アシルCoAシンテターゼファミリーメンバー3(ACSF3)は、ACSF3遺伝子によってコードされるミトコンドリア酵素です。[ 5 ]マロン酸とメチルマロン酸の分解に必要であり、ミトコンドリア脂肪酸合成(mtFAS)とミトコンドリアリジンマロニル化の前駆体を提供します。[ 6 ] [ 7 ]この酵素はアシルCoAシンテターゼファミリーに属します。[ 8 ]
ACSF3遺伝子は16番染色体のq24.3遺伝子座に位置しています。 [ 9 ]この遺伝子は14個のエクソンから構成され、ACSF3タンパク質の2つのアイソフォームをコードする4つの選択的スプライシングmRNAを生成します。[ 9 ] [ 10 ]
3つの転写バリアントは、予測方法によって最初の58または83残基からなる予測N末端ミトコンドリア標的配列(MTS)を持つ、約64.1 kDaの576アミノ酸タンパク質をコードしている。 [ 9 ] [ 11 ][12] [ 13 ]実験的研究により、成熟タンパク質がミトコンドリアマトリックスに局在することが確認されている。[ 14 ] [ 7 ]
観察された翻訳後修飾:
単一の転写バリアントは、アイソフォーム1と比較して下流の開始コドンから翻訳を開始する、より短い311アミノ酸のタンパク質をコードしている。[ 10 ] [ 9 ]
ACSF3は、脂肪酸を活性化するアシルCoAシンテターゼとは異なり、ジカルボン酸であるマロン酸とメチルマロン酸を優先的に利用し、これらをチオエステルであるマロニルCoAとメチルマロニルCoAに変換する。[ 14 ] [ 16 ]リグノセリン酸(C24)も追加の基質として報告されているが、in vitro研究では相反する結果が得られている。[ 8 ] [ 12 ] [ 14 ]このような基質特異性にもかかわらず、他のアシルCoAシンテターゼと同様に、アシルアデニル酸中間体を介して2段階のATP依存性メカニズムに従う。[ 17 ]
したがって、ACSF3は以下の全体的な反応を触媒する。
ACSF3はマロン酸を最も効率的に変換し、メチルマロン酸をその約70%の速度で処理します。[ 14 ]他のアシルCoAシンテターゼと同様に、ACSF3の活性は生成物によるフィードバック阻害を受けます。[ 7 ]
上記で説明した全体的な反応と同様に、以下のサブセクションでは、上流の基質であるマロン酸とメチルマロン酸から始まり、下流の生成物であるマロニルCoAとメチルマロニルCoAに至るまで、ACSF3の機能的役割について説明します。
マロン酸のミトコンドリア由来は不明ですが、細胞膜を通過するのは限られた範囲のみで、酸性条件下では取り込みが増加し、ジカルボン酸キャリアSLC25A10を介してミトコンドリアに入ります。[ 14 ] [ 19 ]主な供給源は、新規脂肪酸合成由来の細胞質マロニルCoAの非酵素的加水分解であると考えられており、そのレベルは脂肪生成活性と相関しています。[ 7 ]さらに、アシルCoAチオエステラーゼ、アセチルCoAカルボキシル化、オキサロ酢酸脱炭酸、マロンジアルデヒド酸化、およびβ-アラニン代謝からも寄与がある可能性があります。[ 7 ]外因性の寄与は食事からも得られ、遊離マロン酸はマメ科植物などの植物に存在します。[ 14 ]
ACSF3はマロン酸をマロニルCoAに変換することで、ミトコンドリア呼吸の強力な阻害物質であるミトコンドリア内マロン酸を除去する上で重要な役割を果たしている。 [ 20 ] [ 7 ]マロン酸は、クエン酸回路(TCA回路)と電子伝達系の複合体IIの両方で機能する酵素であるコハク酸デヒドロゲナーゼ(SDH)を競合的に阻害する。[ 20 ] [ 7 ]この活性により、ACSF3はマロン酸毒性を防ぎ、代謝活性の高い細胞が呼吸を維持できるようにする代謝編集機能を発揮する。[ 7 ]

