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| エイリアス | ARHGEF7、BETA-PIX、COOL-1、COOL1、Nbla10314、P50、P50BP、P85、P85COOL1、P85SPR、PAK3、PIXB、Rho グアニンヌクレオチド交換因子 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム: 605477; MGI : 1860493;ホモロジーン: 2895;ジーンカード：ARHGEF7; OMA :ARHGEF7 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Rhoグアニンヌクレオチド交換因子7は、ヒトではARHGEF7遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7] [8]
ARHGEF7は、p21活性化キナーゼ（PAK）に結合することで同定され、グアニンヌクレオチド交換因子ドメインも含むため、一般にp21活性化タンパク質キナーゼ交換因子ベータ（ベータPIXまたはβPIX）として知られています。 [ 6]
ドメインと機能
βPIXは、シグナル伝達の 足場タンパク質と酵素の両方として機能するマルチドメインタンパク質です。[9] βPIXは、非常に類似したARHGEF6/αPIXタンパク質とこのドメイン構造とシグナル伝達機能を共有しています。
βPIXは広範囲にわたる選択的スプライシングを受け、特定のタンパク質ドメインを含む、または含まない複数の変異タンパク質を生成します。[9]成体型はすべてアミノ末端CHドメインを欠いており、2つの主要な成体型変異体は代替カルボキシル末端領域（β1およびβ2と呼ばれる）を持っています。β1型にはコイルドコイル三量体化ドメインとPDZタンパク質に結合するためのPDZターゲットモチーフが含まれています（以下を参照）が、β2型には両方のドメインと対応する機能が欠けています。[9]
βPIXには、 Rhoファミリーの小さなGTPase、特にRacとCdc42のグアニンヌクレオチド交換因子（GEF）として機能する中央DH/PH RhoGEFドメインが含まれています。[6]他のGEFと同様に、βPIXは不活性な小さなGTP結合タンパク質からのGDPの放出と、 GTPの結合を促進してその活性化を促進します。シグナル伝達スキャフォールドは、相互作用/情報伝達を容易にするために経路の連続要素を互いに近くに配置するとともに、これらのパートナータンパク質複合体を細胞内の特定の場所に保持して局所的または領域的なシグナル伝達を促進することにより、特定のパートナーに結合して効率的なシグナル伝達を促進します。βPIXの場合、そのSH3ドメインは適切なポリプロリンモチーフを持つパートナータンパク質、特にグループI p21活性化キナーゼ（PAK）（PAK1、PAK2、およびPAK3）に結合します。[6] PAKは不活性状態でβPIX SH3ドメインに結合し、活性化されたRac1またはCdc42がこのPAKに結合すると、そのタンパク質キナーゼ活性が刺激され、下流の標的タンパク質のリン酸化につながります。βPIXはGEF活性を介して「p21」小型GTPase Rac1またはCdc42を活性化できるため、このβPIX / PAK / Rac複合体は足場機能の例です。
構造的には、βPIXは、主要なカルボキシル末端スプライスバリアントβ1に存在するカルボキシル末端コイルドコイルドメインを介して三量体として組み立てられ、さらに近くのGIT結合ドメインを介してGIT1またはGIT2の二量体と相互作用して、オリゴマーGIT-PIX複合体を形成します。 [9]このGIT-PIX複合体を介して、βPIXの足場機能は、GITパートナーをβPIXパートナーの近くに保持することもできることによって増幅されます。対照的に、β2カルボキシル末端バリアントはこのコイルドコイル領域を欠いており、三量体化できないと予測されます。主要なカルボキシル末端バリアントβ1には、SHANK1、[10]、scribble、[11]、およびSNX27 [12]タンパク質のPDZドメインに結合するPDZドメイン結合ターゲットモチーフもあります。 βPIXのスプライスバリアントの中には、アミノ末端カルポニンホモロジー（CH）ドメインを含むものがあり、その機能は比較的よくわかっていませんが、パルビン/アフィキシンファミリータンパク質と相互作用する可能性があります。[13] [9]この拡張されたアミノ末端CHドメインを持つβPIXバリアントは、発達初期に最も多く発現しますが、出生後にはまれにしか現れません。[9]
インタラクション
βPIXは120以上のタンパク質と相互作用することが報告されている。[9] [14]
相互作用する主要なタンパク質は次のとおりです。
- それ自体、または三量体コイルドコイル相互作用を介して関連性の高いARHGEF6/αPIX 。
- GIT 結合ドメインを介したGIT1またはGIT2二量体。
- SH3 ドメインを介したp21 活性化キナーゼ (PAK) 1、2、および 3 。
- SH3ドメイン経由のc-Cbl。
- Rho ファミリー GTP 結合タンパク質ファミリーのメンバーであるRac1およびCdc42 は、DHPH RhoGEF ドメインを介して活性化されます。
- 神経シナプスアダプターSHANK1、SHANK2、およびSHANK3はPDZを介して
- PDZ経由の落書き
- SNX27 PDZ経由
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000102606 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031511 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Oh WK、Yoo JC、Jo D、Song YH、Kim MG、Park D (1997 年 7 月)。「SH3 ドメインを含むプロリンリッチタンパク質 p85SPR のクローニングと接着斑におけるその局在」。生化学および生物物理学的研究通信。235 (3): 794–798。doi : 10.1006 /bbrc.1997.6875。PMID 9207241 。
- ^ abcd Manser E, Loo TH, Koh CG, Zhao ZS, Chen XQ, Tan L, Tan I, Leung T, Lim L (1998年7月). 「PAKキナーゼはヌクレオチド交換因子のPIXファミリーに直接結合している」. Molecular Cell . 1 (2): 183–192. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80019-2 . PMID 9659915.
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- ^ 「Entrez Gene: ARHGEF7 Rho グアニンヌクレオチド交換因子 (GEF) 7」。
- ^ abcdefg Zhou W、Li X、Premont RT（2016年5月）。「GIT Arf GTPase活性化タンパク質、PIX Rhoグアニンヌクレオチド交換因子、およびGIT-PIX複合体の機能拡張」。Journal of Cell Science。129（10）：1963–1974。doi ： 10.1242 / jcs.179465。PMC 6518221。PMID 27182061。
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- ^ 「ARHGEF7 結果概要」.
さらに読む
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外部リンク
- ARHGEF7 情報と Cell Migration Gateway のリンク
- UCSC ゲノム ブラウザのヒト ARHGEF7 ゲノムの位置と ARHGEF7 遺伝子の詳細ページ。
- UCSC ゲノム ブラウザのヒト PAK3 ゲノムの位置と PAK3 遺伝子の詳細ページ。