットワーク。virological.org 。 2021年5月20日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年1月23日閲覧。
- ^ ab "P.1". cov-lineages.org . Pangoチーム. 2021年7月1日. 2021年6月9日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年3月7日閲覧。
- ^ 「英国で注目されているSARS-CoV-2スパイク変異に関するCOG-UK報告書」（PDF） www.cogconsortium.uk Covid -19 Genomics UKコンソーシアム2021年1月15日。 2021年4月16日時点のオリジナルよりアーカイブ（PDF） 。 2021年1月25日閲覧。
- ^ ab Voloch CM、da Silva Francisco R、de Almeida LG、Cardoso CC、Brustolini OJ、Gerber AL、他。 （2021年3月）。 「ブラジル、リオデジャネイロ由来の新規SARS-CoV-2系統のゲノム特性評価」。ウイルス学ジャーナル。95 (10)。土井：10.1128/jvi.00119-21。PMC 8139668。PMID 33649194。
- ^ Nascimento V, Souza V (2021年2月25日). 「ブラジルのアマゾナス州におけるCOVID-19の流行は、風土病のSARS-CoV-2系統の長期持続と、懸念される新たな変異株P.1の最近の出現によって引き起こされた」。Research Square。doi : 10.21203 /rs.3.rs-275494/v1。2021年3月1日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年3月2日閲覧。
- ^ ファリア NR、メラン TA、ウィテカー C、クラロ IM、カンディド DD、ミシュラ S、他。 （2021年5月）。 「ブラジル、マナウスにおける P.1 SARS-CoV-2 系統のゲノミクスと疫学」。科学。372 (6544): 815–821。Bibcode :2021Sci...372..815F。土井：10.1126/science.abh2644。ISSN 0036-8075。PMC 8139423。PMID 33853970。
このパラメータ空間の妥当な領域内では、P.1は、ローカルの非P1系統よりも1.7～2.4倍伝達性が高く（50% BCI、2.0中央値、99%事後確率が1を超える）、非P.1系統の以前の感染によって引き起こされる防御免疫の21～46％（BCI50％、中央値32％、事後確率95％で少なくとも10％を回避できる）を回避する。これは54～79％に相当する。 % (50% BCI、68% 中央値) 交差免疫 ... 感染が死亡率につながる可能性は 1.2 ～ 1.9 倍 (50% BCI、中央値 1.5、90% 事後確率が >1) 高いと推定されます。の出現後の期間P.1は、以前と比較して、この相対リスクの事後推定値も推定交差免疫と相関しているが、より広い意味では、マナウスでの最近の流行は、市の医療システムに負担をかけ、医療へのアクセス不足につながっている。したがって、推定される相対死亡リスクの増加が P.1 感染によるものか、マナウスの医療システムへの負担によるものか、あるいはその両方によるものかは判断できません。P.1 感染の詳細な臨床調査が必要です。
- ^ Andreoni M、Londoño E、Casado L（2021年3月3日）。「ブラジルのコロナ危機は全世界への警告、科学者らは言う ― ブラジルでは記録的な数の死者と、再感染を引き起こす可能性のあるより感染力の高いコロナウイルス変異体の蔓延が見られる」ニューヨーク・タイムズ。2021年3月3日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年3月3日閲覧。
- ^ Zimmer C (2021年3月1日). 「ブラジルのウイルス変異株、新型コロナから回復した多くの人に感染 ― いわゆるP.1変異株に関する初の詳細な研究で、ブラジルの都市がいかに壊滅的被害を受けたかが示された。科学者たちは今、他の地域でどのような影響を及ぼすかを知りたいと考えている」ニューヨーク・タイムズ。2021年3月3日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年3月3日閲覧。
- ^ Sofia Moutinho (2021年5月4日). 「変異株に悩まされるブラジルで中国製COVID-19ワクチンが予防効果を維持」. Science . doi :10.1126/science.abi9414. S2CID 234804602. 2021年6月16日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年5月4日閲覧。
- ^ Gaier R (2021年3月5日). 「独占：オックスフォード大学の研究は、アストラゼネカがブラジル変異株に対して有効であると示唆、情報筋が語る」ロイター通信。リオデジャネイロ。2021年3月9日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年3月9日閲覧。
- ^ 「独占：オックスフォード大学の研究でアストラゼネカがブラジル変異株に有効と判明、情報筋が語る」ロイター通信。リオデジャネイロ。2021年3月8日。2021年3月9日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年3月9日閲覧。
- ^ Simões E、Gaier R (2021 年 3 月 8 日)。 「CoronaVac e Oxford são eficazes contravariante de Manaus, dizem Laboratorios」 [コロナバックとオックスフォードはマナウス変異株に対して有効であると研究所は述べている]。UOL Notícias (ポルトガル語)。ロイター通信ブラジル。 2021年3月8日のオリジナルからアーカイブ。2021 年3 月 9 日に取得。
- ^ 「デルタ型コロナ株、世界的に優勢、現在185カ国に拡大：WHO」2021年9月22日。
- ^ “PANGO lineages”. cov-lineages.org . 2021年6月3日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年4月18日閲覧。
- ^ abcd Koshy J (2021年4月8日). 「コロナウイルス | インドの「二重変異」株、B.1.617と命名」The Hindu。2021年5月26日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年4月10日閲覧。
- ^ 「インドの変異株による第2波は、カナダに着陸する感染者便の急増と重なった」トロント・サン。2021年4月10日。2021年6月2日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年4月10日閲覧。
- ^ 「COVID-19に関する週間疫学的アップデート」世界保健機関。2021年5月11日。2021年5月11日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年5月12日閲覧。
- ^ 「インドで初めて検出されたCOVID株、53の地域で発見：WHO」www.aljazeera.com。2021年6月19日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年5月27日閲覧。
- ^ ミシュラ・S、ミンダーマン・S、シャルマ・M、ウィテカー・C、メラン・TA、ウィルトン・T、他。 （2021年9月1日）。 「イギリスにおける SARS-CoV-2 系統の構成の変化とデルタ変異株の増加」。e臨床医学。39 : 101064. doi :10.1016/j.eclinm.2021.101064. ISSN 2589-5370。PMC 8349999。PMID 34401689。
- ^ “英国の科学者、インドのコロナウイルス変異種について警告”.ロイター. 2021年5月7日. 2021年5月22日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年5月7日閲覧。
- ^ 「PHEが懸念すべき変異株として分類したVUI-21APR-02/B.1.617.2に対する専門家の反応」サイエンスメディアセンター。2021年5月7日。2021年7月13日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年5月15日閲覧。
- ^ イングランドで懸念されるSARS-CoV-2変異体と調査中の変異体、技術ブリーフィング14 （PDF） （ブリーフィング）。イングランド公衆衛生局。2021年6月3日。GOV-8530。 2021年7月4日時点のオリジナルよりアーカイブ（PDF） 。 2021年6月26日閲覧。
- ^ Pearson H、Pullen L、Dao C（2021年6月11日）。「AHSがカルガリー病院でのCOVID-19デルタ変異株の発生に関するワクチン接種データを分析」。グローバルニュース。2021年6月12日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年6月12日閲覧。
- ^ Schraer R (2021年6月4日). 「『ネパール変異種』：ポルトガルへのグリーンリスト旅行を阻止する変異は何？」BBCニュース。2021年6月19日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年6月18日閲覧。
- ^ Acharya B、Jamkhandikar S (2021年6月23日). 「解説：K417N変異を伴うコロナウイルスのデルタ変異体とは何か？」ロイター。2021年6月23日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年6月23日閲覧。
