以下に、抗生物質耐性菌の一覧を示します。これらの細菌は、抗生物質耐性(または抗菌剤耐性)を示しています。
クロストリジオイデス・ディフィシルは、世界中で下痢性疾患を引き起こす院内感染病原体です。 [ 2 ] [ 3 ] C. difficileによる下痢は生命を脅かす可能性があります。感染は、最近医療処置や抗生物質治療を受けた人に最も多く見られます。C . difficile感染は入院中によく発生します。 [ 4 ]
2015年のCDCの報告によると、米国では年間約50万件のC. difficile感染症が発生している。これらの感染症に関連して、推定1万5000人が死亡している。CDCは、C. difficile感染症による費用が5年間で38億ドルに達する可能性があると推定している。[ 5 ]
C. difficile大腸炎は、フルオロキノロン、セファロスポリン、カルバペネム、クリンダマイシンと最も強く関連している。[ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]
一部の研究では、家畜の飼育における抗生物質の過剰使用が、C. difficileなどの細菌感染症の発生の一因となっていることが示唆されている。[16]
抗生物質、特に広範囲の活性スペクトルを持つもの(クリンダマイシンなど)は、正常な腸内細菌叢を破壊します。これにより、このような条件下で増殖するC. difficileの過剰増殖につながる可能性があります。偽膜性大腸炎が起こり、大腸の全身性炎症と、炎症細胞、フィブリン、壊死細胞の粘稠な集合体である「偽膜」の形成を引き起こします。[4]クリンダマイシン耐性C. difficileは、1989 年から 1992 年の間にニューヨーク、アリゾナ、フロリダ、マサチューセッツの病院で発生した大規模な下痢性疾患のアウトブレイクの原因物質として報告されました。[ 9 ]シプロフロキサシンやレボフロキサシンなどのフルオロキノロン系抗生物質に耐性のあるC. difficile株の地理的に分散したアウトブレイクも、2005 年に北米で報告されました。[ 10 ]
多剤耐性エンテロコッカス・フェカリスおよびエンテロコッカス・フェシウムは院内感染に関連している。[ 11 ]これらの菌株には、ペニシリン耐性エンテロコッカス、バンコマイシン耐性エンテロコッカス、およびリネゾリド耐性エンテロコッカスが含まれる。[ 12 ]
抗生物質に耐性のある結核(TB)は、 MDR TB(多剤耐性結核)と呼ばれます。世界中で、MDR TBは年間15万人の死亡を引き起こしています。 [ 13 ] HIV/AIDSの流行の拡大がこれに寄与しています。[ 14 ]
結核菌は、ヒト集団内での持続性を確保するために進化してきた絶対寄生性病原体である。[ 15 ]これは、結核菌が人から人へ正常に伝染するためには肺疾患を引き起こす必要があることから明らかである。結核は、TBとしてよく知られており、世界中の病原体の中で最も死亡率が高いものの1つである。特定の抗生物質に対する耐性が高まっているため、死亡率は大幅には低下していない。[ 13 ]ワクチンの開発に長年の研究が費やされてきたが、まだ存在しない。結核は非常に伝染性が高く、その非常に高い病原性に大きく寄与している。結核は最も蔓延している病気の1つと考えられており、1943年にセルマン・ワクスマンがストレプトマイシンを発見するまで治療法はなかった。 [ 16 ]しかし、細菌はすぐに耐性を獲得した。それ以来、イソニアジドやリファンピシンなどの薬剤が使用されている。結核菌は、ゲノムの自然突然変異によって薬剤耐性を獲得します。これらのタイプの突然変異は、生殖成功に寄与する遺伝子型および表現型の変化につながり、耐性菌の進化につながります。1つの薬剤に対する耐性は一般的であり、そのため通常は複数の薬剤で治療が行われます。超多剤耐性結核(XDR TB)は、2番目の薬剤にも耐性を示す結核です。[ 14 ] [ 17 ]
結核菌のイソニアジド、リファンピシン、その他の一般的な治療薬に対する耐性は、ますます重要な臨床上の課題となっている。これらの細菌がプラスミドを持っているかどうかの証拠は不足している。 [ 18 ]結核菌は、プラスミドを共有するために他の細菌と相互作用する機会がない。[ 18 ] [ 19 ]
マイコプラズマ・ジェニタリウムは、ヒトの尿路および生殖器の繊毛上皮細胞に生息する小型の病原性細菌です。この細菌が性感染症の原因菌として認識されるべきかどうかは、依然として議論の的となっています。マイコプラズマ・ジェニタリウム感染は、臨床症状、あるいは複数の症状の組み合わせを引き起こすことがありますが、無症状の場合もあります。男性と女性の両方において尿道炎を引き起こし、尿路からの粘液膿性分泌物や排尿時の灼熱感を伴います
