構造の発見 補酵素Aの構造:1:3′-ホスホアデノシン。2:二リン酸、有機リン酸無水物。3:パントイン酸。4:β-アラニン。5:システアミン。 補酵素Aは1946年にフリッツ・リップマン によって発見され[ 4 ] 、後にリップマンがその名を付けました。その構造は1950年代初頭にロンドンのリスター研究所で、リップマンと ハーバード大学医学部 およびマサチューセッツ総合病院 の他の研究者によって決定されました[ 5 ] 。リップマンは当初、動物におけるアセチル基転移を研究するつもりでしたが、これらの実験から、酵素抽出物には存在しないが動物のすべての臓器に存在する独特の因子に気づきました。彼はハトの肝臓からその因子を分離・精製することができ、その機能がコリン アセチル化に活性な補酵素に関連していることを発見しました[ 6 ]。 ビバリー・ギラード 、ネイサン・カプラン らとの研究により、パントテン酸が補酵素Aの中心的な成分であることが判明しました[ 7 ] [ 8 ]。 この補酵素は「酢酸の活性化」を意味する補酵素Aと名付けられました。 1953年、フリッツ・リップマンは 「補酵素Aの発見と中間代謝におけるその重要性」によりノーベル生理学・医学賞を受賞した。[ 6 ] [ 9 ]
生合成 補酵素Aは、肉、野菜、穀物、豆類、卵、牛乳などの食品に含まれるパントテン酸 (ビタミンB5 )から自然に合成されます。 [ 10 ] 人間やほとんどの生物では、パントテン酸はさまざまな機能を持つ必須ビタミンです。[ 11 ] 大腸菌 を含む一部の植物や細菌では、パントテン酸はde novo 合成できるため、必須とはみなされません。これらの細菌は、アミノ酸アスパラギン酸とバリン生合成の代謝産物からパントテン酸を合成します。[ 12 ]
すべての生物において、補酵素Aは4分子のATP、パントテン酸、システインを必要とする5段階のプロセスで合成される[ 13 ] (図を参照)。
パントテン酸からCoAを合成する生合成経路の詳細。 パントテン酸 (ビタミンB5 )は、 パントテン酸キナーゼ (PanK; CoaA; CoaX)という酵素によって4′-ホスホパントテン酸にリン酸化される。これはCoA生合成の律速段階であり、ATPを必要とする。[ 12 ] 4′-ホスホパントテン酸に ホスホパントテノイルシステインシンテターゼ (PPCS; CoaB)酵素によってシステインが付加され、4'-ホスホ-N-パントテノイルシステイン(PPC)が生成される。このステップはATP加水分解と共役している。[ 12 ] PPCは、ホスホパントテノイルシステイン脱炭酸酵素 (PPC-DC;CoaC)によって4′-ホスホパンテテイン に脱炭酸される。4′-ホスホパンテテインは、ホスホパンテテインアデニリルトランスフェラーゼ (COASY; PPAT; CoaD)という酵素によってアデニル化(より正確にはAMP化)され、脱ホスホCoAを形成する。 最後に、脱リン酸化CoAは脱リン酸化補酵素Aキナーゼ (COASY、DPCK;CoaE)という酵素によって補酵素Aにリン酸化される。この最終段階にはATPが必要である。[ 12 ] 括弧内の酵素命名法の略語は、それぞれ哺乳類、その他の真核生物、および原核生物の酵素を表します。哺乳類では、ステップ 4 と 5 はCOASY と呼ばれる二機能性酵素によって触媒されます。[ 14 ] この経路は、生成物阻害によって制御されます。CoA は、通常 ATP と結合するパントテン酸キナーゼの競合阻害剤です。[ 12 ] 生合成から補酵素 A、3 つの ADP、1 つの一リン酸、および 1 つの二リン酸が回収されます。[ 13 ]
細胞内補酵素Aレベルが低下し、 de novo 経路が阻害された場合、補酵素Aは代替経路で合成される。 [ 15 ] これらの経路では、 4′-ホスホパンテテイン を生成するために、食物などの外部供給源から補酵素Aが供給される必要がある。エクソヌクレオチドピロリン酸(ENPP)は補酵素Aを4′-ホスホパンテテインに分解し、これは生物内で安定な分子である。アシルキャリアタンパク質(ACP) (ACPシンターゼやACP分解など)も4′-ホスホパンテテインの生成に使用される。この経路により、細胞内で4′-ホスホパンテテインが補充され、酵素PPATおよびPPCKを介して補酵素Aに変換される。[ 16 ]
2024年の論文[ 17 ] では、原始的な生命前 世界における補酵素Aのパンテテイン成分(主要な機能部分)の妥当な化学合成メカニズムが詳細に説明されている。
商業生産 補酵素Aは酵母からの抽出によって商業的に生産されているが、これは非効率的なプロセス(収量は約25mg /kg)であり、高価な製品となる。CoAを合成または半合成的に生産するさまざまな方法が研究されてきたが、現在工業規模で稼働しているものはない。[ 18 ]
関数