- ^ イングランドで懸念されているSARS-CoV-2変異体と調査中の変異体、技術ブリーフィング17 （PDF） （ブリーフィング）。イングランド公衆衛生局。2021年6月25日。GOV-8576。 2021年6月25日時点のオリジナルよりアーカイブ（PDF） 。 2021年6月26日閲覧。
- ^ Sharma M (2021年6月14日). 「SARS-CoV-2の新たな「デルタプラス」変異体を特定。これまでにわかっていることはこれだ」。India Today。2021年6月17日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年6月16日閲覧。
- ^ Cutler S (2021年6月18日). 「『ネパール変異株』：これまでにわかったこと」The Conversation . 2021年6月18日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年6月18日閲覧。
- ^ Tang JW、Oliver T (2021)。「南アフリカのSARS-CoV-2変異株501Y.V2の英国への導入」。The Journal of Infection。82 ( 4 ):e8–e10。doi : 10.1016 /j.jinf.2021.01.007。PMC 7813514。PMID 33472093。
- ^ 「インド、新型コロナの新たな変異株は懸念」ロイター通信。バンガロール。2021年6月22日。2021年6月23日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年6月23日閲覧。
- ^ Biswas S (2021年6月23日). 「デルタプラス：科学者はCovid-19変異株のリスクを判断するには時期尚早と述べる」BBCニュース。2021年6月23日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年6月23日閲覧。
- ^ Roberts M (2021年10月19日). 「Covid-19: 英国でデルタ変異株の新たな変異が厳重に監視」www.bbc.co.uk . 2021年10月19日閲覧。
- ^ “SARS-CoV-2変異体の追跡”. www.who.int . 2022年6月7日. 2022年6月22日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2022年6月23日閲覧。
- ^ 「南カリフォルニアのCOVID-19株、急速に世界的感染範囲を拡大」Cedars-Sinai Newsroom .ロサンゼルス. 2021年2月11日 . 2021年4月16日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年3月17日閲覧。
- ^ Latif AA、Mullen JL、Alkuzweny M、Tsueng G、Cano M、Haag E、et al. (The Center for Viral Systems Biology). 「B.1.429 Lineage Report」. Outbreak.info . 2021年7月3日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年5月28日閲覧。
- ^ ab 「カリフォルニアの新たな変異株が同地でウイルス感染急増の原因か、研究が示唆」ニューヨーク・タイムズ。2021年1月19日。2021年6月9日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年1月20日閲覧。
- ^ Azad A (2021年3月17日). 「カリフォルニアで最初に検出されたコロナウイルス株は、正式に『懸念される変異株』とCDCが発表」CNN。2021年6月6日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年6月6日閲覧。
- ^ Shen X、Tang H、Pajon R、Smith G、Glenn GM、Shi W、et al. (2021年6月)。「SARS-CoV-2変異株B.1.429およびB.1.351の中和」。ニューイングランド医学ジャーナル。384 （ 24 ）：2352–2354。doi ：10.1056 / NEJMc2103740。PMC 8063884。PMID 33826819。
- ^ 「SARS-CoV-2 変異株の分類と定義：2021年6月23日更新」。CDC.gov。米国疾病予防管理センター。2021年6月23日。2021年6月29日時点のオリジナルよりアーカイブ。
- ^ ab Zimmer C, Mandavilli A (2021年5月14日). 「How the United States Beat the Variants, for Now」. The New York Times . 2021年5月16日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年5月17日閲覧。
- ^ Wadman M (2021年2月23日). 「カリフォルニアコロナウイルス株は感染力が強く、致死率も高い可能性」. Science News . doi :10.1126/science.abh2101. 2021年5月1日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年3月17日閲覧。
- ^ Ho C (2021年2月28日). 「コロナウイルス検査は変異株にも有効か？」サンフランシスコ・クロニクル。2021年6月24日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年6月24日閲覧。
- ^ 「ロサンゼルス患者の3分の1以上に地域COVID-19株が見つかる」。news wise（プレスリリース）。カリフォルニア州：シーダーズサイナイ医療センター。2021年1月19日。2021年6月13日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年3月3日閲覧。
- ^ ab "B.1.429". Rambaut Group、エディンバラ大学。PANGO Lineages。2021年2月15日。2021年4月28日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年2月16日閲覧。
- ^ ab “B.1.429 Lineage Report”. Scripps Research . Outbreak.info. 2021年2月15日. 2021年6月9日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年2月16日閲覧。
- ^ 「他の国や州で最初に発見されたCOVID-19変異株、現在カリフォルニアでより頻繁に見られる」カリフォルニア州公衆衛生局。2021年6月16日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年1月30日閲覧。
- ^ Weise E、Weintraub K. 「米国を急速に移動している新型コロナの新種には注意深い監視が必要と科学者らが言う」USA Today。2021年3月4日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年1月30日閲覧。
- ^ 「マナウスにおける新興SARS-CoV-2系統のゲノム特性：予備的調査結果」。Virological . 2021年1月12日。 2021年6月26日閲覧。
- ^ Ranzani O (2021). 「ブラジルにおけるガンマ変異体関連COVID-19流行時の高齢者人口におけるCoronaVacワクチンの有効性」medRxiv 10.1101/2021.05.19.21257472v3。
- ^ 「SARS-CoV-2変異体の追跡」who.int。世界保健機関。
- ^ 「Delta-PCR-testen」[Delta PCR Test]（デンマーク語）。Statens Serum Institut。2021年2月25日。2021年2月7日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年2月27日閲覧。
- ^ ab 「GISAID hCOV19変異体（メニューオプション「G/484K.V3（B.1.525）」を参照）」。GISAID。2021年6月23日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年3月4日閲覧。
- ^ ab “Status for udvikling af SARS-CoV-2 Variants of Concern (VOC) i Danmark” [デンマークにおけるSARS-CoV-2 Variants of Concern (VOC) の発生状況] (デンマーク語). Statens Serum Institut. 2021年2月27日. 2021年8月27日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年2月27日閲覧。
- ^ ab “B.1.525 international lineage report”. cov-lineages.org . Pangoチーム. 2021年5月19日. 2021年6月9日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年2月16日閲覧。
- ^ Roberts M (2021年2月16日). 「英国で新たなコロナウイルス変異株が確認」BBCニュース。2021年6月20日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年2月16日閲覧。
- ^ 「保健省、地域7で2つのSARS-CoV-2変異の検出を確認」ABS-CBNニュース。2021年2月18日。2021年5月3日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年3月13日閲覧。
- ^ Santos E (2021年3月13日). 「保健省、フィリピンに特有のCOVID-19変異株を報告、ブラジル変異株の初事例」CNNフィリピン。2021年3月16日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年3月17日閲覧。