マイコプラズマ・ジェニタリウム感染症の治療は、急速に多剤耐性が発達しているためますます困難になっており、マイコプラズマ・ジェニタリウム感染症が日常的に検出されないという事実によって診断と治療がさらに妨げられています。[ 20 ]アジスロマイシンは最も一般的な第一選択治療薬ですが、一般的に使用されている1グラムの単回投与アジスロマイシン治療は、細菌がアジスロマイシンに対する耐性を獲得する原因となる可能性があります。[ 21 ]代替の5日間のアジスロマイシン治療では、抗菌薬耐性の発達は見られませんでした。[ 22 ]マイコプラズマ・ジェニタリウムに対するアジスロマイシンの有効性は大幅に低下しており、これは23S rRNA遺伝子のSNPによって起こると考えられています。同じSNPが、一部の国で処方されているジョサマイシンに対する耐性の原因であると考えられています。[ 23 ]アジスロマイシンで感染を根絶できない場合、モキシフロキサシンを第二選択薬として使用できます。しかし、2007 年以降、モキシフロキサシンに対する耐性が観察されており、これはparC SNP が原因と考えられています。[ 23 ] [ 24 ]ドキシサイクリンを含むテトラサイクリン系抗生物質は、 M. genitalium感染症に対する臨床的根絶率が低いです。[ 25 ]ドキシサイクリン、アジスロマイシン、モキシフロキサシンがすべて失敗したが、プリスチナマイシンで感染を根絶できた症例がいくつか報告されています。 [ 23 ]
黄色ブドウ球菌は、主要な耐性病原体の 1 つです。2019 年に AMR に起因する 10 万人以上の死亡を引き起こし、その年の世界の死亡者 74 万 8 万人に MRSA が関与していました。 [ 26 ]人口の約 3 分の 1 の粘膜や皮膚に存在する大量生産が始まってわずか 4 年後の 1947 年にペニシリン耐性が発見された初期の細菌の 1 つです。当時はメチシリンが第一選択の抗生物質でしたが、重大な腎毒性のため、その後オキサシリンに置き換えられました。メチシリン耐性黄色ブドウ球菌(MRSA) は 1961 年に英国で初めて検出され、現在では病院で「かなり一般的」です。 MRSAは、1999年に英国で発生した敗血症による死亡例の37%を占め、1991年の4%から増加した。米国における黄色ブドウ球菌感染症の半数は、ペニシリン、メチシリン、テトラサイクリン、エリスロマイシンに耐性を示している。
バンコマイシン非感受性の黄色ブドウ球菌分離株は、アジアと米国で分離されている。[ 27 ] 1992年に実施された研究では、バンコマイシン耐性は、VanAおよびVanB遺伝子の伝達を介して、Enterococcus faecalis/faeciumから黄色ブドウ球菌に伝達される可能性があることが示された。[ 28 ]
化膿レンサ球菌(A群レンサ球菌:GAS)感染症は、通常、さまざまな抗生物質で治療できます。マクロライド系抗生物質に耐性のあるS. pyogenes株が出現していますが、すべての株はペニシリンに対して一様に感受性があります。 [ 29 ]
肺炎連鎖球菌のペニシリンおよびその他のβ-ラクタム系抗生物質に対する耐性は世界的に増加している。2019年には、耐性に関連する疾患の主要病原体6種のうちの1つとして特定され、同年には世界中で59万6000人がこの病原体による薬剤耐性感染症で死亡した。 [ 26 ]耐性の主なメカニズムは、ペニシリン結合タンパク質をコードする遺伝子に突然変異が導入されることである。選択圧が重要な役割を果たしていると考えられており、β-ラクタム系抗生物質の使用は感染および定着のリスク要因として指摘されている。肺炎連鎖球菌は、肺炎、菌血症、中耳炎、髄膜炎、副鼻腔炎、腹膜炎、関節炎の原因となる。[ 29 ]
カンピロバクターは下痢(しばしば血便を伴う)、発熱、腹部痙攣を引き起こします。一時的な麻痺などの重篤な合併症も発生する可能性があります。カンピロバクターはこれらの抗生物質に対する耐性を示していますが、医師は重症患者の治療にシプロフロキサシンとアジスロマイシンに頼っています。 [ 4 ]
淋菌(Neisseria gonorrhoeae)は、性感染症である淋病を引き起こす性病原体であり、尿道、子宮頸部、咽頭、または直腸の分泌物や炎症を引き起こす可能性があります。 [ 4 ]骨盤痛、排尿時の痛み、陰茎および膣からの分泌物、全身症状を引き起こす可能性があります。また、重篤な生殖合併症を引き起こす可能性もあります。 [ 4 ]
2013年現在、カルバペネム耐性腸内細菌科(CRE)、別名カルバペネマーゼ産生腸内細菌科(CPE)による治療困難または治療不可能な感染症が医療施設の患者の間で増加している。CREは、ほぼすべての利用可能な抗生物質に耐性がある。血流CRE感染症にかかった入院患者のほぼ半数が感染症で死亡する。[ 4 ]