メチルマロン酸は、プロピオン酸代謝経路におけるメチルマロニル-CoAの加水分解によって副産物として生成され、ACSF3によってメチルマロニル-CoAにリサイクルされ、経路にフィードバックされる。[ 21 ] [ 22 ] Acsf3ノックアウトマウスモデルによると、スレオニン異化がメチルマロン酸蓄積の主な原因であることが確認されている。[ 23 ]
ミトコンドリア機能を維持し、代謝性アシドーシスを予防するには、マロン酸とメチルマロン酸の両方を効率的に除去する必要がある。[ 23 ] [ 11 ]具体的には、メチルマロン酸は直接的な酵素阻害ではなく、ミトコンドリアへのコハク酸の輸送を妨害することによって間接的にSDH活性を阻害する。[ 24 ]マウス骨芽細胞モデルでは、骨形成マーカー遺伝子の発現を抑制することで骨形成分化と骨基質石灰化を抑制し、ACSF3を介したメチルマロン酸の除去と骨形成を結びつけた。[ 23 ]
マロニル-CoAは膜不透過性中間体であるため、ミトコンドリア内での局所合成が必要である。 [ 14 ]ミトコンドリアのマロニル-CoAの正確な起源については議論の余地があるが、ACSF3がマロン酸から、ミトコンドリア型アセチル-CoAカルボキシラーゼ1(mtACC1)がアセチル-CoAから供給していると考えられている。[ 25 ] [ 26 ]ミトコンドリアのマロニル-CoAは、ミトコンドリアの脂肪酸合成、リジンのマロニル化、およびアセチル-CoA合成に必要である。[ 6 ] [ 20 ]

栄養素に反応するミトコンドリア脂肪酸合成(mtFAS)では、マロニルCoAが鎖伸長単位であるマロニルACP(C3)の前駆体として機能し、 CO2放出を伴う縮合反応によって、ACPに結合した脂肪酸鎖を1ラウンドあたり2炭素ずつ伸長させる。[ 25 ] [ 14 ] [ 27 ]結果として生じるアシル-ACP種は、鎖長に応じて異なる機能を発揮します。例えば、オクタノイル-ACP (C8) は、ピルビン酸デヒドロゲナーゼ複合体(PDC)、2-オキソグルタル酸デヒドロゲナーゼ複合体(OGDC)、2-オキソアジピン酸デヒドロゲナーゼ複合体(OADHC)、分岐鎖α-ケト酸デヒドロゲナーゼ複合体(BCKDHC)、グリシン開裂系(GCS)など、ミトコンドリアの主要な多酵素複合体の補因子であるリポ酸の生合成に必要です。[ 6 ]より長い鎖長の種 (C10-16) は、 LYRMタンパク質のネットワークをアロステリックに活性化します。[ 28 ] [ 29 ]ヒトでは、このネットワークは少なくとも 12 個のタンパク質から構成され、ミトコンドリア翻訳、鉄硫黄クラスター生合成、および電子伝達鎖複合体の組み立てを調節します。[ 30 ] [ 29 ]
リジンマロニル化は、マロニルCoAがリジン残基にマロニル基を供与し、正電荷を反転させ、立体障害を増加させる動的な翻訳後修飾である。[ 31 ]これにより、タンパク質のコンフォメーション、活性、およびタンパク質間相互作用が変化する可能性があり、エネルギー代謝、特に解糖系およびβ酸化と関連付けられている。[ 32 ] ACSF3は、マロニルCoAの利用可能性を制御することにより、ミトコンドリアタンパク質の摂食依存的なリズミカルなリジンマロニル化を調節し、グリコーゲン動員、脂質合成、およびトリグリセリド蓄積などの肝臓経路を調節する。[ 33 ]リジンマロニル化の程度は、異なる細胞タイプ間で異なることが報告されている。[ 23 ]
マロニルCoAデカルボキシラーゼ(MCD)によるマロニルCoAからアセチルCoAへの変換は、TCAサイクルに供給され、マロン酸分解経路を完了させる。[ 33 ] [ 7 ]同時に、これにより、生成物フィードバックを介してACSF3を阻害すると考えられるマロニルCoAの蓄積が制限され、この経路を介したマロン酸クリアランスの維持に役立つ。[ 7 ]
メチルマロニル-CoA は膜不透過性中間体でもあるため、ミトコンドリア内で局所的に合成されなければならない。[ 34 ]ミトコンドリアのメチルマロニル-CoA プールはプロピオン酸代謝経路によって供給され、ACSF3 がメチルマロン酸を活性化することによってさらに寄与される。[ 21 ]メチルマロニル-CoA はスクシニル-CoA の合成とリジンのメチルマロニル化に必要である。