- ^ 「保健省、フィリピンで初めて検出されたCOVID-19の新たな変異株を確認、ブラジル変異株の初事例も」ABS-CBNニュース。2021年3月13日。2021年5月2日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年3月13日閲覧。
- ^ 「フィリピン、日本より早く新型コロナ変異株を発見、専門家が明らかに」CNNフィリピン。2021年3月13日。2021年3月17日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年3月17日閲覧。
- ^ “日本、フィリピンからの旅行者から新たなコロナウイルス変異株を検出”. CNNフィリピン. 2021年3月13日. 2021年3月16日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年3月21日閲覧。
- ^ “英国、フィリピンで初めてCOVID-19変異株2例を報告”. ABS-CBN . 2021年3月17日. 2021年3月18日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年3月21日閲覧。
- ^ “Covid-19: サラワク州、フィリピンで報告された変異株を検出”. 2021年4月30日. 2021年5月1日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年4月30日閲覧。
- ^ 「SARS-CoV-2変異体の追跡」www.who.int . 2021年6月1日閲覧。
- ^ Barton MI、MacGowan SA、Kutuzov MA、Dushek O、Barton GJ、van der Merwe PA（2021年8月26日）。Fouchier RA、Van der Meer JW、Fouchier RA（編）。「SARS-CoV-2 Spike RBDとそのリガンドであるヒトACE2受容体の一般的な変異が結合親和性と速度論に及ぼす 影響」。eLife。10 ： e70658。doi ：10.7554 / eLife.70658。ISSN 2050-084X。PMC 8480977。PMID 34435953。
- ^ SARS-CoV-2 変異体による配列、2021年7月26日、米国 Our World in Data
- ^ 「SARS-CoV-2変異体の追跡」www.who.int 2021年5月31日2021年6月5日閲覧。
- ^ 「COVID-19に関する週間疫学的アップデート - 2021年4月27日」（PDF）。世界保健機関。2021年4月27日。 2021年6月6日閲覧。
- ^ Le Page M (2021年6月4日). 「インドのcovid-19変異株（B.1.617）」. New Scientist . 2021年6月8日閲覧。
- ^ 世界保健機関は2022年3月に、以前に流行していた懸念される変異株とみなした。SARS -CoV-2 懸念される変異株とイングランドで調査中の変異株 - 技術ブリーフィング10 (PDF) (レポート)。ロンドン。2021年5月7日。 2021年6月5日閲覧。
インドで最初に検出された変異株は、2021年4月1日にVUI-21APR-01 (B.1.617.1) として調査対象に指定された。
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- ^ ab 「SARS-CoV-2変異体の追跡」世界保健機関。 2021年6月17日閲覧。
- ^ 「COVID-19に関する週間疫学的最新情報 - 2021年6月15日」（PDF）（第44版）。世界保健機関。2021年6月15日。 2021年8月16日閲覧。
ラムダは、複数の国でコミュニティ感染の実質的な率と関連付けられており、時間の経過とともに有病率が上昇し、COVID-19の発生率も増加しています。最も古い配列決定されたサンプルは、2020年8月にペルーから報告されました。
- ^ 「SARS-CoV-2変異体の追跡」who.int。世界保健機関。頻繁に更新されます。
- ^ “SARS-CoV-2変異株の追跡（2022年3月16日更新）” www.who.int 2022年3月16日。2022年3月17日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2022年3月17日閲覧。
- ^ “SARS-CoV-2変異株の追跡（2022年3月7日更新）” www.who.int 2022年3月7日。2022年3月15日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2022年5月21日閲覧。
- ^ 「SARS-CoV-2変異体の追跡」who.int。世界保健機関。2021年6月18日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年9月1日閲覧。
- ^ “SARS-CoV-2変異株の追跡（2022年3月16日更新）” www.who.int 2022年3月16日。2022年3月17日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2022年3月17日閲覧。
- ^ “SARS-CoV-2変異株の追跡（2022年3月7日更新）” www.who.int 2022年3月7日。2022年3月15日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2022年5月21日閲覧。
- ^ ab 「オミクロン（B.1.1.529）の分類：懸念されるSARS-CoV-2変異株」www.who.int . 2021年11月26日閲覧。
- ^ Callaway E (2021年11月25日). 「重度変異コロナウイルス変異株、科学者を警戒させる」Nature . 600 (7887): 21. Bibcode :2021Natur.600...21C. doi : 10.1038/d41586-021-03552-w . PMID 34824381. S2CID 244660616.
- ^ Fernando MJ. 「世界の専門家が南アフリカの懸念される新たなCOVID-19変異体に関する特別会議を開催：最新情報」USA Today。
- ^ “outbreak.info”. Outbreak.info . 2021年11月26日閲覧。
- ^ 「Covid: 南アフリカで新たに大きく変異した変異株 B.1.1.529 が懸念される」BBCニュース2021年11月25日2021年11月25日閲覧。
- ^ Whiteside P (2021年11月30日). 「COVID-19: オミクロンの感染拡大は患者ゼロから世界中にどう広がったか」スカイニュース. 2022年1月3日閲覧。
- ^ @BNODesk (2021年11月26日). 「イスラエル保健省の声明、新型コロナウイルス変異株B.1.1.529の感染確認1件を報告」(ツイート) 。2021年11月26日閲覧 – Twitter経由。
- ^ "14:30 4 מאומתים לווריאנט החדש התגלו בארץ, רה"מ יקיים מסיבת עיתונאים" ["...新しい株について検証された 4 つの新しい変異体について検証されたものが国内で発見されました..."]. m.ynet.co.il . 2021 年11 月 26 日閲覧。
- ^ 「ベルギー、欧州で初の新型コロナ変異株を確認」ロイター2021年11月26日2021年11月26日閲覧。
- ^ 「INSACOG WEEKLY BULLETIN」（PDF） . dbtindia.gov.in . 2022年1月10日. 2022年1月24日閲覧。
- ^ 「オミクロン亜系統BA.2に関する声明」www.who.int . 2022年4月4日閲覧。
- ^ ab Schmidt C. 「オミクロンのBA.2バリアントについてこれまでにわかっていること」。サイエンティフィック・アメリカン。 2022年4月4日閲覧。
- ^ 「英国全土で新型コロナ感染が再び増加 - ONS」BBCニュース。2022年3月11日。
- ^ ジェシカ・レンドール（2022年3月29日）。「CDCのデータによると、米国では現在、BA.2がCOVIDの主要変異株となっている」。
- ^ ECDC (2022年5月12日). 「SARS-CoV-2の懸念される変異体、注目される変異体、監視中の変異体のリストの変更」(PDF)。
- ^ ab Peter Russell (2023年1月6日). 「Omicron XBB.1.5: これまでにわかっていることは何ですか?」 . 2023年1月8日閲覧。
- ^ ジョンソン A. 「『エリス』コロナ変異株 EG.5 についてわかっていること: 感染者数増加の原因となっている優勢株」フォーブス。2023年8 月 11 日閲覧。
- ^ “cov-lineages.org” . 2023年8月11日閲覧。
- ^ Mundasad S (2023年8月10日). 「『エリス』と呼ばれるCovid変異株EG.5についてわかっていること」BBCニュース. BBC . 2023年8月10日閲覧。
- ^ 「SARS-CoV-2ゲノム配列の有病率と成長率の最新情報：2023年11月8日」。GOV.UK。2023年12月6日。 2023年12月21日閲覧。
- ^ 「COVID-19 週刊疫学的アップデート（第156版、2023年8月17日発行）」（PDF）世界保健機関。2023年8月17日。 2023年8月30日閲覧。
- ^ 「Covid: 冬のインフルエンザが急増する中、新たなオミクロン種の子孫についてわかっていることすべて」。インディペンデント。2023年12月8日。 2023年12月16日閲覧。
- ^ Bartel A, Grau JH, Bitzegeio J, Werber D, Linzner N, Schumacher V, et al. (2024年1月10日). 「廃水中のSARS-CoV-2 RNA断片のタイムリーなモニタリングにより、ドイツのベルリンでJN.1（BA.2.86.1.1、Clade 23I）の出現が判明」.ウイルス. 16 (1): 102. doi : 10.3390 /v16010102 . ISSN 1999-4915. PMC 10818819. PMID 38257802.