クレブシエラ・ニューモニエ・カルバペネマーゼ(KPC)産生菌は、世界中のさまざまな臨床現場で発生率が急速に増加している、重篤な罹患率と死亡率に関連する感染症を引き起こす、新興の高度薬剤耐性グラム陰性桿菌群です。クレブシエラ・ニューモニエは、2019年に耐性に関連する疾患の主要病原体6種のうちの1つとして特定され、その年には世界中でこの病原体による薬剤耐性感染症で64万2000人が死亡しました。[ 26 ]クレブシエラ・ニューモニエは、抗生物質耐性のメカニズムを多数備えており、その多くは可動性の高い遺伝因子上にあります。[ 30 ]カルバペネム系抗生物質(これまで耐性感染症の最終手段として用いられることが多かった)は、一般的にKPC産生菌に対しては効果がありません。[ 31 ]
大腸菌とサルモネラ菌による感染は、汚染された食品や汚染された水の摂取によって引き起こされる可能性があります。これらの細菌はどちらも院内感染(病院関連感染)の原因としてよく知られており、病院で発見されるこれらの菌株は、抗生物質の広範な使用への適応により、抗生物質耐性を持つことがよくあります。[ 32 ]これらの細菌が蔓延すると、深刻な健康状態が発生します。毎年、多くの人が感染後に入院し、その結果死亡する人もいます。1993年以降、大腸菌の一部の菌株は、複数の種類のフルオロキノロン系抗生物質に対して耐性を持つようになりました。大腸菌は、2019年に耐性に関連する死亡の上位6つの病原体の1つとして特定され、その年には、この病原体による薬剤耐性感染症で世界中で829,000人が死亡しました。[ 26 ]
抗生物質耐性の発達には突然変異だけでも大きな役割を果たしますが、2008年の研究では、抗生物質に曝露された後の高い生存率は突然変異だけでは説明できないことがわかりました。[ 33 ]この研究は、大腸菌の3種類の抗生物質(アンピシリン、テトラサイクリン、ナリジクス酸)に対する耐性の発達に焦点を当てました。研究者らは、大腸菌の抗生物質耐性の一部は、突然変異した遺伝子の直接的な遺伝ではなく、エピジェネティックな遺伝によって発達したことを発見しました。これは、抗生物質感受性への復帰も比較的よくあることを示すデータによってさらに裏付けられました。これはエピジェネティクスによってのみ説明できます。[ 33 ]エピジェネティクスは、遺伝暗号自体ではなく遺伝子発現が変化するタイプの遺伝です。この遺伝子発現の変化は、 DNAのメチル化やヒストン修飾など、多くの方法で起こり得ますが、重要な点は、ランダムな突然変異とエピジェネティックマーカーの両方の遺伝によって抗生物質耐性遺伝子の発現が起こる可能性があるということです。[ 33 ]ポリミキシンに対する耐性は2011年に初めて出現した。[ 34 ]この耐性が広がるより簡単な方法として、MCR-1として知られるプラスミドが2015年に発見された。[ 34 ]
アシネトバクターは、重症患者に肺炎や血流感染症を引き起こすグラム陰性細菌です。多剤耐性アシネトバクターは、抗生物質に対して非常に強い耐性を持つようになりました。 [ 4 ]アシネトバクター・バウマニは、2019年に耐性に関連する死亡原因の上位6つの病原体の1つとして特定され、その年には世界中でこの病原体による薬剤耐性感染症で42万3000人が死亡しました。 [ 26 ]
2004年11月5日、疾病管理予防センター(CDC)は、イラクの自由作戦中にイラク/クウェート地域で、また不朽の自由作戦中にアフガニスタンで負傷した軍人が治療を受けた軍医療施設の患者において、アシネトバクター・バウマニの血流感染症が増加していることを報告した。これらのほとんどが多剤耐性(MRAB)を示し、少数の分離株は検査したすべての薬剤に耐性を示した。[ 35 ] [ 36 ]
Pseudomonas aeruginosaは、非常に蔓延している日和見病原体です。2019 年に耐性に関連する死亡の 6 つの主要病原体の 1 つとして特定され、その年には世界中で 334,000 人の人がこの病原体による薬剤耐性感染症で死亡しました。 [ 26 ] P. aeruginosaの最も懸念される特徴の 1 つは、抗生物質感受性が低いことです。これは、染色体でコード化された抗生物質耐性遺伝子 (例: mexAB-oprM、 mexXY ) と多剤排出ポンプの協調作用、および細菌の細胞外膜の透過性の低さに起因します。 [ 37 ] P. aeruginosa は4-ヒドロキシ-2-アルキルキノリン (HAQ) を産生する能力があり、HAQ は酸化促進作用があり、過剰発現すると抗生物質に対する感受性がわずかに増加することがわかっています。この研究では、 P. aeruginosa のバイオフィルムを用いて実験を行い、relA および spoT 遺伝子の破壊により、栄養制限のある細胞で厳密応答 (SR) が不活性化され、細胞が抗生物質に対してより感受性が高くなることを発見した。 [ 38 ]
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