メチルマロニルCoAムターゼによるメチルマロニルCoAからスクシニルCoAへの変換は、TCAサイクル中間体の補充を支えている。 [ 35 ]その重要性は組織の種類や代謝物レベルによって異なり、特に脳では顕著である。脳ではα-ケトグルタル酸プールの維持がGABAとグルタミンの産生を支えている。[ 35 ]ミトコンドリアのスクシニルCoAは、TCAサイクルの基質レベルリン酸化、ヘム生合成、ケトン体利用、リジンスクシニル化にも不可欠である。[ 36 ]
病原性翻訳後修飾であるリジンメチルマロニル化には、ドナーとしてメチルマロニル-CoAが必要であり、ACSF3はその供給に寄与している。[ 37 ]
ACSF3遺伝子の病原性変異は、複合マロン酸・メチルマロン酸尿症(CMAMMA)という代謝障害 を引き起こします。 [ 11 ] CMAMMAは、メチルマロン酸とマロン酸のレベルが高い状態を特徴とする疾患です。この疾患は通常、遺伝子検査または生化学的検査によって診断され、マロン酸に対するメチルマロン酸のレベルが高いことが診断基準となります。血漿中のマロン酸とメチルマロン酸の比率を計算することで、CMAMMAを古典的なメチルマロン酸血症と区別することができます。[ 38 ]この疾患は通常、小児期早期に症状が現れ、最初は血液中の酸レベルが高い状態(ケトアシドーシス)から始まります。その他の特徴としては、不随意筋緊張(ジストニア)、筋緊張低下(筋緊張低下)、発達遅延、期待される速度で成長・体重増加できない状態(発育不全)、低血糖(低血糖症)、昏睡などが挙げられます。罹患した子供の中には、小頭症を呈する子もいます。 CMAMMAの患者の中には、成人になるまで兆候や症状が現れない人もいます。これらの患者は通常、発作、記憶喪失、思考能力の低下、精神疾患などの神経学的問題を抱えています。[ 5 ]
エピジェネティクス研究では、母親の喫煙に曝露された胎児肺組織においてACSF3遺伝子のDNAメチル化の差異が発見され、慢性閉塞性肺疾患(COPD)の発症起源における潜在的な役割が示唆された。[ 39 ]さらに、肺組織のDNAメチル化と遺伝子発現の統合解析により、 ACSF3がCOPDの重要な調節因子であることが特定された。 [ 39 ]
ACSF3 は、代謝機能障害関連脂肪肝疾患(MASLD、旧 NAFLD)の病態生理に関与しています。 [ 15 ]その発現は、高脂肪食のマウスモデルだけでなく、肥満やアルコール性肝疾患でも増加しており、これらはいずれもミトコンドリア脂肪酸代謝障害と脂質過酸化の増加に関連しています。 [ 15 ]ミトコンドリア脱アセチル化酵素サーチュイン 3 (SIRT3)による ACSF3 の脱アセチル化は、ACSF3 の安定性を低下させ、分解を促進します。これにより、高脂肪食条件下では、マウスモデルにおいて肝臓の脂質恒常性が改善され、脂肪肝が減少します。 [ 15 ]フェノール化合物プロトカテキュ酸(PCA) は SIRT3 を活性化することが示されており、SIRT3–ACSF3 軸が MASLD の潜在的な治療標的であることが強調されています。[ 15 ] [ 40 ]
古代のヒト特有の調節バリアントrs34590044-AはACSF3の発現を上方制御し、身長と基礎代謝率(BMR)の増加と関連している。[ 23 ]解剖学的現代人は、非ヒト類人猿よりも身長が高く、体重調整BMRも高い。この違いは、スレオニン代謝の亢進とメチルマロン酸蓄積の減少による肉食への適応と解釈されている。 [ 23 ]ヒト細胞とマウスモデルを用いた機能研究では、ACSF3がミトコンドリア活性の維持に不可欠であり、メチルマロン酸蓄積を制限することで間接的に骨形成に影響を与え、それによってヒトの代謝、身長、および食生活を結びつけていることが示されている。[ 23 ]