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| FYVE ジンクフィンガー | |||||||||
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 初期エンドソーム抗原1（EEA1）と脂質の二量体。[1] | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | ファイヴ | ||||||||
| パム | PF01363 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| プロサイト | PDOC50178 | ||||||||
| SCOP2 | 1vfy / スコープ / SUPFAM | ||||||||
| OPMスーパーファミリー | 59 | ||||||||
| OPMタンパク質 | 1vfy | ||||||||
| 医療機器 | cd00065 | ||||||||
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分子生物学では、FYVEジンクフィンガードメインは、システインを多く含む4 つのタンパク質にちなんで命名されています。Fab 1 ( PIKfyveの酵母相同遺伝子)、Y OTB、Vac 1 (小胞輸送タンパク質)、E EA1で、これらのタンパク質にこのドメインが見つかっています。FYVE ドメインは、金属イオンの配位と塩基性アミノ酸に依存して、ホスファチジルイノシトール 3-リン酸に結合します[2]。FYVE ドメインは、pH 依存的に細胞膜に挿入されます[3] 。FYVE ドメインは、液胞タンパク質の選別とエンドソーム機能に関連しています[4]。
構造
FYVEドメインは、2つの小さなβヘアピン（または亜鉛ナックル）とそれに続くαヘリックスから構成されています。[5] FYVEフィンガーは2つの亜鉛イオンに結合します。FYVEフィンガーには、8つの潜在的な亜鉛配位システイン位置があり、システインの周りに塩基性アミノ酸があることが特徴です。このファミリーの多くのメンバーには、配列モチーフに 2つのヒスチジンも含まれています。
R+HHC+XCG、ここで+は荷電残基、Xは任意の残基を表す。
FYVE フィンガーは、RING ドメインおよびPHD フィンガーと構造的に類似しています。
例
以下はこのドメインを含むヒトタンパク質のリストです。
- ANKFY1、EEA1、FGD1、FGD2、FGD3、FGD4、FGD5、FGD6、FYCO1、HGS、MTMR3、MTMR4、PIKFYVE、PLEKHF1、PLEKHF2
- RUFY1、RUFY2、RUFY3、RUFY4、WDFY1、WDFY2 、 WDFY3、ZFYVE1、ZFYVE9、ZFYVE16、ZFYVE19、ZFYVE20、ZFYVE21、ZFYVE26、ZFYVE27、ZFYVE28
参考文献
- ^ Dumas JJ、Merithew E、Sudharshan E、他。 (2001 年 11 月)。 「ホモ二量体EEA1による多価エンドソームターゲティング」。モル。セル。8 (5): 947–58。土井：10.1016/S1097-2765(01)00385-9。PMID 11741531。
- ^ ゴリエ JM、シモンセン A、ダリーゴ A、ブレムネス B、ステンマルク H、アスランド R (1998 年 7 月)。 「FYVE フィンガーは PtdIns(3)P をバインドします」。自然。394 (6692): 432–3。土井：10.1038/28767。PMID 9697764。S2CID 4385768 。
- ^ He J, Vora M, Haney RM, et al. (2009年9月). 「FYVEドメインの膜挿入はpHによって調節される」.タンパク質. 76 (4): 852–60. doi :10.1002/prot.22392. PMC 2909462. PMID 19296456 .
- ^ Leevers SJ、Vanhaesebroeck B、Waterfield MD (1999 年 4 月)。「ホスホイノシチド 3 キナーゼを介したシグナル伝達: 脂質が中心となる」。Curr . Opin. Cell Biol . 11 (2): 219–25. doi :10.1016/S0955-0674(99)80029-5. PMID 10209156。
- ^ Misra S, Hurley JH (1999年5月). 「ホスファチジルイノシトール3-リン酸特異的膜標的モチーフ、Vps27pのFYVEドメインの結晶構造」. Cell . 97 (5): 657–66. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80776-X . PMID 10367894. S2CID 15448444.
さらに読む
- Stenmark H、Aasland R、Toh BH、D'Arrigo A (1996 年 9 月)。「自己抗原 EEA1 のエンドソーム局在は、亜鉛結合 FYVE フィンガーによって媒介される」。J . Biol. Chem . 271 (39): 24048–54。doi : 10.1074/ jbc.271.39.24048。PMID 8798641 。
- Stenmark H、Aasland R (1999 年 12 月) 。「FYVE フィンガータンパク質 - イノシトール脂質のエフェクター」。J . Cell Sci . 112 (Pt 23): 4175–83。PMID 10564636。