抗酸化機能と調節 補酵素Aの新たな抗酸化機能の発見は、細胞ストレス時のその保護的役割を強調している。酸化ストレスおよび代謝ストレスにさらされた哺乳類細胞および細菌細胞は、補酵素Aによるタンパク質システイン残基の共有結合修飾の著しい増加を示す。[ 24 ] [ 25 ] この可逆的な修飾はタンパク質CoA化(タンパク質-S-SCoA)と呼ばれ、システイン残基のチオール基 の不可逆的な酸化を防ぐことで、タンパク質S- グルタチオン化 と同様の役割を果たす。
抗補酵素A抗体[ 26 ] と液体クロマトグラフィー・タンデム質量分析法(LC-MS/MS )を用いて、ストレスを受けた哺乳類細胞および細菌細胞から2,000を超えるCoA化タンパク質が同定された。[ 27 ] これらのタンパク質の大部分は細胞代謝およびストレス応答に関与している。[ 27 ] さまざまな研究が、補酵素Aを介したタンパク質の調節の解明に焦点を当ててきた。タンパク質のCoA化により、さまざまなタンパク質(例えば、転移抑制因子NME1 、ペルオキシレドキシン5 、GAPDH など)の触媒活性の阻害が報告されている。[ 28 ] [ 29 ] [ 25 ] [ 30 ] タンパク質の活性を回復するために、補酵素Aとタンパク質システイン残基間のジスルフィド結合を還元する抗酸化酵素が重要な役割を果たす。このプロセスはタンパク質脱CoA化と呼ばれる。チオレドキシンAとチオレドキシン様タンパク質(YtpP)という2つの細菌タンパク質は、タンパク質を脱CoA化することが示されている。[ 31 ]
生物学的研究での使用 補酵素Aは、遊離酸およびリチウム 塩またはナトリウム 塩として、さまざまな化学品供給業者から入手可能です。補酵素Aの遊離酸は検出可能なほど不安定で、−20 °Cで保存すると6か月後に約5%の分解が観察され[ 1 ] 、37 °Cで1か月後にはほぼ完全に分解します[ 32 ] 。CoAのリチウム塩とナトリウム塩はより安定しており、さまざまな温度で数か月にわたって無視できるほどの分解が観察されています[ 33 ]。 補酵素Aの水溶液はpH 8以上で不安定で、25 °C、pH 8 で24時間後には活性の31%が失われます。CoAストック溶液は、pH 2~6で凍結すると比較的安定です。CoA活性損失の主な経路は、CoAの空気酸化によるCoAジスルフィドであると考えられます。CoA- S - S- グルタチオンなどのCoA混合ジスルフィドは、市販のCoA製剤によく見られる不純物です。[ 1 ] 遊離CoAは、ジチオスレイトール や2-メルカプトエタノール などの還元剤を用いてCoAジスルフィドや混合CoAジスルフィドから再生することができる。
補酵素Aによって活性化されるアシル基の非網羅的なリスト
参考文献 1 2 3 4 Dawson RM 、 Elliott DC、Elliott WH、Jones KM ( 2002)。生化学研究のためのデータ (第3 版)。Clarendon Press。pp. 118–119。ISBN 978-0-19-855299-4 。 ↑ Daugherty M、Polanuyer B、Farrell M、Scholle M、Lykidis A、de Crécy-Lagard V、Osterman A (2002年6月)。 「比較ゲノミクスによるヒト補酵素A生合成経路の完全な再構成」 。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 24): 21431–21439。doi : 10.1074 / jbc.M201708200。PMID 11923312 。 ↑ 「補酵素A:小さいことが力になるとき」 。www.asbmb.org 。 2018年12月20日に オリジナル からアーカイブ済み 。 2018年12月19日 に 取得。 ↑ Lipmann F、Kaplan NO ( 1946)。 「スルファニルアミドとコリンの酵素 的 アセチル化における共通因子」 。Journal of Biological Chemistry。162 ( 3): 743–744。doi : 10.1016 / S0021-9258(17)41419-0 。 ↑ Baddiley J 、 Thain EM、Novelli GD、Lipmann F (1953 年 1 月)。 「 補 酵素A の 構造」 。Nature。171 ( 4341 ): 76。Bibcode : 1953Natur.171...76B。doi : 10.1038 / 171076a0。PMID 13025483。S2CID 630898 。 1 2 Kresge N、Simoni RD、Hill RL ( 2005-05-27 )。 「フリッツ・リップマンと補酵素Aの発見」 。Journal of Biological Chemistry。280 ( 21): e18。ISSN 0021-9258。2019-04-12 の オリジナル からアーカイブ 。2017-10-24 に 取得 。 ↑ Lipmann F、Kaplan NO ( 1947 年 3月)。 