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| バットコロナウイルスRaTG13 | |
|---|---|
ウイルスの分類 
| |
| (ランク外): | ウイルス |
| レルム: | リボビリア |
| 王国： | オルタナウイルス科 |
| 門: | ピスビリコタ |
| クラス： | ピソニビリセテス |
| 注文： | ニドウイルス目 |
| 家族： | コロナウイルス科 |
| 属: | ベータコロナウイルス |
| 亜属： | サルベコウイルス |
| 種： | |
| 歪み： | バットコロナウイルスRaTG13
|
| 同義語[1] | |
| |
コウモリコロナウイルスRaTG13は、キクガシラコウモリ（Rhinolophus affinis）の糞から特定されたSARSに似たベータコロナウイルスである。[2] [3] 2013年に中国雲南省墨江県銅関町近くの鉱山洞窟のコウモリの糞から発見された。[4] 2020年2月、[5] COVID-19を引き起こすウイルスであるSARS-CoV-2に最も近い既知の親戚であると特定され、96.1％のヌクレオチド同一性を共有している。[6] [7]しかし、2022年に科学者らは、ラオスのフアンで530km南に発見されたコウモリで、より近い3つの一致を発見し、BANAL-52（96.8％の同一性）、BANAL-103、およびBANAL-236と命名した。[8] [9] [10]
歴史
2012年の春、モ江ハニ族自治県銅関町近くの廃銅鉱山でコウモリの糞を清掃していた3人の鉱夫が致命的な肺炎を発症した。[11]鉱夫の症例が新しい病気である可能性があるという懸念から、[12]鉱夫から採取された血清サンプルは武漢ウイルス研究所に送られ、石正麗とそのグループによってエボラウイルス、ニパウイルス、コウモリSARSr-CoV Rp3の検査が行われた。サンプルは陰性であった。[3] [13] [11]
感染の原因を解明するため、採掘洞窟内および周辺でさまざまな動物（コウモリ、ネズミ、ジャコウネズミなど）のサンプルも採取された。2012年から2015年にかけて、石正麗と彼女のグループは洞窟内のコウモリの糞のサンプルから293種類のコロナウイルス（アルファコロナウイルス284種類、ベータコロナウイルス9種類）を分離した。2013年にRhinolophus affinis （キクガシラコウモリ）から採取されたサンプルの1つには、後に「RaTG13」と特定された新しいリボ核酸配列が含まれていた。[3] [13]
2020年、Shi氏と彼女の研究グループは、鉱山労働者の血清サンプルをSARS-CoV-2に対して再検査した。サンプルは陰性であった。[3]
2020年、サンプルで特定された株は、元のコウモリ種（Rhinolophus affinis由来のRa ）、地理的位置（潼関のTG）、および収集年（2013年の13）を反映して、元のRa4991（Rhinolophus affinisから収集された4991番目のサンプル）から「RaTG13」に改名されました。[14]この名前の変更は、 COVID-19パンデミックの研究室漏洩説の支持者によってほのめかしであると考えられています。[14]
ウイルス学
RaTG13の配列はメタゲノムサンプリング（環境ウイルス学の一般的な手法）から再構築されたため、[15]、潜在的にコンピューターによるキメラである可能性があります。[16] RaTG13は自然界に存在すること、実験室で培養または分離されたこと、[12]または生存可能なヒト病原体であることは確認されていません。[16]生きたウイルス「RaTG13」は、WIVまたは他の場所の実験室サンプルで検出されたことはありません。[16]
配列に基づくと、RaTG13は外膜を持つプラス鎖RNAウイルスである。そのゲノムは約29,800ヌクレオチドである。ゲノムはレプリカーゼ（ORF1a/1b）と4つの構造タンパク質（スパイクタンパク質（S）、膜タンパク質（M）、エンベロープタンパク質（E）、ヌクレオカプシドタンパク質（N）を含む）と5つのウイルスアクセサリタンパク質（ORF3a（NS3）、ORF6（NS6）、ORF7a（NS7a）、ORF7b（NS7b）、ORF8 （NS8）を含む）をコードしている。[3] [17]
RaTG13はSARS-CoV-2ゲノムと非常によく似ており（ヌクレオチドの類似性は96.1%）、動物の糞便で特定されたことは、SARS-CoV-2が自然起源であることを裏付ける証拠となっている。[7] RaTG13とSARS-CoV-2の主な相違点は、スパイクタンパク質（S）の受容体結合ドメイン（RBD）にあり、これは宿主細胞の表面にある受容体タンパク質に結合して感染を引き起こす部分である。このドメインの相違は、SARS-CoV-2とは異なり、RaTG13ウイルスは細胞への侵入部位としてアンジオテンシン変換酵素2 （ACE2）を使用しない可能性があることを示している。 [18]さらに、RaTG13ウイルスのSタンパク質には、フーリン切断モチーフRRAR↓Sが欠けている。[18]
RATG13とhACE2の結合親和性はSARS-CoV-2 RBDとhACE2の結合親和性よりも低い。[19]
系統学
系統樹
SARS-CoV-2および関連コロナウイルスの全ゲノム配列に基づく系統樹は以下のとおりである: [20] [21]
参照
参考文献
- ^ 「分類ブラウザ（コウモリコロナウイルスRaTG13）」www.ncbi.nlm.nih.gov . 2021年1月2日閲覧。
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