- ^ 「JN.1の初期リスク評価、2023年12月19日」（PDF）。世界保健機関。2023年12月19日。 2024年1月11日閲覧。
- ^ 「マスクの復活？ シンガポール、インドネシア、新型コロナ感染者急増で制限を復活」ミント2023年12月14日2023年12月16日閲覧。
- ^ 「COVID-19の活動が増加、JN.1変異体の有病率は引き続き上昇」。米国疾病予防管理センター。2024年1月5日。 2024年1月11日閲覧。
- ^ JN.1 のリスク評価の更新、2023 年 1 月 9 日 [日付の誤表示] (PDF)、世界保健機関、2024 年 2 月 9 日、Wikidata Q124477897、2024年 2 月 10 日のオリジナルから アーカイブ(PDF)
- ^ Leventis Lourgos A (2024年5月9日). 「新型コロナ「FLiRT」変異株が全国的に拡大中。シカゴの保健専門家が最新のワクチン接種を推奨」Yahoo News . 2024年5月14日閲覧– Chicago Tribune経由。
- ^ Kee C (2024年5月20日). 「米国で広がっている新しいCOVID変異株は「FLiRT」と呼ばれています。しかし、なぜでしょうか?」. TODAY.com . 2024年5月29日閲覧。
- ^ Nathan Bartlett (2024年7月9日). 「FLiRTからFLuQEへ：増加している最新のCOVID変異株について知っておくべきこと」The Conversation . Wikidata Q127329080. 2024年7月10日時点のオリジナルよりアーカイブ。
- ^ Lin II RG (2024年8月30日). 「カリフォルニアの波の中で、さらに感染力の高いCOVID株が『始まったばかり』」ロサンゼルス・タイムズ。 2024年9月1日閲覧。
- ^ ミシェル・ロバーツ (2024年9月16日). 「新型コロナXEC変異株が広がり始める」www.bbc.com . 2024年9月16日閲覧。
- ^ SARS-CoV-2変異株の追跡、世界保健機関、2022年5月29日、Wikidata Q127329189、2022年5月29日時点のオリジナルよりアーカイブ
- ^ ab SARS-CoV-2変異株の追跡、世界保健機関、2023年2月11日、ウィキデータ Q127329489、2023年2月11日時点のオリジナルよりアーカイブ
- ^ SARS-CoV-2変異株の追跡、世界保健機関、2024年6月28日、Wikidata Q127328784、2024年7月10日時点のオリジナルよりアーカイブ
- ^ ab 「ナイジェリアにおけるSARS-CoV-2 P681Hスパイクタンパク質変異体の検出」。Virological . 2020年12月23日。2021年6月13日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年1月1日閲覧。
- ^ “Lineage B.1.1.207”. cov-lineages.org . Pangoチーム. 2021年1月27日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年3月11日閲覧。
- ^ “クイーンズランド州の旅行者、コロナウイルスのロシア変異株検出後、ホテルでの隔離が延長”. www.abc.net.au . 2021年3月3日. 2021年3月3日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年3月3日閲覧。
- ^ Koshy J (2021年4月21日). 「西ベンガル州で新たなコロナウイルス変異株が発見される」www.thehindu.com。2021年5月26日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年4月23日閲覧。
- ^ 「ベンガルで発見された新型コロナウィルスの『三重変異体』とは？ どれほどひどいのか？」www.indiatoday.in 2021年4月22日。2021年4月28日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年4月23日閲覧。
- ^ “PANGO lineages Lineage B.1.618”. cov-lineages.org . 2021年5月14日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年4月23日閲覧。
- ^ 「ニューヨーク市の廃水中の新型SARS-CoV-2変異体の検出」ミズーリ大学。 2022年3月10日閲覧。
- ^ ab Smyth DS、Trujillo M、Gregory DA、Cheung K、Gao A、Graham M、et al. (2022年2月3日). 「ニューヨーク市の廃水中に検出された潜在的SARS-CoV-2系統の追跡」. Nature Communications . 13 (1): 635. Bibcode :2022NatCo..13..635S. doi :10.1038/s41467-022-28246-3. ISSN 2041-1723. PMC 8813986. PMID 35115523.