「アセチル 化 の 補酵素、パントテン酸誘導体」 。 生物化学ジャーナル 。167 (3): 869–870。doi : 10.1016/S0021-9258(17) 30973-0。PMID 20287921 。 ↑ Lipmann F 、 Kaplan NO、Novelli GD、Tuttle LC、Guirard BM (1950 年 9 月)。 「 補 酵素 A の単離」 。The Journal of Biological Chemistry。186 ( 1): 235–243。doi : 10.1016/S0021-9258(18) 56309-2。PMID 14778827 。 ↑ 「フリッツ ・ リップマン – 事実」 。Nobelprize.org。Nobel Media AB。2014年。 2017年 11月8日 取得 。 ↑ 「ビタミンB5 ( パントテン酸)」 。 メリーランド大学医療センター 。 2017年10月18日に オリジナルからアーカイブ済み 。 2017年11月8日 に取得。 ↑ 「パントテン酸(ビタミンB5 ) : MedlinePlus サプリメント」 。medlineplus.gov 。 2017年12月22日に オリジナル からアーカイブ済み 。 2017年12月10日 に取得。 1 2 3 4 5 Leonardi R 、Jackowski S (2007 年 4 月 ) 。 「パントテン酸と補酵素 A の生合成」 。EcoSal Plus。2 ( 2 ) 10.1128/ecosalplus.3.6.3.4。doi : 10.1128/ ecosalplus.3.6.3.4。PMC 4950986。PMID 26443589 。 1 2 Leonardi R、 Zhang YM、Rock CO 、 Jackowski S ( 2005)。「補酵素A:再び活躍」。Progress in Lipid Research。44 ( 2–3 ) : 125–153。doi : 10.1016/j.plipres.2005.04.001。PMID 15893380 。 ↑ ↑ de Villiers M、Strauss E(2015 ↑ Sibon OC、Strauss E(2016年10月)。「補酵素A :生成するか、取り込むか?」。 Nature Reviews . Molecular Cell Biology . 17 ( 10): 605–606。doi : 10.1038 / nrm.2016.110。PMID 27552973。S2CID 10344527 。 ↑ Fairchild, Jasper; Islam, Saidul; Singh, Jyoti; Bučar, Dejan-Krešimir; Powner, Matthew W. (2024年2月22日). "水中での生命前段階に妥当な化学選択的パンテテイン合成". Science . 383 (6685): 911– 918. Bibcode : 2024Sci...383..911F . doi : 10.1126/science.adk4432 . PMID 38386754 . ↑ Mouterde LM、Stewart JD (2018年12月19日)。 「代謝における最も重要な補因子の1つである補酵素Aの単離と合成」 ( PDF ) 。Organic Process Research & Development。23 : 19–30。doi : 10.1021 / acs.oprd.8b00348。S2CID 92802641 。 ↑ Elovson J 、 Vagelos PR (1968年7月)。 「アシルキャリアタンパク質。X. アシルキャリアタンパク質合成酵素」 。The Journal of Biological Chemistry。243 (13): 3603–3611。doi : 10.1016/S0021-9258(19 ) 34183-3。PMID 4872726 。 ↑ Strickland KC、Hoeferlin LA 、 Oleinik NV、Krupenko NI、Krupenko SA (2010年1月)。 「アシルキャリアタンパク質特異的4'-ホスホパンテテイニルトランスフェラーゼ は 10-ホルミルテトラヒドロ葉酸デヒドロゲナーゼを活性化する」 。The Journal of Biological Chemistry。285 ( 3 ) : 1627–1633。doi : 10.1074 /jbc.M109.080556。PMC 2804320。PMID 19933275 。 ↑ Alberts B、Johnson A、Lewis J、Raff M、Roberts K、Walter P (2002)。 「第2章:細胞は食物からどのようにエネルギーを得るか」 。 細胞の分子生物学 (第4 版)。Garland Science。 1 2 Shi L 、 Tu BP(2015年4月)。 