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| エイリアス | ARHGEF6、COOL2、Cool-2、MRX46、PIXA、alpha-PIX、alphaPIX、Rac/Cdc42 グアニンヌクレオチド交換因子 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム：300267; MGI : 1920591;ホモロジーン: 3561;ジーンカード：ARHGEF6; OMA :ARHGEF6 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Rhoグアニンヌクレオチド交換因子6は、ヒトではARHGEF6遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
ARHGEF6は、p21活性化キナーゼ（PAK）に結合することで同定され、グアニンヌクレオチド交換因子ドメインも含むため、一般にp21活性化タンパク質キナーゼ交換因子アルファ（アルファPIXまたはαPIX）として知られています。 [ 6]
ドメインと機能
αPIXは、シグナル伝達 足場タンパク質としても酵素としても機能するマルチドメインタンパク質である。[ 8] αPIXは、非常に類似したARHGEF7/βPIXタンパク質とこのドメイン構造およびシグナル伝達機能を共有している。αPIXには、 Rhoファミリーの小さなGTPase、具体的にはRacおよびCdc42のグアニンヌクレオチド交換因子（GEF）として機能する中央DH/PH RhoGEFドメインが含まれる。[6]他のGEFと同様に、αPIXは、不活性な小さなGTP結合タンパク質からのGDPの放出と、その活性化を促進するためのGTPの結合の両方を促進することができる。シグナル伝達足場は、特定のパートナーに結合して、経路の連続要素を互いに近くに配置し、相互作用/情報伝達を容易にすることにより、効率的なシグナル伝達を促進し、また、これらのパートナータンパク質複合体を細胞内の特定の場所に保持して、局所的または領域的なシグナル伝達を促進する。 αPIXの場合、そのSH3ドメインは適切なポリプロリンモチーフを持つパートナータンパク質、特にグループI p21活性化キナーゼ（PAK）（PAK1、PAK2、およびPAK3）に結合します。[6] PAKは不活性状態ではαPIX SH3ドメインに結合し、活性化されたRac1またはCdc42がこのPAKに結合すると、そのタンパク質キナーゼ活性が刺激され、下流の標的タンパク質のリン酸化につながります。αPIXはGEF活性を介して「p21」小型GTPase Rac1またはCdc42を活性化できるため、このαPIX/PAK/Rac複合体は足場機能の例です。構造的には、αPIXはカルボキシル末端のコイルドコイルドメインを介して三量体として組み立てられ、さらに近くのGIT結合ドメインを介してGIT1またはGIT2の二量体と相互作用して、オリゴマーGIT-PIX複合体を形成します。[8]このGIT-PIX複合体を通じて、αPIXの足場機能は、GITパートナーをαPIXパートナーの近くに保持することも可能になることで増幅されます。αPIXにはアミノ末端カルポニンホモロジー（CH）ドメインが含まれており、その機能は比較的よくわかっていませんが、パルビン/アフィキシンファミリータンパク質と相互作用します。[9] [8]
ARHGEF6遺伝子はX染色体上にあり、男性は1つのコピーしか持たないため、ヒトにおけるこの遺伝子の変異は、X染色体連鎖非特異的知的障害を引き起こす可能性がある[10]。また、結合パートナーであるPAK3の遺伝子もX染色体上に存在するため、この遺伝子の変異によっても、同様の障害が生じる可能性がある[11] 。動物モデルでは、ARHGEF6遺伝子機能の喪失は、神経 シナプス障害[12] 、 免疫 T細胞の移動および成熟障害[13]、および難聴[14] と関連している。
インタラクション
αPIXは40以上のタンパク質と相互作用することが報告されている。[8] [15]
相互作用する主要なタンパク質は次のとおりです。
- それ自体、または三量体コイルドコイル相互作用を介して関連性の高いARHGEF7/βPIX 。
- GIT 結合ドメインを介したGIT1またはGIT2二量体。
- SH3 ドメインを介したp21 活性化キナーゼ (PAK) 1、2、および 3 。
- SH3ドメイン経由のc-Cbl。
- Rho ファミリー GTP 結合タンパク質ファミリーのメンバーであるRac1およびCdc42 は、DHPH RhoGEF ドメインを介して活性化されます。
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000129675 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031133 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 野村直人、長瀬哲也、宮島直人、佐塚哲也、田中亜人、佐藤信也、関直也、瓦林裕也、石川一樹、田端真也 (1995年12月)。 「未確認のヒト遺伝子のコード配列の予測。II. ヒト細胞株 KG-1 由来の cDNA クローンの分析によって推定された 40 個の新しい遺伝子 (KIAA0041 ～ KIAA0080) のコード配列 (補足)」。DNA研究所1 (5): 251–62。土井：10.1093/dnares/1.5.251。PMID 7584048。
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- ^ 「Entrez Gene: ARHGEF6 Rac/Cdc42 グアニンヌクレオチド交換因子 (GEF) 6」。
- ^ abcd Zhou W, Li X, Premont RT (2016年5月). 「GIT Arf GTPase活性化タンパク質、PIX Rhoグアニンヌクレオチド交換因子、およびGIT-PIX複合体の機能拡張」. Journal of Cell Science . 129 (10): 1963–1974. doi :10.1242/jcs.179465. PMC 6518221. PMID 27182061 .
- ^ Rosenberger G、Jantke I、Gal A、Kutsche K (2003)。「alphaPIX (ARHGEF6) と beta-parvin (PARVB) の相互作用は、インテグリンを介したシグナル伝達における alphaPIX の関与を示唆している」。Human Molecular Genetics。12 ( 2 ): 155–167。doi : 10.1093/hmg/ ddg019。PMID 12499396 。
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- ^ 「ARHGEF6 結果概要」.
外部リンク
- UCSC ゲノム ブラウザのヒト ARHGEF6 ゲノムの位置と ARHGEF6 遺伝子の詳細ページ。
- PDBe-KBのUniProt : Q15052 (ヒト Rho グアニンヌクレオチド交換因子 6)のPDBで入手可能なすべての構造情報の概要。
- PDBe-KBのUniProt : Q8K4I3 (マウス Rho グアニンヌクレオチド交換因子 6)のPDBで入手可能なすべての構造情報の概要。
さらに読む
- Yntema HG、Hamel BC、Smits AP、et al. (1999)。「非特異的X連鎖精神遅滞遺伝子（MRX46）のXq25-q26への局在」。J . Med. Genet . 35 (10): 801–5. doi :10.1136/jmg.35.10.801. PMC 1051453 . PMID 9783701。
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