- ^ Browne E (2022年1月4日). 「46の変異を持つ「IHU」COVID変異体B.1.640.2についてわかっていること」。ニューズウィーク。2022年1月5日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2022年1月5日閲覧。
- ^ Freund A (2022年1月7日). 「コロナウイルス：フランスで確認された変異株に医療専門家は警戒せず」Deutsche Welle。2022年1月7日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2022年1月8日閲覧。
- ^ ab Freund A (2022年1月4日). 「フランスで新たなコロナウイルス変異種が確認」. Deutsche Welle . 2022年1月5日時点のオリジナルよりアーカイブ。2022年1月5日閲覧。
- ^ ab Bengali S (2022年1月5日). 「フランスで見つかった変異株は懸念事項ではないとWHOが発表」ニューヨーク・タイムズ。ISSN 0362-4331 。2022年1月6日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2022年1月5日閲覧。
- ^ 「SARS-CoV-2変異体の追跡」世界保健機関。2021年11月25日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2022年1月5日閲覧。
- ^ Cobbe E (2022年1月6日). 「『IHU』コロナウイルス変異株は『我々のレーダー上』にあるが脅威ではない、と世界保健機関は言う」CBSニュース。2022年1月7日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2022年1月8日閲覧。
- ^ Chaturvedi A (2022年1月4日). 「フランスで発見された新型コロナの変異株『IHU』はオミクロンよりも変異が多い」. Hindustan Times . 2022年1月5日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2022年1月5日閲覧。
- ^ 「COVID-19：フランスで新たな変異株B.1.640.2が検出 調査」エルサレム・ポスト。2022年1月4日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2022年1月4日閲覧。
- ^ 「COVIDのデルタクロン変異体とは何か、どこで発見されたのか？」。ガーディアン。2022年3月11日。 2022年4月18日閲覧。
- ^ Lapid N (2022年3月9日). 「デルタとオミクロンを組み合わせた変異体を特定、犬は高い精度でウイルスを嗅ぎ分ける」ロイター. 2022年4月18日閲覧。
- ^ 「COVID-19、ウクライナおよびその他の世界的な健康上の緊急事態バーチャル記者会見の記録 - 2022年3月16日」。www.who.int 。 2022年4月24日閲覧。
- ^ Snider M. 「新たなCOVID変異株、デルタクロンが存在する可能性がある。これについてわかっていること」USA TODAY 2022年4月24日閲覧。
- ^ ab Colson P、Fournier PE、Delerce J、Million M、Bedotto M、Houhamdi L、et al. (2022年3月16日)。「南フランスの3つの症例クラスターにおける「デルタミクロン」SARS-CoV-2の培養と識別」pp.3739–3749。medRxiv 10.1101/ 2022.03.03.22271812v2。
- ^ 「フランス/デンマークにおけるDelta（AY.4）およびBA.1組換え体[約30配列、Veroで分離/継代] · Issue #444 · cov-lineages/pango-designation」。GitHub 。 2022年4月24日閲覧。
- ^ O'Neill L (2022年3月21日). 「デルタクロン：この新しいハイブリッドコロナウイルスについて科学者がこれまでに知っていること」. The Conversation . 2022年4月18日閲覧。
- ^ Sundaravelu A (2023年7月28日). 「科学者ら、患者からこれまでで最も変異が進んだ、最も極端な新型コロナ変異体を発見」メトロニュース。 2023年7月28日閲覧。
- ^ ab 「イングランドで懸念されるSARS-CoV-2変異体と調査中の変異体：技術ブリーフィング39」（PDF）。gov.uk。英国保健安全保障庁。2022年3月25日。 2022年4月4日時点のオリジナルよりアーカイブ（PDF） 。 2022年4月6日閲覧。
- ^ 「COVID-19 Weekly Epidemiological Update : Edition 84、2022年3月22日発行」(PDF) . who.int . 世界保健機関。2022年3月2日。2022年4月6日閲覧。
- ^ “Cov-Lineages”. cov-lineages.org . 2022年4月6日閲覧。
- ^ Kupferschmidt K (2020年12月23日). 「英国の変異株、COVID-19パンデミックにおける免疫不全患者の役割に注目」. Science . doi :10.1126/science.abg2911. S2CID 234378594. 2021年6月24日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年2月25日閲覧。
- ^ Sutherland S (2021年2月23日). 「COVID変異体は免疫力が低下した人に発生する可能性がある」。Scientific American。2021年6月6日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年2月25日閲覧。
- ^ McCarthy KR, Rennick LJ, Nambulli S, Robinson-McCarthy LR, Bain WG, Haidar G, et al. (2021年3月). 「SARS-CoV-2スパイク糖タンパク質の反復欠失が抗体回避を駆動する」. Science . 371 (6534): 1139–1142. Bibcode :2021Sci...371.1139M. doi : 10.1126/science.abf6950 . PMC 7971772. PMID 33536258 .
- ^ “新型コロナウイルス変異株とは | 日本医学臨床検査研究所”日本医学検査研究所】。 2021年9月3日のオリジナルからアーカイブ。2021 年9 月 3 日に取得。
- ^ “Variant: 21G (Lambda)”. CoVariants . 2021年7月21日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年9月3日閲覧。
- ^ Frank Diamond (2021年8月7日). 「より多くのデータがLambda変異体の潜在的致死率を示唆」Infection Control Today . 2021年9月3日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年9月3日閲覧。
- ^ Kimura I, Kosugi Y, Wu J, Yamasoba D, Butlertanaka EP, Tanaka YL, et al. (2021). 「SARS-CoV-2 Lambda変異体はより高い感染性と免疫抵抗性を示す」. Cell Reports . 38 (2): 110218. bioRxiv 10.1101/2021.07.28.454085 . doi :10.1016/j.celrep.2021.110218. hdl :2433/267436. PMC 8683271 . PMID 34968415. S2CID 236520241. 2021年9月16日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年9月3日閲覧。
- ^ abcdefg Greenwood M (2021年1月15日). 「SARS-CoV-2のどの変異が懸念を引き起こしているか?」News Medical Lifesciences . 2021年1月16日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年1月16日閲覧。
- ^ タンデル D、グプタ D、サー V、ハーシャン KH (2021 年 4 月 30 日)。 「SARS-CoV-2のN440K変異体は感染力がより高い」。bioRxiv 10.1101/2021.04.30.441434。
- ^ Bhattacharjee S (2021年5月3日). 「COVID-19 | AP株は少なくとも15倍の毒性」. The Hindu . 2021年5月10日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年5月4日閲覧。
- ^ “N440k Covid Variant: Mutant N440K 10 times more viral than parent Strain | Hyderabad News”. The Times of India . 2021年5月2日. 2021年8月30日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年9月3日閲覧。
- ^ "感染・伝播性の増加や抗原性の変化が見える新型コロナウイルス(SARS-CoV-2)の新規変異株について (第13報)" -2）感染力・伝播力の上昇と抗原性の変化が懸念される（第13報）】。 2021年9月3日のオリジナルからアーカイブ。2021 年9 月 3 日に取得。
- ^ 「スパイクの変異がデンマークのミンク農場での発生と関連している可能性あり」GISAID。2021年9月3日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年9月3日閲覧。
- ^ “グラーツ大学”. www.uni-graz.at . 2021年5月6日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年2月22日閲覧。
- ^ 「コロナウイルスSARS-CoV-2（旧称武漢コロナウイルス、2019-nCoV）-構造バイオインフォマティクスレベルで何がわかるか」Innophore 2020年1月23日2021年2月22日閲覧。
- ^ Singh A、Steinkellner G、Köchl K 、 Gruber K、Gruber CC（2021年2月）。「セリン477は、SARS-CoV-2スパイクタンパク質とヒト受容体ACE2の相互作用において重要な役割を果たす」。Scientific Reports。11 （1）： 4320。Bibcode ：2021NatSR..11.4320S。doi ： 10.1038 / s41598-021-83761-5。PMC 7900180。PMID 33619331。
- ^ “BioNTech: 私たちはがん治療の個別化を目指しています” BioNTech . 2021年6月18日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年2月22日閲覧。
- ^ Schroers B、Gudimella R、Bukur T、Roesler T、Loewer M、Sahin U（2021年2月4日）。「SARS-CoV-2スパイク糖タンパク質変異体の大規模分析により、ウイルス分離株の継続的なスクリーニングの必要性が実証される」bioRxiv 10.1101/2021.02.04.429765。
- ^ 「インドで『二重変異』変異体が話題に。それは何を意味するのか？」NPR。2021年4月27日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年4月27日閲覧。
…科学的には、「二重変異体」という用語は意味をなさないとアンダーセン氏は言う。「SARS-CoV-2は常に変異しています。そのため、至る所に二重変異体が多数存在します。インドの変異体は、実際にはそう呼ばれるべきではありません。」
- ^ abc Mandavilli A, Mueller B (2021年3月2日). 「なぜウイルスの変異体は奇妙な名前を持つのか」.ニューヨーク・タイムズ. ISSN 0362-4331. 2021年6月20日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年3月2日閲覧。
- ^ “escape mutation”. HIV i-Base . 2012年10月11日. 2021年5月9日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年2月19日閲覧。
- ^ Wise J (2021年2月). 「Covid-19: E484K変異とそれがもたらすリスク」. BMJ . 372 : n359. doi : 10.1136/bmj.n359 . PMID 33547053. S2CID 231821685.
