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 チロシンタンパク質キナーゼ BTK の PH ドメイン | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
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| シンボル | フィリピン | ||||||||
| パム | PF00169 | ||||||||
| ファム一族 | CL0266 | ||||||||
| エコド | 220.1.1 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| 頭いい | フィリピン | ||||||||
| プロサイト | PDOC50003 | ||||||||
| SCOP2 | 1dyn / スコープ / SUPFAM | ||||||||
| OPMスーパーファミリー | 49 | ||||||||
| OPMタンパク質 | 1pls | ||||||||
| 医療機器 | cd00821 | ||||||||
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プレクストリン相同ドメイン（PHドメイン）または（PHIP）は、細胞内シグナル伝達に関与するタンパク質や細胞骨格の構成要素として広範囲に存在する約120個のアミノ酸からなるタンパク質ドメインです。[1] [2] [3] [4] [5] [6] [7]
このドメインは、生体膜内のホスファチジルイノシトール脂質（ホスファチジルイノシトール（3,4,5）-三リン酸やホスファチジルイノシトール（4,5）-二リン酸など）[8]や、ヘテロ三量体Gタンパク質のβγサブユニット[9]やタンパク質キナーゼC [10]などのタンパク質と結合することができます。これらの相互作用を通じて、PHドメインはタンパク質をさまざまな膜にリクルートする役割を果たし、それによってタンパク質を適切な細胞区画に標的化したり、シグナル伝達経路の他の成分と相互作用できるようにしたりします。
脂質結合特異性
個々の PH ドメインは、イノシトール環内の異なる部位でリン酸化されるホスホイノシチドに対する特異性を持っています。例えば、いくつかはホスファチジルイノシトール (4,5)-ビスリン酸に結合しますが、ホスファチジルイノシトール (3,4,5)-トリスリン酸またはホスファチジルイノシトール (3,4)-ビスリン酸には結合しませんが、他のドメインは必要な親和性を持っている場合があります。これは、ホスホイノシチド 3-キナーゼやPTENなど、イノシトール環上のこれらの部位をリン酸化または脱リン酸化する酵素の活性に対して、異なる PH ドメインを含むタンパク質のリクルートメントを敏感にするため重要です。したがって、このような酵素は、そのリン脂質産物に結合できる PH ドメインを持つ下流のシグナル伝達タンパク質の局在を調節することによって、細胞機能に対する影響の一部を発揮します。
構造
いくつかのPHドメインの3D構造が決定されている。[11]既知のケースはすべて、2つの垂直な反平行βシートとそれに続くC末端 両親媒性ヘリックスからなる共通の構造を持っている。βストランドを接続するループは長さが大きく異なるため、PHドメインの検出は比較的困難であるが、ドメインの特異性の源となっている。PHドメイン間で保存されている唯一の残基は、ドメインのコアを核形成する役割を果たす αヘリックス内に位置する単一のトリプトファンである。
PHドメインを含むタンパク質
PHドメインは、 OSBPやARFなど、さまざまなタンパク質に見られます。この場合のゴルジ体へのリクルートメントは、PtdInsとARFの両方に依存しています。多くのPHドメインはホスホイノシチドに対する親和性が低く、タンパク質結合ドメインとして機能すると仮定されています。サッカロミセス・セレビシエのゲノム全体を調べたところ、33の酵母PHドメインのほとんどがホスホイノシチドへの結合において確かに無差別であるのに対し、高度に特異的に振る舞うのは1つ（Num1-PH）のみであることが示されました。[12] PHドメインを含むことが報告されているタンパク質は、次のファミリーに属します。
- このドメインが最初に検出されたタンパク質であるプレクストリンは、血小板中のタンパク質キナーゼ C の主な基質です。プレクストリンには 2 つの PH ドメインが含まれています。ARAP タンパク質には 5 つの PH ドメインが含まれています。
- Akt/Rac ファミリー、タンパク質キナーゼ D1、トリパノソーマ NrkA ファミリーなどのセリン/スレオニン特異的タンパク質キナーゼ。
- Btk/Itk/Tec サブファミリーに属する非受容体チロシンキナーゼ。
- インスリン受容体基質1（IRS-1）。
- 小型Gタンパク質の調節因子：Dbl様ファミリーの64個のRhoGEF、[13]およびABR、BCR、ARAPタンパク質などのいくつかのGTPase活性化タンパク質。
