ファルプ1

ファルプ1
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	4H6Y
識別子
エイリアス	FARP1、CDEP、FARP1-IT1、PLEKHC2、PPP1R75、FERM、ARH/RhoGEF、プレクストリンドメインタンパク質1
外部ID	オミム：602654; MGI : 2446173;ホモロジーン: 38098;ジーンカード：FARP1; OMA :FARP1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体13（ヒト）
終わり	98,455,176 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	14番染色体（マウス）
終わり	121,521,156 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	腎髄質; ; 子宮内膜間質細胞; ; 精巣上体; ; 神経節隆起; ; 人間の腎臓; ; 心室帯; ; 結腸上皮; ; 肝臓の右葉; ; 耳下腺; ; 甲状腺;
	トップの表現
	内頸動脈; ; 外頸動脈; ; 下顎突出; ; 臼歯; ; 上顎突出; ; 手; ; 生殖腺隆起; ; 髄質集合管; ; 精管; ; 下垂体;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	グアニルヌクレオチド交換因子活性; 細胞骨格タンパク質結合;
細胞成分	細胞質; 細胞投影; 膜; 糸状仮足; 細胞膜の細胞質側の外因性成分; 細胞膜; 樹状突起棘; シナプス; 細胞接合; 樹状突起; ニューロン投影; 細胞骨格; 細胞質;
生物学的プロセス	樹状突起の形態形成; ホスファターゼ活性の負の調節; 多細胞生物の発達; シナプスの組み立て; Rhoタンパク質シグナル伝達の制御;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	10160
	223254
	ENSG00000152767
	ENSMUSG00000025555
	Q9Y4F1
	F8VPU2
	NM_001001715 ; NM_001286839 ; NM_005766
	NM_134082
	NP_001001715 ; NP_001273768 ; NP_005757
	NP_598843
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

FERM、RhoGEF、プレクストリンドメイン含有タンパク質1は、ヒトではFARP1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]

この遺伝子は、もともと、分化した軟骨細胞と脱分化軟骨細胞で発現が増加するため、サブトラクティブハイブリダイゼーションによって単離されました。結果として得られるタンパク質には、予測されるエズリン様ドメイン、Dbl相同ドメイン、およびプレクストリン相同ドメインが含まれています。これは、細胞骨格を細胞膜にリンクするバンド4.1スーパーファミリーのメンバーであると考えられています。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする2つの選択的スプライシング転写バリアントが見つかっています。^[6]

参照

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000152767 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000025555 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Koyano Y, Kawamoto T, Shen M, Yan W, Noshiro M, Fujii K, Kato Y (1998 年 1 月). 「バンド 4.1 スーパーファミリーのエズリン様ドメインと Rho グアニンヌクレオチド交換因子の Dbl 相同ドメインを含む新規ヒトタンパク質 CDEP の分子クローニングと特性評価」Biochem Biophys Res Commun . 241 (2): 369–75. doi :10.1006/bbrc.1997.7826. PMID 9425278.
^ ab 「Entrez 遺伝子: FARP1 FERM、RhoGEF (ARHGEF)、およびプレクストリンドメインタンパク質 1 (軟骨細胞由来)」。

さらに読む

Zhuang B、Su YS、Sockanathan S (2009 年 2 月)。「FARP1 は、膜貫通型セマフォリン 6A およびプレキシン A4 シグナル伝達を介して脊髄運動ニューロンサブタイプの樹状突起成長を促進する」。ニューロン。61 ( 3 ) : 359–72。doi : 10.1016 /j.neuron.2008.12.022。PMC 2654783。PMID 19217374。
Hartley JL、Temple GF、Brasch MA (2001)。「in vitro 部位特異的組み換えを用いた DNA クローニング」。Genome Res . 10 (11): 1788–95. doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863 。
Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
太田孝文、鈴木勇、西川孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
Dunham A、Matthews LH、Burton J、他 (2004)。「ヒト染色体 13 の DNA 配列と分析」。Nature 428 ( 6982 ) : 522–8。Bibcode : 2004Natur.428..522D。doi : 10.1038 /nature02379。PMC 2665288。PMID 15057823。
Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). 「ORFeome から生物学へ: 機能ゲノミクスパイプライン」Genome Res . 14 (10B): 2136–44. doi :10.1101/gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336 .
Mehrle A、Rosenfelder H、 Schupp I 、他 (2006)。「2006 年の LIFEdb データベース」。Nucleic Acids Res . 34 (データベース号): D415–8。doi : 10.1093/nar/gkj139。PMC 1347501。PMID 16381901。

外部リンク

UCSC ゲノムブラウザにおける FARP1 ヒト遺伝子の位置。
UCSC ゲノムブラウザにおける FARP1 ヒト遺伝子の詳細。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000152767 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000025555 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid9425278-5] Koyano Y, Kawamoto T, Shen M, Yan W, Noshiro M, Fujii K, Kato Y (1998 年 1 月). 「バンド 4.1 スーパーファミリーのエズリン様ドメインと Rho グアニンヌクレオチド交換因子の Dbl 相同ドメインを含む新規ヒトタンパク質 CDEP の分子クローニングと特性評価」Biochem Biophys Res Commun . 241 (2): 369–75. doi :10.1006/bbrc.1997.7826. PMID 9425278.

[entrez-6] 「Entrez 遺伝子: FARP1 FERM、RhoGEF (ARHGEF)、およびプレクストリンドメインタンパク質 1 (軟骨細胞由来)」。