- ^ abc 「速報：ブラジルからの旅行者でSARS-CoV-2の新たな変異株が確認」（PDF） （プレスリリース）。日本：国立感染症研究所（NIID）。2021年1月12日。 2021年1月15日時点のオリジナルよりアーカイブ（PDF） 。 2021年1月14日閲覧。
- ^ 新型SARS-CoV-2変異株の調査202012/01、技術ブリーフィング5 （PDF）（ブリーフィング）。イングランド公衆衛生局。2021年2月2日。GW-1905。2021年6月29日時点のオリジナルよりアーカイブ（PDF）。2021年6月14日閲覧。
- ^ Greaney AJ、Loes AN、Crawford KH、Starr TN、Malone KD、Chu HY、et al. (2021年3月)。「ポリクローナルヒト血漿抗体による認識に影響を与えるSARS-CoV-2受容体結合ドメインの変異の包括的マッピング」。Cell Host & Microbe。29 ( 3): 463–476.e6。doi : 10.1016 / j.chom.2021.02.003。PMC 7869748。PMID 33592168。
- ^ Kupferschmidt K (2021年1月). 「新たな突然変異により「免疫逃避」の可能性が高まる」. Science . 371 (6527): 329–330. Bibcode :2021Sci...371..329K. doi : 10.1126/science.371.6527.329 . PMID 33479129.
- ^ Rettner R (2021年2月2日). 「英国のコロナウイルス変異株がワクチンを回避する変異を発症 – 少数の例では、英国のコロナウイルス変異株がE484Kと呼ばれる変異を発症し、ワクチンの有効性に影響を与える可能性がある」。Live Science。2021年2月2日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年2月2日閲覧。
- ^ Achenbach J、Booth W（2021年2月2日）。「英国の変異株と米国の一部のサンプルで懸念されるコロナウイルス変異が確認」ワシントンポスト。2021年2月2日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年2月2日閲覧。
- ^ "東京オリンピックで『最凶』の「ラムダ株」が上陸ワクチン効果は5分の1?" 【東京五輪で「ラムダ株」上陸、ワクチン効果は5分の1？gooニュース。 2021年9月3日のオリジナルからアーカイブ。2021 年9 月 3 日に取得。
- ^ 「ラムダ変異株：感染力はより強く、ワクチンを逃れられるか？ウイルス学者が解説」ザ・カンバセーション。2021年7月21日。2021年9月3日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年9月3日閲覧。
- ^ ab COG-UK、特に注目すべきSARS-CoV-2スパイク変異に関する最新情報：レポート1 （PDF） （レポート）。COVID-19 Genomics UK Consortium（COG-UK）。2020年12月20日。p. 7。 2020年12月25日時点のオリジナル（PDF）からアーカイブ。2020年12月31日閲覧。
- ^ “研究者らがオハイオ州コロンバスでCOVID-19ウイルスの新たな変異体を発見”. wexnermedical.osu.edu . 2021年1月13日. 2021年1月15日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年1月16日閲覧。
- ^ Tu H、Avenarius MR、Kubatko L、Hunt M、Pan X、Ru P、et al. (2021年1月26日)。「オハイオ州コロンバスの臨床サンプルにおけるN501Yを含むSARS-CoV-2スパイク変異体の明確な出現パターン」bioRxiv 10.1101/2021.01.12.426407。
- ^ “新たな変異ある「デルタ株」検出 感染力への影響知らず” NHKニュース。 2021年8月31日。2021年9月1日のオリジナルからアーカイブ。2021 年9 月 2 日に取得。
- ^ “「N501S変異を有する新たなデルタ株(B.1.617.2系統)の市中感染事例(国内第1例目)を確認」 〜医科歯科大学新型コロナウイルス全ゲノム解析プロジェクト 第8報〜” 【「N501S変異を有する新型デルタ株（B.1.617.2株）の市中感染例（国内初例）を確認」－医科歯科大学新型コロナウイルス全ゲノム解析プロジェクト第8次報告書～』（PDF）。2021 年 8 月 30 日のオリジナルからアーカイブ(PDF) 。2021 年9 月 2 日に取得。
- ^ abcd Maison DP、Ching LL、Shikuma CM、Nerurkar VR（2021年1月）。「ハワイのSARS-CoV-2の969bpのS遺伝子配列の遺伝的特徴と系統発生により、世界中で出現しているP681H変異が明らかになる」。bioRxiv 10.1101 /2021.01.06.425497。
CC BY 4.0 ライセンスで利用可能。2017年10月16日にWayback Machineにアーカイブ。
- ^ Schraer R (2020年7月18日). 「コロナウイルス：変異により感染力が増すのか？」BBCニュース。2020年12月30日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年1月3日閲覧。
- ^ 「新型コロナの感染力がより強い株が現在、世界のウイルス症例の大部分を占めている：研究」medicalxpress.com。2020年11月17日時点のオリジナルよりアーカイブ。2020年8月16日閲覧。
- ^ Korber B, Fischer WM, Gnanakaran S, Yoon H, Theiler J, Abfalterer W, et al. (2020年8月). 「SARS-CoV-2スパイクの変化を追跡する：D614GがCOVID-19ウイルスの感染力を高めるという証拠」. Cell . 182 (4): 812–827.e19. doi : 10.1016/j.cell.2020.06.043 . PMC 7332439. PMID 32697968 .
- ^ Hou YJ、Chiba S、Halfmann P、Ehre C、Kuroda M、Dinnon KH、et al. (2020年12月)。「SARS-CoV-2 D614G変異体は、体外での効率的な複製と体内での伝達を示す」。サイエンス。370（6523）：1464–1468。Bibcode ：2020Sci...370.1464H。doi ：10.1126/science.abe8499。PMC 7775736。PMID 33184236。現在、世界 で最も蔓延し
ているSARS-CoV-2株のスパイク糖タンパク質における新たなAsp614→Gly（D614G）置換
- ^ Volz EM、Hill V、McCrone JT、Price A、Jorgensen D、O'Toole A、et al. (2020年8月4日)。「SARS-CoV-2スパイク変異D614Gの伝染性と病原性に対する影響の評価」。Cell . 184 (1): 64–75.e11. doi :10.1016/j.cell.2020.11.020 . hdl : 10044/1/84079 . PMC 7674007. PMID 33275900 .
