ヒトのタンパク質コード遺伝子
ARHGEF9 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス ARHGEF9 、COLLYBISTIN、EIEE8、HPEM-2、PEM-2、PEM2、Cdc42 グアニンヌクレオチド交換因子 9、DEE8 外部ID OMIM : 300429; MGI : 2442233; ホモロジーン : 9053; ジーンカード ：ARHGEF9; OMA :ARHGEF9 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 X染色体（マウス） [2] バンド X|X C3 始める 94,092,541 bp [2] 終わり 94,240,462 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 ブロードマン領域46 前頭前皮質 海馬のI領域 側坐核 視床の外側核群 頭頂葉 上前頭回 中心後回 右前頭葉 背外側前頭前皮質
トップの表現 上前頭回 海馬歯状回顆粒細胞 一次視覚野 嗅結節 梨状皮質 一次運動野 小脳皮質 外側中隔核 海馬本体 淡蒼球
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能 細胞成分
細胞質 細胞質 シナプス後密度 GABA作動性シナプス 細胞膜 膜 細胞接合 シナプス シナプス後膜 生物学的プロセス
アポトーシス過程の正の調節 Rhoタンパク質シグナル伝達の制御 低分子量GTPaseを介したシグナル伝達の制御 Gタンパク質共役受容体シグナル伝達経路 シナプス後特化アセンブリの調節 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001173479 NM_001173480 NM_015185 NM_001330495 NM_001353921 NM_001353922 NM_001353923 NM_001353924 NM_001353926 NM_001353927 NM_001353928 NM_001369030 NM_001369031 NM_001369032 NM_001369033 NM_001369034 NM_001369035 NM_001369036 NM_001369037 NM_001369038 NM_001369039 NM_001369040 NM_001369041 NM_001369042 NM_001369043 NM_001369044 NM_001369045
NM_001033329 NM_001290384 NM_001290385
RefSeq (タンパク質) NP_001166950 NP_001166951 NP_001317424 NP_056000 NP_001340850 NP_001340851 NP_001340852 NP_001340853 NP_001340855 NP_001340856 NP_001340857 NP_001355959 NP_001355960 NP_001355961 NP_001355962 NP_001355963 NP_001355964 NP_001355965 NP_001355966 NP_001355967 NP_001355968 NP_001355969 NP_001355970 NP_001355971 NP_001355972 NP_001355973 NP_001355974
NP_001028501 NP_001277313 NP_001277314 NP_001392830 NP_001392831 NP_001392832 NP_001392833 NP_001392834 NP_001392835 NP_001392836 NP_001392837 NP_001392838 NP_001392839 NP_001392840 NP_001392841 NP_001392842 NP_001392843 NP_001392844 NP_001392845 NP_001392846 NP_001392847
場所 (UCSC) 染色体X: 63.63 – 63.81 Mb 染色体X: 94.09 – 94.24 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
Rhoグアニンヌクレオチド交換因子9 は、ヒトでは ARHGEF9 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6] [7]
関数 ARHGEF9は、活性GTP結合状態から不活性GDP結合状態へと循環することで分子スイッチとして機能するRho様GTPaseファミリーに属します。これらのタンパク質は アクチン細胞骨格の重要な調節因子であり、 細胞シグナル伝達 に関与しています 。[OMIM提供] [7]
インタラクション ARHGEF9はGPHN [8] および SMURF1 [9] と 相互作用する ことが示されている 。
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000131089 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000025656 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Reid T、Bathoorn A、Ahmadian MR、Collard JG (1999 年 12 月)。「Cdc42 に特異的なグアニンヌクレオチド交換因子 hPEM-2 の同定と特性評価」。J Biol Chem . 274 (47): 33587–93。doi : 10.1074 /jbc.274.47.33587。PMID 10559246 。 ^ 石川 健、永瀬 剛、中島 大輔、関 直、大平 正治、宮島 直、田中 明、小谷 秀、野村 直、小原 修 (1998 年 2 月)。「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。VIII. 試験管内で大きなタンパク質をコードする脳由来の 78 個の新しい cDNA クローン」。DNA Res . 4 (5): 307–13. doi : 10.1093/dnares/4.5.307 . PMID 9455477。 ^ ab "Entrez Gene: ARHGEF9 Cdc42 グアニンヌクレオチド交換因子 (GEF) 9". ^ Kins S, Betz H, Kirsch J (2000). 「新たに同定された脳特異的GEFであるCollybistinは、ゲフィリンの膜下クラスター形成を誘導する」 Nat. Neurosci . 3 (1): 22–9. doi :10.1038/71096. PMID 10607391. S2CID 24878249. ^ Yamaguchi K, Ohara O, Ando A, Nagase T (2008年4月). 「Smurf1は、ユビキチン-プロテアソーム経路におけるタンパク質相互作用モジュールの新規な組み合わせを介して、Cdc42のGEFであるhPEM-2を直接標的とする」. Biol. Chem . 389 (4): 405–13. doi :10.1515/BC.2008.036. PMID 18208356. S2CID 27505034.
外部リンク
さらに読む
Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J, Nakai K, Sugano S (2004). 「ヒト遺伝子とマウス遺伝子の配列比較によりプロモーター領域に相同ブロック構造が発見される」 Genome Res . 14 (9): 1711–8. doi :10.1101/gr.2435604. PMC 515316 . PMID 15342556. Harvey K, Duguid IC, Alldred MJ, Beatty SE, Ward H, Keep NH, Lingenfelter SE, Pearce BR, Lundgren J, Owen MJ, Smart TG, Lüscher B, Rees MI, Harvey RJ (2004). 「GDP-GTP 交換因子コリビスティン: ニューロンのゲフィリンクラスタリングの重要な決定因子」 (PDF) . J. Neurosci . 24 (25): 5816–26. doi : 10.1523/JNEUROSCI.1184-04.2004 . PMC 6729214. PMID 15215304 . Grosskreutz Y、Hermann A、Kins S、Fuhrmann JC、Betz H、Kneussel M (2002)。「GDP/GTP 交換因子コリビスティンにおけるゲフィリン結合モチーフの同定」。Biol . Chem . 382 (10): 1455–62. doi :10.1515/BC.2001.179. PMID 11727829. S2CID 2415901. Kins S、Betz H、Kirsch J (2000)。「新たに同定された脳特異的GEF、Collybistinは、ゲフィリンの膜下クラスター形成を誘導する」。Nat . Neurosci . 3 (1): 22–9. doi :10.1038/71096. PMID 10607391. S2CID 24878249。