「 アセチル CoAと 代謝 の調節:メカニズムと結果」 。Current Opinion in Cell Biology。33 : 125–131。doi : 10.1016 / j.ceb.2015.02.003。PMC 4380630。PMID 25703630 。 ↑ Berg JM、Tymoczko JL、Stryer L (2002)。 「アセチルCoAカルボキシラーゼは脂肪酸代謝の制御において重要な役割を果たす」 。 生化学 。 ↑ Tsuchiya Y, Peak-Chew SY, Newell C, Miller-Aidoo S, Mangal S, Zhyvoloup A, et al. (2017年7月). "Protein CoAlation: 哺乳類細胞における補酵素Aによる酸化還元制御タンパク質修飾" . The Biochemical Journal . 474 (14): 2489– 2508. doi : 10.1042/BCJ20170129 . PMC 5509381 . PMID 28341808 . 1 2 Tsuchiya Y, Zhyvoloup A, Baković J, Thomas N, Yu BY, Das S, et al. (2018 年 6 月). "原核細胞における補酵素 A のタンパク質共役と抗酸化機能" . The Biochemical Journal . 475 (11): 1909– 1937. doi : 10.1042/BCJ20180043 . PMC 5989533 . PMID 29626155 . ↑ Malanchuk OM、Panasyuk GG 、Serbyn NM、Gout IT、Filonenko VV (2015)。 「補酵素Aに特異的なモノクローナル抗体の生成と特性評価」 。Biopolymers and Cell。31 ( 3 ) : 187–192。doi : 10.7124 /bc.0008DF。ISSN 0233-7657 。 1 2 Tossounian MA、Baczynska M、Dalton W 、 Newell C、Ma Y、Das S、et al. (2022 年 7 月)。 「 タンパク質 共役および 補酵素 A 安定 化 相互作用 部位のプロファイリング」 。Antioxidants。11 (7): 1362。doi : 10.3390/ antiox11071362。PMC 9312308。PMID 35883853 。 ↑ Tossounian MA、Zhang B 、Gout I (2020 年12 月 )。 「 GAPDH の酸化還元調節におけるライター、リーダー、およびイレイザー」 。 抗 酸化物質 。9 (12): 1288。doi : 10.3390/ antiox9121288。PMC 7765867。PMID 33339386 。 ↑ Yu BY、Tossounian MA、Hristov SD、Lawrence R、Arora P、Tsuchiya Y、et al . ( 2021 年 8 月)。 「 主要な代謝補因子である補酵素 A による転移抑制因子 NME1 の 制御」 。Redox Biology。44 101978。doi : 10.1016 / j.redox.2021.101978。PMC 8212152。PMID 33903070 。 ↑ Baković J、Yu BY、Silva D、Chew SP、Kim S、Ahn SH、et al. (2019年11月)。 「主要な代謝インテグレーターである補酵素A は、共有結合修飾を介してペルオキシレドキシン5 の 活性を調節する」 。Molecular and Cellular Biochemistry。461 ( 1–2 ) : 91–102。doi : 10.1007 / s11010-019-03593- w。PMC 6790197。PMID 31375973 。 ↑ Tossounian MA、Baczynska M、Dalton W、Peak-Chew SY、Undzenas K、Korza G、et al. (2023 年 4 月) " Bacillus subtilis YtpP と Thioredoxin A は細胞ストレスに対する補酵素 A を介した防御機構の新たなプレーヤーである " . Antioxidants . 12 (4): 938. doi : 10.3390/antiox12040938 . PMC 10136147 . PMID 37107313 . ↑ 「遊離酸補酵素Aのデータシート」 (PDF) オリエンタル酵母工業株式会社 ↑ 「リチウム塩補酵素Aのデータシート」 (PDF) オリエンタル酵母工業株式会社
参考文献 ネルソン DL、コックス MM (2005)。レーニンガー:生化学の原理 (第4 版)。ニューヨーク:W.H.フリーマン。ISBN 978-0-7167-4339-2 。