- ^ Butowt R、Bilinska K、Von Bartheld CS（2020年10月）。「COVID-19における化学感覚機能障害：遺伝学的および疫学的データの統合により、D614Gスパイクタンパク質変異体が寄与因子であることが示唆される」ACS Chemical Neuroscience。11 （20）：3180–3184。doi ：10.1021/ acschemneuro.0c00596。PMC 7581292。PMID 32997488。
- ^ ab Hodcroft EB、Domman DB、Snyder DJ、Oguntuyo KY、Van Diest M、Densmore KH、et al. (2021年2月21日)。「2020年後半にアミノ酸位置677に影響を及ぼすSARS-CoV-2スパイクタンパク質変異体の複数系統が出現」。medRxiv 10.1101 /2021.02.12.21251658。
- ^ “研究により、米国で新たに確認された7つのCOVID-19変異株が循環していることが判明”. ABC11 Raleigh-Durham . 2021年2月15日. 2021年9月3日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年9月3日閲覧。
- ^ 「研究により、SARS-CoV-2の配列中にP681H変異が世界的に広まっていることが示された」。News-Medical.net。2021年1月10日。2021年2月14日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年2月11日閲覧。
- ^ 「マレーシア、他の3カ国で見つかったものと類似した新型コロナ株を特定」ザ・ストレーツ・タイムズ。2020年12月23日。2020年12月23日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年1月10日閲覧。
ヌール・ヒシャム・アブドラ保健相は、「A701B」変異株と呼ばれるこの株が通常よりも感染力が強いかどうかはまだ不明だと述べた。
- ^ 「ドゥテルテ大統領、マレーシア・サバ州近郊で新型コロナの新たな変異種が検出されたためスールー州が支援を求めていると発言」GMAニュース。2020年12月27日。2021年1月3日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年1月10日閲覧。
- ^ abcd 「マレーシアにおけるCovid-19のスパイクタンパク質変異の現状と情報」。マレーシア健康政策 – Covid-19 Malaysia。2020年12月25日。2021年7月2日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年1月15日閲覧。
- ^ abc 「COVID-19 A701V変異が第3波クラスターに広がる」focusmalaysia.my 2020年12月25日。2021年5月14日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年5月13日閲覧。
- ^ “Variants of Concerns (VOC), B.1.524, B.1.525, South African B.1.351, STRAIN D614G, A701V, B1.1.7”. covid-19.moh.gov.my . 2021年4月14日. 2021年7月2日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年5月15日閲覧。
- ^ Yurkovetskiy L, Wang X, Pascal KE, Tomkins-Tinch C, Nyalile TP, Wang Y, et al. (2020年10月). 「D614G SARS-CoV-2スパイクタンパク質変異体の構造と機能の解析」. Cell . 183 (3): 739–751.e8. doi :10.1016/j.cell.2020.09.032. PMC 7492024. PMID 32991842 .
- ^ Thomson EC, Rosen LE, Shepherd JG, Spreafico R, da Silva Filipe A, Wojcechowskyj JA, et al. (2021年3月). 「循環型SARS-CoV-2スパイクN439K変異体は抗体介在免疫を回避しながら適応度を維持」. Cell . 184 (5): 1171–1187.e20. doi :10.1016/j.cell.2021.01.037. PMC 7843029. PMID 33621484 .
- ^ Smout A (2021年1月26日). “英国、コロナウイルス変異株の追跡で他国を支援”.ロイター. 2021年1月26日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年1月27日閲覧。
- ^ Donnelly L (2021年1月26日). 「英国、世界中のCovid変異の配列を解析し、危険な新しい変異体を見つける」The Telegraph。2021年1月27日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年1月28日閲覧。
- ^ Galani A、Aalizadeh R、Kostakis M、Markou A、Alygizakis N、Lytras T、他 (2022年1月)。「SARS-CoV-2 廃水監視データにより入院やICU入院を予測できる」。Science of the Total Environment。804 : 150151。Bibcode :2022ScTEn.80450151G。doi : 10.1016 / j.scitotenv.2021.150151。PMC 8421077。PMID 34623953。
- ^ Baaijens JA、Zulli A、Ott IM、Petrone ME、Alpert T、Fauver JR、他 (2021年9月2日)。「RNA-Seq定量化を用いた廃水中のSARS-CoV-2の変異体存在量の推定」medRxiv 10.1101/2021.08.31.21262938。
- ^ Heijnen L、Elsinga G、Graaf Md、Molenkamp R、Koopmans MP、Medema G (2021 年 3 月 26 日)。 「廃水中の懸念される SARS-CoV-2 変異種を検出するためのドロップレット デジタル RT-PCR」。medRxiv 10.1101/2021.03.25.21254324v1。
- ^ SARS-CoV-2変異体の検出および識別方法。欧州疾病予防管理センター、世界保健機関（技術レポート）。ストックホルム：欧州疾病予防管理センター。2021年3月3日。既知のVOCの診断スクリーニングアッセイ。
- ^ イングランドで懸念されるSARS-CoV-2変異体と調査中の変異体、技術ブリーフィング15 （PDF） （ブリーフィング）。イングランド公衆衛生局。2021年6月11日。GOV-8576。 2021年7月4日時点のオリジナルよりアーカイブ（PDF）。2021年6月15日閲覧。
- ^ EU/EEAにおける懸念されるデルタ変異株の継続的伝播の状況下での懸念されるSARS-CoV-2オミクロン変異株のさらなる出現と潜在的影響の評価、第18回更新（技術報告書）。ストックホルム：欧州疾病予防管理センター。2021年12月15日。付録1および2。
- ^ Green ST, Cladi L (2021年1月26日). 「Covid-19と進化的圧力 ― 地平線の向こうに潜む遺伝的危険を予測できるか？」BMJ : n230. 2021年6月8日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年6月8日閲覧。
- ^ Jacobs A (2021年11月2日). 「アイオワ州の鹿でコロナウイルス感染が拡大、新たな研究で判明」ニューヨーク・タイムズ。2021年12月28日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2021年12月12日閲覧。
研究者や外部の専門家は、この研究結果をパンデミックの過程における憂慮すべき展開と位置付けた。北米で最も遍在する狩猟種の間で感染が広まっていると、病原体の根絶がさらに困難になる可能性がある。特に、狩猟種が変異体のリザーバーとなり、最終的に人間に感染した場合はなおさらだ。 [...] 彼らは、鹿猟師や鹿を扱うその他の関係者に対し、感染を防ぐための予防策を講じるよう警告している。 [...] ウイルスが鹿などの野生動物に蔓延した場合、時間の経過とともに毒性が強くなり、現在のワクチンを回避できる新しい株で人間に感染する可能性がある。
- ^ Lassaunière R, Fonager J, Rasmussen M, Frische A, Strandh C, Rasmussen T, et al. (2020年11月10日). デンマークミンクで発生したSARS-CoV-2スパイク変異、ヒトへの拡散および中和データ（プレプリント）. Statens Serum Institut . 2020年11月10日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2020年11月11日閲覧。
