ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
AFAP1 識別子 エイリアス AFAP1 、AFAP、AFAP-110、AFAP110、アクチンフィラメント関連タンパク質1 外部ID オミム ：608252; MGI : 1917542; ホモロジーン ：11009; ジーンカード ：AFAP1; OMA :AFAP1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 5番染色体（マウス） [2] バンド 5|5 B3 始める 36,050,663 bp [2] 終わり 36,161,267 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 子宮内膜間質細胞 腓骨神経 右精巣 左精巣 神経節隆起 S状結腸の筋層 結腸上皮 膝窩動脈 脛骨動脈 睾丸
トップの表現 松果体 脱落膜 虹彩 臍帯 大動脈 上頸部神経節 耳石器官 頭蓋冠 卵形嚢 アトリウム
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
アクチン結合 SH3ドメイン結合 SH2ドメイン結合 細胞成分
細胞質 細胞骨格 焦点接着 細胞質 アクチン細胞骨格 生物学的プロセス 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001134647 NM_021638 NM_198595 NM_001371090 NM_001371091
RefSeq (タンパク質) NP_001128119 NP_940997 NP_001358019 NP_001358020
NP_081649 NP_001390348 NP_001390349 NP_001390350
場所 (UCSC) 4 章: 7.76 – 7.94 Mb 5 章: 36.05 – 36.16 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
アクチンフィラメント関連タンパク質1 は、ヒトでは AFAP1 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6] [7] [8]
この遺伝子によってコードされるタンパク質は Src 結合パートナーである。細胞シグナルに反応してアクチンフィラメントの完全性を調節する可能性のある因子であり、Srcファミリーメンバーや他のシグナル伝達タンパク質をアクチンフィラメントにリンクするアダプタータンパク質として機能する可能性がある。同じタンパク質をコードする2つの代替転写産物が同定されている。 [8]
参考文献
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外部リンク
さらに読む
石田 勇、秦野 聡、永山 剛、他 (1995)。「ヒト染色体4pの遠位領域から21の新規発現DNA配列の単離と特性評価」。 ゲノミクス。22 ( 2 ): 302–12。doi : 10.1006 /geno.1994.1388。PMID 7545969 。 Qian Y、Baisden JM、Westin EH、et al. (1998)。「Src は AFAP-110 とのカルボキシ末端相互作用を制御し、自己会合、細胞局在、アクチンフィラメントの完全性に影響を与える」。Oncogene . 16 ( 17): 2185–95. doi :10.1038/sj.onc.1201753. PMID 9619827. S2CID 28373925. Guappone AC、Weimer T、Flynn DC (1998)。「アミノ末端またはカルボキシ末端の SH2 結合モチーフを介した安定した src-AFAP-110 複合体の形成」。Mol . Carcinog . 22 (2): 110–9. doi :10.1002/(SICI)1098-2744(199806)22:2<110::AID-MC6>3.0.CO;2-Q. PMID 9655255. S2CID 10461528。 Qian Y、Baisden JM、Zot HG、他 (2000)。「AFAP-110 のカルボキシ末端はアクチンフィラメントとの直接相互作用を調節し、アクチンフィラメントの完全性を変化させ、ラメリポディアの形成を誘導する能力を調節する」。Exp . Cell Res . 255 (1): 102–13. doi :10.1006/excr.1999.4795. PMID 10666339。 Qian Y、Baisden JM、Cherezova L、et al. (2003)。「PC リン酸化は AFAP-110 のアクチンフィラメント架橋能力を高める」。Mol . Biol. Cell . 13 (7): 2311–22. doi :10.1091/mbc.E01-12-0148. PMC 117315. PMID 12134071 。 Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。 Brandenberger R、Wei H、Zhang S、他 (2005)。「トランスクリプトーム特性評価により、ヒト ES 細胞の成長と分化を制御するシグナル伝達ネットワークが解明」 Nat. Biotechnol . 22 (6): 707–16. doi :10.1038/nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390. Ballif BA、Villén J、Beausoleil SA、他 (2005)。「発達中のマウス脳のホスホプロテオミクス解析」。Mol . Cell. Proteomics . 3 (11): 1093–101. doi : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . PMID 15345747。 Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。 Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). 「転写調節の多様化: ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模な同定と特性評価」 Genome Res . 16 (1): 55–65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560 . Dorfleutner A, Stehlik C, Zhang J, et al. (2007). 「AFAP-110 は MDA-MB-231 乳がん細胞におけるアクチンストレスファイバー形成と細胞接着に必要である」 J. Cell. Physiol . 213 (3): 740–9. CiteSeerX 10.1.1.636.3591 . doi :10.1002/jcp.21143. PMID 17520695. S2CID 15344259.