- ダイナミン（InterPro : IPR001401を参照）、Caenorhabditis elegansキネシン様タンパク質 unc-104（InterPro : IPR001752を参照）、スペクトリン β 鎖、シントロフィン（2 つの PH ドメイン）、S. cerevisiae核移行タンパク質 NUM1などの細胞骨格タンパク質。
- オキシステロール結合タンパク質OSBP、S. cerevisiae OSH1 および YHR073w。
- セラミドキナーゼはセラミドをセラミド-1-リン酸にリン酸化させる脂質キナーゼである。 [14]
- GRK2サブファミリー（βアドレナリン受容体キナーゼ）のGタンパク質受容体キナーゼ（GRK）： GRK2およびGRK3。[15]
亜科
例
このドメインを含むタンパク質をコードするヒト遺伝子には以下のものがあります。
- ABR、ADAP2、ADRBK1、ADRBK2、AFAP、AFAP1、AFAP1L1、AFAP1L2、AKAP13、AKT1、AKT2、AKT3、ANLN、APBB1IP、APPL1、APPL2、ARHGAP10、ARHGAP12、ARHGAP15、 ARHGAP21、ARHGAP22、ARHGAP23 、 ARHGAP24 、ARHGAP25、ARHGAP26、ARHGAP27、ARHGAP9、ARHGEF16、ARHGEF18、ARHGEF19、ARHGEF2、ARHGEF3、ARHGEF4、ARHGEF5、ARHGEF6、ARHGEF7、ARHGEF9、 ASEF2、
- BMX、BTK、
- C20orf42、C9orf100、CADPS、CADPS2、CDC42BPA、CDC42BPB、CDC42BPG、CENTA1、CENTB1、CENTB2、CENTB5、CENTD1、CENTD2、CENTD3、CENTG1、CENTG2、CENTG3、CERK、CIT、CNKSR1、CNKSR2、COL4A3BP、CTGLF1、CTGLF2、CTGLF3、*CTGLF4、CTGLF5、CTGLF6、
- DAB2IP、DAPP1、DDEF1、DDEF2、DDEFL1、DEF6、DEPDC2、DGKD、DGKH、DGKK、DNM1、DNM2、DNM3、DOCK10、DOCK11、DOCK9、DOK1、DOK2、DOK3、DOK4、DOK5、DOK6、DTGCU2、
- EXOC8、
- FAM109A、FAM109B、FARP1、FARP2、FGD1、FGD2、FGD3、FGD4、FGD5、FGD6、
- GAB1、GAB2、GAB3、GAB4、GRB10、GRB14、GRB7、
- IRS1、IRS2、IRS4、ITK、ITSN1、ITSN2、
- カルン、KIF1A、KIF1B、KIF1Bベータ、
- MCF2、MCF2L、MCF2L2、MRIP、MYO10、
- NET1、NGEF、
- OBPH1、OBSCN、OPHN1、OSBP、OSBP2、OSBPL10、OSBPL11、OSBPL3、OSBPL5、OSBPL6、OSBPL7、OSBPL8、OSBPL9、
- PHLDA2、PHLDA3、PHLDB1 、PHLDB2、PHLPP、PIP3-E、PLCD1、PLCD4、PLCG1、PLCG2、PLCH1、PLCH2、PLCL1、PLCL2、PLD1、PLD2、PLEK、PLEK2、PLEKHA1、PLEKHA2、PLEKHA3、 PLEKHA4、PLEKHA5、PLEKHA6、PLEKHA7、PLEKHA8、PLEKHB1 、 PLEKHB2 、 PLEKHC1、 PLEKHF1、 PLEKHF2、PLEKHG1、PLEKHG2、PLEKHG3、PLEKHG4、PLEKHG5、PLEKHG6、 PLEKHH1、PLEKHH2、PLEKHH3、PLEKHJ1、PLEKHK1、PLEKHM1、PLEKHM2、PLEKHO1、PLEKHQ1、PREX1、PRKCN、PRKD1、PRKD2、PRKD3、PSCD1、PSCD2、PSCD3、PSCD4、PSD、PSD2、PSD3、PSD4、RALGPS1、RALGPS2、RAPH1、
- RASA1、RASA2、RASA3、RASA4、RASAL1、RASGRF1、RGNEF、ROCK1、ROCK2、RTKN、
- SBF1、SBF2、SCAP2、SGEF、SH2B、SH2B1、SH2B2 、 SH2B3、SH3BP2 、 SKAP1 、SKAP2、SNTA1、SNTB1、SNTB2、SOS1、SOS2、SPATA13、SPNB4、SPTBN1、SPTBN2、SPTBN4、SPTBN5、STAP1、SWAP70、SYNGAP1、
- TBC1D2、TEC、TIAM1、TRIO、TRIOBP、TYL、
- URP1、URP2、
- VAV1、VAV2、VAV3、VEPH1
参照
- プレックストリン
- 無関係なFYVE ドメインはホスファチジルイノシトール 3-リン酸に結合し、60 を超えるタンパク質で発見されています。
- GRAM ドメインは構造的に関連するタンパク質ドメインです。
参考文献
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外部リンク
- Nash Lab タンパク質相互作用ドメイン - PH ドメインの説明[永久リンク切れ ]
- UMich 膜タンパク質の配向 ファミリー/スーパーファミリー-51 - 膜中の PH ドメインの計算された配向