- ^ 「ミンクに関連する新しいSARS-CoV-2変異体の検出」（PDF）。ECDC.eu 。欧州疾病予防管理センター。2020年11月12日。 2021年1月8日時点のオリジナルよりアーカイブ（PDF） 。 2020年11月12日閲覧。
- ^ 「SARS-CoV-2 ミンク関連変異株 - デンマーク」。WHO Disease Outbreak News 2020年11月6日。2020年11月12日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年3月19日閲覧。
- ^ Kevany S、Carstensen T（2020年11月19日）。「デンマークのCovidミンク変異種は「絶滅した可能性が高い」が、物議を醸す駆除は続く」。ガーディアン。2021年4月24日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年4月19日閲覧。
- ^ Larsen HD、Fonager J、Lomholt FK、Dalby T、Benedetti G、Kristensen B、et al. (2021年2月)。「デンマーク、2020年6月から11月にかけてのミンクおよびミンク農家におけるSARS-CoV-2の発生とコミュニティでの拡散に関する予備報告」。Euro Surveillance . 26 (5). doi :10.2807/1560-7917.ES.2021.26.5.210009. PMC 7863232 . PMID 33541485。
- ^ Burioni R、Topol EJ（2021 年6月）。「SARS-CoV-2 はピークフィットネスに達したか？」ネイチャーメディシン。27 （8）：1323–24。doi ：10.1038 / s41591-021-01421-7。PMID 34155413。
- ^ ab コミッショナー事務局（2021年2月23日）。「コロナウイルス（COVID-19）の最新情報：FDAがウイルス変異体に対処する医療製品開発者を導くためのポリシーを発行」米国食品医薬品局（FDA） 。 2021年3月7日閲覧。
- ^ Rella SA、Kulikova YA、 Dermitzakis ET、Kondrashov FA（2021年7月30日）。「SARS-CoV-2の感染率とワクチン接種はワクチン耐性株の運命に影響を与える」。Scientific Reports。11 （ 1 ）：15729。doi ：10.1038/ s41598-021-95025-3。ISSN 2045-2322。PMC 8324827。PMID 34330988。
- ^ Wang R、Chen J、Wei GW（2021年12月）。「ヨーロッパとアメリカにおけるワクチン耐性変異を明らかにするSARS-CoV-2進化のメカニズム」（PDF）。The Journal of Physical Chemistry Letters。12（49）：11850–11857。doi ： 10.1021/acs.jpclett.1c03380。PMC 8672435。PMID 34873910。 2021年12月18日時点のオリジナルより アーカイブ（PDF） 。 2022年1月27日閲覧。
- ^ 「研究結果によると、オミクロンの拡散は伝染力の増加ではなく免疫回避に起因する可能性がある」。News-Medical.net 2022年1月5日。2022年1月21日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2022年1月17日閲覧。
- ^ Cao Y, Wang J, Jian F, Xiao T, Song W, Yisimayi A, et al. (2022年2月). 「オミクロンは既存のSARS-CoV-2中和抗体の大部分を回避」. Nature . 602 (7898): 657–663. doi :10.1038/d41586-021-03796-6. PMC 8866119. PMID 35016194. S2CID 245455422 .
- ^ Liu L、Iketani S、Guo Y、Chan JF、Wang M、Liu L、et al. (2022年2月)。「SARS-CoV-2のオミクロン変異体によって発現した顕著な抗体回避」。Nature . 602 (7898): 676–681. doi : 10.1038/d41586-021-03826-3 . PMID 35016198. S2CID 245462866.
- ^ Mohsin M、Mahmud S（2022年5月）。「懸念されるオミクロンSARS-CoV-2変異体：その伝染性、免疫回避、再感染、および重症度に関するレビュー」。医学 。101 （19）：e29165。doi ： 10.1097 / MD.0000000000029165。PMC 9276130。PMID 35583528。S2CID 248858919 。
- ^ “COVID-19に感染してからどのくらいで再び感染する可能性がありますか？” ABCニュース。2022年5月2日。2022年7月9日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2022年6月24日閲覧。
- ^ 「オミクロン変異株：知っておくべきこと」。米国疾病予防管理センター。2021年12月20日。2022年1月27日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2022年1月27日閲覧。
- ^ Shin DH、Smith DM、Choi JY (2022)。「懸念されるSARS-CoV - 2オミクロン変異株：オミクロンについて知りたいことすべて、しかし聞くのが怖かったこと」。延世 医学ジャーナル。63（11）：977–983。doi ：10.3349/ymj.2022.0383。PMC 9629902。PMID 36303305。
- ^ 「COVID-19ワクチンブースター」。米国食品医薬品局（FDA）。2022年9月27日。2022年10月8日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2022年10月8日閲覧。
- ^ “Moderna COVID-19 Vaccines”.米国食品医薬品局(FDA) . 2022年10月7日. 2022年10月7日時点のオリジナルよりアーカイブ。2022年10月8日閲覧。
- ^ 「ファイザー-ビオンテック COVID-19 ワクチン」。米国食品医薬品局(FDA)。2022年10月3日。2022年10月8日時点のオリジナルよりアーカイブ。2022年10月8日閲覧。
- ^ 「2023年秋から米国での使用に向けて更新されたCOVID-19ワクチン」米国食品医薬品局（FDA） 2023年6月15日。2023年6月17日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2023年6月16日閲覧。 この記事には、パブリック ドメインであるこのソースからのテキストが組み込まれています。
- ^ 米国における2023～2024年COVID-19ワクチン処方に関する推奨事項（PDF）（レポート）。米国食品医薬品局（FDA）。2023年6月16日。2023年6月16日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2023年6月16日閲覧。
- ^ 「2024年秋から米国での使用に向けたCOVID-19ワクチンの最新版」米国食品医薬品局（FDA） 2024年6月5日。2024年6月18日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2024年6月19日閲覧。 この記事には、パブリック ドメインであるこのソースからのテキストが組み込まれています。
- ^ 「2024年10月14～17日に開催されたヒト用医薬品委員会（CHMP）の会議ハイライト」。欧州医薬品庁（EMA） 2024年10月18日。 2024年10月21日閲覧。テキストは、欧州医薬品庁が著作権を所有するこのソースからコピーされました。ソースを明記すれば複製が許可されます。
さらに読む
- Krause PR、Fleming TR、Longini IM、Peto R、Briand S、Heymann DL、et al. (2021年7月)。「SARS-CoV-2変異体とワクチン」。ニュー イングランド医学ジャーナル。385 （2）：179–186。doi ：10.1056 / NEJMsr2105280。PMC 8262623。PMID 34161052。
- Corum J、Zimmer C (2021年1月18日). 「B.1.1.7コロナウイルス変異株の内側」ニューヨークタイムズ。2021年1月20日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年2月1日閲覧。
外部リンク
Scholia には SARS-CoV-2 の変異体 (Q104450895) のプロファイルがあります。
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- 共変種
- Cov-系統
- GISAID – hCov19 変異体